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GrainGenes Sequence Report: AA012315

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Sequence
AA012315
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012315
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCACGCCGATGGCCGCAGTGATCCCGCGCTCCCCTCCCCCGTCGGC
CCCCTCCGCGGCGGAGTCCGCGGCCTCTGGCGCCGTGGGGACGGCCGCCG
AGGCGCCGGTGCTCATATTCGTCTACTTCCACAAGGCGATCCGCGCCGAG
CTCGAGAAGCTGCACGCCGCGGCGGTGCGGCTCGCGGCGGAGGAAGGCGG
CGGAGACGTGGCGGATCTCGAGAGGCGCTGCCGCTTCCTCTTCTCCGTCT
ACAGGCACCACTGCGACGCCGAGGACGCGGTACGGTTATCAATGGCGCAC
CCCCCAAGCCTCCTTCTCCCAGTTCTCGATCGCTCTGTCTTACTGAATTT
GTGTGGAATAACATGGGCTACGATGTGTGAGAATGCGGAATTATGTCTGT
GTGGTGGTTTAATACCGCGGAATTGTAGAATCGAGTCCGGGATTTGGGTT
GTTGGATTGGGTGTTTGAAGTGAGGTGTAACACTGCAATGGTCTGAAAAT
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TGACAGTCGAAGGCGATTTCGTTTCTCTATCTGGCAGCAGTATGTGATTT
ATTGCCATGCTGTCTGGGCGTAGTGTGAAGTTCCGTTTTAGGAAGTTTTG
AGTTGTCGAATCAAACAGGTCATATGCTGGGAACTCAGGATGCACTTTTG
GCTCAACGCCTTTGGCTATAGAGATAGGAGGTTATGTGAAAGTTATATGC
ATGTCTTTTGTGGCCTTTAGTTAATTTTGCCCCATCTCTAGTTATCCTAT
TGCCTAATCTGATATATTGAACTACAGGACAATTATAGAGTAACGTCATT
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TGGGTACACACTATGCTGGTATAACGAGACTAGACATTGATTCCAATTTC
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GCCACCTATGAATTACTGGAGTATCTCTAGAATGTCTCGCTAATTGCCAT
GTCATGTATATGAGAATGAACTTTTGCATTCTGTGATCTGTATCAATCTT
ATTGTCCAAGATTCACATAGTATATACACATGTGCTGGTAAAGCATATAG
CTTTGATTAAAGTGCTTCGAACAGCTTAGAAAACTGAATGGCGAACCTAA
CAGTAAATACTATCATTCACATAGTGTATATTAGTCTGCCCCCCTGTCAT
TATTCGTTCCTTTCAGCATAGTGCATACAGTTTTAGTCGCTAATCATGTT
GAGTATGTTTCAGGTCTTCCCGTTGCTTATTACCAAGTTTTCATATGAAG
AGCAAGCTGATTTAGTCTGGCAGTTCATATGCAACATCCCTGTAAATATG
ATGGCAGAGTTCCTTCCATGGCTCTCATCTTCTGTTTCACCTGATGAGCA
CCAAGATATTCTTAACTGCTTGCATAAAATTGTTCCTCAAGAGAAGCTTC
TCCAACAGGTTCTCACTATCATGCATCTTTTGATAACAACAAGGTTTGGC
ATGTTCACTTAATTTTAGTTAAAAAACTCGTGTAGGTTGTGTTTGCATGG
