Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA008853

[Submit comment/correction]

Sequence	AA008853
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA008853
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCCTCCTCCTCCTGGGGATCCTCCTTCGAGCCGCAGCTCTTCCCCAA AAATTTGTTCAAGCTCGCCGTAGACCTCACCCACCCGACCCGGCAGATCT TCGATTTGGCGCGTGAGGGTAACATCGGTAGCATGAAGAGTAAGGTCCCA CGATTCTTCGTGGATAGGATTCGGTGCTCCTGTATCCGATGCGATTTCTG GTTGCTGATTTGTGCATGCAGGGCTGACGGAGCTGCGAGAAAAGGAGGGG AAAAGCGTGGTGGTGGTGGAGGAGATCAAGGACTCTCAAAAAAGATGACG TGGCGGCCTACTACGGGAAGCAGGAGATGTGTGTGGCATCCCGCAAAACC ACTACTAGAAAATCGCGTTGATTTTGTGCATTGCATCATCATGACATCAG CATGCATCTAATTGATTAAAACTATTTTGCTAAAAGACCTACTTTGTTTT CTATATTAATATCCTCCCCCTTTGTTCAAACCAAACCGTCGGTCCAGCCG GATCTTTTATTCATCTAAAACTATTTACAAAAGTTTATTTTAAATTAAAT AAAATATTTACTTTATTTTTTTAGGGGCAGCCGTACCGGCCGATCCGACC CAGTCGGCCACCCCTAGTGCAAAAACCCAGCCTACCCAAAAACCTTTTGC TACCTAATCCTAAGCTACCCAAACCCCCTCCACCTCACCCCGGCCAATCG CCAACCGTCACCTCACCTCTCCCTTTCCTCCCTCCAATCCCCTGCCGCCA CCTGGGCGCGCCACCCACTCCACCTGCCCCAGCCGCCTGCTGGCCCCACC ACCTGCCCCTGTCCCGCCTGTCTCCACCCCACCATCTCCTCACCAACCCC ACCCCAGATCCCCAACGCCACCACACACACACACACCACCGCCCACGCCC AACCACCTCTTTCCCCTGGACCCGGCCCCACCACCCCTTCTCCTCTCTTC CCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTGCATCACCACGCACCCCCGACCCCGCGT CCCCTCCCCCGCTCCGGCCATCACCTCGCAGCGCAGCCGCCGCCGCCCGC GAAGCTCGCCGCCGGGCACCCCCTCAGTCACGCGCCCTCGACCTCCTCCC GCTTCCCCGACGGACCCCACCTCCTTCCTCCGGCGATTCTCCGGCCGCCG CGCCGCCTCCCGCAGTGCGGCCGTGGCCCGGTCCTCCCTGCGCCTCTCCG AGCGCCGCTCGCCCGCGACCGTCCTCACCATCCCTGGCCACCAGCAACCA GCGCCGCCTCTGGCCTTCCTCTCCCCCGACGGCCCTGCTCTTCTCCGCCC GTCGTCGACCCTACCGCCCCCTCCTCGATCTAGCTCCGCTCGGCCGCCGT CCTTCCTCGAGCTCCCTGCAGCAGCTGTCGCCATCAACCCTGCGACCTCG CCGCCCTCTGCCTATCGCCGCCGCGTGGCCTACTTGCCCGCTATCCCCGC CGTCCGGCCTCGTCCTCCCCGGCCTGCGCCGTTCCGCTGAGCTGCTCCGT GCACGGCCACCCGTCAACCTCGCCGGCTCGAAGCCACCGTCGATCCCCTC CACTCCGTCGTCCCTAAGCCAAGCTCTCCCCCGACCTCGCCTGTGTTCAG TCGCCCCCGTCGGCCTCTGTCCGGGTCGAGTTTTCTCTCGCTCGCTGCTA