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GrainGenes Sequence Report: AA026359

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Sequence
AA026359
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026359
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGATCCCAAACCCGTCATGAGGCAAAAGCCGCATACCGGTCTACGTTCG
AGACGTACGCGAGCTCGCGGACCCGGAACCGCCGAAACGAAATTCGTTTC
CAAACCCTCTCGCTCGTCCCGTACGTAGATCGTCTCCCCGTCACGGGGTG
CGTCAGCCAGCGAGATCGTCGGCTCCACCCTCCGCCACCGTATATAACGA
GTGCCGATCTCTTTCTCCTCCTCGATCCAACCCGTGGCTGGCATCTCATC
GATCTGTAGCGCCATCATCAGGATAGAAAGCACCCCCCCGCGCGCGCACA
CGCGGACGAGGGGGACAGCTGCGGCGTCCCACTCCACCCTGTCGGCTTCT
TTCGCGCGCCGAGTTGGTTGGTTAGTTAGTTGCCGGGAGGAGCGGCGTCG
GCGGCGCGATAGGTAGACCGAGATAGATGGACGACGCCGGGGAGATACAC
GCGTTCGGGCGCAGCCTGCGGCAGGAGAGCAACGTGTGGTCGCGGGGCGC
GGAGGACGTGTTCTCGCGGTCCTCGCGGGACGAGGACGACGAGGAGGCGC
TGCGATGGGCGGCGCTGGAGAAGCTGCCCACCTACGACCGCGCCCGGACC
GCGGTGCTGGCCATGCCGGAGGGGGAGCTCAAGCAGGTGAACGTGCAGAA
GCTGGGCGCACAGGAGAGGCACGCGCTCATGCAGCGCGTCGCATGGGTCG
GCGACGAGCACGAGCGGTTCCTCTCCAAGTTCAGGGACCGCGTCGACCGG
TGAGTAAAAACTATAACTGCCTTTCTCGTCTTCTTCGGTTCGCCCCTTCC
AGGCGGCGTCCGCCCTGAGATCTTGATGATCTGAATTTCCTTCTCACCTG
TGATGTTCAGAGTCCGGGTGGCGCTGCCGACGATCGAGGTGAGGTACAAG
GACCTGGAGGTGGAGGCGGAGGCGTACGTCGGCAGCAGGGGCCTGCCCAC
CATCCTCAACACCTACGCCAATGTTCTCGAGGTATGTATGTGTCGCGCCG
CCCTGCGCCGTCAGTCTGTCTGCTCCTCGTTGGCTGGGAGATGACTGATG
GCATAACTGATTGATGTTGACTCCTTATTGGCCGATTTGACTACCCAAAG
TGCTTCTTTTCTTCTACTGACGTACTTATTTGTTATTACTACCCCTCTGC
CGAACACCATATATATATATATATAGAAACCCTATATATATATATATATA
TACCTGTCACCCACACACTTGATGACACAGTATTTTACTCCATCTTTCCG
TTGCTACTGAGTACCGACAGCTTAGGTAGTACGCGATACGTCAATCGGAA
AAGATGTTCCCAGGTGCAAACAGAATGGGATCCTAGCTTAGCTTGCTGAG
GGTGTCAGTAACCCTCTTTGGAGCTACTTAGTTACTTTCACCGCGCTAGG
GCACCGGGTACCTTGCGGTCTCGATGATATTACATCGTTACCCTTTTGGG
GACGTAGTTGTGAAGCTCCGGTCCCCCTAGGTCTCGTTTCGGTGGCTTTG
GTGACGAGTCTTGGCTATTCCTGTATTTTTTGTTTTCTTTTTTTGATCTG
CTTTGTAAGAGGTTCTCCTTATCACCTTGTATCGAATCGGCTTTGTGTAG
