Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018066

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018066
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018066
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTGACATCGACCTCCCCGGACGGAGCTCTCCCTTCCTTCCTACCTACACA CTGCACAAAACTCGTTCATGGGTCAGGGCCACCTCGATCATCTCCCCTCT CGTCCATGCTCCAAAAATACGACTGCCAAAATCCCAAGTATACTGCTACA TCCCATTCGCCCAGAAAACACCCGAACAAAATTTCGGATTCCAGCTCCGA AACCACACAAATCCTAAACAAATTCGGAGCGAGAAAATCGTAGCATCATC ACCGTTTCCTACCACGATGCCGAAACGCCGACTCCAAACTCGTAACACCG GCCATCGCTCCTCCTCCGTCTCCATGGACGCGCACCGGCAAAATCAAACG ACGAATCGAGACGGCAGCAGCTCCACCTGCACACACGACGAAGACGACGA CGACGACGACTTCTTCCATCTCCATGTAACCCCTATCCACCACCTCCTCC TCCCGCACGAAACTACCGAATCCCACGAGAAAAATCAGGATCGCGTTTTT ACAAACCGAGTCGCCCTCCTACTCCTACTCCTTTCTCCTAGGACTTCCAA GCCCATTAGAACACACAAAGAACAGGCGCCTCGGCCGCCAAAAAAAAGAG AAAGAATCCCCAATCCGATTCTTCCTCTTTCTCTCTAGCTGCGCGCATCT CCGTTCAAGATTTCTTTCCGTGCTCCCTTCCCTTCCGCCGTCTCCGCGAC GGCTCGTGGGGAGGGAGAGGAATTCCCCGCCTCTCCAATCCGCCGCGGCG AGGCCAGGGTTAGGGTTTGCGGCCTCCGCCGAATTCGCCGTGATCCCGCC GCCGGCTCGGTGAATTCGAACGAGGCGTCAAGGGTTCGCGTGGGATGATA TTCAAGCGGAGCCAGCGCTCGGAGATCCTCTCCCTCAAGCGCTGCAATGC CGGGGGCGGGGAGGACGCCGGCGAACGGCCGCGGAAGAAGCAGAGGGGTG ACGAGTTCTTCCCCGTTGAGCTGCTCGGCCACGTGCCGGACTCCGGTATC CCCTACGCCGCCGCCGGGTTCCGCTGGTGCAAGGAGCCACAGGTTGCCTC GCCGGCCGCTGCTGAGCTGGCGCCCGCCGCCGCCACGCGCCCGCCTGTCG TTCGCACCTCGCGGGGGCGTGCCCTGGTCATGCCTTCGCGGTACAGTGAC TCGGTGCTCATAGACCCCGTTAGGAAGGAGAAGCCGGTCAAGCCGCCTGC ACCACCCAAGCTCATTCCCAAAACCAAGGTTAAAGCTGCAATCTTGGATA GGAGTCTCGCATTCTCAGAGGTGGACGAGGATGACGACACAGAACGTTAC CGAGTCTGCCAGAATTTTGTTGCCTCCAGGAAGTACTCCATGTCCCTCAG CACACTAACCTCCTTGCACGACGAGCCGCACAACAACGGTTATCATACAA AGGAGCTAACGCGATATGAGGAAGACGAGCAGGAAGATGATGAAGAAGAA GAGGAACAGAAGAAGGTCCTCCATTGGAGTAAAGACTTTTTGTACGGTGA CATTGTGTGGGCACGGCTTGGTAAGAGGCAGCCAGCGTGGCCAGGAATTG TCGTCGACCCAGCTCGGCAGGCTGATGCCGAGGCATTGCCGCCCCAGCCT CGTGGGGGTGCAGTGCTTTGTGTGATGCTGTTCGGCTGGTGCGCAGAGTT TGACGATGAGAAGGTATGTTTTAATTACTGCTTTGTTAGGACTCACATGA CTTGAATTGATGCAACTTTCTATTTTGAGCTATATTGCTGAATGATTAAT TTTGATAATGCGGTGGGTTGCAGAAGTACGTCTGGGCGCGGCAAGGAGGG ATATTTCCTTTTGTCGACTATATTGACCAGTAAGTACTAGTAATTCACTA AAGTTAACTTAAGATTTCATTTAATATGCTGCAAAAGCATATCTCGAAGG