Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA012349

[Submit comment/correction]

Sequence	AA012349
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA012349
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AATTATCCCATCATCTTGTACTTTCCGTGGCATCTCTGCTGGATAGCACA ATAATGGTGTTTTCGGCAAAGCATTGAGCAAACTTCGTAGGCCATGACAC CTTAGAAGGCATTCTTCTCTCTTGTCCCACCATCTCTCACACATTTCATC ATCAGTGGTAGATGTTTTCCCCGCACCCTCCTATGCCGCATGTGCGTGTT CGCCCACTGAAGCTTGTTTAGGGGCGGAGTAGTAGAGATGTTCACTTTCT CCATTCCCTACGAGACTAGATTCTTCCCCTCCCCCACCTTACATTTAAGA TCCGGGAGCAATGGTCACTGCCCGCATCTCAGTGGTGACACCAGGAAATG GCTGGTGGATATCTCTATACTATCTAATAATTTTTTTTTTTTTTTGATGT TCCGTGCCAATTCTCACTACGTCGGGTGTTTCGTCCTTCACCCACCGCAT CGTTCACGTCGTCCTTCACGCACGCGCTAATTCAGCTACACTACCAAAAA CTAAATGAACCGGCTAATGCGGAGTAGTAACTTCCTCATTTAGATCCCAA AATCACGCCACGGGAGCTCCTCCACTCCTCCGCCCCTAAACAACGCCAGC GACATCCAACATATCGGTTGCTGCTGCCTTCCCCCACCTAGAAGTCGGAA GGCTTGGATGCTTTCGCACCGTCCATGTTGGCCTGGATGGCGTCGCACCC ATCCCGCGTGCCTAGACGCCGCCGCCTTAGAGCTCCATGGCTCCATGCGC TGCATGCTGGCCTGGACGGCGTCACCCCTCACCTTGCGGGCATGGACGCC GCGGCCTCCCTACTCGAGCTCCACACACGCGCGCACTGCCCTTCAGCGAC ACGTCGCCGTCACAACGTGCTCCGATGCTTCAGTAGTCTGGACTCTGGAC ACAGCCGTTGTGCTCCACGCGATGGAATTCCCTGCCACAGATTCCCTCTT CCTCTCTCTACTGTCGTGCTCTCCTTCTCCTTCCCATGTCCGCCTCTCTC CCTCTCTAATTTCTCCATGCATGACTACTTTGACTTCTTGCAGGCTAAGT GTTTGTGATATTGCTAATGTGCTCTGTGCATAACTCACTGCTTTCACAAG TATTTACAGGATAATATGTTTGATGAATTTTACAAGAACATAAAATTTCC TGATGAATGGACGCATGCTGAAACCACCGCTCTCGAGGTAAGTTTATTAT TCTGTTATTCTACTTGCCAGGATGGTTCATCGAGTTATTTTTTTAGCATT GGCATTTTTTTCACATCCACGTATATATGTTTCCCATGTATTTGTGTTTA TTATTGCAGCCAAATTTGCACAAATGGCTAACTGATAAGAATGCCAGAGA TTATTTTTTCATCCGTGCCGGCAAGTTTACTGAGGTCCACTGGAATGATG TTGTGTAGGCTACGGACGAGCTCGTGTGTACAGAGAGCAGGAGGCTGGCA GACGGTGCGGGAGCGCGAGTGTGGTAGAGGCCGAGAGGGAGTGAGAAAAG GTGCGCTAAAGCACCGCGCACTCGCCGGGAAGCCAGAACAGGGGTGTATG GCTAATTCCTGTGTATCTTTTTTCATGTAGGAATCTCATTTTTGTTCTTC CTGCAAGGTGTTGGAAAATCCATGCTATAGGATGCAGGTATCTTCTATTA ACTTTGTCTACTTGTGTTTGCTAAATTTTCATTCACGTCTAAACACTGTT CATGTCTTTGATACATATTCAGAAGGCATGTCTTAGACTCAAGGTAATAT