Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA046295

[Submit comment/correction]

Sequence
AA046295
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046295
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTTTCACGATGCCGAGAAAATGGAAGGTTGCTGGTAATGTTGTTGAGGGT
GAAAAACAACCTGCACGTAAACATAATAGTGCATCTCCTTCTGCTGTGAC
CGGTTTACTAGAATTTTTATCAGTTGATCAGAAGGCAGCAATTGAAGCAA
TGGAGCTTGACAGTTTGCTAGATATCAAGTATTCATTACTGCACGACGCA
GTTATGACTTGGTTTGTTAGTTTATATGATAAGCATATACATGAATTTGT
TGTGTCTGGTCGAGGAAGGATACCCCTCGATGAGGATAGTGTATTCAGAT
GTTTGGGTTGCCGCTTGGTGAAGAGCCGGTCCTATATTATGCTGATGCAG
AAATTTAGGGTGCCCTTGCCCCTATTCTTTTTCCTAATGATGATGGCACA
CGTTTGAAAACTCAAGTTTTTTAAATCTTAAAGAATATGACTTCATATGG
AGATGAGTTCAAGCAAGTATATGTGATGTACATTGTGTATACACTTCTGT
CACCTACCACCCGGAACCGTGTTTGTCATAAGTGTTACCCTATCATGGTA
AGTTTCGCTTGTCATGTCTGTTTATTTTCAATATATGTCTTGGCTGGTAA
CTTATATATTTTTGTGTTGATAACTTTCTGTTTGGTGTGATCATAACCCG
TGTGTTATAGGGGTGGTAACATTTTTTGTTTTAGGTTTTGTGGTGGTGTG
TAATATATGTGCAAGTTTTGATGTTATGTTGATAGCTTCTTTTCCATTAT
CTAATTTCAGCACAACATTGGGAATATGTTCAAGTTTCAGTGGTGCAAGT
TTGTCGCTGACCAACTGCATGAGGAGCTTTCTAGTGGTAGTCATACGCAG
CTTGCCTTTATCTCTTGGAGGTACACATTGCTGTTTTTAAATTGTTTGAA
TATTACTTTCTATATTGAAATTTGTTTTATGTTTTAGTTAGTGTATTGAT
TGTATTTTTTTTTTTGGTTTTTTTATTTTTTTTGCAGCTGCTTTATGTTG
ACTCACTTGATGTTAGTGGATTGGGTATTGATTTGCCGGAAGGGCGGTAT
GCTATGAACATATGGTCAAGAGAGTTAATTGATGAAGTGTTGAATGCTGA
TCTGCAAAATGATGGAAATGCATATGGAAAGCTGGAGGTATGTTATACAT
TTTTGTAGCATATGTGTGTTTCTATGTTGTGGATAACTTTTAAGTTTAGG
TGTTGGTAACATTTTATAGGAGTGCTTGATTACATACAGTATAAACAGTG
GATAACTTATGTGTTTATTGGATGGTAACATGTAGGTTATAATGTGAGTA
AGGTGGGTAATATGTAGAAAACTGGTTGATCACATTCGCTAATTTTGTAT
TTGTTTCTTTGTGTAGTTGAAGCCTCAGTATGGCATAAGCTTTGGACTTT
TTGGTGGTGCCCAAGGGTTCAACAAATGGTTTGGCACTTGCGCAAACCCT
AGTTGTTCAAATGAGGTGGGATTTTTAGGATGTTGATATTTTACTTATCC
TTTTTTGGTCCTGTTACTTTTGTTTGCTTTTTGTTTTGTTAATGTTCTTG
TTGTTTATTTTCTTTTTATTTGTGCAGCAAAAGTCACAGATAGCATATCT
TGTTGGCAGTTTTGCATCTGGTATTTTTGGGTTAATGAGTACCCTTGTGC
AAGGCTTGACGACGGTGGAAGGTAATGTTGATGTTGAAATGGCGAAACAA
TTTACTGCCCAGTTTGGTGGTCAACTTGCAATGCATCCCATGGGAGGAAT
CTTCATGGATGGAGCTAGCTCAAGTGGTGCTCGTGGTGCTAGCTCAAGTG