AATTTTTATCGGTAAGAAGTAGAAGTTAATGTGCCATGCTATAGAATAGC ACCCACACATGTGCTAAGAAATACCCTGTCTTTCCATTTCAGATTTCAAG GGCAGACTGATCTAAGAAGTTGCAAACCTGGTGATTTCCAGAGGGCACTA GAAGAGGCATTTTTAGCTGATCAGGGGTTCTCAGAAGTGCCGATGGATGA CAGCTCAGCTGGGCAGCCTGTTGTGTGTCAATCTTTTCCAGACGAATTAG AAGAAGTGACCGGCTCAAATGAGCTGGAGTGCCAGGGACAAATTAAGGCA AGTTGATGTTTTTTTTTATGTCTGATGCATAACTAAGGAGACTTGTATGC ACAGGAAATTTCAGAAATTTACCAATACTTTAGGTTCACTCTTCTCTTTT CTATATGCTGGTTTCCTTGAGAAAGTTCTGTTGTTACTTGTTCTAACTAT GCATTAATCCGAGGTGTATGGTTTAGATCTATCTGCATAATCTTCTAAGA AACAAAAAATATATAATACTGGATGCATATAAGCAAAATGATAATATTTA GCATGTTTATCTATTGCGGAGTACCAACGTTATTCAACATATTAGCCCTA GATGGCTTAACTTCTAGGTCAGTTGATGACTGACTACTGTTAATACCGCC ATAACGCTCCAGTGTTGTTCACGTACTATAATAAAATAAGAAAAACAGAA CTGAAGCTACTGCAGCTATCATATATTGCCCCCAATATACTAATTTTGTT TGCCTATTCGTTGTACACAGCGCTATAAAAGAGAATTGCAGTGTGAAAGT TGTGGAAATTGCTTTCCAGACAAAGAGTCAAACAAGTTGGTGTATGTTAT GGAGCAACTTGCTTGCCAACATTGTGCTAGGGTATGTACCGGCAAACCTA CTTCATTTGGAGTGTATCGTCCTTACACCTTACACTAGTTCCTGTATCTG CAGATCTTGAAATCAAAAGCGTACTGTGGGATATGCATGAAAAATTGGCA ACATAAATTTGGCCGAAGATGGGTAAGACATAATGTAGCTATTAGAGCAA TAAGTTATTTTTATGTTTCCAACCCTGTAAATTCTAAAGAGGGGAGGCGA TTAACCAGGTTTGCTGTCATGGTTGTGAAAGTTGGATTCACGCAGAATGT GACAAAAAGTGCAGCAACCTAAAGGTTTTCCTTTTCTCATAATTGTCCTG GGTGCTTTAGTAACTTACCATTGCTAACATTCCCAATTTAATGCTATATA GGATCTACGAGACAAAAGTTATTTCTGCCTTTACTGTAGGGTTAAATGTA ACTCAGATCTGTCTGGCAAGAAGACAAACTATCCTGATGACAGGTGAGTT AGAAGGCTATAACCACTTGTTCATACCGCAACTCCATATTTCAATGTTCT AATTATGACTCAAGAGTAACATGTATAATCTGTTTTTGAAACAGAAAAGA TAATTCTACACAGAAAGGAAGGAAGCCTGACAATGTTGTGGTTGTTTGTT TTGATATGCAAGGAACTTATGTACCAAATCTCGAACTGTAAGCACCACTT TTCTGAATTGCTTATTGAAGTTACTCCTACTTGTGAATGGCAGTGCATGC CAGCACCACCCTAGTTATTTTTAGTTTTTCTCACAATTATTATTATTATT CAGTGAGATTGTTGATTCCTGTTTTTTTTTTTGCTTGAACTTATATTTCT GCTTGCTCTTGTTCATTGTTTAGGTTATTTCCATTTTTCTGCATCTAACT CTGATGTTCAGTTTTCATATATTTTTGAATCTACTTATGACTTCTAGAAT TTTTCCTTATGCAGGATTGCTTGCCATTGTGCCCCTTGTAAGGGACAAAA GTTCTTGTTCAACGAATGGGAGAGACACGCTGGCTGCAGAAGTAAAAATT GGAAATCTAGTATCAAAATGAAGGATACTCTGATGCCATTTGGAAAATGG GTTCGTACAATAACCACAGCATACTTTCGTTTCAACGTTTTCCACAGCAT GTATATATGCTGTTAGTTCATGTCCTATGGTATTTAGTGTTGTAGTTTAT GCTTTGTGCTTCTGTTTGCCTGACTTTACAGATAGATCAACATCAACCAA GTGTGGGTTCTACAAATCCTTCAAAACGCTCCTCTCAGAAACTGAAGAAA