Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040743

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040743
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040743
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGTATTGCCGTCGTGGACATACTCCGCACCACACGCTGACGGGCTCTCG
GGACTCTGGACTAGGAGGCGGCCATGGCGCTCGCATCGGGCTCCGGTAGC
GGCGGCAGGGAAGACTTCTCCGTGCTGGTGCTGGGGTCCGACTTCGCGGT
GGACGCCGGCGCGGCGCTCCTCACCTCCCACGCCGACCACGAGGAGGCGG
AGTGGCACGACTGCGTCCCCGACCTCGGCGACGACTTCTCCGACCTCGAG
GAGCTCCAGGTCGTCCGCGTGCAGGGCGCGGACAGGTCCGGCCGACCGAT
CGTCCGGATCATCGGCAAGTTCTTCCCCGGTGCGTGAACCCCGTCTCGTT
AATTTCCATCCTCTTCTCCCGGGATTTATAAATTGGTGGTTAGGGATTGC
TGTTGCACGTCTAGGGTCTTGGTGCGAATGAAGTCGTTTCAGTTGGTCAT
GGCTGCATTCCGTGGATAAGTTTGCAGTGACAACATTTGCTGTAATTCGG
ACTTCGGAGTTAAGGATTATTCATTTCGATCGTAATCTAGTTTGTATGTA
CTAGCTTCGGACTTAAGCATGTTTGTGTCACTAAAAGTGAATTTATTAGG
CGCAGCATTTATGATTATTCACTTTGATCGTAATCTAGTTTATATGCAGC
TTGCTGCTAGTATTGGGTGGTTCCTTGCCATGCCCTATTGCTCTATCTTC
ATCAGATTGGATACCTGAATCGATACAACAATTAGCACGATTTCTCATAA
TCAATTAGCAGACCAAGGATTAAGTGTCGTTCGACAAGTCTAGACTTGTC
GCACGACAAGTCTACCTGTCGCAATCCTGATGTCGACAAGGTGGAACGAC
AAGAAAAGTTTAACTTGTCGAGCGACAAACCTAGACTTGTGTCTGTGAAC
TAACCGATCGACAACTTAAAGGGCTGGGATATAAGAAGCCTCGCGTGAAA
CCCTACACCCGTGATTCCCTCCCCTAGCTGTCTCTCCCCTGGTGCCCCTC
CCCTGGCGCTGCCTCTCCTCTGGCCGCCGCTGGCTCGCCGTCGCCTCCAC
CTCTCCCCTGCCCCTCCCCTGGAACTTGTTCTCTCGAACTTATTTACTTG
CTTGTGGACGTGTGGTTGTGGCCTTGGGCATCTGAACTTATTTGGTTATG
AGCTTGGTATTTTTTAGTAGTTACTTGGTATTAATAGGCTAGTTACTTGA
TATTTTTTAGTAGTTACATGGTATTAATAGGCTAGTTACTTGATATTTTT
TAGTAGTTCCTTGTCGACAGCACATCGACAAGTCTAGCACTTGTCGAGAC
TTGTCAAGACTTGTCTACTTGTCAGTACCCCGGCGACAACTTGCAGCAGG
TCGACATGTAAACCTTGTAGCAGACTCGATCGTCATTTTGAAACTGATAG
CTAACAACCCTGTATCTTTTCATTCATTTCCATCTGGGTCGTCATAAAGT
TCATCTCCAGTGTGTGAAACCCCTCTCATTAATTCCCATCCTCTTCTCGA
TTTGGTGCGACATAGGCTGTTGGGGATTGCTTGTGCGCTTCTAGGTTTGG
TGCAATTTGACTGATGAGTTCTTTGTGGTTAGCTTGTTGATGCATTTCGT
GAATACGTATAGAATGAAACTATGCTAGTCTTTACATCCGAGCATATCTA
TGTCTCAGAGCAATTAGCCTTTCTCGTGTGAACTAGGCAGCCGAAACTTT
TTGGAGATCGTAATCTAGTTTGTATGTAGCTTGCTTTGCTCTTAGTTCAT
GATTACTCATTTTGATCACAATCCAGTTTGTGTGTAGCTAGCTTTGCTAT
