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GrainGenes Sequence Report: AA040070

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Sequence
AA040070
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040070
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCGAGATGTCATCTGGCTGGCCTCACACCGCCTCCTCCCGATCCCCTT
TACGCCGCCTCCGTCGCTCGCGCCGATTCCGGCGAGTACTCGTGTCGCCG
ACCACTGCCCCGACACCACCACATCCTCCTCTACCGATTCAATGGCCTAG
CACTGCGGATTCGTTACCCCCACCACAAACCCTAGTCCAGGCGTTGCAGA
GGAGCAGGAGGAGGAAAGGTTCGGTCTTTCCCGTCCATGGCGGCGGCGGC
GCGGCTGGCGGTGGCCACAAGATTGACCTCGACGAGCCAATGTGGCCGGC
CAGCCAGCAAGCCGCGGCCTGGGAACTCTGACCGACGCCGTCGGCCACCA
CCGGCAAGCGTGTCCGGGGGCCGCGGCTAGCTGCAGCTCCTGCCCGTTCG
CACCTCCAGTCCGGCCTCCACCGCCACCCTCCGATCCAGTTGCTGGCGCT
GAAGGCACTGCTTGGCTCCTCGCCGCCTGGACAAAAAGCCGACAGGCACT
CCTGCCCGGAAGAATGAGGCTGCTGCCTGTCTTCATGGAGAGAGGTATGC
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GCGCTGCATCAATTGAATTCAGTTCTGGGCTTATAGGCATGTAAAGATTT
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ACATGCCTTTCATAACTATATATAAATCCTTTATTTTGTTCTAGGTCTGA
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CTTGGTTTGGACTAGTTTTATCATAGCCTGATGCAACCTACACGGCACTT
CATTCATCAACCATGTATATATACTGCTCTCTCCGGTCCATATTAATGGC
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GCATTTGTATCTAGACAAAGTTGAGGTCATTAGTATGGACCGGAGGGAGT
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TGGTTTAAGCATGTTAACTTAACCACATAGTAGCTGTCTTAATCCTTTTA
ATTTTTTGAAGTCGTTATTACTATCTTTTATGCTCTCCTTGACATACATG
CCTATTGTACTGGTTTCAAGATTGTTGACAGATCATTGCAAGCTTGGAGT
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TCAAATACTCCCAAGTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTTTATGTGAATGTATT
ATTGTGTGATAAGCGACAATATAGTTTGTTCCGTTTGCCTCACTTTTATG
TGATGTTGCCTTCATGCAAAGTTAACGTGATGACATGCTGGTTAAATTCA
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AATTAATGTAGCTAGACAAATGAGTAAATACAAGGAGTAGGCAAGTTTTT
ACAGTTTGCATTTTCTGAATCTGCACATGGAAAACATATTATGCCTTTAC
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ATATCATTGTGGAATATAGTTCATGATTATTTGATTAATTTCTTGATAAA
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TTTTCAGCTTTTGGCTCCAAGAATCCTATATGTAGCATCCAAAAAGTAGC