CAACAGTTACTTGATTTGTTAAATGGTAAATGGGCATTTACTTGGTTGCT CTAGTATTAGAAGATCTGTCTCCAAGGGATTTCAAGTGATGGGCTTTGAA TTTGACATTTTTACAGAACCTTATGATCCTGTACATGCAAAATGGACAAC CGAAAGGTGTGCAGTGTGTAGATGGGTTGAAGACTGGGATTACAATAAGA TTGTAATTTGTAACAGGTAATTAAGCTTGTGTTGATACAAATGTTTATCT TCGAAGTGGATCATTTTGAGATATGTGCTAAATTCTGCAATTAACATTCA TGTTCAGATGCCAGATAGCTGTTCATCAGGAGTGCTATGGCGTGAGTGGT GATGAAGACTTCACCTCGTGGGTTTGTAGGGCTTGTGAAACACCTGAACA GAAGAGGGAGTGTTGCCTTTGCCCTGTAAAAGGTATGTATCTGTTACATC CTCTTATATTTGTGAACTCTTAGTTCTTCCTTTCAACATTGTAGACGAAG TAGATACGTAAAACCTAGGTCTCTTGCTAAATAACAGTAGTGAAAGCACC ATGCTGAGTAAAATGAGTTTGTCAAATCTGATACCTGAAAATCTAGTTGT AATATTCTGTTTGATTGAGCATTTTGGTAATCATTAACCTGTTCCTTACT GACTTCAAACACTTCTTTTAGGTGGTGCATTGAAGCCAACAAATGTTGAT AACTTGTGGGTGCATGTGTCATGCGCATGGTTTCAACCACAGGTGGCATT TGCTAGTGATGAGCTCATGGAACCTGCTATTGGAATATTGAGCATCGCAC CTTTGCCATTTATGAAGGTTATATATATTGATGCTATAGCTTTTAAGTGG CTTAAGATGATTGATCTTCAGTAAATACTACATGTCTCATATGTTTAACT ACACTGGTCTTATTAAGCTCCATCCTCGTCCATTGCTCCAGATGTGCGTC ATTTGCAGGCAAATACATGGTTCTTGTACACAATGCTACAGGTGCTCTAC TTATTACCATGCCACCTGTGCATCGAGGGCAGGCTATCGAATGGAGGTAC AACTAATACTGACTGCTGCTAGCAGATATTACTTAAGCTGTCTATATTGA TGAAAAGTTTGCAACTTCATTTCTTTTGCTTGCATCTCATGTTTTTCTAA ATCAGCTGAACTTTACTATGTATTCGATGTGTATAGCTGCACTGCTTCAA AAAAAATGGCAAACAGACGACAAGGAAGATTTCATATTGCGCTCACCATC GGTAAGTTTAAATAAGTGGAAGCGACCACAAAGTTATAATTTGCTCGTGT CATTTTGTGCACCATATTGTCTTTACTAGCTGAGAAGTCTTTCAAAGTAA ATAATTCGTTTTTTCTATTTTTCTGTCTTACTGAAAGTTGGTGTCTTGGG TGATTATTTATGTGCAGGAGACCTAACCCTGATAATGTTTTGATAATTCA AACTCCTGCTGGAACTTTCTCTTCGAAAAGGCTTGTTCAGAGTAGTGTTA CTGTTGCTGCTTCAAGACTGATTAGGAAAGACCTTCCCAAGGATTCAGCA ATCAAAGTTGAAACCACAGAGAATTTGTGTTCTGCAAGATGTCGGGTTTA TGTTAAGAAAGAGTTAAAGGTATGCCCGTATATTGGATTATATGTTCTGA CCATTTTCTAACAGAATCCTGTTACAGTTGATGCAACTTTACGCTAGCCA CAAGATTAGCCACAATACTTACAAGTAGCATTGTAACATAAGAAACTCTT GGCAATAAAGTTGGGGAAAGTACTTGTTTTTTCTAAGGATATGGCCATTA TCATTTCATTCTAATGCGAGTGCTACTCAAGTATGAGTGACTAGGTTCAC TAGAAGATGACAATAGTAGCAAACTTATCTGTGTCTACCAGAAATTTTGT GATGCTATTCTCTGTTGTGCTGCACTGTGGAATCTAGTTAGCTGAATGAA TTTTAATATTTCCAACCAACTGGTTACCTCGGATAAAAAAATTCAATCAA CTTCTAGCTGTTCGACCCCAGTTCATCTTCTTTTCATAGTTACACTCATA TGGAGCAACTACATGGTATCCATCAAGTCCTTGGTATCCATATTATGCTA GTTACTTTTCTAATCCCAACGCATCCCACTCGCCAGACTGGCTGGACTCG