Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA027302

[Submit comment/correction]

Sequence
AA027302
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027302
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGCGACGAGCAGAGCGTTCGTCTCCAGTCCGCAACGGGAGGAGAGGCGTC
GTCACGCCACTCGCCCGCATAACCGGCGAGCGAAACGCGCACGGGAGAGC
GAATCGGACGAGGCGTCGGAGACGACGGGGAGAGAGCTCGCGCCGCGATC
GGTGGAGGATGATGAGGGGAATGGAGACGAGGGCGTTCTCCGCGGCGGCG
CCGCATCAGGCCACGGGGCTGGGGCTGGGAGGCGGCGGCGCGGTGGACGA
GCAGCAGGCGGCGGGGGTGGGGATCCTGCTGCAGATATCCATGCTCGTGC
TCTCCTTCGTGCTCGGCCACCTCCTCCGCCGCCGCAAGTTCTACTACCTG
CCCGAGGCCAGCGCCTCCCTCCTCATCGGTACGTACCCCTACCCTGACAC
GGTGACACCCATCCTTCCGCCCTCGATTCTCAGAGGTTCGTAGGTCGAAA
TGCCGGCTTTAGGTGTCTCCATGATCTTTGTGGGTACAATCTTCTCGCTG
TTCTGATCCCGTGCCATTTATTTGGTGGATGAGGCGGAGCTGATTGGTTC
AGGAATTGGGGTTGTTCAGTGACGCAGCCCGAATCGTTCCAGTGTTCAGT
GGCCAGCGGTGATGGTACGATTGTGAGGAACAACTGCGTTTACGCTCCCT
CAAAAAACTGCGTGTACGCATTTTGTTTGTACCTTCGAATGCGAGAACCG
GGTGAACAAATTAAAATGCATGCGCTGCATTCTGCACGCGCTACTGCCTA
CTTCTAACAGCGTTCGTTTTCAGTGCTGTGAGTGAGTGTGTGGTTTCAGT
CAGTTGTAATTTGTGTCGCTTCCTGATTTATTCAGATCTACCACGAGTGA
TGTGCCATTTGGGTTATTTTAGTTGTGTTTAATTTTGGAATCTTGGTTGG
TGATATCGACCGCTCTTGATAATTTCTACTTGCCTAAGAAACTAGCCTAA
CTTGGATCACTGCCAGCAGTCCTGACTGTCAATGTTACATAATGTGCTCA
CTGTACACTCACTATGATTCACGTTAATTTGGATTACTGCTAACTTTGAC
TTGTTCGTGGAAAGTCTGCATAATTTTCTTAGCTGATAATGTTTGAGAAC
TGTGGCAGTCCAGCTTCTTTGCATTCTTACTGGGTGTAAGGTGATTTGTT
CCTTGTTATAATTTCCCCCTCTTGCTGTTATGAAACATAATGCAATATTT
TGTAAGAATGTGTATATATCGTTATAGTTTACTCGCTAAGATGAAAATTG
CAGGCCCTTCTGAGCTTGTGAGTGAAGTACTAATGATCCATAAATTATTT
CTACAAAACCCCTCTTTTTCCTCCCAAATACAATAAATACTAGTCATAGA
CTCAATTCTTGATGAAATTAACAATGGGCCACATTTGAATAACATGAGCA
ACAGTTCATTGGATGTGTGTAAGGACTTATATCTCGGTTTCAGTAAAAAA
TGCTAAGAGGAATTATGACATGGACCAGAGGGAGTATTATAGTTTCTGAT
ACTAACACAGATGCATCCAAGTACTAAATCTGTTCCATAATGTAGAATGT
TTTAGCAAACTAATTCAGTTTGCCAAAATATTCTACATTATGGAACGGAG
ATAGTAGTTGATAATGCATCTGTGGTTTCTCAGCTGTCCCAAACAGAACA
CGAAGAACAAATTCAGAGAGTCAGGGTTTTGCGCTGCGTGCAAACTTGCA
GCATTTTCTACCTTTCTTCTTGCCTTTTATTCAACAGAAAAACGATCGTG
TCTGGTAACACTATCTCCTCTAACGAGCGTGCCATCCCATGCTCAGGTGT
CCGAGTTTACAGGATCAAGATTGAGTCTAATCTTATCTAAACCGACCCTA
GCAAATAGCTGAAACACTAATTGAAAACTGACACGTTAACTGACGCGCTA
AATGAACTTTATTTGACACCTGACAGCTAGATTAACTAGCAGCATCTTCT
CTACCTTACCCTCTCTTTGAGTGATATTGCCCTACTCTTTAGACTGTATG
