Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA010769

[Submit comment/correction]

Sequence
AA010769
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA010769
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAAGATAAACTTGTACTATTGGTCAATATTTCCCGTCGCTGCTAGGG
CACGGCAGTCGGCGGAGGCTGACGGCGCCGGCGCCGAGGCTGCGGCGGAC
ATGGAAAACCCTAGCGCCTAGGGGTTGCTGGAGGATGGGGGGTCGGCGGA
ATCGGAAGGAGCCGCCGGCAACCAGCGAGGAGAGGGATGAGTGCCCCATG
CCGCAGCAGCGGCGAGGGTGATGCGGCGACGAATTTTACGCCACCCTCTC
AGCGGCCACCGGCCACCGGCCACCCAATTCTCGAACGAAGTTTTGCACGC
CACAGGTGCGTCTCCCCTCTTTCTTGACTCTTTTGATTCCCTCTTGATGA
AATTTTGTGAAATCTCAACGTTCATTAACTCTGTAGTAGCAGTCCTGCAC
CTGGTCCAGTCCCTGCATCCGTATCTATCTTGAAGTATCAAGGTCCATTG
ATTTGATACTCATTTGGCCCCCTTGGTTCAGCCGGAAGTGAATTTGTGTT
CTGTTTGCTTCGAAGGAGAAGAGATGAGTTATTGAAATTATTATTGTTAA
AGATGATTTAAATAGTCGTGTGATTAAAGATGGAGATGGGCCACACTAGC
TTATAAGTTTATTGGTTTAGCTCACAGTAAGCTCTACGTAGTAGCTTCTA
CTTAGGAAGTTTCGGTGCAGTAAAGTTCATTTTCTGTACTATGGGTCTAT
GGCTATCTTCGAATATTATGATAGTTTTGAAAAAAAAGTAGATGTGCATT
TCAGTCTATCCCGTGGCAAAGATTTTCACATATTCATCGACAAAACAGGA
GCTACTAAGCATAGAAGTGAAGCTAAAATACAATTTCGCATCCACAAACT
AACAGCAACATATCCAGTAGCAGATTGTGTAAATCACATTTTATGGTCAG
TTCATGTACTTACAATTTCACATCATGTACTAATGGATGAATCATGTAAT
GTAAATTCATTACTCTGGCTTATTCTCAATATGTTTGTTTACTTGTATGC
AAGTCAGTTCCGGTACTAGCAGTATGAAGAATCAAACACTTAAACTTTCT
GTACAAGCAGTATGAAACATCCTCTGTTTCCTACAGTTTGACTTAACTCT
GTGAATAATCACTATTTTGTTGTTGATATCCAAAAGGTTTGATTCTGGCT
TTCAAGCTGAAGAAAATTCTTGCTGATGCTGACTTGGAACAAAATGGTGG
ATACAATGGTGATTTAATAAAACAGCGTCTGATTCTGATTCCTAGAGTTC
ATCTACAACTGTTGTTACCAAACAAGAACATCTACAACTGACTGTATGAG
GGAGCCTTACTGTCTTGAGGCCCTAGAATAATATGATGCAGGTTCAAGCA
TGTTCACAGAGAGTCAGACAGGTGACCAGTATTCTCTTCCTTAAAAAGCA
TGCTTCATCACTGCCAAAATATCTCAAATCATCAACTTAGTTAATGCTGG
CAACAAAACTGAAAATGACCTGTTATGTGATGTGAGCATGTGACAACTGC
TTGTTTAGTTTGGTTCATGCCTAGGCTCCTAGTACTCTGCATGTTTGTGC
AACCTGGAACACTAAAACTTCATGTTCCATCGAGTGTATTGTGCTAACCA
TCACCTTAACACTCAAACTTCAGGAACAAGTTATATGCAGAGTTCAATAT
