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GrainGenes Sequence Report: AA034030

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Sequence
AA034030
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA034030
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAAAAGGCAAGCGCGGGGGGAAGCAGCGCGGAAACAGCGCCCCCAATTC
GCTTCGTTTCCTCCGCCGCACGGCTCCCCTCCTCCTCCTCCGCTTCCCTG
CCGCCACCGCTCCACCACCCCACTTCTCTTCTCTCCTCCTCCTCCTCCTC
CTCCGCCGCCGTCTAGCTCTCACATCCGCGCGCGGCGGCGCCCGCCTCGA
GGTGGCCTGACATCTGCTTGTTTTGGGGTTTATTCGGGCGCGTGGGGTTT
GTTGGTTCGATTTTTGCCTTTTTTTTCTCGGTTTCTCTCTGACGATGCTG
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AAGAGTGACGCTGGACTTGCTCAAGTATGTGATCACTGTCGTGGGAAATC
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GTGGACACTTCACACTTGGGTATTAGCATGAAGGATGAGTGTTTAGATTG
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ACAAGAGGGTGATTACACTGCCAATATGTATCCTTATCCAAACTCAACCT
AGTGCTTGTCCTAAATTTTATCTGTATACGAGCCTCCTAATTCGATCGGA
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GGATGTCCTGCTCTTGTCATGCAATTCTACTGCATTGCTAGGAATATTTT
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CATGCACATGGCTCACCTTGGAAGTGAAATGCTTTATATGTTCATGCATT
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TGATAGTATTGTCAGTTCATTAGTTTTGCACATTGCTGTCATATGTTCAT
GCATCGTTAGAATGTTTCTTAGGGCATTTTGAACTTGTGTACTTATGCAA
AATTTGCACCACTACTGCTAGTGCTCCTGCACATTCGATCATAACTGATA
GGATAAGTATAGTCAGTTCATTAATTATACTCATTGCTGTTATGGTTTTG
GTCCATTCTGCAGCAAGCTGCACTTGTGCTCAATGCTTCTCGGCGATTCC
GATATACACTGGACTTGAAAAAAGAGGAAGAAAAAGAACACATAAGGAGG
AAAATTAGGGCTCATGCTCAAGTCATAAGGGTATATATCCAAGCTTCTGT
TTCTGCAGTATATATGTTTTATCATCACACATCTTCCCTTTTGATATTTT
AGTTTTGAATTCAATCAGGCCGCATTACTTTTCAAGGAAGCAGGAGAAAA
GCAGAATGGCGATAGAGAATTACCAGGTAATTGCTTCAAACTCATTTCGT
TTTTGTACACATAGGATACTGTCAGTGTCTTTTATATTCTGTGTTATTTA
ACCCTGATGGTCTACTTAATCAAGGACCGTCCCACCTTGTTAATAGTTAT
TCAAATATGGCTATTTTATTACTTTAATGTTTCTTTTACACAGAAATTCC
CCCACGGGGTTTTGGCATTGGAGAGGAACAACTTACGTCGATGACAAGGG
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ACCTGCAAATTTACTAGAATCTTCAGCATCAGCATCATTAATTAATGTGG
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GGGCAAGTTTATTTTTTATAATTTTAGTTTGTGATTGTACCAATGAATAT
GTTGTGGTATCAGTGATTAATCCTTCTTACTGTGTTCTGTGTCATGAAAA
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TGTGGCTGCAGCCATTTCTCTAGCATTGGGCATCGCTACAGAGGTGAACT
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TTTTTAGCTGATGCCTTAGTGACTATATATGTTTTCCCTCTTGTGAGTTT
TAAATCTGGTTCCATAAACTTCCAAACAAGGTTAACTGTGATTTCTGTAT
GGATCAACCCTTTTAATATTATGTTTCCTTTTAGTTCTAACTTCAAGAAT
TTCATTAGGGTATCAAAGAAGGATGGTATGATGGTGCTAGTATAGCATTT
GCTGTCTTTCTTGTGATATTTGTTACTGGTATGCTGTTCTCTCTCTCTCT
