Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031911

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031911
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031911
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAGCTAAACCTCGGTCGCTTGAAAATTCCAAGCCGCCGGCGCCGGCGGCC TCCCCACTAGAAACCTCCGCCCCGTCGTCCCAAACCCCGCCTCTCGCGGT CTCACCGAACAATTCCTCCTTGATGTCCTCGTCTCAGTCTCTCGTCCTCC TCCTCCCTTCCCCTCTCTCCCCGCCTCCGCTTCCTCGCATCGTCGCCCCT ATCGCACTCTCCTGGCGCCCTACCACCGGTCGCCACCTCCCGCGCCTCGC CGCTAAGCTCTGCCTTCCGCCACTCGCGACCTCCTCGTCCGGCGGATTCG CCGATGGCAGTTGCGGCGGTGGGGGTGGGGTTGGCGGAGGAGGAGGGGGG TGGGGATGGCAAGGGGGAAGAGGAGACCCTCCTGACGACCCCGGTGACGG GTGGCGACGATGGCTCCAGTCCCTCCACCCCGAGTTTTTCCTCTTGTTCC TGCTCCTCCAGTCCGACGCCTTCGCTTCCATCCCATCCGCCCTCGCCGAT GCCCTCGGACCGACCGGCGGCGACCGCGGGAGCGTCTGGGAGGTGAGGGG CAGCGGGCGTACGCTGCTCGTGCCCAACCCGAACGGGACCTCATACCTCG TCGCGGGAGACGATAAGCGGAAGCATGAAGATGGGATGGAAAAAGGGAGT GCTGGCCATGGTGAACTGAACGCTCTGCGGAGGCAACTTGAACGGTCATG GCGGCGGTGCACCGATTTTGCTCTTCAGTTGCTGCTGCCTGATGGATACC CGCATAGCGTGAGCAGTGATTACATGCAATACTCGCTGTGGCGCGGAGTG CAAGGTGTTGCCAGCCAGATCAGCGGCGTGCTCTCCACGCAGGTACCGTA ATGCTTATGTTAATTATGTTCAGTTCTTAGTCTGTCAGGTACAATTTAGC ATTTCAATCGAGTGATGTATTCTGCAGGCGTTACTGTATGCAGTTGGTTT GGGGAAAGGAGCGATACCGACTGCTGCCGCGGTGAATTGGGTGCTGAAAG ATGGGCTTGGCTACTTGAGCAAGATACTCTTGTCGAAATTTGGGCGGCAT TTCGATGTTAACCCAAAGGGATGGCGTCTGTTTGCAGATCTTCTGGAGAA CACAGCTTATGGGCTGGAGATTTTGACTCCAGTCTTTCCTCACCTGTTTG TTCCCATTGGTGCAGCTGCTGGAGCTGGCCGATCAGCTGCTGCTCTGATA CAGGTCAGGACTGTTTACTTCTGTTTGTGGTATGACTTATTGGATTATAA TAAGCATTACAATGTTCCTAAGTCCCATCCTGTGCAGATCACTGGCGAAA CCCCCTTATTTCTTCGTACCATTCAAATCTGGAACCAGTTTACAGAACTA AATTTATTGATTGGACAAATTTTACAATCTAGAACATTAACTTTTATGAC ATATTAAGGTCACACAAATATCTGTATAGGTCTTGTATGTGCACATAAAT AAACAACTTATTTCACAGTCCTTAAACAAGCATTTCCTCTGACAATATAT AAATAATATTACATATTTCCCAGTAAGTAAAAATAGTACTCCCTCCGATC CAAAATAAGTGTTGGAGACTTAGTACAAACTTTGTACTAAATCAGTACCA AAAATCACTGACACTTACTATGGATCGGAGGGAGTACTTATAATTTCTAC AACGGCATGATGCTGTCTTGAGTTTGAATTGAGATCCAACTTGTGGAACA AGTCAGTATTCCTATATATAATGGACTAGCATGTAACCCTTTGATCAATC AATCAATAACAGAAGTTCCAATATGCCTCGCAGCCTCTCTTTCATGCCAG GAACAAGCCCTGTCGACAGATAATAGAGGGTGATCACCCTATCGCTTGTT ATTGGACCTTTATCCTACCCAATTTATTCCATTGTGGACGAAGCTCCATA ACAAATTCTATGTAAGGATTATTTTGTTCCAGGCACGATGTGATAACAGA