Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA010368

[Submit comment/correction]

Sequence	AA010368
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA010368
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AGTGTTTTTAATGCGGTTCGATCTTGGTTGCTTCCGTGCACGGTATCCCC AGCTCGGAGTCCGCATCCGCCACGACGGGCCACGTGATCGTGTCCCGTAT CCCAACCTCACGGTAACCCCACCGCAACAAACCGCCGGAACCTTCGTCTT CGCCTGCCCATCCCCACACCCTCCACTCTCCGCCACGCTCGCCTCGCCGT AACCTTTGCCATGATGTCCTCGTCGCCGCTCGCCGGCGCCGGCGACGGCG ACATGGAGTCGCTGCCCCTCGCCGCCGCCTCCGACTACGCCTCCGTGGCC TCCACTTTCGACCCCCTCCTCTCCTCCTCGCCCCCGTCCCCTCCCGCCCC CGTCGCCTTCCCCCTCTCCCGTGCCTCCTCCTCCTTCGTGGACCCGCCCT CCTACGCCGACGTCGCCGCCTCCTCCCCGCGCTCCGCCTCCGCCTCCTCC TCGGCCTCCCCGAGATCCGCGCGCGCCGCCACGTCGGAGTACTCCCACAT CGCCGTCTCCGACCCGGAGACCGAGGTCGAGGGCGCCGCCACCTCCCTCG TCCCCGGATCCGCCCCCACCTACATCACCTACCTCGTCACCAGCGCCCGC CGCGGCGACCACCGCCGCCACGCCGTCCGCCGCCGCTTCCGCGACTTTGT CACCCTCGCAGACCGCCTCGCCGAGGCCTTCCGCGGCCACTTCGTGCCCC CGCGCCCGGACAAGAACACCGTCGAGAGCCAGGTCATGCAGCGCGACGAG TTCGTGGCCCAGCGCCGTGCAGCTCTCGAGAGGTACCTCTGCCGGCTCGC CGAGCACCCCGCGATCGGGACCAGCGACGAGCTGCGCGTGTTCCTGCAGG TCGAGGGAAAGATGCCGCTGCCCAGCAGCACTGACGTTGCCTCGCGGATG CTCGATGGCGCAGCGCGGCTCCCACGGCAGCTGCTTGGGGAGGAACCCGT GGCGCCGCCGCAGGACGTGGTGCAACCGGCCAAGGGAGGGAGGGACCTGC TGCGGATATTCAAGGAGCTGAAGCAGTCGGTGGTGACGGACTGGGGTGGC GTGAAGCCGCCGCTGGTGGAGGAGGACAAGGAGTTCCTGGAGAAGAAGCA GAAGGTGCAGGATTGGGAGCACCAGCTCAGTAGTGCATCACAGCAGGTAA TTTATTTCCTGATTAGCTACGACAGTAAGGCATTCTTTAAACCACAGTAC TAGTTCAACTCTCCCCCATCAAACAAAACTTTTAAGCGGTTGTTATAATA GTTGGGTGATGCAAATTTCTAATTTTTGAACACTCTGGTTGTTAAACAAC AGTGTTCTTCTCCAAATACTACAGTGTTCAACAACATAAAAACACTCCTC CATACATGGCAAGAGCTCTAGAGTCGTAAGGAATACATTATGGTCGCTAG GTTTTTTCTGTTCATTCTGCTACCTATCCATGTATTTGTGGTCGCTTCTC TTGTGCTGTATCCAAAGGCTTGTAAAACCACTATCTTCTTAAGCTCTCCT GCATGGTTTTGAAAAAAAATACGTTGGATGACCTTTTAACCCTAAAATAC TTCCAATTGTAAGTAGTATATTCATGTTAATATATTCAAATTGGTCTCAT GCTTTTCATATTGTAAGTATTCCCTCCGTCTCAAAATAGATGTTGGAAGT TTGTCTAAATTTGAATGTATCTAGACACTATTTAGTACTAGATACATCCA AATTTAGAAAATTTTGCGACATCTATTTTGAGATGGAGGGAGTAGTTAAA ATCTATCAATGCATTCTCCCAAACTGTAATTCGTTCCGTGCTTCTAATTT TGTAAAACACCATAATCCATTCTTTGTATTGAGGATAAAAGTTACATTAT TTTGACGCAATGCCCATGTAATTATAGCATTGTGCCTGTAATTAATATTT CCCTTGTGCTAAGAAGCGTCTTAAGTAGTGCTGTGCTTGGTCATTTTGTC TAGTATTAGAATGCCCTGTACCATTATGAGCATCTAAAATGGTGTGTCCA