Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA007141

[Submit comment/correction]

Sequence
AA007141
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007141
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAAAGGAAAAAAAAAACGTCGCCCAGCGGCCCTGCATCCATCCATGGCG
TTCGCGGGCGACCTCCCGTCCCGGACGCCCCCGCGTACTTCTCACCGCCT
CCCTCCCTCGCGAAGCGGGCGGACTTCTCTCGACGCCCCACCACCACCAC
CACCGCACCCCGTCTGCGCCGATCGAGATCCGCCGCCCTGCGCTGATCGA
GATCCCTCGCCGCCTCGGCTCCTCCAGAAACAGGTACGTAATTTCAAACG
CGGGGCTATACCAATGCCGATGCTGGCTACTAGGATTTTGGTTTCCGATC
GGAGATTGGAGAACCCACGATTGTTTCTGCTACTACATTCTTCCTGCCTG
ATACTCCCGCATTGTCGTGCCCTCGCTTTGATTATCTTACGAACATGATC
CTTACATGTTCGACGAAATTCTTGATTGGGCAATCAAGCCTCCTCTAATT
CAGAATCCGGTACCTGATTTCTCTAATTCCTAGAGGGTGGAAGGAGATAG
TTTCAATTAAAACAATGCCGCTGCTGCTTAATATTTCAGGCTACTACCCT
GCAATGGCCGCGCCGCCGGACGACGCACCATCGCCGCCGACGCCGAAGCT
GCACACGCGGCTGAGGCTGTGGGAGTTCCCGGACCGCTACATGTTCGAGC
CCGTGGACGGCCTCGCCGACCTGTTCCTCTCTGTAAACCGGACCAGCGGA
TCCATGGACCTGGTGGAGGAGCTGCCGCCGCGTGGCCCCTCGGCGAACCC
CAACGTCAGGATAGTGTTTGGCGTGATGGGAGTGCTCAGGCTCGCCGCAG
GATCGTATTTCCTGGTCATCACCGACCGCAACTGCGTCGGCTCATACATG
GGGCACGCGGTTTTCAGAGTCACGGGGATGAAAGCTCTGCCCTTCCATAC
CTCTTCTTCGGCCGAGCAGGTCCGACACTGATTACTTACTTTGTTCCCCG
CCAGATTATGTTGTTTCCATCTGTGTTCTGTTTTTGTAACTGACCTGGAA
TGACATGGCAACAGAAGAAGATGGAGAAGGAGTTCTCGGACCTCCTGAGC
GCTGCAGAGAGGTCTATAGGCCTCTACTTCTCCTACGAGACCAACTTGAC
AATTACGTGGGTATTTTATATATATGGTTCACTTCTTTTACCAATTTTTG
TCATTTACTTGTACATAGAGGAGTGCCAAAGAAAACATGTACTTAGCTTG
GTAAATTGGCTGGCAAATATTCTCCTAGTTAAATTTTAGAATCAACCCAT
GTGATCATGCTATTGTCTTAATTTACTCATGTTCTTCCCTTGGCATTGCA
AGTATGCAGCATTTATCTTCACATCCCTTTTATCATGTTACAGCTTACAG
AGGCTATATGACCTGGGGGACAAGTTCAAGGCACTTCCACTCTGGAAACA
GGTTCGTTGCCTTCTATTCATGTGATGCCTCGATCTTGTTTACACATGGA
AGGGCCAATCTTTCTCCATCTGTTTTTCGCTTTTTGAGTACTCTGCAAGT
GTTTGTTGTTTTTCCTCCACTTCATTGGATGCTACGTCGTAGTTTCTAAA
GAACATTTGGAGTAACAATATGAACAAAGTAATCGCCGGTATCAGCTGCC
CAAACATAGGCCTTCGTGCAAATTTGCATAAAGCAACACAATTTTTGTTT
CTAATTGTTTCTTGTACTAGTAAATGTGCCTCTGAACATCCTAATACAAC
TCTTTTGTGTTCTCCCGACTACTAGTGCACAGACCAATTTACTACATTCT
