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GrainGenes Sequence Report: AA004331

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Sequence
AA004331
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004331
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCTCAAATTGGCAAGAAATTTAATTCTACAATTGAGGCTTGGAACTT
TTGGACTTGTTATGGAGGTCACATCGGTTTTGATGTAAGGATAAATTATG
AAAACAAAAGCAAAACTGATGGAGTAATCACTTCAGCGAGATATGTTTGT
TCCAATGAAGGCTATCGAGCAAAAGACAAAAGAGATCATAATACACGGCG
TCCTCGTGCAGAAACAAGAACTGGCTGCAAAGTCCGGATGGGAATCACTA
TAGACCGAGAAGTAGGAAATTATGAAGTACATGAGTTACATGTTGAACAC
AACCATGTCCTGCAGCTGCCCGGAACATGCCACTTGATGACATCACAGCA
GAAGATTACAACTTTACAAGCTTTTGAAATTGAAACAGCAGATGATTCAG
GAATTGTGCCAAAAGCAGCCCATGAGTTGGCAAGTCGGTCTGTTGGTGGG
TCAATAAATCTTGGATACACACGTCGTGATCACAAGAATTATTTGCGAAC
CAAGTGTCAAAGGGAGTTAAAGTATGGGGAAGATGGAACCATGCTTAAGT
ACTTTCATGATAAAAAAGTCAGAGAACACCGCATTTCAATATGATGTACA
GCTAGACTGCGATGAAAAAATTGCAAATATCTTCTGGGCTGATGCTAAGA
TGATCATTGACTATGCTCATTTCGGTGATGTTGTCACCTTCGATACTACA
TTTGGGACAAACAAAGAATATAGACCCTTTGGTGTATTTGTTGGCTTCAA
CCATTTTAGAGAAACAGTAATTTTTGGGGCTGCACTGTTATACGATGAAA
CATTTGAATCCTTCAAATGGTTGTTCAACACGTTCTTATCTGTGCATAAC
AACAAGCAGCCTAGAACTATCTTTACTAATCAAGATGCTGCAATGGGTAA
GGCAATTGAAGCGGTATTTATAGGAGCATGGCATGGATTATGCAATTTTC
ACATAATGCAAAATGCCGTCAAACACTTGCCTCCAAAGAAAAAGGATGAG
GAGGGCCCAAATGTTCTTGCTGAATTCAGTGCTTGCATGTATAAGTATGA
GGATGAGGAAGCATTTGAGGAAGCTTTTGTTGCCATAATAAGCAAGGTGG
ATACACAAACTTGGTTGGACAGTATATATAAAGTAAAAGAGAAATGGGCA
AGATGTTTCATGAGGAATGCTTACACTCTAGGGATGAGAAGCACACAATT
AAGTGAGAGCTTGAATATGTTGGAGATATTCCCTAGAGGCAATAATAAAT
GTAGTTATTATTATATCTTTGTGTTTATGATAAATGTTTACATTCATGCT
ATAATAGTATTAACAAGGAAACATTAATACTTATGTGATTTGTAAACTTA
ATTTAAAGTCCCTAGTATAGCCTCTATACTTCACTAGCTTGTTGGTTGAT
AAATGATTGTGGTTTCCCTATCATGAACATTGAGATGTTATCAACAACAA
GATCATATCGTTAGGAGAATGATATGGTGGACATACTCCTATAGATAAGC
GTAGCATAAAGATCAAGTCATTTCAATAGTTCAATTGCTATATGCTTTCT
GATACATAGTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGATCATGCATATCACCTT
TACCGGATGGATGCTTTGATGACATCAAACACCACACCGTAACTGGGTGG
TTATAAAGGTGGCATTGAGTGTTCGGAAAGTATTGGTTGAGACACATGGA
TCAAGAGTGGGATTTGTCCATCCACATGACGGATAGATATACTCTGGGCC
