Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA039562

[Submit comment/correction]

Sequence
AA039562
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039562
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAGTGGTGGTGCGGCAATCCCTTCTCCGCCCCTGGCTTTGCATTGCCAT
CTCCTTCCTTCCTCCGTCTCCCCCTTCCCCCCAGCAGGCTAAGCACAAAC
CCGACGCGAGCGAGCGAGCGAGCACATACACATCGACTCAACTCTCCTCT
TCCTCCACCGAAAGTCCAACCTTTTCGCTCCCAATCCACCACCCATCGCC
CACCACCAATCCCGCCTCCCTCTCCCTGTCCTTCTCTCTCCCTCGCTCGC
TTGATTCGATCAGAGAGAGCCCCGCCCCGCCCCGCCCCCGCCACCAGACC
TCGACCAGTCAATCCCCCCTCTAGGGTTTCGCCTCTCCCGCCGCCCAATC
GGATCCACCTCCAATGTGAGTTCGCCTGATCCCTCCGCCTCTGTGGTTAT
ACCATCGTTTCACGCGCAGATTTGGTACAATCCGATCGGAAATTTAGACC
TCCCCGTGCTGTTAATTTTCCATGCGCGCGTCCCCCCCGCAACCCGACGC
AACCCGCTTCGGAATTTTGGACCCCTTAGACGGTTTTCCGGATAGATTGG
AGGGCCGATTTGGTGGAATCCTGCAGATTGACCTTATCCACGCGCCTTGT
TTCTAGTGTGCTTATTTCGGATCTCAGGCTTCCGGTAGCTTTGGGATTGC
AGTATATCGATTTCGTTTTTGTCTCTCTAGAAATTTTGACGTTTCTGTGG
TTTCTCTCCGTGCTGGAACCCAAGGATGACGATGAGCGACGACGGAGACC
GCACCTGCCCGCTCTGTGCCGAGGAGATGGACATCACTGACCAGCAACTC
AAGCCCTGCAAATGTGGCTACGAGGTACCGTCCCCTGTACCGGGCTGCTC
CTGCCTGTGCAACAACCAGCACCCTGTTTTTTTCACTGTTTTGTTTGTGT
ATGCGACTCTGCAGATTTGTGTCTGGTGCTGGCACCACATCATTGATATG
GCTGAGAAGGAGGACACAGAGGGGCGTTGCCCTGCTTGCCGCACTCGCTA
TGACAAGGACAGGATTGTCAAGATGGCAGCAGCCACTTGTGACAGGTGTG
TCTATCCTAAACTTTCCCCTGAATGCGGTCGCTCTTAATAGTCGATTGGA
AACTGCCCTTTTAGATTAGTGAATATTAGTAAAATCTTTGCTCTGCGTAT
TGCGACCAATGACTTGCAACTTATGTACATCTGGATGGATACAGGACGGT
GGCAGATAAAAATACAGACAAGAAGCAGAAGACCCAAAAGGTTAAATCAA
AGGCACTGACTGTGGAAGCTAAGAAACATCTGGCCAGCGTCAGAGTTATA
CAGAGAAACCTGGTGTATATAATTGGGCTGCCTGCAAACTTATGCAGTGA
GAGTGTGAGAACAATATTCTTTACATCTGGATCCTATTTTCTTATGGAAC
ATCTAATTGTTATATGCTGAGTGATGCTGTAAATTTTAGCCCTCATGTAA
ACATTATTATTGTCCTCTGTTTTAGGTACTCGAGCGCAGGGAATACTTTG
GTCAGTATGGAAAGGTTTTGAAGGTTTCAGTTTCTCGTCCGACTGGGACT
CCTTCCCAGCAGACAGCAACAAACAACGGTATCAGCATGTATGTCTACAA
AATAATAATGATCTTCTCATATCCCTAACATTGCCTGATCCTATAATCAC
ATTGATATATTAAGTGACTACCCTCTTTCCCCCATTACTATGGTGCTTCT
