Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA020942

[Submit comment/correction]

Sequence
AA020942
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020942
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTCCCTTGGCTGCTTCTTGCCTTTTCCATAGGAGGATTGTGCAGTGCAG
CCACGTTCTTCTTCTTCCGCTTCTGCTCGGCTCTCAAGGGGAATGGGGCG
CGCGCGTGCCCCCAACCAACCCTAGCTATGCTAGCTAGCTAAATCGACTG
ATGATGGCGTCGCTCCTGGCCGAGATGGTGGCGCTCGCGACCCTTGCGTG
GCGCTGGCTGCGGTGCGCGGCCGAGCTGAGGCGGCTGACCTCAGAGGAGG
AGGAGGAGGAGGTCCACCCCTACTACCACGGCGCGACGGAGGCTCTCCCG
TGGACGGACCCTGTGGTTCCGCCAGCGGCAGAGGCCGGGAAGAAGAAGAA
GGGGTCGTGCGAGGTGTGCGGCAGGCCGACTTCCTTCAGGTGCAAGCGCT
GCAAGGGCGTCAACTACTGGTTAGCTCCCTCCCTGCCTGCTTATTTCCGA
TGCAGTTTATTGTTCCTTCATGAGTTCGATTTTTTTATTCCTTCCTTCTC
CTTCCGATAGGAAGAAAGCTGCCTCACATGCCGTGTATTGGTCGGTCTTT
TTTTTAATCAAAAAATCAATGTACTAGTACTGTACTAGTTTATTGGTCTG
TGTGGTTTCCTGAGCTTTTTTTTTTGAGGGAGAAGATGGGGTTTCCCTGA
GCTATGTTGTTGAGGTCAAGGGGGGCGCCGCACCACTCCAACCCAAAACA
GAAGTAAATTTAATTACAGCCTAACAGTTTGCTAAGTTTGGATAAAAAAA
ACTACTCGTAAGAACATTCCTTCGGCCCCCTTAATTCTGTAGCTTACGGG
CCTGGGGGTGGGTTGCTTAGGCCCATCGTGGCGACCCATCCTGATTCGCT
ACCACAAGACTTCGCACCCTGCAGCAGCACCGTCGACCGGGCGGCGAGCC
ACCACCCCCGCCCACTTCTGGTCCGGTATCCGCCGACCCGGCGGCTAACG
CTCAGCACCAGCACCAGCGACCCTACGGCGACCGGCGACCGGCGACCGGC
GACCAACAGACCAAGCAGCTCAGCCGTTGAGTCAACATTCATCAAGTTTA
TTACTATATCCCATCCACCCCTCCTCTCCACATGATTCTTGGTAAGCGGT
AATCTAATTAGGATTTTCAGTACGACCACAGTCTCCTCGATGCTAAATTA
CTAATTTGGGATTTTCTTCTTGTTTGAACCGCGCGCGCGTATTTCTCCAA
TTATCCTGCTGATTGATGAATTACGACTTGGGGGTAAGAGGGAGTTTAGT
GAATCTAGGATTTGGGAACTGGATACAAAATGGCTAAAAGGGGGTACGTA
CGTACCATTACTCCTATCTAGGCCTGTAAGTGGGCATGCCCGCCCATGGG
CTTGCCGATTGTGCCCGTTTGATTATTTGGGAGTACGATTTTGCCCAGTT
AGTACCCGCTTGGTGCCGCCGGCGTCCATTAGTCTGATTAAGTTTTATTA
CCAAATAGCGACAGGCAGCAGCTCTTCAGCTTGCAGGCAAGCGCTCAGCA
GGTCGTTCTTTAGCTCAGTTCCATAGTTCCGAGGACGGCGAAGTGGTTGG
CCTTGTCGGCGGCATGCTCGTCCATGCTCTTGGTCAATTCGCGCGAGGGC
