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GrainGenes Sequence Report: AA038218

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Sequence
AA038218
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038218
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCGCACCCGACCCGCTTGGGCGCCTGCCTTCGTCTCCACCAAACTCAACT
CCCCCACCACTCCCCCTCCTCTCCGCATCTCGCGACTCCCCCCGGCTCGT
CCCTGTCTCCGGCGACCACTCCGGCGGCGGAGCGCTCGCCGCATGGAGCA
GTAGTACCAGCGCAGAACCTATCTCCTCTCCGCTGCGTCCGCCGCGGCCA
TGGCGAACTACCTGGCGCAGTTCCAGACCATCAAGTCCTCGTGCGACCGC
GTCGTCATCGCCGGTATGCCACCTCCTCTCTAAACCCTACTCCTAACCCC
TCGGATCTCTTCCGTACGACGAACCGTTCTCTGTGCGCGCGCTGCCGTGA
CTCGCAGTACAGCGCGATCTGCGCACTGCGACCTGCGTGATCTCGGGGCT
ACAAGCTCGGGCTGCGCCCGATCGGGCAGCCATTGGAGATGAAATGGGGA
TATTTATCGAGACTAGAGATGAAATGGTGGTCTCGGGCTTGCTCTGGGCA
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AACCAGCTTCATATGGAAATGATCTCAAATTGCACGCACCTGTGTAATGT
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GAGTTCAAGTTCGTGTATTTGTTGTGAAAATTCTTTCTCATACAGCAAAT
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GGCGAGGAACCCTGTTTTAGTGGAAAACCTACCAGCTGAATTTATACAGA
CTACCGATTCAAGGCTGAGAAGTCGATATCCACAAGAACAATACTTGTTT
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TTTGAATAAGTTGCTTCTCATATGTATAAAAATGTGCAGGATCTTGATGA
GTTCAAGACCATTCTTAAACCTCGCCTCAAATTAATTGTGCAAAATGATG
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CAAGCAACTAAGATGGCAAAGAAAGTATATGCTAGGCTTGAGGCTGATTT
CAACACTAAAAAGAGAGAAAGGTAACAATCACATCTGTGTGATGAGTATT
TATATGTATCTGCAGTAGAGTTGGTAACAATCACACCTGTGTGCTGAGTA
TTTATATGTATCTGCTGTTTGAATGCAACATGCTGCCATCGGTTGTCATC
TTGCGCTGATTCTGTTTTTTATATTTTTGCGAGGATGCTTCCACTTTTGA
ATTCTCAATAAACCCTTTTGGGTTTTTTGGTTTATTGTTACTACAAACAA
TACTGATTTATATGCAAATATTAAAATGTTTATTTATGATATAGATGCTG
CAAATTTGATTTCCATGGACCTGATGCTGAGTTCTGGGATGATTTCGACT
CAAAAATGGTGGATTGCATAAGAAACACCTTGGATAGAAGGGTTCAATTT
TACGAGGAGGAAAACCGTAGGTTAAGTGAGCAACGGTTCACTCCAGTATG
GAACTTCTGCAACTTCTTTATTCTGAAGGTATCATGATGCAACCATTTAT
ACTGCATGCCAATCGTCATTACTTATTTCATTTCCGTGGCACTGTTTTTT
TACCTTAACGTTTCTCGGACATTTTTCACCTTTATCTTTGTTTGGATTTC
TCAATCTTACACCTTTTATTTCTTCAGGAAAGTTTGGCCTTTATGTTTGA
GGTGACTAATCTTCATGAAGATTCACTCCGTGAATATGATGAGCTTGAAC
TATGCTACTCCGAATCAGGTTTTTCTCAAACTTTGATCTGGCACCTATGC
TGCATTGATTTTTCAGCTTTGCCTCTAACTGAATTTGCATAATCAGAAGA
TTTTATTTTCCAGTCGATCAGGATTTCATTGTAAGGTGACTTCAAGAGTG