TTGCAGGCAGAACCAAGATTTCTATGGAATGGTTACTTGTTGGAGCCACT
AATCGAGACCAAAGTAGGTTTAACCTTTTATTTTTGTAATTTCTAGTTTT
AAGAATCTAATATAATCCATTGTCTAACAATTTTTTTATTTATCCTTTCT
TCCTTGACAGCTGGACCAATACTTGTTGCCGGTGTTTCAAGGAAGTATCC
TTGGATCATTGTCATATTCTAGCTCGCTACCCAAGATAACAGATCATGAT
TTAGTCTCCCAGTTCCAAAATAGATGACGTGTTTGACTTTGCACAGTCTA
AAATATACAATTTGACCATTACTCTTGGCATCAATGTGTAAGTAAAAGAT
TAGAAGATTTTACTACGATTTCTATCTAAATAATCTGAGTAGTGTTTCGG
AGTTTACACCAATGCCACTACTTCAGAACCCAATTCCATTCCTGGTACTG
GGGACTGATGGTGTTGACGAGAGTAAAACTGATGGGAGTAGCATATATCA
AATAGCATAGTTGCATTTGTGTAGTTCATGGAAAAACAATGGGAGAAGCT
GAATTGGGTTTGAGAATAGTGGCATTGTTGTGAAATTTCCATTTTTATTA
ATTACTGTTCAATAGAGAAGTTTGACTGCACTCTCTCTAGGGCGTCATCT
GTTTTAGAACACAGGGACTATTACTTGTATCAGTTATCTCAATTTGAGTT
GTTGTAACTTAACTACAAATCAGGTTTTCAGAATATACATGCAGAAGTTG
GGTCAGAAAAGGTAATGGTAACCATGATTGCACGCAGATGCACACGAAGG
ATAGGTGAGAGTTCTGAAGCATCAAAATAAGTTTGATCTTTAGTTTAATT
TCACTAATTTAGACTCATTCCTGGCCATATTTTCTCATTAAATTCAATAG
CTTCTGGACTTTACAAGGCTGTTGTTTACTGAAGGTACACGGTGTTGGAG
ACGAGGCGCTGATCCAGAGGGCTACGCAGCAAATTTTGTTGAATCAGAGC
AGATAATGCAATCAAAGGGATTTACAGCATCATATGTACAAGTAAGTTTC
TATGCACAATTTTAAAATCAACAGATTAGACTATTGGTTTTTTAATATAT
TTTATGTTGAAAGGTCTCCTCTTCCGGTTCCTTTATTTATTTATTTATTT
TATGTGCTTAATGTTTTGAAATTTTCACGAGGATCTTCAGACTCAATTAC
AGTTTCACCAACTAATTTTACACAACTTGAAGTGGAGCTCCAACATTAAA
TAAAAAATTCTCTGCCATAGGCCCTTCTGTTGTTTCCACAAAATTTTAAA
TCCAACCCGATCTGACCCGTGAACCTGACAGTTTGGGCCTGCCGTAAGCA
AATGACAGTCAGATTGTCAGATTTGCAGGCTGGTGTCGACAACTACTGCA
ATGCAAGGTTGAAATATGTGGTGTTAGGAACAAAGAAATACTAACCCTCA
TGTTTTACTCAAGAGATGCTAAATTAGGATGTGCAAACTGCATAATTACT
TTTTTTATCATCTCCAAATAACTCAATGTAACTACTGTATATTGCAGGTT
CGAGGTTCAATGCCTTTTCTGTGGGAGCAGATAGTTGATTTGACATACAA
ACCTAGTTTTGATGTCATTAGAGTAGAGGAGGCGGTGAGCTGTCTCAATC
TTTTTTTCTATTTTCTTTTATCATCAGGGCATTGATAAATTTTTGAGCTA
TGCACTGCAATGCAATATTGGTTAAGTTTTCTTCATCCTAATTTGACTTG
AGTTTTTGTTCTGCAGGCTCGTGTTCTTGAGCGACACTTTCATGATTTAC
AAAAGAGATATGGAGCTGTCGTGGCTATTGATCTCGTCAATAGTGTAAGT
ATTGCACTCATGGACTCGCTACACTACGTGGTTTCTAGGAAAACTACTAT
TCCCTCCGTCTCAAAATAGATGTCTTAGATTTTTCAAATTTTGGATGAAT