ATTGGAGGTAAAGCAATAAGAATGGTGGCACAAGATTTGGATAATCCTTG
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GCAGATGCTCACATGAGCATTCTAAAGTCGGAAAGCGGAAGTATGCACAA
TCTAGTCACTGTCAGCTTGCAGTACATCCAATAGATGAGATCTTGTGGTG
GCACAATGCTATCCGAAAAGAATTGAGTGATATAGTAGAGGAGACAAGAA
AGATCCAGCAGTCCGGAGATTTCTCCAATATATCAACCTTCAATGCGAGG
CTTCGGTTTATTGCAGACGTGTGCATCTTCCACAGGTCTGTGACTTTGAA
TCTCAATTTATGTGCACCTTTATTTGAAAATCACAAGTCATCTCTTTGAG
TGAATGTAGAGCATCAAATTATATGTTTGGACAGCAAGTGGTGGTTTAGG
CGCAACTCTTCTGAATGACTGTGAAGTCCTAAAAACCTAAGATACTAGCT
AGCACAGTGAATGATGTTGTGAATATCTTCTTATTTGCTTTGCCTGGAAT
TATATGGTTTTCTCGAAAGAACTTTATCTTTATAGATCCAATCATAAGTT
TATGTTTTATGAAATGAAGTGGAATCGTGTAACCTTAGTTTGATCAGTTG
CAGTTTTTCTCTTTTGTTGCTCTGCAGTATTGGCGAGGATCAAGTTATAT
TTCCTGCAGTTGATGGTGAAGTATGCTTTGAGCAGGAGCATGCTGAACAA
GAACAGCAGTTTAATAAATTTAGATGTTTAATTGAACAAATCCAATCAAC
TGGAGCAAGATCAACTGCAGTGGATTTTTACTCTGAATTATGTTCACAAG
CTGATCAGATAATGGATGAAATGGAGAAGCATTTCAATACCGAGGAAACA
AAGGTTAGTGTTTTTAAGAAACATTATTTTAGTAGTTGAAAAGCCGAACC
ATTCCCGCTCAGAAGAATATTGTCTGGTTGACCAAGTGACCAACATGGTC
TCATGTCCAATTCACCTTATTATGAAGGTACTTCCTCAAGCTAGGATAAA
GTTTTCACCGGAGAAACAAAGTGAACTTTTGTACAAGAGTCTTTGTGTCA
TGCCATTGAAGTTATTGGAGCAGGTTTTACCATGGTTTGCATCAAAGCTG
GATGATGCAAATGGACAGTCTTTTCTTCAGAATATGTTCTTGATAGGTAC
CTCTTTACTTCAGGTTTTATATGTTATATGCGTCTATACCATACTAGCGA
TCTAAAACGCCTCCAAATTTGAATATGTACTAATAAACTGCATGGAACAG
CACCTTCCTCTGAAACTGCACTGGTTACTCTTCTGTCTGGCTGGGCGTGC
AAAGGCCGTTTGAAGGATACATCCAACTCTGGGAAATTCATATGCATGCC
ATCAGGAGCACTGAACTGCTCATTGGATGGAGATGAGTTAGAAAAGTGTC
AGTCAATCTGTCCATGTTCTTTGGGCAACAACACAGCTTTTTCAGTACCT
CAAACAGAAAATAGTTCAAGGCGAGTCAAGCGAGGAAATCATGCAGAATC
TAGTACCAATATTAACATAAGTCACTGCCCAGAAACTACTGACATTGAAG
AGACTCGATGTAGCAATAAACCTTGCCACATTCCTGGGTTAAGAGTGGAA
ACTAGCAACTTTGCTGCCGATTCATTTGCTTCTTTGAACTCTTTTCGCTC
GCTCTCTTATAGTTATTCTGCACCTTCATTGCACTCTAGTCTTTTTTCAT
GGGAGACAGACAAAGCATTTTCAAGCCCAGATAGCATCTCTAGGCCAATT
GATGCGATATTCAAATTTCATAAGGCAATTCGGAAGGATTTAGAGTTCTT
AGATGTTGAATCCGGAAAGCTCATTGACAGAGATAAATCTTGCCTTCGCC