AGTAGCATTTAATACGTTCCTAAGCTAGAAAATTCCTAATATATGACTCA
GAAAGTAAAATGAGAGTTTGGTTGTGTTTAATTAGGCAACTTTCCATAAA
AGTTGGTGAAAATAATGGTCAATTCTAACATATGTCCTTGATACAGCCTG
CCAATTTCAGACTAATCTATCCTAAATTTTGGCCAAGGGCCACAAGAAAT
TCATAGCATGTGTAAAGTACCTTTGATAACTTATAGCCAACATGAAGCTT
TCCTGCGTCCTAGAATCCAGGGATTTTAGATAAATTTATAAGTGTTCAGT
CATGGTATGGGTTCACTTGACCAGAATATTTTTATGGAACTTTTCCCTGT
TCTATCCGAGTTAAGCTCAGAAGACCTGTGTATACTGATGTCAGTTGTTC
CTTAGAAATCCTTTACAAACTACCACTTCTGTAGATTAGACCGTAGTTCT
CCACTGAGTACAAAGTGCCACTTGTTTATTCAGTACTCCATATTTCTCTC
GAGAATCATATAGCACTGTCTGGATGTACCTAACCCTAGGGTCCTTATGA
TTTCAGAAATATGGAAAACATAAATTATGGAATAACTTTACTCTCGAATG
AAATGAAGTACATCTCTACTCAGCTTATATCTAGTAACTCTTGGACGCAA
AAGAAATCTTAAAGGAAATATCTACTTTCCTGAAAATAAAAGGAGATCCT
CAAGTAGAATCTTTGGACTATATCCATCGTGTGTACTCAGCAATTTAGTA
GCTGATAGTTAATGGATAACCAGTATGGACTTGCGGTTTTTGTTCTCTTC
ACTGAAAACTGACTCTTAAACACTGGCTTATTAGTTATTACTGGGATATG
TGTTCAGATATATTACTTACGCCAAAGAAGATGAGGCCATCAGGTGTATT
CAGGCTGTACACAATTTTGTCTTGGAAGGGAAAGTGCTAAGGTTGGCCTT
TGTATATTGTTTCTTCACTAGTAGCAGTTTTGCTGTTTTGCACAATATTG
TTATTCTAATGTTTTTTATTATCGCAGAGCATGCTTTGGTACTACAAAAT
ATTGCCATGCATGGCTACGGAACATGGTACAATTGATCCTTCATCCTGAC
AGCTTAATTTACTAGTACTACCTAGTGCTATCTTTCTCAGTGCTTCTTGA
TTTTTCTCTCAGACATGTGGGAATCCAGACTGCCTCTATTTGCATGATGT
AGGCAGTCAGGAGGATAGTTTCACTAAAGATGAGATAATCTCAGCATATA
CCAGGTAAGACCTAACTTCTTTTAACTAATATAATGTGGAGCCACAGTTA
TTGCTCCGCTTCCTTCATCTATTTTGTAAAATCCTGGCTGTATAGTTTTT
CTATTCTTTTCCTATAATTTTGTACTCTTGCTATATATACCTCTTTCATT
ATTTTATTAGAAGAAGCCCCCAGTCTATTGTTCCACTTCTCTCTACACTA
GTAGCCTACTAGGATTGTTGCCTTTTAGGGAATTGGATCTTGGAAATGGT
CTCCCTGTCATATTGTGCATGTCTAATACCATTCGACTGTTCTGGTGAGC
TATTTTCGCTGTGAGGTATGAATTGCTAGAGCATGTACGTAGTAGTAGTT
TGGTTTGGTGAGCCCTTGTCTCTGAGAAATAAATAGCCAAACTCCTCCTA
ATAGTTTCAGTTGACATTTCAACTCATCCTCTGATGCTTCTGTCAGGAGT
AGGGTTCCTCAAATGGCGTCTACTGTTTCTCAAAGACGTGCAGGAACTGT
ATTGCCTCCTCCAGCAGATGATTTCTCATACAGTGCGGTGGTTTCAGCCA
AACATACAATCAAGAATGCAATAACTGTATGTTTTTTAATGCTGGATTCA
TATGATGATATTCTCATTTTTTCTTAATTTCGTTCTGATTTGCTGTCTAA
TTTGTTGACAACTATGTCTTTGTTGTTTTACATGATGTTTCACTAATGTC
