Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA043403

[Submit comment/correction]

Sequence	AA043403
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA043403
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAAGCCCCCGTTGGGCCTTCATGGCCCATCATCCATGCCAGCATTCCTCC ATCGCAGTCCGCCACGCATATCTAATGGCGATCCAGGCCACGCCGCCCCC GAGCTAGGGTTAGTTAGACAGGAAAAAGAGGTTGTATACTGGAGATGCGC CGCCACCCGCCGTGCGCCGAGCAGCTCCCTCCTCTCGCCGTCACCAGGCA AGTGTTCCTCGTATGAGGATCGAACCGTCTGTCAGCGTAGGCGACCAAAT AAGCAGCTCCCTCGGGAGCTGCAATCCGGAGCCGCGGCCCGCAATCAAAG CAGCTCCTTTCCGAGCTAGAGTCCGAATTCGACCCCATTTCGGTTTAGAT TACGGAAGGAAATCGAATCCTTCTCGATTTCAATCTCCTAGTTGCCACCG GAGGCGGAACCCGAGCCGCTATATATCTGCCCAGGAGATCTCCCCGGCAG TCGTCAGATTTCGGAGGAGAGCAGCAACTCACGAAACATCACAAAACCTC TCCGGCGATGTCTCTCCTGCGAATGCCTGCCAGATCGACGGTCAAATCAT GCGTCGCGAGTGCTACCCGCACCCAATGGATCTACTATATGGTGAGTTCA TTGTCCTAGCTCTTATAAAAGTTGTAGTATCTTTGTTTCTGCAAGCAATC GGAATTGCATCTATCACTCACTGCACTGGGAAACTGTAAACTACTAGGAG TCTAGTCTTTGTTTGTGGATAATATCATTACTGCTCGTCTGTAATAAGAG GATGAACTCTTATTTATTTCCATGCCAAATGTAGAAAGGAGATGATTGGC TTAGCAAGTTGCCTGATGATATTCTGCTCAACATTGTCGACGGACTTGAT GTTGTTGATGTCGCACGATTCAGCATCCTTTCCAGACGGTGGAAGCAGAT CCCTGCTATGCTCTCCAGAATTGTTATAACCGTCGATTCGTTTGAGCGCA GATGCCAGGGGTCAAATAAAAAGATACCCTTCTATGATGCAGTTCGGCTC AATTCCACCATGATTGACACAACCAGGAGCATGCTGGGCAGAAGGAGTCC AAAACTTTACACAATTCGAGTCCTGCGCATGAAATTCTACTTGGGAGATG ACTCCATTTCCATTGGCCAGACAGTTGCAAATACCATGGCAACTCAAAAT GTTGGCTTTGCTGAGTTCACAATAATGACAAGGAAGAATAGTACAATATG CACCGATGAAGATCAAGTCAACTACGGGAGGCAGTTCGTGTCATTTGTTT ATACTTGTCCGAATGCATTCAATGGCCTCGCAAGCCTCAAGCTACAGAAT TTGAGGCTATCTGATTGTTCAGACTTCCCCCAAATTTTCAGTATATGCAA GCGATTGGAGTTCCTCCGCTTGGAGTATTGTGACAGCGGAATGTTGTCTT TCCTTGAGTTGGAACACCCGCAAATCAGTGAACTTGAAATTGTTGACTGC AATTTTGAGATGGTTGATCTGAAGTGGCTGCCGAAGCTCACACTTCTTAC ATTTTCTGGTTGGTGCTCTCTGCATGATCCGTTGTCTTTTGGTCACGTCC CACTGCTGCAGAATGTAAACATCTCAAACGTTGGTCTCTCTTGGCACAAG AAGCTCAAGTTAAGTCGGCTCCTTGGCGAGTCCACCATAAACGATCTGCA TCTGAACTTCAAAAGCGAAAAAGTTAGTGATGGTTATATATTCTTGTTGA TTATGTATGGAACTTTCCTTTGTCGTATCAATATGATGTTCTAATCTTTA ATAATTTTTTCCCTTCTATCTTTTGCAGATTTGGGTTGTACCTGAAGCTC CAAGAGTATTACGGCGGGTGTTCCACAAATTACAGATTCTTGAGTTGATT AACATTTCTGAAGATTGTGATCTGGCTTGGATAATGTTCATTGTACAAGG TGCACCTTACCTTAAGGATCTATGTGTCAGGGTAAAGTCTTTGCTCCTAT TCTCGAAATGTCTTCTGCTTACAGCGTATACAGGCTCGTGTTATGTTCAA AGTGCACAATCCCATTTCAGAGTTTAAACTTTCTGAACCAAATTGAAATA AGCAATCACAAAAGTTGTTTCTTCTTACTGTCTTGGTATCTCTTTTTTTG TACGATCGAGTGTAGGTGTGGGATCACTTATGTGATATTGTTGGCGATGA