CTTTACTTATAAAGCGGTGCGAAAGACTGATTCGAGAAGGAGTACTATAC
TCCATCTTTCCGCTGCTACTAAGTACCGTGTAGCTTTACTTATAAAGCGG
GGCGAAAGACCGATTCGAGGAGTACTGTACTCCATCTTTCCGCTGCTACT
GAGTACCGACAGACAGCTTAGGTAGCACGTCAATCCGAAAAGATGTTCCC
AGGTGCAAACAGAGCGCGAAGCTTCCGGTTTTTATTTTTTGGGAAGCTTG
AGACGTTAGGGTCAATGCAAATCCAGCAGACCATATATAGCTTAAAATAA
ACAATCTGCCGACTGTTCTCTGCAGCTTCGACATCAGGAGTTATAACACG
CACAGATTAGTAGTACTACTATAGAGGTACTGACATAGTGCTAATCCTCT
TCAAACAGGGCCTGGCAAATGCTCTTCACCTGACCAAAAACAGGAAGCAG
AAAATATCAGTCCTTCACAATGTCAGTGGAATCATCAAGCCTCACAGGTA
AACCTCTGGACATACCGTCACTTCGCAGACCATCTCCGTTGAATTGTGCC
TGCCTTACCTCTTATATTTTTTTTAGGATGACCTTGCTTTTGGGCCCGCC
TGGCGCCGGCAAAACCTCGCTGCTCTTGGCCTTGGCCGGAACTCTGCCTT
CAAGTCTTAAGGTACACATCGTTTTTGTTCTTTTGGCTATTCTCTTTTTC
ATCAAGGTGCTTGTTTTGTTCTTTAGTACACCATGATTATGACTTGCTAG
AACTGACACGAGGAAACATTGCAATGACAACAGTTGACAGGGGAAATAAC
CTACAACGGACATACCATGGACGAGTTTGAGCCGCGGAGATCAGCAGCTT
ATGTCAGCCAGCATGATCTGCATATGGGTGAAATGACTGTCCGTGAGACG
GTCAACTTCTCTGCAAAATGCCAAGGAATCGGTCACCGCTTTGGTAAGAA
CCAGAAAAAACGGGTAGTTCTAAACTCATCACACTTGCATAGTGCATTAT
ATATAACTTGAGTTCTCTAAAAAATGACCAGACCTGCTGATGGAGCTATC
AAAGAGAGAGAAGGAAGAAAATATCAAACCGGATCCAGAAATTGATATCT
ACTTGAAGGTTCAGTACAGTTCCTATATTCATATAGTAGTTCACTTCATT
CAGTGTTTCAGGGAACGTTTCAACAACAACTTTGATGCACATTAAAGCTC
TCATTTTGCTTTATGTAGGCCGCTGCAACAGGAGAGCAGAAAGCCGAGGT
GGTCACAAATCACATACTAAAGGTGCGCTTATTTTATTGCTCGGTTGTAA
TTACATTTTGAATGATGTATAGTTATAACAAGGATGCCGTCAGGTTTCTT
TCATAAGCTTACCAAAGAGTTTTACAAGATCAAGTGATTACATTACTAAT
TCTTTAATTTCCATTTGAATTATTGAAGATCTTGGGGTTGGATATCTGTG
CGGACACACTCGTCGGCAATAATATGTTGAGAGGTATATCCGGAGGGCAA
AAAAAGAGAGTAACTACAGGTAAATACAGCTTGAGAGTGAGAAACATACC
AGATGCTACGTCTTACAGAATTAAATTACTGTTCAATCCAACTCATCCAT
TCCCTGACAAATTTTGCAGCTGAGATGCTTGTAACACCAGGACGGGCCCT
TTTCATGGACGAGATATCAACTGGACTTGACAGCTCGACAACCTTCCAGA
TTGTGAACTCTATCCGGCAAACAATCCACATTATTGGTGGAACAGCAGTC
ATCGCCTTGCTACAACCTGCACCAGAGACATATGAATTGTTTGATGATAT
AATTCTCCTCTCAGACGGTCAGGTTGTCTACAATGGCCCTCGAGAACATG
TGCTCCAGTTCTTTGAATCAATGGGATTCAAATGCCCCGAGCGAAAAGGT
