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GrainGenes Sequence Report: AA044984

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Sequence
AA044984
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044984
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTTGCCTAAATCTTTCCCGTAGTCTACCGCCGTGTCGTACCTTAGCGTC
ACCGCCGGCGCCTCAATCCCCTCCCGCCCCCGCCTCCGCCTCCGACGCCC
CAATCCCGTCCTCAGGCACCTCAATCCGGCTCACCAGGGTCCCGCTCCCG
CTCCCCATCCCGACGCCCTCGCCTGTCACGCTCGTCGCAGCCGTCACTGC
CGTCGCCGTTCCCGTTCTTCCTCGTCGGAACGCCGCGTCTCCACCCCGCC
CGTAGTCGTTGCCCATTGAGTTTCGAGGTATGATGCGTTTTTCATCCAGC
TATTAGTTAAATCCCACTGACCTTCCCAACTTCTGGGTGCGCAGGTGCAC
ACCCGGCACACCATCTAGATCCGCCCCTGACCCCAACTGGTTGTAGCTTT
GAAGAGAATGGATAATAGTCAGAGCGAGAACCTTACGGACTCTAAGCAAG
ACGACGAGGCGCGCCAAAGCAAACAGGAAGATGAGGTAATCCTAATACAG
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CTTTCTTTTACTTCACCCACCCTGCAGTATTGACCCATGGCTACTAATCT
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TTATTTACCATTAGTGTCCATTCCATAGAAGTTGTGATAGAAAGTTCTGT
TTAATTTGAATGCCTGAAATTCATTTGCTTAAAGTCATATTGATGTATAG
CATGCGTGCAATGTGCAACTGCACAAAAAGAATTCAAAGAGTGTTACAAC
CATTCTTTGTTCTTATTCTTGTTATCGGTGAATAGTTTCTATGATAAACA
AACAGTGTGTCAAAGTGCATGAATGATAGTGTAGATGTTGCAGACAGTAT
GAGTTTCTTGCTATTGTCTCCATCTTTGCAATTCATATATATTTATTTGC
TAGTGTTATACTAAACTACAAGTAATCAGCTATTATTTTGACCAGTGTGT
AGTAGTGCTAGGACTAGTACAATAGACCAAGGTTCCATTTGAGTCATGAT
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TTTAAACCGTCTTCTTTTGAAACCACGATAGCAAAAGCTTATCCCAGTCA
GTAAATATTGAGACTGTACAACTAACTAGATTTGCATAAGAGAGCACAGG
ACAACAAACCGACTGCAAACTGTTTGTAAACCTTTTGGCTGAGAACTTCG
GCCATTAACATGTCCATTCATGTGCATGGAGAGGTTGGGTGGAACGAGGT
TGTTCAATACAACTTCAAAGGCATATGAGGGAGGAGGAACTGAGTGAATT
TTTGTTCAATACAAACACAAGTATATTATTGTAGGCGGTACATGAATGAA
ATTGAGAAAATATAACTGGATCTCAGGGTGAACAATTCCTATTTTGTTAC
CTCGCTAGTTTCAGATGTACCTTGAAGTTCCTGATATTTTTCAGCCATGT
TTATAAAGGAAGTTCTTCTCCCAACCTCACTCTGACAACCGGTATATTGC
TGTGTTCTATCTATTAGCTCATCTGTTCTTATTTTATCGCATGATCTTCT
