Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA024003

[Submit comment/correction]

Sequence	AA024003
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA024003
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCCTTCCAAAAACCCCAACTCTCGACTCCCCAAGGCGACGGCTGTGACA AGGCGCCAGAGCTCGTCGCCGTCGGCCATGGACAACTCGAACTTCAGCTT CGGGCTCGGCGTCGAGAGATATCTTCGATCCGCGCTTCCGTACGGCGGGC TTCCAAGCAAGGACTCGCCGCAGATGGCGTTCTTCGACGCGGCCTCCGAG GGCGACCTTCCCCGCATGAGAGGTGAGCGAGCTCTGCATCCGTCCTGTAC CTCACGCGTCTGGCCGCGCGCCGCTCCCCTCCTTCCAATGCGGCGCTGTA TTTGCTAGGGTTTTGCATCAGCTAGGGTTTTGGGGGAAATGGGGGCGGGG GTTGCGTGTGCTCCTTTCGCCATGTAATGCCTGTGTCTCACCTCCGAGTT TTTTTGGTGTTGTATTGAAGAGCTGGCGAGCGGCAGGGATGCGGAGGGGA AGGCATGGCTTGCCGATGTGTGTATCGCAGGTGGGGGGCCGTTTCAGACG GCGGCGCGCCTGGGAAAACTGGATGCGGTCAGGTGTATGGTGGAAGAGTT GGGGTTCGACGTCAATGCTGGTAGCCAAGAGGGTATGTGTGCGGTTTCTC TCTGTTAACATTTCATTATATTCTTTCGTGTTCTGGTTACCTCAATTTCA CAATGTCTGTTACCCGTCTGCATGATCTTTCAACTTGCATATATTTCAGT AAATTCACTGAACCAATCTCGTATGCTTTGAGCAGTGCAGCATGCCATGG TCCAACTTTTGCTGGTTCACTTACGAGATATGAGTACATTGGTAGCTTTC ATGGAAATTCATATCTTAGTTGAGAGAGATATGTCAGTGATTGCACTAGT TACCTGTTGCCAATGTTATTGGCAGGTATAACTGCTTTGGATGCTGCTAC AATGGACGAAAGGATGGATGTTATGAGGTATCTTCTCGACCATGGGGCTG ATCCAAATAAGCGAGCCAATTCAGGATTTGTTCCTCTTCATTGTGCTGCA AGAAAAGGTCTCTTCTCTGCACATACTAAGATTTGTGTCTGTAGACTTGT GTTTACTAAGTGGTTGCTGTGTGAAGAAGAAAGATTTGGAGTGGTCCATT TTTCTCTGGAACACTCTTCAACTACTCACTAATGCAATTTGATCATTTAT GGCTTCTAGGTTTTGTTCTGCTTTAGACACTGAATTCTTGCAGTTCTACC AAAAATATTATCTGACTTTTTTTCTCACAGTTCATGCTGGTTTGTAGTGC TATCCAACCGTGTAAGCTTACGTATTACATTTTCAGTCTGGTTCAGATAA TTAGCAATCTAGTTCCCCTACTTTTTGTATTCCATTTTGTGGCTTTATTA GATAAACTCTCAATTACGTGAATTTGGTTCTTGAGGCCATCTAGCAGACA TTGGCATGTACATAGTTTCAGTTTTATTTGTTTCCCTATTGATTAGAACA TCTGGTCCCCCGTCAGAAAAACTAATCCGTCAGTTCTTACTCTCTGTGTG TATCTCATTTATAACAAAATGATAACAAATTATGTGCTTGTTCTTTTGTT TCTGTAGCATTGCTATGTCTTTTAAATAGTTTCACTAAAATAATCATGAC TCAATTGATTAATGCTTGGCCTCTAGCTAAGCGAGGCAAGTGGTGCTGCT TCTTGATAACCCTTAAGAATATATTTTTCTGCTGTGCAAGAAATCCATGT TTTTCATGGTAGCGTTATATTCTGCTTTTTGTGCACCTTGTCCAGGACGT GATGAAGCAGCAAAGCTTTTGCTATCAAGTGGAGCTAGTGTTGATATAGC TTTTTCTGATGGGACACCACTACATTTTGCTGCTGCCTGTGGGACGATTG GTGTCATGAAAGTTCTACTGGAGCATAATGCAGATGTAATAAGTAAATTC CATGCTTTTGTATTTGAGATCTATATGCTACCTTGTTAGAAGCAAATCAT CAACATTTAGTATATTGGATTGCTGTTCCACGCCTTGGTCTCAGCCTTTT ATTGTGGCTGTAGGTATTCATCTCCTATATTTCTAATTAATAATAGTTCA AAGTTGTTAGCTTGAATGGGCAATTCAAATGGCTTTTCAGCAGGTCACAT