Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA036164

[Submit comment/correction]

Sequence
AA036164
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA036164
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAATCAATTCCTACCTCTTCTTCTTCACCCTGCTCCCCGTCTGCTTTTC
TCGTCGCCCGGCTACCTTCCACAGAAAAGCTAATGGCGAGCGCCCTGCGG
AGCACCGGCCTCCTACGGCTCGGTTTCCGTCATGTACCCTCATTCCTGTT
CCGTGGGTCCTTGTTCCAAGCCCCGAGCCCGTGTGTGGGCGTCGGCAGGT
TGGGGTTGATCCGGCTCCGATGCTCCGCATCCGAGGCCGGCGACGGCAGG
GGCAAGAAGGTGTCAGCGCGACTAGCTCTGGCACAGCAGGTGATGCGCGA
CGCCGAGGAGCGCGCGGCCTCGGCCGGGTCTGACCCCGCCCCCAAGGTCA
CCATGGGTAACACACTCTAATCCCCCCGCCCTAATTTTCCCCCATTCGTG
TAGTATATTATACTTGCTGAATGCTCCTAATCCTAATCCTAATTCCCCCC
GCCCTAATTTCCCCCATTCGCAAAAAAAATAAAAATGCTCCTAATCCTAA
TTGATGCCTGCATTTTTAAAAATCAAAATCAAATCCTGATATCCTGCCGA
AAAACTTGTATTGGGGACAACCATTTTCAGCTTCTAGTGCATGATGAGAA
ACATAGTACCTGGGCTAAGAATTTAGGATCCAGGTATCATATTTGTTGAA
GGAGAAATAAACATCTGTTGTGGGTCTAAGTCTATGCTACCTAGACATCT
AGCCCTAGGGAGTTGGCCCTCCTGATCATGGTTTTAAAGGCGTCGCCTAG
GCGACGCTTAGGCGTCCAGGCGCCCCTCCTCCGCCTTGAAAAAATGGGCG
CTTTAGGCGCCTAGGCGTCAGAGCGCCCCTACATCGCCTTATGACGCCTT
ACCGCCTTAAAAACCATGCTCCTGATTGCTCATTCAAGTGTATGTGTATC
ATTTTATAAGAAAAAAAAGTGTATGTGTATCAGGTATGCACACTTTTCAT
GCTAAGGACATCGTTCTGTGGTACTCAGGCAGCGTGGTGAATGCTACCCG
TGAACTTGATTTGGTTGGTCTCTTGTCAATCTGCAAAGCAGAAATGCTAG
TATGGAAAGCAAGTTAATTAAGCTCGGAGAAGAAGCTAAAGCTTGCTTGA
CTTATGGCTAGAAGCATAAACGAGTAAATACTAGTTACAGCTACGAGGTA
GTAGTAAATTGCTGGTCAGCGAGTTGCTCTATCTAACCTGTAAGTGGATA
AAAGAGGAGGTAACATAACATCTGGTCCGGTTGTTGTGAGCTGACTAGAA
GTAAAATGCATATTATTGTCATCAGTGGCGGCGCCACCTGGGGGGCGAGG
GAAGGTGGACGCCCGGCTCGAATCTCTAAGGACGCCGCGGCACAGCGCCT
GGTGCCATTACAGGACTCGGGTGGAGGTTTTTTGGTAGGAACTAGACGAA
CCGTTACTTGAAGATCGTGGAAGGGATAGAAACATGGGTCATGGGCCAGG
TTTTGTAAGTGGAATTGGATAGCCCATAGGCAGCTGCTTCCTGGAGCAAG
TGCACCAGTGCACAACAGCCTCATGCGGTCAAACCCATAAGTAAAATCAG
TGAATATGGTACCCCGAAAATTATAGATGAAATGAGAAATGCATATTTGT
