Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA002854

[Submit comment/correction]

Sequence	AA002854
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA002854
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCAAAACGCCCCTCTCCCCACTCCCTGACACCACCATCAGCTTTTGCAT CTGACACGCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCTTTCTCTCTCTAGCCCCACCAA CAATGCATCGGCAGGAGCGGCAGCAGCAGAGGGCGCCGCAGCAGCCATAG CCTTCGCCCTCCCTGCTCCCTCCCTCCCTCAAGATTTATCTATTCTTTCT CGGAGATAGATTTACATCATCCGGACGCCGTTTCTTGGGGATTCTTGCGT GTCTTGGAAGGTAGGATTATCGTCCTCGTCCTGGTTTCCCGATCCTCCGG GCCGTGTTGGATGGATGTAGTGTGCATTGCTGGTGGTGCGTGATGTCCTC CCGGCGTTGTTTCTTGCCCTCCATGGCCCCCATCTAGGCTGCGCGGTGTC CCCCATCTAGTCAGTCTAGGGTTATTCTAGGCGTTGGAGGGCAATGCCGT TGGTTTCTCGCGAATTCCTAGGGTTGTCACGGTTCGTGTTGTTGTTGTAT CGCTAGGCAATGCTGTTGGATTTATATGGTAGTTTTTTTCCTGTTGGTCG TGGTTAATTTGTTTGATTTATTCTTCTTGTTCTATCTGTAAAATGTTTGT TTTGATTTTTTTCTTTCAAGGGACGCAGTTTGTTCTGTTGCGCTTTATAC ATGTTTAGTTTTGTTTCCCTGTTCATATATAAAAGTAAAGTTTTGTTGCC CTGTTGCATCTTTCTGTTCTCTGAATGTTTCTTCACTCCATTGCTGCATC GTCCAAGAGCATAAGGTGATTGCCATTGTTTTTTTCTGGTCCTTGTAGAA ACGTCTGGCGAGCAAAGATTTCCTGAAGAACACGGTTGAATCTTTTTCAC ATGGTAGGCACATTCATTCATTTCTTTATGTCAGTTTTATTGTAATTTGT TTGCTATTACTAGGTATGATTAAATGAAAGGTTTGCGTGTGCCCAAAAAC TTCAATTGGTGACATTTCTGTTTCATGTAGATATCCAGTTTCAGCGAGAA GGGACACCACTGATTGGTTTCATAGTCTCCGCCTTCCTGGTAAATTTATT TCTGCGGATGGGAATGCTGCTGCTAACTTATCATATATATATTCCTGCAT TTCCTTGTCATCTGTCTGAATTACTGACTCGCCATGCTTATATTCGTAAA AAGGATGGTGTTGATACAAATGAATGTGTTTGTGTGGGTGGATGTAATCA TGAAGTCCATCTTCTCAAGTATATTTTGGCAGTACCGTGTGCCCCACGTT TCCCACGTCTTTGGAAGTTTTGTTGCTCACTCTTTTCAGCCCTCTAGATT TCCCTTGCACTGTTCTGATTGTAGAATTCTCTTTAATTGTATTTTGGATG GAAAATGTAGAATTAGAAATATCCATAAATAGGAGAATGACAATAACCAT GTTGATTACTGGGTCAGATTCGGATGGCCAAGATCAAATGACAAAAGCAT TTTGTATCTCTTTGAAAGTTCGCTTGGATTATTCTGTATTTAATCTCAGA TCATAATACCCTCTAGTGGCATGAACAATCTACACCATTAAAATCTGACC TGAGACCAACGTTGAAGTTCTTATAATGGGACACTCTGGGAGGTTCAATC