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GrainGenes Sequence Report: AA035593

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Sequence
AA035593
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035593
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGACCCCGAAGGAATTCGAACCCCACCCGACTCACTCGAGGGTCGAGAC
TGCCATCCCCGCGATGTGGAACGGCGCGCCGCCGCCTCCGCTGCCGCCGA
TGGCGGCCGCTCCTCCTCCCCCAGGCACGGTTGGCGCGGCCCCACCACCG
CCGCCACCGGCCGCGCCGCCGCAAGCTGGCCAGCCGCTCACGCCGGCGGA
GCTCGAGGCGCAGCTCGTGGAGAAGGCCCGCAAGTGGCACCAGCTCAACT
CCAAGCGCTACGGCGACAAGCGCAAGTTCGGCTTCGTCGAGGCGCAGAAG
GAGGACATGCCCCCCGAGCACGTCCGGAAAATCATCAGGTAAAACCTCCA
GACCACGCTGCGCAGCCCCATGATGTTTCGTGCTATATCTAGTTCCTGTG
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CCTCATGCCGTTTACAAGCTACTTGAGAATATGCCGATGCCCTGGGAACA
GGTACACCCTTTACCTGTCAGTTGTCACTGTATTAGATATGGACATCGAT
AATTTTATTGTTGCCAAGATTACCTGTTCCGTATCCATAAAATAATAGAC
TCTTGTTTTCAGGTTCGCAATGTTAAGATATTGTACCATATCACTGGCGC
CATTACCTTTGTAAACGAGATTCCATGGGTAGTCGAGCCCATCTATTTGG
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TTGTTTTATGCTTAAAATGTATCTCTTATCATGAGCTTTTCACAGTGGGG
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AAAGAATGCGCTTTCCTCCATTTGATGACGAGGAACCTCCATTGGATTAT
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CTCTTGTGAAGACCAAGCTTATAAATGGTCCCAGCTACAAGAAGTGGCAT
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GTCAGACTTGATTGACAGGAATTACTTCTATTTGTTTGATATGGAGTCTT
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AATTTCTCCCACCTGGTATCTGACTGTTAGCAAGGTTTCGTGAAAACATA
AGTAACCATAACTTGTACTTTTCTGAATATATTTTCTTATGCTTTATTAA
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CCATTATACCGTGATATGGAGAAGGGGGATGAGGACTGGAATGAGTTTAA
TGACATCAATAAGCTCATCATCCGTCAACCACTTCGGACTGAATACAGAA
TTGCGTTCCCCCACCTGTACAATAACAGGCCAAGGAAAGTGAAGCTTTGC
ATCTATCATACTCCAATGATAATGTATATCAAGACAGAGGATCCAGATTT
GCCTGCATTTTATTATGATCCTTTGATAAATCCGATCACTTCAACCAGCA
AGGTTGATCGTCGGGAAAAGAAAGCAAGTGAAGAGGAAGATGAAGATGAT
TTTTGTCTCCCTGAGCATGTGGAGCCTCTTTTGAAAGAAACTCTACTCTA
CACTGACACAACAGCTGCCGGCATTTCATTACTTTTTGCTCCAAGGCCAT
TTAACATGAGATCTGGTAGGACACGCCGTGCTGAGGATATCCCTCTTGTA
TCCGAGTGGTTCAAAGAGCACTGGTGAGTACTGCAACGAGTTATGCATTT
CCATAGTTTCCTCTGGTATACTTTTGCCTCATGATTGCATCCATACCTGT
TTTGCAGCCCACCAGCCTATCCAGTTAAAGTCCGGGTGAGCTACCAGAAG
CTGCTGAAGTGCTATGTACTCAATGAACTACATCATAGGCCTCCTAAAGC
ACAGAAGAAGAAACATCTCTTCCGTTCACTGCAAGCAACAAAGTTCTTTC
AAACTACAGAGCTTGACTGGGCAGAAGCTGGGTTGCAAGTTTGCAAGCAG