GGGGGTGAGGAAGAAATTTGCGTTCAGCGAGGAGAAGAAGGACAAAGGAT TAGAATGGGACACATCTGCATCTAATTTCACCCACCACAACCTAAATGTG CTCAGGATCTTTGGGTTTCAAACAGAAGTGAAGTTCATTAGTTTTATCAG AAATGTCATGGAAGTAGCTGTGAATCTCGAGAACATATACCTGTATAACA AGCCAGTTTGCAAAACTTGCTACCACATGGTTGGAAAGCCCTCCAAATAC CCAGGTTCATGGAAGCAGAAGAATTCACTTAGGAGCAAACTCAGCAAGGG ATTGTGCTCAGCTGCGGAAATTTACTTCCCTCATAAAATAACGTGTTAGT GTTATGTGCTTTATTTGCTTTTAGAGCAAGAAGATTATTGTAGACCTCTA GTGCAAAGTGCAGTTCGTGTAATGACCAGTTTATTTGCTTTTGTTTTGTA TTGTCAAGAAACCTGTTCGCATGGTATTTCTGAAATGTTTGATGTGTGTT TTACCTTCATCTATCTTTTTAAGAGCTATTGTGTGGTTACTTGAAAATTT GAATTCCTCGTCTAGTTCCTCACTTCTAGGTTTGGTTTTGCCGGTTGAAG TCTGGTGAATGAGAAATGTGATTACTTGATTCCTGTGGAGAACTAAGCTA GAACCTAGGTACAAGGTGCAGATAGCCTTGGCAGGACTGTTTTGCGATGA CATAGATGTATCTAAAACTTGATTAACTAGACTAGTCCAATCAGGCAAAA TCTGATTTATTTAGACGCTTAGAGTTGGAAAGAGATATATTGCTATCTTG ATAGACAGTAATTTGTGGCTCTTAGGTGCGCTAGAACCAGTTTTGGACAA TTAAATCGAAACGCCACAAAGTGAGCCTAGCATGTGCATGAATTATTCAT GTATCTTGATAGACAGTAATTTGTGGCTCTCAGGTGTGCTAGAACCAGTT TTGGACAATTAAATCGAAACGCCACAAGGTGAGCCTAGCATGTGCATGAA TTACTCATGTGAAATAATAAGCGATGGAGAAAACTGCACATGAAAAAGAT AAATCAAAGAAAATACTGTAAGAAAAGTAAATCATGGAAGTAGGCCTGTG CAAATCCGGTTTGATTGGTTTGGCCAGTTTGGGCTAGTTCAAAATTTTGT ACTAAATCTAAAGTTTAGATTTCACTTGTGAAGGAAAATGAACTAGAGTA TAGCTGTCCGGTTTGACCGGTTCCAATTTCTGCACAGGCTTACCTGGAAG GTAAAGAGATAAGAGTAATAGATTTGTTCGAGCGAGTAGAAGAGGAGTTT CGTGGTAGCATGAATTGGATTGGAGCTCTTGACGATCTGTTCCAGGCTTG AATCTTGAAGCCACGAGAAAGACAATTGAGGGGAAGAGGAATCCCGGGGG ATCCTTATATAGGGGGTTTTAGGTCAAGAGAACTTTGTGGGCGAAAGAAT CAAGGCGATCGGACGACCGAGGAGCAAATGAGGGTAGGTGGCACGCCTAC CTGGGCTGGGCGCTCCACCCATGCTCATTTGGGCCTCTTGGCACTCCAGG TGGGATTCTTGTGTTCCAGATGCTTCTCGTGGATAAATATTGGCATTTCC AAAAAGTTCATGTCCATTTGACTTCGTATAGGTCCCGAAACATCAAAAAC ATTGAAAACGGTGTTTTTCTGCCATGGCGAGTTATAGCCAAAATAAAGGG GATCATTGGTAAATCTACAAAAATAATATACATGGATATAACATTATATA TGATTCAAATATGTAGGTAAACATGTTAACAAATTACAAAGTTCATGTAT GCATTTTACATGCATCAACATCCCTAAGCTTAATATATGCTCGTCCTCGA GCATGAAGGTGATAAAAATTAAACATGGTCTTTGGAGTTTGTTACTTTTA CTTCCTTTATTATCATGTAAAGTTCATAGGCTCAATTCCTTTTCAATGAA ATATAATATGCAAATATACAATCAAGTTGTATCTTTTACACATCTATAAA CATGTTGAACAATAAATAAAGGTGTGATAAAACAAATGATGAACATAACA AACCTTCAAGCACACTTTGATAAACCTATAGAATACGAGACTCTTTTCAT GATTGGTATTGGTGTTTTATGCCTTTATTTTTTGGCTACTTCTTATTTAA TGCCCTTGACTAGAAGAATCACTTCTTAGTTTATGTCTTCCCTGGAGATG TTTTGCATCCTGTACCAAAAGTAAGCATTGAATACATATATTAATCCTCC ATAAAGAATGTAGAATAAAGTTTTGATCTATGTAGTTCATGTCAACAATA CTAATAAGGATAGGGTTCCAAGTATCTTTTATTTCAAAGCTTCATATGGT TTATGTACTAAACATCTTACAAGTTAATTGTTTCATGCACCATACCTATG