CTCTCGGTGAAATGTCATCCAATTAGCTTGCAAGCATGTGACTTGGTCAC
AAGGGATCACATATCACGGGAACGAGAAAAGAGTACTTATCAGTAACGAG
GTTGAACTAGGTATGCAGAGATACCGACGATCATAACCTCGGATAAGTAA
CATATCGTGAGACAAAGGGAAATTGGTATCGTATGTAAGTGGTTCATTCG
ATCGCAAAGTAATCGTAGAAATATGTGGGAGCCATATGAATTTCCAGATT
CCTCTATTGGTTATTGTTCGGAGAAGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATT
CACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGACATTGTTTGAGTAGTT
ATGGTGTTATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGGAGTCTCGGATGGGAT
CCGGGATATCACGAGGTGATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATAT
AAGGAAAGTCCCGTTTCGGAGTTGCGGAATGATTCCGGTGTTTTCATCGG
GAATGTTCTAGAAGGTTCCGGATTGTCCGGCACTCCGGGGGGGGGGGGGA
GGGGTACATGAATGTGTCATTACATATTGGAATGATTGCATCATGTACTA
AGTGTTCTTGCTGTCCCAAATAAAGGATTAAATTGAATCCTAAAACAGAA
AAGTCAAATGTCCAGTTTGAAAGTCAAACGGCTAAAACAAGAAACTGTGG
GAAACAAGCAAGAGGAGTTGTAACCGACTTGGAGGAGGAGTTTCTCTCCT
CCAAGCCGGCGGCCAGCCCTAGGCCGAGTTGGGGAGGGACTCCCTCCCTC
CCCTGGCGCGCCAGCCCCTCCCATCTATATAAGGAGGGGCAGGGCTCCCC
TCCTAGAACACACAAGTTCCTATCTTCTACCTCCGGTTTAGAGCCGTTTG
GGTTTAGAGCTTCTAATTGCTTTAGCCTTCGGTTTAGAGCCTTCTAGTTG
GTTTAGAGCCTTCTAATTGGTGTGTCTAATTACTAGACCACTAATAGCCT
CTCTCATACTCCACCATACTCGCACCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGGGA
TTTCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGCTGCCGGAATCGCGAGG
AGAGTACTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTT
CGTCGAGTACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCCGAAACGTGG
AGCCGGAAGGATCGTCTACACGATCTTGAGATCGGGAAGAGTACGACTAC
ATCACCCACGAGAATCCGCTCTCGTTAAACACTTTGGAATCTTCGAGGGT
AAGTTATTCCATCGACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGATCTTGGCTT
GTTTGTTTGTATGCGATAGAAAATTTTTGTTTTCCATGCTACGAACCCCT
ACAGTGGTATCAGAGCCGTGTCTATATGTAGATCTATTGCACGAGTAGAA
CACAATGGTCATTGTGGGCGTTGATGCTTTTATTGTCGATTGCTTCTTGT
GTACTTTGCATCTTGCGGTATGTTGGGATGAAGCGGCCCGGGCTAACCTT
ACATGACATCGTTCATGAGACTTGCTCCACGCTTGACATGCAACTTGTAT
TGCATAAGTGGCTTTGCGGGTGCCTGTTTCTCCTAGCATAGTTAAGATCC
AATTTACAACGGGTGATTAACAATGCTAGTATCAATGTTGTGGTTCTTGT
TCGTAAGTTAGAACGACACTTATTGAAAGCCCCAAACCACGTAAAATATG
CAAAGAAAGTAGAGGCGTCTAACTTTGTTTTGCAGGGGTGTGCAGTGATG