CCAGAGGCGCGAGTCATTTGATTGACCATAATTGTTTCACAACAAAATGT
CGAGATAATTGTGGTATAACAAAATGTTCCTATTGTTTTCATTGCAAGCC
TCCAAGCATCAGTGCCTTAAAAAATGTTTTTGCTAGTTTTAGGTCGACTG
AGAATTAAGTTAGGGCTCGGTCGGCTCCAGGACGTTGGATTTGCATCATG
AGTCGTGCACCTCAGAATTGCACATGGAGTTGAAATTGTAGCAAATAAAT
CCCACTTCCACATAAATTGCACATGAAATTTGATGATATAACCGAGAATT
AACTCAAATCTAGGTAGACCGAGAAGTAGTCGTGTCGTAAAGACAATTGT
AAACAATTTATTTTGTTGAATATACTCGCTTTTGTGGCTTAAATATTTTA
GATCTTATATGTTCGCCGCTCATCTAAAATCCTGGCTCCACCACTGCTTG
TGAGAGCTTGTTGTAGGTATCATGCAATACCTTTATATTACTTGTAATAT
GTGTATTTTGACTATATGAACTGAAATAAGAAAATAGTTTGAAGAATTGG
CTAAATTGCCAGCATAAAGATAGCATCTATTGTAACTATTTATATTCACA
GTATTAGTTCTACATGCTGTATCCCAGTGACATATTTTCATTCGTGGTGA
ACTGATGATTACTTGCGCAATTGTCATGTGAGCTGCCGAGCTGTTCTGAA
CTACCCCATTTTATGTCTGCAGATCATGTAACTGTTAGCTTTGCAAGAAG
TGGGGGTGCGGGTGGTCAGAACGTCAATAAAGGTATGCCTCTGTCCGTTT
TCCTTATTTTATCATTGCATTGTTATTTTTCGCATAGCATGTCTAAATCG
CTCTTGGTTCATCATTGTGAAACTAATGACTGGTCTATCTTGGTCAATAT
TTTCAATTAATGGGTGTCATGTTTTATTTCATCATTTGTCATGATTTGAT
AATTGCTGTCGGCCCATTAATGGGGTGTTTGGTTTGAGGGATTGCTTTGT
CCTGTAATTGGCAAGTCCATCATGTGATGGTCCTTCAAATACCAAACTAT
TCCATTCGTCAAGCCAAACAAGTGGGTTAGGTTTGGAGGTAGGATGGGAT
GGTCCATTCGCTGTCTGGTCCTCCAAACCAGATACCCCATGTGTCTTTAT
ATTAAGGATGTCAAAATAGTGATAACTTAAGCATGCTGATGTTATCTCTT
TGTGATAAAATGTGTACCACCACTTTACAGTTAACACGAAGGTTGACATG
CGGTTCAATGTTGAGAAAGCTCATTGGCTTGGAGAAAGGATTAAGGAAAG
GATATTGCAAACGGTTTGAAAAACCTTCTAATTTTGCTCATCTTATTTGT
TTTTGTTGCTGTCATGTCTGAAGATGATTCTGGATTATGTTTTTTTTTTT
TACTTCTGATTGATGTACGTCATCATTTTTTTCTCTTTTATGTATTCTTG
TTTTATATTTCATATCTAGAGAGGTCGTTTACAACTTCAGTTCTCTGCAT
GCCCAGGAAAAGAACAGGATAAATAGAGATGGTGAACTTGTGATGTCTTC
TACAAAAACTAGGACACAGAAGTAAATATTACTTAGCTAGTTTTTTTGTT
GTCTTTTTAGATAGCAATTGACATGTTTATCATCTCAGGGGCAACATTGA
AGATGCTTTGCAGAAAATACAGGTATGCCTCATCCATTTCAAATCTTTGT
CTTGAAGCAATTTGCATAGGGCTCATGATGTTGTCCTTTTTCTTTATATC
