Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA009324

[Submit comment/correction]

Sequence	AA009324
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA009324
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCCGGCGGCGCGAGGGTCCCGATCTGGGGTTTCGCGGGCGGCGTTGGC TCTGGCCGCGGCGGTGCTCGTAGGATGCCTTGCTGGAGGCGTCTCGGCTG CCGAGATCCGATGGCAGAAGAACGTGCAGGTGGCGCTCCGGGCCAAGTGG GCCGGCACTCCGCTGCTGCTCGAAGCCAAGTGAGTGGTTTCTGGCTCGAT ATGCTGGTATATGTGATAGTTTGTTAGAGTTTGGACACCGATTTAGTGGC TTTGAGTAAGTTTGTTATGCGATTCTGGAAACTGGTTAGGGAGCCATTCC GTTGATGCGTACTAGATACGTTTAGCTAATTGTGCTAAGCAGGGTTGTTC AGAAATGATTTCCGAAGAAACTGTGGATACCGGCTAGTTCATTCTGCTTC AGTAATCACAGCCATTCCAGCGAGTCAGTAATCACAACCATTCAGCGAGC TTAGTATAAAATAATGAACTACTGGTTTGCCGGGTTGAACTGCACCCGTG AATGAACACCCCTATTGCTAAGATTCCAGGATGTTCCTTGGAGCTGTTAC CAGTCTGTTGTAGAAAAGTTATATGTACCATGGAACACAATAGGATTCGT AAGACATCAATATGTGTTTGTGTTCAGCAGCACACATTCGCTATGATCAA ATCCATTGAGTTGTACAGACCGAATCCTAATAAATAACGGAATCAATTTA GAGGGAGGTTCCAGATTACGAGGTTTTCTGTATCACAGGGTATAAACTAT GCCGTGACAGACAAACACGCCATGTCTTATCCGTTCACTGAGATTGAAAT GTTTGCATTCGTTGTGATTTGTTGAGAGTATTAACTTTTTGACACAAACC TACCTTTGCTTTCTGTTCTAGCCAAATCTCTAGACGATCTTAAAATTTTA TTACGTGTAGCCGAATGCTGTGCTGCTACAGTTCTCATTTATGCATTGAA AATGACTCGAACATATTGGACAAAATTGTACAAAGTTCATATTTTGGTCT GATGGGGAAACTTAAATTATGCAATGCAACATGTTGTTACTGTCCAATTT GTGTTTTTTTTCTTGGCAATACCTAACACTTATGTCTACTGCTTCCATTA GTGAACTACTTTCAAAAGAACAAAAGGACTTTTTTTGGGATTTTGTTGGC CACTGGAAGGAATTGGACAAAGGATCTGATTGTCTGACTGCCAAATGTTG CGTTCAGAAGATTGTTGAGGATGTCCGCTCACTTCTCAGCGAGCCACTGG CTTCAGTTTTTGAGTTTTCTCTTACCCTTAGATCAGCGTCACCGAGATTA GTGCTGTATAGACAGCTCGCAGAGGAGTCTTTATCTTCAATTCCTGTTAA GGATGATGCAATTGAGCAAATTCCTGGCAACGGGCCTGTGGAAGAAACTT GCTGCTGGGTAGATACAGGGAGCGCATTATTGTTCAACTCAGCTGATCTA CGTAAATGGCTAGAGGGATCAAGCAAAGAGTAAGCATCTTCATTTTTTAT CCATTTGTCACTTCGCTTAGGGCTCCAGGCTATAGGGTCGGTAACTCAAC TTCTGCTGAACAGAGCCACGGACTCCACTGGACAACCTGAACTCTTTGAC TTTGACCATGTATATCCCCGCTCAAATGTTACTGCTCCAGTTGCTATATT