CTAGAAATTTTGCTTCGATCATGCATGCATTCATCTATATTCGTAGGTAG
TGTACCAATCTGGAACTAGGTCTTGCCAAGAAAATTTAACCGTTGGTTGG
GGTCAGTCTAGCTAAAAATGTCCACAATGAAGGGATTCACGGTCTACTGT
GTTCAGGCACAACCAAACACATGTTTCTCGGACTTTTGATCTGGCTGAAA
AAATCTAGGGAGTCATTCTGGAGGCCTGGCTGTTAGGAGCATCCAACACC
AGACTATGTCCATGCAGGCACAGCAACGAAAGCTTGACAGACGTAGCCAG
TAATTTGTCATCCCAGAGGGTAGCTAAAGATTCACTTATCTCTTCCATGA
TTTTAGTTTAATTACTTAAACGAGGTCTGTTAACCATATATGAAACGACG
TGGCACTGATACTCTTGCACAAAATATTTATGGAGTAAACCTATGAATGA
CTTTCTGTAGAGTAAATTGTATTTGAAATTGCAATACCGACAAGTGCAAA
GTACACATATTATTAGTACACTAGAGTATCCTGAACCAAAGTGGTGATTT
GTCATACTAGTTACCAGAGGTACATTGAACATTATATAGTTATACCATTT
TTTGTAATTTGTTAATGATTTTTCTATCAGGGATGATTGTTGGAGGGTTT
GCTAACATATCAAACACGCAGAAAAGTACTAGGTATATTCTCACTCTCTT
TATGCTTTGTCCCGATTGAGAAACTTGTGCTGTCAATTATCATAATTTTG
TGCAATCTTTGATGTTTGTCTACTTCATATGTTAATTCAGGAGATGGTTC
AATTTTCGGGAGGACTTCTTCCTTCTCTTTTTACTTCCTCCAATTATATT
ATATCCTTTATTACTGTATGCCAATTTTCTTTCTAAATTATTTTTTGGGA
AGTTTTGAAATGTTTTACTTGACTGCACCTTACTCAGTCGGGATTTAACT
TAGCACCAGTAAGTGTTGAACTATTAAGGCCCGTAGTTCCTTAATGTTCC
ATCAGTTGCAGGTTCACATCTAATCGTGTCAAATTTTGTTTCCGGCAGAA
ACCATTCTTTTCGAACTTTGGTGCTATCATAACTTTCGCAATCCTGGGAA
CCTTCATTGCTTCCATAGTTACAGGGCTTCTAGTGTAAGAAACCATTTTC
TTTCGCCTCTTTGCATATTTCCCTTCGTTAATAAGCATCTAATGCTGCGG
TTTACCTAATTGCAGTTATCTTGCTGGGTTAATCTACGTCATCTATAGGC
TACCTCTGGTTGAATGTATGATGTTTGGTGCTCTTGTGTCAGCAACTGAT
CCTGTAACTGTGTTGTCTATATTTCAGGTTTATGCAATCTCTTCATATAC
TAACATGCACAAGTTTAGTTACTGTTATCTCAAAAGAAATGATTACATAT
TCTTCGTGGAATTACAGGAACTTGGCACCGATGTGAACCTGTATGCTCTT
GTTTTTGGAGAATCTGTTCTAAATGATGCTGTATGTGTAATTATTTTTTC
TGCTTACAATATGTTTTTAAATGTTTTCTACTGATGCTCACGTATTGTTT
GGTATCTACCTATGGTTTGACAATTAAGGTGGCCATATCCTTGTACAGGT
GAGGATGTTATTCCTGAGATTTTCTGTATGTGCTTCCTTTCACGATTTTG
CTTTAACTACCTTATTGATTCAGAACCATGGCATCTATGAGGACGAATTC
TCCCGGTCATAATTTTTTCGTAGTCATCTTGAGGTTTCTTGAGAACTTTG
TTGGTTCAATGTCATCAGGTAATGCAATTCTAGTTCTTCAAAACTGCTGA
TGTGTGGAGCAGATTCCAGTAGACTATAGTATTCGCTTCCTCAATCAGAT
TATTTTCTTGCTTTACAAACTTTAATCTGTTATCCTACATTTCATATTTC
AACTTCCTTTTTGTCGTGCAGGAATCGGAGTTGGGCTTATCTCTGCTCTC
ATATCCTCTACATTGCCTTTTGTTCAATTAATAGGAATCTACTTTTTTAA
GAACGTTGTTGTTGCATTGTTAATGTGATTCATGAAAGTAATGTGGTTTC
AATTAGTAACCCATCTATAACAGCATATAGCTGAAACTGTTAGCTAATAT
TATAAATATAGCAATATAGCATATGAGTCTGCAAGCATCTGGACAGTTTT