TGACCTGCAGCATGGACATCCTTGGCATATGTTTCCTCCGTGCGTGGCCT CTGGAGAATACGTGAACGCCGATGGAGTACTGCTGATTAAGGAGTAGTAT GTGAAGGGGTGTTGTTGTCGTTGTAGCATCAACCGTGTGGCGGAGATGGC TTGTGGGGCCGTACTAAGGTGGCCTTTGACTGATGTCGCCCTGTCCGCGA AGATCGACCAGTGTGTGACCCGTCCAAATCCATCATCGACATCGAAGCCC CGAGTCTTCCTCATGGACCTGAAGAATTCCCGGACATGGAACGCCGAGGC CTCCTTCACGGACACCAAGTTCTCCGACCCTGGATCCATAGACAGTTCCA CTGAAGACCGAACCCGAACCCCTCCGAAGCCGCCAAGATCGCCATGGAAC GACAAGCACTTCACCCCGGACGCCAAGTCCGACCCGTCCCGCGGACCCGA CAAGGTCTTCACGACGACAAGAACGACATCGACCAGGGCGAGTCCAATGC GCCCCCGACGCCACACCAAGTCCTTCTTCCCGGAACGCCAAGCTCTTCAT CTGGCAAGCGACCTTCGAAGACCGATCCCGGCGACTGAACCCGAACCCCT CGGAGCCCAAGTTCACCGAACCCTAATGTGATTCCCTATCCGAGACCCCA TTATTTTATAATATGACATTATCAACTGATGCATATTAAATCATTCATCT CGCATGCATATTTTTGTGGTTTGGGGGCATTATGCCGAGTCACCTCATAA TTAAATATGGGACCCATATGCGGGCAAATCTAGTCGTATATTGGCCCCAT TTAAACTTGTGCATCAAACCGATACTATAATTGCCTTGCTAATACAACAT TTAATTTGCGGGGTAGATAAACAACTAGAACCATATATTTAATTGTCGGG ACCCCCGGTTCCGCTTAATATTGCCTAATTGCATCGCATCTTGCCATGTC ATACGTCATACATGCATCATGCCCGATCTTTTGCCGCAGTATTAAATATT GCATCCGATGTTTATTTTAGTGTTTTGCTTCTTCGTGGATTAGGCCGATG AGTTGATGCGAGTGACGACCCGATCTTCGATTGAACCTTCGGCAATGTTT TCAGGCGAGCATCTTCCCCTTTCTACCTATCTTACTTTTATAGTATTTAT TCCCTCCTGTTGATCTATTGCTATCTGTGTTGCGTTGCTCTAGTTTTCGT ACCCGTGATATCCCTTGCAGCCTTATATTGCCTTGGACACCTCCTATTAC CTGTTGTTTGGTAGATAGTTGGACCTGCGCGTCGTAGTCGCTTGCTCAAG TGTTGTTGCGTGTCGTCAAGTACCACAGTTGTTGGAGTATTGCCGTGTGT TTATTGTTGGAAATGATCAAAACTTTAATTACTGTTTAACAACTAAAATT GAAGTAGGAAAATGCAGAGGCACATGTGGGCAATAGATGTTATTTGGTTG TTAACCGTCCACTTGTGTTCCGTAGGACCCCGAGTACTTGATACCTGTTC CTTGAATATTCGCGCTATCCACATCCGGGAGGATTATGGGACCCCCCTGA GCCAGAGCTTGATTCATTCTTATTTCTTGGGGCCACAAACTAGTTTGAGG TTTTATTTACTATCCTATACTTATGCCATGCTTTACTGCTTTATTTAAAT TGTGCGAGGTACTGCACACTGTACTGTTTAGGATCGGGACACGTTTTCGC GGTATCGACAAACCCAGTCACACTTTCGGGTTCCCAGTCGTTTACAGCCG TCCACCCAAACCTTGAGTCCGTCTCGGAGTCAGCTAACTTCGTTGCGGGT AGCTTAATGGGGTGGCCCCCTGAAATATTTCTGAATCTTGTGATTGCTTT GTCGTGACTGCCTCGTTGGGTTTTGATTTGGTTTTTCCGAGGTTGATCGA