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GrainGenes Sequence Report: AA021547

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Sequence
AA021547
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021547
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCAAACAGCAAAGGGTAAAAAGTAAGTGAGAGAAGGACCAAATCAAGAA
GCAATAAGTTATAACTGGTATCTTCATCAGGATACACAATTCTATGCCGG
TGAAGGGTGGAATTATCCCTTCCCCGGCATTTTTTGATCCCGGAATATAT
ACTCTCCTACGCCCGCAGGAATTTCTTCCAGCGAACCTCGCTAATCAGCC
ATCCCTAAATACGCAAATCCGAGTGAGTTGTATCGGGCCTCCTTGGTATC
TTAGTTTTTGTTTGGATCGTGCACAGATCCTTTCTCTTCGAGCTCTGATT
TGCGGGCTTGATTTGTTATTTATTGGGTATTCGTTGTTGCCTGGGTTCAG
ATTACCCGAGAGTGTTGATCTCTTCCGTCGGTGTTCGTCGAATTTGGGGA
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TGTGAATGGCGTCGAAGCAGGCTTTAATATGTACTTGGATAGCAATGGTG
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AAGCTAGTGCTGGGGATGGGAAGGTACTTGCAAGACAGAGCACCATACTT
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CCTTCCAGTAGTCATCACACAGATGCTGACAAGGCTAATCAGGCCGAAAC
CACAAAAATGGTATTTCCAGATTGTAGCTTTGATCATTACAAAGCTGTGG
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AGGAGGAGTTCAGGAGATGAAAAAGAGCACTGTACACAAACAACTAGTGT
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GTTGCAGGGTAACTTTGAAGATGGTACAATAAGGGAAATGCATGTGGAGG
AGGTCCTTTCCCATGGCATTTTTGAAATTCGTGCAATCGAAACAAACATT
ACTAATGGTAGGAGTGAGGTGGTTGCACAGTTTGTAGCTGTTGGTTCTGA
TGGGGTCAGCCAAAATTTTACTCAAACAAATTCACCAACTTATAGCACCA
CATATTTTTCAAGTGAAAGGCATGATGGTTCATTGATTGATTGTGGTCAC
GATGCATGTCAAGAGAAAGTGGTCAGTATCAGTAGCCCAGAGATTGTGGA
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GGACACTGTTTCAAATGATCATAGTACCCGCTCAGGTAATAATTTAGCTT
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CTTGGAAACTAAAACATGCTATGGTGAACATGATGTTTCGTTCATTCTGA
CATCAGAAATGGAAGTTGTGAGCAGAGAGTGCCCTGCTCAAATAGATAAT
TTCCCTAGTAAAGTGGAAGGTGAAGTTTCACCAATTATTTTTGGTTCCAG
TTTGAGTGAAGTCAACACTGAAAATGCCAAACTAGATTATGATGAGAACG
GATCTAGTTCTGCAAGTGGGGTTGAAATTGGGCCTGTGCCTGAGGAGCCA
AGGGACGGAGCAGAATCAGTTGTGTCACTATCAAATCTTGTTGAGAATAC
AACTGTTTTTCCTGATAAATCGGGAATTGAAACTTCACTTATTTCAGATT
CTTCCAGTTTGAGCGAAGCCGAAGCAAAAAACACCAAACTGGAAGATAAT
GCGAACAGACTTAGCTCTGCAAGTGGGGTTGAAATTGGGCCTGTGCCTGA
GGAGCCAAGGGACGAAGCAGAATCAGTTGTGTCGCTTCCAAAGCTTGTTG