ACCTTTATTCCCAAATTAGCTGTCCTACCATAATGGTCTTAATGGGTACT GTCACGGCACTGATGTGTATCTGGGCTTATTAAAGTAATTTCTTTTCTAT AGAAATTCCCAATACTTTCCTGATATACTTCAGATGATCTGATGAAAAAT GGATATCCTTGTTCATCTTCGGCCTTCTCCATCATGGGTTCCATTGCCCT CAAGCTCCTCCTCTTCAGATATGGTAGTACTGCAGGAGGATAGGCAGTGA TAGAGGAGGGTAGAGAGGGGCAACAGCTGACGACGGGCTCGCATGGCGTC TGCAGGAGTTGAAGCGGCATGAATAGAAGGAAGGCCAAAGGTGACGAGCC TTAGCGATACAACGAGCTAGAGTAGGTAACCCTAATAAGGCAGGCTTGTA ATGTGCAAAGGTCTGTTATTATAGTTACTCAATTGGAAGTTATATCTGAA GCTTGTGTTTCTGAAAGCACATTTGCAACTGAAGCCCAAAACCTACCCAT GGTATCAGTTAAACAATCAATTCAGGACGTGAGAATTTTCAACAAAGAAA TTCCTGTTGAGCAAAACAATAAAATACCCGTGGCAGAGTTCAAAATTTCG TTTTACAGTTTTTTGTCCCCAGCAAGAATGGGGTATTTCCCTAATTTTTT AATTTCCAAAATGAATCTATTTTTTTCACCAAATTCAGATTTGGACACCC GGCAATGTATTACTTGGATAGGCGATGCCATGTAAATGAAGTAAGTTGGT CCAGCCTAATGGTTTGTCTATATAGTTAATAGTTATCTACCGGCTAGTCT TGAGTTCGAGTTTCTACCTATTAAATTCTTTTTAATTTTCTCTACCTTTT CTAGTGAGTGTTGCATGACCAGGAGGTATAACATGCTAAATAAAGTCCAA AATAACTGCTATAACATGCAGTAAAATAGAATTAAAAAAGTGTGCGTATA AAGTCCAAAAAGTTTACCAATGCACCAGGAGCTATAACATGCTAAATATC TGCTCCAAAAAGCAATTGTTTTATTTCAAAATGATTTTTTTGGGGCAAAA CTGAACTTTTTGTGCCCTCCATCAAGAATTGCCAATTTCTCAATTTCTTT TACCAAAATCTAAATCTCTGCCCTGTGGTACAATGTAATTCCTCTAAAAA ACATCGAAAAAGGAAATCAGAAAACTTACTCAGCATTTAGCATTGCGTGT CTTGTCAAAAGATTACGTCATTACGCCGCTAAAGCAATAAATATTGCTTT CAATTAAGACCTTCTCCTGTTCTCCTGCAAGTAGCTTTTGGCACAGTTGC GCCAAATCCACCCCGAGGCCGTTGGGGCGATGCAAATACCTAACCCCTTA AAGGCGGCCAAGGTGATGAATTGATGATAATCTCTAATTCCTTGCCTCTC TTGTTTGTTTGTTTTTTCATCTGTGCTGTGCTATGCATTTTTTAGCTGAG TGCTATTTGCATTATATTCACAATTTTTGAAATCTTCATTCTGTTGGGCA ACTGGATCCTTACCTTTAAGGTTTCCTTGAAAATCCAGAGGATGGTTTTT GATGTTTAAGCTGTAGTACGAATCATGGATTTTATGTGATGTCCAACGGG ATTGATTCGTTAATTGAATTTTGGTTTAAGAGGTGACAATGATAAAACAC TGTCCAGTTTAGATAACTGTATTATGTTTCGTGTTGTGTTATCGAGGATT GGCAGGAAGTGGATGCTTTTCCAATTATGCTAGTGAAATGAAGTCTTACC CTGTTAAGCTCCTTGTAGAGTATTTAAGTTTACAATAATTGAGCTTGTGG