TACTGGATGATTCCTTGCCATGTCCTGTTGATCTGACTTCTGGTTGGATA
AAAGTTTTGGTGCCACAATTAGCATTATTTCTGAAAATCAGTTGGCAGAA
GCTATCACCATTTGACACATAGCTAATGAGCTGGGTTTTGTTATTTTCTA
TATATTGTGGCAGTTTCATAACTTCTAACATAAACTTTTTTGTATACAAG
CTTTAGCATTTATGTTATTCTAGTTCCTACCACTACCTGTAACATTCACA
CTGCCTTTTCTCTTGGAATTCCAGCTCCTGTTATAGATGGTGAACGTCTG
AAGAGGTATGTGTTCCACAAGCTCCGCACTGAGTTGCCAGAGGGTCCGTT
CAGCATCTTGTACGTGCACACCACTGTGCAATCAGATGACAACAATCCTG
GAATGACGATTTTGAGGGGTATTTATGAAGAACTTCCACCTGAATACAAG
GAAAGGCTGGAAATAGTGTATTTCTTGCATCCTGGGCTTTATTCCTGGCT
GGCCATGGCCACATTTGGCAGGCTCTTCTTAAGTGGAGGGTCAGTTTTCT
CTCATACATTTTTTGAACATTTTAAAATATTCAAGCATGTTGGTTTATTC
TATGATGATATGGGATATAGCTAAAAAAAACAGCATCACACTTTTATATG
GCTATATGCAGTTCAGAGTCCTTCTCACAGTATGAGGGCATTAGTAATAA
ACTAGTACCTGTGGACAAACATTATAGATTTTGCTGACCTTATCCCGCTT
GAGAATGATTTTGTCCAGTGTACTTTTCTTGAATCATGAGCAGTGAACTT
TACTTGTAATTTGCTTTAAGGAATTTTCCTGGAGAAAAAAACACTCGTTT
AATATGCTGACCTTATCACTGCTCTATTCTTAGTTTTTGGTCTTCCATAT
TTACCAAATTTTGGTGAAACAATACAACACTATACCGTCTGGCCAACAAA
CAGTTTCTTTGAATTCATATATTTGTCTTGTTCACTTAAAATTTTATTTG
ACTTCTCACTCAAAATGCAGTTAATTTCCCTCATTTCTGCTCATTTTTTC
TTGCAGGTTGTATTGGAAAATCAAGTATGTCAGTCGACTGGAGTTTCTGT
GGGCGGACATAAAAAAGGGCGAGGTTGAGATTCCAGAATTTGTTACTGAA
CATGACAAGATCCTTGAGCACCGACCATTGACAGACTATGGTATAGAGCC
TGATCCTCTGCATCTTACTGATATACCTGCTGCGGGGTACTCGCTTGGTA
GGTATGAAGACAAATGGTCTCCTGAAGATAGGTGGCATTCTCGGAATTAC
ATGTGACATCTTGTGCTGTTGAAGGCTTAAAGTTTGATGTGTGTATTAAG
TATTACTTTCCCATGGTAACTCATACCGAATTGTTGTAGGAATCTTCAAC
ATAATAAGGTCCTGTCTCACAGATGAAAGACAGATGCTAAATTATGTGAT
TTTATGTTTTTGGGTGTCAATATAGATTCATGAGCTCTTCGTTTACGTAT
AGATTTTGCTGGTTATTTGAATAGGCACATATTTCATGACATTGTGTTAC
GTCCTGTCACCGGCATCATACTTCAGTCGCAAAGAGCCCAAAGAAATATG
ACTGTAACATTGTTTTCGGAATGAAATATCACTCTGAACAACAATATGGA
TCTCATGCTACCAACTCCAACAAGATATCCAGAGACCGGAAATTACATTG
AGAACTTCTTTGGAGTCTGAGATCAAAATATCTCATAAAAACGTCTCTTC
ACCATTTTATTATGGAATTGTAGCCAGCCTAATATCTGCTACCAGCATAA
TAAGATAACTAATTTTTTGAGAGCTCTCGGCATCTAGTTGTGGCAGCAAC
GACAGCATTTATCAGTGTCCCACGGAAAGAACCCTTCTCGAGCTCATGAA
CCCCAGCTATGGTAGTCCCTGCAGGGGAAGTGACCTGATCCTTCAGCTGT
CCTGGATGTTTACCTGTCTCGCTTACCATGGTTGCAGCGCCAAGCACCTA
