Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA009627

[Submit comment/correction]

Sequence
AA009627
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009627
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAGCTGAGCGCTCCACATCACACGTTTGGTGAGCGAGCGATGCGCGCGA
GCGGCGGCGCGAGCCCACGACCCGCACCACCGAAGCGCTCCCCCACTCCG
ACCACCACCAGCACCACCACCAAACTACTAGTACCCGCCGCCTCCTCCTC
CCTTGCCATGCCGGCCCCTCGTCTCGCCCATCTCCGCCGCCTCCTCTCCC
TCCACTCCCCGCCTCCCCACCCACTCGCCCCCAGTCCCGTCCGCTCGTTC
CCCCTCCTCCTCCCCCGCGCCATGGCCGGCGCTGCACATGCAGGTAAGCT
CGCCGACCGAACCGAAACCGGGACCTTCTCTCTGCCGCGTCTGGGGCTGG
TGAATGATGCGGTGGTGCGGCGCAGGTGTGGCGACGGCGTCGGCGGAGTA
CGAGGAGGTGCTTCGGTGCCTCTCGTCGCTGATCAAGCAGAAGGTGCGTG
CGGACACCGGCAACCGCGGCAACCAGTGGGAGCTCATGACCAAGTACCTG
CAGGTGGTGTTTCTGTCAGTCACGAACTCACGATGCTTGTTCGATCGGTC
TGTGGTTTCTAAATTCTAATAGGGGTTTGGTTGTTCTGCCAGATACTAGA
GCTGGAGGAACCAATCGCACGGCTGAAGGTGGTTCACGTCGCGGGGACCA
AAGGGAAGGTGAGTGTGCATGTGGGCGCTGTCTCAGGGATGGCAGTGCTG
CATTACACCTATTTGAACTGATTTGGATGGATTTACGTCGTGTGGTTTCA
GTAACATATTCATCAGTTACCGAGCACAACAATAATCGTAACAGGATGGA
TAGCTGTTCTCTGCATTTTAACTTTATTTCCATGTGAAACATCGGATTGC
CTTTTGTTTGACGAGAAATGGGGAGTGATACGAGCTGACTTAAAGCAGTT
TACTTTAGAAACTTCCATACTCTGACGTAGCCTTTGCCTTATGTCTTGAT
TATTATTAAAGTTCAGTGCTTGTAATATTTGGAATTGTATTGTGTTTTAT
AGTTGTTTGTGATGATAGTATCTGACCTAGAAACCAACGTAGAGAGACTA
TAGCACTTTCTGATTGTTCTTGTGCACATTTGCTGAGTCAATCCTTTGTG
ATATTCTTGTAAAGAAGTATTTTGCAGCAGGGCTGGTGTTGACAGCTCTG
GCCTTTTTCTATCCGTTAGGGTTCGACATGCACATTTGCCGAGTCAATCC
TTCGATCATGTGGTTTCCGCACAGGACTGTTCACCTCTCCGCACTTGATT
GATGTCCGTGAGCGGTTTCGGCTTGATGGGTACTTTTCTATTTGCTGCGC
TCCTACATTTATTTATTTATTTTTGAATGTTGCTATTTATTTTTTTCTCA
TAATGTTATCTTACCTTATTTTAGACTTGAGGAGATTTCTATTGTTGAGT
TGCTTGAAGTTACTTAATTCTTCCTATCACTATGCATCATTGTGCTTACC
TATTATATTTTCTTTCTGGCGAGGTAATAGGCTGGACATTTCAGAAGAAA
AGTTTATTAGGTATTTCTGGTGGTGTTGGAACAAATTGAAGGTAAATATC