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TTGTTGCGGATGAGGCATCAAACTATCTCTGTAGTTTATACACATCTTTT
TTGTCGTAGCAATGAAAATAAGATTGTACTCACTCAATTGCTCCATTTTC
GCTAGTCTTTTATCATCTTTTTACTTATTTTCATTCCTTTTATGTTTCTT
GGTTCCTCTCTATTCAAATGAGGATTAATATTTATAATCTTGAGTTGATA
CCTTTTCATCTTAACAAGTCATGTACATGTTTTTGTGGCATTGGTATGAT
CTGATATTATTCACTAATTTCAGATGTAAACTACCTGAGGACTCTTGACT
CAAGCATTAAACGGAATACAACAGTTATAAAGAAGCTCAAAACAATAAAT
GATGAACAAAAGGATGGATTAATGGATGAGTTGAAAAGTGTGAACTTGAG
CAAATTTGTCAGCGAAGCAGTTTCTTATATTTGTGAAGCTAAACTTCGTT
CTTCTGATATACAAGCTGCAGTTCAGGTAATTGATGTTAATTTGTAATCA
CCTCAGTACATGAGCAAAAAATTGCCCGTGTCATATGGCCGTCCCCTGTG
CCTTATGAAGATATTTTTGTTTATTGGACTTGTCTATTTCAAGCTTCCGT
GTTACAGAATGAAAGCATGTTCCCTGCTTTGGTGTGATCGTTTACATAGT
GCTGCTACGTATATTCTCAATTATTTCACTTGGACTTATTGGTTTAGATC
TTGCTGTTGCATTACATTTTTCAGTTTTTTTTTGCTTATTTGTCATCGTG
CTGTTACATGGCTTCATCACATCACTTTAGAGTTTGAGGTTTAGTTGATC
ATGAACATGTGAGCCTCTAAATACATCACTTCTATGTGAACTCATGTAAC
GTAATAACCCTTGTAGCAATGTAATGTAGGTTTGCTCACTGCTTCATCAA
AGATACAAGGATTTCTCACCTTGTCTTGTACAAGGTCTACTGAAGGTCTT
CTTTCCTGGTAAATCTGGCGAGGATCTGGATCTAGACAAAAATTCGAGAG
CTATGAAGAAGAGAAGCACCCTAAAGCTTCTGATTGAACTGTATTTTGTT
GGAATTGTTGAAGATGCTAGTATCTTTGTAAACATTATAAAAGACCTTAC
ATCACTGGAGCATTTGAAGGACCGGGAAGCAACTCAGACAAATCTGTCTC
TTCTCTCTTCCTTTGTTCGTCAAGGGAGGTTATTTATAGGATTACGGTCT
CATGGTCATGAATCAAATGATGAGGTAAGAGATATAAGTAGCAACATAGT
TTTATTGGGTATCAAATGGTCTCCGAACAAAATGATAACCACATTTGACA
TTTTAACTTCAACTGTAATAGGTAGAGTAGCTGTTTTTGCTAAGTTTGAG
GCACATCATTGAGTCCCAAAGTTACATTTTTTGTAATAGGTAGAGTAGCT
GTTTGCAGAATTTAGAAACGACCAGGGAATACTTAAATTGATGAGTCCAA
CTCATGTCAAAGTTGGCATGAATCAAGCTTATAAAAGCAAGATGGCTCAT
TATGAAAAAAATAGCTGGGAACTTTCGGAACTGTAATTGACTCTTTGATG
TAAAATTTACACTTAAACTAGATCCTAAGCATGGGAGGGACCTGCATGCA
TAGAATTATGATTCTGATAATTGGGCCTGCTCTCACCATCCTATGATGTT
TTATACACTATTCTCAAAGTCTACCGGTGCCGAATGTCTGCACTATATGC
CACCAATTGGTCAGAAGACTGATATGTTTCAGTGTCCATACTGGGCAAAC
CTACCAACATTATTTTAAATTGATGCAGTTCTTTAAGGATCTAAATGTTA
CTGCTGATCAGAAGAAGTTCTTCAAGAAAGTGTTGAACTCTTACTATGAT
GCCGTGTCTGAACTACTACAATCAGAAAATGCGGTAACTACACCCTTTCT
