Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA001945

[Submit comment/correction]

Sequence
AA001945
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001945
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGTCAATTGTGCGGAGCTGAAACCCTAGACACTGCGAAATAACATAGGCC
AGGCCCATGTGCTAATCTTGGCCCAAAGTACAGCGAGGGTTTTGGTTGAA
AGCCGCCAGGTGGGAGGGAGGAGGAAGAAAGTATCACAAACCCTCGACCC
CCCCGCGGCGTCTCCTCCAGAACCACAGCGCCGCCTCACTCTCCCCCCTC
AGATCAGCTCCCCGCGCGATCCGCCCTCCCAGGAGTTTCTTCCGGGGGGA
GCAGCGCCAGCGCTTCGGCGGCCATGGCGCTCGCCTTCGACGAATACGGG
CGGCCCTTCATCATCCTCAGAGAGCAGGAGAAGAAGTCGCGGCTGCAGGG
TCTCGACGCGCAGAAGGCCAACATCGCCGCCGCCAAGGCTATCGCGCGCA
TCCTCCGCACGTCCCTTGGGCCCAAGGGCATGGACAAGATGCTCCAGTCC
CCCGACGGCGACGTTACCATCAGTAATAGCCGCTCCCCTCCCCTCCTCTC
CCTTTCTGGTTAGCGTGTTACGAGATCTGGAAGTTTTCGCCTGCCATTGG
ATCTTAGGCGGTGGTAGCAAGGAAGTGATTTGAGGATCATGGTTTCCTTA
GGTGTTACAGTGTGTTTATGGTCACGAGATCTAGTTATTTGTGGGAAGCT
GCTTGCGGTCAGGCTTCTATATTGTTGCCTGTGGAAGGAGATGCTTCATT
TTGTGAAGGTAGTTTGTTGATTTCGTTAAGTTTCTGTTCGGGTTGGAACA
CTATGTACCGCGGAAATGCTAGGTAGACATTTCTGTAGCTATCTCTATCT
AGTGTGTACGAGTGCAGTCCGAGTTTACTGCTGCAAAGGTCATGGTAAAG
TGAGGTGCCCCCAGTTTATGTGGATCTGGACATTGGTTGTGTGTTTTTAG
CACTTAGTTATGTGGGCTTTCATAAGTTAATGATTTCTCTGTTGTTTTGT
CTACTGACCATCTTTCCACATGGATTGCCAGCTAATGACGGGGCGACCAT
CCTGGAGCTAATGGACGTTGACAACCAGATTGCAAAGCTGTTGGTGGAGT
TGTCACGCAGTCAAGACTATGACATTGGAGATGGTACCACTGGAGTGGTG
GTCATGGCTGGGTCTCTCCTAGAGCAGGCTGAGAAGCTACTGGAACGTGG
TATTCACCCAATAAGGGTTGCTGAAGGTTATGAGATGGCGTCAAGGATAG
CTGTTGATCACCTTGAAAGCATCTCCACGAAATATGAGTTCAGTGCCACA
GACATTGAGCCTTTGGTGCAGACCTGCATGACAACTTTGTCCTCAAAGAT
GTGAGTTATAAGATGTCACGCTTGGTCAATCAGCTTCTTTTACAGCATCT
GCTTTTGAAATTAGTTATAACTTATAAAATATTATTTTGGATAGAATTGG
GCATCATCTACTAGGGGCTGTCATGGGAACATATTGACAGTTTTGTTACC
TTTGTTTTGTGCGAACAACTAGTAGACGGTGTTCTTCTTTACTGTTTTAA
ACAAATTCTGCTGTCATTTTATGATTGTAACCCTTGGCATTAAGCAGCAT
TCTGAACTTTATTTTCTGCTCTATGTATGTCTAGGTTTTTTGTCAGGTTA
TTGTGGTGATTTTCCATGAAATTTAATAATTCTCTCCTCTTTTAGTGCAC
ACTGACATTATGCAATTGAATCATTAATGCACATGGATAATGATTATCTG
ACCAAAAGCTTAATTAAGGATGTTAGTGTCTTATTTCGTTGTCACTTGAA