GGCTACAACATGCTAAACTTGTTGATTCACAGGAAGAATCTTAACTATCT
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AGGAGAGAAAGAAATCTCGTTTTGGGAATGCATTCCACTTGTGCCGTGAG
ATTCTGCGACTTACTAAGCTGGTCGTTGATGCAAACATTCAATTCCGCTT
GGGAAATGTTGATGCCTTTCAGTTGGCCGATGGTTTGCAATACATATTCT
CGCATGTTGGTCAGTTGACTGGTATGTACAGGTACAAGTATCGACTGATG
CGTCAAATTAGGATGTGCAAAGATCTGAAGCACTTGATATATTATCGGTT
CAACACTGGTCCTGTTGGAAAAGGACCTGGCTGTGGATTTTGGGCTCCAA
TGTGGAGAGTGTGGCTGTTTTTCCTTCGTGGTATTGTGCCCTTGCTAGAA
AGATGGCTAGGCAATTTGCTGGCCAGGCAGTTTGAAGGTCGCCATTCAAA
AGGAGTTGCTAAAACAGTAACCAAGCAACGTGTTGAGTCACACTTTGATC
TGGAACTTCGAGCTGCAGTTATGCATGATGTCCTTGATGCCATGCCAGAG
GGCATCAAGCAAAACAAGGCCCGGACTATCCTACAACATCTTAGTGAGGC
ATGGCGCTGCTGGAAGGCAAATATTCCCTGGAAGGTCCCTGGCCTGCCGG
TTCCTATCGAGAACATGATACTCCGTTATGTGAAGTCCAAGGCTGATTGG
TGGACAAATGTAGCTCACTACAATCGTGAGCGTATCCGTCGTGGTGCTAC
AGTTGACAAGACTGTTTGCCGCAAAAATCTTGGAAGATTAACTCGTTTGT
GGCTTAAGGCAGAACAAGAGAGGCAACACAACTACTTGAAAGACGGGCCA
TATGTGACACCTGAAGAAGCAGTTGCTATTTATACAACTACAGTTCATTG
GCTGGAATCAAGAAAGTTCTCACCGATTCCTTTTCCCCCACTCTCCTACA
AGCATGATACTAAACTTCTTATACTGGCACTGGAAAGGCTAAAGGAGTCT
TATAGTGTGGCAGTAAGGTTAAATCAACTCCAACGAGAGGAACTTGGTTT
AATAGAACAAGCATATGATAATCCGCATGAGGCTTTGTCAAGGATAAAAC
GTCATCTTCTTACTCAGCGTGCTTTTAAAGAAGTTGGCATTGAATTTATG
GATCTGTATAGCTACTTGATCCCTGTATATGAAATTGAGCCTCTTGAGAA
AATTACTGATGCATACCTTGACCAGTACTTGTGGTATGAAGGGGACAAGC
GTCACCTCTTCCCAAATTGGGTAAAGCCTGCTGATTCAGAACCACCTCCT
CTACTTGTATACAAATGGTGCCAAGGTATGAACAATTTGCAGGATATATG
GGACACAAGCGATGGGCAGTGTGTTGTCATGCTGCAGACAAAATTTGAGA
AGTTCTTTGAGAAAATTGATCTGACCCTGTTGAATAGGCTTCTACGGTTG
GTCTTGGACCATAACATCGCTGATTATGTCACTGCAAAGAATAATATTGT
GTTATCTTACAAGGATATGAGTCACACAAATTCTTATGGTCTTATTCGGG
GTCTTCAGTTTGCATCTTTTGTTGTGCAATACTATGGGCTGGTGCTGGAT
CTCTTGCTTCTTGGTTTAACACGAGCTAGTGAGATTGCAGGTCCGCCTCA
GATGCCAAATGAGTTCCTTACATATACTGACACTAAAGTTGAGACAAGGC
ATCCCATCAGGTTGTATTCTCGATATATTGATAAGGTGCATATAATGTTC
CGGTTCACTCATGATGAAGCTAGGGATTTAATTCAGCGATACTTGACAGA
GCATCCTGATCCTAATAATGAGAACATGGTTGGTTACAATAACAAGAAAT
GTTGGCCTAGAGATGCAAGAATGAGGCTCATGAAGCATGATGTAAATCTT
GGAAGAAGTGTATTTTGGGATATGAAGAATCGCCTCCCAAGGAGTATTAC
GACATTAGAGTGGGAGAATAGCTTTGTCTCTGTGTACAGCAAGGATAACC
CAAATCTGCTCTTTAGCATGTCCGGGTTTGAGGTCCGTATACTGCCCAAG
ATACGTATGACCCAGGAGGCATTCAGCAACACAAAAGATGGAGTATGGAA
TCTGCAGAATGAGCAGACAAAAGAAAGGACAGCTATTGCATTTTTGAGGG
TTGATGATGAACACATGAAAGTGTTTGAGAACCGTGTCAGGCAAATCCTT
ATGTCATCAGGGTCAACAACATTTACCAAGATAGTCAACAAGTGGAACAC
TGCTCTCATTGGCCTCATGACATATTTCCGTGAAGCAACTGTTCATACGC