AGAATACAACAGTTTTGCCTGATAAATTGGGAATTGAAACTTCACCAATT
ATTTCGGATTCTTCCTATTTGAGCGAAGCCGATGCAGAAAACGCCAAACT
GGAAGATAATGTGAACAGACTTAGCTCTGCAAGTGGGGTTGAAATTGGGC
CTGTGCCTGATGACCCAAGAGACAGAGCAGAAACAGTTGTCTCAGTATCA
AGGCTTGTTGAGAAAACAACTGTTTGGCCTAATAAATTAGAAGTTGAAAC
TTCACCAATTATTTCAGACTCAGCATCAGATTCTTCCAGTTTGAGCAAAG
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GCAAGTGGGGTTGAAATTGGGCCTGTGCCTGAGGAGCCAAGGGACGAAGC
AGAATCAGTTGTGTCGCTATCAAAGCTTGTTGAGAATACAACTGTTTTGC
CTGATAAATTGGGAATTGAAACTTCACCAATTATTTCGGATTCTTCCTAT
TTGAGCGAAGCCGATGCAGAAAACACCAAACTGGAAGATAATGTGAACAG
ACCTAGTTCTGCATGTGGAGTTGAAATCAGGCCTGTGCCTGATGACCCAA
GAGACAGAGCAGAAACAGTTTTCTCAGTATCAAGGCTTGTTGAGAAAACA
ACTGTTTGGCCTAATAAATTAGAAGTTGAAATTTCACCAATTATGTCAGA
TTCTTCCTGTTTGAGTGAAGCCGATGCAGATAACACCAAACTGGAAGATA
ATGTGAACAGGCCTAGTTCTGCATGTGGAGTTGAAATTGGGCCTGTGTCT
GATGACCCAAGGGATGAAGCAGAATCAGTTGTGTCGCTATCAAAGCTTGT
TGAGAATACAACTGTTTTGCCTGATAAATTGGGAATTGAAACTTCACCAA
TTATTTCGGATTCTTCCAATTTGAGCGAAGGCGAAGCAGAAAACACCAAA
CTGGAAGATAATGTGAACAGACCTAGTTATGCATGTGGAGTTGAAATCAG
GCCTGTGCCTGATGACCCAAGGGACAGAGCAGAAACAGTTGTCTCAGTAA
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TCTCCAATTGTTTCTGAATTATCCAGTTTGAGCAAAGTCGAAGCAAAACA
TACCAAACTGGAAGATAATGTGAACAGACCTGGTTCCGCAAGTGGAGTTG
AAGTTTGGCCTGTGCCTGATGACCCAAGGGACAAATCAGAAGCAATTGTG
TCGTCCTGTGAGTTTTTAGACGAAATTCAGTTTCAATTTAGTGACACTAG
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CAGGTGGAGTTGTACATGATGAAGCTGATGGTAATGCAGATGAAGAGGAA
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AAGGCCTGAGACTAGCATTATTCCTATTCCTGGAAGTGAGTTGCATCTAA
GTGATAATAATCTAGAGGCTAAATCTCTACCGAATCTCCGTTCTCACATA
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TAGTGAGAGTAGTGTGGTTGATCCAGTCAAGAGTAAGGTTTGTAGCTTTC
CAGAGCAGGAACTAGAAGGCACTGGTGAGTCAAAACAAGATATTTGCGCA
TCTGAGCTTATCAACAATCCAGTGCCTGACGACAAGAAACCTGATGACCT
GAAAGTTGATTCATTCAGTCCTTTTGTAGGTGAGTTTACCAATATAAACT
ACTACTTCTGTGCACTATAAGGCTTTTACAATATTGATTCTGCAGATTAA
ATGATGCTTATTTCTGAAATCTAATTAATAGTTCTGTTCGTGCGGTATGT
GTAGTGAATTTTGTAGACATACCTCCCATACATCAAATTTAGTTATTCGT
TTTCTAGTTTTTTCTACTTCTATTGGTTACCTGCAGTATTGTCTGTGTCA
ATGTAATAATCTCTAGCTGTGTCATTTTTGTAGAATTATCCCTATGCAGG
CACTTGTTATCTGAAGGCATGGGAGCAGATGCTGCATGCAGAGCCTTTGA