GCTACTCCGTTCCATTGCTTATTTTTTCCTTGCTGCATGATCTTCAGTTC TTCAGGATGTCATAGCAGATATTGATGTCAAATGTCTTTAACATGTGTAT TTTATTATTTGATCTGTCACTCAACAGCATAATGTTATTCTATGTCGTGT TTTTAGTGTCATAAATATTGGTTGGGTTGAAAGAACTGTCTTTGCAGTTG ACGCTTGGCAATCTATATAAAATATGCATTGCAAACTGTCATGTGCCTGT CCTATGATAGTTCTGTCTTCCCACTTCCAAGTAAAAGGAGAATCATGAGA ACGGAAACATGTTGTGTCTGTGATATAATTTCCCTCTACATTAGTTCGAG CATTTAATTTCTTCCTATATCAAAAGTTAATATTTTTCACTGAAGAATAT TCTGTCATAAAAATGTAGCCGAACAAGCTTTCAGAAATTGGAGGTACTCC TCTCTCTGAAACACTTTGCGCCACCAATAAAGGACTACCTGAAACTATTT TATTGAAGTGTGTGAAGCTTCTTGTGGAGGTCTGGTAACTGTCCACCTTG ACTTCATGATAGCATATTATAGTTTTCTTACGATAATAATCTATTGCATC AGTTGCATAGTCCATATCTGTTAATTTTATATGGTTTATATCTACAGGCA GGCGCAGATGTAAATTGTACGACCCAAAATCCATTGGTGATAGCAACTAC TCATGGCTTAACTAACTGTGTCAAGTACCTGTTGAAGGCTGGTGCAGACC CAAACATCCCAGTGTCATGTGAGTTTTGTTGCATTTTTACCTGACTGTGT CTTCTAGTGCTTGCAGTTTTCTTAGTCGCTGGTATTATCTAGGTGACTGC TGACATATCTAGCATGAACACCTATTTCCTACTTTGATTCTAGCACGCAA ACCTCTCCCTGAGGCATCCAAAGAACAGGCAATGAATCTTCAGAAAATTG ATTTATACTAGGTAGTTCTTCAGGCTGCTAATATCACTGAAAGTTGGCAT GATATAGAGTGCAGATGCACTTAATGTTATCAATTTTCAACAAAAATGTT CTTGACTTTTGATTGAGGAAAGCTGATTTTTTGAGAAACAACTCAGGTGC CATTTTGAAGTGGGTGCGTCATGTAATGTCTAGTTTAACTTCATCAATTT GTGTGCCCAATTTCATTTTTCTATTTCCTTCATATATAATTTTTCTGTAA TTATTACTACTGAGATTCTTTACTAGGTTTGTATTTGTTTTTTAAGCCCT GGTAGCTATATAATGTTACTGAATCATGTGGTTCCTGCTTGTTTCTTTGG TTACATGACAGTGTGGTGTCAAGCCAATAGAACTAGCTGCAAGCAGTGGA ATGCGGAAGCTTGTGGAGTTACTATTTCCTTTAACTTCTCCCATTCTAAC TGTACCAAACTGGACAGTTGATGGAATTATGGCCCACGCCAACTCAAGGC CCTCAAAGCCCAAGGTATGAATTGAACTCTGAGAATTTGAATAAGCCTAT ATTGAGTTATTTTTCTGTCCTCCAACTGTAATGGCATAAATTTTTGCACC TCTAATCACCTGAATATTTTTTAAAATGGGAGTATGGGAATATGAGAGAC AGGTCTACTTAAAAGAAATGGTATAGCAATTTTATGGATTTTGTTACTAA TGCAGATTTTTCATTCTGTTTTTGCCGTTCTCTCTCCCTAGGCCACAGTT CAGTAGTTCACTGACACGGCCCAGTGGCAAATTTGAAATGCAAGCAAAAA TATTGAACAAAAAATCTAGAGTCAAGCATTATGGCCCCGATATTGTAAAT ACAAAGCACACTAGAAAGATAATCCTTTGGATCCAGAAAATCTTGACCTC AACCAAATTACAAAGAGAGAGGAAATTAGGTTCGGCTTCATCCACTTATT CTATCGTAGAGGAAGCTCTGACCTGTAACCATTCCAAGCAAAAACAGCAT TCTTCTCCATCTATGCTTTATTAGGGTGGATTTATTTTTCAGAATCGCGT GTCCATGTTTCCGAGCAACAAAAGAAGTAATTAGTTCCTTGGAGAAAATT TGTGATACCGCCTTAACTTTATAAGACAAACATGTTCAATTCCAGCCATA TTCTTTACCTGCACATCACAAGATACACAACAATTTATGAAGTTGCATTC TACCTGCAAAGCTGCTCACATTGTTTCCCTTTTATATACTTTATGATGTG TGTTGTAAATGATAGATCACCTTTGAAAACAGTGTAAGTACCTTCTCTGT TCCAAAGTATTTGAAGTTCTAGCCTTGTCGTAAGTCAAACTTTTCTATAT