TATCATGTCTGTAGCATCTAAAAAAAGCAACCTATCTATAGAGCCGAAAA
AACATATCATGGTTTGTTTGATCGTTCAGGATGAAGAGAAAAAACTTACC
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TCATCTCACACCAATATACATTCCGTGGTTAAACCGGTGGTGGAATTTGC
CACCAAGGTGTTTAGCCTTGTAAACAGGGCTGCAATAACCTATGGTGCAT
CTGTACTTGTGTTTTGGTGTTCATTCCAGTATATGCAAATTGGGTGAATA
AAGGTTTAAGCATCATGGACGCTCTTTAATCTGGCTTGTTGTGCACGAGT
ACTCCGTAGAATAAGATCAGTAGTTGGCCTGTGTGAGTGTCTTGTAAGCT
AGTGTAAAGTGGTGAAATTCGAAGCTTCAAGTGCTATAACTAGTGTGTAA
ACTATCATATTATGAGTCTTTTGCTACCTCCGTGTGCTTATAATAGTAGC
TTATTTAGTTATTTATTTATCATCACATCTGAAGTGTGGACTGTAAAGTG
AACATACATACTGATAACTTGTCAGTTTAGCAACATCTCGTTTTTTGCAG
TTAAATTTCCTATATTATATGTAATTCCCGATAATGGTTTCATCTTGCAA
AAGTACACTTAGTTGCTTTTGCTACTCTTTTTCTACATGATTAACAGGTG
GTTTGTTGTGGTAGCCAGAGAGAGGCACCCATGCCCCTGCTTAGTTGCAG
GAAGACATGAGGCTTCTGCTGCTGCTGAACCCTGTCTTCAATCGATGTGG
TTGTGTCATTGGGAGAGGTATAAATCCTTCGTTTAGTTCTATGTATGATT
CAAGTGTTGATATGTGTATGATGTGCTGATTAGTTCCTCTTGTTGCATGA
ATTGGTTCTTCATTTCCTGCCCTGTAATGTTTTCGCTTGTGATAATGATT
GTCTTGAGTGGATGTTGGTCCGGAAATAGACACCTAATTTTACTGTTGTC
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TTGATTTGGACAGCTCATGGATTGTTAAATTATTTATATATAAAACGTAG
ATTGTAGGTTAAATCAGATATAGATTTGTTGGTGCTGAATTACTTGCTGG
TCACAAAATTAATCATCAACCCATTTTATTCCAATGAAGCCCAAATGTTA
TCCATGTTGATTTCTATTAATCTCAAGTGCATTTTCATCTTGAATAGCTA
TCTTCTCTTTATTGCAAACACACGAATATATAGAGAAGCTGAGAAGAATT
TTTGTGCTGTAGTTACAAAGGGAAATGGCTGAAGCATGCATGGAGGGGTG
TCTTGTTGATGTAGTCATGTTGATGTATCTTGATGTGTAGATAGGTTTTA
CTTACATGTGGGATTTCTCCCATGCCTTTCAATTATTTGGATTTTCCCCT
GTTGACGAGGACCAGACATATTTTCCTTCGTTCCTTGCCGTGATCCCTGT
TGTCTTTGTCCCCTTCCGTTTGTTCGGAGGTGCTAGGTTCCTAGATTATT
CCTGGCGGTAGTCGAAAGCATAGGATTCAGTCAGCTAGCCTCTTTATTGT
TTATTGCCGCCAGTGGTTTAGCAATGTAGCGGTACCTATTATACATCTGT
TTGTTGTGAAATCTAAGGATAAGGTGCCACTTAGTTGTCCTTTTGCATTT
CCTAGACTCATAGGTCCGTTTGCATTTCCTAGACTCATAGGTCATGTGGA
TTCTTTTCTCATGTATCAAAAGAGCCTGATGCTCGGTACTTAAGATGTCC
CAAAAGAGTGATTATGGTCCTTCCAAGTAAATCTCAAGCGCCAAAGCTCT
AGAAACTATTTTGGACACAAAGGTTTTGTCTATATTGATAAATGATTGTT
TTGCATAGTAGCTTTGGTGGTTAGTAGACAGAGTGTTGATTTGAGACATC
CATCTCATTATACATGATATATCAATGTTGGTACATATTTTGTTGAGCCA
AAACTGAAGCCCAAGAAGTTTGGCAAACATTTTCTCTTGCCAAGGTGTGT