ATGGGTTTTTCAAGAACTCACAGTAGTTCAATAAGGTCTTTGTGATCTCT
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CAGTAGATAGCATTGCTTGAAAGGGGGAAGAGAGATACAGGGGTACGGAA
GAGAGTTTGGGGAAGATGTATTTTCTTATTTGCTTGAGAAATGAAATGTA
CAATGCTGACTGGCCATAGCATTGCAAAAAATCTAGAACTCAGCAGACAT
CCAGACAAGAAATGTAAGGGCAGAGTGCAGTGGAAGAGATTAGGAGCGAA
TACAGTTTAGAAGAGTTCAAGAAGTCCTTCTCCAACAAAAAATGTATCTT
CCATTATGATTTTGCGTTGTAGTAGTCTGCCGTGCTAGAGCCTCGCCTGC
AGCGCGGTAGCGCTAATCCTTGACACGTTTGAATCTGGCTGTGTCCGGCC
AGCTGGTTCTTCTATGCCACTGATTCCTTGACCTTGTCGTTTTCCCTGAT
ATGAACCTACAACAGTCTATGTTTGTATAGGCTAACATTAACTTCTGTTT
TCGGAACTACAGCGCAAATTCCTCATTTGGGCCATAAACTAGAAGTAACT
TTACTTAAGGAGGTTTCTAACTTTGTATTGATATAGAGGCATTGAGTGGA
TTAGTTAGATACAACAAACACCAAGTATGATCATAAATCATTAATATTAC
TTTTAACCATAAATTTATAGGTTTATTTTTGTGCTAGCTTGCTTGTTCTT
TCTGGAGGTGAGTTACTGGTTAGTATCCAACTATTTGGCATGTTTCTTGT
TTCAATACTATAATGGCAATGTCATCAACTACAGTTATTTCTTGTCTTCT
ATGTTAAGAAAATAAAACTGTTATTTCCCGCCATTTTTCGAGAAAACGCA
ATAGACTATTGTGTTTCATTTCATTGTAAGGCAGAGTTTAGATACACAGC
CCTCCTAGGAGGCAGAACAAGACTATATGCTGCCGTAAAGCTTATGCCGT
GCACTTGATACGTGTTTGGAATGATACATTTCATTTATATGTATTTTATA
AGAAATTTTGCTCATTGGTATCCATATCATTTTGTTCACATGAATGCAGT
AAATCTCCCAGGGAAACCTCGAGAATTTGGAGGACTGGATACTGGCGATG
ATCAGGCCGCGCTGCTAAATCCAGGATTCAAAGCACTGACCCAAATTGTT
CAGGATGACGTGTTCAGGGAATTTGAGTTTAGGCAATACATATTTGCTTG
CCAGGCTAAGGTATTTGCAATTGTGCATAATGGATTCTTCGGTTGCTGAA
ATGATTTATGTAATGTTGTACTATTGCTAAGTGTTTTTGTAAGTATGGAA
ACACCTCCATTTATTGCTTTCTTTTGTAGCGCAGAATTATATAACGTGTA
CAATTAGGAGAAAAGTATGAAAGAACATAATTTATTTGTAATTTAGTATG
GGCATGAAAGTAACACTTATTTAATTAGTTAATTAGGAAATGACTATGCT
CTTGTTATGCTTGAATGGATCGTGTTATATAAAACTACACTCCTTGTGTA
TTTATTTTTATAAATTTATTTTATCCATTTTTTACTAATGAGTTTGGGGC
AACTGCCAATTATTATTTCCCTTATCATTCATTTCATTTCACCATTTTCA
GTTATTATTTAAACTGTCTCGCCCAGTTGAGGTTGCTGCAAGAGGACATG
CTTTTGTTGTCAGCTTTTCCAAGACGCTAGCCTGGCATGAAGTATGTAAC
CGTGATTTCACTATTTTCTTCCTCTGCAAGAGGACATGCTTTTGTATAAA
TTATTTTATCATTTTTTAGGAAGACTACCTTTGCAAAGTACCACTTGTTT
ATTTACCCTGAATGTTCTTATTCTTTTCTCTTCAGAATGCTCTGCCATTT
TGTTTCCGTGAAGTATGGGTGATAACTGCATGTTTGGGTTTAATAAAGTC
TACGAGTGCACAGTATGATGGTGGAGTCGTTGCTATTGACTCAGAGAAGG
AGTTCTATCGTCTTCAGGGTGACCTTTATTCTCTCTGCCGTGTTAAGGCA
AGCTTTAATACTCCTGGTATTCCATTATTGATTTGTCTGCAATTATTTGT
CTTTGTTTTCTGAGTTTACCATTTTTCCTTTCTGCAATTAAGAAAATTAA
AACATAAACTTGTATTATCAGGTTACTTGTTTTGGGGCTCTAGAGACTGT
TCTCTTGTCATATGCAACATATTATAGGACCAATTCAGTACTGTTCACAC
