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GrainGenes Sequence Report: AA003021

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Sequence
AA003021
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003021
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ACGGGATCCGCCGCTTAAACCCTTGCCCCGCTTGGCTCCCGAACGTCCAA
AGCCTCTCTGTCGCCTCCACCTCCCCCTTGCCCCTCGCCCCCTCGCGTGC
ACCAGCTGCAGCCGACGACGACGGCGCCCTGCGGCTTCGGTTGCGGAGCC
AGCGGCTGTCTATTGGTGCCAGTAGGAGGGATACGAGCCGATTCCAAGCT
GAGGCGGTTCGTGGGCACCATGGCGGCGGCGGCGCCGGCGTCCGGGCACC
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CGCTGCCGTCCGCCGTTGCCTCGAGCCTTCCCCGGCCGAAGAAGGTACCT
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TCCCATATGGAAGTGCTTTGACCAGCGAGTCTAAAAGCAAAAGGAAGGCT
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GTTTACAGTGACCGTGGATTACATATGTTTTGTCCACTCTGCATAGCTAT
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AGGCACACATAGTTTAAGAACAACTTTGACCATTAATTTTGGTCAACAAA
TTTTACATAATATCTCACAAAAATTATACCATTGGATTCATCTTCAAAAG
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TTTGGGTGGATGTGTTAGATGGTGGAAGGGATGTCTTGATGGAGTTTGCT
CGATTCTTTGAGGACCCGTCTATCAAGAAGGTCCAGTTTTATCCCTCCTT
ATTTATCATGGAGTAATTCTCTCGCTATTGTTTTCCTTTTTATATGTTGG
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ACTAATTTGTATACTTCTGCATTTTACATGGCGCTCAGCCATTCAGTATG
ACATTGCTGGCTTTCTAACAGCAAAATACTGCCTTGACTGCACCTCAAAA
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CCTGTTGCTTGTGGTATCATGCCATAATCTTTATATTCTATTCTGATTGA
TTTGCTGCTTCGTAACACAAATTTGCTACCTAGATGCCATTGTGGCCTAG
AAGCTGCTATATTCGAACTGCAAATCTACAAAAAAATTACATATTACAGA
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GGAAGTGATCATTTGTTTTTCTCTTCATCATGTAGGTTTGGCATAACTAC
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CTTAAAAAGCAAGCTTGAAGCAAAAGAATGGATTTTTGATGGTTATCCTA
GAGGAACAATGTACGATTTCTATGAAGAGTATTGGCGCCCCTTTGGGACC
CTTCTTGTGAAGATGGAAACAGAGGGAATGCTTGTTGACCGTGCTTACCT
TTCAGAGATCCAGAAAACTGCTGTTGCTGAACGAAAATTGGCTGCAGATA
AGTTTAGGAATTGGGCATCTAAATATTGTCCAGATGCCAAGTCCATGAAT
GTGAATAGTGATCTACAACTTCGCCAGCTTTTCTTTGCTGGCATTGAAAA
CAGGTATTGTCGCCATATTATGCTTATATTTTCTTTAAAGTTTTAACATC
GAATGTCGTTTGGATTTGCATATACTTTATTCTAGGATATCTTCAGTAGT
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TGAGTTTGCACACATTAACCATTTGTGACACAGGCTATAAATTTGATGTT
AACTACTGTTATCACCCACACTGTGCTGCAAAGTGTACCTGGACTAATTA
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TGTGTCTAATCAAAACATCTCAAGTATTTGGGGACCAGTAGTTAGTATGC
TAACTGGTTTTATCTGAGCGATAGTATAATCAATGCGTCTGCTCTTCTTA