GTGTGTGTTGCTATTTGTGCACCCCTGCAGGGTAAATCTTTCTGAAAGCC GTGTCCGCGGTTATGGATGACTTGGAGCACAGTATCTCGATCATAGACAA CTATAACTAAAGTAGTGCTATAAATTTGACTTTATAATGACTAGTAATCA GCTTCACTATAATGGAATGGCTAAATAAAATTGCCAACCATTGCTTGTTT GGTTTGACGCTTGCTACCATTGTATCTGACTAGTAAGTATTGCAACTATA ACGGAATGGCTAAATAAAAGTACCAACAACTGCTGGGTTTGGGGATATCT CATGCTATTTGTATCTGACTAGTAAGTGTTGCAACTACAACGGAATGGTT AACTAAAAGTGTCCACTGCTTATTCTATCAGGATGACTATCTATACCGGA CTAGTAATTGCTGCAACGATAACTGAATAAATAAAACTGCCAACTGTGTG AGTCCCTCGGTTGACTTTCTCGTTTGGGTATCGAGGGGGAAATTCCAGGA TGGGTATGCTTGGTAATAGTTAAATATTGGATCCGAATAGGTCTTTCTTA TCCCTCTCTGATAGCCGACGGTTATATCGAGTCTCTATAGGTTGTTTAGT GCATGCTGCGCCGCCGCTGCAGTCCACCATACCTGTGTAGGCGAGGACCG CCAAATTCTAGCCTCGCCGTGTACTGGCCTCAGTACTGACCGCTCTCTCC TTTTCCTTTGCCCTTTGTCGGCACCCCTTTTGTTTTAGCAGGTTTCGACG TCGTTAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTTGGCCTGGGCAGGGTTATGGACGC CATTGGTTATTCTTCAGGGCTCTTAGCTCAATTTGCATCTTGTCCGTACT CGGACGCTATATCGTTTTAAAGGTGATTTGGATCTTTGTATTGTATATCT GTATTCTTGACTCATGGAGTCGTGTTGTATATATATCTGTGCTGTGGGTC CCATCGAGGACTGTTGTGTAATGTTATTACTTCGTTTTCCACCCGCACGC AAGTGCCTGGTGGGCACCTTTGAATCGTTTCTATGCGGGTTTGGCGGGAA GCGCTGAAACTTGCATAGGGCCGATTCTGAGGGTGTTACAGAGTGGTATC AGAGCTCAGCAGTTGCGATACCCCACAAGTCCAGCCTGTAGGATAACCTA GCTAACGGCCGAAGTAGAGTGTCAAAACTATTTTTGCAAAATCGGTTGGA TAGTTCTGATTAGGACTGATTTTACTCCTTACCCCTCTGCTATTCGCCTC TTACCTCTACGCATTTTGAATCCTCTCTCTTCTCTCTCTTCGAGTCCAGG ATTTTCGTGGTTGGGTTCCATCGTACCTTCAGGGTTCCACTTCCTCTTTT GGTAACGGTGTTGCTACATCTGGTCTTCATGCTATCCGAGGAGTCCTTCG TCTGGTGGACTTCTATTTGCTCCTACTTGTGCCTTTCGGTGTTTTCCGAC GCGACGACATCATCTACGCCAGATCCGATGCAGAGTCTGCATCACTCCTT TGTTTCCGAACCTCGCTTGTCGAGATCTACAATCTGAATTCTGAGAGTTG GTTGCATAATTTCCTATTCATGTGCAGAGTAATGCTTTGGGTGCGCGATG GACTGATCACCATCCGACTACTCTTATCATTCGCTCTTGCACATTGAATG GTGAATCATTGAAGTTATACTTCTTCCGCGGAAGTTAGAGGTGGCTTTAC CCTTTTGAGACCTTTACCTTCATCTTTGTTTCTCCGGAGTGTTCCCTCGA CGAATGGGGAACAATCCTTGTTAGAGGTGTCACGAGGGTCTTCACGAAGC GCGAAGGATCAGATCGTCGGCCTTCTTCCCTGTACCATGAGGCGGATCTC