TTATGGGGCTGTTGGGACAAAATGCTTCAAAGAGCTGCATGTTCATTTGG CAGAAGCGTCAAAACAGGTAACATACTTCTGATCGTCTTCCGGTTTAGTT CAGGGCAACCGAGGTCCTTAGAAAACAATGTACTCTGGACAGTAGAGATA TAAGGTCTTATACAAGGGGTCATGGGAATTTTATATCAAATACCCTTTTT TTGTTAGAGGGATACTGTTAATAATCACTGATATTCCAGCTATCATGTCA GGCAAAAGGGGCCTGTTTAGATTGGAGCCCAAGTGTACCATGCCAGACTT CAATATTGGTAACCACGTTTTGCTAGGATTTGCTATAAAGTCACCACCAT TTTGTTGGCATGGCAATATTGAAGCTGAATATTCTAGTTGCATGTAGCTT CAGTTGAATCAAGGAATTTTGCCAAATACATCAAATTAGCAAATATATGT ATTTCTAAATTTTGGCATGGCAGCTTTGGTGTACAACCCAAACAGCTTTA CTTCTTGCTTTTGTCTCTCCAATTTTTAGTGTATTACATATCTCTTGGCT TTAAGCTGTAAATGTCTAACACACAGTATGTGTTGTATATAGGGAAAAGT CAGATATGCTCTGCGTCCTGTTCTGCCATCTGGATGTCAGGCTACATCTA GCTTTTGTGGTTCCATTGGTGCTGCAGATGTAGTTACTTTGAGTGGTTAT GGGGTGGAACTTGCCCTAAAAAACATGGAATACAAAGCCATGGATGACAC TGCTATAAAGAAGGGTAACTCTACTAGTTGTTCTATTTGCACCAGAGCAT GTACTCATCACCAGTCAGCTCTTAATAAGAAATATTTTATTATGTACTTT TCAAGTAAATCAGTTATATCCCAATGAAAATGAGCAAGTGGAAAACCTTG CAACACGCATCTTTCTGTATGGCACATGGGTGCAAGTGTGACTACACCTT GCTGTAAGATGCATTTTTCCATATATTCTTGCACCTAGAAAGATCATGTC AAAAAAATGCGTACCACCTAAAGAAAAGTTATATACTACCTAGGTGGTCT TACATACTTCATACCATGGGTACATACTCCACTCTGCACTACATGCCCTA CATACCCTCTATATTGTTAGAATGGCATGGGGGAGTAGCTACACCTGGTT GTTGAAAAATGTTTTCTGTACATGTATATATATTTCAAAATCCTATTGAT GCTTATTATGTTCTTGCAGGTGTTGCTCTGGAAGATCCTAAAACTGAGGA CCTCAGTCAAGATGTCAGAGGATTCATATTTTCCAAGATTCTGGTTCGTT CAGTTCAGTCATAACAATAACCATGCTGATTATTTATTGCAAAGCTAGAA AAGTATTCATATGTTTTCTTCCTCGTCTATCGTTCTCTAGGAACGCAAGC CAGAGCTAAATGCCGAGATAATGGCCTTCAGGGATTCTCTATTGTCATCA ACAGTGTCTGACACACTTGAAGTCTGGGAACTCAAAGGTATTGTTGGCCA TAGTTGTGTGTTTCTAGCCGTCTTACAAGTTACAGTGATGGTGTAGAAGC ACCTCTTTTATATCTGCTCTTCTCCACGCTACAGATTTGGGTCATCAGAC AGCACAGAGGATCCTTCATGCATCAGATCCTTTACAGTCAATGCAGGAAA TCAATCAAAATTTCCCCAGTATAGTATCTTCACTATCAAGAATGAAGGTA GATGTCCTATCTGGAGCTCCCTTTATATCTTCAGCTATGCACATAAGTAA TGAAAATAAAATATGTTAATGCGAGTTTATAAAGATTTTGTTTTTGAGGA TGTTCATACGAACTACTTCCATGTTCCACATGCAGATTATTAACACCAAT GTTTTGATTGTACAGCTTGACGATTCCATCAAAGATGAGATCATAGAAAA