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GrainGenes Sequence Report: AA002079

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Sequence
AA002079
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002079
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGATCCTACTAGTTTACAGACAGAAAATTTGATGCCAATGTCGCTACA
GTATGTCTATCTGTGTTCGGATTTCTGTATGTGAATTTGCTGGAAATTTT
GCTACTGTATGTCGTATGTGTCTTGCAATTTTCCTTCCCCAAATTCAGTA
CTGTACTGTATATATTTTCAGAGTTTCAGGTTTTCGGCAATGCGGATCAT
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GAACATACAATAAAGCTTTAGTACCTCTAAATTTATTCCAGCTGTGTGAT
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GTTATTGTGCTTTTCTTATAATCCTAAACCTCATGACCCCATTTCTCTTG
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ATCACTCTGTTCTCACTGTCTACAAGGGGCGCAGCGGAAAGCCAATTTCT
GTTTCAGTAGTACCCCATGAATATCCATACTTTGGCTACTAATTTTGGCT
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GTATGACAAATAACCGGGCTTCACTTAGTCATAAGAAGCCTCATATGGTC
TTGCATTTCCCTCAAATATCTGAGACTTTATTTTTTGTTAGTTTGACAAA
ACAGTTGCTGTAATTATCTATAAACCAATTTGTTTCTAATCTTTTGTAAA
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GTTGAGCTTAAATAGACTACCCACTTTACTGGGGCTTTCTCTCATAATGG
ATTAGATTTTAGCACATTTATCTTATCAGAGTTGTCTCTTTTTTTACCAG
GAAAACCGTAGGGGAGACCCCTACGGTGTAGATTTTTATTAATTATAGAA
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TTTAGAAACATGATGTTTTCTTCAGGCCTTTTGCCATCAAGGTATTGTAT
AAAAATGGTGTTACTACTGAAACATTTATTTTAGTCTGGCCGAGGCATTT
CGGAACCGCTAGGGGCTGCCCACCTGATGTAGATATAATGACTCCCTTAA
ACACACGGTCAGTGTAGTAGAATTCTTGTGTAATGCTATTTATACATATA
TCGCCGTGGTAATATGCAATCTGCATGTACTCAGTACTTCCACCAGTTGT
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TAATATTAGTAGCTGCTTTCTGTAACAAAAGTTCTTTCAAGTTAATTATA
GTCCTGTACTGTCACCGATTTAGATTACGTGTGCGAGCAAATTTTGTTTA
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GCAGGAGAGGAAACAGTGACATGAATGATGACTGGTGAAGTTGGGATATA
CTGATAGATGGAAGCAGATGTCTTGAATTGCTCTTTTCTGGAATGGCTTC
TTAACATTACTAAATTATGAACTGAACTAAGAAAAGGGTATGAAGGTAAC
ATGCTGGCATTCCTTATCCTATTGCATGTTGCTTTCCGTATCCTGCAGTT
TCATTCTGATTTAAAGTGGACATTCCCAGATGTAGATTCATTTTTAGCTA
GCGCACCATGGACAAGATATTTATTTTGGCTCGTTCAGATATGTAAAAAT
TGTTAGCTAATTGCATGCCTGTAACAGCATGGTTATGGGCAGCTTGCTAT
TCCTTAGTTTTCCATGAGTAAATCAATTGACTTTATACAGGTATTTCTGT
ATTGCATGCAAACTAGAAGTTGAATGACTTCATTTGGGCTAGCTCTGCAA
ACTCAGATATTACTGCATTAATAATACTTACACTTGAGGTGCACATGCAA
TACATATCCTAAATATGTATATGCATAGTATAATCGTATGTCCCTGTCAA
TGACGCAGTTGTATTGATCATGGTTACGAACTGTACGACTAATGGTATAA
ATGGATAATTCTATGTTCTTGATCTTTATTCCTATATATTAGTGTCAAAA
TAGTTTGGTCACCAATCCAGGAGTTCTTGAACAGTTTTGGCTTGCATCAT
