Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027503

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027503
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027503
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTAATTGTAACTTCCTCTAGACTACTACTGACCCCATGACTCAGTGTCAT CCAACTTTGATGTCTCTGTAGAAAAAAATTAGTGCACCCCTTCTCTCTAT CACTCCCCCCCACCCCCCCCCACACACACCTATGGCGTTTGATTTCTTCT CCGATCCCGTCTCTCTCCACGACGGAGCCGCCTCCTCCCCTTCTCCCGTC CCTCTCGATGTGCAAGGGGAAGTCGGGATGCCATTCACCTCCTGCCCAAC CCTCTCCCCTCCAGGATTCGTCTTGATTAGGAACATCTCCAGTCCATCCT TTTCCCCTCTGTGCGCCGCCATCATTGGGTTCTCACATCCGGCTTAAAGA TCTCAATATGTTCAGTACCTCGATGCGGTGTGAGCTCGGTGCGGCCACCA CGACATCTGATTGAATGGCGGTTGGTAGTCCCGGTTTTGCAATCGCTGCT GATTTCGTGGTGTCCGCCTGAGGGCTTGGGTCAGATTTTTGCCGTACTTC CATCAGTTCGTCACAGTCGTGGCCTGTCGATAGGTAAGCTGGTTGTTTGC CCTGGCCTTATGGGGACACGCAGCTGCAGGTGAGCGATTCCCCTTTATTT TTCTTAGGTACATGTATATCCTGTTTGTAGTCCTAATCTGGGGACAACCG CACCAATTTCTCGCATCAATTGACATTAGACGTGCATATTGTACCTTTTC TAATTATATTGACATGAGTTTGGAAACAAATTAGGAAAACTCTAATAGCT ATTCTATTTAATGTACAGACTATACTATGTGCAGATATGAACGATGTATC TGAACTAACCACAATTGTTTCAGGTTGCATTCATGTAACCTCAATTAATG TTAGAATAGTTCATAGAATTGTAGTTTTTTCTAATTTATAGCCTTAATTA ATGTGCCAACAAATATGTGAAGTGCTTAAACTGGATAATCACCAATGCCC ATTCTGACGTTTAGCCAGTCTCAGGGCTGAGATTGATCTCACAGTGACTT TCATGTAGTTTCATCTGAAATTGTTGTGAAGTTCATGTGAGTTTTAGATC AACGACTAACCCTTTATTTCCTCATGTTTACATACTTTTGTTTAGAAGAT GAAGGCGCGATGGTGATGGATAATAGCCAAATTATTCGTTTGTGAGTTGG AGCAGCCACACCGGACAGCGCAAGAGTACTATCACAACCTACATGCGAAG CATTTAGGAGAATCATCACTAGGCTCAGGGACGCACGGACAGCCGCAGAC GCGCACGACACATTGTCAGGGGCGGATCCATGTGCATACATGGGGGTGAA CAGGACACCGGGTAAAACTGATTTTATTTGTAAATTAGCTATTTTCCCAC CATGTGTGCAACCCCTAATACAAGTAATTTTGATGTTGGGGCACCATCGT GCACCCCGATCAGCACTTCTCTAGCTCCGCCACTAGACGCACGGACAGCC GCAGACGCGCACGACACATTGTCAGGGGCGGATCCATGTGCATACATGGG GGTGAACAGGACACCGGGTAAAACTGATTTTATTTGTAAATTAGCTATTT TCCCACCATGTGTGCAACCCCTAATACAAGTAATTTTGATGTTGGGGCAC CATCGTGCACCCCGATCAGCACTTCTCTAGCTCCGCCACTAATCCTCATG AACTCCCAGACAGATGCGGTACATGTTAATTTTCTCGCGGCAGCATAGAC ACGGCATAGACTGTCCATGAACGTGTCCATTTTGGCCATATCCTTTCATG GCGAGAATGTCACCCCGGCCGCCAAACAGATACAGTCACCACTTCCGCTT GCGATAGATGGCGGCGAGCCCTCAGCGCAGGCAGGTGGTGAAGAGGCGAG CAGAGGAAGAAGTCAGGGGGTGTCCATCAACTTGGAGCTGTCTCGGCACT CCTGCACCCCCTCGAAATCGGGCAACAATGGTGGCTGCTTCATCATCTGT TGTGGTTGCATGTCTGTGTTGCTATGCCTACTCATTTTTGCAGCAACACC