ATTGGATTCTTTATTAGGAGTCAGTTTTAAAGTAAAGTGAGACTGTACTT
TACTTAGTTTCTATCATTTGTAGTTCTTCTCAACAAGAGGGGAAATGGGA
AAGTGGATTTTCCTTTTCCTTTTGGATCTGCCAGTCATTTTGTGTATAAT
TCATGAGAAAGAGTAAACCAAATCCCTCTTACCTATGTACCTGCTTGCGA
ATAGCCATTGCTTGTGCATGGTTCTTAGAAGTGTTAACTTCTCTAATCTT
TGTAGCAGACATAAACCTGGTGAGATCTGGCCACAAAGTAAAACATTTAA
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TTTGCTCCGAATGGGTGGCCTTCAGTCAGCATTGATGCATTGAAAACTTT
GTCTGGTAAGATACCCATGGATCAGATTTACACAATGGACGATGACCAAG
AACATGATGAATATAGCAACGGTTCAGAACTTCCCGAGCAGGATATAGAA
GATGCATCGTCATATGGAACTGCATATAAAGCATTTGGTGGAGGAAAGGA
GGGAAAGGAAGCATGCCATGCCATTGCAGCTCTATGTGAAATCTCATCTA
TTGACAAGTTGATATCCAGCTTTATTCTTCCCTTGCAGGTTAGCCAGCTG
ATCTTACTCATGTAGTCGAGGGCTGTTGTTCCTACCTTAATTAAGACTGA
ACCTCTGTGATGCATTTACAAAATCAAGATGTGCGACCATGGTTTTTAAG
GCGTTAAGGCGTCTTAAAGCGACCTGGGGGCGCTTTGGCGCCTAGGCGAC
GCCTAGGCGGGCGCTTTGGACGCCTAGGCGCCTAAAGCGGTCGTTTTTGC
AAAGCGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGCTTTGACGCTTAGGCGTCGCC
TAGGCGTCCTAAAGCGGACGCTTTAAAAACCATGTGTGCGACATGCTCAG
TTCAAATATTCTCTACTTGGTACTCTGTGAACCATCATGTGCCCACCATG
GGATATGCCAGGTTCTGTAGAGGCGGCATGGACATAGATAAAGTCGGTGA
CATGTGCACCGGCAAGTATGAGTTTTAAATGCTTTGAGTATTGTTGTTTG
ATACTTAGCAGAAAAACGTGTGGGTTCATGTGGATTTCAAAAAATTCCTA
TGATCGTACTTTCCACTGTCCCCCATGGAGTATCTTTGAATGTTTATATG
TGCTAGGCTGTGTAGTGCTGACCTGTGCTTGTGTGTTCTCTGACTGAGAC
AACTCAACAACCATATAAATTGTTTTTTTTTATTCCTTTACGTGTGGTTG
TGTGTGCGTGAAGGGGTTGTGGGGGTTCAAGTTAACCTTGACTATGTGCA
CCACCCAGTATTTTAGTCTTAACGCTATTTTGTACATCGTAGGGAGGTAA
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AAACAGGGCGCTTATCAGCACGAATACCAAATTTGCAGGTATGTATCTTT
CACATTTCTATTGCACTGTGTTTGGATGTAGGAATTTTAGCTCGGAAATG
AATTAGACTGGGGATTCCAAATCCTAGATGGAAAGGAAATGGACTGCAAT
TCCATTTCTGTTGTTTGTATGTGCATGGAATTTCCTGTTAGAATCGAAGG
GAATCACCCATTTCCAATTCCTGTTTGGATGTAGGAAACATGGAATTGTC
AATTTTGTTGATTTTGGACAGTCTAACGTATGCACACTACTACATATGTA
TATTTCAATGTAATATCTACAACATATGTATATTTCAATGTATATATATT
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TTCAAGTGGCAACATCATTTACAACATGGATAAAACTTGTCTCTAACAAA
ATAGCACAAGTTGGTAGTTCATGTCCTTTGCAGAATGGATACATAAAGCA
TAACTAAACAGTTCACAAACAGTTCATACTACTTCATTCCAACAACCACA
CATGATAGGAACCATCAAGGCAAGGTCAAGAGCCATTGCTTCCTAAAGTT
CTCGGGGAGCGCCATGAGAGCATCAAACAAGCGCTCATTGATGATAAACT
TTCCGTAAGCTCTCAGCAAGTCATCTTCCCCCAAATCTGGTACCTTTTTC
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CTCGGTTGTCTTCAAAGCATCATCAAAAGAACATCTCATTTCTCCCATCA
TGCACAAGATAGCATCCCCAGTGCGTTGCCTGTTTGTCAATAATAGCCGT
