Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040980

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040980
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040980
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTTTGAGATGCTTAAAGGTTTCAAAGTACAAGAAGGGAAATTTTATTTAG
TTGATGGTGACTATACGAATAGTCAAAATTTTCTTGCACCTTACCGCCGC
ACATGGTACCACTTTGAAAGAGTTTGTCCATGGTCATCGTTGCAGATAAG
GAGTTGTCTAATGACAACCATGATGTCATGAGAAACCATGTAGAAAGAGA
CCTGGGCATTTTGAAGAACTGATTTCCTACTATTTGTGTCAGAACCTTTC
ATCCGATAAGGAATTGAATAAAGATACCAGTTGCTACTGCAATCTTTCAT
AATATAATCAAGATACATGGTGGATATTGAGTGTTGAGAGTTAACCTTAG
CAATGTCCACTGTTATGGACTTGGGTTTCAGGAAAAAGTGGTATGTTGGT
GATTTCGTTGGTTTATCAGACAAACAAGGGAGACGAGATTTACTTAGGTT
TAGGCCCTCGTAGAGGAAATCCTACTTCCTGCTTGTCTAATCTTTATTGA
TGGAGAGTACAAAATCGCTAGGTTGCTAGATGTGATCTAGTTTACAACGC
ATTGCTATGAGTATATTATTAGTTGTCCTCCCCATCGGATACTCTCAGCC
TTTATATGAGTGACTGGGTCTCAGAGTCCAATCCAGATTGGTTACAAAAT
AAAAGGTAACCTTATGATAAAGTAAATTAATAATTCGAGAGGTCCTACTC
CACAAAAAATCATTTTTGCCACTAAAAAAGTTCATTTTTTAGGTTAACAC
ACACACAAAAATTGCAAGAGACGTGATTTGTCTCTGGATTGTTGAAACGG
TCTAGGTTTGGACCCGTTTTCATATAGAGTTTGTTTAATGTTGACATGGA
TATGACTTTGCACATTTGGTAACATGTCACTACGAAAGCTAAAAGTGAAA
TCATAAAAGGATAGAAAGGAGGAGGAAATCCTCGAAATTTCTTAGGTGAG
TTCAGGTACATCTCTAAATGTCAAAAAATCAGGGAAAAGAAGTTGTAAAC
ATGCACGTCCATGCTATATGTGCACATGAAATTTTGAAGAAGAAATTTTA
TATGACTTGTTAAAAATAATTTTTTTGGTTCTCCACAAATTGCTTTTTAT
AACATAGTTTTTATTTTTATGCAGATCACTACTATGCCTTTTTTCATTAA
AGTTTTGTAGAAGAGGTATGCTTCGGTGTCCTCCCCTTCTCCCAAACTTA
GGGAATTAAAAACAGAAGGAGGACCAGGATTGACCAATACCCCTTCATTT
AGAGGGCATGAAGGGGTATCGTCCAATCTTGGTCATTCTTATGTTTTTAG
TTTTCTAAGTTTGAGAGGACGAGGAAGATACTGGAGCAAAACTCTTTGTA
GAAATGGACCGGATAAAAGTTTTGTGTAAATGTTAAAGAAGCGATCACGG
TACTTTGTATAAAAAACAGACTTTCCTTGAAAACTTCAACAATTTTTCCC
ATTTAGTGTTCACACTGGGAGCAGATGCACCATCCGGTACTAAAAACCAT
GTACGGAAAAAATCCTAATTTTGTAAATTTTGTTTCGAAAAACTCTCATG
AAAAGAAACGACGAGTAAGCCAATGTAAAGAACTTCTAAGAATCTGGAGG
AAATTGTGAAGTTTTTTGCTAGAAGTTATAAATTGGGTGAAAATATTTTT
AGTAACCTTATAATAAAATAATATGGATAAATGTAAAATTGGAAGCAAAG
ACAAAAAAATAGAGGATAAGAAAATATTTCAGACTATACAGAAGACAATT