TGAAACTTCGAAGTGATCAAAGTATATGCTTTGCTGCTTTGATTGTTGGA TTGTAATTAACTATTGCATAAATGTGTGCTCTAAATTTTCACTTTGTATC TTTCTGATATAGAAATAGCTTTCCATGAGGCATGGATTGAAGAAAAAACT CCTTGTTTTGTAGTAATTATACCTATTCTGCAGATACTTTTCCTTTGGAT TTGGGAGCATTATAATTCATATACATTTTGAGAATTCCTATTCATATACA TTTTGAGAATGTCTATTCTTCAGAAGGAAAATATTTGTTCTTCTATTTCT GTTTCATAATTAATTGGGGATAAAACACACTCTTTAGTATTACCCCATCT TTATGTTGGTGTGATTCTATGATCTCTTACTCTTATAGGAATTCTAATCT TCACTCTAAGTTCAGTAGCATAATTCTTGCAAATATGAGATAAGGGCAAT TTATATGTAAAAATGTTCATGGAATAATTCATGTCCGGTCATAGTTCAAG CTACATAAGTGCATTGACTAGCTACATAAGCTATATATGTTTCCCATGTA TTGTGTTTATTACTGTAGCCAAATTTGCACAAATGGCTAACTGATAAGAA TGCCAGAGATCATTTTTTTCATCTGTGTCGGCAAGTTTACTGAGGTCCAC TGCAATGATGTTGTGCAGGCTACGGACGAGGTCGTGTGTACAGAGAGCAA GAGGCTAGCGGAGGCGGCGAAGGGTAAGGAAACAAGGTGTGGCCTCTATT CCAGGGAATGTTGTGACCAGGCCATGATTCCCGGCAGTTCCAAGGCTGTT GCTTGGTGTCCTCCTGCTGAAGGTATCATCAAAACAAAAGTTGATGTAGG TTACTGTGAGAATTTGGGCTATGCTACTGCAAAGCATAATTGCTAAAAAA TCCAAAGCGGCGGTTTTGTTTGCTCCAAATCAGGTTTTAGTCCCCTCTGT TTTGACTCTGAAATTGCTGCAACATGTGTTTGTAAAGTTCGCTGACCTGA ATGACTGCACTTTGCATGTAGTTTTTAAGGTGGATTCAGTTAAATTAACT CTAATTCCAGGCCTGGCTATAAAAGCTTTAACATCTATAGTGATATCCAC AATCTTTCGCTCATGCCTTGATCTCCTGTAAGTTCATTAAAATTGGTACA TGTAACAAATCGGCTCAGGAGCTTGCTGCTCTTGCTCAACGCATTATGTT TTTAATTAACGATGAAGCATTTGTTCACTTCGAGCAATGGATTTGTTCTC ATTAAGCTGTAGGCATATTTCAACTTTTATTCACGGAAGAGAAGGTGAGC ATGTTGGATTGTATACTAATATGTTCTGAAGGTTCTATACCGAGCAAGTT TTATTATTAATTTGTACGTGATGAAAATGTATAAATTCTGCACTATATCA TTTCATAAAATTATCTTTTTAATTGTTGCAAAATGAATTGGAGAACTAGA TTACCAAAAACTGTAATGTACTGCCTCTGTTTATATAAATATAAGATGTT TTAGATTTGTTTCCAAATGGAGGGAGTACCTTGTGCAAAATGAAACCAGA TTTAGTTGAAGAGTATGGGGTATAAAAGATACGCTCCAAGCTTGAAGCAC AAAAGTGAAAATGAAAGGACAACTTTGATCTTTTATGAGAGAATGGGAGG ACTTGACCGTTGACTTCTTTTATTTTGTCCCCCTTGATCTGCTGGAGACC ATGGATTTCTTAATTTGATGTGCGTCGAGGACTGAACTCGCATTGTTTTG GCTCAATCGCGCTGGTTCATGTCGAACTATTTTTTTCTTTTCTTTGAGAA CCAATCTTTTATTTACTGTTTCCATTAGGCCAGCATGATTGGTTGTGATT GGTTGTCGAGGAGGGAGGATGAATACGGAGTAGTACACCGACTAGCCCTT