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GrainGenes Sequence Report: AA037142

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Sequence
AA037142
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037142
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGGAACTCCAAAGCAGCCAGCCCGGCACAACCGTAGCTGCAAGAGACGG
ACAGCGCCACCCCCGTCGCTTTCCTCACCGTACCCGTACCCGTACTCGTA
TTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTGTTCTCCGTCTCCAGCTCTCCCCTAAA
CAGCAAGCGAAGCGAGCGAGCAACCACCGCCAAAACCCAAACCCTAACCG
CCGCCACCACCACCACCACCACCACCATCCTCCCCATTTCCGGCTCGCCA
CTGCCCTTCCGTCCCCGTGCAACGCGCGCCAGATCGGCGGCCGGATCCAA
TGGCGCGCTCGCCGCCGCTGCTGCTGTAGCGCAGGGCGGCGGGGAGACCG
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GTGCCTAGTCTAGATACTCTATCCATGTCTGGAAGTCCAGAATTCAGTAT
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GTGCATCTACATTTTCTCATGTCATAATAACATGCTAATCAGGTTTTCAA
GAGTGGACATCTCTTCATATCATCGAAAGGTACCTCTCTAACTGTGCTAT
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AAGTTAAGAAGTATCTGATGAAAATCTGTTCTTGTGATGATAACTGAGAT
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TAAGAACGCTATTGCGTGCCTTGTCACCAGCATATGTGGGAACAAAAATA
TGTTACTATGTACATATTTCAATTGTCAACTGCAACTAGGCCACAGATTC
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TCTTTATTATGAAAGAGAACTCTTGCATATGTACTTTTCAGGACTTGGAT
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AAATACAACTATCATTGTTGCTAGTGCCGAACGTTTCAAAATTTCCTCCA
AAAGAGTAACCGCTCAACTGAAATGAAGTAAAATGCAGACAACTCTTGAG
ACTACTAGGTAGTAGATATGATGATTCATGCTGTCCTCTACATTGCCTCC
TTCCTGTAGAAATTAATGTGATAGTTCTATTTGATTTCAGTGTTCGTTGC
ATCTTCCACCTGCATACTGATACTGTTGTCATGCATGCTTATTCAACGTC
TTGGTGCTGATGTCAGACTGGTTATTCAGTATGACAACATCCTTAGGTCG
AATAATATTTCTCTTATGTCATCTTGGATCCAATGGTTATGTACATAAGT
TTCATAATGAGTCCAACCACTAGTGGATATAATGCATGTTTGGTAACCGT
ATCAAACAAATATTCTTTCTACAGTGATATGCTAAATATGGAGTATCATT
GAAAATTTTGCTCTCTGTATCTTAGTAGATGAAAATTTAGGCCTTGTGTG
CAAGCACACATTTCTTATCACTTCTTGACAAGTTCCTTATGTGGGCATTG
CAGAATACCTTGCCCCAGAGAAGTGGCGAAGTGAATGTTACTTTGGGAGG
GATTGATTTAAACAATTCTGGCAGGTATTTATCTCTTCTACTGGACATTT
TCATTTTAGGGATGTTGTGTGGCAGTATTATTGTATTAAAGTATTTTTCT
TGTGCAGTGTGGTAGTCAGAGAAGACAAAAAATTGCTGACTGTCCTTTTC
CCAGATGGTCGTGACGGTCGTGCTTTCACCCTTAAGGCATGGTTTCCAAC
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TCTCTTAAAATTATGCTTTTGCTTAATGCAGGCAGAAACTTCTGAAGATT
TATTTGAGTGGAAAACAGCATTAGAAGAAGCTCTTGCACAGGCTCCAAAT