ACCTTGCACCCCTCATGCTACTTAACTTAGGCATGTCATTGTGAGCTCAT GTTCGTCTTCGAAACCGCATCACTGAAATACCTCTTGCTCCCTATGTAAC TATATGCCCCCCTTTTTATTTATATTTAGCATAGGAGTTGATATAATTCC TTGGTTATGTTCAAGGTGGGAGGGGTGGTATCTCTACTCCATAAGAACAA GCAAAATAGACATATGAATTATATCAACAAGGATCATCATGCTGTAAGTT TCCACCACGTGTGTCGCACGACGCATGGATTTGACCAGCGGTTCAGGAGA GTTTTCTCTTAACATGCATACTCCAGTATGCACATTTTATTTCACATCGA TACAATCCATAGGCAGAACTTTAACATGATTAATTATCAACATTTTACAT TGAAATCTTGTACCATGACAGCATGGTTTGGCCAACAACAACTAATAAGA TGTAAAGCACAAAAATTTCCATAGTGGTATCACCCCAATCCCCAAACCTT ACTTTCATATGAGCTTTAAAATACATGAAAACTGTGTTTTTAAGAATGTT TGAAGGATTAACATACATACTGTACTTCATAGTAGCTTTTCCCACAAAAA GGTGGATATGCCTAGTCTAGTTTTAAGGGGTTTGGAACAATTCTTAGCTT GTGTAAAGAAGGCTTAGCAAAAAGAGATCTAAAGAGTGTGCCATCTAGTT CATAATGCCAACATTTATTTTCTCACCTTGATCCTTAATGTTGAACATAA ATATACACCATCAAAGGATACAAATTAATAGTCACAAACAGATCATACTT TATATAATGTACTTGAGCTTAAGAACTAGACACAACATGAACTTCAGATT TTGTTTTTATCTCCCCTTTTATTTTATTCCAAGGCATTATTATTAACTTT TAATCTCATTAAGGCAAAGTTTCTTTTCAGTAACTCAATTATAAACATTT ATAACAATAGTGTTGGTGGTCTTTTTATTGCTAACAAAAGTAAAATAAAC AAAATACACGCTCCAAGTTTTTACGATAGTTTTATGTTGCTCAAAAAACA AAGTTTAGAGGTTTGGAAACTGAGAGTTTAATAGGTCCAGTGGGGTTCCT TGGGCATACCCAAGCTTATGGTTTTTACCATCTTTGGATTGCTCTTGGTG TGATGTTCCTCTATTCCGTGTAAAAAAACTTCAACACAAACTTTTTCTCC CATCTTTTTTCTGAGTGGTGACATTAGTGGCACATAAGAATAATAGTTGT TGCATATATATCAAAGAAAAAATTCTTTCTAAATGTTCTAGCAAGCATAT AATGTATCTACATATTGCTAGCATATAATAATAATTTTAGAACACTTGGG AATGGTTAAAACAAAACGTGGCAGAATCTGCCTGGATTTTCAGCAGCATC AAATTGAATTTTTTTGACCACTTAGACATGTCAGGAATTTTAGCCAATTT TTTGCATACATATGATGAAAAGTTGTAAATGTTGTGTATATTTGAGCATA ATCAGAGTTACAGAAAAAATTAGAAAATTCTTGCACTAAAAACTGTTCTG TAGAAATTTGCTACTCCATATGTTTAACAAATTTTTTAACATCCAAAATG GGTTCCAATTGGTACTTTATTAAAAATTACAGAAACAAAACAAAAAAAAA ACTCTCTTGGTACAGCAAGAGTTCAAAATAAAAATCCAAAATAAAAATAA CCGGGTTGCCTCCCGCAAAGCGCTTTCTTTATAGCCATATAGCTAGGCTT TACTTACTTGGTTTAAGTGATATGGAATTCATGGGATAGCTTGTGTTTCT TTTCTAATTCCTTCTTCCTTAGAAATTTTTTCATACACTTCTTGTGAGGA AATTTAAACTTTACATTTCCTTGTTTTGTATCAATGACTGCACCTGTGGT TCTCAAAAAGGGTCTACCAAGTATTATAGGACTTGAGGTATTGCTCCCCA TGTCCATGACAATAAAATCAACAGTTAAAAATGTCACATGTAATTCAACC ATGATATATCTAACTTTTCCTAAAGCATGTTTAGTTGAATCATCCGCAAG TAAAATATCTATAGAGCATTTTTCCATAGGTTTCAAATCAAGTAAATCAT ATAGATCTTTAGATAAAACTGAGACACTAGATCCTAAATCTAGAATAACA TGATGTGTCTCTTTTTCAATAGTGATTAATATCTTTGGGAGCCATACATC CCCAAGCTTAGGTGGTATCATATCTTCATATATCTTTCAATATTTTCTTT TATAACATAATTTGCTAGGTAAGAACCAAATCATGCTTGATGACCATTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.