CTGTGCAGAATACCACAAGCCAGTCAAGACTGTCACCTCCAAACAGTAGT
TCAGGGAGGTCCACACTGCCACCAGCTACTTCATGGTATGGTTCTCCCCT
TGGAGTATTATGTTTCATTTTAAAATGCAACATGCTGCTAATTTTTTTGT
ATGCACAGGGGGCATCGTGATCTGAACACAAGGGCATCAGCAACTGAGGT
GGCATCCTCACAATCACTTGTAAAATCAAAATCAGAGGCACAGAGTAGTT
CATTTTCGAGTTCCTCTATGATTTCAAGTGCAAGACTACCTTCTTCATGG
AATGATGATACAAGCACAGTACCAAAAATGACTGAAGGACGACAAGTATC
AGAGCGAGATAGTCTGTCTAAAACCTTGAAGCCATATAGACCTGGTATTG
CAAAGGAAACCCAAGCTGTAACATCACTTGAGTCGTCATTGGACATAGAC
TTTTCTACAATACCTTCAGCTTGGAATGACGATGAAGTTGTAGCATCAGA
CGAGGCATCAAAAGGAAGTGAGGAAACACAAGTTGTAAATGGACAGCTTG
TTCCTTCAGCGTCTTCAAAGGCAACAGAGCCAGGCCAGCTTGGGTCTAAG
CCATCATCATCAACAATGAATAATGGTGCAGCGTTAAACAGTTCCAAGCA
AAGTCTTGTAGATTGTGTGTCACGTTCAACAATATCTAGTTCAGATGTAA
AGGGTGGTAATGGTGATGACCAGTTTACCAACATGGATCCTAAAAGCCCT
ACTTTGAGAGCTATGAACAGCCAATCAAATCACACTGCTAGCGAGAGTAG
ACCGGGCGACACAGAAGTTGATAAGTTATCTGTTGGAGTATCTTCACTAA
CTTTAGATAGCAAAGAAGAAAACCAACAGCCGGGTGCAGTTAAAGAACAA
TCTCATTTGAAGCTCTCTAGGCTTTTGTCATCAGAAAATAAAGACTCTGT
ATTTTCTTCTCAATCTAGTTCTGCTAAGCATCTTGACTGGAGTTCAGATC
TGCAAAGTTCTCATGTGACTTCTCCTTTAAATGACATATGGAATTCTTCT
GTGGCCACTGATAAATCCCATGTCAGGATGCTGGATACTATAGATCAAAC
ATCATCATCTTATGTCCATACTGCTAATACATCACATATTTCTCCGTGGA
ATGATAGAGAAATTAACCGTACTTCCACAAGTGATAATAGATCTTCTGTT
ACCATGATGCACGCTGGGCTGTTATCTTCAACGGACAATAATTCTGCCTT
GTTGAATGGACATCAAGAGGGGCTAGGACCTATGTATACACCTGGTATGG
TTTCTGAACATTCGGGCATGAGAAGTCACCAGCATGGACCAGTGGATGCA
GCAAGAAATGATAACGTAGGAGGTTTTGGCAAAGGTATAGGTCGAAATAA
GGACGAGGGCAGCATAATATCTGATATATTGTCTTTGGAGTTTGATCCAT
GGGATGAATCATATTCAACTGCTAACAATTTTGTTAAGATGCTTCACAAA
TCTGAAAAGAATGATGATGCACTTTTCAACGCGCCTTCATGGAAATCAAA
AGGCAGCAGTAATGAGTCTAGATTTTCATTTGCTAGACAGGATAATCAAC
GGAACTTCCAGGATTCATCTTTCAGAAATTCGGGTAGTGATCAGAATTTC
AGCTTGCTATCCCAGAATTCTCACGGCAACATTTATCAGAATGGTGCCGT
GTTCCAGTCTTCTGAGGAAGAGTTTTCAAAGAGCAATTCTCTTGCTATGT
CGGATATGGCAACTGCTGGTGAGTATGATACTTGCGTGTTCTGTATTTCA
CCGAACAAAAACATGTTTTATTAGTACTGTAATTGGAAGATTTGCCTAAT
TAATTTGTGTTTTCTCTCTTTCATCTTGGTTTTCATCTGTCTGCCAAAAT
AACACAAAACCAACTTACCTGCTGAAATAATAATACAAAACAAAATAATG