TGATATGGCCATGATTGTGGTTATATTTGATGTATGCAATGTTCCTTATT
GTAAGTAGGCAACCGGCAGGAGCCATATGGTTGTCTTTAATTTATGTTAA
GACCCGCGTGTCTATTCAAAGTAGTTGTAATAGTTGAAGCCGGTAGACGA
CAACCATGGAGTAGCGTCATTGACCTTGATGCAATGCCGGTGATGATGGA
GATCATGTTCGTGCTTGAAGATGGAGATCGGAAGCACAAAGAAGAAAGGC
CATATCATATCACATACATATTATGAATTGCATGTGATGTTAATCCTTTA
TGCATCTTGTATTGCTTAGTAGACGATGGTAGCATTATAAGATGATCCCT
CATGCACATGAATTTCAAGTCATAAAGTGTTCACCCTTAGTTAGCACCGT
TGCTAAAGCTTGTTGTTTCGAAGCACCACGTGATGATCGGGTGTGTTAGA
TTCCGCAAGTGTATACAACGTGAGCAAGCCAGATTTGCTCATGCGGAAAC
TAAGGTTTGATCTTGACGAGCCTAGCATGTACAGACATGGTCTCGGAACA
CGGATCACCGAAAGGTAAAGCATGAGTCATATAGTAGATATGATGAACAT
GTTGATTGTTCGCCATTGAAACTATATCAACTCTCGTGATGATCGGTGTT
GATGTAGTGGATTTGGTTCGTGTGATCACTAAAACAATGTGAGGGATATT
GTTTTGAGTGGGAGTTCACCTAGTTTAATTACATTAATTAATTTGAACTC
AATTGTCATAAACTTAGTCTAAACTATTGCAAATATGTTGTAGATCAATG
GCAGCCCCTACCATCAATTTTAATGCGTTCCTAGAGAAAGAAAAGTTGAA
AAACAATGGAAGCAACTTCGCGGATTGGTTCCGCAATTTGAGGATTGTCC
TCACAGCTGGTAATTTGACCTATGTGCTGGATGCACCGCTGGGTGACCCA
CCTGCAGCTGATGCTCCCGATGAAGTAAAGAATGTTTACCTCGCTCGGAA
GAATCAGTACTCCATAGTTCAGTGCGCTATCTTGTATGGTTTGGAATCGG
AGCTTCAGAAAAGGTTTGAGGATTCAGACACATATGATATTGTCGAGGAT
CTCAAATTGATTTTTGAGACTCATGCGGCAATTGAAAGCTATGAGGCTTC
TGAAAAGTTCTTTAACTACAAGATGGAAGAGGGCAGCTCCGTCAGTGAGC
ATGTGCTTAAGATGTCTGGGCACGCAAACAAACTTCAAAGCTTGGGTATA
GTGATTCCTAATGCTTTGGGGATTTACCGTGTCCTCCAATCACTACCACC
AAGTTACAAGAACTTTGTGATGAACTAGAACATGCAGAACATGAACAAGA
CGTTGCCAGAACTCTTTGCCATGTTGAAATCTGCAGAAGTGGAGATCAAG
AAAGAGCACCAAGTGTTGTTGGTCAATAAGACCACCAAATTCAAGAAAGG
CAAGTCTAAGCCAAAGGGACACTTCAAGAAGGGTGGTAAGAAAGTTACCA
CGCCGACGAAGAAGACCAAGGCTGGACCTAAGCCTGATACTGAGTGCTTT
TACTGCAAGGGAGAAGGTCACTGGAAGCGGAATTTCCCAAAGTACTTGGC
GGATTTGAAGAACGGCAACATCAAGAAGAAAGGTTTATCTGATATACATG
TTATTGATGTGTATCTCACTAGTACTCGTAGTAGTGCCTGGGTATTTGAT
ACTGGTTCGGTTGCTCATATTTGTAACTCGAAACAGGTGCTGCAGAATAA
ACGGAAGCTAGCGAAGAACGAGGTGACGATGCGCGTGGGAAACGGATCAA
AGGTTGATGTGATCGCGGTCGGCACGCTACCCCTTCATCTACCATCGGGA
TTAGTTTTATACTTAAATAATTGTTATTTGGTGCCTGCGTTGAGCATGAA
CATTATATCGGGATCTTGTTTATTGCGAGACGGTTACTTGTTTAAATCCG
AGAATAATGGTTGTTCTATTTATATGAGTAATATGTTTTATGCACATGCA
CCTTTGATAGATGGTCTATTCTTATTGAATCTCGATAGTGGAAATACACA
