Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040137

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040137
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040137
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGATCTCGTAACATGCCCACATCCACATGGCTAATTAACCAACAGAAGCC
TGCGTTGACCTGCAGCAGCTAGCTTCCCTTTAAGCTGTTGTCCGATCTCG
CCATGGAACATGCATGCATTGGTAGCTGCAGGGGGTGCTAGCTAGCTCTT
TCTTCTTCATCGTCTGGCGAATTCAGACAAGCGCGCGCGCTCCCCGAATT
CAGAGGTGCGTTCATGCATGAGTCTGTGTTCGATCAGCATATATTTATTG
GCTCGTTTCTTCAATATCAGGCATGAAATAAATTGATTCTTACGTTCCAT
CATGTGCATGTGCTGCCATCGACCAATAATTATTGCAAGCATTTTATGTT
TTCGTAATGTTTGATTGATCGATTGATGGGCAAATATTAATGTTTGGTCG
CCGCCGCCGTAGATCCATTCTCTTCAAAAGCCGCCTGATTGGCAGCAAGC
CTTAACGTGGGATCTAGCCACGCCATGCATAGCCGTTGAGTCTTGATACA
CCCAAGGTGACTAGCTAGTACAGGTTCCGGCCGGCGGAGGAGTTGGCCGC
CGGGGGCAGGTCGTGCGTGTGGATGTGGGGGGAGGGGGCTCTTCAAGTGG
CGGCGCGAGCTCGATCGGCCTGGATGGTGGCATAACACGTACGGCGGCAG
CGTTTCTGCTATTGACAATGGTGGTCTCCGGAGGTTCGGAGCGGTAGGAA
GGTAGAGACGGTGGGTGCTGCGAGATGGTGTGCTGCTTCGGGCGGCACGG
GTTGGGCCTGATCTGGGTCAACTGGCCCTGGCCAAACTAGTACCGTGCAC
ATTGCCCCGCTACCATGCTGCTGGGGCGCTGGGATTTGGGCCGGGCCGGC
CTAGTTTCGGCGGCCGACCTGTAGACCCAGCTTGGGTGTTGCAAGGTTTC
GACTTGCGGGTGGCATGGAGGCGTCGTGTCTATCGTGCTTGTTGCACCCC
CACTACCTTCGTGGTGCTTCGGCACCGGCCTAGATCTGGTGGTCGCCCGG
CGCACCTACTCTAGTGATCCCTAGGCGGTGCGGAGGTGCCGTGTTCACCA
TGTTCATCCTAGCTCACACTCGCGGGCCCAGCTGGTGTTTCCTCAGACCG
GCGGTTGTCCGGCAGGTCGGGTGAGCACGATGTTGACGGAGCTGCTGCTT
GGTGGCAGGGATCAATGGTGGTGGCGGATCCCTTGGTGGATAGAGGAGTA
GGGACTTGTGCTGGGGATTGGCGTGGATAGTGGCTCTCTTGCTGCAGTGC
GGTAGCGGGGCTTCATGGGTCCATTCAGGCTCGGCCGGGTTAGGAGGGCC
TAGTTTGTCACTGTGGGTGCGTCCGGTTGGCTACCACCTTCTAGTGGTGG
AAGCAGTTCCCTCCCGCATGCTGCTGTACAGCCGATGCTCGATGAAATTT
CCTTTTTTGGTCCTACCGACCTCACATCATGGGTCACCGTGAGACGATGG
TGGCGACTGCAAGACTGTGGTGGCGTATGCTGGTGGGCGGCGAGCTTGGA
GGACCATTATGAAGCATCCGGGGGTGTGGTTTTTGAGGGATCAGAAGAAA
TCCTTTATGTCTAGACTCCGACACGGTGACACCCGCGGGTGAAACCGTCC
TTCCTAAAGGGCGTCGGGTGTATCTCTTCCCAACCTCTCATTGCGAATTG
GGGAAACCACAGGACCAGTCTTATCGCTTCCCTTCTTGGAGGTGCTGCTT
GGTACGTGGCGCTTCAGAGTGCTAGGCGTGTGGTGGTACCGGGCGCAGCG
