Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005542

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005542
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005542
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCTGCAGGCGGCGCAGGCGATTGGCGCCGAGCGGTGTACAGGCAGAG AAGGCGACGCCCACCAAGCCATCCTGGAAACCGGCGGGCAGAGAGGCGAC GCCTCCGACCTGCGTTCTTCTGCGACCGGCGACCGGCGACCGGCGACCGG AGCAGGGCCCTCCCGACATTCTCCTCACCGTTTCTCCTCTCCCGCCTTTC CCCTCTCCGGCGGTCGTCTTCTCCTCCCAAGATCTGCTCCGCCGCTAATC TTTGTCCCCTCCGGCGACGAGGACGGCCGGCAGTTGCGTCTGTCTTTTTC CTCTTCGACGAAGGTTAGTCCCCTACTCCTCCCCCTCCTTCTTTTGCTTT CTCTAGTACATGTCTAGGAACGTGAGCACTGACGAGTTACTGCTCCAGAT TTAGGAACGTGAGCACCGTCTTCAGGTCTTCTTGTTGGAGTTATTGGTGT TGCTTAGAAGAACGTGAGCAGCTTGATTGCTTGATATCTTACCGTTAGAA CAAGTGATAGATATGGCTCATGGCAAGTTCTTGCAGCCACCATGGCCCTT ATTAATTTTGGCTCTTGGCTTTGCATTTTTACCTGAATAAGGACGATGGC TTATGTAGCTCGGAACAATTTTTTGGTCTATTTGTTCTTCTCGCCTGAAC ATGGATTCAGACACGGGTGCAATAATATATAACCTGTATAAATGTATACC TCTTTTTCCTTGATCCAGTTGATTGATCGCCCTGGAATCTTCCTCATTTT GCTGTCAGCTGCGGGTCTGTTTCCATGTATATGAAAAATATGAGTACGGG AGACAGTCTATTGACGCTGAAATATAGCATAGCATAGGAGTTTGTTTTGC TAGCTCGATTCCTATACGTGGCGCACATAAATCTATACTGTTATGCATTT TTGTTTTGTTATTGTTGTTTGAGTTATTCATATGCTAGTTAGTTGAGCTT GTACTTGTTAGTTGCTCATATGCTTAGTTCTTACTTTTACGGTAGGGTTT TCTTTAGTTCACTGCCATATGTGTTGAGCTAATTGATATATCTGTGTTTG AAGTTTTTCTTGTCCTCTTATTTATTTTGTGTATGCAGAGATTCTGTTTA GGGTTCCTTGTCGGGGATTCAGCTCGACGATCTTGAGGAAGAAGCACCCA CAATTAACTGATCAGGAGTTGCAGGTACTCGCTTTGTATCCTTGTCCCCT GCTATAGTGCTATGCATGCACAACTTCTGAAATAGCTGTACTTTTTTAAC TAGCTAGAGAAATTAAATAATCTGCACTTGTTAGTATATTAGTTCAGTAT TTAGGTGAGGAGTTAGTGTATTAGGACTGATGTATTGTTGTCCATTTTTG TTAGCTGGCTGTAGCAACTGGTTTATAGTATTTGCAATGGTTATACTGTA AAGTGTTATCTGCATACATAGCACTGATTCTCAACTTGCTATGATGAGTT ACTCTACTCATTGTGGTGTCATTGTGTTGCAGGGGATATAACTGCATGTT AGATCATTGAAAAATATACAGGTTTTTTTTTAAACCAAAAACTACTATGG TGTTGATCTGTTATATGTTTCTGCCCTTCTTTGCCTGATCTTTCTGTTGA TTGTTCTCCTAAATACCTGATTTTTTTAATATTTCATTAATTTATTTCTT GTTGAAATAATAGTGATGGTTCTAGAAGGGAAAAAATTAGGAAGTTTATA TTGCAAGAACAAGAGAAAGACGTTGAACTCTTCTTCGCTTTGGTGCCTAC