Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA030463

[Submit comment/correction]

Sequence	AA030463
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA030463
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGGGAACCAACAGCCATGGGCAGGTCGATACCCCTACCCTATGTATCGGA AGAAAATGTCGGACATGGACAGGGTCGCAACTTTGACATAAGTCGGGTGT GATCTGCAGTGAGGTGTTATAGACGCACACGAAATCGCCTCTGTAGTCGA GCTACTTCCAGGAGGCGATCGACGGGGAAAGGAAATGGGCGCCGGGACGG GCGCAACCGCCGTGCTTCTGGCGTTGCTGGCGATCCTCCCGCCGTCGGCG CGTGGCCTCGGCCGCGGCGAGTTCCCGCCCGGCTTCCTCTTCGGCGCCGC CACTTCTGCTTACCAGGTTCGTCCGTACTCCTCTTTGCTGTTTGCAGGAA TTAATAGGTCATCACACCGCTCTGCTGTTTCTGGTTGCAGGTCGAGGGCG CGTACCTGGAGGACGGCAAAGGCCTCAACAACTGGGATGTCTTCACCCAC GCATACCGTAAGTCCATCGATCTCTCCCTTCTCCTTCTCCTCTGCTCTGC TCTGCTCCATCCATGTGTTCAGGTAAACTGCTCCCTGCTCTCCCTCCTCG TAATGTAAGCACGAATTTTGCTTCATCGAATTTTGACTGGATGATGCTCT GTTAATCCACCTCGCTTGCTGATCACTGAGCTCGATTACGCTAAGAGTCC AATTTTTCCTTTTTTTGATTGATTCGCTTTCCTCAAGAAACGTTTATAGT ATAGTGCAATGAGTAGCAATTCTGCTTCATCAAACTTCGATTGGATGATG CTGTGTTAATCCACCAAGTATGCTAACCATTGACCTTGGATAACCCTACC GTCCAGGATGAGTCTACCAGGATAGAGACACAAGCCATTTCCTGTTAGAC AGTTTTGCGCTAAAAAACAACGAGCACTCTGTTTATGTCGGTAAATGAGC CTTAACTGCGCTGAGCTGTCGATCTAAAACCAGATCTAGCATGCCCAAGT CTTCAGAGTTCTCACATGCACTTCTCCGTCAAGTTGCCATGCACATATTA TCAGATTTATTATTACTTCCTTCGTCCAGATACATTTGAATCTAGACAAA CATAAGTCAGGGAGTAGTACTTTTGATTTGAGGGCAACTCTTTTCATAAA TTTAAACTCCTGATTTCCTCTCAATTTTTTTTTGATTGGGCTGCAGCTGG GAATGTCTTGGATGGACGGAATGCGGACGTAACGGACGATCACTACCACC GGTACATGGTACAGAATCAGCAGACGCACAATCCCTTGTAGTAATTGCCA TGCCAATGCATCTTAATTGTACGTACCAAATACCAATGTACTGCTCTCTC GCTCATTGTGCCCGAAACAGGAAGATGTGGACATCATGCATAAGCTGGGC GTCAACTCGTACAGATTCTCGATCTCATGGGCGAGAATCTTGCCAAGTAT GCCAAGCACAATTGATAAACACATGCATCAAGTTCGTTTTGATATATCAG CGTTCAGTTCTTTGACAAACTGTGGTTTGAATCGTCCTAGGCGGACGGCT TGGAGGCGTTAATCCAGCTGGAATAGCTTTCTACAACCGCCTGATTGATG CACTCCTGCAGAAAGGTACACTCCACGCCTCTAATAATCTTCAATCTAGA