GTTTATTAATTTGGACTCCTATTTGTCTTTGCCTACCATCTAATATCTTA
CTGCATGTACCAACTATCCACTATATCCAGTCTCTTCGTCTGATGGAGGC
AGAGAATGCAAAAGTTTTAAGTGCCAAAGGGGAACTAAGTGATGAGAACA
CAGCTTCATATGAGAAACTCCGGAAGTCTTTTGATCAGTTACTACGTGGT
GTATCCTCGTGAGTATATATTCGAGAATGTCATTTCCAATATGTGTGTAT
TGAGTATTGACACATAGCAGCATAATCTGCGTTTTGTCCGGTTCTGTTAT
TCGTAGGCTTGTGACATATAATTACTTGTTGGGGTCTATTGTTGTTGAAT
ACAACAGCACAGGCTTGGCCCTTGTAATTTACTAGCTGTATTTGTTGGTA
CTGTTCATGCCCTATCTCCTTAATAATGTTACTAAATAATCTGATCATAT
GGAAATTTTGTATTTACACGAAATGGGATTCATTCATACAGTCATACTCA
TTGCAGCTAGGAGATAACATAAACTGTCTGCATAGTATCGGCTTCTCCCA
TACCACCTGACAATTTCAGCAGATAATTTCTTTCAATTCTGTAATCTGTA
CTACTCCCTCCGTTTCAAGGCTTAAGGCGTCCTCGTTTTGCGTGTTTTTT
CTTTGACCAAGAATTACTCTAAATACGTAAAGAGTTTTGGTATAAAACTA
GTATCACTGGAAAGTATTTTTCAATACGAATCCAACGGTACTAATTATGT
ATAATATAATTAAGATTTTGTTGCTTAATTCTTTCGGTCAAACTTTGCTT
TGGAAAGCGTGTGCGCCTTAAGCCTTGAAAACAGAGGTAGTATTGTTTTT
TATTGAGATTCAAACACTATTTTCTTGTTCATATTTTCTACTAAGGGGAA
GATCTAAAAACATGTATTAAAATGAGAACACATCATCTCAATTAATTTAA
AGCTCATTATGTTTTACATTCAGTGTTACCAAGGACCATAAATGTTCAGT
TGTATCTTCTAAAATATGTTAGAAAGGACAAAGCAACTTTTTCCTTGAAT
AATTGTTAACTATGTGCCTTCTAGCATGTACATATATTATATTTATGTAT
GATTAATGAGGATCTGCAACCTTTTCATTTACAGGTTAGCTGAAGCTATT
GACTTGCAGCCTCCAGTGATGCCAGATGATGGGAATACAACAAGGGTTAC
TACAGGAACTGATGTCACCCCCTCTCTGGGAAAAGAACCATCTGTATTAG
AACCTATTTGGGATGATGATGATACCAAGACTTTTTATGAATCTTTACCT
GATCTAAGGTTTCTCTTCATACTATTAATAATTATCTAGCTTGCGTTGAA
CTACCTTAACTCTGTTATTTACTAGATTCTTCTTCTGACTACATAAACCT
ACTTTCTGAGCAGAGCATTTGTGCCCGCTGTGTTACTGGGAGATGCTGAA
CAAAAGGCGAATGAACAACACACTAAGAGCCGTGAACTATCTAGCGTAAG
AATCTGATACCTTCAAAGCAGTAAATTCTGTCAGTTCGCTTGGTACTGTC
TGAGAAGATTTTATTAATACCTTTCTTTTGTATGGTGTAAACTGGATTGT
TAGATGACAATGTGTCATTCTGTTATTATGCTTGTTTGCATCATATCAGC
AGTGTAGAACTGATATTTTCATTTGTGAACATCTTTTCTGACATCTAGAG
TGTAGAGTCACCTCTTGCTTCTTCTTGCTCATTTCTTCTGGATAGCAAGG
TGAACAACATATGGTTTGTTTTTAAGCAGTGTAAATGGAATTTCAGTTTT
CTCTTGTTTAGCATTTCTTATTTGTTCAACATAAAATCATTTGTATGGGT
TTTTGTTTTTGAAGGAGTCCAGCGCGGAACAAGAGACTGAAGTACATGAC