GAGGGCGAGATCCATTGTTAGTGGTGTCGAATTGTGGCATCCCGCAAAAC CACTACTAGAAAATCGCGTTGATTTTGTGCATTGCATCATCATGACATCA GCATGCATCTAATTGATTAAAACTATTTTGCTAAAAGACCTACTTTGTTT TCTATATTAATATCCTCCCCCTTTGTTCAAACCAAACCGTCGGTCCAGCC GGATCTTTTATTCATCTAAAACTATTTACAAAAGTTTATTTTAAATTAAA TAAAATATTTACTTTATTTTTTTAGGGGCAGCCGTACCGGGCCGATCCGA CCCAGTCGGCCACCCCCAGTGCAAAAACCCAGCCTACCCAAAAACCTTTT GCTACCTAATCCTAAGCTACCCAAACCCCCTCCACCTCACCCCGGCCAAT CGCCAACCGCCACCTCACCTCTCCCTTTCCTCCCTCCAATCCCCTGCCGC CACCTGGGCGCGCCACCCACTCCACCTGCCCCAGCCGCCTGCTGGCCCCA CCACCTGCCCCTGTCCCGCCTGTCTCCACCCCACCATCTCCTCACCAACC CCACCCCAGATCCCCAACGCCACCACACACACACACCACCGCCCACGCCC AACCACCTCTTTCCCCTGGACCCGCCCCCACCACCCCTTCTCCTCTCTTC CCCCCGACCCCGCTCCTCTCCCTGCATCACCACGCACTCCCGACCCCGCG TCCCCTCCCCCGCTCCGGCCACCACCTCGTAGCGCAGCCGCTGCCGCCCG CGAAGCTCGCCGCCGGGCACCCCCTCAGTCACGCGCCCTCGACCTCCTCC CGCTTCCCCGACGGACCCCACCTCCTCCCTCCGGCGATTCTCCGGTCGCC GCGCCGCCTCCCGCAGTGCGGCCGTGGCCCGGTCCTCCCTGCGCCTCTCC GAGCGCCGCTCGCCCTCGACCGTCCTCACCGTCCCTGGCCGCCAGCAACC AGCGCCGCCTCTGGCCTTCCTCTCCCCCGACGGCCCTGCTCTTCTCCGCC CGTCGTCGACCCTACCGCCCCCTCCTCGATCCAGCTCCGCTCGGCCGCCG TCCTTCCTCGAGCTCCCTGCAGCAGCTGTCGCCATCAACCCTGCGACCTC GCCGCCCTCTGCCTATCGCCACCGCGTGGCCTACTTTCCCGCTATCCCCG CCGTCCGGCCTCGTCCTCCCCGGCCTGCGCCGCTCCGCTGAGCCGCTCCG TGCACGGCCACCCGTCAACCTCGCCGGCTCGAAGCCACCGTCGATCCCCT CCACTCCGTCGTCCCTAAGCCAAGCTCTCCCCCGACCTCGCCTGTGTTCA GTCGCCGCCGTCGGCCTCTGTCCGGGTCGAGTTTTCTCTCGCTCGCTGCT ATGACCTGCAGCATGGACATCCTTGGCATCTGTTTCCTCCGTGCGTGGCC TCTGGAGAATACGTGAACGCCGATGGAGTACTGCTGATTAAGGAGTAGTA TGTGAAGGGGTGTTGTTGTCGTTGTAGCATCAACCGTGTGGCGGAGATGG CTTGTGGGGCCGTACTAAGGTGGCCTTTGACTGATGTCGCCCTGTCCGCG AAGATCAACCAGTGTGTGACCCGTCCAAATCCATCATCGACATCGAAGCC CCGAGTCTTCCTCATGGACCTGAAGAATTCCCGGACATGGAACGCCGAGG CCTCCTTCACGGACACCAAGTTCTCCGACCCCGGATCCATAGACAGTTCC ACTGAAGACCGAACTGAACCCCTCCGAAGCCGCCAAGATCGCCATGGAAC AACAAGCACTTCACCCCGGACGCCAAGTCCGATCCGTCCCGCGGACCCGA CAAGTTCTTCACGACGACAAGAACGACATCGACCAGGGCGAGTCCGATGC GCCCCCGACGCCACACCAAGTCCTTCTTCCCGGAACGCCAAGCTCTTCAT