CCTCGCGAATCCTAAACGTTGCAACAAAATCCGACCAGGGATTGAGCCAT TTGTGACGCTGCATCACTTCGATCTGCCGCACGAATTAGAGACCCGATAC GGCAGCTGGCTGGGCACCGGAATCCGGTAAGTATCCTGCAATCTCATGTT CCCACAGTTCTAGCAATTTGTGATTTACATGTACCTAGCTCAAACCCGAT TTTTCCAGGGAGGAGTTTGCTTACTACGCGGACGTGTGCTTCCACGCGTT TGGTGATCGGGTCAAGTTCTGGACGACGTTCAACGAGCCCAACCTGTTCA CCAAGTTCGAGTACATGCTGGGGGCGTACCCTCCCAATCGCTGCTCCGCG CCGTTCGGGCCTTGCAACAGCGGGGACTCCCAGCGGGAACCATACGTCGC GGCTCACAACATCATCATGTCCCATGCCGCCGCTGTCGACAACTACAAGA GGAATTATAAGGTATAAAACAGCCCCAGCAACTTACTCTATCGTTGCACG CTAACTTTGTTAGATGCATATGAAATGCAGAGCCGCGTTTCTCTTAGACG TTTTGATCCACTTGTGTTAGGTGAAGCAAGGCGGCTCGATCGGAATCGTG ATTTCGATGAAATATTATGAGCCGCTCACGAATACCACGGAGGATATTCT GGCAGCGCAGCGTGCATTGGCATTTGAGATACATTGGTATGCAACAATAT GAAAATTGTTCTCGCATCGACTTTATTTATTATGCTGATCAAAATAAAGT TCACCCAGTTATACTACAAAAGAGGGGGAAGTCGCACCCTTCATTAATAT TAGTACTACTATGATTGTTGGTTTTCATGTCTATTTTTCCGTCTGTAGGT TTTTGGATCCGATATTCTTTGGTGAATATCCCAAGGAAATGCGTGAGATG TTATCATCAAACTTACCAGAGTTCACCCCAGCAGAGAAGCTCTTACTACA AGACAAGATAGATTTCATCGGGATAAACCATTACACTGCGATTTATGCCA AGGATTGCATCTCTTCTCCATGCAACCTGAAGACATATGAGGGAAATGCG ATGGTATTTGCTACAGGTGAAAGAGACGGTGTACAAATCGGAAAATCAGT AAGAACTGGTTCTGCTATGTATTAATGATCCTATCCTTTTGTGCTTACTT TGTTGACACGTTTGGAGTGATCAACCTTCCAGACTGCACTTTTTGGTTTC TACGATGTTCCAGAAGGCATGGAGCAGATCATCAAGTATGTAAGTCAAAG ATACGGCAACACACCTATCTATATTGCTGAGAACGGTGAGTGGAAATGAT ATTACAAAATTCATGATGCTTTCAGTAAACTCTCTGAAGATTCTCAATCC CTCCTAATTTTCTCACGTTATCAATGATCTTGTGTTATCATACACTCTCT CTTTTGTCATTTCAGGATACTCGCAACATAGCAGTAACAATATGGAAGAC ATGATCAATGACGTTGGCAGAGTGAATTACCTGCGGGGTTATCTATCATC CATATCTTCGGCTATCAGGTTCCATAGACAAACACATCGATTTATTTCAT GTGCATTATACTTTATGAATGACACCCTGAACAAAATGCCTCAAATTCTT AGAATACTGGATTTGTTGTCATGCTTATAGGGGAGGAGCAAACGTTCGTG GCTACTTCGTGTGGAGTCTCATGGACAACTTCGAGTGGCTTTTTGGTTTC ACCCTAAGGTTCGGGCTCTACCATGTGGATTTTGCAACACAAAAGAGGAT TCCAAGGATGTCTGCGGAGTGGTACTATAACTTCCTAACGGACTCTCGGC CGGTGGACAAAGTGCAAGCTCTAAGAGCAGATTTCTGACATTTCAAAAGC