TTACTTTGCATACTAAAGCAATATAATATGCTTGTGCACCTTTAATCTAT
TTCTTGTTGAGCATTGATAAATGTTGTAACTCGTGCGAATGCGTTGTTTT
GATAGCTTAGATCGTATTTCTTTATTTTTATGTGAAATGGCTTGGTAACT
GATGTTCTCATTGTCAGGCTCTTCAAGGTCTAAAATATCTGCACCTCCTG
GATTTTCGGCACCAGCGAGAGTTCCCCCTCCTGGTTTTTCATCTCTGGAT
GGGTTGAATCCCCCACCTGGATTTTCTTCAGGATTCTCATCTCAGGATAT
GTTGAATCCTCCTCATGGATTTCCTTCTGGATTCTCATCGCAGGGTGGAT
CGAATCCCCCTCATGGATTTTCATCTCAGGCTGGATCTAATCCGCCTCAT
GGATTTTCATCTCAGGCTGGGTCTAATCCACCTCGTGGGTTTAATTCTGG
ATTTTCTTCGCAGGACGGATCTAATATCCCTCCTGGCTTTTCTGCGGGAT
TTTCATCCCAGAATGGGTCTAACCAGGTCTATGGCTCAACATACTCAGGT
CTGCTGACTTCCTATCCTTTTTCCTTCTCCAAAGCCAATTTCAGTTTCTA
ACACATTTGTTATTCTTGGCAGAAACTCGTCTACTTGATAATCTTTTTGG
TAGCCACACCAATCAGTATCAACCACAGATGTCTAGACACACAAATGACA
TTGAATTTATTGATCCTGCTATATTAGCTGTGGGCAAAGGGCGGATGCCA
GGAGTTAGTGATTCAGGGTTGGATCTGAAAAATGCTCCTTTTTCAACACA
GTTGCAAACATCAAATAATGATCCAAGGCTTCAGTTACTTATGCAACAGA
GTATGCCCTCTCATCAAAATCTCAGATATCCAGACCATGGTCAGGATGCA
TTCAACTCTATGAATGATAATTATCTGGCATCCCGACTTCTACCACAGAA
CAATGGTTCTTTATCCCCTTATGCCCAGATGTCACTCCAACAACCCAGAA
ACTCACAGCTTGCAAATGGGCACTGGGATGGCTGGAGTGATTTGAGACAG
GGGAATAATGTTCCCATGTCGGACATGTCGAGGATGTTATATCCAACTGA
AGCTAACAACTTTCACATGATGGGTTCAAATGATATGTATAACAGAACCT
TTGGACTTTAATTGTATAACAGAACCTTTGGACTTTAATTGTCTTGGAAG
ATGCATATTTGACCTGTCCGCCTCTAACCTGTGGCGTGTCTTGTTCTGAA
AGTAACTGGTTGCACAGTGCTGTCTAATGAGTGGGCTTATGAGCTGGGAC
GTGAGCATTCTATTGGAAGGGTAGTTGATGCAAAATTGCAAATGGACCAA
CATGAACCTGAGTTTTACCAGCCCTTCCAAGCACCAGGTATGTTCTTCAC
CATTTTATCCATTTCTTGGGACATTAGTTAGTTTTTGTTAGGACTTGGTA
ATGACCTCCTCTTCAATTGTAATTATGCTTTGTAGTGTTCTGGAGGTTGC
TGGATGTGCACACTAACCGACTGTTATTGTTACCTTGATTGTCATCAGGT
TCCTGTTAAGCGAAGTCATACATGAACAGGCGGCCATTGAAGTATATGGA
TCCATGTTGTTCGGGTGCGAGCAAAGCCAGCCTGAGAAGTGATGAACTGT
TTGACAATTTGTTCTATATTTCACCATCGTAGCTGTGTAAATGTTTTCTT
GCCTTGGGAAAATGGAAGTCCTTTGTACATGATATGTAACTTGCCGCTGG
TAGCTCTTGTGGTGCATAGAATCTCATGTTTTGGTGTGTGGTTTGCTGAG
CCAAAAACTGAAAGCAAATGACTATCATCTATAGCTCAATTGACATTTGT
TTGGCGTCAAATTGAAGGAAAGTTTTGAGTACGCATATAATCTTGTTATT
ATCTGTTGTGTGCAGTTCTCAAATTTGTTTCAAGCAAGATTCTGTATGCA