TTATTCCCTAAATATTTGGTAAGCAGGCAATCATTGATGCTGCATCATAT
GTTCCTCCACCACCTTCAGAAGAGCAAAAGAAGAAAATTGAAAAGATGTA
AGCTGCTCTTTTGACCATTTGCTTCCTCTAAATTTATTTAGGTGCCAATA
TGAACCGGTTATTGCGACAGAGACCACATTAAAAAGGTTTAACGATTTCT
CTCCAAATGAATATCCACACCACATGACACTTTATGATTTCCTTAAATGG
CTTGCACTTATATAAACTAAAGAGCTAGTTCGGTTCAGATTTGCTCATCA
GTCGCTGCTTTGTGGACTGGAGCATTTCTATTTAGGAGATCATCGAAACC
TTCTCTATGTGTATATGGTTGTTCGATCCACTACCTAACATCACTAGCTA
CTTGTGAAATAAAGCCACAACTCACGCAAGTGATCTTTTTAGGCTGTTCT
TTTGTTTGTTTCCACACTTGTAGCGTGCCACGGATTCTTAGCCTCATGTC
ATGTACCGCCTATCAAAGACACGGTTTCTTAGCCTCTTGTCATGTCCGGC
CTGTCAGAGGCACAGGTTTCTGCCAAACCTGACACACTTTTGGTGGATGA
TTTGCTCACCATAGAAACTGTGACATGCTTGGCATATTTGTTTGGCATTG
TGTGGATTCAAACTAAACATGGCCCTAACCTCTTTTTTTGCGGGGAATTA
GGAAAGTTTATTACTCATAAATAGGGTTAGAATCATCAGCAATAGCTGCT
GACGCACAGTCAGGTACACGATGTAACAATAAGTTTCTATACCGGTTAAC
CTGAGCAAAATTTGCTAAAAGATCTGCAGCCCTATTTTGGTTACTGTCAA
TTTTCTTGAGTAACAGCTCGTTACTTCTTTGGGACATCAGCTTAATCCCC
TTGATGATAAAGCCCAGCACTGATCGATCCATGTGCGAGCCCTTCACTTC
CTGCAGCAATGCCAAAAAACAGTCCGAACGAAGAAGCAGTCGCTTGTCCG
TGTGTTGAAGTGATCTTGATCCCTTCTAGTGCTGCCTGAACCTCGGCTTC
CAGAGCGTGATGACAATACTGTAAAAATCGTGTGGTAAACGCGATAAGCA
CCTCAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCACCCCCCACCCCACCCCACAAAAAAAACAAAAACAAATTCACAA
TGCTGTAAATGTCATGATCTCTAATAATTACCCCAATACCAGCCACACCA
TCTGCAAGCGATCCATCGATCGTCATGGGCTCATGGCGACTTGATGAGTA
GCTAGTCTAGCCCATGGTTCAGCTTGTATCACGGTCCTCTTCTCCTTTCT
GGCAAGCAGGCTTGCACCTACAACCTGTTTGCCCTTCACAATGTCTCGAC
CATCCGGTTTTTGAATCATGAATAGTGAATCAGCATAGCTTGACAAAAAC
CGCCTTAACGCTTACATTGGTGGCTTTGGCTTATCATGAACTAAATCATT
ACAAAGCTGCCACAATCTCCATAATAACAAGAGAACCTTGCATCTTTGCT
CCACCGAGATTGGGCGATTAACATCAAAAAGCCATTCAGAGGTCCCGTAT
ATACTATGTCCTCAACTGACGGCAATTACCATATTTCTGACATGGCATTC
CATAAGGCATACAATGACAGGCAAATGATTGTCGCATGGAAAGTGTCCTC
ATCACACATGCCACACCGGGGACAGTCTCCCACCTGTTCAATATGATGTC
GCTTCCTATTCAACATTGTAGGAAAGCTGTCAGACACTAATCTCCACGCA
