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GrainGenes Sequence Report: AA011171

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Sequence
AA011171
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA011171
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATCGACGTCGATAAACGTTGGCTCTGGTTTGTTATTCATAGTCCGGACCC
ACATGGCACTGACTCCTCTCAGCCCACCCGCCTCTTCGAGATTCGCTGGG
CTGCCCCCTCGCTTACGCATACCCGCGGCGGAACACGCGACACCACCACC
CAGCTCCGGAGTCCGGACGGCTTCCGCTCCTCCTCGACTGGTCCGATCGC
TTCCTCGCCTCGTTGATCTCAGATCTCCCTATCTCGGCGTCCAGCCCTCC
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GTGCAGGAATATAACACCGCATTCGTTCATCTGCTTTCTTCTCTGGTGGA
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AACTACTATTACTATCTTCTAATTTTACACTTTATGTAGGCAGAATCACT
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TTTCTTATGTATTTCATTATAACAGTGAAATATTTATGACTTTGCAGGAT
AGTATCCACGAGTACTTGGAGATGATGCTATCTGTTCATCATGCATTTAC
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TTTTCTTGCACACCAGGGCAGGAAGACTTGAATCTGTATCATCAAAAGGT
ATTGGGCAGGAATGGACCCGTTATCAGAAGATAGAGGGATTGAAAGAAAC
AATAAGCACAACAGAAGAAGCGAAAAACCAGGCTCTCAGAGAATATGAAA
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CAGACTCTGAGGGAGTACTGACATCACTTTACACTAGTTTAACTGTGTGC
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ATGCTAATCCAGATGTAATGTGTTGAGGTCTAGACGCAATTTTTGTCTGT
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CCCAGAAGGTGGTCTGTCTTTGTGTGAGTTTGCTAAGATCCTGGTAGTGG
AGCATTACATATGTTTCGTTTTTTTAGAACAACGGTACGAAGTGTAGGAT
CATTTGTTGAGTCAAAAAATGGCTGCAGGCCGATTTCTTGTGTGGAGTTG
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AGCAGAGGAAACTAAAGTATTCGCAAACAGGAGCAACTGATGCAGGCCTG
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GTTTATTTTGCTCCGATTTCGACACCGACACAACCTTTCTTGTCCTACCC
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GTCTGAAATTTAATTGCGGCGAGTGGTATAACAACGAATCCGTTTACCGT
ACGTTTGCTGACTGGGCTGGCTGACGAGCTAGTGGCTGGTATTTGCTTAT
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CTGGACCGGATCGGCGTGTTGTTATCTCCACCCTGCGTCCCTCGTCCTCT
TGTCCATCAGGAATCTTATCGATGTGGATGGCTGGATACCTAGCTACGCG
ATGTGGTCTCTAGTTCAACCTCTATTTTTTTTAAAAAATCTTCGGTCGGA
AAATTTAAGCGAGTTTATCCATCACACAAAATAAGCTAGTAGGGAAAAGT
GTTGAGAGATCGCTGCTCTGCTAACTGCTACCACGAAGCAGAACTGCAGC
TCGGCCGCGAGAATGTCCAACTCGCCGTCCAGAAACGCTGTCCCCTTCAA
ACCTCTCCTCCCGTCCCCGCGCTCCCGCCTCCGCGCCAGACCCCTCACCT
CCGGCTCCTCCTCTCCCCGCCGCAGCGTATCCGCCTCCGCCGCTTCCCGC
CGCGACTTCCTCCTCCTCGTCCCCTCGCTCGCCGCCGCCTCCGCCGTCCT
CCGACCGCTCGCCTCCGCCGCCACCGCGGCCGATGAAGCGGCGTCGCCAC
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GGGACAAGCTGGCGGCCGCGAAGGTCGTGTACCTCGGCGAGGCCGAGCTC
GTGCCCGACCCCGACGACCGCGTGCTCGAGCTCGAGATCGTGAAGAAGCT
CGCGGGCCGCTGCAAGGAGGCCGAGAGGGGCCTGGCCCTCGCGCTCGAGG