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CTTTTATACACCCAAGGAAATTGGAGGTCTGGGTATGTTGTCGATGGGTC
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GGTGTGACACATTTTCGAAGTGGTATGAGCCATGAAGAGGACCAACTTAT
CCCTAACTTGTATCGCTACATTCAACCATGGGAGAGTGAGTTCATTGATT
CACAGCGTGTTTGGGCTGAGTATGCTTTGAAGAGGCAGGAAGCACAATCG
CAGAACAGGCGCTTAACACTTGAGGATCTGGAAGATTCTTGGGATAGAGG
TATACCTCGTATCAATACGCTATTCCAAAAGGACCGCCACACTTTGGCTT
ATGACAAAGGATGGAGGGTGAGAACAGACTTTAAGCAGTATCAAGTGCTG
AAACAGAATCCATTCTGGTGGACACATCAGCGGCATGATGGAAAGCTATG
GAACCTAAACAACTACAGAACTGATGTCATCCAAGCACTTGGTGGTGTAG
AAGGTATCCTGGAACATACTTTATTTAAAGGAACATATTTCCCTACTTGG
GAGGGTCTGTTTTGGGAGAAGGCTTCAGGTTTTGAGGAATCAATGAAGTA
CAAAAAACTGACAAATGCACAGCGTTCTGGGCTGAATCAAATCCCGAATA
GAAGATTTACACTTTGGTGGTCGCCAACCATTAATCGTGCAAACGTATAT
GTTGGTTTCCAGGTTCAGCTAGATCTGACAGGGATCTTCATGCATGGTAA
AATTCCGACCCTGAAGATCTCTCTGATCCAGATTTTCCGTGCACATCTTT
GGCAGAAGATCCATGAAAGTGTTGTTATGGATCTTTGCCAAGTTCTGGAT
CAGGAGTTGGATGCGTTGGAGATTGAGACGGTGCAGAAAGAGACAATACA
CCCCAGGAAGAGTTACAAGATGAACAGTTCTTGTGCAGATGTCCTCCTTT
TTGCTGCACATAGGTGGCAGATGTCCAAACCGAGCTTAGTTTCTGAGTCA
AAGGATGTCTTCGATCAGAAAGCAAGTAACAAGTATTGGATTGACGTGCA
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CCAAATTTATGGACTACACAACAGATAATATGTCCATCTACCCTTCTCCA
ACTGGTATGTTTTTTAGTTTCCATGAAACTGCCAAATTATAGTCTTGTAT
GAACTGTCTATAGTTAATGTTGATTAATATCTATTTCAGGGGTGATGATC
GGACTCGATCTAGCATATAATTTGCACTCTGCTTTTGGTAACTGGTTCCC
TGGGTCAAAGCCCCTCCTCCAGCAAGCAATGAACAAGATCATGAAGGTAA
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TCTGGTAGATGTCCAGTTTAAATAATGCTATTGAATTTTCTCAGAGTTTA
CATAACGGTCTTGATTTTTTTTGACAGTCAAATCCTGCCCTGTACGTGCT
GAGGGAGAGAATAAGGAAGGGTCTCCAGTTGTATTCATCTGAGCCCACCG
AGCCATATCTGTCTTCACAGAACTATGGAGAGATATTCAGCAATCAAATC
ATATGGTTTGTGGATGACACAAATGTCTATCGGGTTACCATTCACAAAAC
CTTTGAGGGTAACCTGACCACCAAACCAATCAACGGCGCTATCTTTATTT
TCAATCCAAGAACTGGTCAACTGTTTCTTAAGGTTTGTTCCTTTTTTTTC
TCTTTCACCTCTACTTTTCCTTTAATTATAGCATAACTGCAGTATCGCAA
GGTCGCACTGGAAAGGCTTAAATGAAAATACGTCTAACTTTGCAGGTCAT
CCACACGAGTGTATGGGCAGGACAAAAGCGTCTCGGGCAGCTGGCCAAGT
GGAAAACAGCCGAGGAGGTGGCTGCATTAGTTCGTTCTCTTCCTGTAGAA
GAACAGCCAAAGCAAATTATTGTGACAAGGAAGGGTATGTTGGATCCATT
GGAAGTCCATTTGCTTGACTTCCCTAACATTGTTATCAAGGGTAGTGAGT
TGCAGCTGCCATTCCAAGCTTGCTTAAAGATTGAGAAGTTTGGTGATCTT
ATCCTCAAGGCTACAGAACCACAGATGGTTCTTTATAATATATATGATGA
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TATTACGAGCACTACATGTCAATAATGAGAAGGCTAAGATGTTGCTGAAG
CCTGACAAGACAATTGTCACGGAACCACATCACATCTGGCCAACTTTGAC