GTGTATCTAGGGGAGGGGGAATGCTCAGGTCATTTGATGGAATGACTTCT CCAAATAAGGTTTTATCTTTCGGCTGTCTTAATTCTTGTCTTTCCCAATC AGCTAGTAATTGGGGTTGGGAGATATTAGGGCCTCAAAATAGATACCTGG ACATGTTGTTGTATCTTGGTTCTTTGTTTGCTCGATAGTTTTAACTTTGT ATCCATGCAAGATACAAGCTAACCCGCCCTCCTCCAGCTCATCGAAGAGC TGAGTTGGGATGAGTTCAGAAGTAAGTCGGGTGGACTACTGTAGGGAAGC ATTTAATGTAGTACCTATTTTTGTCTTATTTGTAAGGTTCCATGCAGTTT AGCACTAAATTATGGGAGCTGCTAGACAAAGAAGATATGGAAAGGGGATA AAAACCACATCGTGGATGGAAAGTTGGTGAAAACATAAAATAAAATTATT AGCACACACAGAACTCCGCTATTGATAGAACTGAATTGCAATTAATTTTC TGAAAAGGGATATCCAGCCTGTGGTAATTTTAAAAAAATATCCTTTGGCC GCCATGTTTGATTACAGAGATGTGACATCCTGCAAGCTCTTGTCTCATTT GTCCTCTTATGCCCCTAATAATCACTTGGCCACAAATGATTACCATCTTA CGAAGTATTTACTTCATTTTTCTTGTGAGCCAAACACATGAGCGTGCGTA AGGAGCAGCTTTCATTACCTTTATGGACCTACTTTGCTACCTGCTGTAAT ATATCCCTTCGATGCTACCATTATATCATTTAGATCATGACACATACATA CAGACCCAATATGTAGCATGTAGCACACCAATTATATGATGTACGAGATT GATAGGACAGCATATGGAGGCTATGATGTTCCTGTTGGTTCAATGCTGAA TTTTACGGCTCATGCATAAATTTGGAGAAGTGCCAGGGACGAGGTAGTAG TGAAACCCTGGTTTAGAGTCGCTTCACTGTAGTCAACTTGTACTAATTTC TTCTAAAGTGACCTATGCAGACCTTTTGTTTTCTATCACTAAAGGCCATT TATGGTTTTATTGTGTCTATCTCCAGTATGCAGTCTTCCTTTGGTTTCTG ATAGCTATGCCTGAAGAAGAGCTTGTTTGCTCCTATATAAATGATAATAC TAGTATAGATGGGGTTCTTTTGGGTGCATTTTCTCTATTTGATCTAGAAT TTGCACCAACATTATACACTGGAGGCAATGATCATGTCAGTTGAGTCCAG AACCACACTAGTGGCAGTTATAAAGACTGGTATACCTGGTAGCATGATTC AAATAATAGGTGGGGGATTTAATTTAAATAATGTTAATTCGTGCTAAAAA GTGCGTACTAAGTTTTGGTGAAAGCTCTTGAATAAGTATTGGTAATATAC ACCTGATGGTCTTTGAAGGTAGTTATCATTGGTTTATGAGTTTGTTTCGT TTCTATCTCTTTTATAGGCTGAAGCACTTGTCAAGGCTCAGCAAGATATG GGTGAAACAATGGGTGCTCTTGGATTGGCATTCGTTAAACTTACGAAATT TGAGACAGAGGAGGCAATGTACGACTCTCAGAGGATAAGAGCTGTTGACA GCAAACGTATAGCCACAGCAGCTGTCAAAGCTAGCAGGACATGTCGAGAT TTGAATACACAAACTGTTAAATATCTGGTACTATTTCAATTCCTCAAGTT GTATATTTATGAACTTTCCTGGCTAACAAGTAATCATTATTCCATGCCTT GTTTCGTTTTTGCAGGATACTTTGCATGAACATTTGGGGATAATGCTCTC TGTCCATACTGCATTTTCTGATCGGGCAAGTGCACTATTGACTGTACAAA CGCTTATGTCAGACCTTGCATCACTACAATCAAGGATCGAGAAACTCGAA GCTGCGTCATCAAAAGTGTTTGGTGGTGATAGAACTAGGCTGAGGAAAGT TGAAGATCTCAGGGAAACAATAAGGGCTACTGAAGATGCTAAGTGTTGTG CCTTAAGGGAATATGAGAGAATCAAGGTAACTGACATGCATTTTCTGAAA GATAAACTGATTGGATGCTTTCGTAACTAGCAATGAGCATGACAAGACCA GTGACTGTGCGAGCATCATTACTACTTCTAGCTCATAAAAGTGTGATGAT ATGATATATCATTAGTTTCTTTGCTTTTTAAGGAACCAGTTTCTAGCAAG