CAGCTACAGGAACAAGTTAGTCAGAATAATCAGGCTACAATTTGGCTTTC
CATTTCTGCTCATTGTATCCCTTACACAATTAGGCTGACCTGTACACTCT
CCTCATTTCTTGTGTCATTTTCTACAGGTTTAATGTTGACAGAAGTGATA
CATCCAATAGAAGATCATATCAGGAGGGTGGAGGCAGATAGCCTGACACA
TGACATGAATGGCCTACAGAGACATAATACCTAACCTACGTCGTTTCATC
CTTGGTGAGGCTGAGTGCTCAGGCTTCTCCGCGACACAAGTGGCAGAGAT
AACAGTGTAAGGGGGCAACCTTGACTCCCACACCAGCTCAAACTTCATGG
GCAGAACAACAGAGCCTGCTATTATATCTCCAAACGTCATCCTGGGGAGC
TCACCTGGTCTGGAAGAGTGCTTTCCACCAACCAGCAGCCTAAGTCGAGA
CGATGACGGTGAGAACGCGGTGATGTCGACGGTGCTACCTCTGTCAAGAA
GAGCTCTCGGGTGTTCTCCGGAGATGGAAAGATTAGCCTCCATCACTGCT
CTGTACAGTTTCAGGACACGGATCCAGAACTGAACATTCAGGTTGATCCT
CAGCATGCTGGAGTAGACGCTCAGATGGACAAGTGACCCCTTCATCATCG
TTGCTAGTTCCTTCCCTATCAAGGCTAGCCGCGGGTGGTCCGCCGGGTCG
GAGCTTCCAAACGACAGGACCTTGAAAAGGTAGCTGTATTCCTCTTGCGA
GAGGCTGTTGATCCGTACCAGGTTCACGGTTCCAAACCTCGCTAGCCTCT
CGAGCCGGCTTATGATCACAACTTTGCTTCCTGCGCCCGTCAGAGTTAAC
AGCAGCGAATGAAACTCGTGCCATTCCTTGTCATCCACGTCTGACTGAAT
CTCAACGATGACCAAAGTCCTGACATTGCTGAACCTGCCACGGTCAATCG
TTCGAGTGTCGCATCCGTTGACATGGATGATGGAGGAGAAGCGAGAGCGG
ATCCTCTCGTCGGAGCAGACGCTCCAGGCAAAGGTCTTCTTGCCTACCCT
GCAGCCACCGATGATCGGCAGCACCGTCGGAACCTTGTTGAGCGGGTAGC
TTCTGTCCTGCATCAGGACGTTGATGACATGCTGCCTCTCTACCTGGCGT
CCGAACATGAAGTTGTCGATGTGAAGGTAGGGGCTGTACGGTCTGCGAGA
CATGTGATCGCAGCCTGTCAGGAGGGCGATGAATTCAGTCATCTCTCCGG
TGGCGGCCTCTAATTTCTCCAACGCAGCCTGCACCTCTCTGCTAACAGTT
GTGCTGCTAAAACGTCTGACAGTTGCGAAATTGATGGTGTCTGAGTCTGA
GCCACTCACCTTCATTTGTGCTCTGATCTGTTCCAAGGGACCATAGGTGT
CCAGGACATCGTACCCCTGGTACATGGCCTCCGTGAGCATCCTGAGCTGC
GCCAGCATCCTCGAGTTGGCGATGTACCGCCCCTCGGCCTCCTCGACGAC
GGCGTGCACCCTGAGTAGGAGCCGACGCAGCGATTCCAGGCTCTGCTCCC
TGCTCAGGCATAGGCATGCCCGCTCTCTGTACTTGCCGATGACGAAAGAC
ATGAGCCGGCTGACCAGCTCGCTTGCCACCGCAGATAGAGCAATGTCCAT
GCTTCTCTTGCTACGTGTGTTGGCGCGAGATGAACACACAGAGGAGCATG
ACTGATGATATGATGCCTGAGATGCACGGCTTGGACTGGTCTGGACTCAC
CAGGGAACGACACCTCGGCGTCTATTATTGGTTCGACTTCAACATTGTTG