CATGTTCAACTCCTAATATTTCGTGTTATTAAATATGGATACTTATAATT
ATTATACTAAAGCAAGGTGGAAATAATGTGCCTTAAAATCAAATATTTTT
GACCTGGGATTCTACTGTCATTTTTAAAGATAACCACTAGACCCCTTTTT
TAGTTTTATTCCTCAGTAGTATCCTTGGGTCCATCTTCATACATTGTATT
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TTCAAGTATATCTTTATGTTGTTTTCTCATACACGCCATTTCTTTGAACT
TCACCTTTTCTCCTTTTGCTCACTACGCCCAATGTAAGAGTGTCCAGTTT
GGACAATCCAGTTGTACCTGACTAAAGATACTTTTTGTCTTATTATTTTA
GCTGTCAGTGATTACAAACAGTCCCTGCAGTTCCAACACCTCAATGAGGA
GAAACAAAATATCCAAGTCGAGGTTTGTGAGCTTAACCTGACAAAATCTT
CACTATTTATTTGCCATTTTTAGTCTTCTGATAGTATTGCAACTGTGCTG
TGGTGATCAGGTTATTAGGGGCGGTAGAAGGATTCAAGTGTCAATCTTTG
ACATTGTGGTTGGCGATGTAGTAGCTTTAAAAATTGGTGATCAGGTACGC
TGCAGTAAACAAATATGGTCTTCTTTCACTTATTTTTGTGTTGTTTGCAT
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TATTTTAATTAGCGGCCATTCTCTTGCCATTGATGAATCCAGTATGACTG
GGGAAAGTAAAATTGTAAGTTTTCTCTTGATTTTAGACTCCTATGCAGGA
TTGGTTTGTCCATGAGTAGTAAACCTTCGATCTTTGATTAGGTTTTCAAG
GATCAGAAGTCACCTTTTCTAATGGGAGGATGCAAAGTAGCTGATGGTTA
TGGTTCCATGTTGGTGAGCAATCATATCTTGTCTTCTCGCCTCATTGTTT
TTCTTTTCTGTTTTGAAAATCGCATGTCTACGAGCAAAAAGAGTCAGTTG
AGGGCTTGAGGCTCATTTGCTTTGTTTGTGCCCTTGGATTTGGGCATTAT
TTACCTGTCAGCTAGATTAATCATTTTGTGAGGGCAGTGGATTGACCTTT
AACCTCACTCAGTGATTTGATAAATCCCACTTGCAACTGTGCTACTCAAA
TGCAGGTAACCGCGGTTGGTCTGAATACGGAATGGGGTTTACTAATGGCT
AGCATTTCAGAAGACAACAATGAAGAGACTCCATTACAGGTTCTTCCTCT
TTTTTATCCTTCCGCTGATGATCTAATTGTGAATTATTTGGAACAATCTA
TGTGCCATCTGTGTGAATTCATGGCCCTCTCTTTTCTGTTGAAGGTGCGG
TTGAATGGAGTAGCAACATTCATAGGCATTGTGGGGCTTGTCGTCGCTGC
ACTGGTTCTTGTAGTCCTTTTTGCAAGGTAAGATGCATTATGTGTTTCCC
CCATTATTTGAACAATGTCCATACAACTGAAATAAAGTCACAAATGTACA
ACCTGTGTTGTAATTGGTATGCTTTATGCTTCAGTTCAGTGATCTATGTT
GTGCTCTTGTATCCACTATATATGTACATACACAGATACTTTTCCTTTGC
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TCCTTATCTCATTCTTACATCCCAACATTTAGGTCACTATTGTTGTTGTT
GCTGTACCTGAGGGACTACCGCTGGCTGTAACACTAACGTGAGTTGATAT
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TTCTTATCACATGAATCTACATGTCAATTTAAGGTGAGAAGACTTTCAGC
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ATCTTCACTTTATTACTTTATCCTCTGTGACCATTTAATTATATGTGATT
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ACCTCAGGCTACTATCGAGAAGTTGTCACCTACAGTTACCTCTTTTGTAC
TTGAAGGAATTGCACAGAATACTTCAGGCAGTGTGTTTGAGCCAGAGGTA
ATGTCACATGTTTCCACTACTCAACATCTTTTACTACTGCGTTTAGATCA
CACATATGATAACATGAAGTCTGGTCACTATCATCTTTATAAATTTAATT
TTTGTAATTTATTTTTCTGCTTTGTGTTGAATCTTCAAGTAGTGTTTAGA
ATTTCCATCTTGGGATTATTTTCCGAGAGGTTCCTCTGCTATTCTCAGAA
GAGAACACCCAGAATTCACATTAAACGTTCTTCCATACATGTAGTGGAGG
CTGTGACGATGATAAGACAACATCTATTTCAAAAAATAGGCGGTATCTTC