GTTGCGAGTTGTCTCCTATTTCATCAAACCACCAACGTTGGCTTTGTCTT
CTTTTTCTTTCTTCTTGTTTCTTGTTTGGTTTGTCTTGTGCTGTTTGCCC
CTATATTGGTTACATCGTTGTATCATATATTAGTATAACGGGGAAAAAGT
CTGTTTCGAGGCCTAAGTCTAACGCAGTTACGGGTTTCGTATGTGCCTAT
CTAATTACTGGTTTCCTACTAGTGATCATTGCTCGATTCGTCCACCCCTC
CTTTGCTGCTCGATTCTACCAACCCGCCTCCGCTGCTACTAGATGGAGAA
GTTTGCGCCTCTTGTTGGCTCCCATGCCTCCTCCCGTAGCACTTCCAATG
TCGGCTCCCATGCATCCTCCGATAGCACCCATGAACTCAAAACCTCTCAT
GCCTCCTCACATAGCACCATACATGGAAACCATGTATCCTCCCATGACAC
CTCCCATGTAGCCACCTCACATGCCTCCCATGGCACCCATAAACCCGCCG
CGAGAGATTATCGTCATTTGTTTCCTCGCAAAGACTTGGTCGCGCCAAAG
CTCCATAAACGCCTTTAGCTTATTGTCCATGCCATTTGTGTTCATGAACA
TCAGCTTTTGCTCTTGCTCCATTGCTTGGGAATTTTCTTCCATAGCCACC
TTCCTATCCTCGGTGGACACCTTGAGCTCCTCGGTCGCCGCCCTCGTATC
CTCGATCGCGTCCTTGTGTTGCTTGGCCTCCTTGAGCTCGTCTAGTTCCT
TCATCGTCAAAGGCTTTCTATCTTTGTTCATCTCGTTGCGATGATTCATC
AGGACCTCAAGTGATACGTGTATGTCATCATATCTGGTCTTATTTCCCTT
CACCTTGGCATGCTATCTTCATTGGGGCCTCTTGGTTATAACAAGCATGT
TGGCAGTGGTGCTTCTTTTACCTTCAACACTTGATGCTTCATCATCATCT
TCATCACAATCTACAATGGTTTCATATCCCACCAACTCTGTTGGGATTCT
TATTTGGAACCACATATATTTCACGATTCTTCCCCTTCTCGTCATTTTCA
AGATCGACCCAACAATGATGTAATGTGAATGCTTCGCCCAACTTCACGGG
CTTCCCCTACTTCCCCTTCTTTCTTCTTCCCCTAAACGAATTTTATGCAA
TGTTATTTTAAATATGACGATAGATAGAACTCATTTAGCCATATACAATA
CAATGGAAAAATAAGATTTTATGGAAAAATAGGATGCAAACACTCACTAG
GTCACTGGCATTGGTGCAACTTGGGTTCAAGTGATCCAACTGTGCGCAGC
ATGCGCTCCACTTTCGAAAATCGGTGGATAATATGCCCCATTGATGATGA
ATATAAAGCACTGGTCGCACATTGCCACTCTTGTTTCGTGCATCGAAGAA
CTCCTTTTTTCTGTGCATCGAAGAACTCCTTCATCCTTCTATAATAGGCG
TCCTTCGGTTACTCCATGCCCACAATCGGATCTAGCCCCAACTTCTTCCA
TGCCAACACAATCATCTTGTCTTCTGATATGTTGTAGTTCCCCGTTCTTC
CCCTCAGACCGTCACCCAAGAAACCCTCATTGTAACAATCAAGATTATCA
TCATCATAATTTGTCTCATATTCTTGCGATGGGGTTTCATACTCTTGTGA
TCCAACATTCATATCTTGCAAAACCGCCACATCGTCAATACTGCATAGAT
GAACAACACATATCAAACACACTCAATTGCATACAACTAATATATCCATG
GAGAACTAAAAGACCAAAAGGAGGGATATAAATTATCGTTGTGTTATTTC
ATGGAGGACGCGAGAGGTGTCCGACGGTGCAATCGGGGACGACTCATGTT
CTTCAAATGGGTGGTGGAGGTGGTGTCGAGAGAACCTCCTCGATGCGGCG
ACCTGTGAGATGGTCGTTGGCTTCAGTTTGGGGGGTGGTGACGAGTAAAC
GGCACCGTGGGTCACTCAACTTGCATATACACTTAAGTCACACATCTTTA