TATCAACAACATTGAGGCTAAACGTTTGAAATCAAGCGATAATTCGACCT
ATATGTGGCACTGTCGTCTTGGTCACATCGGAGTGAAACGTATGAAGAAA
CTCCATTCCGATGGACTTCTTGAATCACTTGATTTTGAATCACTTGAAAG
ATGCGAAGCATGTCTGATGGGAAAAATGACTAAGACTCCATTTTCTGGTA
TGATGGAGCGAGCTACGGACTTATTGGAAATCATACATACCGATGTGTGT
GGTCCAATGAGTGTAGCATCGCGCGGTGGTTATCGTTATGTTCTTACCTT
CACGGATGACTTGAGTAGATATGGGTATATCTATTTCATGAAACATAAGT
CCGAAACTTTCGAGAAGTTTAAGGAGTTTCAAAATGAGGTAGAGAATCAA
CGTAACAAGAAGATTAAATTTCTACGTTCTGATCGTGGAGGTGAATATCT
AAGTTACGAGTTTGGCGAGCATTTGAAGAAATGCAGAATACTTTCACAAT
TGACACCGCCGGGAACACCACAGCGTAATGGTGTGTCCGAACGTCGTAAT
CGAACTCTCTTAGATATGGTTCGTTCTATGATGTCACTTACAGATTTACC
GCTATCATTTTGGGGTTATGCATTAGAAACAGCCGCATTCACTTTAAATA
GGGCACCATCTAAATCCGTTGAAACGACACCGTATGAATTATGGTTTGGG
AAGAAACCTAAATTGTCGTTCCTTAAAGTTTGGGGATGCGAAGCCTATGT
AAAGAAGTTACAGCCGGACAAGCTTGAACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCT
TCATAGGATACCCGAAGGAAACTATTAGGTATACCTTCTATCATAGATCC
GAAGGCAAAATCTTTGTTGCCAAGAATGGATCCTTTCTAGAGAAGGAATT
TCTCTCGAAAGAAGTGACTGGAAGGAAAGTAGAACTCGACGAGGTTGTCG
AACCTTCTCTCGAAATTGCGAGTAGCGCAGCACCGGAAGAAGTTCCTGTG
GTGCCTGCATCAATAAGAGAGGAAGCTAATGATGGTGATCATGAAACTTC
GGTTGAAGTTGCTACAGAGCCTCGGAGGTCAACGAGAACTCGTATCACTC
CAGATTGGTATGATTCCGTTATGAATGTCATGTTGGTGGACAACACCGAT
GACCCCGAGACATATGAGGAAGCGATGATGAGCCCAGATTCCAATAAATG
GCAAGAAGCCATGAAATCCGAGATTGGATCCATGTACGAAAACCAAGTAT
GGACTTTGGTGGACTTACCGGATGGCCGGAAGGCTGTCGAGAACAAATGG
ATTTTTAAGAAGAAAACAGATGCTGATGGTAATGTTACTGTCTATAAAGC
TCGACTTGTCGCAAAAGGGTTTCGACAAATTCAAGGAGTTGACTACGATG
AGACTTTCTCACCGGTAGCGAAGCTAAAGTCTGTGAGGATTATGTTAGCA
ATCGCTGCATATTATGATTATGAGATATGGCAGATGGATGTCAAAACAGC
ATTCCTCAATGGAGACATTGATGAAGAGTTGTATATGATGCAACCCAAAG
GTTTTGTCGATCCTAAAGATGCTAACAAGGTATGCAAACTTCAACGGTCC
ATCTATGGATTGAAGCAAGCATCCCGAAGTTGGAATCAACGTTTTGATAA
GGTAATCAAAAGTTTTGGTTTTATACAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTT
ACAAGAAAGTGAGTGGGAGCTCTGTAGCATTCTTAATACTATATGTGGAT
GACATATTGTTGATTGGGAATGATGTAGACCTTCTTAATAGTGTCAAGGA
ATATTTGAATAATAGTTTTTCAATGAAGGATCTTGGCGAAGCAGCTTACA
TATTAGGCATAAAGATTTATAGAGATAGATCGAAACGCCAAATATCATTG
TCACAGAGTACATATTTGGACAAAGTTCTAAAGAGATTTGGAATGGAAGA
AAGCAAGAAAGGGTTCTTGCCCATGTTGCCCAATACGACCTTGAGTAAAA