CCACGCTTGCGGATCATCACCGGAGGGAGGGCCATCGTCCACTGTTCATG GTCGCCATGCCATCATAGGAGGTGCCTGCACTCTAGCCCTTCTCCTCCAT GCCGATGGTATTAGAGACGATGATACATTCGACATATCGACTATGTTTTG TTGAATAAAAGCTGAAAAAAACATGCACAAATACATAAACCAGCACATGT TTAATCTGGTGCAAGCGCACGGACATGTTTCCTATTCATTTTATAAAAGA AATTGATCTTAATGCACAATATGAACTATGAGAATTGATAACATTAGCAC GGAATAGTATAGGACAGTAGAAAATTCTCATTGAAGCCACAATTCATAAA TCATAAGAGTTAAGACGATACTTTCATAATAACAACAAAGTACCAATGTA CTACAATAGGACAAAAGATTTTCGTATTAAGGCATTACCTCTTGATTGAA GCCAAATTACAATACAACTTTGTGATCGCCTTGTTGGAAGAGATTGATGA CATCCTCATCTTTTAATTTATTGAAGAACTATCTCTTAACAAATGCAACC AAGCAGTTGTTCAAATAGTTATCACCCATTTTGTTTCTTAGCTTATTCTT CACATAGTTCATTGAGGAAAAAACCCTTTCAACACTTGCAGTAGCTACTG GTAGAATCAATACCAACTTAAGAAGCTTGTAAGCAACAAAATATTGTTCA TGCTTGTGGAGGGCTTCAGGTCTGATCCGGGATGGGATGATTTTCTTATA AATGTCACATCTTTTTGTACCAAACACAAGATCAAAGTTGTTGATATGGA GGGTCCTTACTTTCCTTTTGGGCGACCTAGAAGGGGTTTTTTTAATGGTG CAACGAATTTTCATCGCTTCCATGTTGATATGTATGTGGGTGTCATTGAT AGGCAAATTTATGAGCTCGATGACATATTTGTTGAGGTAAACACAGATCT ACTTTCTTGCATGGCAGCATTTAGTCCACTTTGTTCTTTCTCTGCTTATG ATCAAAAGAAATTGGTTAAGCTTGCAAGAAAGTTTTATGCTAATGATTTC ACAAGTGATGAACTTGCAAGACTTCTCTGGCAATTAGACATGTATATTAC TCATGTGCGTAGAGATGAAAGGTTCAAAAATTTGAAAAATCTATGTCTGC TTCCAGTTATGCTTGTCGAGACAAAGTAATACTTTGTGACATCAAGTACC TTAATAGCATGAACAATATCTTGCTCTTTCGCTTGCAAAGCTCTGCTCAA ATCATCTGTGTATCCAAATATTTCCTGCATCAAGTGTGCCATGAAAACAA ACTCAAATGACCGAAATGATGTCAACACTGTTAGAGCCGCTACGGCCTTG ACACCATGGTACTCTTTTCCAATCTTTACGAGCACTCGCCGTATTGCAGC ATACATAGATATGACATGGCTCACGGTTCTGAAGTGAGAGCCCCAACGTG TATCACATGGCCTTGCCAAACCCATTTCCTGATTGAGTCCACTCCATGTT TCTACTTCCTCCAATTCCAATGCATCAATTAGTTCCTCGGCCTGAGCTAT GCGAAGCATTCTCATTTTTACAAGACATGCCAAGAGCATTTAACAAGTAT GCAATCTGCTGAAAGAACCAAGTGCAATCACCACTCTCCTTAGCAACAAC AACAAGAGTTAATTGTAGTTGATGAGCAAAACAATGAACATAATAGGCAG AAGGAGACTCATTCATGATAAGTTTTTTCAGTCCATTGGCATTACCTTTG ATGTTACTAGCTCCATCATACCCTTGCCCACGAGCCATCTCTAATGTCAA ATTGAAGTTCATTAGCATTTGTTTAATTGCAGTTTTAAGTGTCAAAGAGG TAGTATCTTCAACATGAGCAAGACCAAGAAATCTTACAACAACCCTTCCT TTCTTGTCAACATAACGCAAGCAAACAGCCAACTGTTCTTTTTGATACAC