AAATTGAACTAACCAGTCACTTAACTTGCGATTAGGTGCACCCGTGGTCA
TAAAACGGTCTCCTGTCCGGTTTACGCCAAAAAACCGCACGCGCACAACA
CGTGAGACTGATAGCCTTGCCTATGTAATTATCTTTTTTGCCCCACGGAA
TCTATCATTTTCTTTTCATGTCCACATACAGCCGATTTGGCTTCTGATAC
ACAACCACGATCCGATTTGGCTCCTGTCGTCTCAGGCTGCTCATACGTAA
CTGCAAAGTTTTCTGTCCAAACCAATCTCACATGTCGTGTGCGTGCGGTT
TTTTGACGAAAACCGGACAGCAGCATGTTCTATGACATTGGGTGCACCTA
ATTGCAAGTTGAATGACCGGTTAATTCAATTTTAAAGATGTGTGATTTAA
ATGCACATGTCGGATAAGTTGAATGACCCATAGTGCCATTTACTCGGTGA
AGGTGGTTTTGCTATTCTTAACCTTGTCACCAGGGGCCACAACCTGCTAC
CCTTAGGCGTCGGCGGATGATTTTCGGCCTTTTGCCAACAGTTTAACCAT
CGTTCGGACAGCCTGGCTCGGATTCCTGGCCAAGGCGTCGTGAACACCAG
GTGGCTGAGAGGTGGCCCCATATATAGGGTTTGGTGGGGACTCAGCAGTG
GCTGGAGCGGCCAGCCGAGGCACATTATCAGCCGAGGAATGGGAGAAGGG
GCGACGGGGATCAGGTTAGAGCCGCCCATGGCTTTGAAGTGGCCGGTGGC
CATCGAATCGCGACGACACGCTAGGGCGAGAGATGGGAGAGGAAAGGTTT
AGCTTGGTGGTTCGTCTCTCGCGTGTTGATGTTTTCATTTTACATCACCT
AGGGAGGTGATGTATATTTGCATCACCTACACAAAAATTATACATCACCT
CCCAAAGTTTTAGATCACTGGATACATCATCATCAGTTGGAGATGCATAT
TTGACCGAGGTGATATAAAAGTTAGTTTTTACATCACCAAGCCTATTATA
AGTCACCTGTTAGCAATGCTCTAAGCTAAATGACTAACTGGACCTGGAAA
ACACTATTGACCATACTAGCTTTGCGTTCTCATGAATCTTCTTGCGACAT
TCGACCGGGTCAGTACACAACACCTCGTTCGCTATCTTTTTTTTTTGATT
CGTACTAGCTTTCTGTTCCTTTTTAAGTGAGCCTGGGGTTGCATACCCAA
AGAACATTTTACAAAGGGAAATAAATATCCGTTGTTTCCCGCCGTCTTTT
TTTTTCTGTAATCTGCAAGTGCAAACTGTATACTGGTGTGAAGTACTTGT
ACTGGGCCTCCTTCTGGATCATCATTTAATTGGCCCATCCATAAATGGGT
ATTTTCCTTCTTCCTGCAGTTCAGTACGAGTAGCAGAGTCAAAGCCAGAG
ATGGCTGAAAACCTCCTGGAAGCAGCCATATCCGGTGATTTTACGTCAAT
GCAGGCTAATGATAGACATAATCCAAGATTTTTTCTCGGAAAGACTCCAC
AGCAGAACACCTGCCTCCACATTTTCTCCATCCATGGAAAAACGATAGAG
TTCTGCACAGAGGAGGTGACTCTAGAGAGGTCTCTCCTCGAGGCTGTAAA
CTTGGATGATGAGACGCCACTTATGGCCGCAGTGATGAATGATCATGTCT
CTTTGGCTTATCATTTATTCAGAAGATGCTGTGAGCTAGAATTAAGCACG
GCCATCCTGCAAAAAGACAAGTGTGGATTCAATGTACTGCACCATGCTAT
TCGCAACGGCCACGAAGACCTTGCGCTGGAGTTGGTAACAAAAGAGCCTG
CACTGTCGCAAGCAGTGAGCAAGTGCAATGAGTCACCCATGTTCTTCGCG
GTGATGAGAAGTTTTGACAAAGTTTGCGAGAAACTAACAACTTCATCTGC
CTATTCAGGAGGACAACACGGTCGCAATTGTCTACATGCTGCCGTTAGAA
ATGGGGATCTAGGTAACAGTGATTTGTTCACAGTGATTTGTTAACATATA