TGAATTTATTGACACGAGAAAATGGAAATAGTCCCCTTTCAGAAATTGTA GACTTGTAAAACTGTCTAGACAATGGTGCATTGCAAAAGTGTATAGCGAA ACTAATGAGTCTAAAATTGACCTGATGTTTGGTCCATTCTGTTTTGCTAG CATACGAGAAATATAGTGTAGAATGAATGTCAGTTTCATTAGGTTGTCAA ATCTAAAGCTAGCCAAACAGAGAACCGCGAGAATTTGAATATCCATTTGA CCGTATTGCTCTCCTTTCTTTTATGAGTTTTTTTTCAAAATATGTGAAAT GATTTTAGGTGTCATAGTTCCCTATTTGCAGAGGAAAGTTGCTCAAACCA TAATAATTTTGGTACCTGTTTCTACTGAGATGCTAAAAGGTGAAAATTGT TTAAACTAACTATCAGATGCTTTCTGAATGGTAGCCAAGTGGTAGAAAAG GAGCATGCAGTATAATTTTATTGGTAATACTAACTTCTCCTAGCTGTAGG AAAGAAATGGAAGTAGTTTTTCTTTTCTGATATTGTTAGTCAGCTGACTT CAAATTTTGAAAAAGGCTCTAGTTCTTAAGTGCCATGAGTTTGATTTTTA ACCTGGAACTAAAGAACTCCCTACTGCACATCCTTCAACTAATAGTACCT GACAAGGGGCCCTCCATGCCCCGGTTTTGGTCTTAGAAGTGTGTGCAAAC ACAGGTGTTAATTTCTCTGTGCAGTAAAGTTCAAAAAAAATCTCTATGCA GTGGTGCCAATGCGCATTTTATTCGCATCGTTATACTACGGTGTCATTTT ATGTTTGTTTATATTTCTATATGTGGTGTTCTGTCCATTTACAGCGGTCT ATTTATGAATTTTATCTCAGTTAAGTAATCACTACGATTCTTATGATTCT TTCATCCAGGATTTGCGATGGATCCAGAAAAACGAAATGGGATGAGTCTG GAAGACAAGAGAGAATTAGTGTACGAGGTTGCTAGATTTCCACAAAGTGC CGCTGAGATTCTTCAATGCTGGTCTCGTAGGGATCTTCTTGAGCTTATCT GTACTGAGCTGGGCAAGGAGAGGAAGTACACCAATGTTCCGAAAGCTAAG ATGATTTCCCATCTGTTAAAATTAGTTTCAAGAAGGAATAGTCAGCTGAA GGATAATAATTCAAATGCTTTATTATTGGGGCAGAACAACAAAGATGTAA TGCAGAAGAAAGTAAATGGGGAACAGCCGCAGCATTTGACTAAAAGTGTA AACTCTGATCTGTCATTATGCAGAGAGGCCCATGCTGGTAATTTGATATG CAAAAATGTTGCATGCCAAGCCACCCTAAATGAAGGAGATGCATATTGCA AGCGGTGCTCTTGCTGCATTTGCCATAAATATGATGAAAACAAGGATCCT AGCTTATGGTTGGTTTGCAGCTCTGATAATCCATATAATGGGTTTTCATG TGGATTGTCATGTCATTTAAGGTGTGCTCTAAAAAATAAAAAGTCTGGCA TTCTCAAGAATACATGCAACAAGTTAGACGGTAGTTTCTACTGTTTTTGC TGTGGGAAGATCAACTGGCTAATGAGGTAAACCTATTGACAATTTTCATT TAAACATGCATGAATAAGGTGTTACAGAAATCATTTTTAAATCAAGAAAA TAACCTTCATGCAGTAGGCTCAGGGTGGTTCATGTTCTTAACCACTTTAT AACTGTGATATCCATAACTTTTTTGTGCAAAATAATTTGAAGGGCACATT TCACCTGAGAAATTTGTGCCATAGTTGTGTCCGTCTTACTCATACTCCTC AGTTATGTACTTGTGTTCCTAAAAAAACAATCTGGCAGTTAAATATTTGG