Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA028478

[Submit comment/correction]

Sequence
AA028478
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028478
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCGCCGGCCCCTCCCCCTTCCCCAGTTCCCCTCCCGCGCCCACCGAACC
CCATATTCGCCCGCAGGCTCCCGCCGACGACCCCGACTGGATCCGCTTTA
GCTCTTCCCTCGCCGCCGGCCCCATCCCGCGCCCCCCATCTCTGCCCGCA
CGCTCCCGCCTGTAGCTCCTCCCGATCACCGAGCGCCTCCGCCTCAAGCT
GCCGGAACCCCAGCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCGACCTCGCCAGCC
CGCAGATCACCACTCGCAAGTCAGGTTTGTGCTCCAGTTCCAGCAATGTT
TGCTAGCGGTTTTTCTGTCTATGAGTGACTGAATGTGTGTGTGAGATGCT
ACATCCTGCCTGCCTGCCATGTACTATGTAATAGTAATTTGCACCTGGTC
TAATGCGGTGGCTACTCCTGGTGGATCTGACTGTCTAGCTAGCACACTTG
AAGCTTGCTCGTCTCGTCTCTAGTCTAGGCAGTCTTTGATCTCACTCGCT
GCTGCGTGCCTAGTGACCTCGTCACTGTCTGCACCTTCTAGTTGACACAC
ACAGAATATTTTTTTTAGATCAAAAGGGATTTTATTCCCCAACCAGTTCA
CAGCATCCAGTTCACAGAATCTGAAGTTATTACTGCTCCAAAAGCCCCTA
CAGTAACGAACAGAGCACAAAAAGTACTCTACCATAGAGGAGAGTTTTTA
ATCTTGACAAAAACGAACATATATGGGGGATATCTCATGATTATCCCGGC
TAAACCCGGCATAGTAAACGGAATATGGAGATTTTGCGGGATTTAAGATA
ATCCCTCTGATCCCCGCCAATACACTAGCGAATACGAGACAAGTAAACAA
GGTCTAAGAGAGAGGAGGGTTCCGCCTTGACTTCCCTTTTTTTTGTTTCT
TTTGCCGCCTTGCAAAATCCACGCTGAGGAGAAACATGAAGAATGGAAAA
CACCAACGTGAATTGTTGTGTTGTACTGTATATAAAATGTCTGTGTTTAA
GAGAATGGGGCAACTTGGTGGTTATAGAATATCAACATAATATGCTCTCT
TCGTATCAAAATAAGTTATTAGATACATGTGAATCTAGACAAATCAAAAT
CACTTATGTGAATCTATAATATTAATTTTCTTGAGGTTGGTTCATCCGTA
GGCAAAAAAATTTAGATGGTTTTCCCCTGGTAGTTCGAAGATATTACAAC
ATTGCCACCACCAAGTCAAAAAAGTTGTTCTTTTTCTTAACTCCAATAAA
CAGTTTGTCTGTTCGGTGCCCTACCACTAAGCCTCCTTCCTCTCGCTGAT
GGGTTCAACCTCGACAGCAGCTGACCGCGTAGGCGGAGCTGGGAACGGTG
CATCGGCGGCGACGACCGGCGACTGGTACGTGGTAGGTGGTAAAAATGGC
TTCGTTTGTCCGTCTGTCCGCGAGCTGAAAAAACAGGACTAGATGCGCTC
GGAGAAAAAAATGGGAGTAAGAGTCCTCGCTCGATGCCACGGAGAAAAAT
GTGGCCACGTCTTGTGAGAAACCGGAGCCGTCCCAATCAAACCGCCCGCC
CGCTCATACCCTATCGAGCAGTGATCGTTTACTGCGACGACCTCCGAGAG
GGCGGTGAGCAGCTCGAGTGCATGCTCGCCACCAACCGCTTTAGCCTAGA
