Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA033359

[Submit comment/correction]

Sequence	AA033359
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA033359
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCAGAACCGAGGCTCTGGCACCGAGGTTATTATGGCGACCGCGGCAGGAG TTACAGAGCTCGCAGTATCTCTCGCAGCAGCGCAGCGCAGCGGCAGGGAA GCCGAAGCCTAGTGTGCCCGCCTGCCTGCTGTGCTGTGGTCTGTGGAGTG TCGCGTGCGCTCCGCCCTTCTCTTTTGCTTCCTCTCCCTCCCACCCCGAG GCCAAAAAAGCATTTTAAAAATAGCACCACCACAGAGTAATCCCACCACC TCGCGTCGCCTCTCCCCAAGCCCCGGAAACATCGCGTACGCGTGCGTCGT ATACCGTATGTATCTACAGTGAGGCGGCGCGTGCGGGGCGTAGTGGTGCG GCGCGAGGGGTTCGTCTCCGGCGGCGGCGGCGGCGGGCGCGGAGTTGGAG TTGGAGGAGGAGGAGGAGGTTAGATCTGGGAGGGATGGGGAACAGGATTG GGGGGAGGAGGAAGGCGGGGGTGGAGGAGCGGTACACGAGGCCGCAGGGC CTCTACGAGCACCGGGACATCGACCAGAAGAAGCTGCGCAAGCTGATCCT CGAGGCCAAGCTCGCGCCCTGCTACCCGGGCGCCGACGACGCCATGGGGG GCGACCTCGAGGAGTGCCCCATCTGCTTCCTGGTAACAGATCTTTCTCCC CCCCCTCCTCTCCCCCCTCTTCCTCCCCACCGCCTGCGAAATTTAGCTGT TGGGCGTGCCGGCTTCCATGCCACCGGAATGGAATGTTTGACGCGTCCAT GCGTATTGATTGGGTCGATTACTGTCGAGTGCCGTTGGCGTGAGCCTGTC GGGGAGTATTCACGTGATTCTAGTTAATGCCTTCTAATTAATGTCTCCTA CGAGCAGAATTTTACTCAAGCAGTAAGCAACTTTTTGTAGTTTATTACTT GTATTTTTCTTCATCAAGTAGTGTAACCATTTTTTCGCAAAATTAGTACT AGGACATTGTGCTAAGTGCCTGTGTGTGTGTTCGCCTCTCTGCTAGTGAC ACCATACAGCGCTTGTTGTATATACATTGTCCAATACGCGGTTCTGAGTG TCCCTGAGATTGTCACATCCTGTAGGAGAGTTCTGTCAATGTATTTCGTT TTTATGTGTCTCGGTAACTGCTATTCTAGAAGGGTTTGGTGGATGTGTCT CTACTAATGTTCTAGAGAAACAATGCATATGTTCATTATATTCTAATTTT ATAGGCCTACCTGGTGTTAGTAGTAGTACTATGCATTCGTGCTTGTCAGT GCTACTCGGATAAGAGTATCACAGATCTTAGAAGGGATTTGACTAATTCA TAAACAATGAATTTGGCTAATTGTTCCGAGATATTCAGTAACTTTTGGTT TTGAAAGCGTATAGGCTGTAGGGAGGTGTTGCGGTGGAAGTGTTCGTTAC ACAGAATGTTTTGGTGCTGTCTGGAACTAGGATTGAGAATCTTCCTGCTG CTGTAGTACCCTTGATTAGGTTGCGTAAAGGATAACGCCTGATTCTTGTG AATGGTTAGCTGTTGTTCCGGGATACTCTTGATAGTTCTATATTATTTGT AAATAACTGGAAATGGTTCTGCTTTTGGGTGCACTTGTGTGGCACCAGCT ATATGTTCTTAGTGCCAGTGTTGTTTGAAGTTCGAACATTACTGCAATTG ATGTTAGTTCTGTTGCATGTTATCATTAGTGTCAAATATCTGGGTGAATA TGTGCAGAGACGGGCATTGTATTCTAGGAGTTTCTGTTATTTAGCACTTC TAGTATTTCCCCGTTTTAACTTGTTAAAATTAAGATTCTGTTAAGCTGGG CAACCACTGTAATTTCCTATGTCCTAAAATGCATCTTTTTTCCTTATTGT AGTACTATCCAAGTCTTAACCGATCAAAATGTTGCTCCAAAGGGATATGC ACAGGTAATCCATCTGTCCTACTTGCTACCACCAATGATTGTGTGTTACT