CGTCTCAGGCTCTGCTAGCTTCCCGAGATATCTCGAAAGCTAGACTCAAT
GACCTTTTTGATATTTGCCGGCGACGTCATCACTGTATTTCTACATCGAA
GATTACACCTTGCTGTACACGCCGTGGATCAATTTAGCTAACTCGTACCC
GTCTGTGACATGTATGCAATGTCCTGGTGATGTGTATGTGTATAAATACA
TGACGTGCATGCATACGTGACTAAGAGCATCTTCACTGGTTGCTTGTTTC
CAGGCCGAAATCCTGACTTAAATTAGGCCGGACTAAATAAGTTTTCGGCC
TGGAAACGCCGAGTTTCTCACTCGTATTCCTAGGCCGTGTTTCCAGACGA
AGTAAAAAGGGCGAAACATTTGAATTTTATCGTTTTTATCGGTCTTCGCC
TGATCGCCGACGACCGCTTGGGCCTCGGCGAGCTCCTTCGCCACCTTCGC
CCTCTCCTTCCTCTCCTTGCGGCCGCCCGACTCGACCTTTCTTTTCTGCA
CAATGTCCACCCACTCGGCGTTGGTCAATCGTCAGGCCTCTTCGTCGGCG
CTCTCGGTTTCCTCGCCTTTTTCTCCTCCGGTTCGCCGAGGTTGGATCTG
GGTTTGATGAAACCCTTTGGTGGCATGGCAGGCAAAAGCTCGGCGAACTA
GCGGGAGTGGGGGGAATTGGGAGGAAAGGCGGGAGAGGAGAAGAAAAGGG
CAGGATTTCGGCCTAGAGTCGCCGACAGAGTTGGCTCACCGTCGTTTTCG
TTCCATCCGGCATTTCCAAGGCGTTCTCAGGAACCCGGGTTCGGTTTGGA
AAGTCTAGACCAAAGTTGGCCCAAATCCAGACAAAATCGGGGTCCTAGAA
ATGCGACTGGCCAATTTTCAACGTCCAAACAAAAAATCATCCTGGAATCG
GCGTCCTCATAACCCGAGTGGAGATGCTCTAACCCCGATTGTGAGTCTGG
TCGTCGTCGAGTTAGTGCAATCCATCGTGCTGGGTGTTGTACCGCTGTTG
GAAGAAATCGCAGCTTGTAGTGGGCTAGCGGCGCTAGCGGATGAGCCACG
GTTGCCCGCCAGTTTACCGCTCTTGACCGGCCACGGTTGCCCGCCAGTTT
ACCGCTCTTGACCGTGGATGTCCAAGAATGCAAATAAATGGGAACGGTTG
GCGGCTCCGTGGGCAGCCGCGCCCAATTACACCCTGACTCCTATCCTACT
TCAAGTGGTTAAAGGTCACTATTCCAGTTTCTACTGTTTACTGCAAGTGC
AGAATGCGCATTTTCCAGCTTCAAGATCATTAAGACAAGGTTCCCATAAT
TTCTTACTTCACATACACTGAAACTGAAAAATTGCGCTGGTGGCCCTGAC
CTGTCAGCGAGAGAACGGCGATCTCATCCTCATCACTTCCCATTGACTCC
GCGTCGGACCGACGGGCAATGGCCGCATGTCCAATCGCCCACACGGAGGG
CGTAATGGCGCGTCACCGTTCACCCGTCTTCCTCCTTTTCCCTTTTCCCA
CCCTTGCCGTGCTTTCCCGAAATGTCTATAAAAGCCGGCCAACCTCGCCG
TCTTCAGAGAACCCACCTTCACACCTTCATTTCCTCCTCAATCTACCAAG
TTCTAGGCAAAGAGAAGCTCGCGGAAGAAATGACGGAGAGGTACCCTTGC
GACCCCGTGGCGGCGAACGGCTTCGGCAGCCGGTCGCTCCAGCCATGGGC
CTTCTACCAGGCGCTGCCGGATTTCTGGTGCCCGCCGACATGGAATCTCA
GCGTGGGCGGCGTACCCGTGCCACCGGTGCGAGAAGGGCACGAAAGGATC
AACGAGATCCAGATCGCCACCGCCGGCATGGACCCCAAGGAGGCGGAGCA