AATTCATCGGAAGATTTCGTCTACTATGGGGTCTTTATAGAGCACATAGC
AATGCTGAAGATGAAATCGTCTTCCCTGCTCTTGAATCGAAAGACGCACT
ACATAATGTCAGCCACTCGTACACCCTTGATCACAAACAGGAAGAAGAAT
TATTTCAAGATATATCCACCATACTATCTGAGCTTTCACAGTTATTTGAT
GATTCGGGTCATCCCATTGACAAATCTGAAGAAAGTCATATTTGTTCATA
CAATGAGCTTGATTCATCTAGGAAGCATAATGAGCTCTTGACAAAGCTTC
AAGGAATGTGCAAGTCTATCCGGGTTACCCTGTCTAATCATGTGCACAGA
GAAGAACTTGAGTTGTGGCCACTGTTTGATAAACATTTCTCTGTAGATGA
TCAGGATAAGATTGTAGGTCGTATAATTGGATCTACAGGAGCTGAGGTTC
TGCAGTCAATGATACCCTGGGTTACATCAGCACTTAGTCTGGAGGAACAG
AACAAGATGATGGATACATGGAAGCAAGCAACTAAGAATACAATGTTTGA
TGAATGGCTAAACGAGTGGTGGAAGAGTTCACCAACTTCATCTGGCCCCT
CATATGAGACCTCCCCATCAGAAGGTGTGCTAAATTTTTTAAGACTCCCC
TCTACAAATTCTTCCACCATATTTTTGGTCAGCATTTTATATATGTATTT
GCTTTCTTCCACTTGGTAATAAATTTCGAAGTCAGATATTTTTATCCATA
GTAAAACCTTCAATTGAGACCCACGCTATGCTCTTTTTGATAAAGCAGAT
ACAAGAGTTACCACTCACTACATTGGATTGTAAAGAGGATATAATTTCCA
GTGAGCATCATATGAATTTAATACACTAGTTAGAAGTTGTGTTACTTAAA
CGAGACATGTCTCCTGCTTTGCCATACATAATAGTGAAACTGTCGAGTAC
GAAGTTGCAACCAACATGTTGGTTTGCATGGACAAAGGGAAATATTAGAG
AACATTTCAGTTAGAGCAAAGAAGATGGGAAAAAAGTATATTAGTGCATT
TCTTCGCAACAGCTAAAAGTGCAATATGGACTACTAGGTTTCTCTGGGTT
TCCATCATCTAATCTAGACATTATACACAATTGTTGGTGATTTAGATTTG
TGATAAAAGGGGGCCAATCAAGGAGAATGAAGTTGGCATATCATACTGGA
CAGAATACTTGCTAGAGAAATTACTAGTCAGAGAAAACTAAAATAGTGGG
AATGGCATTTACGTTATGATGAATGGGAAAAACACTACACCTCCATGATA
TATAGAATGTTACAGTTTTGAATATCAGATTTCTATTTCAATGAGTTTTT
CTTTTCTCTCACCCTGTAGAGAGTCAATTTGAGGAAAATCTTAACCAGAG
TGATCAGAAGTTTAAGCCTGGTTGGAAAGACATCTTCCGAATGAATCAAA
GTGAGCTCGAGGCTGAGATACGAAAGGTTTCTCAAGATTCTACTCTTGAC
CCACGGAGGAAAGCATATCTAATCCAAAATCTCATGACGAGGTTTGTCAT
TTAAAGTTACAACAAATAAGTTGCCGGGGCTTTCCCTGAAAATTAATTGG
AATTGTATATTTGATCTATACCTAATAATGTGAAATTCAGCCGTTGGATA
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TATTAGGTTGTGAGCATTACAAAAGAAACTGCAAACTCATGGCTGCATGC
TGCAATAAGCTGTTCACATGCAGGTTCTGTCATGATAAAGTTAGTGATCA
TACAATGGAAAGGTAAACTTAGTACAGTCAATGTTTTATGTGCTGAGTGA
CACTTCTATATTTCTTAAAGTAGTAGAGTATTCAATGTTCCATCTTAACT