TCGCCATGAGATGATACCTCGCGGCTTAATTCTGCCTGACATCCTGAAGC
CGAACGTCATGGCACTCCAGGGATCGATCTCAGGCGGCAGGAATCAGGAA
GAGGTGTGGACTTTGTAGAAGCTGGTTGGCGGCGGTGGCGGCGGCAAACG
AACAGCATGGCGACGGCCCACAAATGGCATGACGGCGACACAGGGGTACT
CTTGCACTGGGCATCGACACGATTGCAGATCGTAACGGCGGCTTAGCAGT
GAAAAAGTCTCGTGGGTTGCTGACTTCATCGGTCTATAATTCCCCGGACT
GCATATATCTAAATCACAAGCCGGTATAACCCAAATGTGGACATGATGTA
CTACCATGGAGGCCGCGAGGCCACCCACAAGTAGGCGAATCAGAGAAAGA
GGCAGGGCAGGGTATCGGCTAATAATCCCATCCACATTCAAAGTTATAGC
TTCAAGTGCGAAATACATGCCTGGTGAGCTGCGAGTCAAACGTACACAAA
AGAGTATGTACACCAACGACATACATATCGCATATCAGAGAACATAATGT
AAAAAGAAAGGAAATATAGGCAAAGTCCGAAGACAAAATCCAAATATATA
TAGATAGGTAGCACACATAGGACAGAGATCCCAACATTATATCATACATC
AAGCGAAAAACATGATATGCCATCCGAGTACAGATAAAACCTAAATTGGC
ATAAGATTCCTAGAAATAAGAGAGTGAGCTACATGCCCACACGGCTCAGG
ACTTCCTGGTAGGATCCTGACTACACCTCATGGTAGTCCTCATCAGCATA
GTCAACATAGTAAGCACCAGATAGTCCAGATGATTTAAAAGAAGAAAACA
CTGATCATACATTTTGTAGTAATAAAACCAGCTCATTGTGCAATCCATTT
AGTTATCACTAGTCAGATGTGACAAAAAAAGAAGTTGGTGGCCTGGGGGA
CGATAAGAAACCATAAGTGTCAAAACTACCCCAAACCGATTTAAGAATCA
AAGAAGAGGATTTCCTTATTTTTACCAACATTTGCTGGAAAGATAGTTCT
ATTGGATTTGGCTGTCGATTTGTTCTTCTCTCAGTTTTGGGTCTTTTGTC
ATTTCAGATATTTAAACATCTGGGTAGATTTATAAGGACGTTTGGGTAAA
TTTGGAAAGTACTAGGAGATTCAAAGTTTGTACAATTCCCTCATTAAAGC
TTCACCGGGTCTGAATTTTCGAATGAAATCCTCTTTGATTCTTAAATCGG
TTTTGGGTGGTTGGACACTTATGGTTTCTTATTGTCCCCCAGGCCGTCAA
CATCTTTTTTTGTCAAAAATCTGACTAGTGATAACTAAATGGATTGCAGA
ATGAGCTAGTTGTATTACAGTAATTTTCTTCTTTTATCTTTGTTTGGAAC
ATGCATAATTTTCTTTCTTTCGGAGAGAGTAAAATTTTGAACATTTGAAG
GTGGGAGGAAATTCTAGAACTACTAGGTAGCTTTGTCGTTTGGTTCTCTA
CGTAACCTTGTAGGTATTAAGTTTATGTGCGTTTTGCTGACTACTGCATA
CTGAGCTTGCTTTTTCTGGCTTGCAGCAATATCAGGTTGGGTCTCAGGTC
AAGGGCGTTTTTAATGGGTCCAGCAAAAGGTTCTCGGACAATCCCCAAGA
TCACAATAAAGAAACACGAGGATCGACAGCATCATGAGGATCCAACTAGT
TCAAGCAAGGTGAAACTTAAAGTAAGATATAGCAAGACTTGATGGTAGAT
TGATTTTAGACGGTGACCAGTAGACGTAGCATCAGTGCACCACGTTTCCC
TTTCTTAAGATGCCACCCCACTTTTCAATAATGTGTTGTTCACCTGCTCT