CTGGCAACCGACCTTCAAAGACCGATCCCGACGACTGAACCCGAACCCCT CGGAGCCCAAGTTCGCCGAACCCTAATGTGATTCCCTATCCGAGACCCCA TTATTTTATAATATGACATTATCAACTGATGCATATTAAATCATTCATCT CGCATGCATATTTGTGTGGTTTGGGGGCATTATGCCGAGTCACCTCATAA TTAAATATGGGACCCATATGCGGGCAAATCTAGTCGTATATTGGCCCCAT TTAAACTTGTGCATCAAACCGATACTATAATTGCCTTGCTAATACAACAT TTAATTTGCAGGGTAGATAAACAACTAGAACCATATATTTAATTGTCGGG ACCCCCGGTTCCGCTTAATATTGCCTAATTGCATCGCATCTTGCCATGTC ATACGTCATACATGCATCATGCCCGATCTTTTGCCGCAGTATTAAATATT GCATCCGATGTTTATTTTAGTGTTTTGCTTCTTCGCAGATTAGGCCGATG AGTTGATGCGAGTGACGACCCGATCTTCGGTTGAACCTTCGGCAATGTTT TCAGGCGAGCATCTTCCCCTTTCTACCTATCTTACTTTTATAGTATTTAT TTCCTCCTGTTGATCTATTGCTATCTGTGTTGCGTTGCTCTAGTTTTCGT ACCCGTGATATCCCTTGCAGCCTTATATTGCCTTGGACACCTCCTATTAC CTGTTGTTTGGTAGATAGTTGGACCTGCGCGTCGTAGTCGCTTGCTCAAG TGCTGTTGCGTGTCGTCAAGTACCACAGTTGTTGGAGTATTGACGTGTGT TTATTGTTGGAGATGATCAAGACTTTAATTACTGTTTAACAACTAAAATT GAAGTAGGAAAATGCAGAGGCACAGGTGGGCAATTGATGTTATTTGGTTG TTAACCGTCCAGTTGTGTCCCGTAGGACCCCGAGTACTTGATACATGTTC CTTGAATATTCGCGTTATCCACATCCGGGAGGATTATGGGACCCCCCTGA GCCAGAGCTTGATTCATTCTTATTTCTTGGGGCCACAAACTAGTTTGAGG TTTTATTTACTATCCTGTACTTATGCCATGCTTTACTGCTTTATTTAAAT TGTGCGAGGTACTGCACACTGTACTGTTTAGGATCGGGACACGTTTTCGC GGTATCGACAAACCCAGTCACACTTTCGGGTTCCCAGTCGTTTAAAGCCG TCCACCCAAACCTTGAGTCCGTCTCGGAGTCAGCTAACTTCGTTGCGGGT AGCTTAATGGGGTGGCCCCCTGAAATATTTCTGAATCTTGTGATTGCTTT GTCGTGACTGCCTCGTTGGGTTTTGATTTGGTTTTTCCGAGGTTGATCGA GTGTGTGTTGCTATTTGTGCACCCCTGCAGGGTAAATCTTTCTGAAAGTC GTGTCCGCGGTTATGGACGACTTGGAGCACAGTATCTCGATCATAGACAA CTATAACTAAAGTAGTGCTATAAATTTGACTTTATAATGACTAGTAATCA GCTTCACTATAATGGAATGGCTAAATAAAATTGCCAACCATTGCTTGTTT GGGTTGACGCTTGCTACCATTGTATCTGACTAGTAAGTATTGCAACTATA ACGGAATGGCTAAATAAAAGTACCAACAACTGCTGGGTTTGGGGATATCT CATGCTATTTGTATCTGACTAGTAAGTGTTGCAACTACAACGGAATGGTT AACTAAAAGTGCCCACTGCTTATTCTATCAGGATGACTATCTATACCGGA CAAGTAATTGCTGCAACGATAACTGAATAAATAAAACTGCCAACTGTGTG AGTCCCTCGGTTGACTTCCTCGTTTGGGTATCGAGGGGGAAATTCCAGGA TGGGTATGCTTGGTAATAGTTAAATATTGGATCCGAATAGGTCTTTCTTA