TTGTCTAGATTCATCCAAAATTTGAAAAATCTAAGAAATCTATTTTGAGA
CGGAGGGAGTGCGATTTTTGGTTGCTGCTCCAGCATAAAGCTGTAAGATT
TACAAGATCAGATTCTAAATTCTTCATTTAGGAATTATGTCCCATATTTG
TTCTGCACACTGCTATGGCATCTTTGGTTCTACATATTTCACTCCTTTCA
ATGGAACTAAGCTATTCCGTTCAGATTATGCCCCATAAAAAAGTGTAGCT
ATGTTTTGCCAGAAGTTGCAAAATGCTTATTTACTGATTTTTTCTCTCGA
GAAAACGCAAAAGAGTTGGTGTTTCATTTCATTGAACAGGTAGAAAACAA
CGGGGTACAACCCCCAGAGGAGGGACCCCCCACCCCCCACACACACATGC
ACATACAACCGTCCTCACCAAGCTACTACGACAAGGTGAGGTGTCCTCAA
CTTCAGAAAACAACGACATTAGGCCTCAACTTTGCCTCCAGCCAAGAATG
GCGAGTTGAGACTTGGAGCAGGCAGCATCACTACCGTTGCAAGATGCCTC
CAGAGACGATTACAGTCCAGGACTGCCCAGGCCAATGTCCCTTGCACCCC
TTGTGCCTAGAGAGTCCGCGGGTGAAAGGCAAGGCCCGGCTGGAATTGGC
GTAGCTTTCGTCAAGGAAGTGTCGGCGCTGTGTAGCAGCCTACATCGGAG
AAACACATCGCCAACATCTCCAGTTGCAGCATCGGGCAGCGCCTTCAAAA
AGGGAACGACGCTGAGACGCCGCTGCTGCCCGGTCCAGGAGGCCGGACCT
GGGTTTCCCCCGCTGCTGGAGGAGGAAGTCCAGTTAGGGTCATGCCAGTG
CCTTCAAGAAGGTAACGGCGCCATCAGGCCGTTGACAGCGCAGGCTGATG
CCGCCCAGGGATCTCGCCCCGACCCAAGAACGATGGCCTCCGAAGACCAT
TGATGCAGGGGCAGACTGGAGGTGGCGAAGTAGGTTGCTGGAGTAGACAA
GCAGCGCAGGGGGAAGCCTAGAAACGTTTCCATTGAAGGAGGGCACCAGC
CAGCACAACGCCACCAGGCAAACCACCACCAGGAAACGCGTTGAGCAGGA
CTGGCGGCTATGGCCAGCCACCTGCACCACACCGCCACCGACCATGGCTG
CCGCTGCGCTGATCCATCCGCCAGCAGGAACCGCCGGGGCACAGCATAGC
AGCCACCGCAGGGTCAGCATCCACCGACGGCGGCCGGGAGGGGTAGGAGG
AGGGAGAAGGCTGGGTGAGGGCGGAGGGACAGTCGCGGGTCGGGGCAAGC
CCACGTGGCGCAGATCTGGGGGACCGCATCCCCACACGCGCTTCCAGTGG
CCGGCTGCCGCCTCAGCAGCGCCGCCGCGAGCATCACGCACCTGCTTCTC
GACCTCCCCTGCGCAGGCTACCACCTGCCGTGCCACCGCGCGCTTCCGCG
GTGCCACCGTGTCGATTCTCAACCCGCCGGCGCACGAATGAAGGTCGCAC
CGCCGCCGTCCGCCGGCAAGGGTTTCTCCCTTCAGCATCCTCCAACAATG
GCGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGAGGGGGAGCTTGGGCGGCG
GCTAGGGTTTCGCCACCCGAGTCGCCCCTTGGGAGCGACACAGGGGCTGG
GGGCTCTCGTTTCAGTATGGGTTCTCGTATTCAATTCATTTACTGATTTT
ATTTTCATATTTGTATTTCTAGTCATGCTTGTGTATGCATATTTGTTGGT
TTAATGGTACTAGCTTACTTGACTTTCTAATTTTTATATTCAGACTGGTG
CTGAAGGCCGTCTGTATAAAAGATATGAACAATCAATTGAACCTATCCTC
AGTGAAGATATAAGGTGGTATTTTTCTCCACATTAGAGTTCCTCTATTGT