GTAGCTGACTTCTTGCAAGAAGTGAGTTTCGTCTACTTTTTTGTCTCAAG
CTTTCTCTAATTATAGATTTGTTTAAAAAGCATTAATTAAATTCCCTCAA
GGGAAGTTTCATAATGCAAAGTTTGTTCACAAGTGGAACGGATGGAGTAA
CCTATTTTAATATTTCATACAGTTTGCATCAAAATATGGCAAGCTGCAAA
ATTGATGGTTGTAGAAAACTCTGTCATACTAAGTTCGTTTTTTAATACCA
GGATCATAACTGCCTACAGTGTTGAAGTGCGACTGACTATAATTGAATTT
TTGATAGGTTACATCAAGGAAAGATCAGGGACAATACTGGATAAACAGTG
ACGAGACATACCGATATGTTTCTGTTAAGGAGTTTGCGGACGCATTTAAT
TCTTTCCACGTTGGTCAGGCTATAAAAAGGGAGTTATCAGTTCCATTTGA
CAAGAGCATGAGTCATGCTGCAGCCCTGAAAACATCAAAATACGGAGCCA
GCATGAAGGAACTACTCAAAGCTAACTTCGACAGAGAGATATTGCTCATG
AAAAGAAACTCCTTTGTGTACATATTCAAGGCAGCTCAGGTGATGATTTC
AAAAAGAAAACCATCAGAAGTTCAATTCTAATTGATTTCATTGTCCAAAA
GTATAAAAGTACCGTACAGTATCTTACTATTTCTCTTTATTCTTCAGTTG
ACAATCATGGCAATCATAGCAATGACCGTCTTTCTGCGCATTAATATGCA
TCGTGGCTCAGTAACAGATGGAGGGATATACATGGGTGCTCTCTTCTTTG
GGATCTTGATGATCATGTTCAATGGTTTAGCAGAAGTAGGTCTAACCATT
GTAAAGCTACCTGTTTTTTTCAAGCAAAGGGATCTTCTCTTCTTTCCAGC
ATGGACATACTCCTTGCCGTCATGGCTCATTAAGACCCCCCTGTCCTTGC
TCAATGTAACAATTTGGGTCGGCATAACATACTATGTCATTGGATTTGAT
CCCAACATACAGAGGTAAGGGAGTAAATTCCAACATACATAAATTTTTTC
AATGTATTGCCGGAAGCTAACAAAAACAACGCAATGCTGCAGATTTTTTA
GACAGTTCCTGCTGCTCTTATTAATGAATGAGGCATCATCTGGACTCTTC
CGCTTCATTGCTGGCCTTGCACGGCATCAGGTTGTTGCAAGCACCATCGG
TTCCTTCAGCATACTTATTTTTATGCTCACGGGTGGATTCATCCTAGCAA
GAGGTATGCAAAAGTAGCTAAGCTGAAGTCCTAAGCACTATGTTTGAAGT
TTCCAGCTAAGGAAACCTGGACTAAATTGCCTAAGTTCAGTTGCCTTTTC
CATTTATGTGACATAAATTCAACCATTCCTTTGATTTAACAGAGAATGTG
AAGAAATGGTGGATATGGGGGTACTGGATATCACCCCTGATGTATGCACA
AAATGCTCTATCGGTGAATGAGTTCCTAGGTCACAGCTGGAATAAGGTAA
GGAGACACTTATGAAACAGAATAAAAAAAATCCCCGGTATGTCTGGCTAA
AGCATATTGTTACTGCTACACTACAGACAATCCCCGGTTTCAAGGAACCA
CTTGGAAGACTAGTTCTGGAATCTCGTGGGATTTTTACTGATGCAAAGTG
GTACTGGATTGGTGTTGGTGCCTTGCTCGGATATGTGCTGCTATTCAATA
TCCTCTATACCGTTTGCCTCACATTCCTCGACCGTGAGTCAGACATAACT
TGTATTTTGTGCCAACAGATAGCTATATTGCAATTTTCCAAACAAATTTG
TACATTCTAATCTTATACATCCTCCGATCCGCAGCATTTGACAGCAATCA
GCCAACAATATCTGAGGAAACAATGAAGATAAAACAAGCTAATCTCACTG
