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GrainGenes Sequence Report: AA030396

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Sequence
AA030396
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA030396
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCGGGCATTGGGGTTTAAGGTATCAGACTCTTACCATCCACTGATTA
GTTAAACGCATGGCCTCAAGAAATTCTGTGTGTGTGCCTGTGGCCACCCT
ATCGCACCATCTAGATCCACTCCTTCGTGCCGGCAGTTACGCATTAATTT
CAGTTTTTACTGTTAGGTTTCAAGCAGAGCAGCAGGTGAGCGGTGCTGTA
CTGTTTGGAGGGTTCATACTTCATTTACTCTGCTCAGTTACTTGTTTTGG
GGTGCTTATGCTTGTTCTAATCTACACAGATTGTTATTTCGTAACTGAAA
TTGCAGCAAACAATTTGGTGCTGATGTGCCATTCTGGGTTTGCTTTGCAG
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ACTTTCAGACTTTACTTTTATGTGCATTTGTTAATTCAAGTGTGAAATGG
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AAGCAGTTGCCGCTTTCCCTTTTCACTTATATAATTTGACCACCATTGCT
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TGAAATTCAGATTTAATAACCATGAGAATATTTTTGAATTCCATACTATC
ATAACCCTCCTTATATATAAGGTAGCATAGTCTAGATTCGTTAGGTTTCT
TGGTTAAAAATTGTTAATGGAAGGTACACATATAGTGTCCACTTCGAGCA
AATGCAAAGCTTGCGTCTCAATGCATCGATAGCAAGTATATAGTGTGGAA
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ATGGCCAACGACCACTCGGCATACATTACAAGCGATGCAACCAAACAACC
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AGAAACCCTGCCACAGGAAGAGAAAATCTAACTCTATAAAGAAGGGTAAA
ATAGTGTCCACCTTTGAATTTTTACAGTTTCTGTCAGGTTCAATTGAAAG
CGATTAAGAGGAGTAGTTTCCTGACATATTTAGTGTATAAAATATCTCAT
ATTGCCACTTTATTCCATGTGACCATGACAAGCTCTCCAAATGCCTTTTT
TAGCAGATGCCAAGTAATTCAAAATCAAGCGAAAAATGTTATTATTACAC
CAATTAAATAAATTGCCTTGCGCATAGCTTCCTTTTCCCTGACACATCTT
AAAAATCTTGGATGAAAGAGAATTTAACGAGTCATTGGACATATTGGTAT
TGCAATCAGAATGTTTGATTTGTTCTAAATGTTGATTGTCTGCAGGTGGC
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TTTTCAGAGGCAGGGAAGTATTTATAGTTAATCGATGAATAGTCGCATAC
CCTAAAATCTGAAGGTCTGTAGTTTGAGCCATGTTAAGCTGAGAAGCCGT
ACTCACATGGATCTACTGCATTTCTCAGGTGGCTAATTCACTTGTATAAG
TTAGTTTCCTCGGCAGCTAGCATCCTTATAGGAGAGCGTAGAATTCACTT
GCTATTCCTGACCCTCTAATTTCTCTCGATCTAATCCCTGCTACACTTCT
AATCGCTGGCAATGGCACCAAGACGCAGAGGACGGATTCGCCCTCCTGTG
ATCCACCCTTACTACCTTCGAAGCTTTAAGCGGCCGTTACATATAATGTC
ACAACTTTCCAGGTGGCCGTACGGACTACCTAAGTGTTTTTGCCTGCTGG
AACTATATTCATGTTTGTTTGTTTCCTTTTTTATATCTAGTATACTATTC
TTGTTTGAGAGAGTGAGAGGCAATATGCTCAGCTCAGTTTTGAAATATAA
ACATTTTATCTATTTGGAATACATAATTATGACATTGTCAATCGTTCATT