TTAAACATAAAATCATAAAATATTCTCAAAATATAGAGCAATTTTTGGAT
TTTGATTGGTATGCATGGTGACCCTTTTTTATATAACTTTTGCGACAAAC
ATTTGCACTACTAGAGAAGATGAGTACCATGTAAACACTGGTATCGTCTG
GATTTTTTTATTTGTCACCACATCAGTTCAAACTCAAAAATACATTCTTG
CATTGAGATATGAAGGAGGAGGTTTATTGGAGATCCCATATGCATTTAGT
GCCCCAAGCACCAAGGGTAAGGAGGTATGTAGAATGAAGAAATTTGCTTA
TTTTCACAAGCAGCTACCAATAGGGGGTTTGTGAGATTTTGCCAAGCCAT
TTTTAGTATGCGTTACAAGTAATGTAATGGGTCATTCGTTGTTCTATTGT
CATTCAAATACTCGTATTAACATCCTTGTTGTTTATGTGGAAAATATTAT
TATCACATGAGATGATAATGGAAGATAGGTCAGCGGTAGGTGATATTAGG
AAAATAATTCGAAGTTAAGGATCAAAGTGGCCTAAACATTTCTTTTGCCT
ATTGAGATTACCACATCTCTAGGAGGAATATTTCTTGCTCAAAGAAAGTA
TGTATTGTATCTGCTAAGTGATACATTTATGCTTGAGTGTAGAGCGGTTT
AAACTCCTATTGAGAAAAATCACCAGTTGTGTCATGAATTAGGATACCCA
TTTGAAAGAGCAACCCTATGGACACGAGTTAAAACCATCTTCTGCTTTTT
GTTAGAATTATGGCACTATTATGGAATCTTTATCGGCAATAAAGGGCGGA
CGAGTTTTTATGGCCCTCGTCACCAACAAAATTCCACCATTCTTCGTTGG
CGATTTCAGACCACGTCGGTGACCATGTTGTAGTTTCTACATCGTCCCTT
GAGGTAACAATGCACACAAATACTTTTATCTAACCATGCACACTGAGGTC
ATGTAGCACACAATTTTCTTCCTACCATGTAGGACATACATTATTACAAA
GGAACTTTCACACTAAATATATTCACTCAATATTTAAAAGATACACACAT
CTATTTCATCACATTCACATCATGTAAAAAAACAAAGTTCATATCTTCAC
ACCAACATGCAAGACTCTAATTTACCATTTTTTAAAGTACAATTCTTAAA
ATATAAGTTTCAATGTAAAGAAACCCATTTATTTCTTTTTCATGTCGATC
GACCCGATGTTAAACTAGTTTAGAACTCGGATGCAATATCATGACCACGC
TTTGCACAAAAATTCATCAATGTCTCTACAAGAGCCTTAAAGGTTTAAAA
AATAAATAATCAAGAAAATCAGAAAAATAGGTTATATTTAAATCATGTGT
TATTCTCTCGCATTTTTTGATTTGTGGAAAGACATGCTTAGGGGTGCTAG
CTTCCACCCATATGCCTATCTTACTTTAATCATCTAGGTGGGTGCGCGGG
TTATCTAAAGCAAATTAATATCCGTTTAAAAATCCCAAAACATTCTTGCC
CATCACACTCATCAAACTAAGATTTTTTATATTGGTTCTAGATTTCTTAT
TCCACTTCTCGGTTATACACTAAAGTCTATCGTTCTGCCTACAAGATTTT
TGAAAAAAAAAACAAATCATCAAAATAAAATATCGTCTTCCATCTGATTC
TTTGTTTGCTTTATTCCAATTTTATTTTATTTGTGGGAAGACATATATCT
TGAGATGTTATCTTCCATACAAGAGCATGCCTATATTACTTCCATTAATC
TTGACACTTAAAGATGAGCTTAGTTTTTGTCGGGTCGATGTAAGTAGTAC
GAGCTAGATCCGCGCATCTTTCCAATTCTAGTTCCAATACCATTATATCA
TGCTTGATTATTATTTGATTGAATTCTATTCTTGTAAAGTGCGAGAGGCA
GCCACCAGGGACTAATTTTTTTCGATACTTCATGTGCGAGTACATTCACT
CGGAGGCCAGTGAGCGGGATGGAGGGACATTTATAGCAGTACATGAAAAA
TATATTCACAAATTGTGTTGAGTGTCATTCATCATATTTGTTATGACGAT