GCAAGCGCTGATCAGAAATGTGCCAAGCTCCTGTGGTGAGAGTCAAGATA
AAAATTCTGCATTTTTGCAAATACATACGCCACTGATCAATTGCCAGTAG
GACCGCCATTTAGTCATATACTCCTTTCTCATTTGTTGAAAGGCCCCTAG
TACGAGGGCCCAAGGCTCGACTAACAAAGGCCAATGGATGGTTACCCTAA
AGCAGAAAAACACCAGTGCCAGAATCAGATGCATCAGTTTCTAGCACAAA
TTGCTTGTTAAAGTCAGGGAAAGCAAGTACAGGTGCACTGATTAAAGCAA
GTACAAATTGCTTGAATGATATTTTTTGTAGAAGATGAAATTTTATTTTT
AGTACAGATATGCGTGCTTAGGCTCACGTGTCAAGTCAAGCTCGTCATAC
AGGCACATCTTAGGGAATAAAAAAGCATGCATTATTTTTCAGATGACAAA
TACATGCATAATTTGTTAACGTCAATGTATAAGTTGTTTACCAATTACAG
TTGAGATTTCCTTGGAAGGACCATAATCTCTCTAGAATTTTGGATCTCGG
ATGCAAGTAGCTAATCCCTAACTGTTTAGAACCTGGGGAGTTTTTGGGAC
AAAGAACCACGGCGATTGTAGTGGGTGGCGGGTGAGAGCGGCGCGCAGGA
GTAGCTGCTGAAGGATGTAGACAACGGCTCCGGTGAATGGCAAAAATGAC
AAAAGTGAGGATTTGAAGGAGTGATCAGTGCAACTTTCTAAACCTCCAAA
ACATATCAGATTTTGTTATTTTTGCACAACCTAGAATACAAGGTATGCTG
AGTTGAGATTTTGCATTTTGAGAGAATACATAATTTTCTACATCTAGAAT
TTTTTGTCAGAATTATTTTCCTTCCTGCAAATGGATGTTTCGTAATTCAA
GTGCACATTGTTTCATAATTGCTCTAGGCGCCTAAACCTGCCCTGTTAAT
TGCACACCATTTGGTTTAATAACACCACTGTGTATGTCGTTCTCAACACA
TTTTCGTCACGGCTATGTATTGCTAATTAATTGTAATTTTATTTGATGTG
CTAACATATCAAGATTTTACATTTTAGAACCATCTAGTGTATATAACAAA
AAGTTGCATCATAAGGTTAACCACCATAACTGACATACTCTATTCATGCT
GGTCTGTAAAACGAATCACTTTCTTCCTCACAGCAAAGCATGTGGCTGTT
CTCGTGATGCGTTCAGTATACTGTTTTCTTTCCTGCAAATGAATATTTTG
TAATTCAAGTACACCTTTGCTGCCGGTGCCTCGAGATCCAGCCATTTGAT
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TGTTTTCTTGGGAATCGCTTCTTTAATTGAAGAGTCTCACCATTCTCTAT
CTTTTGACAGGAGCCTGTTTAAGATCTGAACTCTACGCTCTGGACTCTCA
AGTCCACTATCAGCTCTTCCCCCTTCCTTTGTCAGCTTGAGAAATCATAA
GCCGTGCTACGGTGGAAATCACTTCAAGCTCGCCGTGACTACATAACTGG
AGTTTGTCAGGTAATTACTAGAAGTTTCTCGAAACAACCAATGTTCTTTG
TATCTAATTTCTCTGGGCCTTCTTGTAGTTGCCTGGCCTAACTACCCAGA
TCGATCGAGATTCCAGTCACCTTGTTGGACTACCCTTTTGTAATTTCTCC
CTTTGATGACAGCTAGCCCTGGTCTTATTGTGGAAGTCATATCAAGCTCA
CCTCGGCTGTGCTTCGCCAGGTAATTTACCAAAGTTCCCCTGAAATTAAT
ATTCTCCACATCCAGTTTGTCCCAGTTGCCTGCCGTGTGGTGGCTCAATC
ATCTTGTTGGGCCTAAGATCTTTGGCACTTGTATAATTTGTATGAACTAA
CTACACATGAGAGGAAGTAAGCTATTGTGCCTGAGATATCTGGTTCATCT
TGGTTAGATGACATTTAGGTTCAAACTTCCTTCTCATCCCAATGGACTGA
ATGAGCTTATAGTACCCAAAAGTCCAAACAAGATCTAGAAGAATAGGTGT
