Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039159

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039159
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039159
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGCTGTCAATCAAGACCCAAGAAACGCCCGCTCATTAAACATGGTATGC CCAGCGCACGAGATCTCCTAGCCCTAGACGCACAGAGCGGACTGACCACA GGAGTCGCGGTTGAGAGCATCCCGTACTCTGCGCCCCTGTGCCCTCGCCG TCACTCCGCCTACCGAACTACTCTAATCCACCATGGCCTGCTGGAAATCG TGCGCAACCCCATCTTGGTCACACTCGTCAATAGGGATCGATCCTCCTCA ATACGCCATGGCAGCCATTCGTTGATCCTGTGGATGAATCGCCTTCGTCT TAGGCCGCTGCCATAGGCCTCTGCTATGCTCGCGGCGGATCTTCTGGTCA TCAGGCAAAAGGCCGACATCAAGCCCCCCGTGCTGGGAGATCGGGGGATG CTCCTATGTCAACTTCAAGCGCAAGGTGGGCACGCCTGGCCAAGGATGAC CACGCCGATCCCCGTCAGGCACGCCCGTGGTGCTCTGTGAGTTTCCAATT CCGGGCATCCAAATGATTTTAGTTTCCTAAAAATTTGTGCGTACTTCCGT CTGTGCAATTTACATGTGAAGATTTGTGCCAGGGATCTTTTCTACGCTCT CTTAGGATTTGGTCATGGAAATGGTCCAAAGCAACGAGCAGTGGTATGCT CTTTTGTCCCAGCGAAGCTCCAGGTTATGAAGTATCTCAATTTTCTATCT ACTTTTTTGTTTATCATATGTAGAACAACGCTCAACCAATATTTATTGAA ATTGACTTCAAAACAGTTTTTTTCCCCGAAACCTGCACCAAGTGGTAAGA AAGACTGAATTTGTATTGCCTGCTCCAGATTTCTTTTGCAGATTGAACTG AGAAAAAGGCCACGGTTTCGATAACAATAATGAGGCAAGGAACCAGCCTG ATCAATCAGTGAGCTAACGAGAAAAGATACATATATTAGTTGCTCAGCAC ATGAGTCGGTGTTGTTGATGTTCCTACTTAGGATCTAATACTGATAATAT TATCAAAACCAAGTTGTACTGGTAATCTTGGCTATTGTACTGATGTATGT ATATTTAATTAATTTTTATGTGTTCTTCTTCATTGCTTTTTTATCTACAC ATTTATTGACAGCTAATGAGATCTGTATTTTTAAAATGTAGAGATTTAGT ATATCTCCTCTCAGTTTAAGTTTAACTTAATGCATTATGTCTTTCACTAG GAATCAATCAACCAAGTCTAAATTGAGAAACTGAGGCGCTTAATAAAAGG TCAGCTATACGAGAGGGGTAGAGAATGGTGGAGGTGGTGTCACATCTATG GCGATCCTGCCACCCTTACTGTGCCGGCAACTCGCGGAGGAACTGAGTGT GAACCGTAGGAGGCGCCGACGTCCAACCACACGGGTAAGACAATGAACAG AAAAATAAATTTGTTTATTCTTTTGTTAGTAACTACAGATTTCGGAGACA TGAGGAAAGCACTTGATGTTTGCATGTAATTTACATTCTTGCAGAGATCA CTATCATGTTACTCATGCAATGCAGTCTGCTAACTTCATTACTACAGCTG ATAAAAAATAAAGTATATCCTTTTTAAACAAATTCTTGGTGGTTCATGCT TACTATATGGATGTAAGGCTACGAGAATATTGCATGGTCCATGAGCTATA CTCTGGTTCGACACGCGAGATGAAGATATCCCGGAACGTCATGAAGCCTA ATGGGTAATTAAACTGTTAAATTTTTGCACAATTTAAATGAATTTGTGTG ATGATTTCATTACCTTTGGAGTAAACCCAGTACATCAGAAAATAAGTGGC AACTTTTTTTATAATGGTTGTTGCGTAGACGTATAGTGGAATCACTCGGT CTTCTAGATGTGTCTCCAAGTAATTGTTAGTATATACCTTCATGTTCCAG TTAGTTTTTCACATTTATTTGTCGTCGTGAAGTGGTTTTCCAAGGTGGAC TGTGCTATACAATATTTTTTAGATAAAAATGATTCGGTCACATGAACGAT TTGTCCCCCTCTCCCCTCCCAGTGTTTGCTGCATCAGGTGCAATTGTGGA CATTGAAGGTTCCTATGCATATCTTGTAGAGTTTTTCTATTCTAATGAAA ATAGTAGGCGAGTTTCAGTCGGCTGCCATAGCCTGTATAGAGTTCTTGTT CGTTATGATTTCCTTGTTCTGCCGTGCTAAATGGATAATTAAACTGTTAA ATTCTTGCACAATTTAAATGAATTTGTGTGATAATTTCATTACCTTTGGA GTAAACACACTACATCAGAAAATAAGTGGCAACTTTTTTTTATAATGGTT GTTGCGTAGACGTATAGTGGAATCACTCGGTCTTCTAGATTCGTCTCCAA GTAATTGTTAATATATACCTTCATGTTCCAGTTAGTTTTCCACATTTATT