CTGCCCCGCCTCCGGAGACAACTATGATTTGGTTTAAGGTGGAAGGTATG GCCTTCTTGCTGTTCCACGGCAAGACCTTTTTTGTACTTTGTTCAAGTGT TCTGTTTTCCTATAATTGCCCGAGACACACACAGATGGCTGAATTAACAT TGAACATATGCCTTTTAGTTCCAGTTATAATGATTCGGCGACTTCTTCTT AAGGCTATGTTTGAGTTAAATCTTAAATAGACAATATAGTATACATAGAT CGATCGATGTCAAGATTTAGCATTAGGTTGTGTTGGCTAGATTCACCTAC AGTTTGTAGGGAAACATAATGGCCAAACCTATTCTGTAAATGAAATGTTA TTATGTTACATGCTTAATGAAATATATGGTAGAGTTCTGTTCTTTTCGTC CAAATATTTCTTCATAAATAATATATAAGAGAAGGTTATAGAGTTCAGTT TTGATAGGACTGACATTTACTTGATGTCTCACTTCCAAATTTTGTTTCCC TTATTAGCATTTGATCTAGCCGATATGGCCTCTGTAGTATGTGGCCACCA TAGTGTTATATATATCAACCGAGGGCGCACACACAGACACACTAGATTTG TAAACAAACTGTATGTTTTATAGTTATCTTGCTGTTTTCTAAAAAAGCGT GAAGCTAAGAAAGAGTTTCTCACAAAAGTTATGTAGCGCCATGGCACTAG ATTTCAGTTTTATACATATTTCGAGTAGTTCTAAGATTACTCACCGGCTT GTGCATTACCCTATGCAGATTAGTGTTGGTGATGGATATGCACACGGAAT GGCTAAATAGACTTCATGTTTTATGGAAGACGTCTATGTTTTCTCTAGAC ACTTATGTTTTGGTGGAACTGCTAGAATTTTTCTTCAAAGTGCATCCATA TATTACAAGTTCTAAATATGCTACAATATGGTTAGTCCACGATACGACGT CGGACTGTTTTTGCAGTTGCTAACTAATTTAGTGTACCCTAAGAAAACCG GGAATACCTATATTTCTGTGAGATCCCATTGAGGGTGACTTACCTAGCTA TAACTATACATTGTTTAGAGGTTTTTACAACGTGCACTCCACGTCCAAAT AGTTGAAATTTTGAGATGTATATGCAAACATGTTTGAAATATTTCTACCC GTGGACAAGGTCTTATATACACTGAGATTGCTGCGATTATATGAATTTAT CTAAAATCTCACGGAGAGTGGATCCCCTGGCTAGAACAAGGCATCCTTTC AGGATTTTTCCAGCATTGACGCACTCTATTAAAAAACTTTGAAAGATCTT ACCAAATATACCCATTTTGATCTAGGCTAGGTACCTGGGTTATCTGGCTT CATTTTTTCCCCGATGGCATGCAACAGAGTATTTTTTTTGTGCGGAATCC ATAATCATCATTACCTGGTCATAGTTTGAGCGTCCACAAGTGTCTATTTT CATGCTTACCAGTCATGATCATTTTCCATGGTCCCATAACACTTGCCTGT CCATGCAATTTTCCAAGTATATGCTTATCCCACATAATGATTTGCCTAGG ATATAATGCCCTTGGGCTACCTGTCCTTTTTGAAGGGATCAACTATGCCA TGTGGAAAAATAACCGTGTGCATTGGCTTTATGCTGCCACAGAAAGATAA CTCCGCTGATTCCTTGATGAAAATAGTTGAGATCCGCCCCTAGCTATGAA ATGAAAGTCGACGTGGAAGAGAGCCTAAGGCAGAGGCTCATTGAGCTGGT CAAGTCCGTCAGAGCTTCATATGGTATGTCATCAACTATGGCTACACAAA GAAACTCGATAGCAGGTAAAGTAGCTAGCCATGGTCTAAGCAAAGGTCCT CTGACAAAAATATAGCTTGCTTGAATCATTCTGCATGCATGTTTGTGTTG AATATGAAGGTATCCTTCCTCTCCCGGTGATGTTTGGTGCGTCGTCTAGA AAGACACTCATGGCAGACTATGTAGCCTATACTGGAAGCAAGCCACCTTA TACCAGTATGGACTATGGAGAGGTTTACCAGGGCTATCATCAAATTAATG TTCAAATATACGTCTAACCGGGACGAACTGGATTGATAAGGTGCGGCATT ATGATGTCTCTGCCTTTCGAATCTATGATGCAGACAAATGTCTTGCAGTC TTGTTCTTTGATATTTGTTTCCGTACAAAGTTTGCTGACAATTTTTCCTA CAAGGCGGGGTCCATTCGTGTTTTACACAAGGGCGACGGGTGCTTGGTTG