GAGTGCAACTTACATTTATGTGCAATTTTTACAATTTCACTTCACACTGC
TAACAGTGATTTCTTTCCAGGAATTGCTAAAACAATTATGGGGATACGTC
CTGAATTAACCAAAGTATCAGACAAGGAAGGATGTACTCCAGTAACGCAT
GCTGTACTTTATGGAAAAATTGACATGTTACAAGAAATGCTGAAACATGA
TTCAACTCTTGGGTATGATATTAACAGACATGGTAGTCCTCTCCTTGCTT
CTGCTGCATATCGAGGTCAAGTTGCTGCTGCCCGAGAGCTTCTGAAACAC
TGTCCCGATGCTCCTTATCGCAACAGAGAAGATAAGGAATTGAGTCAGGA
CCACTCTCGTGCTCCTTATAACAAGAGAAATGCTGCCACATTGCTTCATG
TAGCTGTATCGTATGATCAGCTAGAGTTCGTTGAGTTTGTCCTGAAGACA
CCGATACTTCGTAAGATTGTTAACACGCAAGACATCCACGGAAAAACTGC
TCTCCATTATGCAGTCCAGAAGTGCAATCCTAGAATAGTTGTTGCCTTGC
TGTCTCACGAGGATATAGATGCAACAGTGATTGACAACGCTGGTCATTCA
GCGGCTTGGGGACTGTTAGAGAACATGAACAATGCCAAGACTTTAAACTG
GGTATGTACGTATGTTACAAATAATATTACTGTAGTTTAGCTCTTTGTTT
AACTCCTTTTAGGCTTAGTCGATGCCACATAAATGTTGGCTGCTATTAGT
TTAGATAAATAAACAGTAAGAACCATTTTTACGCTTTTAACGTACGTACA
TCAATTCTTCGAAGTCTACAAATCATTGATCAAATAAAACCGCCAACCCG
TTGTTTATATTGTTATATATGTGGCACTTCACATTACAACACACTCTTAA
GTTTATTGTTTTACATATATCTAAGTGTAATTTACATATCTACTTTGCTA
AAGCCCACGGCTGAGATATTTTTCAAGTCTTAGTCGATTGATTCTTCTAG
AGTAAATATTTTCTGATTCTTTTTCGGGAAAATGCAAAGACATTGCGTTT
CTTTTCATTGCAAAGAAGAGTTATGGAGTACAATCCACCGAGCAGGTGGG
AGTACAGAGCTTGAGCAGCTCGCTTATTAGGAAAAAAGGACAAAAGATCA
GTGGACATCCCAATCTGTTGGAATGATGACTCGGAGGCGGAGCACTCCTG
CCTTTGCCCACAACGCCGCTTCATCCCGGATTTTCGCATTGAGCTAGGGG
GCTAAAGGGTGTTCCTTGTCGAAGAGACAAGCGTTTCACTGCTTTCAGAT
CATCCAGGCCACGAGTAGCATAGACGAGGCTAATCCCTTGCGCATAGGTT
TGGGGGTGGCACGCTTGGCCGAAATCCACCAGCAGTCATACAGTGTTGGC
TCGCTCTCAGGTGGTCTATAGGGGATCCGCAGCCATGAAAGCATGTCGTA
CCAGACCTTCCTAGAGAAGGGACAGGTGATGAGCAGATGTTGCATCAACT
CAAAATACTGGTCGTAGAGTAAGAACCGTGGGTTGAAGTCAAGCCGGAGT
CGCCGTTCTACAGTCCAGCATATGTCCTTGATGGCTAGCCAGATGAAGAA
TTTGACGGGACGTGGAGCCCAGGTTTTCCAAATAAGCCTCCTGGCGTAGC
AGGCCGTAGATCCATGAAAGGATGCAAGGTAGCAAGATTTATCCATGTAG
ATGCCGCTTGTATTCCATCTCTTGGTCAGGTTGGTCATTGAGTGTTGTGT
ATTGAACCTGACGCCCGATGCTCAAGTATTGCCCAATTTCAATGATGCCA
ACGAAGCCGTGGATATCTCGTGCCCAGTTGTGGTTGAGGAGCCCATCCAC
GAAGGTCCTCTATTTCCGTCGTTGCTTGGGGACACATGCATAGAGCTGAG
GGGCTAATTCACCGATGGATTTGCCGTTGATCCATCGGTCTTCCTCGAAC
TTGCCGTGTTCCCGTCACCAATGACCCAATGGGTGGAGGCTAAGAACATG