TGTTGTCGTGAAGTGGTTTTCCAAGGTGGACTGTAACTATACAATATTTT TTAGGTAAAAATGATTTGGTCACATGAACGATTTGTCCCCCTCTCCCCTC CCAGTGTTTGCTGCATCCAGTGCAATTGTGGACGTGGAAGGTTCCTATGC ATATCTTGTAGAGTTTTTCTATTCTAATGAAAATAGTAGACGAGTTTCAG TCGGCTGCCATAGCCTGTATAGAGTTCTTGTTTGTTATGATTGCCTTGTT TCGCCATGCTATAAGTGATGAAATAAAAATCTAATAGCAAAAGTATTTTT GCTTTCTAGATGCTTGAGGTACACTATCCAAATTCTCCATGAGGTCTATA TGTAGTCGCCCATGCTACTCTGCTTACGGCGAATTGCACATGCTCACCAT TGAAGTCCACGCAGCGGTGGCTCGGTCAGTCGACCACGGCCCTGGTGGGA GATGGTGTGTGGAACAAACAACAAGAGTCGGGAAGATGAGTGGTGGTTGC CGATGAGGTTGAATTCAGCTGCCCAGGAGCGTGGTTAGAGGCCATCAAAG TCAGAGGTGATCATAATGCCATGGTAATGAACATGATAGGTAGTGCCGCC TGTTGTGTCCTACCTCCTATGTTCAGTTGAATGCTTATTTGGAACACACA TGTTCAACTCCACTGAAATAACACATAACTTTGTTATTACTACTTCAGAG TAACCAAAAAATCCATCAAATACATGTGGTAACTGGTAAGTGCTTAATGT CGGCTGCTAATTTAGTAAATAGTGCAATATAAGGACCCACATTTATATTC TTCCAAACAAAGCTAATATTTACTCATGTTTATTGGTTCCGTTGAAGCAA GAAGCTTTATTATATACTGAGGACATTATACATATCAGATTGATTTACTT GGTAGGGAAAAAATTGACATTGAAAATATCTTAGATGTAGTACAAAGTAC ACATCATAGGAAGTAGGGGTCTAATTCTCATCTCACCCGAATAGGTTGTT ATTGATTTTCATTGCACATATCACATGCTAACACTTTTCTCTCCGTTTTG TATAGATTTTTCAAAAGCAAATTGGGTGAGTTTTTTCATGATGTATGTCT CCTCAAGTTAGTATTTCAAGGATATTCACAACCTGTGCGGCCTACCCAAT AATTCGCGGTATGAAAAGTACGAACGGCAAAGTGGTTTCTCAATGGTGTG TTCTTAACAATTTATACCATCCATGTTTGTGTCTAAAATCATAGTGAAAT GCATATGGTGTGCTCTTAACCAATTCAATGCTCAATGGCAAATAGGTTAT GTTCTATGTGGAAAGGCTCCAAATAAGAATATCAAAGGCCACACAACTTA GCAAGATTGCAAGTGCCATTTATAGTGGACATGCGACTTATTTATATTTT GTGTTTTTATTTGTTGTTTGCATGCACATGATGTTTCAGGTCATTTTAGC TGAACTAACAACTATTCAAATACTATTTTGTTGTTATACTCCTACAAAGT TAATCAATATTTTAAAGGGACCCTATTTTAAAACAACTTTACAATGCAGA AAGAGCAAAACCAAATAAGACTTGAGAGTAGTGCACTAGCTGGAAGACTG GAAAGATCACTAACCTTAACTAACCCGTTGTGTTGGTCAGACCATGAAGC CATGATATCAGCGACCGTATAGATTTAAGTAAAACATCAGTGCCCTGAAA TTAAGGTTAGCTATAATAGCACTAAATATGCAGAATTATTGTATCGGTCT GAACCATCACCCATTCTAGAATTAATATGTGTTTTGTTCACATAAAAAAG AATATAGATAAATTAATACTAACAAGTATGCTGACATTTCGGCAATATTT CATCTTATTGTGTTGTAATATTTTGCTGGGCAAGGAGGATGCCGCAAGCT ACTGCACGTGAGAATGCGCTGGGAGGTGAACGCCTATGGCAACAATAGGT TAAGAAGAGGGGCTGGACTTCTAGGAGCAGTTGATGGCGATCTGTGAAAT AGGGGACTACGAGAGGTACAACTGCAAATTCTATGCTCAGGCGATTAACT ATATAAAGCCTCAGTTTCCCATTTTTGCTGAACATCAACAGATCGATGGA TATTCTGAATTCTATTGTGGTCGCAGACAAATAAGGAAATTGCAATTGGG AGCATTGCTACTCAGATAGTTTAGTCTTAGGATTGATGCTTACGCCATGA AGTTTTGGATTATTCATATACTCTCTTCGAACCATATTAGTTGATTCAAA TTTGTCTAGATATGGTTGTATCTAGCACTAAAACTCGACTAGATACATTC ATATCTAGATGAATATAAATCAACTAATATGGTCGGAGGGAGTATTTTTA TGTAATGCGCACTGACAACAACAATCTGGTAATGGGAAAATATCACTAAT GTACATCATCAGGTAGCATTACTTTGAAAGCTTAGTGCCCGTACATGATT AGTAGGACTGTAGGAGCTTATGACGATGTATACAGTGCCACAAGATGTTG TAGGTGGCGTTTGCCAGTAATTTTTGTTAGCCCATAGCAACTCCGAAGTC ATGGTGTTTGAAAACGACTACCGTGGTTTGTCGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.