ATCACTAGACTCATCTTCAAGTATTGCAAAATGGCCACCATCAAGTTCTT CCATGACTAGTTTAGTAGTCAGCGGTGCACAACATTTTGTGAGCTCATGT TATATATCACGGTGAGTCATCCTACAGTTCCGTGGAGCATTGTTTAGAAC CACCATGTCAACCTCTTCAAAATATCAAGCTAACCAATTTAAGAGTCAAG GAATTTTCCTTTATTTAGTGAGTCTTCACTTTCATCGTGTCCTCTAAATG CCAAGCCTTGGCGCAATAGAAACCTCAAACACTTGAGTGTCCATGTCAAA GCGTTGCTTATACAAAGCCTTGTATTGTGAGTTGTTTGAAGCAAGAGACT CCCTAATCGATGCAGATGGTGTAGTGAACATATCATAATTCTCTTGAGCT TCAACATGAGCACTACTTACACCACCTTGATGTCTCTTCAATCTCGATTT CATGTTCCAGTTCCTAAACCCATCCTTTACAAATGAATCTCCACCAATTT TTTTTGTTTTATCTTTGAACAAGTAGCAAACAAAGCAGAAAGCAACATAT TTGTCCACACTGTATTCAATCCATGGATATTCTTTAAACCAAAAGTGGAA AAAGCGATGATCTTTTTCACTTTTATCTATAAACAAAAACTTATGATTAT TTGGTTGACATGACCCCATCTCAATGTCCCTTCTTACTCTATCTTGATCA TTGACATTATATCTTGAGATGGAAATCCGCTTCCCAGGATCATGGTCTAG TGCCCCTAAATCTGCTCGTGTTTCTTCATCCTCTTCATTAATTGTTTCTT CATCTTCTACAACTGGAGTTGGGGGTTGAACGGTTGCTCTCCGGTTCATG TTCTGCATCCGGTGCTTGCACTAGCGCCAATTGCAAATTGCTCTCAGCCC CATCACGGAAACTACTTGATTTAGCAACTATCTGATTCAATGTGGCTGTT TCGTTTGTCTTTTTGGCTTTTGAAGATTTATCCAACAATGCAAATATGCT ACTGCCAGAAACACTCTTATTCATATAAATTACAAGAAACACAGAGAGAA ATAGTTAATATGTTGTTGATAATTGATACATAGACAAAACTGAATCTGCT AATATTAATCACTAGCTAATTGATTACAAAAATCTGCTACTAGGTAGTCT AGGAATTGGTACTAAACTTCAGTAATCAAAAGTATCTAGGAATGATGAAT CTAGTCATATAGGTAGGGGTGGACATATAGCTCGAGGCTCAAGGCTCGAT TCGGGCTCGTCAAGGCTCGGCTCGGGCTCGACTCGGCTCGGAGGTTAAAC AAGCCAAGCCTAAAACCTGAAACTCAGGCTCGAGGATCGACAAGCCCGCT CGATCAAGCTCGCAAGCTGGTTCGAAGGCTCGATGTAATTAAAAAATTCG CCATGACCTTTGCTAAATTGTGACAATTCACAATTGTGATCAACAATTCA TCATGAATACATGCATAACATAGTATACCAAGATTCAGAAAGTACGAATG ATGATAACAAGTGCATATGTCACAAGTTCACAACATAAACGTCCATTCCG GTACATAGATAGTGTCATACATCACGAACACAAACATATAATTATAGTGG CATACATCACAAACACAAACACATGCACTTAGTTCGATAAGTAGAACATC TGAGCCCAAAAGAACCATCATCTCGATCATTTCTTCTTCCTCCATCCTTG TTGCATGTTGATTCTGCAGCACACAAACAAAAGAAAATCACATTCACTCT ATTATAAGACTAGTTGGCTTGTATATCAAAAGTTTCAGGAGGAAACACAC GAAATGAAGAAAAAATATTCAGTTTTTTTAGTTAACTTGATATGTACAAA AAGGTCCAGCAACTAAAGATACAAAAAATCACTATATACACATTTTTGCT TCAGTTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.