GTTAGAAAAAGGGGGAGTCGGGGCTGGCCTGTCAGCGTTGTACCTGGTTA
ACGTGTCCTGACGTGTCTGAACAACCCTTGCGAATGTTGAGGGGCTGAAG
AGATGTCTAAACAAACGAGCCCATGAAATGACCGAGGGAAGACCCGTTGG
TGTCTGGGTTTATGGCCCGCCGCTTAAGATGCTTTAGCATTTGGCATGGT
CATAACTCTTTCGAGATACACTAGTTATTTATACACCAGATAGACTCAAA
AATGCTTTTAGAGTCAGAACTCACTAGATCCCTTTCTTTTAAAAATACAA
AAATGTTTTTTCATGTTTCAAAAAATTCTGAAAACAATATGTACGTATAG
CTAAAGATGTATATTTCAAGTGTGCAATATCTCAATCTGAATTACATTGT
ACTTTGGGTTACATAAAAAAGACAAAATCTGACAAGATTTGATTGTGCAC
TATTAACCTACACACAGATATATAATCTTTTTTGTTCTGCATAGAATATA
ACATATTTCAAATTGTAGATGACATTTAGGTTCAAACTTCCTGCTCATCC
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AGAATAGATGTGTTAAAAAGGAGGGAATCAGGGCAGGCCTGTAGGCGTCA
TACCTGGTTAGGGTGTCTTGACGTGTCTGAGTGCCAGATACATCCTTTGC
TCCATCTGGTTTTTTTTTGCTGCGAGTGGTGGCCGGTGAGGGAGGTGGAT
CTGGCTGCCGCGGTGTGTGCGGAGCGGCTCGTAGCTTGGGAGGGTGGCGC
TCCACCGTCCTCCCAGTGAGAGGGGAGGTCGGGAAACAGTAACAGGCAGC
GGCAAAAAAACAACCTGCTCGGCCTTCTCACGGGAGCGAGCTGCCACCAA
CCCCTTTCCTCTGAACTCGCTCTCAACCAGTGGCGAACGGCAGCGGTGGG
ACTTCTCCCAGCGGCGTGTTATGGTCAGGGGGTGTTGTGGTCGGACGCTG
TTGGGAGCTCGGCGTCGACCATCTGGTCGGCAGTTTGTCGAGGCGGAGTT
CGGGGTGCGGTGGCGTCATTCTGGTCGGCAGCTAGCGGAGGCCAGGACGG
CGGCCCCTAGTCCTGTTTGTGGAGGCGTGTGTGCCGGTCCTCGTGATGCA
GAGGTGGGTCTGGAAATCTAGCGTCAAGATCCATCGCTTGCCGGGCGGGC
TTGAGCAGTGGAGTTTGAACAGAAGAAGTTGTCTCAGGTCGCGCAACAGA
GCAAATCAAACATTGACCGCCTAAGTCCAAAGCTTACTTATGACACCTAA
TAATAATATTGATCCCCGAGTGGCTTTCGAATGTTCATGGTTTCTGCAAG
CTGCAAGCACCGTGCTTACATATAAGCCTTTGTTATAGTCTGCTGCTGCA
ATCCTTTTCCCTTCACAATTACCATGAATCTCATCCTTAAATTTTGTTCG
CGACTGGATTCTCGATGCTTAAAATTGATATAAAGTAGCGAGCGCACCTT
TTGTGCAGACGCATAATAGGCATGAGGCTTACTTGGTTGGTGTTTTAACC
ATTTTATTCGTTCGAGCTGTGTGCATTGATTCCCACGAACTATCACCTAA
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ATGTTTTGATCAATAAGGTACTTATAGTTCCTGATGATGCCTAGTAGACA
CCTTTCATTTGATGGTACACCTAGTTTATATAGTTGTGAGAAGAGTTATT
GTAAGCTGTTGTAATAGAAAATCAGACTTTACTGTAGACCATAACCTAAT
GTCCTTGCATTTTGAACTCTGATTTTGAATGAGTAAAGTTACTCCCACGA
ACAATTCAATTAAACGTTAATCACATCCTCTTAAGGTACCACAATGCCTA
TTTTGTTTGTTGTCTAAAGCAAGCCCTGCACTTGAACAGTATATGTTACC
TTCCAAACAATCGAACATTGTGTTCCACAAAATTATATCCTTTCCTGCAG
TCTTCTCTGCTCCTTAAACGTGGAGAGTTGTCCCAGGTGTGCACAGAGGA