GTGCTCATGGTGCTAGGCTTACTCGATCTGTCACTTGTGGAAGGAATGTT
CCACACTCTAATGTATTTTTGTCTCCTATTCTTCCTACTTATGATACAAT
TCTGCGGGATTCAGACAACAGCTGTTCTAACAATGATGGTGACAACCTTG
AGCCTCAGTTAGACAGCAGTGGAGACGACGATGATGAACGGTATGTCCGT
GCAGACAGGAAGGGTAAGGGTGTGGTCAGTGGTCGTGTGATGTCTACGCA
CGCTTCTATTCTTGTAGACAGTATGGGCCTCCAAGTGCAGAGGTTTGTAG
AATAATAGCAAGTTTCCCTTAAGTGGATTACCCAAGGTTTATCGAACTCA
GAGAGGAAGTGGTCAAAGGTATCCCTCTCAAGCAACCCTGCAATCAAGAT
ACAAGAAGTATCTTGTGTCTCCAACACACCCAATACACTTGTCAGGTGTA
TAGGTGCACTAGTTCGGCGAAGAGATAGTGAAATACAAGTAATATGGATG
ATTATGAGTGGTAATTGCAATCTAAAATAAAAATGGCAGCAAGCAACGGT
GATGGTTGTAACATCCTAGCATTAGAGCTTAGAAATAAGCTGAACACAGA
TGTGTGCATTGCATTCATGCATAGAAAATCCGAATAATTTCGCGCTTTTG
AACAAAATTTGTCAAAGTGATTGAAGCTTCTCTCAACTTGATGGAATTGA
AGTAGATCATCAAGTTGACTGCGATAAGTTTCAATATGACCTTTGTTAAA
GCCTTATTTTGGGTAAAGGAGATTTGATCTAAGGGTAGATCAAATGCAAT
AAAATTAAACCTTAATACAATACTTAATGGTTTATATTTGATCCTTAAGT
AATCATATCCTAGTATTCATTACACAACTCATGAATACCAAGTTATAAAC
ATAACTTAAGTAATAGGAATGTAACAACTAAATCTTGATCTATATTAATC
TCATCTACTAATACCATGAGTATCATGGTAATACCTAACCTTAACTCTTT
AGTAAGATTGAGTTGGAAAGAAACCAAGTCAAGATCAATCACCATATATC
TTTCTTGACATATCAATCTTTACCATTCCTACTAAATCATATTCTAATAT
CTGTTGTTCATCAATGCTGAGTAATCAACTATTGATTCGCCAATTCTTAA
ACCCATCAATTCATGATCTGTCAACTCTTGTTCTCATCATAGCAATCACT
CAAATCCTATAAATAAAGAAGTAAGAAGAGGTAAGTGGAAATGATAGAAT
TAAATATCCTCTATAGGATGGGAGTGTTAGAATAGAATAAGATCAAAGTG
TTAATGGATGGAGTTAATTCACTCCTGAATGGATAGCTAAGTAATTTGGA
ATATATAAGTATATGGTGATAAAGAAGATTACAAGGATGAACCCTGAAGA
AAGTTACCAGGAGTAATCCTATTGGATCAAGTAGGTATAGAAAATGAATA
ATATCTCTTAATCCAATAGAGATACTAATAAGATAATTTCAATACAACTG
TAATGTTGTATTGATGAAGCCTTGATTAGCCAATTGGAAACCTAAACCAT
AAAGGGTCAAAGGATTATAATGACCATGCTTTAGTCACCAAGATTGAATG
CTTATATCATGTATAAATGACATTGGTGGATAGAACATGATTGAACCCTA
GTATAGATATGTATCCTAAGTCAATCATGATAATTCACCATGATAGGATG
TGAAGTTTGAATATAAACTACTGGGGTAAAGTAGATATAAGATAGTATGA
CTAAGCTAAAGCCAGAGTAGCATGGAGTTATTGAAGTAGTGTTATTTCTC
TTAAAGGATAGTAAACTTTTGAGGAGAGTAGTTTGATATATATATATATA
TCTACTGGAGTAATATTAGTGGTGGGTGAATAAGGAAGTGTATGAATGGA
GTAGAAGTAACTACTTGTTGGATTGAAGATTATCAGTAGAAGAGTAGTTG
ATATCACCAAGTCTGGATAGGTGAAGATTATGAAAAGCTTTAATGTCAAG
