Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA027638

[Submit comment/correction]

Sequence
AA027638
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027638
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAAAATATATAGACAGACAGAAAAATAATAGTAATGGGATGCTATGCTC
CTCCTCCGGTGAAGGGAACCGCTCGCGCATGAGCTCGCGGAAAAAACAAT
TCCCCATTTCTCTCTCGCTCTCTCGCGGCTCAGTGGTAGTGGTAGTGGTG
CGCGGCGCGGGGGGTCTGCAGCTAGGGTTTCCCCCTCCCGCGAATCCGGC
TCGGGGTGCCGCGATCTGGTCTGGAGGCTCGGCCGGCGCCGCCTGATCCG
GGGCGGGGATGAAGTCGTCGCTGCGGAAGCTGCGCGGGTTCGCGCTGCAG
CGGCACGAGCAGCGGGTGGACCGCCACCGGGACCACTCCACGGCAGCCAA
GGCGGCCGACGAGCTCCTCGCCGCCGCGCAGGTGCGTGCGGACCCTGCCG
CCTCTTCCCCTCTCCCTTCCTTCCTCTGGCTGCCGCGTGGAGCCCGCTGC
GAGTGCGGAGGAGAGATCTTGCGAGGGAGGAGCAGCGGCGGCTACGGGGT
CTATTTTCTCAGCGCGCACGCGTGAGCTTCCCGAGCGGCGTAGGGTCCGT
CAGCGCGAACTGCTCGCGATGGGTTTGTCGGAGCTGGCGTGGGCACGCGT
GCCCGGTCTGACTTGGCTCGCGCCATGCCGAATTCTCTCCGAATTTCCCC
TCCCCTTCCCGACGGAAGTAAGATGTGATGTCACCGTTCGTCCGGATCTG
CGCACCTATATCAATCAGTAGGAACGAGGAGCCTGATGCTGTTCCCTAGT
GTGAAATGCGCGAGCTGGCTGGTCTCCGGGGATTCTAGATCACCGCTTGC
TCGCATTCGCTTCGTCGCGAGCCGAGTTCCATGCCGTAATGTCTCTTGGG
AGTTTCCTTTGATCTGCTGCCGGTGTGGTAATTCTGGCTGGTTTCAGATG
AGTTTGGGTGGTTTGTCCCGAGGAGTGGGTTTTGCGGCAAACTGTTGCTT
GCTTTGTTCATTTAGATGAGAATTGAGTGATCATGCTGCTTACGAGCAGT
GTCACTCTTTGGTGACAAGAGAACTTTAAATCTGGGAAAATCTGGTAGCC
AACCTGCTCCATGATTATGTTAGATGTCTCGTAGTAAATTGGGGTGACAT
TTTGGCATTTTACTCCATTTGGCTGTTAATTCTGATTGGATACGACAAGA
CTTCCACATTCCCAATTTCTGTTTGTTGAGAATAAATGTTTATTGTTCAA
ACCCAAACTGCTGAGTGGGGGATATTCTGATTAATGAAAACAATGATGTA
TGAGAAACAAATGCGGTCATATTTACCAGAAGTGCAACCTAGTGTAAAGT
CAAAACTAGCTGCTTCTGATAAAACTCTCAACTTATCATTCTGTTAATAT
AAAAGCTTACGTATCTGCATTTTGACAATTTTGTTTCAAACTGCTGCTTC
GCTTTGACAGGATATGGCAGATATGAGGAACTGTTACGATAACCTGCTTT
CCGTTGCGGCAGCAATAGCAAACAGTTCATATGGTATTTTTTCTTGTCTG
AAAATAATTTGCTTTGAGAGATCAGTTGTAATGCCTCCATTTCACTTTAT
TTATGCAGTGCTTGCTGCAAATGTTTTGTTTATCATTTCCTTTTGAGTTA
CTACGGTTAGCTGTCCTTCGTCAAACGGATGGAAAAAATCTTCACTTGAA
CTTCATCTATTTTTGGTTTAATAGGATCACATCTTTCATGGTTATTTGTT
CACTACTATCTTTCTAGGTTGTTCTGACATCACGTGACCTCACTTCATTT
GCATTAGTCACATTTATCATATAGATGACTGCATGATTAGTTTTATAGAG