ACCCCTCTGACCCCCATCTTTGCCGCGTGTCCTACCGATTGCGCCAACAC
CAAGCGTTCCAGGCGCTTCCAAAGGTATTCCACCATAGCTCCTGTCCCCA
CGTCCTTTCATGTTCTACTATAGTTAAAGCAGCTAGTAGAAAACCGACAT
AACTAGTTAAAGTAAGCATGAAAGAATTAATTTCCTTTTATTTTTTTTAC
TACACTACATATGTTGGTAAAGCACTTACCTAAGTTATGGGAAATTCATA
ATTCATCAGTCAGTTATTTTAGAGAATACTAAAAAACAAGATAGAGTGAG
ATACGGAAGTGTAAAATAAAGTAGATTCATCAGATGATACATGAGTCCCT
AATTCCGAATCAAGAGATTGTTATTGTTGTGGAATTTGTCAATTGAGTAA
ACTAATAATATTAAAAACTAGATCATGTAATCCCATTGAAAAAATGGAAT
TCGATTTTCAGGGAAATTTTGGAATAAGTAGAGAACTCGGCGGCGGCGAC
ATGCCGCGCCCGTGTTGTTAACTCATCTGGTAACAAACACATTTTGTGCA
CTGTTAGAAAATATGGATGAAATATACCAAAGCAAAATTTGCGGAATAAT
TTTTCCAGAACAGTTACCATCAGGAATTACATCTGAGACCGAAGAGACGC
ACCGAGCAATTACCATCAGAGCACGCCGACGGAGGATCACCCTCGAATTA
CCATTATCAGGTTGAAAATCTGCGGCTAGAAATTGATCATCCTCAAATTA
CCATTGCCAAGTTGAAAAAAATGAGTTGGAACCCTCTAAGTAGGCTACTA
TCATCACCGTCGTGTAGTTAAAAAATGAGCTGGAAAATATTACCATAGAC
GTAGGCTAATCACTGTCGGAAAATAATGGCAGGGAACTGCGTCGAAGAAT
TAATGTAGAATAACTTTTACCAAAAAGATATGGCTTTGTCGGAATCACGT
CAAAAAATTGCGGTTGAGAAGACGCATCATAATTACGCTGGAAAACAAAG
AAATAAGAAAAATGACCCGAAGGTTAAAAAGAGCTAGAACAAGTTGTGTT
GTAGCCGTAGGCTAACTAATGTCGGAAAATGACGGCGGGGAAGTGCGCCA
AAAAATTACCATCTGGTGGTGAAAAAAGTTACCGTAAAGTAGTCTGGAAG
TAGGTTAAAAAACTATTACCATAGACATAGGCTATCTACTATCGAGAAGT
GAAAACAGGGAAAAAAACACACACTGTAGCAGCCCGTACTGTCCGTGTCG
CGGAACTGTTCATATGAATAGTAAATCGATGCCCCGAGAGGCCGATAACC
CCACGCCCTTTAATATACATGTATATTTGTTTGATTCGAATTTGAGGTCC
GGTTTATCGGTGAGGAGTTGATTTTAGGGTATGATTAATACTCGAGAGGT
ATTAGAGCATCTCCACTCGGGGTCCTAAAGGCCCGCTAAAGGGCTATGGG
GGTGCCGACGCTCAAAATCACGCCCAGCGGGCCATTTTGTCATCCGGAGC
CCCCGACCGAACCCAACCCAAGGGGGGAGGGCAAGCGGGGGCGCCGGATA
GAGCTGAAAACGACACGGGCCAGTCCTGGCAGTGAGATAGACGACTCGTC
TTCCAAGCGTCGTCCCGTCGCCGGTCACACGACGACAAAATTACTCGCCA
GCGCGTTCTCCCACCATGCCCTTCCCGCCTTTTCTACTGCTTCCCGCCCT
TTTCTCGCTATATGTAGGCACATTGGCCATCGCCATTGCAGATCTACACC
ATGACCAAACCTCACACCCTCTCCTGCAATACCTAGGGCGGCGGCAGGAG
GTGCTTCTTTCGCCAGATCTACACTAATACCATGCCTGGCCACCATGGTT