TTGATCAAGTCTATAGAAAATAATACTATTATCTACAACATCCAATATAC ATAGTACTTTAAAAAATATATAGACTGAAGTGTCAGTTTACGCCATGTAT TTTCACATACTGCACTTGTCTTTTGTAACAAAGAAACATAAAATTTGTAT TTGTCGTTTCAATTGTTTATGACTTAGCTAATTATAAACAGACAGTACAA CCTAATTCCTTAGTAGACCTTTCAATGACTATTATACATTTTGTATCTTT ATTTTGCTTGGTTTAATTTGTCTCGTTGATTTAGGTTAAACCTGTTAAAA ATACAAAAGTTCAGTTGAAATCTTATGGCGAGAAAGCTGTTCAGAGAAAG GATTATGATGGTGCTGCAATGTTCTACACCGAGGTTAGTGCTGATGTGTA TTAGTTATGCTACTCTAAGGTCTTTGAAAGATGCATATGCATGGAACTTC ACGGTGCATCTTTCCCACTTGCTATACAGAAATAGGCATCTGCTTAACAA CTGTCTGTCAGTGTGGATTTGGAGTTTCTGTTCCGAAATATCTGTCCGTT GATGAAGTCAAGAGTGTAATTATTTGACACTGTTTACAGGTAGTGATGGT TATTAGTTAGGTCCAACATGGTGCATGGCCTCCCAGCCAAAAATATGATT TAGATGAACACCTAATATTTAACACTATTTGGCCAAATTTGGCAATAGTA CCCTAGATTAGACCCCTCAACTCTGCCCAAAGCTTATTTAGTCCCCTCTC AAATCTTGTTGAAGTTCTGCCACTGTTTCCAGGTAAACATATGTCTAGCT ATAAGCCAAATAACTGTGAAGTACAACTATAGTTCGATCCACCATAGTAC TGTAAGGTCTCCAGCCAAGTCTAGGCATGTATCATGTTGTCTGGGGACCT GTAACAGCCATGACTGCTGGGAACGGTTCAAACCATCTTCAGCAGCCCTC TAGAAAAAGGCCCTTAATGATCTGAGGAACCTTGGTTCTCAGGTTTCAGT TCAGAACTATGATAAAGTGTGAACATACACAATGTCATTGCTGGTAAGAG TGACAGGGGCATGGACATATGGAACCAACGATGTCTTGTTTATGTAAATG TTTGTATAATAGATTACAGTAATTACAGTCTTGCTCTTTTGTCAAAAACT TGTTTTCTTATGGTAAGTTCCTCACTATTTTCAGTTCTCTGTTTTGATGT AGGCAATTGAGCTAGATCCTACAGACGCGACATTGTATTCGAATAGGAGC CTTTGCCATCTGGAAATGACTGAAGCAGAGAAGGCTCTGCAGGATGCTAA CACTTGCATAAGATTGCGCCCTGAATGGATAAAAGGACACTACAGGAAAG GAGCTGCTCTCATGTTGCTCAAGGTAAGCTGAATTGCAGCTTACTCACCT CATGATTGGTTACATGAAACCTCCCCGTATATTTACTGTAACCTGCCTAA CTTCCCATCCATAGGACTACACGAAAGCTTGTGATGCATTCATGGTTGGA CTGCAGCTGGACCCGGAAGTGCCGAGATGGAGAAAGCGTTCAGGTAAGCT ATCCGAAATCATGTTTCACTTCTCAACAGCTCAAGTGATGGAAGTTTTGT GTTTCACTATGTTCACTCGTATTCGTAGCGTTTAGTTTGTTTATTTTCTC CACAGCCAGATGCAATTGCAACATTAAGTTTGATGAGGGTTGAAAAAAGA CAGAACTCATTATTTTCCAAGTTTGTTTCTGCACATTTGCAGACTAGCCA AAACCAGGCACCGAACAGGGCATTAATTCTGTTCATGTTTTGCAGGGGGG CAGTTGAGGCGATGAAGGCAGATCACTTGGCTAGAAGAGGTTTGAAGCCA TCCAGTTAGAGGAAAACTGGGGATTGCACTGCCCGTTTTTGTATAGTATA TATCCTAACGCTAGGAAGCTTGGGCTTAGCTGTCTTCTTTCCGGTACTGT AGACTGTAGTAGCAAGATGCCCAGTGAGCAGCACTATGGCTCTGGTTTGC CTGTGGATGGCGCCGTTGCGGAACGCCAGATCTCCGTAGTAAACCCGACG TGTAGTGAAAATAGATGTTTCCTTTCCTGCGTCCGGTGAAAGAGGACCAT CTTGATGGCTATTATTCCGGTGTCTATGCTACCTTTTATTTAATCCATTC TCCGAGAGAAGTATCCATTGTTACCCACCCTGTGTGGATGAATATCGTGG TTAGCAATGGCAGTCACTGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.