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GrainGenes Sequence Report: AA035962

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Sequence
AA035962
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035962
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAAACCTCGCATCGAACCGTTCCCCACTCACCCCCTCGCGCTCTAGGGT
TTTCCCCCGCCTAGCGGCCACCCACCCAGTCCTCGCAGAGTCGCGGCGCG
GCGCTCCGACCATGGCGTGGGCGGAGGATGAGGCCATCGGCCCCGACGTG
GCCTCTGCGGGCCTGCACGTCTCGGAGCGGATCGGCCGCGACGCCGCCGC
GCAGCCCGACCTGGAGGAGGCACTGGAGGCCTCGCGCTACGCTTCCCACC
CCTACTCCTCGCACCCCAAGGAGGTAATCCCCGGCGCAACCTACCGCTTA
CTGTATTCTAGAGGATATACGCGCCTGAGTCGTTCGTCGGCAGCAGCGTA
TGTTTTGAGCGAAGCACTTTATTTGCCGTATCCGAAACTTGCTGCCGAGT
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GGGGCGAACCTAGGGCGTGAAGCCCTGAAGTGGACTTGAAATTTGACCTG
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AGTTCTGCAACATCTTTTTTTGTGTGCAGAGCTGATAGATAAGAGCATAT
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CCATCGGTAGCTACAAAGTCCATTTTTCATTCCAGAGTGTGCAGCACACT
ACTACCAACCCAGTGTCATCCATGTTCTTGCCGTGTGGAGATTATTCAAG
TGTTTCTTTACCCACACACCTTAACTCTTTTAGGTGGTGAGCATCCTTGA
TTTCTAGCAACATATTCAAATTCTAGCCATCGGGAGCAAAATTAATGAAT
TAGGGGCTAGTGTTTTTCTTGATTGTTTATATGGAAAGAGCTAGGTTTTG
TGGATAAATACTTGTTTCTGTATTTACACATGACTAGTCTCACCTGAAGC
TTGAGAGATCTTGGAAGTTTTTGCCTCAAACAAGGAGATCCTTAAGTCTT
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TTCAAGGGTCTAGCAAGGCCTATTCTTTTCTACCACCTGTGTTTGTTCTG
AGTTATATCCTGATGTTATTATGATTTTTTTTGCTTGTATTATTTTGTCT
TTTAACTATATAAGGTTCTTTATGTTCTGCTGCAGTGGCCTCCTCTGGTA
GAAGTTGCTGATACTCGGCAGCTACCTCCTATGTTGATCGAAAGATACAA
TGCAGCTGCTGGTGAAGGAACAGCCCTTTGTGGAATATTTTCTGAAATAC
ACCGGGCCTGGGCAACTGTTGACAATTCATTTTATGTTTGGCGCTTTGAT
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TTACCGCCTTAGAAACCTTGATTTCAATTGTTATCAGTAGTTGCCAGTTG
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AGTCCCTGTACACTGTGAAGTTGCTTGTCTAGTTTTGCATCCTAATTTTT
TTACCATTGATCTTAATGTGCATATTGTGTAGGGGCTCTGTATCTGACCA
TCTCTATCAAGCCAATCATCTATTATTATCGATGAAGTTGTATCTTCTTT