ACGTGGTACTTGTAGCAGTGGCGGAGCTAGTCCGTGAGTACAGCGTAGGA
AAAATAAGAAGGCATGTGACCAACAGCCATTTTTCCATGAAGAATGCTAC
TTAATTCCACATCTACTCATCCGATTTGAGTGGATGGTCCTGGGCAGAAC
CCAGGCAACTGCCCAGTCTAGCCGGGTGGTAGCTTTGGCACTAACTTGTA
GCATGAAGCACACATGCAGTTACTGTTCTTATGACATCCAAGGATTGGTT
GGATTTACCTTAAGGGTTATGATTACAGTGAGTTAGGATATTCTGCTACT
TAATATTAGACATAGATTTCTTAAGAGTCAAGCCATCTCATCTATACAAG
GATGGCGTAATTAATATAACAATATAATCCTAGTTTTCTTCTCTCCCCCT
CCTATGATGTGGTTACCAGGGACCCATAACACCGTCAGGGTCAATGACTG
AGGGCGTGTTTGTTTGGGCTGTGCTGCTGTGCAGGAAAAGCTGCTTCTAT
GAGTTTGACTGCTTTGCAATTTGGCTAGCTGTCTAGCTGTATGCTAAAAA
TATATCTGAAATACCCTTAGAGTTTTGAGAACACGTATAATTGTTGATTG
GACTGGAATTTGCGGCTATAAACTGGGGACTTCTTACTAGTAAAATACAT
GCTCCTTTTCAATAAACACATGATCCGAGCCAGGAAAATTCAGAATTGTC
ATGTGAACTTTTTTCTTGACACATCTTCCTATATGCTTCTCCATGGTCTA
AAAATAAAAGCAACTCTCGTGACTCGTTGAATAATTGATTTCTCATGGTG
AGCACTACAGGGCACACTACTGCCATACATTCGATCTTGTTCCTCAACAA
CTGCAGGGCTACGGTCAGAGGGGGAGCCGAGCGTGGACAGGGTGGTATTT
CTTCTTGCTAGTAGACAAATCGGTTCGGTCCAGGGAGAGGAGGGACGGTC
TGTGGTGGCATTCTCTCGTAATTTCTTGAAACGAAATGGGTAATGACATA
TTCCGTCAAAAGCTGTGGGAAGCCATGGGAAGTACCCCCGCAGGTGCTTT
CCTGAGTTTGCCTATGCGCCCGGGTGCTTCGTTGAAGCCCACAGCGCAGC
TGTCCCGTTTGGTTTGTTTTCTTGGCTTATTCCACTGGAAAGCTACCAAA
AGCCCAAACAAACACCCCCTGACTATTAAGGACCTTGACTATTGAGTACT
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TCTCCAGGAATTTTGTGCAAAATTTTAAAAGATGTATTGCCTTCTTGGTA
CATACGGCACCATGCTGTGGTTTGTTTTAGACTATTAATAATTTTAGGAG
ATTCCTAGAACTGTCTAGTTATTTTCTCACAATTGCTACAAGCCAACTTG
AATCACCAGATCCTGTATGCAGTCAACGTGAACCATTTTCATTCCTTTAA
TTGGTGGTCATATTGTGGTTTATTGAACTGTTGGGACTTCGGACATATGA
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ATTAAACCATATATATGTGGTCATCATTATCTATTTAATGATGGGCAACC
CTATTCCTAATGTTCCATAGATGATTTGAAGTTCAAATAGGTACTAGAGA
ATGCAATTGTTGTTTCGTGTTTTGGTGGTTTATTAACTTCTTGCTGCAAT
CCTGTCCAACTGTGCCATCAACTTTTGGATTACATTTGCCTAATTTGTTC
AAAACCTGCAAAACTCTGTGCTTATATATTATTATTGATGGATATGGCAG
TTTATGAGGCTTGCTTACTTAATTGGTTACGGGGTTGAGATAGAAAAGAG
TCCAGTCAACAGGTATAAGATCAATGCCACTATTTATCTTTTGAAATCAC
CTTCCAATACACGTTTTGCTGACATGTTCAATGTATCTGCAGTGCATCTT
TAAGCATGCTATCTTGGCCAAAACCAGCTACATGGCCTTCAATTCCACCT
GATTCATCGGCAGAGATAATGGCAAAGGAGAAGGCAAGCATTTTCAGCTT
TGTGGCATGCCTTCCTATTATGTTCATCTGCATTTTTTGGTTCTTGTGCA
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CTGACATCAACATGTTTGAAATCAGTCACTAAATCGAACTGCCCCTTCTT
CCAATTCAGTATGCTCAAAAGGAAAATCTTGGCATGAAATGAAGCATGAG