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ACAGTCTACCATTTCTCATCCATTTTCTAACATACAACCGTAGACATGAA
GAAAAACACATGTATATTGCGCAAATTCGAATCTCCGATCATAGAGTAGA
TAAATGGATTTTATACCTTCAGTTCTGGACTCACCACCTCCTACTTATTC
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GCTCGCGGCAGGCTGTTCTCCTCTCGCCTCCGTCGCCCCTGGATGCCATC
CCCTCCCTCCGCTTCCCCTCCAGTCGTCGTTCCCCATGGCGCGCGATTTA
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CGCGCAAGTCGACCTGGACGAAGCGGTGTCCATGGCTCCTGTTTCCGAGC
CTTTCCGAGGTCTCTCGCTCGGAAACCAGCGACGGGAAGTTACACGCGCC
GTGGGCCGGTGTGGAATTCGGTCCACCTTTCCAGGGTCCATTTCCTTAGC
CATCCAAACTAATGAATTCGGCTGGCCCATTTCCAAAAGGGCAATTCCAA
GCCCAATTACTACATCCAAACACAGCACTGTAGTTTTAAACCATCATCTC
CCAGAGAAGAGCAACAACTCACTTCTCAGTTTTTAAGCACAAGGTATATT
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AAGTATGTACAAAAATGCAACAAGCACTGCCTACTTTTGTTTGCTGGTGT
GCTTGTTTGAGAGGATAACAGAAGCTACTGTTTGACAGATGCTCTTACCC
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GAAAGATTCAAATTTAAGCATTCACCAGCAGCTTTAGTAGGAAAAAATAA
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AATCTCCCTTGCAGGCTCAACCTGCACATGAAAAGGATCGATATAAGATC
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GCTAAATATTGTACAGCTAACCTATCACGAAGGACTGGAGCACAATACGG
CTTCTACATCTCCAAACTCAGTGTGCTTGACCATCAGTTTGAGAGAGAGA
GAGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAGAGTTGTACAAGGGGTTTTATGCATA
TTTACCACTCTTCTACGTGTCCATATATCGGCCTATGTCCTCGTGGGTAT
ACAAGTTGCATATTTTCTCACAGTTTCCATCTCTCAAATGTTGGTTGCTT
CATTTTGGATTTTTTTTCCTGTTTCTAACAATCCAGACTCCCCATGCCGC
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AATCCCAGCATTCCTGAATGAAGGGTCACGTCCAGAATAAGTGATGAAGT
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ATAGCCCCATTATACTGCACAAAGTGGTCCAGTGTCACTGCTGCATGATT
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TTCATTGTTTGTGTGCATTGAACACTCCTTTTCACTAATTATTTTTGGCC
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ATCACCTCTCCTCTATTATTGACATGCCATGTCATCAAAATGCCTGGTTG
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GACTTAGTACCTATCTTCAAGAATAAAGGAGATATTCAAAGTTGTACTAA
TTATCAAGGAATTAAGCTTATGATCCATACTATGAAGCTTTGGGAGAGAC
TGAGGGTCGCTTGATTAGAGTGACGAATGTCACTAAAAACCAATTTAGTT
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ATGGAGAGTTATAGGGCTCAGAAGGACCTACATATGGTTTTCATCGACTT
GGAGTTGGAGAAGGCATATGACAAGATACCAATGACAGTCATGTGGTGTG
CGCTAGAGAAGCATAAAGTCCCAACAAAGTACATTACCCTGATAATGTTG
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GATGGATGAGTTTACGAAGGATAAACAATGAGATATTCCTTGGTGTATGC