GTGAAGTTTTAGAGGCATCATCGAGAGGACGGGTTAAGAACAAAACTATA
GCATCTACAGGTACTTACTGATTCTATATTAATAAATCTGAGGAAGATAT
TAAGATAATGCCAGCTGGCAAAGCTCAATGATATGACCTCCAAGCCTGAT
AGTTAAGGTATAATTTAAAATTAACCCGTGCATATGTTTACCAGATACTG
CGGACGGGAGCAATGAAGAATCAACTTCCAACAACGCAACAGTGGATTCT
AGTCCAGGCAAGAAAGGAATGGTCCTCCCTTTTGTCCCTCTCTCCATCAC
ATTCGAAGATATAAAATACAGTGTAGACATGCCACAGGTATTTTCTTTGT
GGAAATTATTATTAGAAATACAGATATATGGATGGAAACATCATGCATAA
TTCCTTTCCAACAAAAACTGCAGGAAATCAAAGCACAAGGTGTGGCAGAG
AGCCGGTTGGAACTACTAAAGGGTATCAGTGGTTCATTTAGGCCAGGAGT
GCTTACAGCTCTTATGGGTGTCAGTGGTGCCGGTAAGACAACACTGATGG
ATGTGTTGGCTGGACGGAAGACCAGTGGATACATAGAGGGCAACATTACA
ATCTCTGGCTATCCAAAGAAGCATGAAACTTTTGCCCGTGTATCAGGATA
CTGTGAGCAGAATGACATCCATTCACCAAATGTGACAGTGTATGAGTCTC
TTGCATTCTCTGCATGGCTCCGATTACCTGCCAACGTTGACTCCTCAACA
AGAAAGGTTTGCACAGAACAATCGGCTTATTTTTTATTTGAGTATTTTCA
TAGTATACAAGCATATATATTAGAAAAATACATGAAACATGATTAAATGA
GTATAATAACATTGTCAACAGATTTTAAAGTCACTCAATATAAAAAATAA
AATCGGTAACAGTATAATTTAGGTTCACCAAAATGCTTCAGACAGCTATT
TTTATGTGATTTTATTTATTTATTTTTATGTGATTATCGATCACATTTAT
GTACTAGTCACATTCGGTAACAGTATAACATTGTCAACTGACCTTCAACA
CATAAAATCTGGCCTGCAGATGTTCATTGATGAGGTCATGGATCTAGTGG
AACTTTTCCCCTTAAAAGATGCATTGGTTGGATTACCTGGTGTTAGTGGA
TTGTCAACTGAACAGAGGAAAAGGCTGACAATAGCAGTGGAGCTGGTTGC
TAACCCTTCTATCATTTTCATGGATGAACCAACATCTGGACTTGATGCAC
GAGCAGCAGCGATTGTCATGAGGGCAATAAGGAATACCGTAGATACAGGA
AGGACAGTTGTTTGCACCATTCACCAACCAAGCATCGACATTTTTGAATC
TTTTGATGAGGTACTAAATATAGTGCCTATGTATATATTAAACAAGACAA
TATAGTAAAGCGACACATGGGCACTTCATACTGTTTACATACACTTCTAA
TACCTGATGGTCAATGTGTGTCTTTGCAGCTCTTCCTGATGAAACGAGGA
GGCGAAGAGATTTATGTAGGTCCACTAGGCCGGCACTCGTGTGAACTGAT
CAGCTATTTTGAGGTGAAAAAGATAACATGAATCACTGCATGTTTCCATA
TACAGTCTCACAATGTTCTGCAATGTTATTGAACTGCTTTGTTTTGGTTC
TCAGGCTATTGAAGATGTCAGAAAGATAAAAGATGGCTACAATCCTTCAA
CATGGATGCTGGAAGTGACTAGTGCAGCACAAGAACAGATATCTGGGATT
AGCTTCAGCCAAGTATACAAGAATTCTGAACTATATCGGTAGGTTTCTGG
TGCATTACTTCATAGTTCCATAATAATCCAATGAAATGCTGAACATTTCT