TATCTCTTGCACTAAAATGTTTTGATTTCTTAGAAGAGGAAGATGCCAGA
CTTAGGTCCCCAATGGAGCAAGGATGAGCTGATGCACTTTTATGAAGCCT
ACCGTAAACATGGGAAAAATTGGAAAAAGGTTCGGTTCTCAATTTTCCTT
TTCACTCTGGTTTTGTTCCCTCGTAGTTACCTTTTGATGTATGATGAGAA
TGCTGTTTGTTGATTCTTTGTAGGTCAGTGCAGTAATTGGTAGCAAAACG
GCTGACATGGTAGAAGCTCTTTACAGTGTACATCGGGTGAGTATCTGTTT
CTCTACCATTTTCTTTGTTTGGTAAACCAAACATGATAATTCACTTACAT
AGAACAGGACCTGAATATTTATCTGTAGTTTCATGTTCAGATGTAAACAA
TTCTTTTGCCTACCCCAACTTGCTTGGGATAAAGGCTTTGATGTTGTTGG
GTCTACTGTAGTTCAGGGCATGATTTAATTTATAAGGGAGCCTTAAAATA
GTCGTAAACTGACATTTCTTGTTGTAGACTTTCTTATCTCTTCCGGAGCG
CGAAGGTACTGCCATGGGATTCATTGCATTGGTTACTGGTCATCACAATG
TTTCGGTAAGATTTTGATGTTTTACTGGTGCTGAATGTTTAAGCTGGTGT
TTACTTACGATTCTGCCGATGTCAAATCCCTGCAATTTCTCTCTTTTCTT
GGTTAGTTCAGTAGTGTGAATGTTTTTACCATTTGCGGTCCTTTATACTT
TGTAGTTCAGTTTTTAGTGTTGCCTATCAGTACCATATGATACTGTAGGA
GGCCCCTACAGTTCCTATTTCATTAAAAAGAGTTCACAGTTGACAAGGTA
CAGAAGGTGATGAGTATATGATTACTACAAGTTTCAGAGCGGTGATGGTT
ATTACTAACGATTAGTACTAATTTCTATTATTAGTAACATTGCATTCAAT
GAATCGCGGTCTGCACTTAATAAGCTCTGAAATATGATTTTCTACAGATG
GGTAATTATCCATCAAACATGAAATATATATACATGTTAAAGTAAGTCAT
GATAAAGCTTTATATGTGATTCAATCTAGTTTTGAATTTTTACTAGCTTA
AAACTCCCCAATGGCAGGAATCCCCAGGACAGCAAGAAACTGATCAGATG
GTCAGATCATATGGGAAGAGACGGAGACGTGGAGAAGCTGCGCAACAGAA
AGAGAATGCAGCACCATACCCTCATGATCAGGACAGGATAGTTGCTGGGT
TTACATATGCTTTCAAGGAAGGATACCATGGAGGCAAGTATCGCGATGCA
AATATCTTGTCTCCTTTTATTTCCTCTTAAACATGTTTTTGATAATTTCT
TGTTCTTTTTTTCAGTACTTGTCAGGTACATCAGAAGTAACCCTGTTGGG
AAACGTACTCCTCGTGTACCAGTCATAGTTCCTTCAGACATTGATGCCAC
CGACAACACCACACCACCAATTAAAAACACTGTCAGTTCTACAGAAAAGG
CTAATGAAGACATCAATAATGATGGCACTGTCTTTGCAGTGGATGGATGC
TCTCCTGATGGAAGCTCCGTAATCACTGAAGCAAATAAGGTTGTTGAAGG
TCAGACTTTCTTGGAAATCAAAGGAACTGGGGACACTGAGATATCTCAGA
CCCAACAACATTTGAAAAAGAGAAGAATTCAGCAAAGCATGGACGAAGGC
CAGACAAGTGAAGTTGAGCTTGGAACCACGACGGTGGCTGAAGAAGGGAA
CACATCAGCTGATTATGAGAAACTCTGTCAGTTATTTTCTCCAGGTATTT
TTTGAAACGATTTGTTGCTTTCCCTTGTCATTGACAACAAACAGAGTGCC
TCTTTCTGGAATTAGAAATCATGTATCTAGTTCACGAGAAAATTATTATC