TCTTTGCTGATGATGTAGTGCTAGCAGACGAAAGTAGGGTCGGCGTAAAT
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TGGTAGGACCAATACTGAGTATATGAGACGTGACTTTAGTGGTGTTGGTT
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GGACGGCAATCAGACCTGCGATGTTATATGGAGCAGAATGTTAGCCTACT
AAAAGACCATACATCCAACAACTGACTGATGAGTGTTGCGGAGATGCGCA
TGCTATGGTGGATGTGTGGCCATACAAAAAAGGACTGAATTAGGAACGAG
GTAATAGTTGATAGGCTAGGGGTGGCACCGATCGACGAGAGGCTAGGCCA
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TGGTTAATAGTGCTATTCTAAAGGGTGTGGAAAATACTAGAAGGGGGAAG
AGGGCGACCAAAGTTGACATGGATGGAGGCGGTAAAAAGGGACTTGAAGG
ATTAGAATGTTCCTAGAGATTTGGCTCTTGATAGGATTGCATGGAAATCA
GCAAATCCATGTGCCAGAATCTTAGTTTACTCGTTCTTTGTTTACTTTTT
TTTTCTCTCTCCTCTTTTTGGTTTCCTTATCTTTCTGTTGAGTTTAATAT
CTAGCCTACCCAACTTGCTTGGAAAAAAGGTTTTGATGCTGTTGTTGTTT
ACTGAGCACGAATCCACTATTTCAAATTTTGGTTTGCTTAATGCTTTGCA
CTCTGCAGATTATACGAAACTAAATATGGTACCCTAACTTTCAATTTTAG
GATGCTTTTGGTGCTGAGAGGAGGAAGGCTAAAATGCTTAACTTCTCCAT
TGCATATGGAAAGACTGCCCAGGGGCTATCCTGGGATTGGCAGGTATAAA
CTCTTACTGGCTACATCAGCATTTTGAACTAACTAGGATAATTGTGTCCA
CAACCTGATTCAGGAAGAAACAGCTTGATTAGATCATTTTCTTGTACAGT
TAACCCAAACACGTGCGGCATGTACAATAGCTGTATGAGTGTTGCACTTT
TCTCTCCCCCATCCTGCTGCCTCTTGCACGTAGGATGTACTCTCCAAGTC
TCCTTTGACCCTCATCCTCATGCTTTCCTAAAATGTGTCCTCAGGATCAG
TACTTTAATGTTGTTGGTGTTTGTTTGGTGATTACCACCAAAGAAAGTAT
GATCCAGGATGGATATATTGTGCACAGCAACACACACTCAGCAAGGCCAC
AGCCGGTGGATCGTTTAACACTATGGGCCCTTCATTTGAGATTGATTTGA
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TTGACAATACTATCATGCTAGAGAAATATCACTTGATAACACTCTACAGT
TTCACAAATTCTGCTTTTAGAAAGTAGTATGATCAACCAGTTCAGAGTTA
TATCTTACCAGGTGTCTGTCAAGGAGGCAAGGGAAACACTCAAACTCTGG
TATAGCGATCGAAAAGAGGTTAAAGCTTGGCAACAGAGGCAGAAAGAGCT
TGTGCATGATAAATGTGAAGTCTACACGTTGCTCGGACGTTCACGCCGCT
TTCCTAACATGGCCCATGCACTTCATGGCCAAAAAGGTCATGTTAATCGT
GCTGCTATAAATGCACCAGTTCAGGTACTTGCTACTACTGATCAAGGACA
ACGTCTGTGATGTTCCACTTGTTTCTAGCTTAGGAAAATCTTGTAATAAT
GTATCTCTGATCTGCAGGGCAGCGCAGCAGATGTTGCTATGTGTGCAATG
CTCGAGATAGAAAGAAATGCTCGCCTTAAGGAGCTTGGTTGGAGACTCCT
GTTACAGGTTGAGATTACTTTTAGGGTTTCTTTTGTTAACAAGAAAGTAC
TGTTCCTCGCAAAAATAGAAACAAAAAACAAATGCTGGTACTTGTACTGA
CTACTGAGAAATGCAGAGTCTTATGGAATCAAATCCGTGGTTTTTCCTTA
AAACAGAAACTACAAATGCAATTATTACATCATACTTTTTAACTTTGTTT
GCTTCGAAACTATCTATTCGTACCACAAATCCGCCATAGTATGCCATTTG
AACCTTTTTATTGCCATTTCTCAGGTGCACGATGAAGTGATACTGGAAGG
GCCTACAGAATCTGCTGAAACTGCCAGGGCCATCGTGGTAGAGTGCATGT
CCAAGCCTTTCTATGGAACCAACATCCTGAAGGTCGACCTGGCTGTCGAT
GCCAAGTGTGGAAAAAGTTGGTATGACGCCAAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.