TGCTGAGAAGATAACCTTGGAGAAGTTCCGTGCCATGAAGCAGTCACTGA
TAAGCGACAACAAGCTAGTTGTTAGGATTGCTGGCCGTTACTTTCCCTGG
GATGTAGCTTCACCTGTCGTACTGGGGATGGTTTCTTTTAGCGAGGAACA
AGTCTTTGAACACCAAGGTATGATAAAGGTGGAGCGAGTTGAGCCCAGCG
CAACGCAAGTCAGCAGCTGGAGAATCTGGCCATTTAGTTTCAGGAGAACA
AGCACTATGAATGCTATCCAGCCAGTTTGTGAGACAGTTTCTGAAAGCAC
TGTGGAGAATACCTTATCCAATCCTGTTAAAGACTTGGGCGGAGAAAGAA
ATATACCCAGGGCGAAGAGGATCGAGAATACTGTATCCGTTGTACAGAGG
GTTGAGAGGAAGGTGCAATCCCTCACTCCAACATCTGAGGAGCTCGCATC
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CAGATGTTGACGGAACTATCACCAAGTAAGTTGCGAAATCTAGTTTTTCA
TTTGTACTTCTATTTAAATTTTAGACTCCGTTCCTGATCACCGAGAGTAG
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TTTTTTGGTTGATGGAATAACCTATCTACTTATAAGAGGGAGCGAACAAA
ACGCTAATATGCCCTTGCCACTGGGTGGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCTAAGAGCCGCACGACCCCGCTGAAAGATTCGGTCGGACATTATGT
TAGTTTTAGATGAGGAGCTAACACACCTGTGTTAAACCCGGTAATTTCGC
TGGCCAGCTGATCGGTCAGGCAGTCCTGGAGCCAGTTGGACGGCACATGG
CAGGACCACCCGGTCTAATGAGAGAAGATGTCTGACACACAGATCAAGCG
AACTTTGGCGATCTGTGTTTCAGGTGAACAAGATAGTCAATTTACTTGCA
AGGGGAGCAATCAGGTGAACAAGATAGTCAATTTTCAACACCCACAGCAG
TAGAAAAGAATTAAATACTGGATCGGTGTTGTAAGAAAGAGCCGACGACT
TGCACGGTACTAGTCAGATCGGCCCACCCACTTGAATGATGGTCACCCTT
TTTTTCCCGCTTAACTTGCGCTCAGCGTTGCGAACATTAAATAAAGCGGC
CAAACCATTGATTGACGATCGCCAGCGTTGCACAACATTGACCAGAAGTT
GCATGTCGGCCGTCCACGTTGTGCATTTTTTTACGGTGAGGCGTGCATTG
CAGGATTTGCAGACTGCTCACCTGCGGGTTAGGGGTCCTGCGTAGTCTCC
TGCACCCGGCAGTCGCTTGCTTCAATGCACACGGAAGGGACGCAGAACCG
ACGTCGCTCCATTCGGAGGAGCGACGCATGGACATGGCCTTCGCCGCTTC
TGGATTTGAGCACGTGAAACTGGTTGGAGATAGCGCCATTCTCCGACCTC
GCCGACGACGGAGGCATGGTGCCGGTCAAAACAAAGTTCTTTTCCGGCAG
GCCGACACATGATCTTCGCCAGACAGCGCGGCCAGCGGGAGCTCGACGGC
CAGCCCGTGGCTGGTAGCAACCGCGGAGAGATCCCACGAAAATAGCTGCA
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TTTCTTTTCCCTACAAGTATGGGAACTTGTGAACCCCAGAATTTGTGACA
CGACGCGAAACAGATGACATAGACGTGCGCGAAGAGTCTAATTAACCGCT
CGCTCCGTGGAAATTTCAAACCATCTACCCATTGCTTCGCAACAGATTTC
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ACCCACCAAATGAAGAGACGACACTAGCACCATGCAAACGTGTCACAGCC
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TAGGTTTTGCAACTTTTCTGGTACTTCAGAACAAATCTCGAGTGCATCAT
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GAATTTAGGGGCATTTCATCTATCTATGCCCTCCTATGAAAGTTTTTTTT