CAAATCATCACACAGTCATGAGGTGGCCAAGGAAATGCATTCTAAATGAG
AAATATGTCCACAATGTTTGATTAACTATTCATCATAATTTGTGCTGCTA
CCTAATTTCTGTTCCGTGGAGCTTCCTTGTCATATTTGATTAACCCTTGT
TAGTAATGCTTAGTAGTTAGTACTAATAATTATCAGCATTGTGAAATTCG
GGTTCCTGCTTTTTTGCAGTTGAGATGATGGTCTTAGATGTATTGGAGAA
TCTGGTGACTGTGCCCAGTAAAACACCACAGTCCAAGATTAATGCTCCTT
CAGGTTAGCCATATTTCTCCTAGTTCATCTTCTCACATCATACCTTATCT
CAGGAATATTGTGCATGGCTGATGCTCCCTTGTTTTCATCTAATGATACA
GGTACACTTGTAAAGAGAACTTCTGCATTATCTCATAGACAGGATGAAAA
GCTTTCTCCAGTTGATCCATCTAAACAAAGGAAGCAAGTTAGTGAATCTA
GTGCTTCCCAAGCAAAGAAGAAAAGGAGAAATAAGTTATTAAATGAAGAG
GTCAGATATTGTGAATAGTGAACTATGTTGTCCGAATTGAAATGTTAGAG
CTGCTTTTCATTCTCATATAGAACACAGACTTAATACGGTTCGCTGATTT
TTTTTTTCTAATTAGAGTTAGTGGTCTATGGTGTCAGCTTCTAGTAGTTG
TACCCGTGTTCATTCTTTCGGCATTTACACTTGTAAACTTGTTCTGATCC
TTCAGTTACATGCTTGCTTACTGTTTTTTCTATTTCAGTTTGTATCACGT
AATGCTCATTCATGGGAAGCCATTCTTTTATTTGTTTCCAAGGGCATACA
TTGTTATCAATTTATGGCCACCATTATTTCCTTATGCTTATTCATTCGAA
GCGCACCTAAAACAACTGTCAACATTTATGTGTTCTCCAGTATTACTCCA
GTTAGTCTGATGGCAGTTCCTTTTTGTCATGTTTCTTCCGCAGATGCTGG
CTGAAGAACAAAGCAATTCTGGTACTACTTCATTTCTACCAGAAGCACAG
CAGGTTGATACCACCGAGCGGCCCTCCTTGGATTCTGACTTTGACAAAGG
AGCAATAGATATACCTGAATCAACTGCTAATATTTCTGCCGAAGTATCCC
CTAATGCACCGATGAAAATTGACCGTCAAATAAATATGTCAAGGAAGAGC
AAAAGAAAATCCAAAATACCATGCAGAACAAAGAACGTGTTTTGCAATGC
AGGTGCAGATAATTCACAGGTACATAATAATTAGTCAATACTGCAGATTC
AGATATTACCATGTGATACATGTCTCGTAAGAGTAACTCTGCCCTACTTT
CAGGCAACAAAACTGCTGCATTGCTTGTCATCTGAATCACTTCGTAGATG
GTGTACGTACGAGTGGTTCTACAGTGCAGTTGATTATCCATGGTTTATGA
ATAATGAATTTGTGAACTACTTAAATTTTGCAAAATTGAGCCATTTGTCA
AGGCTCACACGATCTGAGTGGAGCACAATACGAAGGTATTAACCTACATA
CCCTTTAAGTTATTGCGTTGGTCCTTTGTCCCTGTTTTGGACATTCTTTA
TCTGCTTGCATATATATTAAAGAATCTTTTACATGCAGTTCTCTTGGCAA
GCCCCGCCGCTTTTCCGATCACTTTCTGGCAGTAGAAAAGGAAAAAATTG
AGGATTATCGTGAAGATGTTAGGAAATACTATGCTGAACTAAGTGATGGT
TTGCGGGATTCTCTACCAGCAGATCTAGCTCGGACGTTTTCAGTTGGTCA
GCATGTCATTGTTCGTCATCCGAGTACCAGAGAACTTTGTGATGGTAAAG