CTCATTGGATTTATAAATGGATTTAGAAGAATAAAAGGTGGATAAGAATA
TTCTTGTGAAGTAAAGCTTATCATGTTAACACATGATGGTGGATATGAAG
AAGTAATATATCTAGGAAAGGAATTCCTTAATTAGACGTACAGGATTGTG
AATTATGGAAGATAGGAATTATGGGTAAATATTAAACCCTAAAACTATAA
TCAAGCTTAACATCCATCCCATCTGTTGGATCAATAATCTTGTTTCCACA
ATGGCTGTTAGGAATAATTTCCTACATCAAATCACTTAAGCACATCTTTG
TCATTCTCAACCATCATTATCCTAGGTGCTTAAGAACTATCTTTATCAAT
TCTTTCTCATAAGTTAGCCTAGAAAACAATCTCACTATTCTACTTTAAAT
AGTGATATCATTAAAAATCACAAACATAAAGACAATATGTTTAGCCATTA
ATCTTTATTCACATCAACATAAGAATATAAGTATATTAAGAACCCTAAAC
CCTAAGGTAAGCAATTACAATTCACACCCTAACTCTTAGGTTAGTTATAA
CAAATATAAACATTGGTATTTATTAGATTCATGGGAATGATATTAACCAT
ACTAAATCCTTAGGATATCATGCATCAAATAATAATATAGGATCATTACA
TAAAATTTTCCCTCCAAACTATGAGCTAACTAAAAATTAAGTTTTATAAA
CAAATAAGAAAATATCCTAAAATAAATCCATGGCTTATTATGGAAAGAAA
ATTAATAACAAACTTCCTTACCAAATATTAGAATGATCTATATAAACAAA
ATAAAGAAATACAACATTAATTAATAAAAGATCATAAAATGACTTTAATA
CCATTCATTATTGTTGCAACTATTTAAAGAAATAAATTCTCCAAAAGAAA
TTTGAAACAAATGTGTAATACACAGATCTGAAAACAAAACAGAAAAGAGA
AAAGGAAACAGTGAGAAAAAACTGTAACCAGGTCGCATCAACCAACCGCC
CGTTTCATTATTGGCACATGGTTGTACACGTAGGCTACCAAATAAAGAAG
CCAATCAATTTATCTAGATACCTGGGTGCCTTTCCGTAATGAAACCACCA
AAATTATCAATACCATCACACCCAGGAGATTCATTGATTAAGTTGTTTTA
GATTTCACAAACCAATACTTTTAGAAACAAGTCTCAGAGATGTAACCCAG
CCCTCGTACATCATAGCATGGCTAAGCACATGTACCAACGGTGGTTCATC
TACAAGGAAGGCCCTACCCCATAGTAGGACATAGCATAGCGATAGTATCA
TCCTACACATGCATCTACAAAATACACGACAATGCATTGAAAATAGTAGG
ACGATATCATGAACAAAGTAGCATCTACTTGCCTTGGTTGTAGCGGTCGG
AAGAACAATCTACACACGAGCAAGCGTTGCACTCGTCACAATCTACACGA
TACAATTGCAATCATAAACAAACAATCTACAAACATATGCAACAAAGATG
ATGCATGAATGCATGCATGACAAGTGGGGTGACGCTACAGCAGCACCACA
TAATAGTATTCAGTAGGGGTACTGATTGCATGCATGGAAAATAGTTTTAG
CGTAAGGAAAACTATTATGCAAAATATAATACTCAAAACTAGAACTAGAA
CCCAATTAATTCACTACCGGTAGTATACTATTTGTAAAATCTTGGAAAAA
ATCTACAGTATATGCATTGCTATTTAGAAACAGTACCAATTGGAATTACT
CAAAAAGGAATTATAAAACTCCTTGAATAATTAAAACACTGCAGAAAGCC
ACTAGACAGTTTCTGCAGAAGTTTTTACTATAAGCCTATCCTTTTAATTC
ACGAAGAGATTCCCCTCGGTCTACTGAATCCAAGGACATATTATACGCAA
TTTTTGGAGTTACAGATCTTTTTCTACGAATTAATTACTCCAAAAAGGCC
ATTAACTCAATTGATTAAACTGTACTAAATCTTGCTGCAAAAGTGTGAAA
CTATGGTACAGCAAGATTCTACATGACTCACTGAATCTACACATATTTTA