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AAAACTCTGGAAGTTTAGCTCCGTTGACAATTGGCATGACGCTTGTTGCA
CATTACGGGCTCACGTTATGATTCATTGACATACAGTTGCTTCAGGAGAT
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GTTCTTTGTAATTTACCATTTTATCAATACATAGTAGCAACATATTGGCA
TATCCGCGACTAGTAATACAGACGTGCTACTAAGATTGTGACGGTCATGC
CGGAACAATAGAGTGTCACTTGGAACCATCACCCATAGATTGGTAGACCT
CATTCGAACTCTGGCGGTTCAGATCAGTTTGGGTAATGGATATAGCTTAG
GATTTCTCTACCTTTATAGGGAAGCGCTCACTAGTGATGCTGAGCTGTGG
ACATCTCTGCACCAGTCCTGTTTGCTTTCAGACATGCAATGGTTAAAATA
GCTATTGTCGTGAACCCTTCTATGGAGCTACTCTATTCGATTTAAGTTTT
TGTTCACAAAGTTTGCTTCATTAGATGAAATACACTTGGTGTCCACTTAA
TAGATGGATAACCGTTATTGTAAGAATAATGCAACTTCTGTGAGTTACAT
CTCTGCTTCTAATTAACAGCGTAGTAATCCTATCACAGTTTAATGCGCAA
GGAGTTTATTGAATCCTAACATTGATTTCATCTTCCATAAATTTGAGTAT
ATCGCCTACAAATGAAAATGCATTCTTGAGTGAGACTTAAGTTCATATTT
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TAAAGCAGTACACGTTGCACTGGCCAGCAGAGCGCTGGCAGGAGTATGAA
CCTCTTCTGAATTTCTGCCGTGATAATGGAATTAAGCTTGTTGCTTGTGG
AACCCCACTGCAGGTGATTGGAATATTCTGTTTACTGTCTATACGAAAAC
ATGTGGATATTTTTTACAAATTTCTTTAGTAACACCATGCTGCAACAGCT
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ACAGCTTGCTGCATCCTGCATAAGTGCTTAGCAGGCAGACAAGTTGTGTA
AAGTATCATATTAGTCTAATTCGGAAAATCATGCTATGATTTCCTTCTAT
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GGGGATTAGAGGTCTATCAAAAACAGAAAGAAAGGAGTATGCTCCTCCAG
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ATAGACAAGATTACTTCAACTCGCGACTCTTCTTTTGGTCCAAACTCATA
TTTATCAGCACAGGCAAGAGTAGTTGATGACTATACCATGTCTCAGATAA
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ATCCTGAAAGACAAAGTATAAGGAGGGAAGGTGAAATTCCAGTTGCTGAT
TTCTTATGGTATTCCGCGGCTAAACCTTGCACTAGAAACTGCTTTGACCG
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CCTTTTGGGATCATTGCCAGATAATGCGTTCCAGAAGAATGTCTTTGGTC
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AAGTAGGGCGAAAGAGAGCTCCTATTTTGAAGTCAGCAGCTGTTTATAGT
TGCTTTCTAGGAACATCGGCAAATTTACGGTACCAGGTAAATTTTTCTTA
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CCTAACTAACCGTCATCAATCCTGATTAGTTATGTTGATCTTTTGAGCCA
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AGTATTGAGCAATCGAGTGACCTGACCAAGTGATTTGGTTACTTCACGGC
GCCTTCAATGTCCATAAACCACATAGGATCAAGAAAACGTTGAGCCTTAC
TCTTGAATCAGCAAGCAATGGAGTTTTGTATTATTTGATAAAAAAAAAAG
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CAGAAAGACGGCAGGTAAGCATGTTTATTTCTGGCACCATCGCTTAACTG
ATAGTTTTTGTTGTGTTGCTGGCCACCTATGTCTTCTGGCGAGTTCCTCC
AGTGCAACCCGTACTTCATGCACCATGGCGAGTGACACACAGGTGGAGAT
CTCCCGCCATCTGTCCATGGACACCAGTGTACGTGGCATCTCTTCCTAGA
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ATAAAGAAGTTCCCCAAGAAGAATAAAAAGGAGAAGACACCAGAAGAGTG
TTGAAGAGAGGCTTTTTGAGCGGCAAGATCATGGCGAGTGCAAAGGCGAT
GGCGCAGGGGGAGCAAGATCACTTTGTTCTCAAGAGCGGGCATGCTATAC