TATCCTTTGTAATGATCAAGGCTGTTTAAATAGTTAGTATATCGTATGCC ACGTCCACTGCACAGATTCAGCCTGCATCCATTAGCTGTCATTTAGTCTG GCATTTTATATGCGAGCCTTTCTTTCTCGGCCGATGAAGAAATCTACTTT ATTTGGTTACCTACTGCCTTTCTTTCTCGGCCGATGAAGAAATCTACTTT ATTTGGTTACCTACTCGATTCATCGAACAATCTATGTCTTATGTGATCAT CAGCCATTGAGAGGAAAAAATATGCTATGTCTGATCTGTACATACTTAGT TACTTATTAATGTTTCTAACAACTATTTACCATCTATAATAGTATCTAAC TGCCGGTCAAATGATTATATGGTGGTGTATGTACTTGGACCGTTTATCTG TCCAGTCGAATTGAGTTTTTTACATAAACATTACCCATTGTTATGTGCTA TTACTACTATCGTTCCTATTCATATCTTTCTCAAACTTGGCGTTCCAAAT TTTGTTCCATTTATAATAGTTCCTAATTGCCCATAAAATTATTGTATGGT GGTGTGTATGCTTGGAGCATTTATCTACCCGGTCAAATTGAGTGAAATAT ATAAGCATTACCGATGTAATCTACTGCTCCCCACAAAAAAGAGTGTTCTA TACTACCGTTCCAATTCATATATGTTCTCAAATTTCATATAACATACTAT GTAGACACTGTGTGCATTATTTCTCAATAAGATGATGCATTAATTTAGTT CTAGAAGTTCTCCTTTGCTGAACTTCTACCATTTCCATGTGCAGGCTGCC ACAAGAAGTTGTTTCTATGCTGGTTTTGCTGTCCAGAGAAACTTTGCTGA GGTGAAGTCCATCTATCCTTATTTCTGAACAGATTTTGCTGAACATTTGT TTCACATGTCTATGGAATAGTTTCTTTTACTCATGTATCAGTCTTTCGTA CATGAGATTATTGTATGTAAGCTGATGCCTTGCAGTATCATGGGCATTGG CACTCGTATAGTTGCAGTAGCACGGGATACGTCTTATCTCTTGGTGTGTT ATGCTCTAGATTATGTTGATTTTGGAAAGTATTTATCGGAATTTGAGCTA GATTAATGATCTCATCTCAAGCTGGTTTTTTAATTTGTCTAGATCAGATG TGAGATAAAGATATTGAGTCATACAGTGGACAAGTTAAGTCATACCTGTG GAAGCCTACACACTGTAACTTATAAGATGAACAAAGAATGAACAATTAGT TTTTCTCTCCCCAAAAATATTATCCCTCATCTAAGCCCCATTTCGCGTAA TCTAGTGTCTAAGACTCCTTCAAGCCATGCAAGTCCCGGCATGTGATATT TAGTATTTACCATGTCTACTTACACCGGTGATGATTACATTAATATTTTT TGTTCCCTTTATTTATGCATCTAAAGCTATAGTAGAAGATGCTATTCTGA ATCCTGCAAGACATGTTTCTACGAACCTATCTCAGATCTTGCTTACCTTT TATATCGTCATTTATGTTAGGGAACATATTGTATGCACACACATATTTCT GATTGTTTGGATGTTAGAGTTATCAGCCCCACTTTGCAGTGCCATCAATA GCTGTATAGTACTATTGTTCTTCTATAGGCTGCACTCCTGCCATTTTTAG TCTTGAAAGGAACTGTACGTTGACCTTTACCTGTTAAGTAAGATATAAGT TAGTCAATACTACATCTTTGTCTCATTTTGTATTTGCGCTTGAGTGACTG AAATGAATTGAGTTATGTCTCAGGTCATTGCAAAGGGTGAAGCTCAGGGA ATGGTTAGCAAGTTTCTTGGCATAATGCTTGGCATAGCATTAGCGAACCA AATTGGCTCATCAGTACCATTGGCTCTTATTTCATTTGCGGGTGTTACTG TAGTTCACATGTACTGCAATCTTAAGTCTTATCAATCAATTCAGCTGAGG ACGTTGAATCCTTACCGTGCAAGTAATTTTATTTTCTCCTTTGCTGCAAA ACTACATTATGTCATGTTTATGTTTTCATAGTCCTGAATCCTCTCATGTC AACATCCATTCTGTGACTAATAGTTAAAATGCTTAGCTAGATAAATCAGT ATCTTTGCGATGCATAAAAACGTCAGACTTCATTGAACTAGGCAAAAGTC