TGATGAGCAGTGGCTGAAGGTTGAATGTGCGCTCAGGGATCTCATCCTTT
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GAGATCCGTGATATAATACTTGGTGCTGAAATAGCCCCACCATCACAGCA
GAGGCAACAGATAGCTGAGATTGAGAAGCAGGTAAGATTTGTAATAACAT
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CACTTGCATTTACTTCAATTTGCAGTCCCGAGAGACAACACAGTTAACTG
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TTTCCTGTATGGGCTGAGTCCACAGGATAATCCCCAGGTTAAGGAGATCA
GATGCATATCCATTCCCCCGCAGCATGGAACTCACCAGATGGTGACTCTG
CCAGCGAATCTTCCAGAGCATGAGTTCCTTGCTGACTTGGAGCCATTGGG
ATGGATGCATACCCAGCCGAATGAAGCTCCTCAGCTATCACCTCAGGTTT
GTCTCCTACCATTTCTGTCTTCAAATCCAACCATGTGATCTTATTTGCAA
ATCTATAACGTGTAATCAAGCAAATTTATGTCTTTCCATCAGCTAATTAT
CTCCTGAGACATTTGAATTCTGAATGAGACGGCACTATTCATGCAATGAA
ACATGTATTTAATATTTAGAGATAAATTGCTTTTCTATACAAAGTACAAT
ACACAATTTTATCTATGCAACTTACACTGCACATTACATACAAATATATC
GCCGTTGGTTGTTTTGTTTCTTGTACATTTTATAATAGTGTTGCCTGTGG
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GGCAGAGTGCCTTTTCCTGTGACTTGGTCTCTACCGAACTCTGTTCTGTT
ATTTCTTGCAAATGCTACCTTTTTTGTGTGTGATCCAGATGGAAATGAGA
AATAGGAACTAGTTGCTCATCGGGCTATCTAGACCATGGAGGGGTTTTAG
GGATTTGGGTAGCTTAGATGAGCATATTCCCTTGTATTTTTTAAATAAGT
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TGCAATATCTTTTGTGTTGTGTGCAGAAAACAAGTTTATAAGACCATGAT
ATTAATTTTCCGGAACCAAATTTGTTTTTCTGCAGAAACATAAAAGGTCC
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GATGACATATATAGCAAATAATGGGTGGTCCAGATTAGAGCTGCCGTGGC
AATGGGCTGCTGAAAATCCTCTTCCCTTGATCCAGAGTCTCAAATACTGA
ACTGTTCATTTCTGTTTTGTCCTTCAGGATTTGACATCACATGCTAAGAT
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AGCGGTTATGAGTGGGGCCGTAGCAACAAGGACAACGGGAGCAACCCACA
TGGTTACCTCCCAACTCACTACGAGAAAGTCCAGATGCTTCTCAGCGACC
GCTTCCTTGGATTCTACATGGTAAGGACTGATGATCTTAGCAACCCATAC
ATATGAGTACTTTGCAATTGTTCTTCACAACCTTTGAACTATTATTCACT
AAACTTCTGTCTTCACTAGGTTCCGGACAATGCTCCCTGGAACTACAACT
TCATGGGAGTGAAGCACGACCCGTTGATGAAGTACAGCATGAAGCTGGGG
ACACCCCGAGACTTCTACCACGAGGACCACAGGCCGACTCACTTCCTGGA
GTTCAGCAACATCGACGAGGGTGAGGTGGCCGAGGGTGACAGGGAGGACA
CCTTCTCGTAAGACACCCTACTGTACTGTAGCACGTCCTCCGCCCTGTCT
TTAGCACATCGAGACCTTGCAATGAACTCTTGGTCAGTTTTGAATGGAGG
CATCTCTGTAACTCGTTACTTTGACTTTGAGCTGCACTGAAGTATTCACA
GCTTTGAATGCGGTTGTATACTTTCTGTTGTAAGTCTGCCCTTCAAGCGG
CATGCTGTACATACAAGTGCACGCATGATAACGGTGAATATTTTGCTTAG
TGGCTATGCTACTGAATGCCATCTCTACTTGTACTTGCTGTTACTTTACT
GTCTGTATGGTACTGAAATGTCCAATCAGCTAGCTCCACTGCTTTTGGCC
AAACAGAACATTTTTGGCTTGCCTAGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.