TCCCGAGAACGAGACGTACTGGGACAAGTACTTCCGCGAGCGCTGGCTGG
CGTACCACGAGGGCGGTGGCCCGGCGCCGGCGTGCAACAACGCCGAAGTC
GGCGTCGCTGGTGGAGTGCGCCCGGTCGCAACCTCACCGCAGTCCTCGAG
CATATCTCGGCCGGCAAGATAAGAGGATCCTCTAGATTAGCTACGCCACC
CTTTGCTGGACCAGGTGGAACATTAGGAACAAATTTACCATTGAACGACT
CTTCCCGGCACACCCAGCGGAAGCTTTAAATAAATTGTCTGCTTATCTCT
AGATCTGGAAGCCGGTGGCTAAAGGCCGTGACGGAGAGAAGTTGATGGAG
GCGATCAACAGGATCAGGAAGCCTAGATGGAGCCGTAGTCGTCTACTGTT
AGTTTCTATTTGGCTGATCTGGCTTGTATCCGCACTACATGTGTGACCCT
CTGTGGTCTGTGCCGTGGTCTGTGCTGTAAACTTCGTTTTGCGTTTTTCA
AACTGCTGATGTGTACTATGTTGGCCGGTGAGGCTATATTAATTTAAAAC
CAGGCTCTGCTCGAGCCTTCCGTCTACAAAAATCATACAAGTATTTTGAA
ACCAATGTGGACAATATCGATTTAAATTTGTCTCAAGTCTACAGTTTCTA
CTTTGTTGTGGTGGCTTAATTGTTTTGGTCTTTCGCCATACCCTCCAAAC
AATTTTATCAAGCTCCGCCATACCCTGTCATCGGACTTGTGTTTTCCTGA
TTATTTTCTGCCTAGAGCATGATGCCAGAAACTGCATTTCCTTCATAATC
TTTGATTCTTAGTAACTGTTTACACCAGCTTACTAGATTTTTCACTTGAT
CAACTTAGCCCCAGTTTGTCCTGAGCGTTTCTGCTGCTTTCAGAAAATTA
CTCCACTGAAGTAGAATTGGCACCCATACTAGGCGCCTCACATTTGGGTT
CAATCGTATAAATCATTCAACTCATTTATGCGGTTCAGTTCAGCAATTTT
GTACAATGAATAGTAACTTTGCTGAAAGTAAGATTCTATGAGTGGGATTT
AACACCAATTTTATGTCACTGCTGGACTGATCAATCTTTCCAAATTATGG
AATCGGTAGAATTTAGCGTGAGCATTATGATGTGAGACGGTCGCATGGTC
TTGTTCATATTCGGCAAATAAAAGGCCCAGAGACCATCTTCAATAATGCA
AATGGCTTGCAAGAAAACTTTATTATTTGGAGGACCCATATATTACTACT
TGTATTATTGGCCAGTGTGTAATATGCAATTATGTTGAGCTCAGTTTATA
TCCCATGTTCGATGGAGGACAAATTTTCTGGTATTATATTAACTCAGAGT
GCTTCTCCAAGTCACCAACTCTCTGAAACAGTACATGAAAGAAGGAGATC
CATTGATCTTAATAGTTGTATATAAAATTTGATCTTCCATCATACATGCT
TTATGTGCATCTTTATCCAACAAAGCATATGTATATATAATGCAGCATTG
ATTTTACCAAGTTGGTTTTGTTATAGTCTATTGTTTTAGTGGATAATTAG
TGGTCACATGTTCTTAATAATGATTGTCCCATCCACTAATTGTGAATATC
TTTGAATTTCACTGAATGTTTTCGTGATAATATTTTGAAGACTTTTACCA
AGTATTTGACTACATGAAACCTGAAAAGTGTCTTCAGAGTTGGCATCCGC
TCAAACAAATTCGTGCATATATTACGAATGGTAACTGTCTGGGTATGTTA
ATGATGTGCATTTTTTACTATAAGATATATTATATCTGGTGTGGTATTGG