TATTGCATATCACATTTGGGAAACATTACTGTATAGTTGATGTTGAAAAT
CATCTTCCTGTATCTACGCGTAATTGAGTATGTAGCAAAGATCAAGTCTG
GTTAGCAAAAGTGATTTAAGCCTTTTATATAGTAACATCTAGTGATACAA
ACAATCTCACTTCTCTGTAGAGTCTAATATTAATTCCCCTCTAGTGGTAT
GCGAAGTTTTGTGGCTAACCATCTAATGTGTGGCATACGTTTTTCTCTAT
TTACCAGGGATGGCCAATGCCAAGAACATCATGCGGATGAGCAAGCAATT
TGTGCTGTTGGACTTGCTAGAGTAAAGCCTGGGATTTTTGTTGAAGCGAT
TCAATACATTTTAGTATTAGCAACTCCTGTGGAGGTAAGGATGCTTGCGA
GCTATGCTTTTGAACTGTAATATACATACATGCCAAACTTCACCAATGCA
AAGTACTTTTATGTTGTTAACTTGCTGTGCAAGGTTTGAGGATGTACAAT
CTACAGTACTCCCTCTGTTTAAAAATAATTGAAGTTCTAGTTTTGTCCTA
AGTCAAACTACTTTAAGTTTGACCAAGTGTATAGAAAAACATATCAACAT
TTAGTACTCCCTCCGATCCAAATTAATGGACTCTAGAAAAATCTGAGTCC
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ATGCTAAATCTGGTCATACTATATAGATCGGATGTTGTAAATTTGACAAT
TTTTTCTCTAATATCTGGTCAAATTAGATAAGTTTGACTTGGGACAAAAC
TAGAACTTCAGTTACTTTGGAATGGATGGAGTAATATATTACTCTTTCAT
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ACCAACCCACTCTAGTTTACATATCAAGCTAGTAATGAAATTTTTGTTTA
ACAAAATGATGGACACTACTCTTACATGTATCTTTAGTTTTTTTTTGTGT
AACAGATATTTGTGTTCCACAGTGCTTGACTATTGGAGCACTTATTTTTC
TGAAATATACTTGGCCTTTCTCATTAAGTAAGATAAGAAGAGAGTAAGAA
TTGCCTGTTATATGTGGAATAGCCGAAGACTACAACTGATTGAAAACAAT
GTTATTTAGTGAAATTTCATCTGTTGGAGGATGACTGCATGATAACATCA
AATAAGACTTTTCTGCTTAATTGAGGTTGATATGCATGCAAATTCTTTGG
TTATGTATTTCTGCTGTTCTGTTTATTGTTTGGCATTTACTGTTGTGAAC
CTGCAAATCTTGCAAGCTCTTTCATAAGTTTCTATTTAGGATACTTATTT
TCTAGCCAGTATACACTCACCTACATCTTTTCTGTCAGCTGATACTAGTT
GGAGTTTGCTGTTCTGCTAGTGCTGATGGAACAGATCCATATGCTGAGCT
TTCATTGCAACCTTTACCTGAGTATGTGATCTCTACTGATGGTGTCACAA
TGACGTGCATCACATGTACAGAGAAAGGTCAAATTTTCCTGTCTGGACGT
GATGGGCATATATATGAATTGCAATACACAACTGGTTCAGGCTGGCGTAA
GCGCTGCCGTAAAGTTTGCTTGACCACTGGTTTAGGCAGTCTTCTTTCCA
GGTATCTGCTGTAAAGTCAGAAATCTGGCCCTTTGCTTTGCTTATTAATG
TTTTTTTTTAGTTTCTTCCTGGTCACATGCTTATTCAGCTAACATAATTT
TCAGGTGGGTCCTGCCAAATGCCTTTAAATTTTCTGCTGTTGATCCTATT
GTGGATATGGTTATTGATGAGGAGAGGAACACTATCTATGCACGCACAGA
AGGCATGAAACTGCAACTTTTTGATTTAGGAGCCAGTGGTGATGGTCCTT