CCCCGTCTCACCTACCGTTTGCGGGAGAGCCATGACACCCGTTTCCACCT
CTCCCTGCCCAACCACACCGACTCGGAGTGCTCCGACATGGAGTGGGTCG
ACTCCGACGACCCCGACATAGCCAACACCGAAGAGCTGGGCTGGGCCAGT
TCCGACCCCGAGTCCGAGGAGCCACTCGACCAACAGGTGACCAACCGTCG
TATTCGACGTGAGTATGGACGAGGGATTCCGCGGTCGCCAATACCCCACG
GCCGGCTTACCAGCCAATGACGAGCCTTACGGGTGGGACATCTTCTGCAA
AGTTTTCCTGCCAAAGCACCGCCAGCTGCAAGAACTCGATGACGTCTACA
GACGGTTCCTCTATGCATCGCGCAGAGAACCCAGCGACGCTGACTTGCGT
GCAAGGCGTGGCCGAGCACGGGAGCAGGCAGACACGCAGCTAGCAAGATA
CAACTCGGTGTTTGACCTGTGGGATGTTGCCAGAGGGCCGCCACCGCCGA
CTCCGCGCCGCCCTCCTGGCGAGAGCAGCGCCGCCGGAGGCATTAGTTTA
TCTTTTCTTTTCAATGTAAATTGAAGTGTCTATGAATGTTGAAATTAAAG
TGTTTGAATGTTTTATTATTTTTTGTAGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGCAC
AACTCAGAGCCAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACAAT
CGTGAACTTATCCCCCCGTACAGTCCAAAATGGATGCGTATTAGGGGATG
AGTGAAGATTCTCTTAGAACAATCAAATAGACCATAAATATGCGCGTTGT
TGCGCCCGTCCATATATGATGAAATTATACACATGGTTTTAAAATATATA
GATAATTCCATTTTATATTAAAAATAATTGAGATATATTTTTTATATGTG
TTAATTTAGTGGGATACAATAGTATTGCTTTCTAGATCTTAATCTTCTGG
CCTTGTGAATGTTGTATTATGGCTAGATTATATGGATCATTAGCTGATTT
TATTTATCTCGGTCAAAAGGTTAGGAAGGTTAGGGGACTCCGTGCCTGCC
CCCATATTCGGTAGCATTGTCGACGTCTTGCTAAGTTAACTAGGAAATTG
TTGCCGCGGACAAAGAAAAACTCATGGACTAGGCCTGATAGATTCGTCGA
AGTTAAACTCACCTAGCTTGCTAGACTAGAAAGTAGAAATGACTGATCAA
TTCGGTCTTTTGCGACTTAGAGAACTAGCTGATTGGTCAATCTAGAGAAG
ACATGGCAGCACGTCTCAAGGATGTTCTCATTTGGTCATTTAACCTTTAT
CTTGCACGAATTTTTGTCACATGATGCATCAGGGGATATCTCTATTTAAC
ACCGTTAGTGCTCAAAATAAACTAGAGTGTTATATAAGGCAAAATTTTTG
GACAAAGTGTCAAATAGGAAAGAAAAACTTTCCTGATGTCAAATAAGAAA
TCATATTTGAAACAGTGTCAAATAAGAAATCTCTCTTATTAGTAAGGTAT
AGATTGGTGCAGGACCGTAATCATACGTGAGAACTGGGATGATATTCACC
CAGTCGCGGGCTGTTAGGTGGGGTATTGGGCTGGCCTGGGTAGGTTCAGC
CCTGTTAACAGGGTTCTTTTGGTCAATTCAGGTAATAAATGTTTAAAACC
GAAAAATTAAATTCGGTTTTTAAAAACTACGGAGCGAATTAGGCACCGAA
ATCTTGGTTTCGATCAGTTCTAGATCTGTCCTGGTTCTTTCGGTTTGGTA
TTTCAGTTCTCGGTTAAAATGCCTACCCCTACTCTACGAGGCGGGCAAGC
