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GrainGenes Sequence Report: AA040003

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Sequence
AA040003
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040003
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTCACACTAGTCACTCCTCTCCACCCAGGAAGCGGCTGCGGGCTGGTAC
TGTTCATCCCCTTCTTCCTCACCCCCGATCCGGCCACCTCGCCGCGCAAA
TCAGGCCCCGCCGCCGCCGCCGCATTCCTCCGCCGCCACGAAAATCTAGG
CTAGGCCAGTCGTTTTTTCAGCTATTCATTCCGCTCGCAGCTCTTTCTTC
CCGTCGCCTTGTTTGACCACAGCCGACCAACCACCCCACCACACCACCTC
ATGCCATTCAAATCTCTCGCCGCCACGGCCGTCGCAACCGACCAGTAGCC
TTCAGCCGGTCCGTCGCAGCCACGCGCAAAAGCAGCGGCACGGCGAGCCC
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GGCCATGGTGTCGCGGGGCCTCTTCGGCTGGTCCCCGCCTCACGTGCAGC
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GACTGGGCGCTCATGGCCGCGGGCGGGGTCGCGGCCGCCGCGCACGGGGT
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TTGGCTAGGCGACACGAAAGGGGTCAAACTTAAAGGAGGCGCCCAAAAGT
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GACTATCAAGATCTGGAGTGCTCATGCTGACCAAACACAAGCTCTTCTTG
TCTGGTTCTTCACAACCGGATTGTTGCGTCCGACATGCTTGTTGTCTGGG
ATTGGCCGCATACCTTTCATTTGTTCTTATCTACATTTTTATAGTTTTCA
AAAAATGCTAGTAGATGTTTCCCTTTAAGTAATGTTATTTATTTTGACCC
GATACAATCTGACTATGCACTGTAATTGAGTCGATCTTATTGCATTATTG
TGCTGAGCTCGTGCCACCGCACATTTGGAACCCCAACTTGCTGTTAGGAT
TGTCTACTTATGTTTACTGGGTCAAATTTATTTCTATGTGAATCTGAATG
GAAATCAACCGAATCACCCAGGTGCATGAAGAAAATCAATCTCACATGGT
GAATCTCCACAAGTTCATTCATGAAAATCATTTGCATATTGGTCTAGCGA
AATATCACACTTCACTGCTCACATACCTATTTTGTAATTTGTCACGCTAA
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ACGTTCACTTGTCTAGCTGTCTCCTTATTAGTTTTTTCTATACCAGATTA
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TGCTTTATACTTCCTCTATATAGCCATTGGTGTTTTCTTTGCTGGATGGA
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TGTATTTCACAAATTTCACCAAGTTCTCCTATATATATACAGAGGTTTCA
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TCTGCTCTAAGTGAGAAGGTGAGTTTTTATTGCTGAACCTTCTTAATTAT
TGATAATGAATTGTGTGCTTAATTATATATCTGCTATAAGCTTATTGAAC
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ACCTTTTGAATTGTGGATAATGAGTCACATGCTTAATTATCTTTCGACCA
TATGTCCTACTGATATGGTCTATGGATCATTTTGTATTTTATCTTGCTGT
TGCGTGGTCCATTGAATTGTGTTTTGTTGTTTTTAGGTTGGAAACTACAT
CCACAACATGGCTACATTTTTTGGTGGTCTTGTCATTGGCTTGGTGAATT