TTAGATGCAAGTCACCTGAAAACACTTGATTCCAGTATTAAGCGCAACAC
AGCAGTTATCAAGAAGCTCAAAATGATAAGTGATGAACAAAAGGATGGCT
TAATGGAAGAATTGAAAAGTGTTAACTTAAGCAAGTTTGTCAGTGAAGCA
GTTTCTCACATATGTGAGGTCAGACTTCGTTCTGCTGATATGCAAGCTGC
TGTTCAGGTATAGTAGTAACAAGTACCTCCTAGTCTTAGTACAATTGTAA
AGTATATTTTAAATCTGTATCGGCAGCCTTGCTCACCAATTTTTCACTAA
ATAAGCTTTCCGCCAGGTACTTAAACGAGTTATATTTTTCTAGATTATTA
CAGAATCTCCTGTCTTAGAGTGGATTTGTGCCTGTATGGGTGGGTGCTCC
TACTATCTACCATGCATGTGCCTTGAAATATGTGCACAGACTCTCCCGCT
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TGGTTGATATAGTGGGAGCACCCACCTATACAAGTACAAATGATTTTTCC
AATCTGGTAGATTTTCTATAATTCCAGTGATATGTCTTTTTTCCAGTTAT
GATATATGTATCTTTACTTATGTCAGCTTTGCACACTGTCGCATATGACT
TTTTTTTACGTCACTTTTATTTATTGGCATGTATCCCATGCCATGTTTTA
CAGTATCTTCTATGATTAATAAATTCAACAAAACCCATATTTTCAAATGT
GTTCTCGTGTGTGGATGTTAAATTCATATAATGAAACAACTATGTGTCTT
GAACCATATTTGATGCAGATCTGCTCACTGCTCCATCAAAGATACAAAGA
CTTCTCTCCTTGCCTTATTCAAGGACTCCTGAAAGCCTTCTTTCCTGGGA
AATCTGGAGATGATTTGGATTCAGATAAGAACTCAAGGGCCATGAAGAAA
AGAAGCACGCTAAAACTTCTTATGGAACTGTACTTTGTTGGAATTGTTGA
AGATGCTAATACTTTCGTAAACATTATAAAGGATCTCACGTCAGTGGAGC
ATTTGAAGGACCGTGAAACGACTCAGACAAATTTGTCTCTCCTTGCTAGT
TTTGCTCGTCAAGGAAAACATTTTCTTGGATTACAAAATCACGGGCAAGA
AGCTTATGATGAGGTCAGCCAGATTTTAGTTTCATCGTGTATTTGCTGAT
ATCAAAGAAAATGACAAAGGTGATCGATCTGTAGTAATTTAATAATCTTC
ATTGTGGCCCAGGGGTTCATTCTTGATATGCAGACATCTGAAAACACTCT
AAAATTTCTGCCAAAAATAATATAGAGTATTAATATGAAAATATGTCTAT
TTTCCTTGGACATGCACAGACTCCCAAATGTATGCATGTGAAAGTTCAAG
CATTCTGCTAGCCTTCATCACGATTCACGAGCAACATGCTTACCTCCTCT
TAGGTTTATTGATACATGCAATAGTTCTTTCAGTGTCCAGTTCTGTCCTG
CAATGAGATAACAGTACAACTCTTAACTACTTGTGACTACTCACGACATT
TGTTCTTTATGCTGCAGTTTTTTATGGGCCTCAATGTTACTGATGATCTG
AAGACATTCTTCAAGAAAGCCTTGAGCTCTTACTATGATGCTGCAGCTAC
AGTTCTCCAGTCAGAACATGCGGTAAATCAATTTTTTTTCAAGTAATTTA
ATGTTGTTAGGCTAATATTGTACTTTGTTAGTGCTTCAGTTTGTTTATTA
TGCAACCCTCTCATGCATAACATCCACCATGCAGTCTCTTCGTGCAATGG
AGTCTGAAAATGCAAAGATTTTGAATGCCAAAGGCGAACTAAGTGATGAG
AATACTGCCTTGTATGAGAAGCTTCGGAAATCTTTCGATCAGTTATTGCG
CTGTGTTTCATCGTGAGCCTCCCTACCAAACTTTTACTCATCCAGCGCTT
CTACAGCTGCACTAGCAGTTCATTTTGTTTGTTTAATATAAGTTTCTTCT
AGTTCTTGCCATTATTTTACAGCACCTTCATCAGTTCATCTTTATTTATG
CAATGAAAGGACCGAGATGCAAATATATTAAAAAAACAACCTATGATTCT
GTACTAGCTAACTAGTTCTCCCTTGTTCCATATTATAAGATGTTTTGACG
AACCAATTCGGTTTGCTAAAATGTCTTATACTATGAAACATAGAGAGTAG