TGAAAAAGATAACTGAAGAAAAAAACCTTGTCGATCCACGAGATGCACCT
TATGGTGGTCGTAGACCTAATGCACCAAGAGCTGCACGATCCCCGAAGCC
ATCAATAGTATGCATATCACCCTTATCAGCCATGGAATCAAAATGGCTCC
ATGCTGTTGCTGTTCTATCAGATGGCAAGAGATTATTCATTTCTACATCA
GGTGGAAGCAGTTCTTCAGTTGGACTGAACACTGGTTTGCAGAGGCCAAG
CTGTTTAAAAATTGTTGCTACTAGGCCTTCCCCACCTCTAGGGGTTGGTG
GTGGACTCACATTTGGCGCTGTTTCTGCTGCTGGCAGAGCTCAGCCGGAG
GATCTGGCATTGAAAGTGGAGTCTGCTTTCTATTCTGCTGGTGCTCTCAT
AATGTCAGATTCATCTGCTACAGCTATGTCCTCCCTTCTAGCTGTGCAGA
AAGATTCTGCTGCCCAGTTATCCCTCCCGAGTACCTTCGCAACAGCTTCT
AGAAGCTCCAGGGCTCTCAGAGAAACAGTCTCTGCTTTGCCTGTTGAAGG
TCGGATGCTTTGCGCCTCTGATGTGTTCCCACTTCCGGATGCTGCTTTCA
TCATGCAGTCTTTATATGCAGATGTGGAGTGCTTTTCAGCCTTCAGTAAA
CCTTCTGAGAAGGCCTCTATAAAACTGTGGGCCAAAGGCGATCTTCCTAC
CCAACATATCTTACCTCGGAGGAGGATTGTAGTATTCAACACAATGGGTT
TGATGGAAGTAGTTTTTAACAGGCCAGTTGACATCCTAAGAAAGTTGTTT
GACGGGAACACCTTGAGATCACAGATAGAAGAGTTCTTTAACCGCTTTGG
TGCTGGAGAGGCTGCAGCAATGTGCTTAATGCTAGCTGCAAAGTTACTTT
ATGCTGAAGATAGTCTGATAAGCAATGCAGTCTCTGAGAAAGCTGCTGAA
GCATTCGAGGATCCTGGACTTGTTGGAATGCCTCAACTTAATGGCACTAC
TGCTTTGTCTAACACTCGAACTCAGGCTGGAGGCTTTAGTATGGGACAAG
TTGTTCAGGAAGCAGAACCTTTGTTTTCTGGTGCATATGAAGGGCTTTGC
TTATGCTCATCGAGACTGCTGTATCCTGTGTGGGAACTTCCAGTTATGGT
GGTTCGAGGATGTTCCAGTGATCATGGGGATGGTGTGGTTGTTTGCAGGC
TTTCTACTGGTGCCATGAAGGTTCTTGAGAGTAAGATTCGTTCATTGGAA
ACATTTTTAAGGTCCAGAAGAAACAAAAGAAGAGGACTTTATGGGTATGT
TGCTGGCCTGGGAGATTCTGGTTCCATACTGTACAAAACAGGGCCTACCA
TTGGCGCTGGTGTCCGTAACAATGGAAAGAGTCCCTACCGCATTAGAGAC
ACAGATGGTGCAGATCAAGCTGCATTGAATAAGAAGCCACGCTCGCTTTA
TACATCAGCAGAACTAGCTGCTATGGAGGTAATATTTCTAAAATTTGTTA
AGGAAGAGAAATTCTTAATATGTTTGCTCAATACTTTACTTGGATAAACA
GGTGAGGGCAATCGAGTGCCTTAGGCGGTTGCTTCGAAGGTCTGGTGAAG
CACTTGTTCTACTTCAACTTATTTGTCAGCATAATGTTGCCCGCTTGGTT
CAGACATTAGGCAATGATTTGCGCAAAAAGTTAGTTCAGTTAACGTTTCA
TCAATTGGTATGCTCTGAGGATGGTGACCAGCTTGCTATGCAGCTTATTT
CTTCACTCATGGAGGTAGCACTCCTCCCTCCCTCCCGTCCAAACCACCAG
CAAAAAAAAGGAGCACCATTCATAACTGTTCATTCATTTTTATTTATGTC
TACTTTCATGTGATTTTCCAGTACTACATTGGTCCAGAAGGCCGAGGAAC
TGTTGAGGATATCAGCATTAAACTGAGGGAGGGCTGTCCTAGCTACTTCA