ATTGTGTAGAAAGATCATTATGGAACATTCCATTGATGGATGGTTGTAGG
ATTTTGAATGCAAATTTTACCCTGTCAATCTCCTCAACCGTCCTATCCAC
AAGCAAACATGCACCACCTTAACAATTCTAAACCAATCTGAACAATAGTT
CCAGGTCGCCATTCTTTAGACATACAATTTCAAACTTGTGTTGCATAGTT
GAAGCTAATGTCATTCACAGCTTCAAATCATTTCTAGAGAACGGAAAACC
TGACTACAAACCTAATGTCATGAGCCTTTGATGAAGGCTACCCTAAGATG
AAAGGCATCTTGTCTTGCCAAATCCTGATTCTATCTGAGGCCTGGCCGCA
TGAGCATTTCATCAAATGACGCATTCTGCTCCAAATCCACGCTGTTATCT
GTGTTAATGGAGACAGAACCCATGGACCTCTTGGACATGAGCTGCTGAGC
CTGGGGTGCCTCCCGCTGCATCTCAATGGCGATGGCGTCCTGGATCTCTT
TCAGCACCTCCGAGATGGTTGGCCTCTGTGCGCCCTTTGGCTTCACACAC
ATGATACCCGCCTCCGCGATCTTCCACACCGACTGCAGGTCGTAGCCAGG
GTCTAGTGATTCATCAATGATGGCATCGATGTTGCCACTCTCAATGTGTG
ACCTTGCCTGCCCAATTCGAGTTCATTCAATCAGCAGTATTGCTTATCAG
TATGAGCACAAACAAAATGCACAGAAAGGCAGTGGATCACGTGATACTTA
CCCATGCCACAATGTTACGGCAATTGAGACCAAAGTTGTCACTAGAGATT
GGCTCGTGGCCCGAGATTAGCTCAAGCAGAATCACACCAAAACTGTAGAT
ATCACTCTTCTCGGTAAGCTGCTGAGAGATGTAGTACCTATTCATCAACA
GAAAAAAAAAGGAGAGTATGTGTCAAATGCTACAAAGATATCAAATACTT
CAACAGTTCAATTTGCTGAACCATGGCACAGGGAGCAAATATAATAATCT
CAGGAAATTAGTCTTACTCTGGATCCAGATATCCAACTGTCCCACGAACT
ATACTTGATACATGAGACCCATCGACTGCAGGTTTTGATAAGCCAAAGTC
CGCAACTTTTGCCCTATTATTCTTGTCAAGTAAAATGTTGCTACTCTTCA
GGTCTCTGTGAATGATGGTTGGAGAGCATCCCGTATGGAGATACTCTATA
CCTGATATTTGCAATCACATAAAATGAGTGGACTCAGAATCTTCAGACTG
CATGCTAGTAGAAGAATCTGAGGAAAATTGAGAGGGACCTTTTGCAGCAT
CTTCTGCTATCTCAAGACGCTTGACCCAGCTAGTTATTTTTACATCATTC
GGTCCTCCTGCAAACATCGGAGGTTTTATATTTTATACGCAATTTATTCT
AAGGAGTGAGATGCACATCAATCTAACAGTTCATGTCTATCATGGAGCCT
AACATTGAATAATATACCTCAAAATAGAGATAATTGACAAAAAAATCAAT
TTATGTGTAGTACTGGAGTTTCTTAATGGTACATGCAATAGCTGATCCAA
GTGCAAGTTTCAGGTCAACTAACCAGACTTACCAAGCTCCCATGCAGACA
CTTACAAAGAACAGTTCGTGGACCGCACATGCAGCGCAAGTTGCTGGCAG
TGCAGCTTCGTGGATTAGCTAGTGTGTTGCTTGTAAAGAACCATTATCTA
CCTACACAACATTGTGTTGTTGATTCTACAACCAAAATTTACATCAGCTA
AGAGGACTTACCACGAAGGTGCTCTTTTAATGTGCCATTATGCATGAACT
CATACACAAGTATGTTTTTCCCGTCTTGCTGACTGTAACCGAAGAAGGTC
ACCAAGTTCCTGTGATGTATTCTGGAGAGCAACGCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.