GCAGCTCTTGTGATGGGGCATAATGGGATATTTCGTAATGACACTGCTGA
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TTTTCTCTAGAGCTTTAAACCACCTTTGCAGTTCAATCATACCAAATTTC
TTGCAGGGAGAGAGAAGAGGCCAATCAAGTCATTAGTTGTTGGCAGGCCA
ATTCTGCTTGCATTGGAAGATATTGATGGCAGCCCTTCTTTTCTAGAGAA
AGCTCTGCGCTATCTTGAGAAACATGGTAGGCGCAGAAAGAATGTTAACT
AGTAGAACCAATTTTTGAACCTGGAAACCTTACCTGTTTCTAATTAAGTT
ATCTTTATAACATTTATTCTAATTAAGTTATCTTTTCTTACAGGGATAAA
GGTGGAAGGAATTTTGCGTCAGGCTGCAGACGTGGAGGAGGTCGATAAGA
GGTTACAAGAATATGAACAAGGTTTACGTAATTTCATAACCAAATTTTTA
GCTTAGTACAGCGACATGGTTGTATTGACAACTCTTGTGCCGTGCTTTCC
TTGTGTTGATCAACGTATGTGTACTCTGTAACTGTTTCTATCTCATACCA
GGAAGAACCGAGTTTGCACCAGGTGAGGATGCACATATTGTCGGTGACTG
TGTGAAGGTATTTCACTCATTCAGTTACTAGTAATTAGAATAATTTTGGT
GCCACACAAGTATGGATTTTTCCTTCTTTCACTAACTAAATTCGTGGACA
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TCTTGCTGTACAGCATTGTTGGAAGCTTTTCGTAAGTTTTCTGTTCAGTT
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TAGCCGTCAGTAGCAATAGCTTTTCTCCAAATTGCCACACGTACCTTCAC
CTGTGTACCCAAGTACAACAGCAAACCGCAACTGAAGGAAGATTTACTTT
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GAGTACCCAAGTGATGTTGAATAAATCTCCTTACTATGTGAAGATTTAAC
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GAAACAGTGTATAAGAAGTACATAAAACTAGCATATGTATGACAGTGACT
CCCATATATATCTATCATTCCACGTGATATATAAACACTGCCAACATTTA
ATTTTTATTAGTAAAGAATGCATGGAAACAAAACTAAATCCCTTGTATAT
ACCCATCCATATAAAAAGCGAACGCCTACTTCCAATTTTGGTTCCGTCTC
GCTCTATTTGGTGAAGCCTGTAGATAAAGAGGAAGTGGGGAGTTTGCTTG
TGGACCATGCAGTTGTCATAGCCAGGATTGGTTGCGGCGAATTGGTGGTA
GGCTCTCAGCTCTCGCCTTCATCTATCCACTGGAAGGCTTCCCGTTGCCA
TTGTAGAGAGGCTCTGAGGCCTACTGGAGAAGGGAGAGAGAGGCTAGAAA
CCTTGTCTATTAATTGCTTCACTAAAACTGATGATATGCCATGCATTATA
TTGAGCCAGACCCTAAAAGCTTAATTTAATATTTCTAGCTAATAAGGATA
ACATCAAATAGATAAGATCCTATCGCTTGGATAAGGAAAGATATAACTAA
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GGTTGCTGAGGGAAGTGCTACATTACCATAGGTTCTACTCACATGAACAG
TACCAGCGACCATATTACCATAGACGTCGTTAATTTGCTCCAAGATATTG
TCGGCTTCTATCTGGTGCCTGCCATCTTCCCTAGTGCGGCCTCAGTCTGT
CTATAATAGCATCGTGTTCCCGTGATCGTGCTCTGATTATCTGTACACAC
TCCAAGTTCGAACAATTGGTTCATTACTTGATACATAGGTTTATCACTGA
ATATTATTATTTTATAAAGGTTCAGATAGCTCAAACAATTTGCTGCCTTT
TTATTGGTTATTAATGGTCCATATATTCTGTTATACATTCATAGGGATGG
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TGATCAACCTGAGCATTTTATGATTAACTTGTATGTGCTAATTGCACATG
AAATAACAACTTCTACTAATGTGGACTATTTTAGCTTCCCCTTTGACTGT