ATTGCTCAAACTTCTTCCACTGAAGATCAACTGGAGGGAAAGGCAGATGA
TGTAGCCAAGCATAGCGAGGACAAAGAAAAAGATAAGGGAAAAGATGCAG
AAAAATCCAAAGAGAAGGATTTAGACAGGAAAACTGAAAAAGATAAAGAG
AAAGTAAGAGCCTTGGATGGTGGAAGTTTGGACAACCTCCTTCAGAGGCT
GCCAGGATGTGTTAGCCGTGATCTTATTGATCAATTGACGGTATATACTC
CTATTCTGTTGTCTGACCTTTCTGTATTTAAGGTTCATTATCATTCTCAA
GCTACTTTGGTTTCTCCAGGTTGAGTTTTGCTACCTGAATTCTAAAGCAA
GTCGGAAGAAACTTGTGCGGGCCTTATTCAGTGTTCCAAGGACTTCTCTA
GAGCTTTTACCTTACTATTCTCGGTTGGTTGCCACATTGTCATCATGTAT
GAAAGATGTCCCTAGTATGCTTCTTGCCATGCTTGAAGAGGAGTTTAACT
TCTTAATAAATAAGAAGGTATGACTATATATGCTTGTAATTCCTTTGCTT
CCTTTTGCTCATTGGTGAGTTCATGTTTCTTAGTCATATCAAATTTTCTT
CTCTATCCATGATAATATTTATGATTTAGTGTTAATTCTATAACCTGAGC
TAAGCAACTAATATCAATATAAACAGTAAATCATGGATTGAACATCTCCA
GAACCTCCCCCCACATTAACTGATGTAGCGTGACTAACTATTCTTCTCTG
TTCTGTTCATTTTCAGGATCAAATCAACATTGAAACAAAAATAAAAAACA
TAAGATTTATTGGGGAGCTGTGCAAATTCAAAATTGCACCTGCAGCTCTT
GTTTTTAGTTGTTTGAAGGTACTGCCTTATACTCTTATGCATGGAGTAGT
AATTTCTATGGTGTTTGCACTTCCACCTGTAGCTTATCTTGTTTAATTTT
GTAGGCCTGTCTGGATGATTTCAGTCATCATAACATTGATGTGGCCTGCA
ACCTTCTTGAGACTTGCGGACGTTTTTTATATCGTTCACCTGAAACTACC
ATTCGCATGGCTAACATGTTGGAGATACTGATGCGATTGAAAAATGTTAA
GAATTTGGATCCTCGCCACAGTACACTTGTAGAAAATGCCTACTACCTTT
GTAAACCGCCTGAAAGATCTGCCAGAGTTTCAAAAGTCCGTCCACCTCTG
TATCAAGTAAGATTTCCAATTCTCTGGCCCTTTATATTTCTCTGATCCTT
CTTATTAGACTTATATATCGAGTGCAATTGAAAAATACACCCTCTTTTTC
TTCCTCTGCAGTACATAAGGAAGTTGCTTTTCTCAGATCTTGACAAATCA
AGTGTTGAGCATGTTCTTCGCCAGTTACGCAAGCTACCTTGGGCAGAGTG
TCAGCAATACCTTGTAAAGTGTTTTCTAAAGGTTCACAAAGGAAAGTACA
GTCAAGTTCATCTGATTGCTCTTCTCACTGCTGGGCTTAGTCGTTATCAT
GACGACTTTGCTGTTGCAGTGGTAGATGAGGTTAGTTCCTTCATTTGAAG
CCTTAAACGAGTCTTTGATCCCAAGAGAAGTTTGATTGCAATAATTATTT
CTGTGGCGGGCAAAATTACCCCTTGATTGATGAGAATGGCTGTATTTAGT
TTATTTTGGAGCAGGTGCAACGAGCTGGCATCCAATTGATTTAATTTGTT
TTCTAATTTGTTTTAGGTCTTAGAAGAGATAAGGGTTGGGCTGGAGTTAA
ACGACTATGCGATGCAACAAAGGCGACTTGCGCACATGAGATTTCTTGGA
GAGCTGTACAGTTACAAGCATATTGACTCATCAGTTGTATTTGAGACATT
ATACCTTATCATTGTGTTTGGTCATGGAACTAATGAAGTAAGCACTTACA