GTTGGCAGATAGCTCTTTTGACATTGGCTACTGGACCCTTCATTGTTGCT
GCAGGAGGAATATCAAACATATTTCTCCACAGGCTGGCAGAAAATATTCA
GGATGCGTATGGCGAGGCAGCAAGCATTGCTGAACAGGTATATTGAATTT
GCCTGTGAATCAATTAGAAAAATAGAACATGTCATGTTGGCATAGTGCAA
TTTAGTTGCAAAATTAAGCATGCTTGGTTGTTAGTTGCATCCATCAGCTA
GCTATAAATGAAGTCCTAAATACACCTGAGCAGTGCTTATTGTGCAGGCA
ATCTTATACATTAGGACTTTGTACTCCTTCACAAACGAGACGCTGGCAAA
GTATTCTTATGCTACCTCGCTTCAAGCAACTCTGCGCTATGGGATTCTGA
TTAGTCTGGTGCAAGGTCTTGGTCTCGGGTTTACGTATGGGCTTGCCATC
TGTTCTTGTGCCTTACAACTTTGGGTCGGGAGATTCCTTATCTCTCATGG
AAGAGCCAATGGTGGTGAAATTGTGGTTGCCCTGTTTGCTATTATTCTGA
GTGGACTGTAAGCATGCTAATTTTAAGAGATTTCCTTGCATCTCTACTTG
TACACTGACAATCACCTTACACACTGCTCTTAACTTTTGCAGTGGACTTA
ATCAAGCAGCAACGAACTTCTATTCCTTTGAGCAAGGACGCATAGCTGCA
TACAGACTCTATGAAATGATAAGCCGTTCAACTTCTACTGTAAACCAGGA
TGGGCGTACCTTAACTTCAGTACAAGGCAACATCGAGTTTCGTAATGTCT
ACTTCAGTTATCTATCCCGCCCAGAAATCCCCATTTTAAGTGGGTTCTAC
CTTACTGTACCTGCCAGAAAGACTGTTGCTCTTGTTGGTAGAAATGGTTC
AGGAAAAAGCAGCATAATACCTCTCATGGAGCGATTCTACGACCCAACCT
TAGGTATTATAATTTTATTTGGTCTCCTTAGGTATTATAGTTGCAAGTTA
TTTTTTTCTACTATCTTGTCATCTCAAGTACACTTTTGGTTTATTCGTGA
TTATATGTTGCAGGTGAAGTACTTTTGGATGGAGAGAATATAAAAAACTT
GAAGCTAGAGTGGTTAAGAAGCCAAATAGGACTTGTGACCCAGGAACCAG
CATTGTTGAGCTTGAGCATTCGGGAAAATATTGCATATGGAAGATCTGCT
ACAACTGACCAGATTGAGGAGGCAGCCAAAACAGCTCATGCACATACTTT
CATCAGTTCACTAGAAAAAGGATATGAAACCCAGGTACCATACATGCATT
ATCTTAGAAGTTAATGTAAATGCATTTCATTTATTTATTTTTACTCTTCT
GTCATCCCTGTTTAATTCAAACTAAATTTATAATAGGTTGGTCGTGCTGG
GCTTTCTCTGACGGAGGAACAGAAGATAAAGCTCTCCATTGCTCGTGCTG
TGCTCTCAAATCCATCAATTCTTTTGCTGGATGAAGTTACTGGCGCTCTT
GATTTTGAGGCAGAGAAAGCTGTTCAGGAAGCACTAGATGTTTTGATGCT
TGGGAGGTCTACTATCATCATAGCTAGACGTCTCAGCCTTATCAGGAATG
CTGATTACATAGCAGTGATGGAGGAAGGCCAACTTGTTGAGATGGGGACA
CATGAAGAATTGTTAAATCTTGATGGTCTTTATGCTGAACTTCTTAAGTG
TGAGGAAGCAGCAAAACTTCCGAAGAGGTCAGTGCATCATCTTCTACGCA
ATTAGCAATTCTATTAGTTCCATGGAAGTAGAACTTGTATGTTGCTACAG
AACTTTCCTGATCCTTTTTTTTGAACAGCTGTTATTTTGTTTTGATTAGA
GTTCCTATGATGATGCAGAAATATCTTAAAAAATAAATCTGCTTATGTAC
AGGACTGCCATTTCACATTTCAGCATGGCAGATTTGTCTTATCTTTAGTA
TGTTAATAGTTTCTCGAATACATGCTTTATTTTTGTCACTTGTCAGTATC
AGGTTCCTATTATGTTATATTTTGTCTGATTTTTTTATGTCCAACTTGAT
GGTGACATTCCTCATTATAGATGCTTTTTTGTTTGTAACTTCTATCTTTG
AGTCCCTTTTAACCTTATAAGAATAAAGATGGTAATTCATTGGCACACCA