TGTATATTCATCTCTTTACGAGGAAAAAGGACTAGTCCACACATCATATT TACCTGGTGCTAGATTGGCCAAGCAGATATTAGAAGGACATGGGAGTTGG TCTAGGGTCGAATTTCGGATGGAGCCCAATATTTTTAGATCCACCTCAAA TTATCTTAGAAGAGAGCATCTATTGGAAGGCACACTGAGGGTGAGTGTTG AAGAGGAGTTGGGCATGTTCATCCTTGTTTATCTAAGGCCAGAGTTCATG CCTATATCGATGCGATCAACTTGTAAACCTGCTCCTTATTGTGCAAGCAA TGCTGTTTTTGTTGATTAGTTGTGTAGCAGTATTTGCCATGAAATGAACT TGTGCATGACAATCTACACCACTTACTGTGTATTTCACATAGACTTGATA CCTATATTGCCAGTGATTGAACTTGTGTTTGTTTCTGTATCCGATGTTCT CACTCAATCGCAAATCACTATTTGGGGAACATCTCGATTTATCTAAGGCC AGATTTCACACCCGTATCAGCGTGATCAACTTGTTAAACATGTTTGTTAT TATGCAAGCAATGTTGTTTTTATTGATGAGTTTGTTTAGTACCATATACT ATGTGTGATATTGATGAAAAATCTAACAGCCATGGCTAGCTAGCTTCTCA GGTTATTTTCTGAGAGATGGTATTTCTTTGTTATCTCATCTATTGGTGGG AGATTTCACATGATTCCGTATTTGAAGTTTTTCAAACTCTTTTTATAATG TATTACTTTTGTCATTTATGTACTTGTATTTCACAGTATGTGTTTCCATG CTGATATTGCAGTATGGCAGCCAGATGCAACATTCCTTATTCTGTTCTTC CTACCGAGGACAGGGATGAAGACAATGTTGATCGTCGGTTCACATACACT CCAAAATCCTTGAGGAGGATCCTGTGGAAGTCAATTGCTCTAGCGTTGTT CCTCCTCCTCCTGGGAAGCACTCTCTTGTTCCTATCATATTTCATATCCA TGGGTCACATGGAGGGTGATAGCTCTCAGGTGTATGGCCTATTGTTCCTT GGTATCCTTTCCTTTCTTCCCGGTATGTCCATGTATACCGCTTCAGTTAC TGTATTGAGATTGATATGCATCTGTTTCATACTCTAGTATGAATGTTGTC TTCCTAAAATTATTCCGTGAGCTTCTGTATTTACTATATTACTATGGCCA CTTGCATACACCCAACCAGTTGTCAAACTCAAATATTTCATCGTGTTTAC TTTAAACTTTCTGTAAAACTAATGGCCACTCACGTCACCGTAGTAAATTA AGCATAGCTTAGTTTTTCTCTTATCATTGCATATGCCTCCTGTAGAAACA ATGTCCACTTGCATCACTGAAGTAAATTATGTAAGACAAGCTACACTCTT GATATGTACTGTAACTGGTAGCGAACTGTTCTATTTCAGACGAAGCATGT TACTTTTGGCATCTTGATTATTATGCTGAAAACATAACCATTCCTACCCT TCAGCATCTTAACTATTACACTGAAAACAAATATTTTCTCTCTTTAGCAT CTCAATTAATACGATGTGCATTAGGGGAAATGATGTGCTTTGTTCTAGTT GTGTGAAAACATCTATAGAACTGTTCCACTTTCCAGAAGACTAATTCTTA CATATACACATTTACATTATTTCTGCAGGATATTATGAAACTCGAGTTGC TTACTATTCATGGAGAGGAGCACAGGGGTACACCTTTGCGTCCATTCCAG ACTATTAGTCTTCGGTTTTAACTCATTGACTGGGCAGTGAAGATATTGAA CAGGGTGAGGGAAATGTGAAACGTCATCCAGAATCAAACGAGCACTTATT CTTAGCACTATAAACAGTTAACATGTACACGAGGTCACCTAGTGATGATT ACTGTCACATATGTTGCTGCTTCATCAGAATATTTGCATGTGCTGCAGGG TCTATTGTGCTTGCTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.