TAACCTATATAATTTTGATCTAAGCTAAGAATCATATATTTGGAAATGAA
AAACAACAATCAATATTTTCTGGAGTATGTTTTAACTATTATTTAAGAGG
GTAGATCTTTAAAATACAAAACAAGAGTATCTGCGAACAAATATGCATTA
CAGATGACCCATTCTAAAAGCGTGATAATACTTTCTTTTTCGCGATTGAA
GTTTGAAATATCTAAAATGTGCACGAATATTCTCGGTTTTGTTGCATTTC
AGGAGGAACAAAAATTTAATAAAGGAGCTAAGCACACCTCCTGAAGGTTC
AAGCGACCTATCCTTTCCAACACAGTACTCACAAAACTTCCTCACTCAAT
GTTTCGCTTGCCTGTGGAAGCAAAGTCTGTCATACTGGAGAAATCCTCCA
TATACTGCAGTCAAGTTCTTCTATACTACATTAATTGCCCTGTTGTTTGG
AACAATGTTCTGGGACATTGGCAGAAAAAGGTAATGTAATATATGATAAA
AGAAAGCATTCACAAATACGATATTTGTTAAGGAGGCTACCTATAGTTCC
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GGACTTGTTCAATGCCATGGGCTCCATGTATGCCTCAGTTTTGTTCATGG
GAGTGCAGAACTCGGCTTCAGTTCAGCCAGTTGTGGCTGTTGAGCGCACA
GTCTTTTACAGAGAAAGAGCGGCGCACATGTACTCACCTTTACCATATGC
ACTGGGACAGGTAGATTTACTATGCATTAACTTTCATCTTTAGCTATCAG
TCAAAACAAGATTAGTGATTTCAACTATCAAAAGGCATGGCATGGTCAGG
TAAAGCGCCATATATAGGTGCAGGCATGTGCATTCGAGGCTTGATAAAAG
ATTCAAGATAATTTTGAGTTACAGCCAGTCAGATAGTTAAACCAGTGCCG
TAAGTAAGTGCAAAGCAACCGTAAAACGATATGATCACTAACATCTAGTT
TCCCTTGCAGGTTGCAATTGAACTTCCGTACATCTTTGTTCAGACCTTAA
TATATGGGGTGCTAGTATATGCTATGATTGGATTCGAGTGGACAGTTGCC
AAGTTCTTTTGGTACCTGTTCTTCATGTACTTCACTCTAGCTTACTTCAC
GTTTTACGGAATGATGTCGGTGGGCCTGACTCCAAACTACAATGTTGCTT
CTGTTGTTTCCACGGCATTCTATGCTCTTTGGAACCTTTTCTCGGGATTT
ATTACACCAAGAACTGTAAGTACTCCTTTTTATCTCAATGTTTAACTTCA
TATACTTCCATTTATACAGAAAAGACTAGAACCAGTACCAAACTCTGCTC
CTTCTATTCCTAATATTATGCCAACTGGTTACTTTTCTCTACAGAGAATC
CCGATATGGTGGAGATGGTACTACTGGCTCAGCCCTATTGCATGGACACT
CAATGGTCTTGTCACTTCACAGTTTGGAGATGTAACAGCAAAGTTCGAAG
ATAGCGGCGTGCAGGTGTCAGCTTTTGTAGAAAGCTATTTCGGGTTCCAC
CATGACTTCCTGTGGGTAGTCGCTGTGGTGGTCGTCTCATTTGCCGTCCT
CTTTGCTTTCCTCTTCGGGCTCTCGATCAAGCTATTCAACTTCCAGAAGA
GATAAGTGACCAAGGAAGACATATCCAAGACTGATCCAAGCCCGCTAGCG
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CAGTGGCAGTGCACATTGTGCACTATGCCTATGAAGTTCAGTTTTGCTTG
CAAGTTGTATAAATCAAGTGAGTTTGCCACACTGACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.