Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018301

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018301
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018301
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCCCGTTACGTCTTCTCTCTCTCCCTGTTCTCGTTTACCGTCGAGCCTAG CGCCGGCGCAGCCACCCAGCGCTGCCGGCCCCACGCCGCATCGCGCCATA GCCCCCCCTCTCCCGCTCTCTCCCTCGACCCATCTTCGCGCCCGTTCTTC TGGTCCAGTGAGCCCCACCCGAGCCGAACCCTAGGTCCGGCCGGCAGCCA GAAGTGCAGGGCGGCGGACCGTCTCTCGACGTCTTCCACCACACCGCTCC CGTTCTCCTCTCCCGTGCCGCCAGCTTTGCCCGCCCCCGTCCCGCCCGCG GCCCCTGCATAGCTAAGCCCGAGTCACTGCTGTGACATGAAGCCCAAGGT CGCAGCTGCCGCCGGCGGTGGCGAGAAGGGCCGCGGCGTGGACCCTTTGC TACCGCGGTTCAAGTGCCAGGAGTGCCACCGGCGCTCGTGGTTGTCGGCG TGGAGTCCTTCCCTGATAAGCAGCCTCCTCAGGCCAACTCTGGTACCTTT CGCTCCCCTTTCGTTTTATGAGTCTGTAATGATTGCATCAGTTGTAGTCA AGCGCACCTTTGTGGTAACATTCTAGGTGTTGGATGATTCGGCACAATTG AATTGTGTGTTAGAATTTTAGTTCACTAATTTAGTTTGTCAAAACGTCTT ATACTGTATTAGTGAACAGAGAGGAGTAGATTCTAATGAATTATTGACAA CTGTTTCTGGAGAAATGTAGCTTTTTACTTCTTTTCAACTGATATTAGAA CAGATATCCAGGTATGTGCATGGTTGAGTTGGATTTGTGGTACCATTATG TTTGATATGGTAGTGGAACCTATATGATGCTTTTGGAGATCATGTCCAGG GCTTTAAGTTTTAGCACAACTAAATACCCTCTAACACTTATTTCCTTTAC TGTTTCGGATTGAAACTAGAATGTTCTCCCTAGTGGTAGCATATTTAGTT TACACAACATATGTCTCTCTTTACAATCTTATCATGTGGTGAATTACTTG TATTGGCACTCACATTTCAGTAAACCTTGAGCCAGAAAATGCTTGCATAT ATACATAGGAATATATACATGTAAAGGTGATGTAAGGTGGGAAAATATTG CTACATTGATCATGGTGCTACTGCCAACTGTTCCTTTTTATTTACTTCTG ATGATGCTACCTGCCAAATTACTTCCAATTACTGTCAGTTCAAAAACTAA CTACTTCATTGCTTAGCCTAAGATAATTGTTGAAATGTTTCCATTTTCTT GTCAACGATAATTAAGTATACTAAGATTCTATTTTGTGGTAGTAGTGGTT CTTATGTATTATGCCATTAATGGATACAGGTATGCATGCATCCTCTGTTC AGGGCAGTATTATGGGGGCGAGTAGGATGGACAGTTCTTATGTTGTGCTA TCCAAGCAGAATAAATCTCAAGCCCCTGGAATTCCCCCACGCCCACCAAG TGCAGCAGCCCGGCATGTCGAACCTAATCAATCAACAAGAGCAATAGAGG GGTCATATATAATGCTTCCACCTGCTGCTGCTTCCATATACAAGACATCC GCCTCTGAAGGAGGTGGTGCACATTTGCCACCTCCGAGTCTTAACTCCAC TAGCCATTCACAAGGAAACAATTCTGGATTTCACTCTAGTGTGACTGTAT TAAAACGAGCATTTGAGATTGCTAGTTCACAAACTCAGGTAAAGTTGCTT AAATTATATCCATATTGAATGTGTGGCGTTTGGATGCATTTGTTACTGTT TCATGTTATGCAGTCAACTTGCTTGTTCACAAACTCAGGTTCATTAAGTT ACTTAAAACTGTCTATATTGAGTGCATGCACGCATATGCATTTGCTTCTG TTTCATCAGATTTGCATTATTTTGTGCTGCTGCATGTTGTGTACATTGCA