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TCTATTTCACTTTCCACTGTATCTTTACTATTTTCCTTATTATTAGTTTG
TTCTGGCACACTATTTCTTGAATAGTCATATTTTCCCAAGAATGAGTTTT
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TAGGACATTAGAACAGAATAATGACCAGTCGATTGACAAAATTCTTTGCT
CACACCTACGTTTGAACTCTAAAATATATCTAAAGCACGCGTGCTAATAT
TCTGCCAACCCTTGCAAGTATTTTGCTGTACAAAAGAGGCCCCTGTGGTC
ATTTCAGTGTCTAATTTAACTTGAAAACAACATTAGTCTCTGGCATACAA
ATACAGAAATACTTCCATCTCAGGATTGACATACTTCATTTAGTTTAAGA
GTCTGACATGTATTTGTCCTTGTGTTAAGTGTGACATGATTGTGTTATTA
ATGTGGTTTAGCTAGAGTGTCAATCGTTGCATGATTGACAAGTGTTGTTT
TTTGTTCTGCAATACACACTTCAACCATATAAACTGAACTTGTCATGTGC
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ATTATGTAGTTTCCTGCCTCATTTTATTCTTTCAGGCTAATCAATTCAAG
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TTACAGAAATCTTGATCTGAAGGACATTCCAAGTGAGGAACAAAGAATTA
GCTGGCAGTTGCCAGATAATGACCTGACTCTTATCGGTATTGTGGGGATG
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GCAATAGCACTCGAGTGTGGAATACTCACTGACCCCCAGGCTTCTACACC
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AGGAAGTTGCCGACAAGATATCCGTAAGACCATAATTTGTTTGTGCTCGC
AAAATTATTAAAATGTGTCCCAAGTTTATGAGCTAACCTAATGTGAGTAC
TTTTGGTTCATTTGTTATTCTGAAAGGTTATTGTTGTGCATCTTGCCTTC
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GGATGTATTTTGAATGAAAACAAGGACTAATTATACTTGTAATCATGTAC
TGCACAGCTTAGTACAACAAACATTTATGAGTCGACATTGTTGTTTCCTA
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TTTCTATGGGCATCCAAGGAACAGAAGTAGCTAAAGAGAGCTCAGACATA
ATTATTCTGGATGATAATTTTGCTTCCGTCGTGAAGGTTAGGCCTGCCTG
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AATATCCAAAAATTTATTCAATTCCAGCTTACTGTAAATGTTGCGGCTCT
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TTGGCGCCTAGGCGGGCGCTTTGGACGCCTAGGCGCCTAAAGCGGTCGTT
TTTGCAAAGCGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGCGCTTTGACGCTTAGGCGTC
CTAAAGCGGATGCTTTAAAAACCATGATTGCCAGATTAAAATTATTTGAC
ATGTTATAATAGTTTCAACGCTAGCTGTATCTGAATATTCCTAGATAATT
GGATCTACATGACATTCACTGTTACCAGTTTCTGAAATCATTATGCTGGC
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GTATTTATCTTTTAGAGCATGCATGAGAGCTGCATGTGTTTACATTAAGA
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GTTTCTCATGATTGAAAATTCTCCTGTTTCTTTCGAAATCTTCCACATGA
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CCATAGGAAAATGCCATACTACTTTATTGCGGGTGTATGCACCCATGGGA
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ATCATTTTTGCAATATGTATCTTTCATAAAATGTTGAAGACGACAATTAT
GAAAATAACGTTGCCATGGGCTAGTAGGAAATTGTGAATAAACAGAAATG
AATTTGAGGTACTATTAAACTTGTATTGGTTTTGATATGGCCAGATGTTT
ACTTGTTTCTGTTGTTGACACAGCTTCTCTGGGTTAATCTCATAATGGAC
ACACTTGGTGCACTTGCATTGGCTACTGAACCACCAACGGACCAACTTAT
GAAGCGGACACCTGTTGGACGGAGGTTAGTCCTTTTCCTCTTGAAACTGT