AATACAATATTGTCTTCCTAAGTTGAAAGCTCAGGTCAACTGATACTAAT
CTGAAGTACTCCTGAGTGGCTTCAGTGGGTGGCACAGGTATGTTTATATG
GTTTACTCTTTGTCTTTTTGTCTTCAAATCATGATATTTACTTAGTGAAT
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TTATTTAAGCACATAACATATTTACAAACATTATTGTCATACTTTGAATT
TGCAGCTATAGTAGTTTAGTATACAATTACCTTGAGTCTTTCATCCTTAA
TTTCTTTCAGGTTTAGTCATCAGCATTTGGGAAATCTCTATAAAAAATTC
ATCCAATTTTGTTCTGTTTTACAGGAATATGACCCTATCAACCATGGCAG
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TAGGAATGGATGAGCTTGATGTTCAGGCTAAGGCGTGGAGAGACCAAGTG
AGGGACATGTCGTATGATATTGAAGACTGCATCGATGACTTCATGCATGA
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ATTGAGGCTCGTGTACTTGAAGTGCATGAGCGGCGCAAAAGATACAAGCT
TGATGAGTACAACCCTAAGTCCAAGCTTGATGAGTACAACCCTAAGTCCA
GTATTGTCCATATTGATCCACGGGCACTCGCCATTTTTGCGGATGCGGCT
GGTCTTATGGGTATTGATACCCCCAGAGATGAGCTTGTTGAGTTGTTGAT
GCATCCAGATCAAGAGCTGAAGGTGGCTTCTATTGTGGGATTTGGAGGTC
TCGGAAAGACCACCCTTGCCAGTGAAGTGTGCCGTAAGATTGAAGGGAAG
TTCACTTGTCATGCATTTGTATCGGTATCTCTAAAGCCTGATCTACCAAG
GCTTCTCCAGAATTTATTATTGAAGCTTACTGGACAACAGTCCTCTGAAA
TTAGCAGTTTGGATGATTTGATTCGAAGTATCAGAGAGTATTTATTCAAT
GAGAGGTATTTTTATTATGTGTGTTCTATTGTAGCAATATACACTTTATG
CATTTTTACCAATATATCTTAGCAAGTAATAGTGATTTAATGCACTCTAA
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AGCATTTTGCTTCACCATTAGGACATATATGTCTCTGTTAGAGAAGTGTC
ACACAAAACTAATTATTCCACTATACTGTTGGGCTAAGAATATTTTTTAA
CATAATGAAGGAAGTTCTGTATTCCCAATCTAACTTCGCATACAACTCAA
ACCACCTTGAAACTTGCCAACATTATGGTATAACTTAATAAAAAGCAAAC
TGTTTTGAGGAAAGAGGGTATAAATGTTTCACAGTTTTTACTTGCAAGGA
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GTCTAGATTCATCTAAAATTTGACAAATCAACGACATCTATTTTGAGACT
GAGGGAGTACTGAAATGTATAACAACTCAGCGAGAACTAGATCGCCACTG
GCACCAGAGTTGTCGTCGAATGGATGGGGAAAGAGGCAGTGCCATAGTGG
AGGCTGGACCATAAAGTTGGAGGTACGGCAGCCAGATGTTGTTCGCGCAG
TTGGAATTGGTACACGTGGGGCAGTTTTGGTGAGGTGGTCTCCAGAGTGA
GTTGGGAAGAGTGCGCTGGTGAGCGCCGCTGGTTGTTCGAAAGCACTGGA
TGGTGAGGTTGTGCGGGTCTGCGTGGCGTACAAGGAAACTCTTCCGGTAG
GAGTACATATACTAACAAATGATGAAGTGCCGAGTACAAGGAAACTGAAG
TTATTACATATACTGCAAAACGACTTCTACTACCTGTATTTATATCTCAT
CACGGACGATTCAAAGGTCACTTGTTGTGTACAATATAATTTATGTAAAT
CTAATTAATCGTACGTGTTATCATGGTTTATGTTGTAGACATTTACACAG
ATAATTTATGATATAGGTAAATAGGACTATAATTTTTCAAGTTTATAAGA