TCTTAACATAAATTAGAAACATCAAATAAGTATGCCGTGATATAAATGTT
ACTAAGTAAAAAGTGAGATTTAGACAAGCTTGTGGTTGATTAGCTCTTGT
GTAGACTGTAGAGCAGCAAGGCAACATGATTATTCTAGGCGCTTACTCGT
CATGCCCCTTGTATTATCTTTTCTTTGGTTCTCCTTCATCTGCTGTCTTG
CTACAAGTTACATTCACATGGAAGTAATTGGTTAAAAGCTTGAATGAACA
AAACACTGGCCCTGTGAGCTTCTCCTTAACTTCCCAATTTGTAGCTTTTA
ACTGCTATGCCATAGCTATGCAGTAGTTTAAAAACGTACATAAGGATGGA
AGGACAGAAACCGTATTCTGTTGCATACCTTTTGTGTAGTCATATGTGTT
GGTTGTTAGAGATCTCTTCTGAAATTAAGCTGAAAAGATATTACTCACTT
TGTGAGGCTGCAATTTTTAGGAAAGCAACGGTGGAGATGATGTGCATGCT
ATGTATGAAAGTCCAACCAGTTGGTCCAAATTGCCAAACTCCTTCCTGCA
ATGGTCTATCCATGGCAAAATATTACTGCAGTATATGCAAGTTTTTTGAT
GATGAAAGGTAAAGTGTGAACGTGTTTGCTATTAGTTTCTCTTGTAGTAA
GTCTTCTATTACCTCTATCCTCTACTTTCTCTTATTTGCAATCACTCCTT
AAAGCCAAAATGTATGAACTTTAATTGCCAAGCCTCAAATACCTAGGTCA
GCTGCATTGAAGAAAAATTTCCAGATTTAAGTAGCTTTCAGTAATGCTTG
ATCTTCATAACTTAGGTGAATATGTGCTATGATAAATGCAGCAAGTGGGT
TTTCTTTTTGCATAAGCATCAGGTGGTTTATGTCATTTTTTCCCAAACAG
TACAGCTTTTATTTCTTGAGACAATAGTTCAGTCCTCTAGATCACACCCT
TCTTTAAACTTCAGTTATGCGTGAAAGTACAGGCCGGTCAGTAATAGCTT
CCGTTTGGTGCTGTCCATCTCCATAATATAGTGCAGAGGTCTAATCATGT
GAACTTTACAGGAGTGTGTATCATTGCCCCTTTTGTAATTTGTGTCGCCT
TGGAGAAGGATTGGGCACCGATTTCTTCCATTGCATGAAGTGCAATTGTT
GCCTCGGTGTGAAACTGAAAGAACACAAATGCCGAGAAAAGATGCTGGAG
ATGAACTGTCCAATCTGTTGCGACTTCCTATTCACATCAAGCGCGGCAGT
CAGAGGCCTTCCCTGTGGCCATTTCATGCATTCAGCTTGCTTTCAGGTAA
TGATAGTCTAGTTGTATTCTCAGACTTGTTTCTGATGTACTTCTCTGGCC
TGGAGTCTGTTCTGACAATACTGTTGATTCTAGGCGTATACGTGTACTCA
CTACACATGTCCAATCTGCTGCAAATCCTTGGGAGATATGACGGTGAGTT
ACACCACTTGATACCAAGACCGTTTATGCACTTCACCCAAACCCTGTGTT
CTATCTCACCGAAACTAGAAATTTCGGAAGCAGTCAGACAATTTCCTCTG
CAGAAATGCCACCTTTTCTTTTATAAAAAGAAGTTTGGAAACCCCAATAA
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TGGCTTGCTGGCTGCAGAGGAGCTCCCCGAGGAGTACCGGAATCGGTGCC
AGGTACGCTATTCTCACAGTCGTTCCTGACTCTTCATCTCTTCCCGTTTA
TCGCTGAAGGATTTATATACTGAGTTGCCGTCTGAATCGTCCAGGATATA
CTTTGTAACGACTGTGGGAGAAAAGGGAGTTCTAGGTTCCACTGGCTGTA
TCACAAGTGCGGCGCCTGCGGTTCGTATAACACCAGGGTTATCAAGACTG