CTCTTGTTTCTGAGTGTAACTCACCATGATCGCCATCTTTTTCCCTATAA
GATTACATTGAGATCTTACACTTTATAATGAACACAAATGCGCAAGTCGT
TGGAAAAAATACAAAAGGCCATAACCTGGATGGCTGGACTACATATAGGT
GAAACTATCCAAAATAAATATATTTCTATAGGATCATCAGCTAGAACACT
TTGTATCGATATATGCTATGATGATAATCTTTATGGGTCTAGAAGGAAAA
GTAAAAGCTCAGATTCTGTAAATTATCAACCAGTAGAGATTGTTATAGTA
TAATTCTAGGGGTATAAAACATGATGTTCCATACAATAATACAATATAGA
TCTGCACATTAGTAGATCTTTCTTGTTCTCATTTGTATTGTGCTGTCTAG
CCATGCATGCATGAACTCCTTAATTCTGTCAAACCTCTTCAAGTACGCAG
AACTTGGCGTCGAGAAGTAAGATCTAACACATCTAATTTTTTCCAAAACT
AGAGTTTAGCGTAAAAGCAACTAAATTTCTTAGTTTTTATTTGCAGCCTT
CATAATCTGGAGAGTTGCTTGTTTGTCCTTTTCCCTTACTTCTCGTAAGT
CTTAAGCCTATCTACTTCGAACTACATATCAAGGTTTCCTTTCATTCACA
GGTTACTATTAGTAACTGCCGTTTGTGTTAGGTACATGTTAGCTGAAGGC
CTTGGCTTGTCCGGCATTGTTTCTATTCTCTTTACCGGGATTGTAAGTTT
AGTTTTGAGAACGCCTTGTATTTCTTCTGTACTCTGAATGTTACAGAAGA
TGGTTACATGAAGTTGAAGTTTTATTTCAGGTGATGAAAAGATATACATT
CTATAACTTATCAGCAGATTCTCAGCGTTTTACTGCTCGTTTTTTCCATT
TGCTTTCATCACTAGCAGAAGCATTCATGTAAGTCATATTCTAATTGTGA
CATGTTTAACTAAACTAATTTAGTTAATAAGCTGGTGCTTATTCTTCTAA
ACAGATTCATATACATGGGGTTCGATATTGCAATGGAGCGTCAAAGCTGG
TCTCATATTGGATTCATATTTTTCTCAATTGTATCCTTCTTTGATTCTGC
ACCAACATGTTGAAATCCCTTTTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCG
CGAATCTGTCTAAATTCAAATGTATCTAGACACTATTTAGCATATAGATT
CATCAAAATTTAGACAAACTTGCGACATCCTTTTCAGGACGGAGGGAGTA
TTTTTGTTGTTTCCTTAATTTTTCCCTTTTGTCAACTAATGCAGATCTTC
ATATTGGTTGCAAGGTATCATCCAATGAACTGGTCTATATATTATTTCCT
TGTTTTGTGGTTGTGTGACGTGTCAAACCTGGTTGCTGACTGTTTGGAGA
ATATATTCCATCTATCAAACACATTTAGTCTGTTTGGCACCTAACTTGCT
TTCTCTCCGCTCGTTTGAAGGGCTGCAAATGTCTTCTCTTGTGCATACAT
ATTAAATTTGGCACGACCACCTCATTCCCAAATACCTAGGCAATATCAGG
TGGCCCTCTGGTATAGTGGTATGTATGCCGTTAAACATGCTCATTGGATA
AATAATAATGCTCACCAAATAAATAAGTTCAAGTTTGAGGTGCTAGATAT
TGATGCTTACTTTTCAGGACTTAGAGGAGCTATGGCTTTTGCCCTTGCTC
TTCAGTCAGTTCATGATCTTCCAGATGGACATGGCGAGACAATTTTCACC
GCTACCACATCTATTGTCGTTCTCACTGTAAGTTACTGCATGTAGTTTTT
TGGATTTCTCTAAAGCATCGTAAATAACTTTCTCGCTGCAACATCCCAGG
TACTTCTGATCGGAGGTTCAACTGGAACAATGCTTGAATCCCTACAAGTA
GTTGGGGACAGTAACCGTTATCGACACTCGTACGAGGCAAGTGATTTTGC
AGTGTTGAACGCCAACATATAGTTGGGTGCTGAGTGCCTCAGATGTCATA
TGTCATCCAAATGGCGCCGGAGTTAATGTTCCTTTAAAACATTTAATTAT
CATGCTTCTCTGCATTGGCCATTTAGTTCCTACAATAATAATTTTGTTCC
TTTTGTTGTGACATCATAAGTTCATAACCTTATAGTGAAATGGTACTAAA
AAGAAAGAAAAAAAATGTACTCCCTATAAGGTCAGTGCCTAGCCTGCTAT