TCAGCGGATGGTACCACCTGGCAAGTCATTAATGGCTTTGAATGGTGCTT TGATTAATATTGAGGATCTTGATCTCTACCTGTATGTTTCACTATACTTC CCGGATAACGATGTTTCTGGTTATTTACTTTATTAATGCAAACTGATTCA CTTCTTGTGTTAGCCCAATGTAGACTTTAATCAGTGTATCCTGTAACGAA TAGTGACTAACTCTTCTCTGCTACTTGCCATTAGAAACTGTGCACCAGAA GATGCATGCTCACAAGTCACAAGTGACAGTATCAAATTTATAATGAAAGA AAATTCCAGAAATAATAGTTCGTATACATCTTTTCTCATTAAGCTCGGCA TTGTCCTGTGTCTGGCAAGCCCCTCATCCACTGCAACCACACACTAACCT ACAACTGAACCAAAAAGTAAGAACAACCGGCAACCATTCAACTGGAAATA ATTTTAGCCGAGAAAGTCACACACAAATACCGATTTTAATTCTATAAAGT CTTGGGAACATATGAAGATGATTATGAACAGGTGTTTTGCTAGTTGGAAT TGCTGTTCACTTATGAGGACAAATGGATTTGTTAGATTCTGCAGTGGGGT TGACATAAACACATAACAGTTGTTATAGTTGGAACAGATCAACTTGGCAT CTATTTCATATTTCATTTCTTCACCTGTCTTCTTCTTTGCCCTCAGTTTC TTCTGTTTCTTAACTCGTCACTCCTTTTTCCTTTTTTTTGGGTGCTGTTT TTTGGGCTCTATCTGGCATTACTTCACTAACTTTAAAAGTTTTTGCTAAG ATACTCAGCGGTTTTGCAGTCTGACACTTAAACATATCATATACGGCTAG CAAAATAGACATTTAATCATGGCTTATCCGGCAGGTTAATGGACATGGTC CGTGAAGAGTTATCTCTGGCTGATCAGTTCATCCGATTAAAGGTGAATTT TTTTTGAGTGCTATTAATGTGTGTAATTTGGCCAGTCCTTTCTATATCGA GAGAACTACTTTGGTGCTTGCTATTTAGTTATTTTGAAGTTTCAGTAATA GGGAACACATCAACACCTATATATTATTAGAGAAATTGGTTGAGTCTTGC TGTTGAAAAATGAAAACTAGTTTTGGGAAACCTGATTATATTTTTATTGT GATTTGTTGGTTATATTACAGAATGAGATTTGTTGAGCAGAGATGCAGAA TGAGATTTGTTGGTTACTTATATTACAGCCAACTCCATTTGCTCATTCTA AAACCTGTATACCACAAGTACTATTTAGTGTCGCTTGTTTATATAGTATA TTATTGTTTTCTTATCATAGCTTATGGCATTTGACTTTGACTTGATGTGC CCTTCATATCCTTAAGAATTTCTCTAATTTTGGTGATACGTCAAGCGTGG TAATTATCTTGGAGCTTGAGCATTTAATAGTAGTATTGAGCATTTTTGTT CCTATGTATGGATTATTTCTTGGCTATATTCGAATAACATATTCATTTTG GCGTTCGTACATCTATGGCCAATATTGTGAAAATGCTAATACATTCAACT TTTAGAACATTTGGTATTTATGCTGGGAATTACCATGTTATAAATCAATA TAATCACATCACAAAAAATATAATAACACTATCTAGTTAATACTCTCTAT TCTTAGCATGTGCTTTTACCTGATATTCCTGTTTTTCTCCTGTTCCATTC GAGTATGTACTTTCTGACCAATTGACAAATCATTTCACACTTGTTGTCAA ATGACTACCAGTTGCCTCAAAGTGCTGTCCACAAGATCCTGTCAGCAGCG CCACCGGCAGAATCTAATTCATTCCGTGTTGACTTCCGGGGTTCCCATGT