TTACTTGTTAGGAGTCAATATAGTGTCTATCACTAGCATGGTAGTCTATA
GATGGCTATCAGTTTCTTGTGTTCATCTGAGCTTTCTTTCTTAAACAAAA
AGAAAAAATAAACAGATGCTTCAATTATATATTCACTTTTCTTTTAGCTT
ATTAGCATCTTATTAGGACCATACACATCTGTTCGCATAAATCTTGTGAA
ACATTCAAATATGTTTTCTTGCAGCTTAGCTGAAGCTCTTGATATGCAGC
CTCCTGTTATGCCAGACGATGGACATACAACAAGGGTAATAACTATGGGG
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AGCAGAGTATTCGTGCCTGGTGTACTATTGGGAGAAGCTGAACCAAAGTT
GGTAGATCAACAAAGAGAAGTTCACGAGAAAACTAGCGTAAGAAGTCTCT
CATACTGAAGAATTTTCTGTGTTGTGTGAAATAAAGACTCAGTTTGTGGC
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CATCACTTCATCTCATATGTTTAGGCACACAAATGCAATAATATGTTCAC
TTCAATTTGTATAAGAAAATAGCTAGCAATCGCCTAAATATCCAAAATTA
GGCCAAGCAAATGAGATTATAATAATCATCCGCAATGCTCCGTGGAGCTT
ATGTAAGGGTCAGCAATAATTGATTTCATGAACAGAATTATCAAATATTA
CTGCAGCAAGCTGGTGACTTCTGACTATATAGCTAGCTGTTTTTTTCTCC
ATTTTCTATATGTTCTTCTACTTCTTTTCTTTATTTTTAAGAGATGAACG
CTATATTTGCATGATAGCTGTGTGTTTTAAAAAACAAACCATCTCATCTG
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TTTTGTTTCAGGAGATTAAATTGGAACAAGGAACTAAACTTCAAGACAAT
GCTGAAACTTCTACCTCTGAACACCAATTGGAGGGAAAAGAAAATGTTGG
AGCCAAGAATAGAGAAAAGAAAGAGAAAACAGACAAAGAAAATTCTAAAG
AAAAAGATGCTGACAGAAAAGGAGATATTGAAAGGGAAAAAGTAAGAGTC
ACAGATGGCGCAACTTTGGACAACCTGCTACTGAGGCTACCAAAATGTGT
TAGCCGAGATCTAATTGATCAATTGGCGGTAATAACAAATGGATTATGTA
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ATTCTTTCAGGTAGAGTTTTGCTATCTGAATTCTAAAGCAAACAGGAAAA
AACTTGCGCGAGCCTTATTCAATGTTCCAAGGACTTCGTTGGAACTGTTA
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CCCAAGTATGCTCTTGTCAATGCTTGAAGAAGACTTTAACTTTTTGATGA
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TTAGACATTGTTCCAATTTTTACCAAATTGCTTTTGGCTCTTTCAAGTTT
TCTACTTTGTTGTTCTATAGTCACATATATAATTCAAATTCAGTACAACT
AACAGGGTTATCTGTTCTCCAGCACTAATTATTGTTCCCTGTTATATTCC
CTCTTTCAGGATCAGATCAAAATTGAATCAAAAATTAAAAACATTAGGTT
TATTGGGGAGTTGTGCAAGTTCAAAGTTGCACCTTCAGGCCTTGTTTTTA
GCTGTTTGAAGGTATGTAAATCTACAAATAAATTCACTTGCATAATCAGT
CGCTCTTTGTTATACTTCAGTTGAGTTTCTAAATTTCGTTGTGCTTTTGT
TGTACTACCTTTGAGATGGTACTGGATAGTTTCTGTTTGTGACGTATTGC
TTAGTTTCTAAATTTCAAAGTTGCACCTTCTTGCCTTGTTTTCAGCTGTT
TGAAGGTATGTAAGTAAATCTATAAATAAATCCACTTAAGGAATCAGTTG
CTGTGTGTTATACTTCAGCTGAGTTTCTAAATTTCGTTGTGCTTTTGTTG
TACTACTTTTGAGACGGTACTGGATAGTTTCCGTTTGTGATGTAGATGTA
TAATGTATTGCTTGCCATCTGATGAGCTATCGTGTAGAATTTCTAACTGG