ACGAGTCAGACTACAAGTATTACTCGGCAGTGGAAAGTCTTGAGAAAGCA
TCTATGATAAACAACCATGAGGAGAGAGATGTTCTTGCTAGAGAAGCCTT
CAATCTCTTGACCAAAATTCCAGACTCTGCTGATTTGAGTGCTATTTGCA
AGAGATTTGAGAACCTACGGTTAGTTGCTTGCTGAACTATCTTGTACACA
ATGAATACATTATATAAATCCTGAACACTTGGATTTATTCTGTCTGCAAA
CTGATGTTTCCTTTATTTTGCTGGCTGAGTTCAGGTTCTACGAGGCTGTA
GTGCGGTTGCCACTGCAGAGAGCTCAAGCGCTTGATTCCAATGCTGGTGT
TATCAATGGGCAAATTGATGCAAGGCATCATGATACAATAACTGCACAGC
GTGTTCAATGCTATGAAATAGTTATGAATGCTCTGCGTACCCTCAAAGGT
GCTGGACGAAGTGGGCAACCTAGTCCAATGATTGCTCTTGATCCAGCTTC
TCGAAGCAAATGTATCAAGCAGATTATTCAACTAAGTGTCCAGTGGCCAG
ACACAGCGTTCCATGAACATCTATACAGGACACTTATCGAGCTTGGTTTG
GATAATGAACTTTTGGAGTATGGAGGCTCGGATTTGGTTGCTTTTCTTCA
GAGTGCTGGTCGTAAGCATCAAGAAGAGGTGATTCCTAATAACCATGTGA
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CATGTTGGACCTGATGGCCTTGTTGAAGAGTGTTTAGTAGAATATCTTGT
CATTTTGTAGTTTTGTTTTGCATCTGTCTTATAGGCTCCACAACTGCCCC
CCGCCCTCATGCACCTATTGTCCTGGTAGGAGTAGGAGTGTAGGACCCAT
GCATCTTAATAAAATGTGAACTGAAACTATTAACATGATTTCCCTTGGTT
AATATCCTGTTTATTGCCAGCCAAAAAGTACAGTATCTGCTTAGGTTTGC
ATGTAGCCTGCCATTCTTGTTAAATACCAGCCAGATCCAATCACACTACC
ATGCAATTGTTCCTGCTACGTAGTGTTTTTTCTGCTTTGTTAATCTAGGA
GTGTCATCTTCAAATTCTGATTATATTATTCCTTCAGTTAGAAATATCTT
TGTGTTTGCTAGATCTTTCCAGGTATCAAGTGGGTATGCATAAAATCATC
ATAACTTTTACTCACTCCAAATCTGTACCGTGTTTGAAACTATATGTATG
TTGCGCTGTCCTGATCTGCTCTTCTTCAATTTTAAGGTTCGAGGAGCTCC
TAGGTTGGATGATTTAGGTGCACCTATTTCTACTAGTCAAACGAAGTATC
TTGAGCTCCTAGCCAGGTACTATGTTCTCAAGGGGGAGCATATTGCTGCT
GCCAGGATGCTATTGATATTGGCAGAAAGGCAGTGCTCCAATGCTGAAGA
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TAACTCTGCATTTCCATGCATTATATGGATTAACACCTAACTTCACAATA
CAGGTATCAATATCTGAGCAATGCTGTGCTACAAGCCAAAAGTGCAGGCA
TTACCGCTGATTCGTCGAGAAATCCTATCGATAGTAGTACAGTGGATCTA
CTTGAAGGCAAACTTGCAGTGCTTCGGTTCCAAATGCAAATCAAACAAGA
ACTGGAGTCCGTGGCTTTGCGGCTTGAAAGTGTTCCAAGCAGTTCTGAAT
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GCCAAGGATGCGAAGGACAAGGCGAAAGAACTTTCACTGAATCTTAAGAG
TATTACTCAGCTATACAATGACTATGCAGTTCCATTTAATCTTTGGGAGG
TATGATTTTCTGCGACTCATGGAATTCTAGTTCAGTCACAACATTGTAAC