ACGCCCCAGATTGTTCCACATCGAATCAACAGGCGAGTTAGTTTTTTCTT
TTCTTATGCTCGGCCGACTCGGAAATTTGTTGGTGTAATCCATATGGACA
CCGAGAAACGTTTTGGTTGCTGTATAGCTGTGGTAATAAAGTCGTTTCGG
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AACACGCACATGTTCACTGAGGTAAGTAAGGATGAACGCCCCCAAAAAGG
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GGCCAGAAGTGTCATCGTCAGGTAGAACTAGTAAGCGTGTACTCTCAAAA
TACAATGGCACAAATATTTAAATCACATTTTTTATTGAGTTGTTTTTTAC
ACAGTCATCATTAGATGAGGCACTTTAAATTATATAAGTCCTATGGACGA
AAGGTGTAAGTGTGCTCATGAAACCTACGAATCCTCTCGGTCCGAGGGAT
TCATATTGCTTCATCATATTCGAAGTATCTGCTTCTCACTCCCTCGTTCC
CAGTTCAAGTAAAATAATAGCTTTTGCTTTAAAATGTGTAACCTGAATCT
AGCAAATAGTAAACAGAGTTGTTTTTCCCAACAATAATATGACACATAAT
AAATATCATGATACAGAACAAAGTAGAATTATTGGACAAAATATCTCCCG
GTCCATATTCCATAAAGCTTAACATCCACAAACCAGAAGATGACTTACCT
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CATAATCAATTAAAACCAAATATCAAAAAAATATTATGAAATTTAAAATT
AGGCAAATAGGATGCTAAAAATATTGGTATGTAATGCTAGCTGGAGTAAA
GCAAATCTAACATTTATTGCTGAGTTGAACCCATTTGGTTGAAAAAAATA
CACACAGCACGAACTGAACACATCTCAAGCTGCGTCTCTCTTTCCTTATC
CTCAACTCCTAAAAGAACACTCCTCAAGCCGCATCGACTATCCTGTTGAC
TCCCCTCCACTGCCTCCCTGGCTCCCTGCCGCCATTGCGGAGGGCTGCCC
CTCCCCTGTCTCCCCTTCGCCGGCGAGTGGACCTCCTCCTCCCTGCCTTC
CCGTTGCTGCATAGAGTTCTGCCCCTTCCCTGCCTCCTCGCCGCTGCCGC
GACGACCAGCCCCCTTCCCCTGCCTCTGGACATCCTTGTGGAGAGCAGGC
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TGCCGACGAAGGTCATCCACATATTCGTACCCGTGCTGCTGCTTGAAGAG
GTACATTAATCTCGTCATGTCGCTAGCTAGGTTGGTTTGTTGCCATAGCA
GAAGGGTGCGTACCTGGACATGCCGGTAGAGATGTTAAGGGAACTGCTTT
GTCCGATGTTGGTTGAAGTATTAATTTTTGACTTGATTCGTAGCAGTACC
AGACAGATGCAGTCAAACATTGATCTGTTTAAACAGTACGATGGTATACT
GATTGGCATATGGATTTTGGTACTACAAGTTTAACAAGCTGCATCTATAG
TGACTTTACATGACAAAGGATGAGTTGGTCCTCTTCACGTCCCTTGGATA
TATGGAGTATTAGAAAATTAAGCATTTTGGCATTAACACATTCTAGCACA
TTAGTGGAATGTAAATATTTGGGATAGAGCTGTACCCGTTGGATTTGGCA
AGCCTGTCATAACACGATGTAGATTGAGAGAATTTTTTTGGCAAGCTTTG
TGCACTGGGACCGGGCTAGGAGTAATGGAGTAGGTTGGTCTTCTTTCAGA