CGTGGATAGCCGCGTATCCGTAATGTTTGGGTGTAGATATGAACTACGCC CCATGAATATTCTCATGTGTTGTTACCCAACAAAATTATTTAGCTAGAGC ACCACCCTATGAAGTTGCCTATTTGCACCCTTAATGCGTGGTGGTGGTGG TGGACTAGACATATACATTTGCATCCAACACTTACCTTAATATCAAGTAC ATCAGACTACTACCTAACTCAATATCATGAGAAATTCAAGACACCAAAAT ACACATAAACAATATAATAAATGACAAAAAGATCAAAAGTAAAATTATGG GACCTGCCACATAATTACTATGATGCTTTGCTAAAACCCTTTTATTAATC ATTGCAATCCTATTGCATGAACTTAATATTTCTTCTATGACAAGATATAT TTAATCCATGAAATCCCTTGAACACTTCCAATTTGTTTCATCACTCTACT TCATTAAATAGATATTTGCATATCGATTTAAGTCGTTAGTAAAATTTCAC TAAGTAAATAATCCACCAAATCATGTGAGTTAATTAATTACACACATCTC TATATATGACTCTAGTTATCTCATATCCTTATTTCATACACTTTTGAAAA TAATCTCTTAGTATTTAAATTCATTGAAAACTTTCAACGTGCCCAAACGA AATTGAATTTCCAAAGTCTAGGTGAATAGATCTTGCTTGTAATTTTCCAC ATGAATATGATTAAGTCATATGGTGCCATACACTTATGGAATATTCTCAT AAAAACTTAACATTTAACAAATAAGTCAAAGAGTAAACTCCACCATCAAG ATAACATAAACTTAGCCTTCGAAGATGTACCAATTTATCATATAGATCCT TAAAAAAAATTAACAATGATTATGTCAAAATCTCGCTATAAAAACGATGA AGCAAAATAACTATTATCTAGCTCCAGTGTCAATCTTGATTGTTGAATTT GAGCGCATCATCTCGGCGTAGAGGGTTGCAATCCAACCGCCATCCTCTGA GCGCATCAACACTTCACATCTCCCCTAGACTCTTTTTCTTCGAATCCTCC GGCATGACTATGCAAGTCATTAATATCTCATACTAAAGCTTTCGAAATAA AGCTTGCAAGAATATGTCAATAATCTACTATAACAATTATACCTTCTTCT TTGGACTTTCTGGAGTGTAGTCCGGGATCAACTCTTGATCATGAAAGACC AATGTTCCTTCATCCATCAATCTCAACATGGCAAACAATTCGGGGAACTC CTTGGTCACTCCCATGGCTAGGCAACACATGATGAAACTTTTAAAGGATG TAGGAGTGACATGAATACCATGTCAGTGGAGTATTATTCCTAGCATGAGG AAAGTCCAAATACTACTTCAATTGCTTGAATAGCCTCATCTCCTTCGACA ATCTTGCAATTTAGAATTGCATTGGTTATCTTATACAACGGTCGATCTGA GTCCAGTTCCAGAAGATCACTCAATCCCTCATCATATATGCAGGAGGAAG GATATCCTCGAGTCTGGTTCCGGAAGAATCGGGTGCATTAGTCCCTATAA TCAGAGCCATTAAATTGCTTTAATTTTCGTGCTAAAAGCTACCGGAAAGC ATAGGAGCACTAGTAAGGGATTTTTTAGGTTCTAATAATTTAGTTAGACA TGCTGGTGGAGAGGCCGAAGTCTTACTCCACTTCTCGGAAACAAAGTCGG TAAGTTCATATATCATTCCCCTTCAACATCGATCGATCAAAATGTCCCTT TCACGTGCACCACGGGAACCGAGAGCCTAGCTTTTTTAAGTCGGGCATGG