ACAGTTTTATCCCTTCTGACGTTGAATGAACTTTTCAGTTTGGACTAATA
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TGCAGAATTTTGAAAATGATGTACACCGTTGCTTCTCATACTGCTGAGAA
TCGGATGACAGCATCAGCAGTTGCTGCCTGTATGGCCCCTCTCTTGCTGC
GTCCGCTTTTGGCTGGGGAATGCGAGATGGATGAAGTGTTTGATATGGAT
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TAAGGTTCTCTGGCGCTGCAAGTATTTTACCTGCAAATCTTAGGTGGCTT
CATTTTCTTTCTGATAGTTGTTATAGGTATAAGTTTTTTTTCTCTTCAAA
TCTTATGTTGATTTGTTCACTATTAAAAATTTACTGTCCGTGCTGCACAT
ACGATTATTTCTGTGTACTGTGTCAATGGAGGTATGTGAGGCAGCTAGTG
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TTTGTACATGTACCATTGAATATTCATGTTTAATATTTTTGCAGGATGAA
AGCCTTGTTGGATCGTCCCCATCACCCGAGTCTCAGATTGAAGATAGTGG
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TCCAAAAATTCATTCAAATATGGAAATATCACCGAGTGAAAAAAATCCTT
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TCTTCTTTGGATCCTGGAATTTCTCTACCTAGCCATGGTTCTGAATATTC
TGCAGACAGACACTCAAACAAAACAAATGTGTCTCACCCACATGTGAAGC
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TCTTTTCCACTAAACGCCGATCTTATTTATTTACATTGCTGCTTCACTGG
GTGTTGATTTGCCTGTTAGGCTTCTGTTCTACACCTCCTCCAAATAAAAT
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ATTCTTGCATTGAGAACTCATTACTTAACAATGAATGTTACAAATTAGAT
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TCTGATACCTGTGCACTTTATGAACGCGGACACTTGTTTCAAGCTTGCCA
GTTTCTTCTTGGATGAACAAGTCCAATGGTCAATTTTGATTTCAATTTTC
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GCAGGCTCGAGGAAATGCAATTTTACAGGCGAGTTTGGAAAGAAGAAAGC
AAGCACTACATGAACGTCGCTTGGCCCTGGAACAGGATGTATGCTGCATT
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AGGTTGCTAGTTTGCTACTTTAGCTCTCAGGACAATGAGGGGGTTACCTC
TACAAAGAGTCCAAATCAAATAATCTTCCTAGCATAATGCAATATCCTGT
TTGTTTTGCTGGAAAGCATTTTTTCACTATGCTGACTTTCTTTTGTTGCT
GAAATTTGTGTGTTTTCTATACTGAGTAGTCATCAATGTCTATAATCCCT
AAAATTGCGTGAGAACATCCCGCTGGCCTCCCGATTTTGGATACCCTAGT
CTTAGCCAGTATTTGTGGTAACTGTCCAACCAGGTTCCTTCTGGGATTTG
GAGCCTCTCTCTACAGAAAAATTGTCTTGTATTGTATGCTAGCCTTGCCT
GTCAGTTACTCGGAAGTTAGACCGAGTTTGGTTAATTTATTCTTGGAAGG
ATCGAATTGGAAGCACCCCAAAATCAAGGAACCAAAATAAGATAGTGCAT
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TTTTCGTGCAGTTACTGTTGAACAAGTTCTGATATACTAAATGGTGATTG
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AGATGGAAATGATCGTTATCACCGTATTCCTGGCCATTTTTCACAGCAGT
AAGAATATCAATTTTTGTTCTTTCTTTTTTGTCGCCATTGATGATGCTGT
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TTAATAGTTCTATTTTATTGAAGTAAAATCTTCTTTATTTAGTGCCGAAT