CAGCCGTTGGATTAGGCACTTGGAGAGCTGGCTCGGACACTGCTCACTCC
GTTCAGACAGCCATCACAGAGGTACATCGCCATTCTCCTGGTCTCTTTGC
TTGTGTTTTCAGGGTACAGTTATGCCTCGTGCTGGGAAAGTGTTGTTCAG
TAGACTCGGTTCTCTTTGAGCAGTGTCTGAATTCAGAATAGCCATGACAT
CGTGCTACTGTTGGACCAAGAAGCTGCAAGATTTTTGGAAATCTGAGTTC
ATGGTTACCGTAGCTTCTTGGTCCTAGGCATGTGACACAGTTGCCGGTAG
AAACTCTGTAATAATCTGAATACATGGTTCCTGCAGGCTGGATACCGGCA
TGTGGACACGGCGGCTCAGTACGGCATAGAAAAGGAGGTGTATAAATCAA
AGCAGTATCATGTTTCTGTACTAGGCTAGCGGTCGAACATGTCTTTAACT
AAACATCCTCTGCTGATTTCAGGTCGGCAAAGGGCTTAAAGCTGCAATGG
AGGCTGGAATCGACAGGAAAGATTTGTTTGTGACGTCAAAACTATGGTAG
ACAACCAGACTGTCCCTTGATGTACAATTAAATGTCAGAACGTAAAATGT
GAATTTGATCGATATTTGTCTGCTTTAGGTGCACAAACTTGGCTCCTGAG
AGGGTGCGACCAGCATTGGAGAACACACTCAAGGATTTACAGCTGGATTA
TGTTGATCTTTACCTTGTAAGAAACCGCAACTAATGCCTTATTTTGTTTG
CAAATTACTCTAATTAGTGCTTAACTGCTTTATGCTTGTTATCTTATGGT
ACTCTAGTTTCCTTAAAGCTCGCTACACTTGCACCCCAAATACGCACACC
CCGTCCCGCACGCGTGCGTGTCCATTACACGTGCTAGAGATAGCCTCATG
TTGTGTGGTTAACGCTTTTCACCGGTAAACGCATATGTGTACTCTGGTTA
GATACTTCACACGGTGCGGGCAGTTGGAACTAACACCGCAGCCACATGGT
GTGTCAGCCACTAGACAGTACGGAATTAGTTGCTGGTTCAATTCCTGGAT
GCTTATTTATGCAAATTCATAAGACATGTTTTATACTGAAAAATGCTGCA
TTCTTTTTGGAACAAAAACTCTTTAACTTGCATATTGAACGCAGATCCAT
TGGCCTTTCCGGCTTAAAGATGGGGCGCATCAGCCTCCAGAAGCCGGGGA
AGTACTAGAGTTTGACATGGAGGGAGTATGGAAGGAAATGGAAAAACTCG
TGAAGGATGGACTAGTTAAGGACATCGGTGTTTGCAACTTCACCGTGACC
AAGCTCAACCGACTGCTACGATCTGCAAATATCCCACCGGCAGTATGCCA
GGTTGCACAACTTTGAAACTTTATCAGTAGTCCCAACTCCAACATGCTGA
AATATAAGCAAATAACTTTTGACCATTTATTTACTTTGATGACTTGACAG
ATGGAAATGCACCCTGGCTGGAAGAACGATAAGATTTTCGAGGCCTGCAA
GAAGCACGGGATTCATGTTACTGTAAGATATTTCTTCCGGAAAAAAAGAG
ACATCATAATGCAATACCTTTGCAGCTTTTAAATTTTGATATTCTTGGTT
TCCTATTGCTACTTTTAGGCTTACTCTCCATTGGGTTCATCAGAGAAGAA
CCTTGCTCATGACCCTGTTGTTGAGAAGGTACATATATTCAGAAATCAAA
TATTTTCCGTTTAATTACAAGTACTGTTCAGCTCAATTCAAGAATTGATA
CTGCAGGTCGCCAACAAGCTGAACAAGACCCCAGGGCAGGTGCTCATCAA
GTGGGCTCTCCAAAGGGGAACGAGTGTTATCCCCAAATCCAGTAAAGATG
AGAGGATCAAGGAGAACATCCAGGTGTTTGGATGGGAGATCCCGGAAGAG
GACTTCCAGGTCCTGTGCAGCATCAAAGATGAGGTGAGTCTGGTACTAGT
TCGTACCATACGGTATACGGTGGTAACTACTGTCCTAGAATTTGAAAATG
TTTATGCCCCTCGGTAGAGCAGAGCAGAAGGCATCAGTGCATCACTTGAT
TCCCCACCACCTGAACGTGAAATGAGATCTACTATTTTCCTAGATATCTG
TCACGCTAAATATGGTAATACAGAACTGTAGGATCCAGATGCCGCGGTTG
GACCACCTGTTAGTTTATGTGTTGCTGCTAGTCGTTTCCTCAGGTTATGG
TGCAGATAGAGCATCGTTTGATCTGCTTACTGTGGGCTCTGTGGCAGCTA
GTAGTTCTTAATTACTCCATTTGCACTTAGAGAGTTAAAACTATACAATA
CATGTCAAATTAGCAATTTCAGTCTGATGTAATAACGTGGATGAGCCTGT
GTGTGTGTGTGTGTTGCAGAAGCGTGTCCTGACCGGAGAGGAGCTGTTTG
TGAACAAGACCCACGGGCCGTACAAGAGCGCATCCGACGTCTGGGATCAC
GAGAACTGAGCCCCCCACACCTCCATCCAGTGCTGGCGAGGGTTTGCTCA
AATAATGGGCTCTGAAGGAAGGGGCGAAGACCATGTATGTCTATGAAGAA
GATGCAGGGATCAGCGTGCTCTTTACAAAGTGCAGGGAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.