AGTTAGCTCAGCTTTGGAATAGGTAGATTCTACTACTCTGGTGTTGGAAG TTTCTAGTTGAGCTAGTTAACTTGAACATTTTACTTCAGTTGATATCTTA TATTAGTAAGAGACTAACTTCCCGTCATATCAACTGTAACAGTTCTCCCA GTATGGTGTTTCCTATACCTGGTGCTAATAGTTGAAAACCCCCTCGAAAG TTCTCTCTTCTAATTCTGTGGCCCCTCTCTCCTACTGCTTCAGGGCGTTT TGTGCAAAATACTGCCTATGTGGCGGTGGTCAACCTGCCACGCATGCAGG TCATGCATAGGACCTGCGGTTAACGACTAGTTTTAGAACCCATTTTTTGA AGAATTGGGACTAAATTGACACCTCCATGAAAGAATTAGGACCTCTGATG CATTTTACTATGTTTTCAACTATCCGGTTGTCTATGTGGAACTATTAGTA GAGCCAGCATAGGAAATACTGATGATGTAATAGTACCACGTATTACACAT ATTATAGCAATATATGTATTATTCATAATATGAAGCATACCTATCCTAAT ATCCACCATCTGTAACATACTTCCTAATTTGTGAGCACGCCATAAATATT TCTTGTTTACCTGTTTGCACGAATCACAACTAGTGCAGTGAAACCCTCGA AGGCCCATTTGTAATTTCACTGGAATTGACCCAGAAATCTGGATTTTTTG TGTGTTCTAAGTAGGTGGCCAGTATTAAAGTGGCAGCCGTAGCTCTGTTG CACTAAAAATTGTCTTTGATAAACTTGTTGTAAGCAGCATGTTTTTCTTT ATTTTTTTGCAGCTTAGTTTAGGTGACCACTGTATGGAAATTTCAAATTT GTGGCAGATATCTTAGATCTTGACTTATTATGCAGGAAAATAACAAAGTT GAACTCAGCAGATTAGACAGAGAAAGGAGGGAAGATTTCCTGGAGATGTT GAAAGGATATGTTACAAGCCAGGTATTATTTCAGATGTCTGAACATTGCA TTAGCTCCTTTTGTGCAAACGACCCTAGTTAGAAAATCTTGTCAGGACTA CTAAATGGCATTGCTCTGTACCTTCCTTAGCGATTTGATAATAAGTGTTA CGTAGACTAGAATTTGCCCACCAAGTATTTCGTGGAATAGATCACACATG CTAAACCTTCTGAACATGTGTTTTTGTTTTCTGATGTTTTTTATTCATTT GCTGGAAAGATCGTGACACATAATCTATAACAGGACAAGTGGAGAAACAA TATAACCAGAAAACCACATAACTACTACAACCATTTTTTTTAGCTTAAGG CAGTCAATGTCTGCCGCTCGATTAGATAGAATAGAGTTGACCCAGTTATG ACCAAATTTAGCTAAAGCATGCGGCACTGACGCCTCATTGCCCTATGCTG GTTCTCCTGCATCTTTGCTGCGGTGAAATCGTTAAGCATTGTGGTATCTT ATGTACCAAGGATTCTAGCATGGACTGGTCCTTCTCCGAAGAGGATTAAC TATGCACAGATGACTGTACTATCCACTTATCCAGGATGCGGCAACTGACA CAATCCTTCGGCAACACTACCACACACCTCCAGGCCAAGATCTCCACCAT TTCATGATGGCGAACAGAGATCGGTTATGTCGACGCTGATCATCCCTCAG CAGTTTAGGGTTTGAAATGAGGGTTCCTAGTCTGCAGCTTTTTTAGTTAA AACGTCTGTCTCATCAAATAAATTAACAAATAGAAACAATGAGTAGCTCT GTTACATGATCTGCCTCCGTTGCTTGTTTTCAGCCAGCTATGCATACGTT ATCCTTGATTCTATTGGTTCCTTTGTGCATATTATTCCATTTTAAACTCG GTTCTTACAGAATATGTTTCTTTTCTTTGATGTGTACGCAGGCTGCATAT GCAGAGAAAATAGTTGACGGTTGGGAGACGGTAGCGGAGGAGACAAGCGG ATATGGGCGAAGATCAGATAACTTTACATCTTAGTCTGTCGTTTGTTTGG ATACATGAATGTACAATGTAATTTAGGATGCACTCCTGGTAGAAGAAAGA TGGACCTAAAATTGAATTTGTTTCTCTGTTACACCAACTGTCTCGGTTCT GATCTCTATGTGTCGCGTGGACCACAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.