TATGCTGCAGCTGGTCTTAACATGCTTCCTTTTCAGACCAGTTTTAACAC
GGCTTTCATTGCAGTCTTTATATTACTAGTTCTAGACATAAAACTGGATA
TGTTGTGCGCTCGTAATTTACTTGCCATATTATGACACTCTTTTATTGTT
ACCAGAAACTTTGTTCAACCAGGATTCGACATGAAGGTTGCCTTCTGTAA
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CTCAATGGTAATACTGAAACCTGTTGAAATTCCAGTTTCAAGAGCATGCC
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TATTAATTGTTAGTTTTGGAAATGAACAGTACCGTTATTAGTCATGTCTG
GTTATTTTTAAAAAAATCTGGAAATGTTGTCTTGCTTTTGCAGTATAGAG
TTATTGAGGTTTATCAGTTTTGTTGGAGTTCGCCTAAATCTGTATAATGG
TTCTAGATTCTTTTACTAGGACTACTCCCTCTGTCTCAAAATAGATGTCC
CAAATTTGTCTAAATTTGGATGTATCTAGACACTATTTAGTATATAGATA
CATCCAAATTTAGACAAATTCCTGACATCTATTTCGAGACGTAGTAAATT
CAGTATTGGACATATTTTTCCTGAGGACGTAATGAAGTTTCTTGGATGTT
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CCGTTGCCTGCATGTAGGTATATCAAAAGTCAAACATATGCTAATCTCAA
ATAAAAATTGCATTGGGTCGACTTTTAGAACACCTATATGCGGGTTTATG
CGGGCTTGTGCTTGCAGCCTTACTATCATCACATCAATGCTCATTTAGTT
TTGTCATGAGAAACTTAGAGCGTGTTTTTGCGTCCACAATGCTTTATGCT
TGGCCTGGACTTTCCCTGAGGTGTGCCTGGCCGTTGTTTGCTTCGTGTCC
TAGAAAACAAAATGCATGCCTGGCCTGGCATGTCATGTCTGGATCCGTGA
TTAGCCTGGCCTAGTGCAAAAAGTAAATACGAAAACAAATAAGCCCACCC
AGGCAGCATGATTAGCCTGGCCAGGCACCCCCTTTCCTTCGCCTAGGCAT
GCTGCTACTGCTGCCTGGTGCTAATCACCGGCCTATGGCAGTATGGCCCA
TAGTTTGACACAGCAGAAGGTCCAGGGTAGTAACCAGACACCGATACACC
AGGCTAGCCTTGCCAGGCAAAAATATCCACGCATTTCAGGCTTGATCCAG
GCACCACTTCTACCCAGGCATGTTGTTCAGGCCACATTCTTATACTATTA
GATTTGTAACGAAATTATCTTCATAATATCAAATTTACAATTGTATTATC
ATATTCATGTGAAAACTAATGGTCAAAGGTGCATATCGGATACCGTCTCC
CAAGTCCAAAATGTCATCTAGCTACGGACGGTGTTATTTTAATTCCAACT
CCCACAAGTCTGCTATATGCTGGTAGAAGTGGCCAACTGTTGGCCTGAAT
AAGGGTTACAAGAACTGGTGTCCTATAAAGTAGTGGGTACTTTGGGCAAT
CGATTGTTTAGTGTCATAAATTCTAGAAAGATTTGAACACAGAGAAAATT
AAGGGTTGTTTTCTTTTAGCAGACTCCTAGGTAATTTCTACTGATACTGT
ATTATTTTGGCAGGAGAGCTCAGTGGATGCATCACAATGGAGGAACATCA
AGCAACATGTACTACCTTATGGTTCTTCAAGACCGCTGACCCGCAAGCTT
TCCTTGGATGCGTCTTCAAGTGATTCAAGAGGCATAGAGGCATCAACAAG
CATGTCATCAGAGAGCACTTCTGTGGTAATCAATATCCCAAAGTTAACCG
AGGTTGGGGAAATCAAAACACTTTGTTCTCGTTAATTATACCATAAATAT
TAAGACGATTCATATTTATTGTATGGCAGGGTGTTGAATATGGGAGGCAG
CCAATGGTGGCATCCTCCACGTTGGTAGAACTAACAACTAGGCTAGATTT
CTTCAAAGAGCGGAGGTCGCAACTGATGGAACAACTCCATAGTCTTGATC
TGGGACATGGATCTGCTTCTCAGGGTTTTCCATACAAGCCACCTTCTCCT
TGGAACAGTCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.