TTGGCTCTGTTCTAGGAAAGAAATATTGGTCCGTATAGTGGCCTATATAA AGAGGTTTCCTGGTTGCACACACTCTGCCCGTTTCATTTTTTGAGCTATG TGTTATGTATGTGTCCTTGTGGTTTTGTAACCTGGATTAGCATTTTATGG GTGCTGGTGCGCCTTGGATCCTTAGTGCTTTTGCAAGATGGAATCATCAT GATGTAGTTGTAGCGTACAACTTCAGTGGTGGCTTATGAATGTAGCCAAA TATTTTTCATTTTTTGAATTGAATGTAGTTAAAGATTTAGGGTACATTTG AGCATGCCGTTCATGTCATTATGACCCAGTCTTTATCGTGTTAGTGACGA TGTCATTGTGTCCCACCGTATACAGTTTCGCAAGAGTTCATGCATTATAG TCTAGAGAGCCATCAATATCTGCTTCACTGGGTTTCGCTGGGTTCATCGG TTTCATGCCAAACTTGGCCATGTTCCAGAGCAAAGAGCCTAGATGCAATG CACCAGCCGCACCATGAAACAACACCAAGCAGACGGCGCGGCGAAGCGCG CATGTCCATCTAGTATAATTTACATGTCATGGATTAAACCCCCCCAGATC TTATCAGCTTAGTGTTCAAAGGCTTCGACGAACAGGTAATATTCCTCCAC CATCCCAATTTCCACTAACATGAAAAAAATGTATGTAATGGAATAGGCTG TTAGAGCAAATTGCCCTTTTCTTTTCCTTCTATTGTAGCGCACGATTCAA TAGTTTGTTTTCCTGAGTTCAATATAGATAACAGTGCATTCACAGTTGTT ATGAGAAGAAGGTTTCTAAGATGTGTAAAATTCAACATCGTAGATTATGG AAAATGTCTCTTCTTGTAAAACATCCATAGCATTAATAATTCCTCTAAGC TCGGTAAAATTCAACATCGTAGATTACAGTGTGACATACATGTAACCTCA ATCCCAATTTCTCTAGTTTTGATGTTTCTGTTATGGCTGAATTTGTAAAT AGTGTTATGGCTGAATTTGTAATAAATACTGTTATGGCTGAACTTGTACA TGAACAGATGCATGTTTCTAAATTATAACCCCTCGCCGCCTTGATAATTA ACAGCCTAACAGCTTGTCGAGGCTTGTAAGTGGTCGCGTGGATCGTGGCG GCCGACGGCACTGGCCCAATCTGCTCAGTTGGGGGGCGTTGCGTCAGTGA CTGACCCACTGATCGGATCGGCTCGGCCTGGCCAGATGGTGCAGCGGCAG CGACATGAGCGGACGGGAGGCGCTGCGGTAGCGACAGGCGCGGATAGGAC GATCGGCTGACAGGCGGTGATGCGTGGTCTGCTGGGCGGGAAGTACCGAA CGGGAAGTAGATGGGCCGAGCCCACGCTGATCTCCTTCATGGTGGGCTTC TCGTCCCATTAGGCCTTCCCTGGAACAGCAACCGCTAAAGCGAGCCCACG GGAGGGGTATAAATACCAACTCCTCGACCTCAAAGGACCCTAGGTTAAAG CGACGCCGCCACAAGCCGTCCGCCTTGCTCTTCTTCCGAGAGCCTGGTCC CACAGGGTTAGCTCTTCCGTCGATCTCGTAGCTGCTGCCATGGCGATCAA GAGGACCAAGGCCGAGAAGAAGATCGCGTACGACAAGAAGCTCTGCTCGC TGCTGGACGAGTACAGCAAGGTGCTCATCGCCGTCGCCGACAATGTCGGC TCCACCCAGCTCCAGGAGATCCGCAAGGGTCTCCGCGGCGACTCCATCGT GCTCATGGGCAAGAACACCCTCATCCGCCGCTGCATCAAGGTCCACGCCG AGAAGACCGGCAACAAGGACTACCTCGAGCTCAGCAACCTCCTCATCGTA AGCCCCACCCCCACCGGATTTGTTTCATTTCTGTATATGCTCCGTGCCGT TCCTTGTTGGTTGCGGTTTGTGTGCTGACATAAGGGATGCCCCTAATTGT AGGGCAACGTTGGGCTCATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAGGTTCGT GAGGAGGTCGCCAAGTACAAGGTAAATTACCAACTGCCTTACATATGCCA GCCTTGCAACGTTGCTGGTAAAATTCCTGAGAACACAAATATAAGGTCGC ATAATTGTTACTTTTTTCTTGGATAAGTTAGGATAACTGTTCCCTGTTGT GCCATCTTTCAAAGATTTATAGAGATCCATCAACTAATTGGTCGATTGTA