GGTCGACTGTTCCTAAATTTGCTATGTTTGCCTACTTACCGCAGATTCGT
GCATTTTGACTTCCATAAAATCTGTGGCCATATTCATTTTGAGCGCCTTT
CCCAGTTGTATGATCAAATTGAGGATTATCTTAAGAAGCATAAGTAAGTA
TCTCAAAGATATGAATTGAAGTTATACGTGATTTATCGCTTACCAATTTT
TTAGAATGTTTGATGATGTTAACTTCTACTACACTTTCTCTTGTTCTCTA
TTTCTGCAGTTGCTCAACTTTAACTGGATTTTGTTGCTTAACTATATCAG
CATAAACTCGTTTGTGTTGATGTTATATTAGATCGGTAATTTGTATTTGA
CTTAAAATTATTAATACCCCATGCTCACTGCAGAAAATAAACGTGTTTAA
TTAATGGTGTCTGGTTCCTGGTTTAGAGTGACAAGCTTCTACAGGAGATG
TCCCATTCATATAGCACTCTCTCTTACAACTTCTGAGGTTTTAATATTGA
GTGGAAACATTAGTATACTTAGACGGAGTATATATACACATCCCTGGTTG
TCGATTATTCCTACCACAGAAAAGAACTGCATAAGTCAACACATATTTCT
TGTGTGGTGTATGTGTATCTGCTCTAGCCTCCCGGCCACCTCTCTCATTT
ATGGGAAAAATGTCAGATCTCCCTCTCCAAAAGCAAGAAGAGGAAATCAT
GTGGAGGAACTAGGATTTTCTGTGCACACTATTTTGCTGATGTTCATACA
ATGTTGTAGATTTCTCTCGCTGCTTCCATCTCCATGGTCTTACTGATCTT
ATGTTATAGGTACTTCCTTTTGAATGAGGAAGGCAAGAAAACGGAGGAAC
AGACTGGCACTGTCAGAACAAATTGTATCGATTGCTTAGATCGCACTAAT
GTAACTCAGGTACATACTTCCGAGCACAAGTTATCCCTTTTTTTCAACTT
CTGCTTCATCAATTGGTAACATGTGTCTGTGCTGATCCATCAACCCCTAC
AGCTTCTCCTTCTTTTGAAATTTATATATGGTGATATTTACTTTAGACAG
GAATTTCTACTCTATCTCTCTCCATGATACTCAGTTCTCGAACAGAACAT
CATATTGATGTACTCAGATTGCATGCCTCATTTACATCTAATCGCAGATC
ATACGTATTATATCAGTTTCAAAATATTTGTATTTGCGTGTTGGTCCATC
TTTTTGTGATGAGCCGTTACTGTATCGATCTTTTTGAAGTATTGCATTTT
CTCTTATCTTCCATCTTGACTTGCATACTGAACAGTAATAATATCTACAA
TGGTTAAACAGAGCATGGTTGGGAGAAAAATCCTTGAAAGCCAGCTCCAA
CGACTAGGTGTTCTTGGTGCTAACGATACAATCAGCAAGTACCCAGCTTT
TGATGCAGATTATAAAGTTTGTAAGTATTATGTTTGATTCACTAACCATG
GTTCATATTTCTACCCTCCCTACACTTTGTTTTGAACAATGTTGCTGGAA
CCAATTTCAGTGTGGGCTAATCATGGAGATGCAATAAGCACTCAGTACTC
TGGCACTCCTGCTTTGAAGGGAGACTTTGTCCGGTAATCTCTAGAAAGCG
ATTTCAACACCTTTTTTTTCAAGTGTTGCATTAAAATTTATAGCATCCTT
ATATGCTCCCTTTTCATTTACCCAATTTGGTTTACTAAATATTGATCATC
GCCACCTTGAGCATGATCACTGCTGAGCTGCTAATATTTAATTTAATTCA
AGGCTTTTAACATGCTGTAACATCTGGTGTACTCCCTCCGATTCATATTA
CTTGTCGTGAAAATGGATGTATCTAGACATGTTTTAGTGCTAGATACATC
CATTTCTGCGACAAGTAATATGGATCGGAGGGAGTAGTAAATTTCTTCTC
CTGTTTCACTTTCATAATGGCCGCTGTTAAATAGATGTACTTTTTACCGC