ACCTGTTCTGTTTTCATATGGTGGCGTTGCTGCTGCATCACTTTGAAGTG
AGACATGAAATAAATATTAGTGGAATGTGCATCATTTATTTCTATGTTGT
ACTGTATGTACTTTATGACTTCTCTTAAAACACCCATTAATGTTGTGAAT
TTTGTTTACCTTCCAGGTCAAGACTGGCGATGATATTCCAATGCCAGCCT
ACTTTAGGTTCCTTGCACTGTTAGCATTCAAGATTTTTTCAGATGAGCAG
GTTAATACTCTGCAAATACTTACTATTGACAACCTTTAACTCTTGTAATG
AATCTACATTAATACATGTTTGAGTTTTTCCTTTTTTTTTTGGATTTTGA
AGACTCTCCCCCATCTAAAAAGTACTCCCTTCGTCCATAAATAACTGACT
TGAGTTTGACTAGATTCGAATGTTTCTAGACGCATTTTAGTGTATAGATA
CATTCGAATCTAGGCAACCCAAGTCAGTTATTTCTGGATGGAGGGAGTAG
ATACTATGGACATACACTCATTCTATATCAGATTAATCTGTACCTTTATG
AAAGAAAGGCACCTAGCTTCATTCAATCTAAAAGTCTGTCACTGTCCTAC
CTCCATAGTAATTTTTTTCGTCTTCACTCGAATTGCAGCCTATGGCACTG
ACAGATATGTTATATGAATAGTAATTTGGACTGTGAAAGGGTCAGTTATT
GGGTAAGCTTATTTAGAAGCATCATCATTGTTTGGGTAGATGAGCATGTG
GTACCGCAATCTCAGAACTGCATATTTGATGCTTTTATAGAATGTACTCA
TTTTGTGTGTTTAAGCAGGTGGATGTAGCTGTGCTCGAAGTTGGTTTGGG
TGGGAAATATGATGCAACGAATGTGGTGTGTGATATTTCTATTACCATTT
TATATTCAAATAATGCACATTGGTATGGAAGTGTTTGTATGATATAGTTG
GCAACCAAAAAGGAAGCTTATACACCAGCACAAGTTGTCCTTTGGACATA
AATATGTCATCTTGACCCTTTTTTGCACACAATGTCATTTTTTTTAACAA
CACAGTAATGCCATCTGGACGTTCTGATTTGAATGCTTAGTATTTGCATT
TATACTTTAGTGGTATAAAGGCTGGGCAGAGATCACAGGTGCAAACTTTT
CTTTTTAACGTTAAAGAAGGTTGAGGTCTGTGCAAACTATAGTAGAGTGA
CAGTACGGTAGTTTGTTCATCTAGCTACCTACTTAATCCGTAAGCTATCT
AGAATCTGTTGGGGGCATCAGGTGATGCCTCTTTCAACTTTAGCCCACTG
AGTTCATCACTAGCATCTTGACTTCAGAAGAGTGAAGCATAACATGTGAA
AATTGAAACTTTTGCAGGTAAAAGCACCTGTAGTTTGTGGGATATCTTCC
CTTGGATATGATCACATGGAAATTCTTGGTTAGTCATGAAACTGAAAGAA
GAAATACCTTGCACCCATAGTAAACTTGTTTCATGCATGCTGCCAATGCT
TGTTGTGGTCCATGAGCAGGAAATACACTTGGAGAAATTGCTAGGGAGAA
GGCTGGAATATTGAAGGTTTACTTTGACCTATTTTTTTCTTCAAAATATT
TGTTAGAAGAGCTTACTTTGTTTGCTTTGCTCCCATCTTATTCAGCTGAC
AACAGATGTAACTAAATTTGACTGTTGTTTTGTTCCCGCCTGGATTTTTT
CATCAACACAGAAAGGAGTTCCAGCCTATACAGTTCCACAACCAGAGGAG
GCAATGTCTGTACTGGAGCAGAGAGCTTCTGAATTGGGTGTATGTTATAC