TGAAGAATCAGAATATGGGTTAAGGAATTGTGATAGGCTATTACCTTTTT TCTCTTTGTTAGTTTTTCATCACGACAGTCTATACTTTCATCCTTCAGTT GACAAATTTCCGTGGAAAAAGAGAATGATGAAAGCAGCTTAACATTGATG ATTTGAAACACTATAATAGCCAATCCTTCACAAGTAACAAATGCTATAGT TTGTTTTCTCACACACTTTCTCTTGCAGGAATCTGCGGAAACAACTAGCT GTCGCAAGGGAAGCTAGAAGGGTTGATGTACTATGTGAGCGTCTGTCGTT GAGCCATACATTGTTCAAAGGGTCTGAGCGTTACAGGGAACTGTCCAGCA TAATTAGCTCAGCTGTGAAAATGCTTAAGCAGGAAGTTGGGGGTGTGTTG GATCATGTATCTGGAATCATTGGCCGGGGCCTTGTGAGCCGTCTTAGTTG TTGTGCTGATGTTCACAAACTCTGTTCTTCCGCACTAGAAATAGTGGACT CTACATTGGAAAGCACCTTAGTGCTTGAGACAAACAATAATCTGGAACCC CCAGGTAAGTTTGTATTGTTGACTTACTCGAGCAGCAGCTTCACTCTGCG AACTCATCCTTGTAGAACTAGTCTTAGTTGCATGTATTGAAAATGCATTT TTAAAGAACTCTTTACAAATGCTCCAGACAACAAATCTGTGTGTTAACAG ATGGTATTCACTTCTGCAGGTCCCCAACCCCGAATCCATTTTGAAGAGAT AACTTCATTTTCTTTGGTTATTGTATTGAAATATCAGGATAACAGTAAGG AGGACATTGATGGTTGCAGAGTTTGGCACCGAAGTGCCAAAGTACTCAAC TATCCAGCAGAGCCCACATGCCACATACTGAGGCCAAATACTCGGAACCT TTTTTCTGGTTTAAGCCCTTCAACTGAATATTTCTTTAAGCTTTTGCCTT TTGGAAGCACACGGGGTTTCGGTGAATGTGAGGCAAAATGCTCTACACGG AACCTTGACCGGGGCAGCAGCCAATGCTCTACGCAAAATTCTGAGAGCAT GTGCGTCAAAGAGGATGTACCACAGTATCAGAAAAAGGAGTCGAATGTGC AGAAGCCACCAAGGGCCATTGAATATGAGTCGCCAAAGGGTTCTACAAAC TCGAGTGAGAACAATGAGTCCCCAGAAAGGCATTACAAGCGGGCAAAGAT TGCGAGGCTGGATGGTGCAAGCGACAATGATGAAAGCCAGCTGCCACCGA CATCAGAAATTGTACCGTTCACTAGCTCCAACTCCTCTCCTTCAGAAGCT CCCAACAAACCCGACTGGCTTAGCAGCACCCCTGATTCGGCCTGCAAAAA CCATGTGGAGCGGCAATACGAGTACTGTGTGAAGGTGATCAGATGGCTGG AGCACGGAGGGCACATGGACAAGGAGCTCCGGGTGAAGTTTCTCACTTGG TTCAGCCTGAAGGCGTCGGCAAAGGACAGGCGCATCGTGAGTGCTTTCGT GGATGTTTTCATCAGCGACCCAGCTAGCCTGGTGGCGCAGCTGATGGATG CATTCAGGGACGCCGTCTGCAGCAACGAGAAGGTTGCTCCATCAAAGGTT GTTCGTTGCTACAGCCTTTGGCATTAGAGAGTACATCATTTCGACAGCAA TTATCTGCTGATTGAACACTGGACTAGTCGAGTTATTCTTCCTCCTAGAT TGTTGTGTTGGATTTTTTTTGATTTGTGGTGGTTGCACCATTGGGTGATA TTGGGTGGATGGAGGATGCTCTGAAGTTGTTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.