TTGTTATCGGCCGTGAAGATTTTTGGGAAAATTACATAGTGAATTTGCAT TGCAATGATGGACCATGTGTGTTTGACTTGGATTTTCTTCAAGTAAAGAG GAATAATGTACTTGTTAGTGATACATTATCTATGGATGATTCGGATGGAG CTTCAATGACTTGGTGTTTAGAAGTCTCTCCGTGACTTGGTGGTGAAATC CATCGTCCATCTTCGATCCAACGTATCATATTGCCTCTAATTTTAAAATA AAAAACTAAAACTATTCGAAAAATTCTGAAAAAAATTACAGTAAAGCGTA ACTATCTCGTTTTGAAATCTGTGAATGTTTCATCCCATTTGGATGAATAG ATTATGATTAAATAGCTTTTTACGTTTTAGAACACTAGTTTGAACTAAAT ACCTATTTAATCACAAACCTTTGATCCAAATAGGATGAAACTTTACCATA ATACAAATCGAAACATGCATGAGTTACTTGATTTTTTTCAAAATTTTCCG AGTAGTTTTAATTATGTTGTTTAAAATCTAAATCAATCTTGTATGTTGGA TGGAAGATGAATGGTGGATGATGGCACCAAGTCACGGTGAGACTTGCAAC CACCAAGTCACTGGAGCTCGGTCGGGATGATTCAGTACAAGTCTAACATT GTTGTTCTGCAACTTTTTGTACGATATTAATCATAAATGAGCCAGTTCGC TAGCTATTGTCTTCCAATCTACATAGGCACATATGATTTGCTAGCTTATC TAGTGGTCTCAAGTCAAGTCTAGTTTATTGCTAATTGTGATGTTGAATGT TTTAGTTGATACATCCTCTGTCATGTTCATTTTTTCGTTTTTTTTCTGTT GATGAAGTAATCTTCAGGACTTAGTAGTATTGGATTATTATTTGATGTGC AGTGACCCTGATCTTGTTTTGTGTTGCGCTACAGGTTGGTGCTCCTGCTC GTGTTGGGCTAGTTGCACCTGTTGATGTGGTTGTTCCCCCTGGCAACACT GGTCTGGACCCCTCCCAGACATCCTTCTTCCAGGCGAGCATTTGTTAATT CTTGTCCTTTTGAATCTCCCTTTGTACTAACCTAACTGTTCTGACCTCTG ATTTCTTCTTCTAGGTGCTTAACATCCCCACCAAGATTAACAAGGGTACT GTGGAAATTATCACCCCTGTGGAGCTGATTAAGAAGGGTGACAAGGTGGG CTCTTCTGAGTCTGCCCTGCTAGCCAAGCTTGGTATCCGCCCGTTCTCAT ACGGGTTGGTCATCAGCAATGTGTATGACAGTGGGTCGGTCTTCAGCCCT GAGGTTCTCGACCTGACTGAGGAAGACCTGATGGACAAGTTTGCGTGTGG TGTTTCCATGGTCGCCTCGCTGTCTCTGGCGATCTCGTACCCTACCATGG CTGCTGCCCCTCACATGTTCCTCAATGCCTACAAGAACGTCCTTGCTGTT GCTGTGGAGACCGATTACTCGTACCCACATGCTGATAAGATCAAGGAGTA TCTCAAGGTAATCCCCAATCATCTCATTCATGCCAAACATGCTGGAAATG TCTCTTCTGAACATCAGAAGTACAAGATTTTACTATAACAAATTTGTTTA GCTCGCCTTGTATTGTCTATTTAGTTTTTATGTGGATGCATGTATTGTTC CAACTGGGCAGGCATATCATCTTAAGAGCAATAAATTGATCCTCTTCTTT TCCATTGCCATCTTGTAGCAATAGATTGTCTATGTCATTGTTTTTTTATG GCAGACTGTATGCTAATTTACTTCTTGTGCAAGGAGACAATGCTAGGCAG TCTTCTTTGCTAGACCTGTGATGCTGACCTGACATGCTGTCTCTACTAAT TGTATCTGCCCTTATCGTTGCACCATTTCTGGTACTCGTTTGTAACCTGG TGTGTTCTCCTTCTCTGTACAGGACCCCAGCAAGTTTGCCGTCGCTGCCC CTGTTGCCGCTGCTGCCTCAGGCAGCGGTGGTGCTGCTGCTGCCCCCAAG GAGGAGGAGAAGAAGGACGAGCCGGCGGACGAGTCTGATGAAGAGATGGG ATTCAGCCTGTTCGACGACTAAGCTGTGTGCACGTATCTCGCCAGTGTCA AAGAAGTGTCAAGTTGTCTTAGTGTGTCTGAACACTAAAGTTGCATGCTG TTATTTTTAACTCAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.