TTCATGCCTCCGCCGACAGCATGTGCAGCGGGTCTCACCGGTGCTGCTAC
ATGAAAAAACGGCCTGGAAGTATCGATACATGGTCTTTTGTTAATCCAAT
TGTCAACAAATAAAAACTTATTTTCTGGACCAGAGAGTTGTAGCTCGAAA
ACTTCAAATATTATTCCTCACAACTTGATTTTGTCGAACACAAGCATTTT
CACACACGACAAAGATAAATCATTTATTATTGCATATAATGCACTTGCAA
CCATCTTGATAGCACCCCGTGGCAAGATTGACGGTGCATCCTGGGCATAG
CGTATGCTCTAGCCTCGCCTGACACGCCTTTTCACAATTTTCATCATCAC
AGATAGACGGTAGAGGGATCATATAAATATTACACCCATTTTTCGCATCT
GTAAAGTTAAAATATTGCACCATGAAAAATTGTATACAATGAAAAAAAAT
CAAGCCACACAACATGGCTATAGATTGCCAAAGGACAAAATACACGAGCA
CGAGAAACGTATAAGTAGATACCAGTTGAAAGTGTGGTGGATGCGATGAT
CAGAAGCAACATCAGAATTGTGGACCTCCTCGCCATCTTAGTTAGATATA
GCGTCGATCAATGGGAGATATTGTATATAGTTTGGTTTTGTTACACGGGG
GTGGTGGAAGAGATGAACTTTTATAGAGCACATGACATAAATGCTCATTA
TTACTCCATTAATAATTTTATAATAAGTAGTATTCAAGATTTTTAGTGAC
ATAAATGCTAATTATTACGGGTGATAATTTTCGTATATTTTATAGGATTT
TTAACTAGGTAAACACTAATTACCGGGTGCCATTGGATACAAATCATCGA
ACCCCCTGGACACCGTCTATCTCATCTCAAGCAAACAGTTGGTCTTGCTT
AATTACGTCGGTGGTAAGTCTGGGTAATCGCACTCGCTAATCCCTTTAAC
ACAGGTGACCAGCACACTAGGGTCGGAGGCGGCTTAGGCTCTGTTTGTTT
GGGCTTTAGCTTCTGCTTCTGGGGCTTTTGGGGGCGCAAAAGCAGCAGGC
CAAACAAACAACAAAAAACTGCAAAGCGACGCTTAAAAAGCTGGGTTGCG
AAATGCACTAGACGAGGAGGCTCCGCGAGCGAAAGCAAGGCCAGGGGTGC
TTTTTGATGCTTCTCGAGCTTCTGAAAATGGAGCGGACGGTAATTCCCCC
TGGACTTCGGAAAAATTGCAGCGAACTACCACCGCGCCCACAACTCATCC
TGTCGACTGCCCAGTTTCCCCTCGCAGTCTCGCGCGAGGCATGGGCCCAT
CGCCACCGCCAACGCTCGGTTCTTTCCCCGCCACCGCCAGCGCCCATCCC
CTCCGCCATCGCTCGATTCCTTCCTCCCCCCTCCCCCCCCCTCCCCCCCG
CCCCGCTGTCCCCAGGCTCGAGCTCATCTCCACCGCCGCCACCAGCGCCC
TTCCCCGCTGCCGGCCATAGCTCTACACCTCCACCTCCGCAGCATTCCTA
CTCCTCTCTGATGGTAGCTTGGGGGATTCCGTCGCTGCTCCTATCCTTTC
CCCATTAGGATAGGTGAATTTATTTTTTATTTTTTCTAATTTGCAACTAA
GGATCAGTACAACAACCAAAATCTGGGATCTTTTAATTTGAAGTATTTTG
TTTGCCCCGAAAAAGATGTTTACAATTGAATGGTCGAAATTAGCTAATTC
GAATCATATTATTCTATTACTCGAATAAAAATAGAGAATATTTCATGTTC
TATGTTTCATATAATATAGAAGTCTTGTAATATAATTACTGCTAAAATTT
CACCAAAAGCCAAAACCCAAAAGCCAAAAGCTAAAAGCACATTTATATTT