TATCTACAACAAAACAAATATGTGTGCATTATACTTCTGTGTTAACATTT
ATCCTAAGCAGAATTGTGTATCTCGTTGTTCTCTTTCCCGCATAAAGGTT
GTTGAATACACCCTTCTTTTTTATGAGGGCCCCACACATTTGAAGGACTA
AAAAATTTAGCCATTACTTATTCCAACAATTTATAGGATTAGATGCGAAA
ATGGCATAAGCGTATTGGAAAATATTCATAGAATTTTATGGTACAACCAT
AAACATATTTGAAATATTTATAGGATTTTGATTAGCACTAGTATTGTGTA
CCATATAACATTCATAACATTCTTGTTCATATATTGCAGAGAACCTCTTG
TGACTAATATCATGTGGAGAAACTTGTTCATTCAGGTAAAGTTTCTTCAG
ATGTTGTCTGTCAACTAAATGTTTTACTAGGCGGTCACTTACTCAGCTCT
TATGTAACCACAGGCTGTCTATCAAGTTGCTGTTCTTCTGACGCTTAACT
TTGGAGGCCGAAATCTTCTGCATTTGACTCAAGATACCCTTGAACACTCA
AGCAAAGTGAAAAATTCATTTATATTCAACACATTTGTCCTGTGCCAGGT
AACCTCCTATCTGTTTTAAGCACCTTTCTAGCTTTATGGTTGATTTTGAA
TGTACTGTTTTTCTCCATTTTGAGTAATGAATATGTGGAGCCTCAACAGT
TTTACAGTAGCATGCTTCCTAACTCTATGCTACATTAACATGCACATCAT
TAGCTTCAAGCCTTTGCCTTCAACAGCTGACTTAGAAATGGTTTAGTAAG
ATTGGAGATATTTTATAGCAACGAGTAATTTTGAGATAACATCATTTTGT
TCATATTGCTCCTTTCTCCCTATTTGTTCAAGTATTTTGGCTAAGCTCCA
TAAAGCAGCCTTTCTCCCAAATGTTGTGTAGTCCCAGTATGGACTCATCT
TCCTCTTAATCCCTTCCCTTCAGCATATCTTGCTGCTTGACAAAGCTTAA
CTGTTTCATTTTGTCCGAATAGGTGTTTAATGAGTTCAATTCTCGTAAAC
CAGAAGAGCTGAACATATTTGAAGGAGTTTCAAGAAACCATCTCTTTTTG
GCCGTTGTGAGCATAACTGTTGTGCTGCAGGTATGAAATGATAGAAAAAT
GCAAATTTATGAGTTAATATAGACAGCCTTTGAGTCTGTAGGATTTGAAA
TTCGTCCATAATTTATTCTCAGGTGATAATTATTGAGTTCCTGGGGAAAT
TTACATCAACTGTGAGACTCAGTTGGGAGCTTTGGCTTGTTTCTGTGGGT
ATTGCTTTTGTCAGGTGAGATCCTTGTCCCAATTATGAACCTACTTGTGT
TCTAGAGAATAAATTATGCATTCCTTGACAATAAAGTATGCATTCCAAAA
TAATATAGTTATAAAATTTTCGTTCCAAGTACTCCTATTAGTTTGCTAGC
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GTTTGGACTTTAGCCTGCTTGCTTGTTAACCATTGGCTTGTTCGTGTAGC
TGGCCGTTGGCTTTTGTTGGGAAGTTCATTCCAGTTCCCCAGACTCCATT
GAAGAATTTAATCCTAAAGTGTTGGCCAAAAAGGAAGAAGCAAGGTAGGT
GACGATCAATTTTGAAAATACCTGCTGCATCTGCAACTATTATCCTTTCT
GAATCTGGTTAGCGAGCAACTGTGTAGAATCTACGATTTGTTCCCACTGT
TGCTATTTGATAAAATGGCTGTTTTTTTATTCTCAATATTAAATCATCCG
TGTCTCAAATATATACAGGTGCCGAAGGACCAACTCCACCAGTGTGAGAC
TGAACATCTCTCCAAGTGACAGAAATTATCAGCTACCAAATTCCAGTGCT
TGTTCATATTGATGCTTGCAGAAATTTGAGTACTGATTTCTTCTAACCAC
GCTAGCTTTTAGCCTGACTCGATACTCTTGAGGTTGAAGACAACATGAGT
GAGATGCTTCGTTCTCGCTGACTCGTAAACTGGGGTTTGAAGCCGTTGTG
AACAAAGGACAATATTTTACTAGCTTGACAAAGTTTAGGAACTTGGCAGC
TATACACTGTACAGATGGTGCATCGGGTTTAGAATGATCTCACCGGTTGG
GAAGTTCGCTGGTAAACAAAATTCCTTTTGGACAAGAGATGTGTATATTC
ATCTAGGTTTCTCTTCTTTTGTTCGAGTCCTGGGATTTTTTTTCTAGCAA
ACTAGGCTCTTGTGGAGAGTTGGTTTGGTCGTTTGGGTTTTCATTTGTAT
GCTTCTGATGTGGGTGAATCACGAACTTGCATGGTGTGCACTCTTTGATG
AAATGTGCAAAAGCTTTGCCTTTGCCTTTTCATTGTATTCGATTCAATAG
TGTGCGCACAAGCTGACCTAAACAAAATTACAAAAGCCTAATCTCCTTGA
ATTGAGTTTTGTGATCGTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.