TCGTAACCATGGAGCGGGATTGTTACAAGGTCCAGTTTGATAGGACTGAT
CTAGGTGTTAGTATAGTGAAGGTATGTATTTGCTATTTTGGTTTCCTTCT
GACTTAATGATTTATATACTGTCCAGGAATGCATAACTGAAGTTGTTTTT
TTTCAGGACACTGATTGTATGCCTGTAAACTGGTTGGATAATCTGCCTGA
CGATCTCAAGAATATGAACTCCCTCTCAAATAATGCACACCACAAGGTGG
ATATTGAGTGCATTGCGGAGCTTACTCCAAAAGAGAGCTGGGGTCACATC
ATGAACGGTATTTCTGTATCTGAGCTGTCCTGTAGTCCACATGTAACATC
AGATGATCAGCTTAAGGTTTTATTCTGTCCAAATTTATTTTCTAAGGGGC
ATATATATGTGTGTGTATTAGTCAGGTTGAATGTAACAGTGCTTATGCAG
GTTAAAGCTACTGTGAAATGCAATTGCGTGTGATTGTGGTATCTCAGGGC
TAATTCTGATTACTCTATTTATTCACAGGCTGGATCTGCTGTTGGTTGTG
AAGTGCTACCCAACAAGGGTACCATTTGTAGATCTACGGCACCACCATTG
CGCCCACTCCAGTTCGGTGCTGACAGTTTACAATCTAGATGTCGCACAAA
CAACAGGAGTGCTCATGATGTTGAATCGGATTCGTTTGTTACTGTATTTT
TCCAAAACTTACTTTCGCAAGCCAAGCAGATGGTTGGTGAAGTCATGCAG
GTATGTATGTATGCTTAAGTCCACCTGGCAACTCTACAATATGCTGTTTG
ATGTGTTGTTGGGAAATCTCTGAAAATGGTGATGAATCTCAGGAAGAAGG
AAGGAATCAAGCAACACATTGCCTGGGATCTGAAGCTGCTCTTGGCGATT
CCCAACTTCCGTCCAGCCTGATAATGACCTGTGTTGCTACAGTCCTCGCA
ATCAAGGTAGAATTTCTGCAGATCCCATCTATTGTTAGCATTGTTTATAT
CTCACTTCATCTTCCCCCGATATGTGCAGGACCTTAGCGCATATCGCCAT
CCGCCTGCTAAAGTAGCAGGTGTCTTGGAGCAAGCTTTCTCGATGCTGCG
CCCAAGCTGTCCAGAGAACCTCACAATCTACAACGAGATAGAGACTTGTA
TCTCGGTCGTGAAAGCCCAGATACTAGCACTTGTGCCAACACCATCTGAC
AATGGCAGCTCTGCGATGCTGATGTAAGTAGTCCCAGTACTCACGCCCTC
TGCTGTAGGTTTGGAAGGCACTGGTTTTGCAGCCGTCCCCACTGTGACTC
TGGGTGACAGGAAAGCCGGGCACCTGGAGCGAAGATAAACTCTGCTCTGC
CGACATGAGCTTTAGATATACAGCAGTTGGAGTAGAAAGCGTAGGCATTA
GGTGGATTTTGATTGTCCAGCTCCCTTGTAATCTGTGTATATAATAGCCT
CGCGGCGCGAATAAACCATTTCAAGGTCTGCTTGGAATGATAGAGTTCAT
TTCTCACAGGAACAATAAAAATACCCGTGTTTGGAACAACTGAATTTGAT
ATAAGTTTGTAGTTAATGGCAATGTCTACAATCTGAATTCAGACATTGCC
ATTAACTACAATCTGTAGTTAATGGCAATTTCTTGTCAATGCGAATTCAG
ACAACTGAATTTGATATAAGTTTGTAGTTAATGGCAATGTCTACAATCTG
CCTATTTTGTACAATTGCATCTCTGTGTATGTATTGAAGTACAGAAGCCA
AGAATGCTGACTATTGTTTCCTCTCCCAGCGAATCCTGTCTGGAGATTTA
TCCTATTACTACCCAAATAATAAGACAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.