TCTCACTATTAACTAACCTTTATGTGTTCTCAATGTGATGTGATTTTCAG
GTACTTTATTATAATTGATGATTTATGGGACACATCAGCATGGGATATTA
TTAAATGTGCTTTTCCAGAAAACAATAATGGCAGTAGAGTGCTAACAACT
ACAAGGATTTATTCTGTTGCTGCTGCTTGTTGCTCTAGAAGCAGAGGATG
TGTTTACAAGATGAAAGCTCTTACGGACAATGATTCAAGAAGATTGTTTT
TTAGCAGAATATTTGGTTCAGAAGATTCTTGCCCTACTGAATTAGAAGAT
ATTTCAATAGATATACTGAAAAAATGTGGTGGTATCCCACTTGCTATTAT
TAGTATATCAAGCCTTCTAGCCGATCAGCCAAAGCCAAAATTTGAGTATG
TAAGGAAGTCTCTCGGATGCATGTTTGATGGAAATCCTACTCTTGATCAG
ATGAGGCAAATTTTGGAGCTTAGCTTCAGAAACCTTCCTAACCATCTTAA
GACATGTTTGCTCTATCTTGGTATGTATCCAGAGGACCACAAGATATACA
TGGCTGATTTGTTAAGGCAATGGATAGCAGAGGGTTTCGTGTGTGCAATC
CCTAGGATGGATGCAGATGATGTTGCAAAAAGCTACTTCAATGAGCTTAT
TAATAGGAGCATGATCCAGCCTGTGGAGACTGACATTAATGGGGAGGTGT
TGAGTTGCAGAGTACATGATATAATGCTAGATGTCATCAGATCCAAGATT
GAAGAAGATAATTTTATTTCTGTGCTAAATGACCCGGAAGTTGTGTTAAG
GATGCACAGAAATATCCGGAGAGCTTCACTCCAATGCCATGGTGAAGAGT
GTGTAGTGACATCGGCGATGGTGAATGGGTCATTATCAAATGTCCGGTCA
GTCTATGCTTTTGGAGGGTTTTCTTGCCAATCTCTGATGTTGCTGAAATA
TGTCCGAGTTCTACATCTTGATATCGATGAAAATGATGTGGTAGATCTCA
CTGGTATATCTAGGTTGTTTCTGTTGAGATACTTAAAGGTGGTCGGTGGT
AAGAGGGTTGAGCTACCTAGCCGAATTGGTAAGCTACAACAATTGGAGAC
ACTTGATCTAAGAAAATCCGCCGCCTCCAAGCTTCCATCTGACATTGCTA
GTTTGCCTCTGCTGCTGTGTCTTATTGTTCATAGGGATACAGTTTTTCCG
GACGGCATTGGAAGATTGAGACATGTGCGAACTATAGAGGTTTTCGATTT
GTGGAAGAACTCAGTGGAGAATATCGAAGGCCTAGGTGAGATGTCCAGCC
TAAGAGATTTTGAGTTCCTATGTTCGGGAAAGGACTTGGTTGAAGGGGCG
AGACGTATGGACGTCTTGCGCTCTTCTCTAGAAAGGATCAGCGGCAGCCT
CATGACCCTTAGGATGTATTATTATGGTGGTGGGATTTTGGATGGCTGGA
GCACATTTTCCTCTCCACCTATCCAGCTTCGAGAGATGTGGATGTGGGGT
TGCGTGTTTTCGACGATCCCCAACTGGTTTGGTCAACTCCGCGACCTTCA
ATCCTTGGATTTCAAGGTCAAGGGGGCAGGGTTGAAGGATGATGGTGTTG
CTATACTTGCAGGGTTTCCATCACTTGTCTATCTTGAGTTACACGCAACA
GAACCTGTAGAAGAAAGGGTGCACATCCCTGGCAGCAGCATGGCATTCCG
ATCTCTCAAAGTGTTTTGTTTCTGGAGTTATCATAAGGTGTTGCTGACCT
TCGAAAGAGGTGCTATGCCTATGCTCAAGAAGCTTCATTTATTGTTAGAA
CCGAGTGGTTGCGAGAGTGGTGGGTCTGCGGAGTGTCCAGTAGATGGCAT
TGAGCACTTGCCAGCTGGCCTCAGAGAAGTCAAGTTATGGATCCGCGGTG
AAAGAAAAGTGGCCGTGACATCTTTGTTAAAGATTGCTTTTGAGGAGCAT
CATCCTGGTGCTGCCTTGTATATCTACTGATTCTCGTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.