AACGGACTATCTCTTGTGTTTTGTATGGATTATGGATTAGTGCACTTAGA
CGTGGTAGGCAGGAGAGTGGTTAAGTGATAGACTGAGAAATGCTATTAGC
TATGTATGTTTCAAGATCACTTTATACACTCATATAATTTCTGACCACAT
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TTTATTCTGACAAGGACGGCATGACTGTCCTAACTTTCCTTCCTTTCTCT
TAATATCTAGCTGGGAGTTTTTGCCGTGCTGGCAACATAGCCTTTTCTGT
GCATGAGACCCAGGCTGCACGCTCATGCGGGTTTATCAGCCTTTTTATTC
TTCTAAGTTGTGAAAGCATTGCACCACACTTAATTTGGTGAAGCCTATTT
TTTAAGTGAAATATGGAACCCCCCACATTAAATTTGGCAAAACCTGTCAC
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CCCTCTTTGTCCTTATTTGGTGTTGATGTGCAGCTGGTAGCAGCTGCTGC
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TTTATAAACTTAGCAATAACATGTCCTGCGTGTATAATCCATAAAAACCA
GGACATAGTTTATCATATTGTAAATTTGCAACACCAAACACATTAAACCA
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TTGCTTAGATGATTTTACCCATCATAACATTGATGTGGCCTGCAATCTTC
TTGAGACCTGTGGGCGCTTTCTTTATCTCTCACAAGGAACTACAGTTCGC
ATGTCAAACATGCTGGAAATACTGAAGAGGTTGAAAAATGTGAAGAATTT
GGATCCACACCACAGCACACTTGTAGAGAATGCCTATTACTTATGCAAAC
CACCTGAAAGATCTGCCAGAGTCTCTAAAGTTCGTCCACCTCTGCATCAG
GTAAGGCCTTTTATCCCTTATCTGATCTGTTTTCTTTCTGATATTCTGAC
TTATGTGTGTACATAATCTTTTAATTGAATAACCAATATTTTTTTTCAAT
GCATGCAGTACATAAGGAAGCTGCTTTTCTCAGATCTTGACAAAACAAGT
GTTCAACATGTTCTTCGTCAGTTACGGAAGCTACCTTGGGCTGAGTGTGA
GCAGTACCTGGTGAAGTGTTTTCTTAAGGTTCACAAGGGAAAGTATAGCC
AGGTTCATCTGATTGCTCTTCTAACTGCTGGTCTTGGTCATTACCATGAT
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ATAGTTCGAATTTTTTTTCGTTGATTAAGTAAACTATTACATGATAACTG
AGTAGCAGAAAGCATTTTACATTTTGCATGAAAATAATATATGGCATGCA
AAGTTGCACCGTGACTATTATTGGATCAGTCTTTAAAACTATTCTGTGCA
CTTGTATGTCTATCGTTCTTCCTTTACATACTCCGTGTTGGTGCCCAAAT
TACCCTCTTCATTCTTTTCTCTGAGCTCTGACTATCCTTAAAAAAGCATA
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TTGATTCAATGGCTTGGCTGACACAGTTGGCTCCTTGTGTATCCGGATTC
AGGTTCTGGAGGAGATTAGAGTTGGACTTGAGCTGAATGACTATGCAATG
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CGAGCATATTGATTCGTCAGTTATTTTTGAGACACTGTACCTTCTTATTG
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ATCAAAACTTACATCTGCTATCTTTAGTTGATTTGGTTTATACTGATACT
GCAGCAATCCAGGTACTGGCATATATATTGTTAAGTGCTTCTGATATAGT
ATATTTTTGAAGAAACCCATGCACTTACAATATGACAACGCTCTTGATAC
AACCATCTTTTACCCTGCTATTCCTTAACTTATTTTATTTTATTTTATTT
TATTAAATTTATTGTTTAACATGCTTGGTATGTATATTTTCTTCATTCGA
ACTGTGTGACTTGTGAACCTCCAAAACAATGTTCATATTTCTTTTCTGCA