ACAGCTTCTCAATCTGATTACCCGCAGGTTGGTCTTCTTTGTAGTTAGAT
TCATACATCAAATATGGCATCACCAATTCACCAATTTGTCTTAGTTATTT
CCTTCACATCCAAACACTCGGTCAAGATGGTAATCTGAGCCCTGTACTGA
AAGGTGACTTCTAAATTCACGTGTGAATGCTAAAGAAGGTACTAATTCTG
TTTACCAATATAAAATTACATTTGGCAAGGTTATACACACACTCTCTGCA
TCGATTTATGCCCCCACTCAATTGGTAAATGACATACCAGTTGATTGATG
GTTCCTCTATCCTGTGAATATGCATTCCATTAAATTTGAAAGAATCCGGT
TATTGTGACATGTAAGGATGAACACCACCGTCAAATGCAAGGTTACCATT
AGTACCGACAAGCTTTCAAATGTTATTAAAATGCATTTGGTATGTCTCTT
TTGTTGAAGAGGATAACTTATAGTACTCCCTCCGACCAATATTAGTTGAC
TCAAATTTGTCTAAATTTGAATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGGT
TCATTCAAATTTTAACAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGACTA
CATTTAGGCGTGCTAGATTAGTTTAATAGAGGCAGATGTTTACAGCGTGT
TTAGTAGAGTTTTGATCGTAGTTTAGTCAGGCAGTACACCTATTACACAT
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TATTGAAGTCAAGCTCTAAACAAAAGTTATATAAGTCAGGTGTTATTTAA
GGCTGCAAGCTATTTGAGTTTATAAGTCGGGTCTTGTTCAATTAGCAAGT
CATAGATTTTGTCAAGATATGGACTGCAACTGCCAGCATTGACATATGAT
TCTGCTCATTCTACCATTATATAGATTTATCTCCCCTAATTTACTTCAGT
CATTGCACAATTTCTATATGACCAGTTAAAGTAATATATATCTCTAAAAT
TCCCTTGAGATCATACATTATCTAGATAATATTGCATCCGTATTTGTTTG
GTAGCAGCAATAGACATGATTGTCAGGCTTAAATTTTTACTGAAAGTTTG
AATGTCACCGTGTTTACAGGATGGCAAAGGCGAACCCGGTGCAGGGAGGT
GACGGTGCGACAACAGTGAAGAGGCTCCTACTCCGGGCGTCGAAGTCACG
GTCCAGGAAGTCGGCGACAGCGGCGTGGAGGTCGCTGTAAAGGAATGCGG
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GAAGTCGCCGTCCAGGGATAGCGGCGTCGAGGTTGCGAGATAACGGGGTC
CAGTTCTCTGTAAAGGAATGCGGCGAAGGCGGCGTTGAGGTTGTGCGATG
GCAGCCTCGAGTTCGCCGCAAAGGAGTGCGGCGTCAAGGTCAGCGTCGAG
GTCGCTGTCAAGGAAGGTGCCAAGCGGCAGCGACCGCACCGTCCAGGGAG
GTGATGGTGCTGCCGGGCGGCGATGGTGTTGTCGGGTGGCGTAGGCGCGG
TGGCGACGATCGAGGCCGGTGTTCACGAAAGATCGTGTTGATCAGTTTCC
GTTTTTGCGATGGATGAGTTCCTTGATTTTTGGCCTTTTTTTCGCTGCTA
GGGAGTTTTCCGTGCGGGGAGAGTGCGGGGGGCAGAGTTTTAGTCCGTCA
ATGGTATTTGCTAAGTGTACCAAAGAAAAAATCTAGACAATTCAAGTAGT
TGGATTGCCTCTGGTGGCCTGATCGTACGGTTGTAGGGACGTGTGTCTGT
TTGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.