ACTCGGTTTAGGACTCCTAGCCCATGTGGACATGCCCCTGCTGCTACTCT GCACGGAGCTCCTACCGTTTCCCTGCCTGGTGCTTCTGCTGCACTCGCTG CATTTCCACTATTTTTCACAAACTGGAAATGCAGGACTAAGGCCACAGCG AAACTGATATGTGTGACCCCAAAAGGAGTCCACAGCACTACCTAGTCTAA CTGTAATGTAGGTTCCTGGCTGCCGGTTAATGTGCTTACACCTTAATTCA CCACTTGTGGATAACCTTGTCACTTCCCATTCAATTCCTTGAGCATCCCT ATATATTGTAGTTAATTTTAGTGATTTTAGGATTTTCTCGTAAGGTGTTG ATCAATATGTAGTGCTAAAAAATATAAATGTTGTTGCTGGTTGAGTTCTT GTATTGATAACCTATTTGTTGTGTGCCTGACTGGAGTTCTGTTGGGATGC AGAGATCTCGGGAGGCAGCAATGGCACATCGTGTAAGGGGATCTTGTCAG CACCGCTGGGATGAAATTGACAGTCTGAATCCACCCAGGGTAATTTTATG ATTTGTGCTTAATGTGTGCATGCTGACTCGACAGCTGTTCCAATCGTTTA GTCAAATTTCTTATGAAGGAAACTTTGTACTCTGCAGGAAGAGAGGGATC CAGAATCCTTTTCTACTTTCAAGGAGCGTCTACGTTATCTTCAGGTTAGT ATATGCCCATGCTTGGCTTTCCCTTGTACCCTTTATATTTGTAGTTTAGA TCTAATCAATTTCTTCTTATTTCAGAAAACGGAACATAGTAGAGTATGCT TTGGTCATTCAGGAATTCATAGGTGGGGACTTTTTGCTCGTAGGGACATT CAAGAAGGAGAAATGGTACTCCCACAAACACTATTTATGCCATGGAAATA TTTTTCAGAAGTAGGCTGCACTTGAAATATAGATGTGCTCGATTGTTTTA CATGGTTTAGTTTATACTTTATATGTTAGCTTCAGTTTACATTATTTTTA AAGGTCCAAGTATTCTCTGCTACATGGTTTCTGTGTAACCACTCAAGCTA TTTTTTTCCCCTCATATTCATATATGCCCCACTTCTCATATCTGCATTCC GCAATAGTTCCTCGTTAACGTGCTGCTTCCCTCATTCAACAAATTGCTCA TGGTTAGCGTTTTTATCAGGTTCTTGAGTACCGTGGTGAGCAGGTCAGAC GAAGTGTTGCTGATTTGCGGGAAGCACAGTATCGTAGACAAGGAAAAGAT TGTTATGTGAGTTATCTTCCACATCAGTTCACCAGATCTATGGTGTGAAC TATTTTACGAATGGAGATGTTTTTTTCTATGAAATAATATTATATCTATA AAAAATATGCTATTTGGCCATGCCAAATGTTAGATATATTTCCTGGCTAG CTTATTTTATTGATTGATCACTATACAAGCTAACATAGACTATGTGGACT ATGGAGTAACTCTACAGAAGGTTCCATGTCTGATTCTTCATTCTTCAGAT TTATATGCATATCGAACTTAGGCATGTCATTAGAAACTTGCGCCATATAC ATTACTATCCATTTGTGATGACTTGTTTTATATCATCTGATATTTCATCT AACATAACTACATCTATGCTGTCCTTTTACTAAACAGCTTTTCAAAATCA GCGAGGAAGTGGTTGTTGATGCCACGGACAAAGGAAACGTGGCACGCCTG ATTAATCATTCTGTAAGGATCATATATTTTATCTTTAAATCTAAAAGATT TTGAATCGAATGTGTATGTGATATATTTTCATTTTCATTCCAGTGCACGC CAAACTTTTATGCGAGGATTATGAGCGTGGGTCATGATCAGAGCCGCATT GTTCTAATTGCAAAGAGAAATGTTTGTGCCGGCGAAGAACTAACGTACGT CATATAGGATTCTTTTTTCTTATCTTTGCAGATGGTCTCAGCAAATTATG ATAATTCCACCATTATTAATCTTTGTTTTCTGCAAGACTAATCATGTTTT ATCTTTATGTGTATTTTCTAGGTATGATTACCTGTTTGACCCTGATGAGG CTGACGATTGCAAAGTTCCTTGCTTATGCCAGACTGCTGACTGTCGCAAA TACATGAATTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.