GGCCCTGGGCAGGTCGATATACCGTACCACTATGTATCCGAAGAAAATGT CGGGCATGGAAATTGCCTCTGTAGCTAGCTAGCTACCTCGAGGAGGAGGA GGCGACAGGGAAAGGGAATGGGCGCGGGGACGGGTATAACCGCCGTGCTG TTGGTGTTGCTGGCGATCGTCGCGCCGTCCGCGCGGGGGCTCGACCGCGC CGACTTCCCTCCCGGCTTCCTCTTCGGCGCCGCCACGTCTGCTTACCAGG TTTGTTCTTCGTCGGGAGCTGCTTGAATTGGCTCCGTCGTCGGCGGCGAC TCGGCGTCTCTCTCTGCTGTTCGATCGTTGAATCGACACTATGGTTGGTT TCCGGTTGCAGGTTGAAGGCGCGTACCTGGAGGACGGCAAGGGCCTCAAC AACTGGGATGTCTTTACCCACACACACCGTAAGTCATCTCTCCCTTCTCC CTCCTCCTTCTGCTCTGCTCTGCTCCATCCATGTGTTCAGGTTTGAGCTG AGACTGACTGCGCGATCCCCTCCCCCTGGCTCCCTGCTCTGTGTGGAACA GAGACAGAGATAGCCCACCAGAAATTCCATAAACACGATTTTTTTCTTCA TCAAATTTTGATTGGACGATGCTCTGCTAATCCACTATGTCTGCTAATCA TTGAGCCGGATTACTTTACTGTCGGAAAATCATCACCAGGATAGAGACAC ATGTCATTTCTATTTACAGCTAAGAGTCCAAAAAAAAAGAAGTTTGAATG ATTCGCTTTCCTCGAGAACGTTTATAGGATGATGCTCCCGTAGTGCCATG AATATCAAATCTGCTTCGTCAAAGTTTGATTGGATGGTGCTCTCTTAATT CACCATGTACGCTAATCATTGACCTTGCACGATTACCCTACTGTCAGCAA ATTATTACCAGGATAGAGACACAAGCCATTTCCTGTTATAGCTTTGCGTT CAAAAAGAACGAGTCTTCTGTTTCTGTTAGAAAATGAGCCTTAATTAAGC TGAGCTGAGGATATAAAACCATATCTTTCGTGTCGAAGTCTTAAGAGTTC TCACATGCAGTTTTCCGTCAAGCTGACATGCACATATTACCATCATCTAT TTTTAGTAATTTTGAGGGCAACTCTTTTAAAATTATTATTTTGAAATGAG ATCTTTTTTAAATTTAAACTTCTGCTTTGCTCTCATTTTTTTTTTTGATT TGGCTCGCTGCTGCAGCTGGGAACATCAGGGATGGACGTAATGGGGATGT AGCAGACAATCACTACCACCGGTACATGGTACAGATTCAGCAGACAGACA ATCCCTAGTAATCCCCATATCATGCGTCTTAATTGTACCAAATACCAATG TGTACTGCTGCCATTGTCCCCGAAACAGGAAGATGTGGAAATCATGCATA AGCTGGGCGTCAACTCGTACAGATTCTCGATCTCATGGGCGAGAATATTG CCAAGTATGTCAAGAACAAATATATACACACATGCGTCAGTATATCAGCG TTCGGTTGACAAACTGTGGTCAAATCATTGTAGGCGGCCGGCTTGGAGGT GTTAATCCAGCTGGAATAGCTTTCTACAACCGCCTGATTGCTGCACTCCT GCAGAAAGGTAGTCTCCCACACCACACCTACACCTCGTAATAATCATCTT CGACCCAGACACGCTAACGATCCTAAACCTTGCAACAAAACCGAACCTGC AGGGATTGAGCCATTTGTGACGCTGCATCACTTCGATCTGCCCCAGGAAC TAGAGACCATATACGGCAGCTGGCTGGGCGCCGAAATCCGGTACGTAAGC ACCCTGCGATCCTGCTGCAATCTCCTGTTCATGTTGGGGCCAAGTTTGTG