CTCAATTTCTACAATTACATCAACTCCACAGTGCTACTTCTAGCATGAAA
CTTGCTCACTGGAAATATATTTGACACCCTTAGAAGTGCCCTTCCGTTTC
GTTATAACTGTTCTCAACTCAGGTGAAATCTATTTTGAAATGATTTTCTG
TTGAGGAAATAAAAAAAGTGGATGCTTTACTTCTACTCTCTGGCTTGTTT
TACAGTAAATGTTAAGTGGTTGTCACAGATCCTTGTGGTATGGGTTTGCG
TGGTCCTCTGACTTACTTTTCTTAATTTGTTCTTAGTGTTTGTGTTGGTC
TGTTCGCTTGGCGGGCTGAGGATAGAGTGTAAATGTGCAATAGACGGAGT
ATTTCCTTAAATGTTTTATATAGGTAATTTAAGGCGTTTTGGGTTTGACC
CATTATTCTTATTCTGCAGTGTTAGCCGTTGTAAGCGGGCCCTAGCTGAG
ATTGCTGTCAAAGCAGTCCTTGCGGTTGCTGATTTGGAAAGGAAGGATGT
AAATCTGGACTTGATTAAGGTGGAAGGCAAGGTTGGTGGGAAGCTAGAGG
ATACCGAGCTAGTGCAAGGAATCATTGTTGACAAAGATATGAGCCACCCC
CAAATGCCAAAGAGAATCGAGGATGCTCACATTGCCATTCTGACCTGCCC
ATTTGAGCCCCCGAAGCCCAAGACCAAGCATAAGGTTGACATTGACACTG
TAGAGAAATTCCAGACACTGCGTGGGCAAGAGCAGAAATACTTCGATGAG
ATGGTTCAGAAATGCAAGGTAAAACCCTATGATGACACAATGTTTATATA
TGGTGGAGTTGCTTGTTTTTCTGTGGTTGGGTTTGTAACGTTTCATTGCC
ACTGATTTATCATATCGATTCTGATGTGGTTCTGTTAACAATGCATTATA
GTGTTAATTGATCTTAGGCTGCAAAAGCGCTTCCTATGTCCTGTTATTAG
TTTTGTATTATGTATGGTGTATGATGCGTATTCATTTACATTCCATGTTA
TTTATGATGTATGATCTGCTTGGAAAATAATTGTGCAAATATGCATATAT
TTTTAGGATGTTGGCGCAACCCTAGTTATTTGTCAATGGGGGTTTGATGA
TGAAGCCAATCATTTACTAATGCAAAGAGAACTTCCTGCTGTCAGATGGG
TTGGTGGTGTTGAATTAGAATTAATTGCCATTGCTACAGGTATTTATGCA
TACTACTTCTCTTCATGTTAATCTGAATCTTTTTAGGCAGCAGATAACAT
TTAAGAACTGACTGCAGGTGGGAGGATTGTTCCGAGATTCCAAGAGTTGA
GTACTGAAAAGCTTGGGAAGGTATAAACTGATTTACCTTTATCTTTTGTT
TAAAATAAGGAATATGCATGTGTTTCTTGTGAGGACTGCCTTGATTTTGT
ATTTTGATTGTTAGCGTATGATTGTTGTTTGTTGTGAAAATAAGCACATT
GATTGAAACCATTAGTTCGAAAGAGCATGTCTGTGGGTTTCTAAGGCGGC
TATTGACCACTGGCTTATATGTTGGATGTTTATCTTCAGCTCTAATTTAA
TGGTCATGCTTTTCTTGGTATTTGAGTTGGTTGGTTTAGGCATACATATA
TTGTCTTGTAAACACCATGTGAATGCCTTGCACTCTTGAACATCTGTTAC
ATTAGATAATACTGAATTGTACTGTTTGAAGTTACATTAGATAGCACATG
ACTTATTTTCTGCTTGTGCTGCTTAAACAGGCTGGATTAGTCAGAGAGAA
GTCATTTGGAACAACAAAAGATCGGATGCTTTACATCGAAAAGTGTGCCA
ATTCCAAAGCTGTAACTATTTTTATCCGTGGAGGTATGTTCTGATCTATA
TATCTTTTCTCTTATCATATTGACACACATATGCGCAATGCTTTATCCAG
CCATGAAAGCATTATCCTACTAACGATGTGAATCTGTTGGACGGACGCTT
TGCAGTTTGTATGAATAGATATTGCTCTGTAGCTACTAGTAATATTCTTG