TACTGTGCAAAGTAATCATAACTGTCATCAGCGCAATCTGGGAAAAATTG
ACCTGTACAACTACAATAATCACACGATTTGGAAAATTTTCATGCGCCAG
TGCCAATATTGTATTATGTTTTTACATTCTGCTCTTTTTAGGTATTTAGC
TTTATGTTTGTATATCCATTTTATCGTTTCAAACTTTACAAAAAGAATAT
TATTGCATAATTTGTTATTCTTGAGTTGTCCATATTTATAATTTTTTTTG
GTCTACTAGGTACGGGAAACGAACTACCCAGGGGATTTTTAATGATCTAT
GGAATGCACTTGAGAGATACTACTTGAACAACTTTGCAGATGGTACTAAG
CAGGTAGTTTGCTCTCTTAGCCTGCATTTTCTGGCCCGGGGAAGCATCTG
CAACATGAGAAGACTTTGATTTTTGTAGAACAGGCTAATATATAGCTGCA
TTCTTTGATTTTATATGAGTGCGCACTAGTTTATGGGGAATCTAAGTGAA
GTATCTTGCTGAGCTGATGTTTTAGGATGGAATTGTAGTGCATAGATACC
TAATTGTTTTGTTATCTTTTTCTTGCGTTTCTAGGATGCCATGGATCTTC
TTCAAGGACATTATGTATCATCTGTTAGTCGGGATATCGCAGTTCCAGGC
AAACCAGGAGCTCTGGAGGTGGGTATTTAGCTGGTCCAGTGGAAAAAACT
TCTTTAATGCATACTATTTGACATTGCAATAATTATTAGTTCCACATTGC
ACTGAAGGCTGTCTTTCTTGCACGGTTTCTCCTTTGCAGTCATTCCGCAT
TGCTTTTGCATTGATTCTGGTTGCTGCTATGTTCATGATGATATCACTCC
TTCAAGGTAAAGTTTCTGACCGCAGGAATTCACATAGCCAAATGGTTTTA
ATTAGTTTAAGCTAATTAGGGCGCTCATAAGGTTTACTTACATTCACATA
GCCGAATCATTTTGTCGATCTATGCAGTACTGTAGACCTCTTGTAAATGT
AATGTAGTGACTTGATGTTGTCTTTGCACAAAGAGAACTATTGAGGAATG
GAGAACACATGGAAATTGCGTGGGTAGTCATTCAGATAGGACACATGAAT
ACCACAGAGGAAACTGCCTCGATCCAGTGTGGATGTGTAGAAAAGAACAG
GTCCAAGTGGATGTTGAAACTCTTCTGGAATTAAGGGCACATGAAGGGAA
TTCATAGGAATTTAGAGCATTATTCCTTTCTTCATATATGACCTCTATAG
GATAAGATCTAAAAATCCAAAAGATCGGAAACTTAGGATAATCCCACAAC
CCAAGGCAGGCATATTTATGGGGAAGTTTAACTTAGTCCGTTTCATGCTG
AGTGATATTTTTGTTTTCCAGAATTTGTGCTGTATTGACATGTAACTCGA
TTCTAATGCCTTCTCGTAATCCATAACTTTTTCAGCCCGGAATGATCTTC
GCCATTTGGTGGTAGCACTTGTGTGGGCCGGTCTCTGCATCGGCATCACG
CAATATGTCAAGAAGAACGGTCGCAAGTTCTGCAACCGACCTCGGTTTTT
CCTGTCACGCCATTGATATACGTGTGAAGATACCATTTGCATATGCCAAG
TGATACCATTCATAGAGCACTTTCCCTCCTCAATTTGGTAATATCATGTT
CTATTCCAGAACATCTCCATCCCAATTTTGTACTACACCCTCCAATCTGA
TTTAGTTGCTGCAGGTTTAAATCAGATCGGAGGTTGTATTAAGTTCCGTT
TCTAGTTTCCCGCAATTTCTTGTTTATAATCTTTCCATGTCAGGGAACTA
CACAGTTTGTGTAATTAGTTGGATATAATTGTAAATCCTCTATTGGTATA
CGATAGCAATTACTAACTGATGTACTACATGCAATACTGCAATTAACTGA
TGTACTACATGCAATACTATTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.