TCAAATGAAACGAGGGCCCATTGTCTGAACAGATGTTAGTATTGTGTGTG
GTATGACGAATCGTACTGTATATACTGTTCTACTTGCTTAATTTCCCTTT
TATTTGTTGCAGCACCTTCGGATGCCAGATGGTTCACTGGAGACAAGGAC
ACAAAGATGAATGCCATCCACCAACTGTTGATGCTAAGAAAGATGGTACA
ATAAAAGCTTCTTCGGCAAAGAAAGGAGTTGAATGCAATAACTCATATGA
AGAAAGTGAGGTAGCAGGAGTAGAGAGAGCAGTTAAAATAAAAAATTCCA
TTGGTGCTATGCCTGAATCTTCCAAGGAAAACTGTGTTGCGGAGTGTTTA
AATGATGAAAGAAAGGAGATGCCCTTTGGGAAGGGATCCAATGCCGCAGA
GGTTTCTGAACATGACAGCAATATGTTCAGATTTTCTAGGGTTACAGTGC
ATGCAGAATCTGCTGATTGTTCAAGTTTTCCAACTTCTGGTAAATCTTGG
AAAGGCAATGACACTTTTGTTAGTGAAAATGGCTCTGATTCTCGCGTTCC
AGCAGACAACTCTAGTTCGCAAGCAGATAGATTTGCTGGGTTGCAATATG
AACTGGAGCAAGCTTGCAAACAATCTCCTTGCATAGATAACCATAAAAGC
TCTAGAAATTTGCCATCAATGTCAACTGTTGACAAAGTTTCTTCCATTCG
TGCTGTTGCACACTTTCCAGCGGGTAATCCATCTAAAAAGGCAGATAATC
TTATTGAAATTTCTGCGAGATTAGAGAGCAGTGTTGTGGTGCCAAATAAT
CTATCCACGACGAAAAGTTTGATCATGCAACAAACTGCTCCAAAAGTTGT
CAGGCGTTATCCATCAGAATCGGTATGCTCGTTTAATCTCTAACAGAGAC
TGTTACGCATTCAGCCTAATGGTTATCTAAACATCTCATAAATAATTTCA
GTACGAACTTTTCGTCAAGCTGTACAACTTTAACAAGGTGGAGTTACATC
CTTTTGGTCTACGTAACCTTGGGAATAGGTAAACAGTTATTTTTTCTGAA
AGGGAGGTAAACCATTCATGTTCTTTTATTAGGTTATCATACAAGTTATT
ATTTGGATGATGTTAATACCTATCCCTATTGAACTATTTCCTTACAAGAC
CTTCCTAACATATTTATGTTAGTGCTTTTCATTTGAGTCTAAATGTGACA
ATTTTATGAAAGATTTTGTTGCGTTGATCTTTGATGCATACCACTTTAGT
CATGCCTTAATATTTTTAAGCACTTTTCTTGTGACGTGCTTCATGTATTT
GTGGAAGAAATATTTGATTCATTACAGACAGGGTTCCATATCAATTATAG
ATGAAATCAAAGAACATGAAATGATATTTTTGGCTCAAACTGACATACTT
AATAGCCAATGGTTTCACTTTCTAGTCCTTTATTGTTACGAAACTCAAAC
TGTAGTTTCTATTTGGAGTAAATATTGCTCGAATAACAAAACAAGAGTCC
ACTGGCAGTATCCAGGGATTCACAAACTACTACTTGTGTCCAACAGGAGA
CGTGGTGGTGGACGCTAGATCCCGTACATCAAATGTACTCCCTCCGATCC
AAATTAATTGACTCGAATTTGTCTTGATTCGGATGTATCTTGCACTAAAA
CTTGTTTAGATACATCCGAATCTAGACAAATCCGAGTCAATTAATTTGGA
TCTGAGGGAGTAACATATTATGCACACCTTATCTCAATTTCTTATAAAGA
GGATTGATGTTACACATATTTGTCACCTCATGTCATAAGTATAAATAATT