ATATGGAAAAGGGACAATGCTATTCCATGTTAGGGAACAGTACCATTTTC
AGTTTTTTATTTGAAGGAATATCTGTGAACATGTAACATACGCGGAAACT
TTCAGGTTCATCACAAGTATAAATTATGCATATGGTGGTGGGGTAGAATG
AAAGAAAAAACTTGATACGCCAAATTTAGGAGATGAAAAAGGGGAATTGC
TGTATGGGCTTTCCCTCTGTCTTGGACAAAGGGAAATGCTTGCACTGTTT
AGCTGCCTATTGCATATTTAATGCAAGGTGTGGCTTGATGTTGTGAAATG
TTTCCCTTATACAGACAATTCTTCAAGGAAAACCAAGAGAAAAGCTCTTT
GACATTCAGAGGAAACCATTGCCATTAGAACCTTCTTTTCTTCTACGGGA
GGCTAATAGGCGTAGAGCTTTTCTTTCAGTTGGAAATATCTCTGAATTAT
ACGAATCAGTTGATGGGTAAGGTGTTTGTTTCCCATTTAATGATGTAGTT
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TGTGTATATTTTTGTTCGGGCAGTTCAGGTTTAGATGCACATTCAAAACT
TTCTCCCAACAAATCTGCTTCTAACTTGATGACAAGAACTATGTCTGGGC
CAGCAACGTCTGAGACTTCTCTACCAGTTGATAGACCCATGAGGTTGTCA
GAAATTCATGTTGCAGCTGAGCATGCATTGAAGCAGACGGTATCTGATCC
TAATTTTATGACATCACTCTCATCACCGGAAGAATTTGAGGTAATATATT
TATTCCACATCATGATTGATTATTTCTTACTGTCCCGTTACAAATTCAAG
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ATTTTTCCTCAGTTTTTTTTTTAATTAGTTCGCCAAAGTAATTTACTCTA
GAGACACCAATTCAATACCATGTTATTTACAGAATTGGCCTAAGCAATAG
ATAAAATAAAACAAGAGTAATTTTTTTTGTGTTACCAGAATAGATATATG
GAGCTTACTAAAGGTGCAGCTGACAATTATCACCGCTCTTGGTGGAAAAG
GCATGGAGTTGTGCTTGATGGAGAGATTGCAGCTATATTTTTTAAGCATG
GAAATTACGATTTGGCTGCAAAATCCTATGAGAAAGTTTGTGCTCTCTAT
TCTGCAGAAGGCTGGGAAGAGCTATTGGCAGATGTTCTTCCTGATCTCGC
AGAATGCCAGAAGGTTCTTAATGACGAAGCTGGTTATCTGGCTTCTTGTG
TAAAGTTACTTTCTCTAGATAGTAGCTTGTTTTCGTCTAAAGAGCGGCAA
GCTTTCCAGTCAGAGGTTGTCCGGCTTGCTCAAAGTGAAATGAAGCATCC
CGTGCCCCTTGATGTTTCATCCCTAATTACATTCGCTGGAAATCCTGCTC
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TGGAGTGGCTTCCCACATGACATCACACTTGAGTCTCTAAGTTTAAGATT
ATCAGCTTCCTCTAGTGTGGATGAAGGCCTTGAGGTACAGTTAGTTTGAT
GTTACGTTTTTTAACTGAATTTGCTTTTACATTACAGATTGCTTTCTTTC
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ATTCAGTATCACCATTGTAAGACAACCACCAAAAACAGCTTGGATAATTG
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GCAATAAAGAGTACAGACGCACGTGTTCTTGTGCCAGGAAGAAATGTTAT
CACCTTCGACGTTCCTCCTCAAAAACCTGGTTCCTACGTGTTGGGTGCTC
TTACTGGACAGATTGGCAAGCTATCATTCAGATCGCATGGATTTTCTCAA
GACGGTCCAGTGGACACTGATGAATTCATGAGCTTTGAGAAGCCAACAAG
ACCTGTTTTGAAGGTAATGCATTAAAATAACTGGAGCATCATGACAAGTT
AGCAGCTCTGGTGAACCATGCCAACTAACCATCAGAGAGCTACCAATATT
TTCAGACCTAATAACAGCATATAGCTTGCTTCTACTCAGTGACTTACTGT
AAGCTTTATTGGCCTGTCTCACTTTTTTGTGTGCGTTCGTTGTAGGTGAG
AAAACCAAGGGCTTTGGTTGATATTACTCCTGCTGTATCCTCTGCATTAC