TGATATACATATTGATCTCCTTCTTTTATATATAGTTGGAAAAATTGCGG
GAGAATCTCCAACCAAGGGAGCGCCTGGTAGGAATTTAAGAGGAATTGGC
GGGATTTATTGTTGACCATGTCATAAACCCAAAAATAAAATACCATACCT
TGGGCTCTAGTGATTTAATGATCTCCATGTAATCAAATATACGGGTTGTG
ATCTCCATTTAATCAAATTGTATATATATGTAATGTAGAAATGTATCTAT
ATAATCATGACGATGTTGTGTGTAATGGATTCCTTCGTTGCATGTCACTT
ACGCCAAACGCAACCCTCCTCTACCATCCTCCTGCCGCGGCAGACCCCCC
CCCCATACGGCTGCCGCTGCAGAAATCGGTCTCAAAATTCTGCCGCTGCA
GAAATCGGCCTCAAAATTCTGCCGCGGCAGAAATCCCCATCGGCTGCCAC
AGCAGAAAACGGCCGCAAAATCCTGCGCGGCAGAAACCCCCATCGGCTGC
CGGGGCAGTCGAATTGGTAACTATTGTCGCGACAGAGAATACGAACCGAG
ACTAAAGATCCTCCATCCCGCGCCCTTCTGTGCGGCCACATGCAGATCCT
CTAGCCTCGGGTCAGTTACCCCGCGCCCTTCTGTGCGGCCACATGCAGAG
CCTCTAGTCCCGGTTCGTAACTGACCCGAGGCTAGAGGCTGGAACCTCTA
GTCCCAATTTCGTAGTCCCGGTTGCAAACACGGGACTAGAGGCTGTCTAG
AACCGGGACTAGAGGCCTGATCTCCACTAGTGTTCCATTAATCTTGACAC
TTTGTGTTGGTTTCCTAAATAAGGAAGTGTGCATCAGTTTATAAACATAA
AAATTTGCTAAAACATTCTACTCATTATGGTCAAATTATTTTATATGGTT
TATATTTTGTGGATCACCCAAAAGTAGCCTTTGCGGCTCTCCTTGTGTGC
TAGGGTTTGTTTTTCCTTCGACATGATATGTACCACACGCTTTCACTACA
GGACGCGACGGCTAGGCCGACGACAAAAAGCCCTCGGCGGAGATCTCCCT
CGGCAGAGGAAAAAGAGCCGTCGGCGTAGGGCTTTGCCGACGGCCGTGGC
CGACCCGTCGGCGTATTAGCCGTCGGCGAACGACATCTCGCCGTTACACG
GCCGGCTAACGGCGCGACACGTACGCCAACGGCCGGCCCCTCGGCGTATC
GGTGCAACGTGGCAGCTGCTGGTCCTCCCCAGGAGGTGGGCTGGGCCGAC
GGCTGAGGCCCTTGGCGTAGGGCCAGGAGTACGCCGACGGCCTGGTCCTC
GGCGTAGCGGTGCAACGCGGCAGCTTCTGGGCCACCCAAGGAGGTGGGCT
GGGCCGACGGCTGAGGCCATCGGGCATGGCTACGCCGACGGCAATGCCCT
CGGCGTAACACCTGCACATTCGCCAATTCTAAAATGTCCAGATCGATCGT
CGTTGTCGAGGTGAGGATCAATATAATTTTTTAACTATCTAAAATATATA
TGTACTACCTCTGGTTGAAACTAATAGACCCAAATCTGCCAAGATTTGGA
TGTATCTAGCATTAAAACATGACTATATAAATCCAAATCTATATAGATCT
GAGTATATTAATTGGATCGGAGGGAGTAGATGAAAACGCAAAAAAAAAAT
TGTTGGAGATCTGGAGAAACGGGAATAGTGGGACAAAATTGGCTTTTATA
GAAGAAACCTTCACTAGCGATAACACTGGATCAGATAGAGAGTGTGGCCG
CCTGCTGTTTAGAATTTTGCCTTGCACAGTCAGAATGATTTGTCAAAATC
ATATCGAAACTCAAGGAACCTGTCGTACGGTAGTCTATCATAAAATTACT
GGGATCGAAACATTCAACTAGATGCAAATCATATGAGACGCGAAAGAAGA
AGAAAAACCTAGAGACATGTAGCCAACCGCATAATATATATTTTTTATTT
GATGACGTTTCTCCGAACGGCAAGGTACATTTATGCAGTATCAATATCAA