CTCAAAGTCCGACATCGGCAGGAGATAGAGAAAGGATGAGTAAGACTCCC
TATGCCTCAGCCATAGGATCTTTAATGTATGCCATGCTATGTACTAGACC
CGACATTGCAGATGCTATTAGTTTAACTAGCAGATATCAAAGTGATCCAG
GAGTGGATCATTGGACAGCGGTCAAAAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGA
ACTAAGGATATGGTTGTTTCTTATGGAGGTGATGAACAACTCGTTGTTAA
TGGTTACACCGATGCTAGTTGGAACACAGATCCGGATGATTCTAAATCAC
AATCCGAATACGTATTTATTTTGAATGGTGCAGCAGTTAGCTGGAGGAGT
GCAAAGCAAAGCGTTGTGGCGAGATCTTCAACTGAATCGGAATACATGGC
TGCTTTGGAGGCTTCACAAGAAGCGATATGGATGAAAGAGTTCATTACAG
AGCTGGGTGTGGTTCCTAGTGCGCTGGACCCAATGTCTATCTACTGTGAT
AACATGGGCGCCATAGCCAATGCGCAAGAACCAAGGTCACACAAGAAGCT
GAAGCATATCAAGCTACGTTTTCACGCTATTCGAGAACATATCCAGGATG
GGGATATAAAGATTTGCAAAGTACACACAGATCTGAATGTGGCGGATCCG
TTGACTAAACCTCTCCCGAGGGCAAAACATGACCAACACCAAACTGCCAT
GGGTGTTCGGTATATTACCATGTAATCTAGATTAGATGACTCTAGTGCAA
GTGGGAGACTGTTGGAGATATGCCCTAGAGGCAATAATAAATGTAGTTAT
TATTATATCTTTGTGTTTATGATAAATGTTTACATTCATGCTATAATAGT
ATTAACAAGGAAACATTAATACTTGTGTGATTTGTAAACTTAATTTAAAG
TCCCTAGTATAGCCTCTATACTTCACTAGCTTGTTGGTTGATAAATGATT
GTGGTTTCCCTATCATGAACATTGAGATGTTATCAACAACAAGATCATAT
CGTTAGGAGAATGATATGGTGGACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCATA
AAGATCAAGTCATTTCAATAGTTCAATTGCTATATGCTTTCTGATACATA
GTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGATCATGCATATCACCTTTACCGGAT
GGATGCTTTGATGACATCAAACATCACACCGTAACTGGGTGGTTATAAAG
GTGGCATTGAGTGTTCGGAAAGTATTGGTTGAGACACATGGATCAAGAGT
GGGATTTGTCCATCCACATGACGGATAGATATACTCTGGGCCCTCTCGGT
GAAATGTCATCCAATTAGCTTGCAAGCATGTGACTTGGTCACAAGGGATC
ACATATCACGGGAACAAGAAAAGAGTACTTATCAGTAACGAGGTTGAACT
AGGTATGCAGAGATACCGACGATCATAACCTCGGATAAGTAACATATCGT
GAGACAAAGGGAAATTGGTATCGTATGTAAGTGGTTCATTCGATCGCAAA
GTAATCGTAGAAATATGTGGGAGCCATATGAATTTACAGATTCCTCTATT
GGTTATTGTTCGGAGAAGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACC
GTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGACGTTGTTTGAGTAGTTATGGTGTT
ATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGGAGTCTCGGATGGGATCCGGGATA
TCACGAGGTGATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATAAGGAAAG
TCCCGTTTCGGAGTTGCGGAATGATTCCGGTGTTTTCATCGGGAATGTTC