TAGGTGCAAATGTCCTTACATGCCATGGTTGATATTTTTGCAGAGTGCTT TCTTCAAATGAAACCAACTCATACTGCTCGGCCTACACAGTATCCTTCAT ATTGTCTCTGCTCTTGTTTCATATATCCTTGCATACTCTTGGTAATATAT AGGTATTTTCAGTTGTCATTGTTAATACTTAACCAATGAAGATGCCCATT CTGCAAAACTCCCAACTATGCTGTTGAGTATCGTGGTGTGAAGACAAAGG AAGAAAAGAGCATAGAACAATTTGTAAGTCTTATGCCCGAACGTGTTCGC TTTTTTGTTGATATAGTGCCAGTATTTATTTAGTATTTGCAAAGCAAATG AATTGACTTAACCTTGTATAAACTTGTTACAGGAAGAGCAAAAAGTCATT GAAGCACAGATGAGGATGCGCCGGCAAGCACTTCAAGATGAAGAGGATAA GATGAAAAGAAAACAGAGCAGGTGCTCTTCTAGCAGAACAATCGCTCCAA CAACAGAAGTGGAGTATCGAGATATCTGTAGCACATCCTATTCAGGTATG GACTACATGGGACCAATATATTCATCTACTTATGTTATTTTTTATGTAGC TTAATCTGATGACTTACAATGTGTTACGTCATTTCCAGTGCCATCATACC GATGTACCGAGCAAGAAACCGAATGTTGTTCATCTGAGCCTTCATGCTCT GCCCAGGCTAATATACGGCCTTTCCATTCTAGGCATACTCGGTATGTTAT TTTCATTTTATGCTTCATAGGAGTATTTACTTTTTTTTGAGGGGGATACT AGCCTTATGTTGAACATCAAACTTCACTAAAGCTTACATTTTTAAGCGAG TTACTTTTTAATCTATATACAAATTTTTCTTGAGGTAGGTTCATCCGCAC CTCTGATTTTTGTTCTAATTTTTTCTGGACGGTTTTGCCCCTCGTGGTTT GAATGTATTACAAGGCTGCCACCGCAAAGTCAAAACGGGTCGTTTCTCCT CCACCGCATCGGTCCTAAGCTACTTCCCCAAATCCGGTCGAGCAGCACGC GACCCGCTGCATAGGCCCTACATGAGGAGCCGCCGGGAACTATTTCCCAT TGCCTCACGTGACCGGCGCGGCGACCAAAGCCCACCGCCTCGCGCGGCAG CGGCCGGACCTGGCGACGGTGGAAGCAAAATTCCAGGGGCGCCTGCCTGG ACCTGGGCCGCCGCGGCATGGCCATTAGACGGTGGGGCGGCGGTGCCGGC TGAGACTGTGGGGAACAAGAGGAGGGGTTGTCGTGGTGACAACGCGGGTT GCGCAAGCGAGCGCCGATGGGAGCTCGCGGGAGGCGCGCGGAGCGGACGG AGATGCAAGACACGCGCGAGGTTGGGGTACATGGAGGCAGATGGAGGGGG CACACGCAGGTCGACTGCAAGGAAGGTCATGGGTGCACGCGTCGGGGACG AGCTTTGCAGGCAGCGGCCGTCACAGGAGAGGCGGCGCAAGGGCAAGGCG CCGGTGGCAGGGAGCGAAGCAGGAGGTGAAGGCGAGGCAACACAGGGGAC AAGCTCGGGGAAGAGGGCTCCCGCGCGAGGTGGAGATGAGCGGGATGGAC AGTGTGCTTGGCGACGGGGAAACAGGTGAGGAAGGGGCGCCGTGAGCATA GTGGAGGGGATCGACGCTGGAGGCGCTGCCTCTCGCGATGGAGTTGGGGA GAAGGAGGTAGGTGGGGATCGGTCGGGGAGTGCGTGTCGTGTTGCGCCGT GTGTGCTGGTGCACCGCGTGTGTTGGTCTGGCGCTGGGTGTAGTTATGTC GTGTGCGTGTGTTTGTGTCCTTCATGCGTTTGTCGGGCTGGGTCTTTTCT CTCCTGTTTTTAATTTTCTTTTTCCTATTTTTTGTTTTCAAATCCGGATA AAAGAGAAAGGGATTTTGGACAGATTTAAAAGGATCACTAAGTTTGAAGA TTTGGGACTTCTGTCCTAGAATTAAGAACATGTTTTGAACTAAAAAAAAT ACATTATATCTTGGTTTTAAAATATAAGGAGAAAAGAGAGCAAGATATAA AACCACATGAATAATTTAGGAAATGCAAAACACGGTCTGCGAAATAGTTT AAGGGTTTAGGAAAACAAGCCATACAGGTGCAATGCCTATGCATAATGTC ATGACGATGGAGTGAAATCTTAGTGGATAGATGATAATTGTTGGGTTGTT