ATCCTGGCTAAGCATGTTTTAAAAGAAAAAAAAAAGTTACCGAGCATGAT
TTCCACTCTTCGTCTCTAACGCTTTACGCATTCTTAATCACATATATTTT
GAATTAGAAGAATTAGTATATTTGTCACTTTTAATGAGTTTATTCATTGC
ATTTATCCTGTGCAGCAAGATGTGCTTGATCCCCCAGAAGATTTTTTCAG
GATAAGGATGATCATTACACTTCTCCAGACTTGTGGTCACTATTTTGATA
GAGGCTCTTCAAAACGAAAGCTTGACAAGTTTTTGCTATATTTTCAAAGA
TATGTTCTCAACAAAGGGCCATTGCCACTTGATGTCGAGTTTGAGGTTCA
GGTTAGTCTTCTCTAAAAATCAGCAGCATATTAGAGGTTGCATCTTTAAA
GCATATAAATACATATGCAAGTCTTCATTGCATATGCACTGTTAAATCTG
GCTGTCGCTTGATAGAAAGAGAAACTATCTGGATATAGTTGGTAGTGACA
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AAGATCTAGAGAATCCCTGTCCACGTATTTATGAAAGTGAAAGTAACTGG
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GTTCATTTTTTCTGTTAGTGGACATGGAACCGTTTACTTCCTTTTAGACT
GCCGTAATGTGCTTAGCTGTTTACATCCATGTTGGACTGCTTTAATTTGC
TTTGCGAATTGTGCAGTACTCACATAGCATGCTAGATCATAGTAGAGGTG
ATTATCCTTTTGTAGATTAACAGATGTCTCGGCAGTGAAAATAGCTCCTA
ATTTACTTATTTTGCGCCTGGTGCAGGATATGTTTGCTGAGCTACGACCT
AACATGACTAGGTATTCATCTATAGAACTGTTGGCCTCTGCTCTGGTTGA
GCTTGAAGAGAATGAGAAGACAAAACAATCTGAAAGTGCTGCTTTTGATG
CCAGCTGCAAAAGCTCAGCAAACAGACCTGACAAAAACGGTAGGCATCAC
GAAGAAGCAGTAGACAGTGAAAGCTATTCAGGTAGTGGGAGCATCCGTCG
TGATGGACATGAAGACAGAGACTCCCTGTATGAAGAAAAATCAGATGATG
GGTCGGAGAATGGCGTCGACAGTGCCGACGACGATATGCCTGCTGGTTCT
GATGAAGAAGAAAATGTCAAGGTTAGACGCAAGGTGGTAAAAATTGATCC
TAAGGAGCAAGAAGATTTTGACCGGGAGCTGAAGGCCCTTCTACAGGAAA
GCTTGGAGTCACGTAAGCTGGAGCTACGGGCAAAGCCCAGTTTGAACATG
GCCGTGCCGATGAGTGTCTTTGAGGGGTCAAAGGACCCAAGGGCCACTGA
AACTGCGGGTGGAGAAGAAATTACAGCCGAGGAAAGTGGTAATGCTGGGG
CCAAGGTGTGCGTGAGGGTTCTAGTGAAGAAAGGGCACAAGCAGCAGACG
AAGCAAATGCTCATCCCTGGGGACTGCCTGCTTGTTCAGAGCACAAAGCA
GCAAGAGGCGGCTCTGCTGGAGGAGAAGCAAAGCATTAAGCAGAAGATTC
TTGAATACAACGAGAGGGAGGAGGAAGAATTCATTAGAGGGTCATTGCAA
ACTTTGTTCTCGGGTCAAGAAGGAAGCAACAGCCCGGGCAGAAGTATCAG
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GGCAGCAGCGGTACTACGTCGCTGGGGGGCTCTACCATGGTTATGGCAGG
GGAGGGTGACCTTCTGAGGCTTAACTGAATTCAGGGTTTAATTCGTGGCT
GCCTTGTGCAAATGGAACTGTTTGGGTAGTCTTGATCTGCCGGGCTAATA
TGGTTGCAGTGACATGTAATGTGTGTGGGTTTAATCTCTCCGCTAGCAGG
TTGAGGAGTGCTGTTAGGAGGTTTCTCTTGTACATAGGATGTTCTGACTG
CCTCGGATGCAGAATAGCTTCCTCGAGTTCCCAAAATGCACGCACCTGCA
ACGCAGGTTGCCTGATGACTTTTCCCAGATCCAATGCAGACGGTAGAACC
TGAGCACATAATCTACTAGTCGAATCTACCAGTAGTAGTGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.