TCACTATCTTAATAACTTGGAGGAAGATGCCTTGTATAAAAGGTGGAGAA GCAACCTCAATGAGGTTTGTTCACTTATCTTTTTACCAACATTAGTGAGC GGAGGTTCGTCATTTCAATGTTGCTTTCCTGTGGCAAGTCAACTGAGAAC TGAACTTTTATTTTCATGGCTTTAGGGGCATAAGGGAATTGAGTGTATGT TCTTTAATTGCTGTCAATAAAATATTTTAACTGACAATACGCGCAATAGT ATTGCCGTGTTCTGATGCATGATTTCACGTATCATCTTTTTTTAGTTTGC TCTATCATCTGTGGATAAGTTTATTGACTATCCCTTCTGGGCATCCAAGG ATGAGCAGTTTATGCTATTCACCATCTATTTGGCTGTTTCTTCACCACAG CTAGTTAAGTTGTATCGCACAACTATTTTCAATGTTTAATGGTTGTCTCT ACCTTTTCTTTCTTTGTTTATAGCTGTTGATGCCAGTATACCCTGGTCAG ATGCGCTACATCCGTAAAAATTTATTCCATGCTGTTTATGTGTTCGATCC TGCTTCAACCTGTGGCGCAGAGGCTAGTTTCCTGCTTAACTTTTTTCAAT ATGTGTTTGTTTTTCTCCACTTCTTATGCAGTACTCATATGTTGACATTT AGTGTGGTGTTTCCCATTTCACTTAATCTTTACAGACCATTGACATGATC CTGTCTCTGCACCAAGATAATGTTCCTGTAAGGTTTGGTATCATAATGTA CTCTTCAAGACTCATAAATGTTATTGAAGAAAATGATGGATCTACAAGCG CGGAGGACACTTCTACTTTGGTAAATACGTTTTTAACATTTCATTGATGT GATTTCTTGGGAGCTCTTTGATCTGATCTATAGAAGTACAGAAAAGCAAA CTAGTTTTACACCATTACTATGTAATTCTGGGACCTTTTTATCTCTCTTT TCTAGCTCTTGTTATTACTAGTGCTTCTTAGGTACATGAAATGACAAAAA CACATAGTTACACTTGGTTCCATTTTATCACATGATGTCCAGCCTTTTCA TAGTATGGAATTTTTGTATCATAAAATATTAAAGTAACATTAATATGGTC CTCCAGCTGCACATAGACTCCTTCCTTACACTGCCAGGGTGATACTGTTG TAAACATTGATATTTGGGATAACTACCATACAGAGCTTGGCTAGTCGCCA GCTTAAATGGGATCAGGTCATGGGAATTGACAAGATAGACTGAACTGGGA TGATAGACTTTAGATAAGGACCTGGGTATGCCATAGCTGCTGGATTCGGC CAAACTGTTGCAAGCCACGGCCAAGGGCATGCAACAGTTGGCTCTGATAC CAACAGACCAGGTAACTGCTAGTCTACCACCATGAGGATGGCCCGGACGG CACATCATAGAGGATTGGGAGTAGAACATTGGTTAGGGAGAATGAACGAG GACAATAGATTGATTAACTATTATCTTATTGCTTGATTAAGTTTATTACA CGCTAGTCCTTTATAGGATGATCTACAAGTTAGATCTACTCTACCTTCCT AGTTCAGTTGGATTCTTTCAAACTTAACTAGACCTGATCTTATAGACCCA ACCTGTGTCCAACATGATACTTCTTGATCTTTTTCTTAACCTTCCTATCT CTTAACATAACCTATCCAACACCTACGGATCTGCCTACCTCCTGCCACCT TATGTACCCATGAGCCATGATCATAAAAACACACATAAGGTATTAAGTAG CAGGCCCATATGTAGCTTTTTTGTAAATTAGTAGGCCCATGTGTCATTTT AAACTAGAGGAGAAGGGTACTGGGCCATTGGCTGAATGTAAACCTAGAAA