ATTTACCTTGGTCAAAACCCTTCTTTTTTTTGTCAGGGAGGAGTTCGATT ACTATGCGGACGTGTGCTTCCAGGCGTTTGGTGATCGGGTCAAGTTATGG ACGACGTTCAACGAGCCCAACATGTTCATCAAGCAGGCGTACATGCTGGG AAGGTACCCTCCCAACCACTGCTCCCCACCGTTTGGGAACTGCAACAGCG GGAATTCCCAACGGGAGCCCTATGTTGCGGCTCACAACATCCTCATGTCC CATGCCGCCGCTGTCAAGAACTACAACAAGAATTATAAGGTAAAATCCCC TCCCCCAGCAACGTAGTAGTTGGCGCCGCGATACTGTTTCGGTGCATCTG AAATGCGGAGCAGCATTTGTCTTAGACGTTTTGATCCACTTGTGTTAGGT CAAGCAAGGCGGATCGATCGGAATTATTATCTCGATGAAATATTATGAGC CACTGACGAATACCACGGAGGATATTCTCGCGACACAACGCGCGTTGTCT TTTGAGATACATTGGTATGTGACTGTATGAAAATCGTTCACATCGACTAC TCTTATTTATTATGCGAATAATAAAAATAAAATTGGCCTGGTTATACTGC AAAAGAGGAGGAAGTTGCACTCTTTATTAGTAGTACACAGATTGTTTTCA TGTCTATTTTTTCTGTTTGTAGGTTTTTGGATCCGATATTCTTTGGTGAA TATCCCAAAGAAATGCGTGAGATGTTAGCATCAAACTTACCAGAGTTCAC CCAAGCAGAGAAAAGCTTACTAAAAAACAAGGTAGATTTGATCGGGATAA ACCATTACACCGCGATTTATGCAAAGGATTGCATCTCTTCTTCATGCAAC CTAATGACATACGAGGGGAATGCGCTGGTCTTTGCTACAGGAGAAAGAGA CGGTGTACAAATTGGAAAATCAGTAAGAACTGGTTTTGTTATGCATTAAT GATCCTATCCTTTTGTGCTTGTTTTGTTGACACGTTTGGCATGATCAACC TTCCAGACTGCACTTCTTGGTTTTTACGATGTTCCGGAAGGCATGGAGCA TATCCTCAAATATGTAACTCAGAGATATGGGAACACACCTATCTACATTA CTGAGAACGGTGAGTGAAAAGGATATTACAAAATTTACAATTCTTCTAAC AGTAAATTCTTTGAAGATTCTCAATCCATCCTAATTTGCTTACGTTATCA ATGATCTTAGATTATCATACCCTCTCTCTTTTGTCACTTCAGGTTACTCG CAACACAGTAGTAACAATATGGAAGCCATGATCAATGACATTGATAGAGT AAACTACCTACGGGGTTATCTATCGTCTATATCTTCAGCTATCAGGTTCC ATGCGCAAACACACCGATTTATTTGATGTGTGTTACGTATTGCCAATGAG ACCTTAAACAAATACGTGCATCAAATTCTTAGAATACTATATGTGTTGTC ATTCTTACAGGAGAGGAGCAAACGTGCGTGGCTACTTCGTGTGGAGTCTC ATAGACAACTTCGAGTGGCTTTTTGGTTTCACCGTAAGGTTTGGGCTCTA CCATGTGGATTTAGCAACGCAAAAGAGGACTCCAAAGATGTCCGCGGAGT GGTACCGTGACTTCCTAACGGGTTCCGAGCTGGTGGACAAAGTGCAAGAT CTAAGAGCAGATTCCTGATAGTACTTCAAATATATATCTATAATTTTTAT ACTTCAAATATATATCTATAATTTTTTGGTGCAATTATTAGTAAAGATTT GATGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.