TATTGAATTTGAGTGTATCGCTTTAATGCTGTTGTTTCTTCCTAACCTTT
GCCTTTTGTTTTACAGTTGCTACGCAAATGTTGTTATTCAGTGTTTGGCA
TTTACGAGGCCACTTACAGTGTACCTTCTGGAAAGACTCCATTCAAAAAA
TTGTAAACTAATGCTGAACTTGTATTTCTTGTTACTCACAACACTCCTTT
TGAGTTACAGTATATGACTGTATTTTGTAGGTTCCAAAAAGGAATGGTGC
TTCTTGTGTGAGTTTGAAAGACTCATTATGGAGGGTAAGCGAGGACAATC
TCCATTATCACCTACTGGAATACTCTCTCATCTGGGTGACATTGGGAGTA
GATTCGGTCCAGGCAAAGAAGAAGATGCTCATGAGTTTCTCAGGTGAGAT
TTTTTGTTCCTCTCCCTTCTCTCTAGCAGGCACTCATTCTATATGGGTTG
TGTGTGGTGTGGGTGGGTCGGTACGAGGGCAGGGTGTTACATAATAAGTT
AAACATTTTAATGAAGCTACTTCTATTGCCCTTGAGAAAGGAAATTCTTC
TTTTATTGGGGTTAAACTAACTGTTTTGTTGCTGCTCTGCTAACATGTCC
AATGATCATCCTTTTTTTTTGAATAGTTGAATATACTATTGACATTTTAC
TGAACTACTCGTTGGACTGATTACTAGTTTACTATAAGTTCCAACATAAT
GACAGGGTAAACCATTTTTTAATATTTGTACTAGAGTTGATGATTCTATT
ATCACTTCTATGCTAGTTTATGTTTGTAGAGGATGTTATTAAATATTAGG
ATTACAGTGATTAATGACAAATTTAGTTATGCAATGTTCCTCCTGCTCTT
GGCACATGTGCCTTTTGTTGTTGAAAATAGAAGGGAACTTGTTTTTACAT
TCCCAGATGGTTGAAATCCTCCTAGATTGATCTATTGGCAATCATAATTA
GTATTCACATGCCATAAAATCTAAGTCCGACATGAACTCGCTTTGGCTTG
GGTTTGTTAAAATGTATAATCTAAACATTAGGACCTATTTTTTAAAATAG
AAAATACAAAAATGGGACTTCCTGCATATCCGTTTCTACTCCATGGTGAG
AGATAACCTACTTGTAAGAGGTTTTCGATCCAAAAAAAATCACTTATGTT
ATAATATTGTTTGTAAAAAGTAGGAGGGTGTAGAACTTGGAAGCGTTAAA
TACAGCCATTTTACAGGTCAACAAGTCAAGGTGCCAAACGAGGTACATCA
GTGGAACTAAAGTATATTGTATAAACCAAAAAAATTGGCACCTTGCTATG
AAAGAGTGTATGCTAGCTTGTTACATATCAAGCATTTTAATCCAAAAGTC
TCTTCTATTAACCCTTCTAGGATGCGGCCTGTTTTTAACTAGTTAGATTT
CTTCACAATGAGTAGTGTTTTTCATTTAACTGCACTTAATGACAAGTTTA
ACAGGTATGCACTCGATACTATGCAATCTTCCAGCCTGGAGGAAGCCAAT
AATGGTGGTGTGCATAAGTTATCTGAAGAAACAACACTGGTGCAATTAAT
GTTTGGGGGCTATCTACGATCTAAGGTTTTCTCTACATAAAGAGCTCAAG
TTTCCAAAAAATTTGGTTCTTGAGTACTAGTGTTGCATATATAGTGTAAC
ATCTTTCGTTATTATTAATCATTTAATATATTTCCTAGATAAAGTGCACA
AAGTGTGGGGTCAGTTCAGAACAGCGTGAAAGTATTCTGGATCTTACTGT
TGAAATAGATGGGAATATCAATACTCTTGAAGACGCACTTCATCGATTTA
CATCTAAAGAAGTCTTAGATGGCGATAATAGATACCATTGCGTCAGGTTG