TTCTATCAGCCACAATTCTTGGTATCTTGACTCTGTATTGGATGCCAGTA
ATTAGATGGTGTATGCGTGCAGAGTTCTCTGAAGCACTGCAAGAAATGGG
AACTTGTTTAGTGAAGAGAGTCACACCAAATAAAGAAGGAATTAATGGTA
ATCATGTTGTGCTTTCTTTTTTCTCTTTGAGCTTTTTCCTTTCATTCTTA
TAATCAGCTATCATGGTAAAATTTAGGATAGAAAACAATTTATTGTCTGC
AAACTATCTCTTTTGGCTTCATCATTTAAGTTCTTAATGGAAGGTGTGTA
TGTGTAGTAATTAGGGGGTGTTTGAAAACGATTTGGCTTGACATCGTGAA
ACCGTCCTATACAACCTTTTGTACTATCACCGAAGCTGTCATCACATGCA
AAGAATGAAAATAGAACTAGAATCTCTCAGCCTGTTTTAGCGAGGTTGAC
TGCAACCATGATTGAACACTCCCTAGTAGTAATACAGATTATTTGCACTA
GGCAGTAGTAAGAACCTACCTTCTTGGTTCTTACTTTCTCCCATTTGCAA
GAAAGTAGTCACTGCCCCATGAATAAATATAAAGAAAAGGATGAACAGAG
AAGGCTAATGTTTTATTGGTAGTGCTATTAAACATGACATCTAACTTCTG
ATTGTTGCATACTTTGCTTCTTGATGCTTACATTTAACAGTATCCCCTCA
GATAAGGTTTTGCTGTTGCTCGGGAAGTCGCAGTTTGAACTTCGGAAACT
TGTAGATAGTTATGTAAGTTTCTAATTTCTTATTATTGAAGCTACAGATT
TACTGTGATCTTCTACCGCTGATTTGCTTCATCTTCTCCTCAGCGTGTTC
ATGTTCTTAATACCATTACCACTCCATCACAGTCCCTTCTTAATGAGCTT
CAAACTGTAGAGGTATGTTGTTAAGCATTATGTGCATCTCTTTTATGTGC
ATTTCCTTTTCTATATGATCCTTGACCTAAAAAATATTCCTGGGGTCATA
GCAAATTGATTTGTCTTCATCAAGGGGCTCATATGAACTTCCTATTATAT
ATCTCATGGACTTAAATTTCAAATTAAATCCATTCTATGTTAAGAGGAAA
AACTGAGAAATCAGAATGAATAAATAAATCAAAGCCTACTATGAACAGCC
TTAAATTCTTCTTTCTAATAAATTTTGAAAATTAGTGTTAAAATTGGAAG
GGTACTAACACGTTGATAGTATGTGTATCAAAACGAAATTTCAGAAATTC
CAAAATGGGAAATTAATTGCATGAAGTCACCACAAAGGGTGATTGCATAT
CATATGCTGCCTTTAATATGTGGAATGAACTCACCAAGGGTGATTGCATG
AAGTCACCATGGTGTTTCGGAAATTCCATGTCTTATACCCAAAATGGGAA
ACTCCATGTCTTGATACCCAAAATGTGTTATGAAGTCACCACATGATATC
ACTGCATATCACATGGTGCTGCCGATGCGTCATTAAGTTTCTAGTTTGAG
CCCATTTTTTTGTTTTGTCCTAGGCAGGTTGATGTTTTTTTGTGTTCCAA
TGATGCATTTTTTTTGGTAATATTTGTTGTAGCAGGTGTTCGTTTAAAGA
CCTTTTGTATTTCTAGTTTGAACCTGTTACACAACCATGTCTCTATTCAT
TGAGGAAAAACACTTAACTAGCGGAAACAATTTCATTGCAGGAAATGAAG
CGCCAATGTGATGAAAAAAGGTATGATGTTTGTACAAATTTTGGCTTACA
ATCTTACTGTGGTGAAATGGTTTTTAAGTTTCTAATACTCTTTCCAGAGA
ATTGTTCGAATACATGCTAAATGCGCAGAAAGAAAAGGGGAGATCTAAGA
ATTCGAAAGGTGATAATAGTGCATCAGAGCAACAATTAAAACAAGCCCAG
GATGATTATCAAGAGGAAGCAACCCTTTTTCTATTCCGGTTAAAGTCATT
GAAGCAAGGACAGTTCCGAAGTCTTTTCACACAAGCTGCTCGGCACCATG