TCCCTCTCTGATAGCCGACGGTTATATCGAGTCTCTATAGGTTGTTTAGT GCATGCTGCGCCGCCGCTGCAGTCCACCATACCTGTGTAGGCGAGGACCG CCGAATTCTAGCCTCGCCGTGTACTGGCCTTAGTACTGACCGCTCTCTCT TTTTCCTTTGCCCTTTGTCGGCACCCCTTTTGTTTTAGCAGGTTTCGACG TCGTTAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTTGGCCTGGGCAGGGTTATGGACGC CATTGGTTATTCTTCAGGGCTCTTAGCTCAATTTGCATCTTGTCCATACT CGGACGCTATATCGTTTTAAAGGTGATTTGGATCTTTGTATTGTATATCT GTATTCTTGACTCATGGAGTCGTGTTGTATATATATCTGTGCTGTGGGTC CCATCGAGGACTGTTGTGTAATGTTATTACTTCGTTTTCCACCCGCACGC AAGTGCCTGGTGGGCACCTTTGAATCGTTTCTATGCGGGTTTGGCGGGAA GCGCTGAAACTTGCATAGGGCCGATTCTGAGGGTGTTACAATGTGCGAGT TCCTGATCAAGGATATCAACCTCGACGTCAACGCGTCTGCTCAGCATGGT AATTAACCTAACATGTCGCTAATACACGTTATCGGGTTGGTGGGGGTTGT ATCTCCTGATTTGAGTGATTGTTGATGCCATAGCGGGATGGCGTCTGAAA TCTGGTTTCAGAGCGCAATCATACTCCGCTCTTGCTTAGTTTTGCAATCC TGCAAATGCTAGTGCTACTTGAATCAGGCCATTATGATTTCAGTGGTTGT GAATCAGTAGCTACCCCGCTGCATATCTCGATCAGCCCACAGGCATCAGG CCAGAAAATGCTCAATTTAAGAAAGTGAGTGTTTCTTGAGGAGAACATTG TCACTAATAAAAAAATGAGTATTTCCTGTATTCACATTAACCATTGTTGT TTTGATATGAGAATGTCTTGAGTAGCATTTGCAGATGAAAGTACTTGTTT CTACATTGCTGCTCTACTACCACGCTCCTTGATTATGTGACATGGCTGCA ATCATTTGCTCCACCAATTAATTATTCAGCATTGTGGTCTAGTAGTGTGA ACATAGCTATTGAATCATATAAGGGTCTGAACTGTAAAAATGTCAATTTC TTCCTGAAACTATGACAAGTGACTACTCCAAATTAGAACTGCTACTAATT TGGTTTGAACTATGACAAGTGCACATCATCATCCTTAGGACCATTTGGTT TGAATTAGTCATGTTAATTATCTAAAAAGAGGTTTCCCATTAGTTAACCA TGGCATTTCTAGTCCATGATTCTTTTACATCAATTTTAATTATCTAAAAA GAGGTTTTCCCATTGGTTTGAATTGCCTTTTCATTCGGCTTACCTTTTCC TTTGTGCTGAACAAAGTGCTGAACAGATTGGGTATTTAGTTGTTGCCTGC AGGTGTGATAGTTTTAGCCATACATAATATTCAAGCAACGTGGAGGCACA TGACCAAGTATACTGTCATAAACTTGACTATTATACTGTCATAAACTTTC ATTTCACGAGCCTGCTTTTATTTGGTCAATACAGTTCTATATGTGACATT TTCTACCTACAAAAAGATAGAAATTATAACCCAACCGTGGGAGTAAATTA AATTGATTAATTTTACTCTGTATACAAGACTTTGAGGTGTCTGTGCATAT TCCGCAGGACAGCAAAATGGAAACAATGGGGAGCCAGAGTGAGGAGAGGA TGAAGGATGAGAAGATCATCTCACCCTCTCTTTATTTGGTGTATGCGTGC CGCTGCAGCGACTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.