CACTTGTATTCACTTCTTTTGGGGCTAAATATTGAATTCTATTTTACAAT CATAGCTTGTATGCAAATTTGTCAATTTTAATGCATGGTATTGAAGTGAT TATCATGGAAGACAAACCACAAATATGGATGGCACTGGCAGCATATAAAA AACTGGCCAGTATGACCCAGTGTATATTTTTAGTAGAACTATGTTTGCTG TAACACATCTTGGTTTTCATCAATGCACCTAACTACATTTTGTAAAGAAG TTATTTACTCCCTCCATGCCAAATATAGTGCATAGTAGTTCTGTTCTAAG TCGAACTGTAAAGTTTAATCCTTCCATCTTGTATATATTTCTTCTCTATA AATAAAATTTACTGTCGGGGCTTCCCCTACAGTTTTCAGCTCAAAAAAAT ATTAGCATTAGAAAATCAAACATGGATTGTTGTTGGTGTTTTCGATAGAT AACATCCTTTTCTTTTACTCCCATATTTTGGGTTTACACTTTATGCCACG TTATGTTGTTTTCTACTTTTCTCTTCTTTTTTCATCTCTGACAAACGTGC CAGCATACATGTATATTTGTACATATTAGCTCAGTGCATGTTTGTGTTAT GTTTTTGCCTACCCCAACTTGATTGGGACAAAAGGCTTGGTTTTTGTTGT TGTTATGTTTGTGCTATGTTTTTCTTTGGCATTAAACAGTGCTTAAGGAT GTCTTTAAGTGTTTGATTAATAATTCTTTTCCATAGGTTTGGTATTTAGT GAATATTTATTAAGTGGACAAATTCCTTCCGTCAAAGAGGTTAATGACGA GGAACCACTTTTTCCAAATTCGTCTATGGGTTCTCAAATTAAAGTAAGTC CAGAATACCTTTTGCTGTCCTCTCTGCTTCAGTGTATCGCTAACCATTTC TGCCTTCTGTCCAATATAGTGCCTAGTTCTTAATGTATTACCTTTCAAGA TATTATTTTAATCAACCAATACCAAAGTAACAGATCTATTCACAAAGAAT ATTTTATTTCATTTTAAAAAATAGTGAGGACTACAGTCTACGATCTACAT GCGCTTGGCGATGTCTAAATATATAATCATGCCTTTTCTGTTAGAATTAG TATAAATGGACAATTCTTTTGATTGAGCACAGTAAAGTAATATTATTGCC CATGCCCACGATCGATTCAAAGAATGTTTTGCTGCTTGATTTTATATTAT TAAATCTCATTATGTTTTGTTGTTTTTGATTTGTTCAGCAGCAAAGCGAG ATTTTATCAGCAGAAGCAAAAGATGCTGCAGATACAATCTGTCGACGGTT ACAGTTGGGTTCTAAGCTTAGCGAAATAATTGAGAACAAAGAAGATGCAC ATGCACTGTTTGATTTATACAAAGATGAGCAATACCTTGTTACGGATTAC AAGGGGAAATTTTGCGTGAGTTCATCTTGGATCAGCTATTTCCTAAATTT TGTTCTGCTATAACTAATTAACATGTTACTTGTCCTTTATAGATTGTTCT TAAAGAAGGATCTTCCCCAGAAGACATGCTCAAATCTATATTCCATGTTA ACTATCTGTACTGGTTGGAGAAATATATGGGTTTCAAACCATTCAATGTT GCGTCAGAGTGTCGACCAGGTGGAAGGCTTGAAGCATCACTGGATTATGC TCAGAGGGAGTTTATACATGTCAAACTTGATGGTTCAAACAGTGGCTGGG TTATGGATGGTCTGATTGCTAGACCCTCTCCTGTCAGAGTACGCCTTGGA GGTGCTCCTTGATTACGACTCCTCAATTTTTCCACATCTACGATTAGTAG AGTTGTACAGATAGGGATGCAGGCGGACGTCCGCTACTACGTCCCGGCCT GTCCGCTATTGCTTGAAATTCGTAGCTGGATCAATCAGTAGGTAACCAAA TCGGCAAATCCTCTTCTAATCCTGCATGTACTGATTAAGCGGACTGTCCG CAATGTCCGCCGGAACGTCCGCCTGCATCCATATGTACAGAACGCCCATT CTTTGATCAGTTTAGGCACACAGCTAGGCTATGTGAATGCCGTTTAACTT TTTTGTCATACGGAGCAAGTTTACGAACCAGCAGTCTTAAATCTTTGAGT GACTGGAATAAGCTGCGAAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.