ACTGACATTTCAAATGATTTTTAACTTATCATGGTTACCTTTACTTGAAC
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TGAGTATTCCTTCTTTGCAGCGAACTTACTCAAATGCTCAGAATGTTTCT
TCTTGAAATTGACTGTGAAGGTTCTACAAGGCATAGCTCGCCATGTGGTG
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TGTCAAACTCAAATCTTATCCATTACCTTTGATTTTGGTTGGTGTTTTAT
TTTCCTGCTCTACCTTTGTCTAATTAGTCATGTGACTTGATTTACTGAAT
GTTAATCTGATGCCTCTTACATGTAATTTGGTGGCTGTTAATACTACAGA
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TTTGTAAATATCAGAATTAATAGAACCTAGAATGGTGTGTGTTGCCTTCT
TTGTTCCTATTTAACATCTACTGGCATTTAGGTTGTCCATGCATGCCTGG
GTGCTACTTCAGGTAGGTGGTACATGTCAGAGCTTTCTGCAAACAATACG
ATGGATTAAGAGACAACAGAAACATGATGTGAACAGCTCCAGTATGACAC
CAGATTTGAAGCCCCACCACACACACGCCCACCATTGCTCGCGACTCTGT
TCTTCCAGGCGCTGCTGAATTGGCTACGCTCTTTGACGCGCATGACAGTG
TGTTTGGTAGGTCAGGTCCTATCTTCTTGATTCTGTGTCGTCTTTCTGCT
ACTACGGCTGGTTTGATGCAATGGATCACGTTTTAAATGATCATCTCCTA
TCCTTGATTCTGGGTTTGACCCATCACATGTCCCTTTAGAGAAACAAATT
TGTAGTCTAGCAAGACTGAAGAAGCTATCGAATCAAGAATATATACAAGC
CTATGCTGGAGGTGTTGGTTTTTAAACATTGTGTCTGATGGTTAGAAAAT
CTCCAAAATTTACTTCACCGCCTGCTAGGTATCCAGTCATCATGATATTG
AGTCACTTTTCAATCAGGTCTTCTGGTCAAACGTTGTCCCTGCTTATGAA
AATATTTACATCATGTGTCCCCTTTGTGCAGGCTTAAGAGATACACGGCA
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TGGTGGAGGCGACTGGCGGAAGGGCGACCGGGTGAGTGAAATTTCAGCGT
GCCAAGATACGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
GGGGGGGGGTAGAGTTCACGCTCGTTTCGGCATCCCACACCTCGTATGTA
GAGGTCGATGGGTTATTTCTCCGTCACCCGTAAAAAAGTACAGTTCACAC
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AATTCTATAGAAACTGATGAGATTAAGCCAACGAGGTGTCGAAGACAAGG
GGATCCATTGTCCCCTATTTATTTTTTATTGTGGTAGAAGGTTTATCTAG
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ATCGAGATGCACCTATGGTTTACCATCTATTATTTGCAGATGATTCTTTA
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GGATAACTACTGTGCAAGCTCGGGGCAGAAGATAAGTGAGGCTAAATCTA
GTATTTTTTTCAGCATGAATACAAGAGTGGAAGAAAAAATAGAGGTATGC
CAAATTCTGAACATTTTGACGGAATCTCTAAGTGACAAGTTCTTAGGATT
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ATAGAGTTATTGTGCAAGAATAAGTGGGTGGAAGGAGAAGATGTTGAGTT
TGTGAGGAAAAGATATTTTAATAAAGGATATTGCTTAATCTATACAAGTG
TTTGCTATGATGGTGTTCAAGATTTCGAAAAATATTTGCAAAGGAATAAG
GGACGCTATCTCTCAGTTCTGGTGGGGCAATGAGGAAAAGCAGAGACATA
TGCATTGGAAAGCGTGGTGCAAATTATGTATTCCAAAAGATAAGGGTGGA
ATGGGTTCAGAGATTTACACAGTTTCAATTTGGCAATGCTAGCAACGCAT
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GGAGTTCATATACTTGGCAGAGCATTTTAGCGGGACAGGATTGTTTTAAA
AAAGGGTGCATTTGGAGAGTTGGTGACGGTACACAAATCAATATTTGGGA
GGATAATTGGATTCCATCTAGTCATAATCTGAAAATCATGACGTCAAGAG