TCCTTTAGCACAACTTGGAACTTTGTTATCCTTAATTCCTTTTTTGGTGC
TATTCCTTATCATTGTTGAAATGCTAGCTTCTGTTATGTGATTTGGATGC
TGGCACGTAAAGGCTTAGTACAATTTCTCACAGTAATATTAGATGTTAAT
AATAGAACTGTTATTTTGAATTATTGGGTTTTGCTGTAAGTTGGTAACAC
CCTATGCAGTCAATCTATGACATGGCTTTTGGTCCGAGCACCAAAATCAG
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TACATAAGAATTTCAAGTTCAATTCCCTTCTAATTTAAGGGTACACATAA
TTAGAAAAATCTGACAAATGATACAGTAAAGAAGCTAAATGCTACTCTTC
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TCATGCGGATGTGCTCAAATCAAAGTGCAGAGCGTGGTTGCACATCATAT
GGTGCACTGTATATATCAGAATGATGTTGATTAACCAGATCCTTTTTCCT
TTTCATGGTATAGCTGAAGAGTTCAATAGATCAAAATATTATTTACTTTG
TGTTCTTGACTTCTTGCACATTTTAACTGTAAAAACTGTGCTATCTAAAA
TTTACAACTATATAGAACCATCAAATTATTTCTTATGTGGGATAAGTATT
CGCCTCCTAGAAAAACTGTATCATCTGGTGGATAGAAGTAGTACTTATTG
CAAGCTTATGTCTGAGAATGATCGTACACTGTTTCATTTCTTACTTGCAC
AGCAAGATGTGTTGGATCCACCAGAAGACTGCTTCAGGATCAGGTTGATC
ATAACACTTCTGCAGACTTGTGGCCATTATTTCACTAGAGGCTCATCCAA
AAGAAAGCTTGACAAGTTCTTGTTACATTTTCAAAGATATATTATTATGA
AAGGCCCCTTACCACTTGACATAGAATTTGACATCCAGGTTAGTTTCTTT
CTGACGTATCCAAATTCCCAACATGTATAAATACTTCTGTTACTTCCTTT
CTTGTGTGAACAGTTTGCCAACATACATAAATAGCAATAAGAGTTTACCA
TTATAAATGCTGGGCTATAAAGTAAAGAAATAGCTAGTAGCTCTTAGACA
GATACCATTGGTAGACAAGAATATTCATCTAGTAGGTTCTGTATTCTGAT
TATTTGGTAAAGAAAAACAGTTGACCTATGAGTGAAATGACTTTACTGTA
GCAATAGTAGCATCCGCATTTGTAATAGTTAACCAAGGAATTCTGATGGG
CTTCTGAAGATCAGTGGACTTACTAATAGCCGAATACATTTTTATGGACA
TCTGAAGATCCATGGACTTATTTAGGACTTATACTTTTTTACAATCATAA
TGAAACCTGACTGTCTGAACCCAGGCGAGTGCAGGACCGATACTTAACAA
GCCTCTAGCAACTACATTTCTCACACTTAGTCAGCAACTGATAGCTCAAA
TAGTATAAGCAGGGAAAAGTCCTCCCAAGTCCCATGAGGTCATTACACTT
GCAGATTAAAAAGCTTAATAGAACAAAAAACAGCAACACTGAACTAGTGA
CAGCATGATGACAGACTCGCATTATCATCCGTCTGAAGATGAAGACCTGA
TGACACGCACTGCTTCTCCATGTTACAGGCATGATGTTTGAGCTTGTCGG
CCACCAACTTTCATTCTGAAGTGCCACCTCCAAGTTACCTTGTAGAAAAC
TAAGAATGCATGCATGTATGAAACGACCTCCAGAATTAACATGTGATGTT
TCTTTTTAAACCATATCCTATTGCATGCTACATATGATATTCTTTTTTGC
ACCCAGGAAGCAAATATCTGAACCAGGATGCCAGGCCCGTTTCCTGCCCT