GTTTCTTACGCGTATGTTGTGGAGATTAGCTTTCTGTTCATACATAGCAA AGTAAAATCTATTTTCTTGGAATATTATGTGGCTATTTCGACGTGAGTTT CTATGTAAACTATATTTGTATGTGCAGTAAAAAACTTAAGTAAGCCTTAG CAACGCACGGGCACTCGGCTAGTTAACAATAAAATATCCATGTGCCATTC ATACCGATTGTTCCTAATGGAACATGTTACACATCAAACGACAAAGTCTG TAGTCTTAACATGTTACACATCAAATGATGAAGTATTAACATAGAAGCAT CTGAAGTAGCAAGTACTAGCCATTGGATTAAATGCTGAAAGCATTGGCGA ACTATTGCATGATGGCAGAGACCAACCACTAAGAGCCACTGTCCTTCTAG AAAGACCCTGAATTCCTCCACTTTGCACTTCCCATTTTGCATTCTAGTGA TTCGGTTAATCCACCATGATCTACACCATTCAAGTTGACATAACAGCTAG CATCATTTTATGTTTAAGGTTGTCTCCTACTGATACCCAACTGTCACATA TTTAATTTGATCATGCTTTATTCTGCATTTAGTATGATAGCATTTTTTTT GTTAAAAATCAAGAGGAGGTTTTTGTAGTTATTTTATGTTTAAATAGAAT GTTACTTATTTAGCCAATGAGTAAACTAATCTTTATATTCTGAACCTGCT TTGAGTATACCAATCCCAGTTGACCTAATGGTTACACAGAATACCATATA CTTACCCTCTCTATGACTGTGATGGAATAATTGGTACAACCAAATTATTT CAAACAGTTTAAAATTTCATTTGAAGGTTAACGATCTTGAGAGGGAATAC GCGTTTATAGTCATTTTCTGTTATAATTGAATGTCCTGTGATTGGTCTAT GCCGGAAAACAATTCTTACGTGTTGGGCTTGGACCTACTTTGAATGTGCC AACCCAGTTGACCTAACGGCTACTTATGAACATTGCACTCTACTACTCTT AGCTTACTATGAATGCAATAAAATAACTGGTCTTCAACCAAAGGGTGAAA ACGAGACATGTCTTTTTTTGGTTATCTCTTATCAGTTTATAACAAAAAGG ACAATTGCTACACACTTGTAAAGGGATCAATCTTCTCTTTTTTTTGGGGG GGGGGGGGTTCTTGCACATTACAACATGCAAGGCTGCCTGATCAGCCTAA ATTGACTAGGGTTTTATTTCTCTTCCCTTTGTTGTTTTTACCTTTTGGTA GTATTTAGGTTTGGTTAGCTTAGATTATTTTGACTTGTCTTGATTTTTGT CTTGTAAACTTGTGTCATCTTGGCTTTCTCCTTCTAATGCAGACGGCACA TGTTTGAGTAAAAAAGGCTATAATATTAACTTTTTGGGTAATGTTTCATG TCGGCCTGATTCCTAAACTGACAGAATTCCACTCTTACACCAAGGGTGTG GTTTGGAGTGGATATGTCTCCTCGGTCTAAACCATACATTGTTAACTACC TGGCCAATCTCTACATTAAATCCTATCAGTATTTCAATAAATGATATCAC CTCTTATCCTCTTGTGCTAGATTATGAAATAGAAGCCTGCACACTTCAGT TTTTTTAAGTACAAATATGTATATTTTCGAAACGAAAGCAAAAAAGAAAC ATTCTTCTCCATTTATTATAAGAGAGTTTAGACACGACATAACCACACAA AGTGGCCAAAGAAGCCAATCAATAGCGGCCAGCAAACGAAACACAAAAGC CTACTCTTGCGGTATGATGCTCGCTAAGTATTTCGCCCTGTGAGGGCCCA ATTTGCCATCTCTCTTCTACATTTTATTGTACTACTAAGCATATTTAGCA TTATGGTCAAGATAATCCTCAATGCTGTAGAGATAAAGCTGTCTTGTGAC ATTCTGTGAATTGTTTTTTGCTTACAGTGATGATAACATTGACATGAATA TAGAGGATATGATGGTTATGGAAGCGATTTGGCGTTCGATTCAGGTAAAG TAAAAGCTTTTCACATGACCCTTGAATGAACATATTAAGAGTATGTGACG TACTCCCTCCGTCTCAACTTAGTTGTCTTAGATTTGTCTAGATACAGCTG TATCTAGTTATAAAACATGTCTAGAACATCCGCATCTAGACAAATCTAAG