CCTAAAATTTACAAATATATGCAACTTTTACTGTAAATACAGGTCTGATG
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TCATTATCATCTTCTCCAACTAGAGAAGATTCTCCAAATGCCTGAAGAAT
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TCAATTGTGTTTGTTCTTATGGCATTCCACAGGAAAATGGATATCAACTG
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GTAGGTTCACTCATTTTGCTCTGAACCTACACACTAAAAGGCGTCTAGAT
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AGGATGGAAAAGCACTTCCTGATGGCCCTGTTGTGATATCTCCTGATGGC
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TATATCCACCTGTGATGATGCTCAGAGATGAGGCCAGTACGAAATTTAAC
AAACTGCTGACAGGCTTACATGAATCATTTGATCAACTAACTTCAACATC
CAAACTTTGAGACTCCGAAATGACTGAGTGCACGCTGGACTTTTTAATTT
TATATCCATGCCAAATGAATTGGTACTGTATTAAAACCCAAAGTTCCAAT
CTCGGGGCAAACAAAACCAATGTTCTATGGTTGAAAGACCGAGTGTGGGA
TAAGATACTCACTATCCCTTCTTACCAGCACCATGATGAATACTTACTTC
TTTATGTTAGATCTAATTTAGAACTCTCTGATGTTGCTTTTTGACATTGT
GTTGCAGTTATTAGAAGAGCCCCTCATGAATTTAAGATCTCATGCCTAGG
GGTGAGCAACTAGTAGCGCACACACAAAATCAAGAAAAAAATCTTGAATT
ATTATAGTACTGCTGGGAAATAGAAGTATGTATTGATAAAATGTTCCATG
CAGACTATCAAAGCACTGTTCCCTCCCGACTCGCATCCTTTCTATGCTGG
ATTTGGGAATAGAGATACAGACGAGCTTAGCTACCTCAAGGTTGGGATTC
CTATGGGCAAGATCTTCATAATAAACCCCAAGGTATTAACATTTGGAAAC
CGATGGTCTTTGATCCGCTCCTCACTCCAGTCCAACAAGCTTGTCCATCT
ATCTGCATGGTTGCATTGGAGTCCAGGCAGTGAAGGCATGGTTTCTCCGG
AATGGCATTTCTTTAGGAAAAGCTGTGTTTATGTTTTCCTATCGTGCAGG
GTGAAGTTGCAGTGAATCGCCGGGTTAATACCACCAAATCATACATGTCC
CTGCATGCTCTTGTCAATCGGATGTTCCCTCCTATATCATCACCACCGGA
GCAGGTTTGTCATGTCTTCTAATCCATGTGCAGTGTTTGTCCATCAGTCG
AAGTACCTTGACCTGATGGTGAGATCTTTGTTATTTCAGGAGGACTTCAA
TACCTGGAATTACTGGAAGATGCCACTGCCTGATATTTGAGACACAATTG
CACTGTGTGCACAAGAGCGTGCTAGTTCTAGGGCGCAACAGCAAATGTTC
ATAAGAAGAAGGCAAAAGATGGCGAGGAATAGCGCACTGAGGTATGAATA
TTTCCCTGCTAGTTTCTTGCACGCCTCACGTTTTGGCTCATTTTCCATCC
TTCTGTTTCCCCAGGTCAAAAGTTTGTTGGCTGGTGATGCGCGAATGCTC
CTCCTGGTATAATCTCGGAACATCGTGTATATAGGTTACATTAATAGGCA
GCTTACAGTCTGTACTGACCAATGTGGCAGCAGAATTTCTGTGTAACTAG
TTCATAATCTGTTTGTAGTCCATCAGAGCTTGTACTATCTGGAAAAGGTC
TTCCCCTCCATGATCTGCAAGTGGAATGGAGGGAGGCAATCTGGGAGAGT
GTTGCTGGCTTGCTGCTCTACTCTACTACATGGCTGTACCAATGTAATTT
ATGTAGAAAACAGCAGTTAAAATAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.