ATTTCACCAAAAGCCAAAGGCCAAAATTTGTAATATGGAAGATAGAAGCC
AAAAGCCAAAAGCTAAAAGCACATTTATATTTATTTTAGCGCAAAAAACA
TGTTATTTGAGATAATTTAGCTCTTCAGGAATGCTAGTTATGTAAAAAAA
GAGTCAGAATTAGCTAATTCACTTTGAATCATCATTTATACAACTTCCTC
AACATTCAGGGGTATTTTTGACATTTCATTCTTAAAACAGCAGCAGCAAC
CATGAAAAAGCACTACTTCCAAACATCAAATCTCTGCTCCAACAGCTGCT
TCTACCAGCTGCTTCTCAACAGCTGCAGCCCAAACAAACAGACCCTTAGG
CCCTATTTGTTTGTTGAAGCAGCTGGTCGTGGATGATCCTCCTCGCCCTT
GTGATTGCTCTTCCAGGTAGAAATTCTTGGATTCTACGACATTGATGGCA
AGCTGTGCGTGAGAGATCATTATGTATGCTTCTCTTGTCAGGCACATATC
CTTCATTTTATTTGCCATTTGTTTCTCCACAGGACATTGTTGGAAGGGCC
GAGATGATGTACTTGCGGACCGTGCCTTCTTTGCACATGCCGTAAGAGCA
AGTCTAACAGCACCCTTAAACGGGGCAAACCCTCAAAATAACAGCCGTTT
TAAGGTTTTTGGCGAGAAATCGGCTGCGATCAGTACCCTCAAATCACACG
ATCCTTAAAAAAAAGTAAGGGCCGACTTGTAAACCCGCTCTCCACCCGCA
CAAACCAGGGTTAGAGAGGGCGACCTGAACGCGCCCCGCACTCCACTGTT
CCTTTGCGGGCGAGATATTTCAGCTCGTCCCCCTTCCTGCCCGCCGCCGA
TCTCCGCGCCCCCGCCGTCTCCTGCACCGCCGCGGCCGGATACTGACGGC
ATGGAACTGGGATGTAATGTAAATTCATTACTCTGGCTTATTCTCAATAT
GTTTGTTTACTTGTATGCAAGTCAGTTCCGGTACTAGCAGTATGAAGAAT
CAAACACTTAAACTTTCTGTACTAGCAGTATGAAACATCCTCTGTTTCCT
ACAGTTTGACTTAACCCTGTGAATAATCACTATTTTGTTGTTGATATCCA
AAAGGTTTGATTCTGGCTTTCAAGCTGAAGAAAATTCTTGCTGATGCTGA
CTTGGAACAAAATGGTGGATACAATGGTGATTTAATAAAACAGCGTCTGA
TTCTGATTCCTAGAGTTCATCTACAACTGTTGTTACCAAACAAGAACATC
TACAACTGACTGTATGAGGGAGCCTTACTGTCTACAGGCCCTAGAATAAT
ATGATGCAGGTTCAAGCATGTTCACAGAGAGTCAGACAGGTGACCAGTAT
TCTCTTCCTTAAAAACCATGCTTCATTACTGCCAAAATATCTCAAATCAT
CAACTTAGTTAATGCTAGCAACAAAACTGAAAATGACCTGTTATGTGATG
TGAGCATGTGACAACTGCTTGTTCAGTTTGGTTCATGCCTAGGCTCCTAG
TACTCTGCATGTTTGTGCAACCTGGAACACTAAAACTTCATGTTCCATCG
AGTGTATTGTGCTAACCATCACCTTAACACTCAAACTTCAGGAACAAGTT
ATATGCAGAGTTCAATATCAGCTACAGGAACAAGTTAGTCAGAATAATCA
GGCTACAATTTGGCTTTCCATTTCTGCTCATTGTATCCCTTACACAATTA
GGCTCACCTGTACACTCTCCTCATTTCTTGTGTCATTTTCTACAGGTTTA
ATGTTAACAGAAAGTGATACAGTCAATCGAAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.