ACAACTAATTTGGGATGGAGGGAGTATTTGATTTGAATAAATGGTTTTCT ATACCTGGTAAAAGAATAGGTTTTCTATATGAGCCACAGAAAAGTTAACG GTTTATTTTCTTCGTTCTTACTGTCCTGCCGTTTGAGTTTACAGTAGCCC ATTTGTGTTGTTACTGTTCTTCAAACAATGTGGTGGCAGATAATGAGATA TCTTACTCCCTCCGCCCTGAAATAAGTGACTTAGATTTGTCTAGATTCGT ATGTATCTAGACACATTTTAGTGTATTGATACATTCGAATCTAGACAAAT CAAAGTTACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACTTATTTTGGTAATTTCCT TAAAGTATATTTAAAGTTAGGAGTATGAAAGCAAAATTAACAGTACCATG TTTAATCATACTGTTGTTATTAAGCCAAAGGTTCCAGACAGTTCCTGCTC AAACATGCATATAGTTCCTAGCCTCGTGCTTGTTATTTGTTAATGTTTGC AAGTTACAATCAAATGTTCATATGATTAAGCAAAGAGAGACAAAGACCAA TGCAAACACACTACATAGAATTTTCAAGACCGACATCGGCTCCAGAACAT GCTGATCTTAGGGAGGTTTTAATCTTAATTTTTCATATGAGCCTAGACTG CCTATGATTTTCTAGTTTTTTTCAGTAGAAATATGTTTATAAGTATACTC TCACCTTCCCACTGAAATGATTTTTTATATTTAAAATTGTCTCCAATTGA TAAAGAAATATAGTTTTTGTTATTGGTCACACTTATTTTCTTCTAGAACT GTTGAGAGGATACTTAACTTATAAATAAACTGGATATCGCCAGATGCGCA ATCTAAAAATTGTGTAAAATTCTAAGTACTGAATGTAATTTGATACTTAT AAATAAATGGATATTGCCAGATGCGCAATCTAAAAATTGTGTAAAATTCT AAGTACTGAATGTAATTTGATTTTTTTGCACTTGTAATATAATAGACACA AACTATATCTTAGTTTTCTTATGAGCCTAGGCTGCATATTGTTTTCTACA GAACAAAAATCAGTTGAGCACACAGAGTATGTTCTAGTATAGTCTCATCT TCCCACTGATCATGAAAGTTCTGATTTTAAATTGTCATAAGTTGATGATA AGGAAACATAGTTTTGGTTACAGGACGCACTTATTTCCTTGAACTTTTGA GATGAGATTTATGTTTTAAACTTGATAATGTCCATATGCGCAATCTAAAA GCCATTTCGAATTTGTCTAACTCATGTACTTTCAATTTCTGCACTCATTG CTATAACAAACAAAATGCTAGGATTGGAAAATTTCCGTTGCTCATTTTAT AATACTCCCTCCGACCCAAATTAGTTGACTTAGATTTGTCTAGATTCGAT TGTATCTAGACATGATTTAGTATTAGATTCATACGTATCTTGACAAATTT GAGTCAACTAATTTGGGTCGGAGGGAGTAAAATAAAGAAAAGTTTGAATA CATATGTGGTTCTAATATGTTCACATGTTCTCTCTTAGCAGGAGCAGGGA AGTATAGGAAATCCTGTTTGTGGTAGCTTTATGCCTATAATCGAGCCACC TCCACGTGAACGGCAGGCATTTGTTCCAGCTCCTCTAGAAATACCTCATC CTGGTGGATATTCTTGTGCTGTTGCTGCTATGACTGAGCACCAACCACCA AGCATGGATTTCAATTACATGGCTGGTAATAGTGCGTTCCCTGTCTTTGA CATGTTCCGCCGACCATGTAACATTGCTGGTGGAAGTATGTGTGCTGTCG AGAGTTCACCAGATAGCTGGAGCGGGATCGCACCAAGTTGCAGCAGAGAA GTGGTAAGAGAGGAAGGGGAGTGCTCAACCGACCACTGGTCGGAGGGTGC TGAGGCTGGAACAAGCTACGCTGGCTCAGACATCATGGCAGATGCAGGGA CTATGCCACCATTGCCTTTTGCTGAAAACTACAATATGGCACCAAGCCAC TTCCGCCCCGAGAGCATTGAAGAACAAATGATGTATTCCATGGCTGTTTC TTTAGCTGAAGCTCATGGTAGAACGCACACGCAAGGGCTGGCATGGTTGT AA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.