GTTCATTATGTTCCGTTGTTTTTTTGTTTTTTTAAATGCTCATGACGTGA
CTTTCTGTATATTTTACATTCCTTGTATTTATCACTCCAGGTGACTAACT
GAACTCTATAGTATTAAGTAAAGAGTTCTATAGTGGCATGTTGGCAACTG
ATCTTGAAACAGCGCTGTGACCACTTTTATAGTAGCAATACAGCACTCTA
GCGCTTCTAGCTAATCCACTCAATTGTAGGATTCACGGTTGACAATCTCT
TTATATTATTTAATTATGACTAATTGTATAAATTAGTGCATCTTTTTCTG
CTACCTGGCCTTCCTTTTGCTTCAAACTCTGATGCTTCAACTTATTTTTT
CTCACCAGATGCGAATCATATGAACGTGCCAAAAAGAAGCTGACAATATC
AGAAGCACCAAATATCCTGACAATTGCATTGAAAAGATACCAGGTACAGT
ATCATTAAGAATATTAGATTGTTTTCCACCAGTCTGTGGTCTCAAGAAAT
TGTTACATCAAATCATGCTTGGTTATTATTTACTTGTGTTGGGTTTTGAT
CAAGCTGTTGTAGTTTTGTTTCTGTTCATTATAACTCTTTTTTTTTCTTT
CAACAGCCTGGTATGTTTGGCAAAATCAACAAGGCCATCAAGTTCCCCGA
GTACTTGAATTTGTCTAGCTATATGAGTACAACAGATGATAATTCTCCTG
TGTACAGGCTATATGCTGTGGTTGTCCATCGTGATGTTAATTGTGCAGCC
TTTTCTGGTCATTATGTGTCTTATGTGAAGGGCTCACAGGGGAAGTGGTA
CAAGATGGATGATAGCCAGGTAAATTACACTTCCTAAATCTGCTGAGTAC
ACCCTTTTTCATAGCGGAAGATCATTTTTGCTGGAAACATTGACAGATGC
AGATTTATTTTTATTTAAGCAAAAAATATCTTGCCCAGGGACATTTATCA
GCACCATAAGAACAATTATCCATGTGCCGATGTGAATCAATCGTGAATGC
TAACTGTTCTTTCGTGTCTTTAGGTGAAACCTGTTTCTTTGGAAAAAGTT
CGCTCAAAGTGTGCATATATGCTGTTCTATGCGAGGTAATTACTCCACTG
GTATCCCATGTATGCTAGTATATCGCTTTCATATATTAATAAATTCTGTA
AGATTAAATACATTAGGTGTTCACCACGGGCTCCAAGCTCAGTAAGGAAA
GTGATTGCCCAAGACCCATCACGCATGAAGAGAGCCAGGCACACAGTAGA
TCCGGAACCAACTTGTTCGGAAGGAGGTAGTTACCTGAGCAGGCACCAAG
AAGGTGGGCAATGGTGTAGGGATCCTATAGTGTATGACCGCACCTACACA
GTGGATACGTTCGACGAGTCATCATATCCAGTATCAGAGTCTACAAGTCC
AGGCGGGAGTTCTTCGCTCTTTTTGCAGGGTCTACCGGTACTCTCGGCAG
CGGTAGCCCTGACAGCACAAGGATCTCAGGCACCATGGGGGAGTATGATT
GCATATTTGTAAGCTCAGATCAAATGTACCCAGTAGGCCAGTAAGCACAG
TGGTTATACCTAAGGAACATGAGCTTAGCTATTGTTGAAGGTCTAGCTTG
AACCATATAACTCTGCAACTCAATCATCAGGCAAGCCAAGGGGTTAGGAA
TAATGAGGGCGGGGAAGACCTATCCTTCTATACTGATCAAGGTAAGCATC
AGCGCACCTCTAGTAGCAGTAGCAGAAGTTATAGTAACAGTAGTGGTAGG
GAAGGTTGATTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.