CTGCGCAGGTTCACATTTTGGTTACATGGAAATATTCCTCCTTTATTTTG
TTTCTTCACACTGCTTCTGAATTTGTTGATATTTTGTGCCGACCAGCTAA
ACTTGTTCAGAAAGGGCGTCAAGTCTCTTGAGGCTGTAGAGCCACACGTT
AGGCTTGCTGCTGAGCAGCAACACATTGATCACCAGTTCAGTGCACTTGA
GGAGGAAGATTACTCTGTTGAGGATGAAAATGATGACGATTACAATGACA
GTCATGATGGAGAGCTGTCTTTTGATTATGGAGAAAATAAGGAGGCTACA
GAAGGCGGTCATGCTTCCAGGAGTCCTACAGAGGTAGTAATATGCTGTAA
TATTCTAGTCTGTCTAGAAGTTCTCATTTAATTTATCTTCTTTGTCCTGC
ACACAGAATATTCTAATTTGTTTACCTTGACTGTTTTTTCTGTCTTCACT
ATCTTCAGAGTCCGTCATCTGATTTTCTTATTTTCGCAGGAATTTTTTGA
TAGAAGTAAAGGAGACTATTCCTCGTTTGCTAGTGAAAGACAAAGACTTG
TAAGTCAGTCAGCTCCACTTTTTCCTGAGAAAAAGCTTGAGACAGCAGAA
AGAGTAAAAGAGTTGCGGCGTTCTGCAACGAGGAAGTTAAATACTTACGT
TTTGCCTACACCAAATGATGTTCAAGCAACCACTCAGATAGCTGCAGGAA
ATCCTACTAGTGGATCTCCTGTTGAGAGCAAAGGTGCATTCCATTCGTCT
CCACTCAACCCAAGTATAAAAGTGGGAGATTTTAGAGACAATAAGCTACC
AAGTCCTGCCAGGTTATCCAATGCACAGTCAGTGCTGAAAGAAAGCAATA
CCAATAATTCAGAAATAAGAAAGATGCTCCCAGCGACTGATCTGGCTCTA
CCAGGCTATCACGAGCTGAAGATTTCTTCCGACAACAAGAAAGCGAAGAG
GGGGTCCTTTTCTGGTCCAATACCTCTCCGTCCAAGGTCAACTGAGAATA
TTGATGTTATGTCCGCAGCGCCAAGGCACAGCTCTGCACATCAGCCAACA
GTTCATGTGAGAGTGTCCCCCAGTTCCTCGCCACCACCGTTATCCTCCCC
CAGAATTAAGGAGCTTCATGAGCTACCTCGACCGCCTAGTAGTGCATCAA
GAAATACAGCATTTCCTAGTCTAGTCGCTCACTCTGCCCCGTTGGTACCA
AATTCTGCCCCTTTGGCACCTAGAGGCCACTCAGGGCAAGATCATTTTAA
TTTTAGGGTCAGACAAACACCACCAAGTGCTCCACAAACTGCATCGCCTC
TACCAACACCACCTGGGCCTATAGCCCGCAGTTTTTCTATACCCTCTAGA
GGCACGAGAACAGGTATTTCAGATGGTAAAGAAACAGATGATCATCACGA
TAAAGGGGCTGCCAGAATGAGCCTCTCTTCTCTTCCTTCAGCACAAACCG
TCTTAGACGACCGTCACCCTTTGTCAGCAGCTGCCGAGTCAGCTAACAAA
ACATAGGGTGAGTATTCATTATGTGTAGTACTATAGCCTGTTTTGGAACT
GGGTACATTAGTAACCTTCTTAGTAGCAATTTATTGTTATTAGAACATGG
GAGAGCACAGGCACACAGCTAATATTGAATTAGCCCTTGAAGAACTACTC
TGAAATGAAGTTGGCTGCCACATTTGAAGGGACTAGGGATGTCAATAATG
CAGTGCGTTTATAGTTCCATATGTACACCATTGCTCATAATTTGAAATTT
GAATGCTGTTTCGAATTGCCCCCAATGTTCTCATTAAATCTCAGCTTTAC
GCGGCAAACACATCATATCAATGCCAGATTGACCCTTCTCCCTGTTACTT
TTCTGTGCAGTGCACTTGGTGTGAATGTGGAATTTTATCATATACGAAGA
TGCTTATCTGAGGGGCTCGGCGACCTATTCGCAGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.