TAGAGAATATATGCAATAGTACTCCATATTTTTTTTTGCTGCTGGATGCT
ATTATAACTTAAATGCAATAGGTAAAAAGAGAGAGAAGTATATGTTGTCG
AGCCTCAGACTTTTGTAGCGGCAGCAAGGCACATGTCCCAAAGTAAACAT
TATACAAATGAACAATCCAATATCTTAGGTCAACACATTTTGTTGTTGTC
TGGTAATAATATTGTTGCGACGAACCCTGTTTTATTGCTGTTATTTTTAT
CTTACGGAGGCAAAGGACAAGTCTACATGATAGTTCTGTAGTTTTGAATG
CAGAATTAAATCTATTCCATAGCTTTGCTTGCGCATTTTCTTTAGCGTGC
TCATCCATATGTTCTTTCAGGATTTGTTTGCTGATCTAAGACCAAACATG
ACCAGATATTCATCAATGGATGAACTTAACTCTGCATTAGCTGAGCTTGA
AGAACACGAGCTTGCAGCCTCAGTGGAGAAGCCTGAAAGCGAAAGGCACT
CAGACAATGAATCTCAGAAAAAGCAGCCACATGATGGTGCTTCTAATGGC
AGGGGTTCAGCGAATGGAGCTGAGGGAAATGGAAAGGATCACGGGGAAGG
CGCAGATAGTGAGAGCTATTCAGATAGCGGCAGCATTGATGGTCGTGAAG
ATGAGGAAGATCTTCTGTCCGAGGAGAAATCAAATGATGCATCAGAGAAT
GAAGGTGATGACGAGGACGACGGGATGGCTGTTGGTTCTGACGAAGACGA
AGGTGTTGAGGTTAGGCAAAAGGTCGTTCAGATTGATCTCAAGGAGCAAG
AAGACTTTGACCGTGAGCTGAAAGCCCTTCTACACGAGAGCCTGGAGTCA
CGTAAGTCTGAGGTGCGTTCCAGGTCCACTCTGAACATGAAGGTACCAAT
GAATGTCCTTGAAAGTTCGAAGGACCCAAGAGCCACAGAGTCTGAGAGTG
GAGAGGAAACTGTGGATGAAGAGGGTGGTAACGCTGGTGGTGGCAGCAAG
GTACGTGTTAAGGTGCTAATGAAGAAAGGGCACAAACAACAGACAAGGCA
GATGTACATCCCCAGTGACTCTGCTCTTGTACAGAGCACAAAGCAGCAAG
AGGCTGCCGAGCTTGAGGAGAAGCAGAACATTAAGCGGAGGATCCTCGAA
TACAATGAGAGGGAGGAAGAGGAAATGAACGGTGGATCGTCACAAATGGG
GAACTGGGGCCAAGGAGGGAGCAATACGGGCAGCAGTATTAGATCAGGTG
GGCGGGGCAATTGGGATGGCTGGATCAGGGGAGGTGGGAGGCGCCACCAC
GCCGCCGGTGGTTTCTACCAAGGATATGGTAGGAGAAGATGAACAGCGGC
GTGAATGCCAGTTTGCCCTGAGGTTTTTGACAGGGCAATGGTATCTAACT
CCTAAAGGAGAAGAGGATGCCTTGAATGTGCTTGACAGGAGTAAACCGGA
TGATAGAACACTTTCCACGTCAGAAAACATGTGTTGCGTCCGCTGTAGTG
CTATCCCACCACCTGACAATAAGAGAACACCGCCAGCATCATGGGAGAAG
GCCTTCTCTGAAGCGGGCTGCTTTGTGCTGAAGTTCTTCAGGAGCACATT
GGTCTGGTTGTGAATGTGTACATAAGGTTTTCTTCCATTCCTCGAGTGAT
AATTTGCTTCGGCTGTGAACTTAGCTAGCGTGCATATTTACCTGAATGTA
GATATGATGCTGCTACTTCCGTGTGCCTAGGATTGTTATCCTAGGAATAA
CTGTTATCCTAGGATTGTTCTGAAACACGGAATACATGCCAACCATTTTA
TTGTATTATTATACACATGATGGATCTCGATGTGCTTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.