TTTCTCTCGTGTGTAGAGGTTTGTAGATCAATCCCACTCCAAGCTCGCAC
ATGTTTGGTTTTGTTGTACCAGACCAGGCGAAGCCGGAGTGCTAATCCAG
CCCTCTCCATATACTGGATGCCGAGCCCACCATGAGATAGCGGTCTGCAA
ACGACGCCCCAAGTAACATGGCAGTGTCCTCCGATGGCTTTGGCATGTCC
CTCCCATAGGACCCCTCTTTCCACCTTCTCAAACATCTTGATGGTCTTCT
TGGTGGAGCGAAATGCCATAATCTGATGGATTGACATGGCATTCAACACA
GATTTAACGAGAGTGAGCCGCCCAGCCTTGTTCATCAGCCGAGACTTCCA
TGTGGGAGTTTCCCAGCAGCCTTGTTAATGAGTGGCTACACCTAGGCACT
GGTGGGCAGTCGTAACGTGAGCAGTATCCCAAGGTAGGTTAGCGGCAGCT
CCACGATTTGGTGGCTAAGTGTGCCAGAGACCATCGCCGCATCCTTCGGT
GCGCAGTTGAGCATTGTGGCAGAGATTTTTATTGTAATTCACCTTCAGGC
CCGATGCTCTGCCAAAAAGATCCAAGATCGCCCTGACGGCATCAATGTGA
AGCGGGGTTGGGTGGCTAAACAAGGCCACATCGTCGGCGTAGAGAGAGAT
TGCCGGTATGGATCGCCATGGTTGAATAGGTGTATGAGACATTTGACACC
TATACTGATCTATGAATAACAAAGTTGTCATGCAGGCATCGTTTCTGATT
CTTGTTCCACCAAGGCAGAGGTAGAAGAATAGTATAAGTGTACTTGTTAT
TCATGGATCAGTACAGGTGTCCAATTTTCTCATACTTCCGCAGGGTGACT
CATGGGAAAGTAGGTGACAATTTTTTGAGTTAAAGGTACTTCAGATTTGA
TACAATTCTGTTCATATTATTTCAATATATGAGTTATTCCTGGTGCGTAT
TCAGTGTGTTAATATATCTGTTTGATTTGATTGTTTCATGTTTACGACTC
AAAACAGTCGAAGGTCCCCTATAATATATGTTTAATTATTAATAGGAGGT
TTTTTACATGTTATGTACATGGTGAAGGTTCCAATAACAGATTACATTAA
GGTGATTATTTTATTATAAATTTAGCTACAATGACCATAGTTGCTTGCAA
GAGTTTTTGCACTCAATAAACTACATTGAATAACACTATTATTTACACGG
AAGAACATCCTAGTTTTATTTTGTATAATGTAAGATATTTATACAGGTTA
TTCCTTTGGATTCATGCAGAATGAAGTGAAAATGCTTCTGTCAAAAGCTA
ATCCAAAAGAGGCTGACTCTCTTCATAATCTTCACATGGAAGTCAAGAAC
AAGACGTCTAACTCATCAAGGAAGGATGCAAGGTCACTAACTCAAACATA
CACAAGCAACACTTCATTAGTGGCAATCCTCATTGCGACAATCACCTTTG
CTGCTGCCTTCACCTTGCCCGGAGGATACAGTAGTGACACCGGAGGCGAG
GGACTTCCCATCATGTCAAATAAATTTGCATTTCAGGCATTCTTGATATT
TGACGTCTTAGCGATGTGCTCCTCGTTTGCTGTGGCCTTCATATGCATCA
TAGCAAGATGGGAGGATTACGAGTTCCTACTTTATTACAGATCCTTTACT
AAAAAGCTCATGTGGTTAGCATTCATATCAACTACTACGGCATTTTCAAC
CGGTTTATACACAGTGCTGACCCCGCACCTCCACTGGTTGGCCATTACAA
TTTGTGTTCTGGTAGCTTTGTTGCCTATTATTACTTGGCTGCTGGGAAAA
TGGCCTGTCTTGAAGCTCAGATTTCAGTTGGGTAAAAGTTTCAGGTCTGA
TTTCCTTGATATGGTGTAACCTCATCAATTTATCTTATGGTTCTGCTTTC
TGATATTACTTTTAAGTTTATCTGTAATGTACATTATTTGGTTACTCATA
TTTTATTGTTAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.