TAGAAGGTTCCGGATTGTCCGGCCCTCCGGGGGGGGAGGGGTACATGAAT
GTGTCATTACATATTGGAATGATTGCATCATGTACTAAGTGTTCTTGCTG
TCCCAAATAAAGGATTAAATTGAATCCTAAAACAGAAAAGTCAAATGTCT
AGTTTGAAAGTCAAACGGCTAAAACAAGAAACTGTGGGAAACAAGCAAGA
GGAGTTGGAACCGACTTGGAGGAGGAGTTTCTCTCCTCCAAGCCGGCGGC
CAGCCCTAGGCCGAGTTGGGGAGGGACTCCCTCCCTCCCCTGGCGCGCCA
GCCCCTCCCATCTATATAAGGAGGGGCAGGGCTCCCCTCCTAGAACACAC
AAGTTCCTATCTTCTACCTCCGGTTTAGAGCCGTTTGGGTTTAGAGCTTC
TAATTGCTTTAGCCTTCGGTTTAGAGCCTTCTAATTGGTTTAGAGCCTTC
TAATTGGTGTGTCTAATTACTAGACCACTAATAGCCTCTCTCATACTCCA
CCATACTCGCACCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGGGATTTCCCCTCTACT
TCCGGTACCACGCCGTTGTGCTGCCGGAATCGCGAGGAGAGTACTACAAC
CTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCGTCGAGTACCGA
ACATGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCCGGAACGTGGCGCCGGAAGGATC
GTCTACACGATCTTGAGATCGGGAAGAGTACGACTACATCACCCACGAGA
ATCCGCTCTCGTTAAACGCTTTGGAATCTTCGAGGGTAAGTTATTCCATC
GACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGATCTTGGCTTGTTTGTTTGTATG
CGATAGAAATTTTTTGTTTTCCATGCTACGAACCCCTACAGAATAGTGAC
TTGAAAAACCATCTGAAATCTGATCTTGACATTCTTCGTTTCTTCAAGCA
TCTGGAGAGGGTTGTGCAAGGAAAGAGAGACAATGAGCTAAAGGAGGAAT
ATGAGTCTAGGAAAAAAATACCTAGAGTTAGAATAAGGACCCCTGCAATA
ATACAAGCAAGCAAAGTTTACACACCATGCATATTTGAAGATTTTCAGAA
TGAATATGAAAGATCCATCTCGGCATATATCAAGCCATCAGAAGAACACA
ATGTATATAATGTTGTCATTGCAAGTATTGATCCAGAAAGCACATATGAA
GAAGAGAGCAAAGTTCTAGTTGATCATCAGGAGCAACAAGTTCTATGTAG
TTGTGGGCAATTTGAAAGAGTTGGTGTGTTGTGCAGTCATGCTTTGAAAG
CCCTTGATGTCATGAATATTAAGTATCTTCCGAGTCACTATATTTTAAAG
CGCTGGACTCGAGAAGCACGAAGCGGCACTATTCAGGACAGCCATGGAAA
TATTGTTTTGGAATACCTAAGAATGGAAGATAGGTTGCGCTTGAAGTTTT
TCATTCACAAGTTTCATGGCATAGCTTCCAAATCACTAATATCCGAAGAA
TGCAGCAAACTAGTAGATGATGCATTGGAGAGCCTTAGCAAGCAAGTTGA
AGAAAAAGTGTCTAGTACTGCACGTACAACCGAAGCTATATGTGAAGAGT
CAGATGTTAGTTTACAAACTGCGTGCCTAAAGAAAAAAGAAATTCAAAAG
AAGAATACAAGAAGAAATAAATCATGGATTGAAAAGCAGCGCCCCAATAA
AAAGAAGAAGACAGCTCAATTTGTACCCCAAAAACAATCATGCTCTGTAA
ATCTCTTACACATATCTAAACACATTACATATTTACTAATGAAAATATAG
GCTAATCGTTTTTTGAACTTTTTTGCATAGAGAGAAGGGGAAGAAATGAC
AACACTACAAGACCAAATACCTGTGGAGCCAATCACTAGAACAACTGAGA
AT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.