TTTGCAATTTTTGGCCCAGCGGATTAATTTCTACGCAATTTACAAGTTTC
TACGGAAATCTGCAATTTCTAAAACGATTTAAATCAAGAGGGAATATCCC
GGAATATTCCCTGCTGACTCAGCGCTGACTCAGCGCGGGTTGACTGGCCG
TTGACTAGTCAACCGCGCGGTCTCCGGTCGATCTGGGCCGCAGATCTTAG
ATCCGACGACCGAGGAAAGGCGACGGCGGCTTACCGACGGCGGGACGGCG
GCGGTTCAGCGGGTCCTGCACAGAGAGGGGCGGTCAGCGCGCGGAACGGT
GGCGGCGGCGCGAGGTGGCGGTGGTGGCGCGGCGCGCGCGGGCGCTAGGC
GGCGGTTGCGCGCGGCGGCAGGGTGCGGGCGGCAGGCAGGGTGCGGGCGG
CGGCGGCGCACTTACCGAGGCGGCGGCGGCGCGGAGATCGAGGCAGGGCG
GCGGGTCCGGGCGCGTGGGGGAGAGGACGCTTGGGTGGGGTCCGCTTATG
TGGGCCCCACGCAGGGTCCTAGTCGGATACGGGGCGGCGACGGACTATCC
GCCGCGCGGGCTGCGCGGTGCTGGCCGGCTGGGCCGGCGCGGCCCAGCAG
GCTGGCGCCCTCTTTTTTTTTTGCCCTTTCTTTTTCCTTTTTGCAATTAG
TAAAACCTCCGTAACTTTTTCGTACGAGCTCCGAATTGGGCGATTCTTGT
TCCTAAATTTTTTTAAAATCTAGGGGAACAACCTAGGGTCAAGGAATGAG
ATAAACCCCTAGGCTACAAGGGTGTACAACACAAGTCCTACTAAAGCCTC
CCGCAGGAGCCTCGTGGTAAAATAGAGTGGGGTTTAGAAAATAGTGTTTT
GCCGAATCTTTTCAATCGATGGTTTTGCATGGAAGAGTATGATGCAATGA
TATGAATGATATGCAGAACTAAATCTAAAATTTGGGATGTGATAATACGT
TTAATCCTTTGTTACAGCAAACTGGTGAGCTTGACAACCTCACTGTTTCG
TTGGGACAAAGTCTTGAGTTTGTGTTGTGCAGGTCTCCGCGTTGCTTGCA
ACACCTGTGTGACGTTTCCTTTCTCCTTCTGGTTCGATAACCTCGGTCTC
TACTGAGGGAAGACTTGCTGCTGTGCTGCTTCACACCTTGCTCTTGGGGT
TTCCAACGAAGCGCTCCTACATCAACTTAGGCGCCATTAACAAGTTTTCT
GGCGCTGTTGCCGGGGACTTAAAGAAGAAGAAGCTCCCTCGTCAACAGCC
AACCATCATGATGTAGTTTTGATGTTCTGATGATGTATCCATGTGAGTTG
CTCCCCCTATGGTTTAATATCTAATCTCCCTGTGCTGCCTCCTGCGATTT
GATGTGTGATACATTATTTTTGAGATGGGTTAGATTGAACATGATTGCTT
GATAACAACGGATCTAGCCATGAATAACATTGCATAAGATCCTTAATAGC
AACTGATCTATCTATGGGTAACATTGGATATGATTTCTTGATAACCACAT
ATCTATACATGGGTAACATTGGACAGGATCTCTTGATAACAACAGTACTA
ACATGTTATGTGCTAACTTTTGATTATGAATTGAGTATGATTGTATAGGA
TTCCTTGATAACTATAGCACTGACCTTGGATAACATTGGATAAAATTCAT
TGATTACGATAGTACTAACTACTGTATAATGTTTTTGTTAAATTTTGTTT
ATGATCTGTTGGTAACTTTTGAGAAAAATGCATAATAATATATGTGCACT
GACATGGATAACTTATGTTCTGTTGGTATGATAACATTATCTTATTATCA
TGGGTAACTTGTGTTCTGTTGGCATGATAACATTAGTTTATGGTCATGGG
TAACTTATGTACTGATGTGTGGATAACATTATATTATATCCTTGTGGGTT
TCTTTATTTTGTATGGTATTCATCTCTATGTTAATTTTTGGTATTGTTTT
CCTTTTTTCTATGAGTTCTTGTGTACCATTATGGTTGAGTTTCGTATTTA