GTGATCTTCAGTCTGTGGCACCGGAGTTTGCCAAATTAGCTTCCAATCTG
GCCTAACTCCTGAGGGTTTTGTGCTTGATTCTCACGGATCATTTCAGACA
CAGCAAGATGATAAGCACTTCTAACTGAGAATACACCTGACTTCTCCGGG
TGCCAGGCTATAAATCATCTTCTCGCTGAGGCGAGGTTTTAAGCTTCAGA
TCAGCTCCCCATCCTTCTGCATAAGTACTGGCTTATCAAATCTCCCTTCC
ACTTGCCATTCTCATCAAGGAAACTTTGCAGCTCTAGTGTATCTGCACCT
GTCCTGTACTGGGATAGGCCGATGTGATGATTCGCTTGGTAGCCACAGAT
CTCTCCATACACGAACAGTGCGCCCACTACCAATTCTCCATATAATTCCT
TTGTTAAGCAGCTCAAGTTACTTGTTGCAACTATGACTTGTCACAATTCC
TTAGGCACATGTCCCATGTGTCGTAGAGTCAAGTCATGTTTGGCTGTTTG
TTTGCCCTACTACTATGTCAGTTATTTGGTTTTAGTTTGCTTCCTCAACT
GTGGCGCGTAAAACACCCTAACCTGCTTGCCCTAGAGATTTGGTCACTCT
TAGTACTGCTACTGTTTAATGTTGACACCAGATAAAATACCAGATGGGAG
CAAGACAGACATACTTTCCCTGCTTTACGCCAAGAGGAGATGCTGGGTGG
GAATATTGGGCGCTATACCATGCAGTAATCATATGGAAAAGGGTGTGAAC
ACTAGTTATTGGAGACCTAAGCTAATACTTGCTCATGGATTTCAGTTTAG
AGCAAATTCAGCTACTCCACACGTTCTTTGTGTTGGTACGGTTCCCATAA
AAAGTTACAATGCAGATGAGGTTGAGCGATTATGACTCCATGCACACAAG
ACTTTTACAGCCTGAAGCACCATGGAATTCTCCTAGCCAGTTGCTTATTT
TTGTCAGTATCCATCTCGTATAGCAATTTGCGAAGGCTCTCGATGCGGCA
AAGACTTCTTCTGTCCTTGTGAAGCTAGACATCACCCTCGCCTTTGACTC
TGTCATGGTCAGATTTGCTTGAGCTGCTTCAGCTCCTGGGCTTTGGGCCA
CGATGGCGAGATCTTTTTTTGTCTTCTGTTTTCCACAGAAAGCACCAGGA
TTGTGTTAATACTGTCCCAGGGGACGAGTCATTGTTGCCCATGCTGTTCA
ACCTAATTATGGATGTTCTCTGCCACCTAATTCTCAGAGCCAAGCAGTTG
TGTTCCTCTCCCTGGCAGCTGCAGTGCCTGTCGGGCATCATTGTATGCTG
ACGACGCGGTCGTCTTCATCAGGCCACTTGCTGAAGACTGTAATTTACTG
TTGCGGCTGCTAGAAATCTTTGGCTACGCAACTGGCTTGCGAACAAATGT
TCTAAAAAGCTCTATCACTCCTATCTGATGTTATGAGCAAGACATCCAGA
CAGTCCAGCAACACTTGGCTTGCCCTGTCAAGCACTTCCGTTTGCAATAT
CTGGGCATTCCCCTCTCAATCTGGGAGCTGCGAAAGGAGGATCTCCAGCC
CCTTTTGGACAGGATCGACAATGGCTTCGCTGGATAGAAGACAAAGACGA
TGTACAAAGGCGGCCGCTTAACTCTGATCAGGTTGGTACTCTCTGCAGCA
CCCATCCACACTTTGCTTGCCATGGACATCCCTCGATGGCACGAGAAGCC
ATTGACAAGAAGCAGTCGAATTTCCTCTGGTGAAACTGAAGGGATGCCAA
CGGTGGCAACTACGCAGTCGCATGGAGGGACGCTGCCGCCCCGTTGAGCT