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AGATGTAATTTCTTCATTCTTGGTCTTACTCATATGTGCATTTGATTTTG
TACAAAAATATTTTTTGTCATACACACGTGACCTGCATGGCGAAATATCT
AAGTTATTAGTTATGTACATATATTTATATTTTGATTGAGTTTTTCAAGC
ATTATGTGAAACTGGTCTCTTAGACCATGCACTATGTGTGTTAAAGCGGT
TCAAAGGCTCCTAGGAATCGATTAAATACATAGCAGCAAACCGATGCCTT
GTGTCAGAGCAGAGAAGCGCTGCAAGAAGTTGGTTTGGTTCAATGAGATT
GCTTTGTCAGGGGCAGTACATCAGGTCCACATGGCAGAGAGAAGAGGGCT
AGCTTTAAAGAGAGGGGATGTCATATAAATAACGATTGCATGGCTGACAC
ACTCCTCAGGCTCCAAATAAAAAGCGACTTCACACATTGCAGCAAAACCG
TGTCGACTCCTAACTCTTGACATCTTTTTAATTGAACTGGCTCACCATAG
TGGATGGTGTTAGCTTACAGAAGAGCTGTAAGTTTTGGATGATCATTTAT
AAATCACAGATGTTTGGGCTTCTTAAGTTATTGTAGTGACAAAATTACAG
TTCTTGTATGTACTTTGCCCACTGTAAGCTCTGATTTTTTTTAATGTTTA
GCTTAGATCTGATGCAATTCAGTTCCTGTTATATATCTACCTTGAGCTCT
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TGATGTGTTTATTTGTTTTGTTGGTTGATTAAAGCACTTGTTTTCTCCTA
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CTATCATGTCAAAATCACCGTCACTTCAGAAAACACATGGTTTTCTTGCA
TTCAGAAACTCTGATGCTAATCATAACTCGCGTGAGTCACCAAACATTCA
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CCTGATCTTCCCAAAATCGATGTCCCCCTGCACAGACAGTCTTCAAATAC
TTCAGATCCAGAATCACCAATATCACCATTATTGATTTCTGATCCAAAAA
ATGAGCGTTCCCACTCAAAAACGTTCAGCCGAACTCTTGATATGTTTGAT
AATTTTCGTGCTGATGAGTCAAAGAAGCACCAAACAAAAGCTCCATCATT
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GGAGTGCTGGTGCTGCTTGCTTTGGTTCATTTAATCCTCTTCTTGCTTAT
ACAATATCTTTAATAGTGGTGGCATACTACAGAATAGGTGTCCGTGATGT
ACACGATGAAGTGAATAAGTACTGCTCATTCATTGTTGGCATGGGTATAA
TTACCGTGCTGGCTAACTTCTTGCAACACTTCTATTTTGGTATAATGGGA
GAGAAAATGACTGAGCGTGTAAGAAGAATGATGTTTTCAGGTACGTTTTA
AACTATGGAGAATTCCATTCTTCTGTCCTTGATGGTGCAAACCCTCCTTT
TGTAACATGTGCTTGATCTAATATCAAATGCATTAAATAATGGTACAATG
TTCTTACATGATATCTTATTATTAGTATAAGAAACTGTCATTGTACTGCC
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TCAATGCGACTTGCAAATGACGCAACATTTGTCCGTGCTGCTTTCAGCAA
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TTCTTGGTATGCTGCTAGAATGGCGTGTAGCTCTTGTTGCACTGGCAACT
TTGCCTATTCTTGTGATTTCTGCAGTTGCACAGGTTAGCTCTCACCACCT
TTCAGCATTCTAATTCCTGAAGATTGTAAGGTTATTTGTTATGAAGCTTC
CCTCCTGCATGTATGAATATATCTTTTATACTAAATGCCTATGTCATGGT
GTTACACTGTTAACAATTTACACAATTCATTTAGATATTTCTTGGTAAGA
TTCAAACTGTGTCCAAGTATGAGTTCCATTGAAACTTGAAATCATGTTTT
TACATATTGATATATCCATTGTGTTATCGTTACCTGGCAGTTGCAATACG