TCTACGTAATATGCCCTTCATCATCCTATAATATGGTATAGCACATGTTC TGCTCCGAATGTTCTTTCTTGCACCAGATTAAGACTACTTTGTTGCATTG CTTGTTTCTGTTATAATGTGATTTAATTTCTAAAACTTGCACTCTTAATG GTGTGGATGTGCATCAAGGAGACAATAAGGCTAAACTTGCACCAGATTAA TATGCTAACGTTTTTCCATATTTACAGATAATAAGGCTTTTCTTGTACAT CAAGGAGACATACTCGACACAGTTGGCATTCCAATTCCTAAGCGATGTGA GTGTAATTGCCAAATTTGATTCTTCAGGAAATTTTACTGTGGATCATTGA ATTATGTTCTAGCATAGCTTCTTAAAAATTAGAATGCAAGAGCATTACGG TAGAGTTATGTTGGATATTTAAGTTGTTCATCATTGGGCTGCCAAGGTAC AAACCTGTACTGTCTGTAGATGTTCTGAGTTTTATATAGCTGTAGTCAAG TGATATTTTCTTGTTCAGATACATAGTTCGAGGAATGGAGGCGATGACTA CAGTGAAGAGCCTGTGGAAGCTCATCATGTGGAAGAAGCATTTGTGGATT CCTTATTGTAAGCATGTTCATTAAAATTTATATATTGTTAGATCTAAATG CCCAAATAGAATCAGTATAGTTTCCTAATGCTTGTATTTGTAATGCGCAG GTCAAGTGCTAAATCTCACCCTCAGGATGTGCTGCTGAAGTTGCAAAAGG AGAACTTGTACAAGCAAGAGGCAGAACAAAATTCTCGTTTTGTTCACAAA CTTGGATTGTATAAGCTCCAGTGTTGTTTATTGATGAATGGACTTGTTCA TGAATCAAATGAGGTAATAATTGGCTATCCAACTTAAAAGTTGATAAAAT GGGAGAAGCATCAAGGCTCCGTAATACTTAAATATGAAGAACATTAAATT TATCTTTTTCTACATTATTATATTATAATGTTTCTTCTACCAGTAGTAAA TTCAATATTACTAAGAATATCACATAAAAAACTGCTAAAACAATAGCTAG TAGCTAATATGGTGCCATTTTTGCTACTCTTATATTTCGAAGGACGCGAC CATGAATGCTATGAACGATGAGCTTCCTAGGATACAAGAGCAAGTCTACT ATGGGCATATCCAGTCCCATACAGATGTTTTGGAGAAATTTTTGTCAGAA AGTAGCTACAAGCGATACAATCCATCAGTAAGTACGAAAATTTGAAAATT TGTGGCAGCATTTGCTCTTGATTCATTTAATAATGTTATATTTTACCCTC AGATTACTGGAAAGAGCACAGAGAAGAGATTTGTCTCATTATTTGCATCA TATCATCAGGAAGACTCTATACTTCATGACATTAACTACTTACATTCTCA TGGAAGTATATTTTCTACTATTCTTTTCCTATACCTTTCATCCATCATCA AAGATAAGTGGTGTTAACATATAGTTGTTTAATCTCTCTGCAGCTACAGA TGATGTGAAACCTGTAACTCATCTATTTGCTGTTGATCTTTCTTCGAAGA TTGGGATAAAGTTGCTTCATGAGGCCATACGTTACCTGGTAGATGCAGCA ATTGCTTTACATGTCTATCATAATATGCTCTTTACATTGTTTTCTCCTGA TAATGTCTTGCTCTTCAACATGATACAGATGGACGGGTCTAATAGAGCTC GTGTTGGTCTACTACTATATGCCCGCAGTGATAGTGTTTCTACTATTTTA CTTATGAAGGATCTCATCGATAGAACCATTTTGTCTTTTAGGTTTGCTCC TCTCCTTTTCTTTCCTGTCACCATTGAATACTCTAATCTTGTGACTTGTT GTCTTGTTCTAGCAACACGGGAAAGTTACTGAACTTCCTACACGGGCTCT