ATGATGCACTAATTTCTCAGCTTATGGATTAGTTTTTAACGCTTGACGTT
GTGGAGCTAAATATTAGCAAATGAGCTTCTCAAAATATCCATACTTGATA
CTTCCATGGAATCAAATCGACCTTATGTTTTCTACCGATTATCATGTTCA
TCTGTTTTTTACTTATTCACCTAAAATTGAACTGTAACCAGGATCGAAGT
TATTTTGTATTAAAGTTGAATGAGATGTTGATTGATGTGCACTCTAAGAT
CATGCAGGCTTATGTTTTACCTTGGAACATGTAATACTAGGAAATCATGC
TGCTAGTGTTGTCCTATTTTTTCTTGTAAAATAAATAATGATGCGGCTCA
TCAATTTGGCTACTTTCGTAACCAAAGAAATGCGAGACTATTCAGCAAAC
TAACACTATGGCTGCGGTGTTTTTGTCTTTCTGTGGGTTGGGTCATGCAT
TTGTACTTACAAGTGCCTTTTACTTGGGTAAGGCTTATGTCTGGTTCTGG
CAATTACTGCAGAATTTGATGACTTAAAGCTTATTGTTTATAGGTTTGCC
TGGAAATGCTCAACTTTGCAAATTACTCCGGAGATGCTGATAGCAAGATT
GTTCGGGAAATTTGGGCCAGACTCCTTGACCAGACACTTACAAGAGGTGG
TGTAGCAGAAGCATGTTCTGTGGTGAAGAGAGTTGGCTCCAAACTTGATC
CTGCAGATGGAGCTTGTTTACCTTTGGATATAATATGCCTTCATCTTGAG
AAGGCCGCCTTGGTATATAGCATCTATTAATGTATTTTTCGTACTTAGCA
CCATTGCACTTCACATGGGACTAATAGCATCATGATCGTATCTACAGGAT
AGGTTAAGTTCAGGGGCAGAATTAGTTGGTGATGAGGATGTTGCAAGAGC
CCTTCTTGGAGCTTGTAAAGGTCTAGCTGAACCTGTGCTTGCTGTGTATG
ACCAACTGTTATCGAATGGTGCAATTGTGCCCTCACTTAATCTGAAGCTG
CGCCTTCTGAGATCAGTTCTCGTAATTCTTCGTGAATGGGGAATGTCGGT
CATTGCACATAAGCTAGGCACAACAACTGCTGGGGCTTCGTTCTTTTTGG
ATGGAACATTTTCGCTGAATCAAACAGGGTCTTTGAACCAAAGCGTCCGA
GATAAAATAATTAGTTTGGCCAACAGGTAAGCAACTTACATAATACATTT
CTGTGTAGGTCTTTTGCAAAGTTCCCTTTCATTCCTAGTGTTTTTACTGC
ATGGCTATATTAATTGCCCTATGCTTGCAAATGGACATCTAGATTGTGTG
GATGTTCTAATGAGCAAGCAGCCATGTTCAGACTATGAACTGAAAAGTAG
CTTTATGTTCAGATCATGAACCGACTCTCAGATACATCAAACACTGTACC
GAAACCCCCTTTCTGCATTACAGTTGGATATATCTATCCTATTTTTTGGG
TTAATTGGATATATGCCACTACAACTTCTGGCTATTTGAGAAACGCCACT
CCAAATTTCAACTTTTGAGAAACGCCACTCTAATTCCCTCTACATTTCGT
AGATGCCATTATGGCTATTTTAACACGCATATTACATATTATACACTCGT
ATTTTCTGTAGTACATACGCATATATGGTGGGGCCAACCCTGATCAGCTT
AGTATGTATTTGATTGTTGGCTATTAACAGGTTAACACGTATTTTAAATT
AACAGGATATCGTATCCTTTTATTTTCTTGGTGGAGGCTGAAGGGGAATG
GCCTCACCGGTGTCCTCGGCCCAGCCTTCCCGCCACCTCGCCGGAGTCTT
TGGCGCACCCCTCCCTGTTTGCTCCTTGTGCCAGCACCGACGCCCAGTTC
AACGTAGGTAGTTGCCATCGGAGACGCCCTGTACTAGGGGTTTCCTGGGT