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TCCTATTATCTCCCATCAAGCCTGGGTTGCTAACACAATAGCATGCACAA
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GATGAGTGCACTTCGCTCTTTACTAGGAAATTTCCCGTCATCATTAATTT
GGCAATAGCTATATTATGTTCTCTCTCTCTAAGTGTTACGAGTAAAGCAA
CCTCATATTTTCTCCCATCAAACCTGGGTTGCAAACACGACATGAACAAC
ATATTTCCATTCATCTAACAGTTTACAAAAGTTACTTCCCATTGGTATAC
ATTCTAATACCAATATACCATCAAGTGTGTACTTGTAGTGTGCCTATTGT
CTATGAGACTTGCTTCTGCTTTTCTGTTTCCAGTCCATTCAAGTTCAAGT
ACAAATTTTAATCCACAGCTGTGTTACTTTGTTTAGCTGTCGGTCAAGAT
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GCTTTCTGGTTTTTCTAGAGGAATTCAGGAGATGCACAGGAAAGCTTCTT
TAGTTCTTGAAGATGCAGTCAGGAATATCTATACTGTGGTGGCATTTTGT
GCTGGTAACAAAATAATGGAGCTTTATAGATTGCAGCTTGGAAGTATTCT
TACCAAAAGCTTTGTTCATGGGATGGGCATTGGTTTTGCCTTTGGCTTCT
CCCAGTTCCTTCTTTTCGCCTGCAACGCACTTCTGTTGTGGTATACAGCC
GTTGCTGTGAAGGATGGACATCTTACCCTAGTAACAGCACTCAAAGAGTA
CATAGTCTTCTCTTTTGCGACTTTTGCACTAGTGGAGCCATTCGGCCTTG
CGCCATATATTCTGAAGCGCAGGAAATCCCTGACCTCAGTGTTTGAAATT
ATTGATCGTGTCCCCAAGATTGATCCAGATGATGCTAGTGGCCTCAAGCC
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GATAATTTCTTTGATCGAGAGATTCTACGATCCTACTGCTGGGCAAGTTT
TGCTGGATGGCCGAGATCTGAAGCTGTTTAATGTGAGATGGTTGCGGAGC
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AGGCTGCCAGGATTGCGAATGCTCACCATTTCATCAGCAGCCTGCCTCAT
GGATATGACACACATGTGGGAATGCGTGGAGTGGATTTGACTCCTGGGCA
GAAGCAACGAATTGCCATTGCCCGTGTAGTGCTGAAGAATGCGCCCATCG
TGTTGCTTGATGAAGCCAGCTCTGCTATCGAGTCCGAGTCAAGTAGGGTG
GTGCAGGAAGCTCTTGATACATTAATCATGGGGAATAAGACGACGATTCT
CATCGCGCACAGGGCGGCGATGATGAAGCATGTGGACAATATCGTGGTGC
TGAACGGCGGCAAGATTGTCGAGCAAGGGACGCACGACTCGCTTGTGCAG
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CCGCCAACGTAGACTGATATAGATGGTCCGGTAGATTCTGTACATTGTTT
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ATGGCTATTTGTGACCTGACAGAATAGGATTGACACAGGCTCTGGACTGG
AGACATGGTATTGATTGTTCTGAAATTATACTGGGGCTTTGACAGAGCCG
AAATACCATTACCGAGATTTCTTTTTTTGCGACACCTTTACTGGGGTTAT
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CAGGCTGTGCTGCCTACCCAGATGCTTTTTTTTGTAACTGATGATGACTA
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TTTTTGTCTGTGTGAATCGTGATAGTTTGGCACTGAGGTGTGTTAAGTTT
AGAAGTAGTGGGTGACTGGATTAGATAACTTTTTTGTACGGAATTGCTTA
ATTTGTGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.