GTGGCCTGGCTGTATGTTAGCAACTAACACAAATCAGTGAGCCATATTTT
CTATACCACTTTCCAAACCACTGAAAGGGTTAAATGGAAGTTCTCGGGTA
TTTCGAGGCTTCAGTTAGAAGCCTCAGTTAGATGGTTATGTAATTCGTGG
GCATTATAGACACCTGCTATTCAGGGATCATTTCGACCTTTTCTCTAGAA
TCGGTATACAATCATATCATAGCAAGAAAATCATCTGTATTATTTGGTCT
TACTTTTAGGATTTTAGGATTTGAAGTCATCAAAATATGATGTTAACTAT
CTTTAAAATAGCAATCTTAGCTGCTGCATTTCAGTCTTAACAAAATGTAC
TCCATCCCAAAATAAGTGACTTGGGTTTGTCTAAATTCGCATGTATCTAT
ATACTAAAACATGTCTAGATACATGCAAATCTAGACAAACTCAAATTACT
CCCTCCATCCCAAAATATAAGGCGCCTAAGGTTTTGTCAAAAGTCAACGT
TTTCTAAGTTTGACCAAGATTATACACAAAAATATAAATATTTACAATAC
CAAATCAATATCAATAGATTTATTATAAAGTATATTTTCTTAACGTGTCC
ATTCTATAATGTAGATGTACATATTTTTTCCTATATATTTGGTCAAAGTT
AGTAAGATTTGAATTTTGACCAGTCCTTATGTGCCTTATATTTTAGGATG
GAGGGAGTACTTATTTTTGGACGGAGGGAGTATATTTCAGTCATTATCTG
TGCTTAAGTATTTGGATATCTTCTGATTGGAGTTCTGGTTATGCACAGGA
TTTTAGGATTTGAAGTCATCAAAATATGATGTTAACTATCTTTAAAAAAG
CAATCTTAACTGCTGCATCTATATCTTTAAAAAAGCAATCTTAGCTGCTG
CATTTCAATCTTTACAATATGTATATTTCAGTCATTATATGTGCTAAAAG
ATTTGAATATCTTCTGATTGGAGTTCTGGTTATGCACAGGTAACAAAATG
ATGATTGAGGAAACTAGGCGAAGTATTCATGATGCTCTTTGTGTTGCAAG
GAATCTCATCATCAACAACTCAATTGTGTATGGTGGTGGTTCAGCAGAGA
TATCTTGCTCGATTGCTGTTGAAGCTGCTGCAGATCGGCATCCTGGAGTT
GAGCAGGTGATTGCTGGTTTTAGAACTGGTAGTTACAAAAAAAAGGCAAC
ATATAAACATTTCTGATTGTGTTTCCTTTTTTTTCAGTATGCAATCAGGG
CATTTGCTGATGCTTTAGATGCCATTCCACTGGCTTTAGCTGAAAACAGT
GGTTTGCCACCTATTGATACTCTGACAGTGGTAAAATCCCAACATGTCAA
GGTATGTTTTCTCGTTTGCTTTTGATATCATTCTATAATATAAGTTGTCA
GCCTGTTCTTAACTGTAGCTCTTATGAGATCTTCATCTCACTTTACTTAT
TGATGCCAATTGCATTTGAATGTTGCTACACCGCACACTTGAGCAGTAAT
ACTACGTACTAGTCGCACTTGTTTGTTTAGGCTTGTGATAGAACTGGGTT
GATAAGATACCTTTTCAAGTTCCTGCTTATAAGTCACTGCATGTACTGGT
GGTTTTGGTTTACTCGCTCAATTTGTATGTTGTGTTTACCTGTCACTGCT
ATTTACCACTGGGTTTTCTTAGTTTCTGTTATGTCCTTCCTTCCGTATTG
AGGTAACATTTCATTTCTGAACATATTTCTAGGAGAACAATTCCCGCTGC
GGCATTGATTGCAATGATGTGGGTACCAATGACATGAAAGAGCAGAATGT
TTTTGAAACTCTGATTGGCAAGCAGCAGCAGATCTTGCTGGCAACCCAGG
TCGTCAAGATGATCCTCAAGATCGATGATGTTATCACGCCTTCTGAATAT
TGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.