ATCTCCGCCCGAATCCACCACCCGTGGAGTACCAGGCACCGGTGACGTGG
AGTATCTGCCGCCAGCGCCCAACGGAGTTGACTGTCCCCAGCATCGGCCG
TTGACTCCCCTCTGCCTCCATTCGAGTACCTATCGCCGATGCCCACGACT
GTCAGTCCCCGCCGGCACACTGGCCTTGTGGCCTCGATACCCTCTATCCC
CAGGTGCACGCTCGCTCAGCCCCTTCCCAACTGCGAGCATGATGGCAGAC
AACATCCAATGTTAATGACGACTGCGATCCCGGATACCCTCTCCCGTTAA
GTACAACATAATCCTCAGTTCCTGATTCTTTGTCTCGAATTTGATTCATG
GTTCTATTAAAAGTAGTCTGTGTCGATTCACTCCTATTATTGACTGTCTG
TTTCTGGCGATTCATAGTAGATGCAATGGGAGCAAACAATATGAGATGGA
TTGGGGACATTATCTATTCCATAATGTAGAGATGCTAATTGTATTTTCTA
CCGAAAGTTTAGAAATAAAACTACACCAATCAATATTAAATGTTTCCGTA
TGCATGCTGCTTTAAACGTGGAGCTAATGATGGTACTATCGTGAGTGAGT
GAACCTTGAGCTATATCCCAAATGTTGTCACGAAATCTCTTCTTTTGGAC
CATGTCCAAGCTGATTCCGGTGGGGCCCTCATGTATTCGTACAGAAATAC
AGATGTATATAGTGTGGTATGTGTGTTAAAATAGGCATAATGGCATCTAT
GAAATGTATAGAGAATTGGAGTGGCATTTCTCAAAAGTTGAAAGTTGCAA
TGGCGTTTTTCAAATACGCAGAAATTACAATGGCGTTTATCTAATTAATC
CCTATTTTTTCTGTTAGCCACAGATTCAAAAACCCTTTTCTGCAGAACTG
TACCAAAAGCGCGTGTTACCAAATGGTAAAATACGAAAATCTGGTGCAGC
AAAACAGAGGATTACCATAATCGACCAGTGACAAAAATCTAAAAATGAAA
GACTGTTCTTTCAACAGCTACGATTTGAATTGGGAGTTTCATTTTTTTGT
ATTGCCCGTGTCATTTTATTTGATCCTTTGTAACCTTGCCATATAATAAC
TTCTAATCAGTGAGTCAAATTGCTAATCCTGTTTGTTCATACTTGCTACT
TGAATGTTACTTCTAGTAAATCATGTAACTGCATATCGTACATGCTTACA
TTGTGTTCTCATCTTCAGGTATATGACTGAGGTGAGGCGATTAAACCTTC
CACAGAACCAAACTGAAAATGTCTACCGAGGTTTCCGTGACCTAGAGGAG
AAATTGTTGTCTCCTTATTAGCCATTCTTTATTTGTCTTCTCGGTGTAAA
GTATGGGATGCACATCTGTTGTTGTACCAAGTATGGGAATAAAGCCAAAG
ACATCTTGATTCTACTGGACATGATCTCTCATATGCTGTGAATCTGTGAT
CCATGTAGTGGATCTTTTGTGCAAGAACCCAAGGCTACCCAGGAGGGCAT
CACGAATCAGATTGACTGTACATGCAAACAAATCTTTTATTTCTTCAGAA
GTTCGCTTGGATCTGCAGAACTGTTTGCTTCGATTGGGGAAACAGCAGGG
TACTGAATCTGATCTCTTTTCACAAATTCAAACTTTGCCTGCTGTTGTTT
CTTCAGAAGTTCGCTTGGATCTGCAGAACTGTTTGCTTCAATTGGGGAAA
CAGCAGGGCACTGGATCTGATATCTTTGTCCAACTCGAACTTTGCCTGCT
GTTGTTTCAGTTGTGTTGTGTACCATCAGTTTGTACAGCTCCATGGGTAA
ATGATTTTTTTGAAGTTGTTTGTCTCTGTAGCATTGTTTTTTCTTAGTTA
GAACATCATTTCTATAGCAGAAAATTTGTTACTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.