TATTTTCATTTTAAATTGTTTGTAGTTGTCACGATGCCGAGAAAATGGAA
GGTTGCTGGTAATGTTATTGAGGGTGAAAAACAACCTGCACGTAAACATA
ATAGTGCATCTCCTTCTGCTGTGACCGGTTTACTAGAATTTTTATCAGTT
GATCAGAAGGCAGCAATTGAAGCAATGGAGCTTGACAGTTTGCTAGATAT
CAAATATTCATTACTGCACGACGCAGTTATGACTTGGTTTGATAGTTTAT
ATGATAAGCATATACATGAATTTGTTGTGTCGGGTCGAGGAAGGATACCC
CTCGATGAGGATAGTGTATTCAGATGTTTGGGTTGCCGCTTGGTGAAGAG
CCGGTCCTTTATTATGCTGATGCAGAAATTTAGGGTGCCCTTGCCCCTAT
TCTTTTTCCTAATGATGATGGCACACGTTTGAAAATTCAAGTTTTTTAAA
TCTTAAAGAATATGACTTCATATGGAGATGAGTTCAAGCAAGTATATGTG
ATGTACATTGTGTCTACACTTCTGTCACCTACCACCCAGAACCGTGTTTG
TCATAAGTGTTACCCTATCATGGTAAGTTTCGCTTGTCATGTCTGTTTAT
TTTCAATATCTGTCTTGGCTGGTAACTTATATATTTTTGTGTTGATAACT
TTCTGTTTGGTGTGATCATTACCCGTATGTTATAGGGGTGGTAACATTTT
TTGTTTTAGGTTTTGTGGTGGTGTGTAATATATGTGCAAGTTTTGATGTT
ATGTTGATAGCTTCTTTTCCATTATCTAATTTCAGCACAACATTGGGAAT
ATGTTCAAGTTCCAGTGGTGCAAGTTTGTCGCTGACCAACTGCACGAGGA
GCTTTCTAGTGGTAGTCATACGCAGCTTGCCTTTATCTCTTGGAGGTACA
CATTGCTGTTTTTAAATTGTTTGAATATTACTTTCTATATTGAAATTTGT
TTTATGTTTTAGTTAGTGTATTGATTGTATTCTTTTTTTGGTTTTTTTAT
TTTTTTTGCAGCTGCTTTATGTTGACTCACTTGATGTTAGTGGATTGGGT
ATTGATTTGCCGGAAGGGCGGTATGCTATGAACATATGGTCAAGAGAGTT
AATTGATGAAGTGTTGAATGCTGATCTGCAAAATGATGGAAATGCATATG
GAAAGCTGGAGGTATGTTATACATTTTTGTAGCATATGTGTGTTTCTATG
TTGTGGATAACTTTTAAGTTTAGGTGTTGGTAACATTTTATAGGAGTGCT
TGATTACATACAGTATAAACAGTGGATAACTTATGTGTTTATTGGATGGT
AACATGTAGGTTATAATGTGAGTAAGGTGGGTAATATGTAGAAAACTGGT
TGATCACATTCGCTAATTTTGTATTTGTTTCTTTGTGTAGTTGAAGCCTC
AGTATGGCATAAGCTTTGGACTTTTTGGTGGTGCCCAAGGGTTCAACAAA
TGGTTTGGCACTTGCGCAAACCCTAGTTGTTCAAATGAGGTGGGATTTTT
AGGATGTTGATATTTTACTTATCCTTTTTTGGTCCTGTTATTTTTGTTTG
CTTTTTGTTTTGTTAATGTTCTTGTTGTTTATTTTCTTTTTATTTGTGCA
GCAAAAGTCACAGATAGCATATCTTGTTGGCAGTTTTGCATCTGGTATTT
TTGGGTTAATGAGTACCCTTGTGCAAGGCTTGACGACGGTGGAAGGTAAT
GTTGATGTTGAAATGGCGAAACAATTTACTGCCCAGTTTGGTGGTCAACT
TGCAATGCATCCCATGGGAGGAATCTTCATGGATGGAGCTAGCTCAAGTG
GTGCTCGTGGTGCTAGCTCAAGTGGTGCTCATGGTGCTAGGCTTACTCGA
TCTGTCACTCGTGGAAGGAATGTTCCACACTCTAATGTATTTTTGTCTCC
TATTCTTCCTACTTATGATACAATTCTGCGGGATTCAGACAACAGCTGTT
CTAACAATGATGGTGACAACCTTGAGCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.