GCAAAATTTATGAAGGTCAACATATGGCGACCTCGTCTGTGGTTGGTGAT AGCATTGACACTATAATGGACAAGGTGTATAGCTTGGCTGCTGAAACTGC CTTGCCTGTTGACGATTATAAAGCGTGGCTTACAAGTTTTTCTGCTGATA CAGTTCCCAAAGGGATCGATAAGGTCTGCATCTCAGGCCTGAGATGTCTT GCCCTCCGTCTGAAATTCTCTCTCTAAATTGTTACTATGTGTACTTGTGT AGTTTTAACCTTTAGGGGACTCTGAAACTTGGCATACATTAAGGGCTGGA ACTGAGCTAGGTTCACGGAAACCCTATCAAGACTCAACTTTGCTCTTCTT GGTTGGATAGCTCAGTTTATAGGGTTCAACTTATTTGATAGCTCAGTCTA GTGTTTGGCTGAAACGGGCATAACAGCTGCAGAAATTAAAGAAGCTCTAG CCATCAGGGCTCAGTCTAGCTTGGCCAATATAATAATATTGTGCTTGGTT TAGCTTAAGAACCCCCTACAAACTGCAATATTTATGTACTTGTAGGTTGT AGGTATCTATTTAAGTTTAGCTTGAGCTGAAGTTGGGCCCAGTATTAGGT CAGTTTCTGTAGCTGAGCCCAAGTTTGAGAAGAAACCTGACCAAATTCTG GTATTTATCTCGCCCAATCCTATTTACATAGCATGCTCCCAGGACTCGTA ACACAAAGATCATAGTAGGTGATCACTACCGCCCCACCTGTTTGTCTGTT GCCCACTGGTCTCACCCTTGTTCAAGACTAGGTTAGCCTTTAAGCCGAAA CCGCTGTTTAATTCCTTCTTTTTTTTTGTCTAAATGGTATGGGGTGACGT ACTGTAAATAAACCATTGTTTAACTTGCTGACCACAGGCCATTTTGGGCA AAAACTGACTCGCGATTCTTTCTTATGTTTAACTTTCAAATCAATACTTT TCTCTCAGTCTCCAATCAAATTTGCTCAGAAACATATCACACATATTTCT TTGGCTGTGCAGTTGTCAGACTTCTTGTTTGGGCAATTGGGGCTCGAATT TGGTAGCAATGCTGTGATCACCAATGGACGGGTAAGATTTTGTTCCCTTC ATTTCTCTCTTCATGTCCAAACTGGTTCCGTTGTTCTTTGTTATTTTGGT GTCTTGCAAATACCCTCTCAGTCTCTCAACGTAAGTCTGTTGGGGCATCG TCACACTCTCCAATGTGACACTTCGACCATCAATTTCTTTGATTGTTGCT TCAAATGAAACAGTTCTAAGAAAGGAGAAAACAATTTTGATGGGAAATGG TAGGTTAGAGCCTGACTGAGCATATTAAATAAGGAAAAAAGAAAACGAAT TAATAAACAATTGTTTTATGATTGATATTGTACTATTAATTTGATGTTGG CAGTGCTGGGTAATATGAATAGCTAAAGCTAAACAATGTTTGACAGAGAT TCTAAAAAGACTTATACTGTGACATGGAGGGAGTACCTATTACGTTCCCG GACTACTGTACTCATGATAACAATTATTTGTGGCTGCAAAGTTACTCTAC CTGATTCCTAAGCAGCTCTGTAGGTCATGACCGTTACTCCTACGTTGCAG ATTTTTGTTGTGGGTGAAGGCGACTCGTTTTTAACTGATGATTTAGGTCT CCTTGAGTCTATGGAGTATGAGCTACGAACAAAATACATACATGAAACAA TTGAAGATGTTGAATGGGCAGGTGTTGACCCTGATTACCTGACAGGGTAA GATATATCATTTAGCAGTTTCAGTGGCTTTTCTATAGGGGTTTAATTAGC TACACTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.