TCCGTGCTACACTATCTTTGGTCGCCACTCTGCCTATATCACTCTAGTGT
CATTAAACTTGACTATATATTGATCCAATTTTTAATTTATGAAACTTAAA
TTTATTGAAGGTTTCTATCCGAGTAGTCCCACCTTTGGACCCACGACAAT
TAGAAGATCAACCTCTTGGACTGCATGGTGAGCATCAATACATGAATGCA
GGCCTTGCAGTTGCATTGGCTAATACCTGGCTTGAGAGGCAAGGACATTT
GGACAGAATACATGTCCAAGATCATGTAAGTACTCCAAACTGGCTTCTAT
TGTTATCTAGTTTCCACAAAAGGAAAGTTTGGACCAGTTATAATTTTACC
ATGGAGTGCAGGGTACCTTGCCAGATCAGTTCATCAAAGGGCTATCAATT
GCTTGTCTGCAAGGCAGAGCACAGATTGTCCCAGATCCACAAGTGAACTC
AGAATATAAGGATAGTTGTCCCCTAGTTTTCTATTTGGATGGGGCACATA
GCCCAGAAAGTATGGAAATATGCGCAAAGTGGTTTGCCCATGTTACAGAA
AACGATATAACACAACCAGGTCCTTTGGAGCAGCCTCATAGTAGCAGCAA
TTCTAAGAAGGTATGTTGTGCTTTGCAGTGGCAGCCTTTCGGATTAAACT
AAATTGTCTATCTCTTATGCACATTCTCTTGACGCTTCCAGATTCTCCTG
TTCAATTGCATGTCTGTAAGAGATCCTCAAAGATTGCTTCCACGTCTTCT
AGATACATGCGCTCAAAAAGGTATGTCAACCGAATTCTCTGTTGATGTGT
TGATGGTGATCTTGAACAATTCAATGATTTTTTTTTGTAGTTACTTGTCA
TGTTTGGAGAAACAAATTTCTACTAGAACAACTGTTTGCTTTGATTTTCG
CTTCTACTAGAACAATTGTTTTAGCTACGGCTTTTGTAAACAGCCTTGTA
TTTGTTCTCTCCTAATTAATTAAATGGGCAGAGTGCCTGCATTTTATTTA
GTTTCATGCACCAATTAGTAGAACCCAAAGTACGAACTGATGGAGAGAAG
GTGGGCAACTCACATATACTGTAACATCCCCTCTCACGCATGACTCGATG
AGGGTTTTGTGAATAGCCTTGTATTTGTTCTCTCCTAATTAAATAAATGG
GCAGAGTGCCTGCATTTTATTAAGTTTCATGCACCAACCAGTAGAACCAA
AAGTCTGAACTGATGGGGAGAAGGTGGGCAATCCATATATACTTTAACAC
CCCCTTTCACGTGTGACTCGACGAGGCCGACACACGATAGAAAGATGGCA
AGATCAATTTTTGATCTAAATTGTGAAAGCCGATACTTAAACCCAAGACC
TCTGCTCCGATACCATATTAAGTTTCATGCACTTACCAGTAGAACCAAAA
GTCCGAACTGATGGAGAGAAGGTGGGCAATCCACATATACTTTAACACAT
TTCATGTCAAAGATAAAATTGTTCATTTTCGTGTATGTATTTCGCTAATG
GCTTGAATGATTGAATGAACCAGCAGAATGTTAAGGACTTCATGAAGTCA
CTGGCATAATTTCTTTATTTAATTCAGAAAATGAACAATACATTTGACTA
TCTGTATTGTGTGCTGAATGGACCTTTTCATTGCTCTTCTGTAATGTGAT
CAGTTATTCTGCCCAGGGCTCCACTTTGATCAGGCCTTATTTGTGCCAAA
CCAATCACAATATAACAAGCTTGGTTCCCATGCATCACAACCTTCAGGGA
GAGAACAAATTGATTTGTCATGGCAATTGTCGCTCCAAACGGTTTGGGAA