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AATTGGGATGTTGAGTTAGTAGAAGGTTTATTCTGGCCTATAGATGCTCA
TCGGATACTCCATATTCCTTTGACACTGGGTAGGGAGGACTTTGTTGCTT
TGCACCATAAAAAAACAGGGATTTTTTCTGTCAGATCTTCTTACCATTGT
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GTAAATTTAAAAATATTGGGTGGAGAGTTCTTCATGGTATGATTCCATGT
CGAGAAATTTTGGCTAATAAGCATATTGGTAATCAAGGTGGATGTCCTAT
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GGGCAAAGGAGGTCTGGCGCTGCCTTGAACTAGGGAGTTCTATAGAAGAA
GTGCTGCATATATGGATCGGTCGGGATCAGTCTTAATGGAAGAGATGATT
ATGCGAGATAACCCGAATACCTGTGCCTGATAATGTTGGCTTTGCTAAAA
TCGTTTTGATTGCAGGTTGGTACATCTGGTGGGAGTGCAGACAGTTGGTG
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GAGAAGGGTGGAAGAAGCCAATGGAAAGAGAAGCTGATGGTTAACATTGA
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GAGATTATACGGGACAATGTATCGCCGCGGCGCAGAAGTTTCTTTCTCAT
GTGGTAGATGCCCTAATGGAAGAGGCTTACTCTCTACGAGATGGTCTAGT
CCTAGCACAATATATTGAAAGTAACAATTTATTCTACAAACTGATTGTAT
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AGCGATTTATGATGACTGCAACATTTTATGGTCAGGATTTGATAATGTTT
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CTTTTTATCCTTAGCAAGCTCTCAAACGATGTAACTACTTTAATTTAGAG
GCCGCAGGTTTCAGACACACTTTTCTTCCCAATCAGAGTATCTAAGGGGA
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GCAACAACTTGCTCTTAGCTGCCCAAAAAGACGTGACCGAGTTGCTGGAA
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AGATACCCCCAACCCCAACAGATCAAAAGCTTCCTATCCCCTGTGAAAAA
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GCGGAGGGGCTGTCCACGGGCTGTTCCGAGGAGCCTGCTCGCGCGAACGA
TGGAGAGACTGCTGAAGATGACTACGACATGGTGCTCAGTGAAGAGCGGG
ATCTTGCACGCATCCTGCCCGGCGACGTACTAGCCTACGTCTTCGGCCGC
CTCGCTCCGCGCTGGCTCGCCGTGTCCCGCTGCGTCCGCAGGGACTGGCG
CGCCGCCATCGACGCCTGCCGACACCTGCGTGCGGACCTGCTCCCGCTCT
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TTTGCCCGCCCTGCTTCCTCCTCCACGGGCGCCCTTGCCATCACAGGCAG
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CGATGCTGGCCTCATCCATACAACTTTCAAGATGTATCTAGTCTTTGATC
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GGTCAAATGGAGTGGATACTGAAGCATGACAAAGATCTCAGGCCCGTGCT
CGCTCCTCATCGACAAGTTCATGGACGTTGGATGTTAAAGGATGTTAACT
ACAACATATATTGTTCCCACCTTCCAAAACACAAGAAGAACGATGTAATC
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ATCTTGGCAGCGGAGACATGGATGAGTGTGACTTGTATGTAGAGCCTTTC
TTGTATGTGCCCAGAATTAAGATACTCGGATTTCATCCGCGTACAGAGAG
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CACACACCATGTTGGCTTGAGAGCTCTTTTCTGGTACCTGAGATGAACGT
GGGCTCTCCGATCGGAGAATCTAACAGCCCAGAGCGAGCCGTACTGCTCG
ACTTGGCTCCATGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.