GTTACACCATCTATGTGAATGAAAGTAGTATGTCGATGATGTTTCCTCAC
GAGCTCAAGAACAACGAACGACGACTGAGGACAACCTTGCAATATTTCTG
GAAAAGAAAAAGAGAGAGGAACTGAACTATTCTACCCCAGATCGGCCCGT
TCAATGAACACCGGCAGAGCAGACAGCCAGACGTTGGCCCGGCACTTGGG
GCACGTCGCCGCCGTGGGGAACCAGTCGGAAACGCACCGGCGGTGGAACG
CGTGCGAGCAGCCCGGCAGCACGGCGGCGCTCTCTTGCTCCAGTCCATCG
AGACAGATCGGGCAGTCTCTCTCCCCCGACGCCGTTGACGCCAGCCACTC
CTTGGACGCCATCAGGAGAGCTCGCTCGTCGTGAATCACCCGGAGTTGTA
CCTCCAGCGTGAAACTGAAGGTGAATCCGTCGCCGCGGAGGACCGCGTTG
ACGAGCACCGGAACGACGTCCCCGGGCACGACGGCGTCCCACTCGGCCTC
CGTGAGGCGCAGCGCCCGGAGCTGCGGGAGCAGCGCCAGCATCCGGCGCA
GGGTGCCGCGGCAGGTGTCGGCGCTCTGGAGCGCGGCCATGTTGCCGATG
GAGAACGCCGACGTGGTGCCACCGGCGGAGTGGTTATGTACCTTCTTGTC
CTTTGGCGCCTGGTCGCCGCGCTTCCAGTACTCGAAGGAACGCTTGGCGA
AGCAGGCCACGAGCACCTCGAATCGGCCGGCCGGCGCCGGTTCCTCCGAG
AAGCAGATCGTGGACGCCTCGACCAAGCGTCGGATTGGGTGCCCGGCGGC
TCCCGGCTCGTTCGCCATATTGGCGGCGTTGTGATGTTGATCACTGGGGG
ATGTGGTGGGTGGCATATGTAAGTGTGGAGCGTTGCCTTGGCCTCGTGCC
CTAATTCCAAATCCAATTTTGGAAGGATACACGAATGCGAACGCACCGAT
TTCACACGGATGGGCCAGGCTCTTTGAATCTCAACCAAATTTGTCAGCCC
AGTTGGCAAGTCGTCAGCTATCTCCCAAGGATTTTTGGCCTTTTCGCATC
TCTCTAAAAAAACTTTTAGCCTTTTTGGCTGCTCTTCTTTGAGATAAAAA
TAAACCTCCTCAACTAGCACAATGTAGATCGGGTGTTTGCAAAACAAAAA
CTAGCACAATGTGAATACTTTAACCCTCAAGTGATTTTCCCGCACTCAAT
CCCCTTAATTATATGAACTAGTGCTAATCACCCCTAAGGCCTTGTTTGAC
GTCAGGTTTCTAATGGAATTAACATGTATTTTACCGGCCTAACGTGTTAC
TCAAAAATACACTTCACGGTCGTTTGGCAGCCCGTTTTGCACTAGCGTAA
CCCCGAGTAAAACCCTCAAAGCACACCGGGTACACGAGTTTCTGAGACAT
TATGTCAGGGTTGCATTTTTTCCACTCGCCCTGCCGTCGAACGATTCTAT
GATCGTCCTCATTGCACTCCACTCCGCCACCACTTCCCGCCCTTGTATCC
TCTTCGTCGTCGCGTACGCCATCGTCTTATCTTCGACGACGCCTTATCAC
AGTCTCCTCTTCGCCGCCACCTCCTATTCTATCACGATGGCGTTCTCACC
GACATGTTATCCCCTCTCCCCCCCCGCCCCCCCCCCCCCACCCCATGGAT
GTGAAAGGTTTCCCAGGTTCCAATTTCGTCAGAGTTCTTGATTAGGTTCT
GAACAAGATGTTGATTAGGTTGTGAACAAGTTGTTGTTTATGGAGGAAGC
TGCATAGAAGTAACTTGACATTGCTAATAAACGATTTCTTCCTAGATTAG
GTTGTTAAACATGAATATAGCAGGCTTCACCATAAGCTTTCCACCGGTAT
AGTTTTGGTGAATTTGGAGTATAGTTTTACTAACTGGAGCAATAACAGGC
CTATACCTGTTAGTTTCTACTATTACAGATTACTTTTTTCCCTGATTTCA
TGTATGAATATCTTCTTGAACGATTTTTCTCTCCGAATGAAGTGTACTCC