AACCTACTTCATGGCAAGAAAGGTATTCTAGAATTCATCACAGTTAGTTC
TGAGTTATACTGTCAACATGACCATTGAATTGAAGATGACTGATGCACTC
GAATGAAACGATGCAGGTCTAAATGGCCCAAGCTCTAGCGGGGCTAGTTT
AGTTTTTGAATCCCTTCCATCGGCAATTAAGTGGCTAAGGGAAACTTCTC
GACAAAACGAATCTACTTCATGCCAGGTAGAAACTTTGGATATATTTTCA
GCAATATTCTTTGAAATGCTTCATAACAGTACTACAGCATCACGTACCTT
TTACTGTCCATCATTTGCGCATGTACGTAATTGTCAGTCTTTTTGGCATA
TACTCCCTCCTTCCAAATTTATAAGCCCCTACATATTTCTAGAACCTCAG
TTTGACCAATGAAATGTATACCGCTGGATTCTTATTCTAAAGAAGTTTCT
AGGTATTTTTGTGTGTGTGGCATATAACACATATTTTGTTGGTCAAGTTG
AGGTTGAGGACCTACAAATACTTGAGGGCCTTATAAACTTGGAAGGGCGA
GTATACTTTTTCCACCTTTTTGATGCACGTTCATTTGTTTCCTTATTTCC
TCTGGTTCTGCTATTCCATGATCTATCCTTCCATTTCATTGCATTTGTGC
TTTGGTTTGTTTGTTCTGTTCTGCTAATCCATGACGAAGAATATTTGTTA
TGTTTATTATATTTCTTGTCTTGCAAGTTGCACCTGCTTTCCTACTCGAT
GCTTATACATTTGTTTGTACACTGAATCAGGTCTTGGTTACTGGCTCTCT
ACATCTTGTTGGTGATGTCTTAAGATTGATCAAGACCTGATTCTCCCTGC
AGCTCGTTGGTGGTGTCTTACGATTGCTCAAGAAGTAAATTTGGAATACA
TACTCCCCCGTTTCAAAATATAAGATTTTTAGCTTTGTGAAGCAAATGTA
TCTAGACTTCTTTTGGTATGTAGGTTCACTCAGGTTTGGAGTGAATCTAC
ACACTAAAAGAAGTGTAGATACATTTTCTTCACAAACCTAAAACATCTTA
TATTTTAAAACGGAGGGAGTAGTTCAGAATGAAGTTTCTAGTTACTAGAG
AGTACCATACACCGGAGCCTATCATTATTTCTGATTGGCATCCACAATGC
AACCACCTGGCTGAAGAATGGGATACTTGAAGGACCTTCTTATTCTGATA
TGGACTTGCGCAAACATGTTGTACTGCTTCTTTTTGTGTGTTCTGCCGTT
GTGGGCAATTGTACACCATTGTAGCCTATTTGTGTTTGGATGTTGACATG
TTGTACAAACAGCAAATGATATAATATGAACCATGCCATTTTTCAAACTT
GGAATAACCAAAAAAATTCCAAGCTTTCGATTCTCAAAATTGTTGTGGAA
AATCTGAATACCCTTCATATTGGCATCCGCTGGTTGGTAGATAGAGAAAT
AGACTGATGTTGTCAGGTAGTTTTCCTGCACATCCATCAATCATAATGTT
ACTTTGCACTGAAACAGGACTGACAGGTCACTCTTTTGCAGAACAAATTC
TCGGCACTGAAGCTAATATTAAAGGTAATCCGGATTGCTGGACTTGTTCT
GAGGAAAGAGGGATTTCAGGTCAGGTGAGGGATCAAAAGTATAGGTGCAT
AATGTGAATTCTGCGTGGTCGAGTTTTAACATTGTTTCTCCTGTTTCCCA
GTTCATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.