TTATGAATGAACTCCAGTGGATCGGGTTGATTGTCAAGCCTATAGACTAT
TCTTTGAGAGGTGGAATATTGCATATAGATGCTGGTGCTGAACTGAAAAT
CGAGGAGTCACGGATGATTGAGATAGAAAGCTACAGAAGTGAAGGAGAGC
ATTATTGTTCTACTGATGCTTCCAAGGCACTATCAAGCTCCACTGATACT
GGAAGGGTTGAGAAGGTTCCTATTGAAAATGGGAAGATAAAACTGCCAGA
TTGGGCCAGTGACATGACTACTCTTGTTTGGTTTCCTGTCCGTGCTATCG
ACGATACAATTGCAAAGGGAACATCCCCAGGTTCGTATGAAATAGGTCAT
ACGTTGGGTATGGTAGTGTGTTTCAGCCAGTTGACGTTTTTATTATTTCT
TTATTTGTTCAGCGTCCCCTCAGAAACATAGCATAGTAGATGGAATGAGA
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AAGGTATTACACTCAAGTATTTGTGCTCTCACCTTGTTATGTTGATATGC
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TTCACTAATCCATTCCATGTGAGCACACGCGTGGTTGACAAGTGCAATGA
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TGATACCTTGTCATAAAATGGCGCATAAAACATCTTGTATTGGACGTCAT
CAACACTTCTGGCAATATTAATAAAAATCTGTGCAAATGTATGTATTTAT
TGGTAATAAAATCTCTTGGATTCTTAAATGCCAATCTATGTTTTGTTTCA
CGTCCAGGTGATCTTACATTCTGAAGTAAAGGCTACTCTGCATGTAAAGG
ATGTATCATTAGACCTACAAGCTGGATTTGAGCACTTAGGCAAGGATGGA
CGGCCGACTTCAAGTTTGTTCCCTCTGGTTATTGCTCCTTCTTCCAGAGC
TGGAATCTTATTTGTAATACGTTTAAGTGGCACAAAAGGTATGTCTTTTC
TAGAAGTCCGCTTTTCATCTTTAGCTGACCTTTGCAATGCATGATTGCTC
TCATCCATTACTCTTTACTACAACTATAACCAAAGTTATTGTCTATCGTA
TTTTTGTATTAGACCAGAAAAACATGAAATTACACTAGGGTTGAATAAAG
GAGCATTAGTGGCCACAATGACCATCTAAAAGAGTACAGTGTAGACTCAG
TTTCCATACAAGCTATAATTCTTTAACATGAATCATCCATTTTACTTTCA
CATTTTCAGACCTAGATGAGCTGGAAAAGGCAGACAGCATGTTGAATATT
AAGTACGGGATATCCGGTGACAGGACTACTGGAGCACACTCTCCAGTTCC
TGTTAAACCTGATAATTCTGAAGAGCTTCTTCTATTCAAGATTTCACTCA
AACTGAAGCGCCCTGTTCTGGATCCATGCCTGGCAGTTGGATTCCTTCCA
TTCTCTACCGACTGCCTGAAGGTTGGTCAATTGGTCAACATGAAATGGAG
GGTTGAAAGGCTGAAGGACCTGGAGGCGGCATCTCTGTCTGGAGTAAGTC
TGCAGAAACATTCTTGTTCTTTCTCGCATCCTATTCCATGCTATCGATCA
CAGATTCGGCATGTTTTTTTTACAACTAAACTTTTACTTTATTTGGCAGG
ATGAAATACTTTATCAGGTCGACGCTAATCCACAGAATTGGATGGTTGCT
GGGAGGAAATGCGGTCATATTTCATTCTCAGAAGCACAAGGTTAGCATGT
AGACACATATGTGGTTCAGTTTGCCTGCATCCATCTTTGTTCAACCCCAA
TCAATATGCATTCGTTTAACCCACAGGATCGAGGATCGAGATTGCCGTGA
CATGTGTCCCGCTGGTGTCTGGGTACGTGCACCCGCCGCAGCTAGGCCTG
CCCGACATAGGCGATGCGAACATCAGCTGTAATCCAGCAGGCCCCCACCT
GGTGTGCGTCCTGCCTCCCACCCTTAGCACCTCCTACTGTATACCAGCTT
GATTCATGATCTCGTTACGATAGCTACGTAGATGCCACCATTTTTTTCCA
TACATGAGATACAGGGTGCCCTGTTTTTTGCCCGGAGATTCTTCTTTAAT
TTGTACAATGGTTAAATTCTTTGTGTATATTGACAGGATGGAAATCTGAG
TTCTCGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.