CTCTGGTCCATAATAAGTGTCACTCATCTAGTAAAAAGTTTGTACTAGCT
TAGTACAAAATGAGCGACACTTTTTATGAATCGGAGGAAGTACCTTGTTT
AAGTAGACAAGTACTGGCTAGTAGTTTATATCTATAAAACCTGGATGCAT
AAAAGCTATGTGATGTCCAATGCTACTATTGTTTAGCAGCTAATTAGCCT
TTTGATGTCGTTGTTTAATGCCTCATGCTCATGCTAATTGAGCATTGGCA
ATTATAAATTGAGTGTACCATTAGAAATTTAAAATGTTGCTATGACCTGA
TTATGTTTTGTATATACTTCTGGACTTGACAAAGCATACTCCTGACCGTT
CAGTTTGCGTATAGATTTTGCTACTAGTCAGGTCAAGTAATCTCAGACGC
CTTTTTAAGGTACCAAAACCTTATTGGACTTCATGAATCAAAGAGGAGGG
TCCACCAGGCTAGGATCCTATGCCTAACCCTTAAGATTTTGTACCTCATC
CTATCTAAGGTAAATAAATTCTTTCTTAATTGCTAAACCTTGATTATCTT
TTACCATTTCTTTAATTGTTGGACATGCCATCTCTGTTATAGATATTTAT
ATGCTTCTGTTGCTGTCTACAGAGCCTACATTGTTTCTACATGTATTTTT
GTTGATCCTGTACTACATGTTTTCCTTCATTGGTAGAATGGATCCACAAA
GCATACAACGTATTAAAAAAATGGAAGTTAAGGAATGAGTTGATGTTCTT
TTTTTCAGCACTATGTGTTCATATTAATTAAGTGGAAAAAAGTATACGTT
ATCCCTCGTTCCTATATGTCAAGTGGAGAGTCAGGAAAATCCTTGGTGGG
CATATTAAGAACTGCTTTGTAGCTTTTAGAATTGAACCTCACATCTTTGT
GTGGCTTGAAAACTATCTTAGAGATGAAGGATTGCTATTAGATTCTAGGA
TCAAGGTGGAAGCGAAGCTAGCCTTCATTCTTTATATGATCTCACATAAT
GCTTCCTATGAAGATTTACAACGAGAGTTTTAGCATAGTGGATGGTCATT
CTGCAAATACATCAATCAATTCTTTGATTAATTCCTATTTTGACAAGACA
ATTTGTGAGGCCATGACACATTAATGAACCTCATCAAAAGATTTCTATGG
ACAATCGCTTCTTTCCATATTTCCAGGTTACGATATTTTTGTGAACCATC
TAGGTTCCAATTCTTTTCCTTGACACTTATCCATCTAGGTTCCAATTCTT
TCTTTGACACTTATCCATACTTCAATGGAGAATTGTTTAGGAACAATAGA
TGGTTCTCATGTTCCCATCACTATGTATTCTAGTCATCAAGCTCCATGGA
GAAATAGGAAAGGAACCCTTAGCCAGAATGTCATGATAGCATGCCATTTT
GACTTGAACATCACAGTTATTTCATGTGGCTGGAAAGGTTCTACAACAGG
AGTTAAAGTACTCAGTTCTGTGATGCTTAAAGGTTTAATTTCGTTGATGG
TGTCTATACGAACACTCATGATAAACCGACACACATGATACCAGTTGAAA
GAGTTTGGCCATGGTCATCCCCGACCGCAGAACTATAATGAGTTATTCAA
TAATCGCTATGTTGTCATGCGAAACCATGAAAAAGGAGACGGGGTCATTT
TGAAGAAGAGATTCCCTGTTCTTCATCTCATAACATTTCATCCAATAACA
TCAAATAAAGATATTAGATTTTACTTAAATCTTTCATAATATGATCAAGA
TGCATGGTGGAGATGAAGCAAGGCTTGATCAGAGATGGATTGATGATATC
ATAGATGCGACTAACTATGTGAACCTTCCCAATGATGACAACAACCAAGA
AGACGATAACCAAAAAGAGAACCACATCCAAGGGAACAATTTGAGAGACC
AAATAGCTTGGCGGATGTGGAACAATTACCAACAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.