TTGTTCCCATAAAATGGTACTCCCTCCGTTTCAAAATCTAAGATGTTTTA
TCTTTTTTCTGAATCACATGTATCTAGACTTCTTTCGGTGTGTATGTTTG
GAGCAAAATGAGTAACCCTAAACACTAAAAGATGTCTAGATACATATGTT
TCAGAAATAGGCTAAAACATCTTATATTTTGGAACGGAGGGAGTAGTCTC
TAAAGTGCAGCTGAGTCCATTTTGGCACTTATAACTGGACCGTCGAATGT
GAAATGCATTTCCACTGTTTACTGTAATTATCCTTGTATATTTCACTGGT
AGTGTCTCAAATCCTGACTCCTGAGTATTGGTGTGTAGTTTCAGAGCAAA
ATGAGTAAACCTACACACTAAAAGATGTTTAGATACATATGTTTCAGAAA
TAGGCTAAACCATCTTATATTTTGGAACGGAGGGAGTAGTATCTAAAGTA
CAGCTGAGTCCACTTTGGCACTTATAACTGGACCGTCGAATGTGAAATGC
ACTTCCACTGTTTACTTGTACTTATCCTTGTATATTTCACTGCTAGTGTC
TCAAATCCTGAGTATTACTGGTGGTTGAGGATTTTTTTTTTAAGGAACGG
TTGAGGATTATTATTTTATAAGAAAATACTGGTAGTTCATGTTTACAGAC
AATTTACTTGGCAAATGCAGGAGAACTTTGATGGGAGCAATTCTGGTTAT
GAGGAAGGAACATCTACTCCGAGCAAATTTCAACTGAAACTCAGAGAACT
CCGGAGAAGGTGCCTGATCTTGAAACTGTGCTGCTTGTTGAACTTTTTCT
TTTCTCCAGTGAGTTCCAATTCGTTGGGTACCAAGTTCTGTGAACTGGCA
ATCTGTCACTTCTTGGCTGAAGTGGTTGAAATAATTTGTCTAGCTACATA
GTAATGATCTCTATCTAATATAACGTCGCATTAGTTCTTCCTTACAAAAT
TAATCATAAGTTGGTGATATGCATTATTTGTATTGCGTATTTGTCTTGAT
AACCTTCTCTGATATTTCCTGTGTTGCAGTGGAGCAGGAGCTTTCTAATC
AAGATTTCTTTTTGTCCTGCAGCACTTCCTCTTTTGCTTTGTTGGACAGG
AACTACCTCACTCCCATTTTTACCTCTCAACATGATGACGACTCTGATGA
TGACGACGACATCGATGATGATGATAGCCCTGGTAAGAGACATATCCTTA
GTTTCCATTCCTTAACATAAAGAAATGTGAAGTCAAAATGAGAGCCTAAA
GTTGCAATCTGTGAAATTGGTTTTGTAAAAGTTCAAATTAAATGTCCAGA
TAGTTATAATACGGAAGGGTATAATACGGAAGGGTATGTTCTGTGTCCGT
GCAATATTGAATGATCAAATTCTATCTCATTTGCGAGATACAAAAAAAGT
CAAATGCTTGGTATTGTTATTCCTTGTATTATTCAGTATTCACTAGAATT
TGTCGGTACTATTCAGTACTCAGTAGTCAGGTCACAACAAGATGCTTTCC
CTCCTAAAGAGGCAAAACATGACAACTGGCTCACTTCATCTCAATTCTTT
CCGTGCTCAGTTTCTCTGTGCATATTCAGATTGTCCTCTATAAGCTTGAG
TATTCCTTACGGAGTGATGACTATTCTGCGTAAAACACAGATGAAGCGTT
GGGGATACCTGCAGTTGGAGAGCTATAGCTAACGAGTGGGAGCACGAAGC
GATCGATCGGCGGATTTACACAAAGAATCTCTCAGAGCTGGTGAGACTGC
CACATAATAGACGGGCAGACATTGTAGAGCAAGTGTATAGGGACATTAGG
ATAGTTCAGCATGTGTTAGTTACGACGGAATTCACTAGGTATCCTGCTTT
TTTTTTAGGACAGAGTTGGCTTGAAATATTGTTCTTCCATTTGCCCTCTT
GTGTAATTGCATCAGTTGCGGGGTTCATCGGGGCCGATCTGCTCTTCCGG
GTTCTGTAATCTTGTTCACAACTGCCGGACCATGTCGGCGCGTGTTGTTT
TCAGACATTGTCGTCTGCTTTTCTGTTGCGGTGGTACGGCTGTACGATGG
AGCTTGGGGCAGCAGGAGGAACGATTAGCGTCTTTCAGCCAATCGGCAGT
ACTTTTGATGTTGATTCATACTGCAGTGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.