AATAGCAGATTGAGATCATAAATTACATCATCGCAAGTACAATTAAAAAA
AAGGATACTGAACATAATTAATGCGCAAAGGAACAACACACAATGCTCCA
GCTTACATAAATCATAAATCTAACGATAGGTTGCATAAATCATAATGCGC
AAAGGAACTAAACACAATGCTCCAGCTTACAAACTAACCAAGATAATGCA
CAACTATGTAAAGGAACATATGTAATGGAGTCAATGGACACTTACTGTCT
GAGCTGCAAGGCCAAGAGCAAGATCCCGAGGAAGCCCGGCAGCAACTCCA
CCATCAGCCATGGCCTCTATTGCTAAGAAAATGTACGCTGGACCACTACC
ACTGTATTCAAACATATGGAAATGCATGTCAATTTTGAAATGGTCACGTC
CTATTTTTGGTATAGCTTACTTAAATTTTATGTAGAATCTGTTACATACC
TCAAACCAGTTACAGCATCAAAATATTTCTCTTCAGCTGTCCAAACTTTT
CCAATCGCACTAAACAAGCTTTTTACACGGTCTTCATCTTTCTCAGTAGC
CTTCTCTCCCAGACACATCACTACGTAGATGCAAGAGCAACAACATCAGC
AAGAAAAATACAGTTTCAATTGTGTGAGAAATGCATGAAATGTCTAGTCC
AACTACCTCCATTTAGTTAAATTTTAATAGCATTAGAGTTTCAACCAATA
ATAGAAAATCAAAACATCACAGAACGGTAGTCCTACTGGAAAAGACAGTA
GATAATGCGTTGCCCCCTACAACTTTATGGCAAGTAGATAATAAAAATCA
ACCAAGAAGCGCAACTATTCAAGATTTTGAAGTAAAATCAATTGTATTTA
AGTCAGGTAAACCTTGGTGTTTCATTAGAGACACTAAAATAAATAGAAAC
AAAAACAGAATAAGAGAAGGTCATGTTACAATCAGTGATTATGCATGAGC
TAACCCATGAGATAATAGTTCACTTTTAGAGCCACAAGCATCACTGCATA
GTTCCATTTCATGATCAAACCCCTAACAGGGCCCAACCAGGGGAGAGCGA
AAAGGAAATATCCGTCATTCTAGTCAACCGATAACTAGATAAGAACGATT
GGTTGACAGTACTAAGTAGTATGTGCATAGTTGATAGGTAACAGGTCAAA
GAGTGAAGTGTACAAAGAGAGAAGTCCGCATATGTTACCTGATGCTGCCT
GTCCAACAGCTGAGGGAGTGTTTGGCATTACCCTAATAATTCGGCGTTGT
CCAGACCAATCCTGTAATTAAAATAGGAAATTTAAAAATAAAGTGATAAA
CTGTGACTTGAGTGGCAGTCTCGTACTCTTTATCTGTTGGAGGAAAAATA
ACTGGGGTTCAACTTCAATATTTTGATGGAGGGTACTTTTACCCTTTTAT
GTAGTTCTAGTGGTTGTTTATTTACATGTTTTAATCGGAAGGTATATCTA
TAAACTTATTCGTAGCTCCAAAATTGATATAAAATGGACCTAAAATATTT
ATATCTATCTGGTAAAAACTGTATGTATCTCTGCTTTGAAGTGTTAACCA
ACAAAATGATTGCTAAAATCAACCAAGGCGGCCAAAACCGTATCCGGATG
TAATAAGCAAGGTGTCCTGAGCTACCATAAAAAGAGACATGCCATCACTT
GCCTTCTTCAAAATTGGAATAGAGATACTAAACTAAACCACACGGCGCTA
GGCCCCATTTATCAGGAGTGAGGAAAAGGCTGAGTAAACCCCCTGAACTG
AATGCACAGTGACGGACCTGTAAATCTTGCATCTTGATGCCAGCAGCGAT
GGAGACCAGGAGCTTTTCTTCAGACAAGAGGGGCTTGAGCTCAACGAGGA
CCTGCTTCACTGCAATTCCGCATGTGCACGATTTCATCAGCGCGGAGAAC
ATAAGGCCCAAACCTGACACCTAGATCAAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.