TGATGGGCTGGGTGCTCCGTGCACGCTGGCTTTGGTACCAGCGCACCGCG
CCTTCCAAGCCTTGGACAGAATTCCCGGTCAAGGTTAACCACCAGGTGGC
TGCCCTAGTTCATGCCGCTTCAAAGGTCATTGTCGGCAGCGGGGCGAGCT
TTCTTCTGGGCTGACCGCTGGATTGACGGCCAGACTATTTCAGAATTGGC
ACTAGCGCTGTTTACTTCGGTGACTAAGCGGGCGGCGAAACAACGGACAG
TCCGTGTGGCATTGTGGAGCAAGATTGGATCTGTGACATAGTCGGCCCCT
TGAACATGCATTTGTTGAGTTCATCCACATGGTGGACATTATCGACTCCC
AGGTCCTGCAGTCGGAGGTCGACAATCAGTTCATCTGGAACCTGTCAAGA
TCGGAACAATACTCTGCCAAGTCCGCCTACAACGTGCTGTTCACTGGTGG
CATCGAGTCGCCGGCGTGGTGGGCTACTTGGGATGGCTGGCCGCCGCTGA
AATGCAAAATGTTCGCATGGTTGGCCTCTCGCAACTGCTGGACGGCAGAC
CCCCTTGCTCGTCGTGGCCTGCCGCATCCGGCATCTTGTCCGCTGTGCGA
CCAAGCTGAAAAATCACTCTCCCATCTCCCAACAAGGTCTGTTTTGAGAC
GCTGAAACATTGGTTGCTGCAACATCTCTGCCCACAGCCTGGGGACTCTT
TCGAGGACTGGTTCCTGTCTGCAGCTGACCACGCAGAGGTGTTGGCAAGG
TCAAGGGCGCACGCTCGCTTGTTCTCCTACCAATGTGGCGGCTATGGCGC
CTGCCTCCCCCGACGCGGCTGACCTGATCGATCAAATCATCAACTAAGCA
AACCTCTGGATGTTGGCCAGCTCGAAAGCGCTTAGGCAGCTACCTCTCTA
TGCAAGACCACTTTACGTGGGTGCTTAGACAGTACAGTAGTTCTTGTGCC
TTTGCTTTTTTGTCTTCCTTTCTATTTCTTTTCTTTCCTTTTTGTTTCTG
TGCTTTTTTTTACCTTTTTTTGTTTCTCAGTTGATTGTACTTGTTCTGCG
CCAGCTCGGTGCCTCTCGTTATAATACAAATGTAACATGCACAAAATCTT
CGCTGTTGGCTGTGGCTTCTCTGAATCAGATAAATTGTCAAACTGAACTT
GTTAACTCAGTTGATGTACATGTCGTTGCAGTGCTGCAGCCGCTGAGAGG
AACAGAATGCAAAACAAGAAGGTACTATCGCAGAAGAAGGAACTTAGGAG
GTCAAAACCTAGCTGGGATTGATTTGCAAGATAGCAAAATCGACTTCTCT
GTTGCCCTGATATATTGATGTGATCAAGCTTTCTGCATGGTAACCGCTTT
GTTTTCTCCATTTTGTAGTTTTAATAAATGTTGCAATGCATGAATGACAC
TGACTAGTGGCTTTTCCTCAGCGTGGCTCTTGGGCATACCTTCAGCCGAT
TCCTGCTCCAGTAAATGTGAAGAACAAGGGCCTGCCCAACATACATGGTG
AAGATAGCTAGTTTTACAGCCGATTTTCGTTTTCCATCCGTTCGGAAACC
TGTAAAAATGTGAACAACAAGGGTTCAAAAGTCAAAACACGTCGATGGCA
TCTTGGTGGGGACTGCTGGTTTCACGGCCAGTTTTTGTTCCATCCATCGG
AAACCGGCGCCTGACGAGAAACATTGCTTCTGTCCCGACGCACACTGTAC
TGTACATCAGTGGTCCTGATCATCCCTGAACTTATCAGATGCATCACATG
TTAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.