TCACTACATTTATGAGTGGCTTCATTATTAGAAGCTCATGATTTTTTACA AAATCAATGCTAACACATGCGTGAATATGAAATATATTTGCAGGTTGAGC AGCCACTCTGTCTGGAATGTATGAGGGTGCTCTCTGACAAGATGGATAAG GAGATTGAGGATGTAAATACTGACATTAAAGCTTATGATGTGTGTCTTCA ACGTTTGGAGCAAGAATCCTACAACATCCTTAGTGAAACTGATTTCAACA AGGAGAAACAAAAGGTGCCGATGTCTGTTGCTTATGATGTGTACACGTTA GTGCTATGCTAATTAATAAGTTTACAAGCTGCAGGGTTTACTGTTTAGCT GTTATCCTACATATAGGCCTTTATCATACTGACCTTGGTGTTGTATTTTC TGAAACAGCTAGTTACAACCTGGACAAGTAGATAGCAGTTTATTTTCTTA GGGCTGAATTGGTTTCTAATATTTTTACCTAGACTAATAACCTATCTAGG TAAGAGAGATGCTCAGCCAGGGACAAAAAAGCACTGGACGACAGGGAATA GTTTTTATTAATAAAGCATACATGTAGGAACTGCACAGTACCTTTACATG AAAAATATTTCATTTCCAATACATCAGTATAAGCAATTACATTTATATAA ATATATTTAAGTGTAGGAGTTCATGTTGTGCAGTGTTCATGTAGAAGACC TTTCTTATGTCTTCATATTTAAAATGAACATTTTAAGTTTCTTGACTGGT CAATATTCGTTAGTTTCTTATAGGATACACAAATTGTATTTTGCATCATG TATGTTCTTTCATTTCAGATAGAGGAAGAAGAAAAGAAACTAAAAGCTGC TATCGAAGAAGCAGAAAAGCAATATTCAGAAGTTAGTTCTGAGATGAAGG ATCTGGAAACAAAGTCTAAACAATTTGAAGAATTAGAAGAGCGGTTTGTG TTTTCTTCACCACGCCACTTTTGGTTCAGGCATAATATTATTACTTCCGC AATCCATCTATAGGAAGAAGGATGCAGTATCAAATCAAGTTTTATTACTC GTGGGTGTAAGCATGCATACTTGGCACTAATTGGAGCATGCATACTGTGG TATTGTTCTAGAGTATAAGTACAATACGGTTACAGTAAAAAGCACGAAGA TTACTAAAGGCATCACAGCGTCATGATAGTGTTATAATGTTTCTAGTATA TAACTATATATTATAGTGGAAATGTTTCTAGTATAGTAACAACTCACCTT AAACTATGATAGCTTGTATCTATTTGGTAGTCAACTGAAAATAGTTCTCC ATATGCTTGGCACCAAAAGACATCTCCGTTGGCTAATAATATCACACAGA CAGGGTGATGCTTTTCCAACTACGAAGTGGTTTTGGGCAATCTGAACTGT TCGCTGGCTCCTGTTAAGCTCTAACTAATTTTAACCAAATATAACTTATC ATATTTGTATTCAGGTATTGGCATGAATTCAAAAGCTCCTGTCAAGCTCT AACTAATCTCTAACCAAATATAACTTATCATATTTGTATTCAGGTATTGG CATGAATTCAACAGCTTCCAGTTTCAACTGACATCTCACCAGGTATATAC GCATTACAGGAGACAGGAACTTCTTCTTGTCAGAATAATAACAGATTAAC AGTAATACTGTTCTCTTATCATATCTTCAGATCTCCTACATTCTTGTACA AAAGAAACTTAATAGCATTTTTTAAATTATTGTACAATCAGCCATACATC TTGTTCCAGATCAGTGAACTAGGGCTACAGTTTATTTTATGCTCCTTATT TTGTTGGCATAAATAAATATCTTTTGAAAAGCGAGTATAAGAGAACCTTA ACCAATAGGTACTAGCACCTGTAGCGTTTTTATTAAGAAAAAAACTGTGA GCACACGCTGCAGAGGCCAGATATCGAGCGCAGGTTTGCTGGGCTCATGG ACATGTGCAACCTGCCCCCTCTAGCCACTTAGCAACACATGGTTCTCTTT TCAAAAGCCTACATGGTTTACACCAGATTCCGCATTGATATATTTCATTC TTAAAAAAACATCATAACCTTTTCTTCCTTCTGTATGTGCATTCTTTCTT ACTCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTTGTGAAACGAATGTA TGGCTGATTGTTTGAACTGATCGGTAACATATTCACATGCTGCAGAGTAT GTTTGAACTGTTCGGTAACATATTCCCATGATGCTTTAAGGCATTTGCCT AAAGATTGCTTATTCCACTTTTTAGGAAGAAAGAGATGCGGTTTTGGCCA AGATAGAAGTATCACAGGTTCACCTGGAATTGTTAAAGCGCACAAACGTT CTCAATGATGCATTCTATATTTCCCATGATGGAGTTATCGGAACAATAAA CAATTTCCGTCTTGGTCGTCTCCCTAGTGTACAGGTAACGCTGCAAATTC GCTGATACCACATCAATTCATTCACCGTCCTGTGTGCTTCACTTCTGCTA TATTCACTCTGTTTTTGGAGTATACGCATTTTGGCCTATGTACTAACACA AAAATTTCTATTGCTCTGACCTTAGGTTGAGTGGGATGAAATAAATGCAG CTTGGGGTCAGGCTGCTCTTCTTTTGCATACCATGGCTCAGTACTTCCCG AAATTTCAGTATCCTTGGCGCATATGACCTTTTCTTCTTTCAATTTAATT ACTGGTTATGAGTGCATATTCTTTATTGCTAAGTAGCATAAATGATACAT ATTAGTGCTCAAGTACAGTGTACACCACGATTGTTCTAAGAACAGATGAT TTTGCTGTCTAGTTCCTGAACTTTTATCTAGATACCGGATCAAGATTCAC CCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTAACAGACATCAATAGTAATACCTATGA ACTGTAAGCTTTATCCTGGAAATGTACTCTTTTTCTGTCTACTAGGAAGA TATCTTGGGTCTTCGTCATGAAACAGATCATTTTATACGGCAGAAACATA TATGAATTGAACATCCTCTGCACATTTTATACTCACTATTTTATTGATCA TTACCAATATACTTTCACTGAGCATCTATTATGTTGGTTAGTGCTGTGGG AGTATATTAAAAGGGTAGTTATAAAGTTCTGGCAGTTCTGGCATCTGTTA TTTTGCTTCTTTATTTCTCTGGTTGTTGGGCAGTGCAATTTCATTATGCT TTGGTAGATAAGATGAATTGTTGATGTTCAGGTTTGGTCCTGTGAATTTA TTCTGGAGCACCCGATTTGACAAGGCGATGACCTGGTTTCTGACTTGCCT GCAAGAGTTCTCCGAGTTCGCCATAAGTTTGGATAAAGAGAACAATGTTC CATCCGATAAGTCATTGAAGCTCCCATACAAGTAAGGTTTCCTGCAACTT CTCTTGGTTCTGTTACTTTCTGAAAGAATTTCATGACGCACCAACCAAAG GTTTTCACATGAGGTGATTTTTGTAGATGGCAACCATACTAACTTGTTAT TAGATGCGATGAAGTGATTATGATTTTTTCCTTTGGTTCATATGACAGCT TAATATAACCAAAAAATTGGAAGACATGTTATGTATACACCAACACTGTG GATATTTGTGTGCAGGCCTGTGTTGTTTAATTTTATCTCTTTACTTTGAC AGGATTGATGGTGACAAAGTAGGGAGCTACACGATCTTCTTAAGTTTTAA TAAACTGGAGAACTGGACGAAGGCGCTAAAATATATGCTGTGCAACCTGA AGTGGGTTCTCTACTGGTTTATCGGGAATACAAGTTTTGCGGCAGAATCA ACATCTTTGCACTTGGCGCAATCGCCAAACAAGAAAGGTTGATGTGATGT TTGAACAGAGATGAAGCCACTGACCTCAGATGCTGAATCGCTGATTGTTG CTACATGTTGACTAAAGGCAGTAACAGCATGCATTTGATGTACATAATTA CCAGTCATAGCTACTTGTAAGTCACCGATCGATGTATGTACCTTCCCACT GTGTATATGGACTGCACGAGGTCCATTAGTATGCAATCAGCTCTACATGC ACATGAACTGGAATGACAGCACAATAGAACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.