Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA035760

[Submit comment/correction]

Sequence	AA035760
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA035760
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAAACTTCTGTCCGAAAACTTCTTTCCTTCGTCTTTGCCCTGTTCGCTCT CGCAAGTCGCTCGGGACCTCGGTGGCGGCGGCCGGCGCCGGTACGTTCCT CCCTCCATCGTCTTCCTTCCGTCCCTCCTCCTTCTCCATCCCCGTCCTGT CCCCTTCCCGGACCTCCTCCTTCCCCATCCCCTCCCTATCCTTTCCTCTC TGCTCTCGCTAACCCTAGTCCGACCGGTCATGGAGGGGTGACGGTGTCGA CAGGGGAAACGGCGGCGGGAGGGGATAGGGCCTCTCCCCGTCCTCCCCCT TCCTATTCCCTTCCTCTCACATTCCTATTCCCTGTTATCGTTCTCTGTTT GCTCATGTTTTGTCTCTTTGAACTGCAGTACGTTCTCGGTTGATTATGAA TGGTACATTTGTGCTAAGTGTGTGCTATGTATAAGAGACATAAATTATCT ACTTGCTAACTATTTTATGTTACATATATGCTTCTTGTGATATTATTCGG AATATTTTAATGATAGTATCTGTTGAAAACAATATATATACGTTCTAATA TATAGACATGTAACTGTTCATACATTTACACAAGTATAAATATTAGCCAA AAGCAAAAAAAAATCCAATTTCATGGTTTGTACATCCAAACAGGAATTTG AATTGAGTAGCACCATCTGATTCCAACAGCAAATTCCAAGGCACCCAAAC AATAGAATTTGAATTGACAACCATTTCCTTTCCAAGCAGGATTTGGAATT CCCACCTGATTCATTTCCTGAATTCAACTCTGTGCATCCAAACAGAGCTG GTTTTGAGTTCGGAGGCGCCACCGGCGAGCTGAGATGGCTGATGCGGTCG TGAGGTGCCTTCGGGATGGCCGCCTCGACGGAGAGCACGCGCCCGCGTTG GCCATGCAGGGTTCCCTCCAGTGCTGCCCACTCGCCGCGCGCGCCATGCT CCACCTCGCCGCCGCCGTCGCCTCCAACGCGGCTACCGGGAAGGCACAGG CCAGGTATTGTTGATGTCCTCGGTGGTATGCTGCTTTATCTGGGCCTCGT CTGGCTGATGACGCGAGTTGCTTGCTTGGTTGGCAAATTGTGGTGGTGCA GGGGACTTGTGGTTGTGGCGTTTGATCGAAGCCCGGAAGTTTATCTGGAT TTCATGCGGCGGAGCGGACTTGATTCAAATGCTTTGGGTCGATGGTAAGA TCTGGCAGAGCAATTTTCTTCTAGGAAAAGGAATGAGAGATTTAGCATAG CCAGCAATTCAGTAGAATTGAAATGTGAAAATTTGAGTTGGGCTGTGAAA TCAGAGATTTTTTTGTGTTAAATGTTCTACTGTGAACTGTACATAGTATG TCCTTAATGCAGTCCATAGTTTAAATGTTCGTGATGGTAGAATTTACATG AATGTCTAATACTATGTCTTATAATATTTGTATTGTTCCAACAGTGTTCG GATATTGGATTGCTATTCAGACCCACTTGGGTGGAAACGGAATATTGAAA GCCTGTCGCACCAAGAGGACAGTGGAACACCTTGCTCAACAAACAAAGAC AACACCACAATTTTCAGAAGTGTGAAGGATGTTGATAAGTTGTTGTGCTC CATTATTGATCTTGGAAGAGGCAAGTCCACCATATCACCTTTTAAACTTG TTAATTTACCTTATTTATGATAATGACGCTAATGCTGTACTAAATGCTAT GGATATCAGGGTTTGAAGGAGAGAGCAAGACTTATTTTTCGGTTGCTGTC GATTCAGTATGTACCTTGATGGAAACTTTTGCATTCTGTGGAAACCATAA AGCTTACTTGGGGCAGATTTAATACAATGAAACTGGGTCTATATTGTGTT AACTGCATCTAGGGCGTACATTGCATCACATATTACTATATGCATTCTTC TGTTATAATTTATTATTGTCGACGTTTATGGAACTTCCGGCACAAAATTG GGAATTCCAGATATTCGTGCCAAAATTGAACAGTACAAACCTATAGCCTT GTAGTTAGCAGTTTGTGTATTGAAGTTAAGTAGGTTTGGATACCATTTGG AAACACTTTACTCCAAACTGAATAACAACAACCTGTCACTCACAGGTATT CTACACTCTGTATTTTACACTTATAAGTTACTATTTATGTATTGTTTATA GTAAAGAAATCTTTGCATTCTTTGTGATCAATAGTTCATTACGTTTTCAC AATATTACTTATTTTCTTTCAATGCTTAACAGCAAATCCTTAATGATATT TCAGATTAGCGCTATGTTAAGGCATGCTACAGTGCAATCAATTTCAGGCC TTCTTAGTAATCTTCGAAGCCATGGTATTATTTCTTATATTTTCCGTTTG TGTTACAGAGTTGTGCATTCATGGTACACTAGACACAATAAAAATTTCCA GCATTAACATTGGATATACATCATATATTGTATAAAATGCATGTTGTATA TATCTTATAATGTTAAGGGATACATGTTATCACCTGAAAGACCACCCTTG AACATACAGTCAGCAGCATGCCAACATATGTCTAAATGCATTGTAATATC AGTAGGATGTATTCTTGTGGTCCAAAAGGTTGATATACCTTTCTTCATGT GATTCTTACAGTAGTAATGTTGGTTATACTCGTGTTGCAGATCAGATATC ATCAATCCTCTGGCTGATGCATTCAGACCTCCATGAACCCAAGTTTTCCC GAGCTTTTGAATGTCTTTCTACTATGGCTGCTTGTGTAGAGCCAGAAGTT GTAGATTCAGGATATGGAGAAGAACGTAGAGGAAACATATCTTTCCTTGA GCATAACTATTCTAAAGCAAAGTTCCATGTGCGCCTGAAACGAAGGAATG GACGGGTGAAACATCTGGTAAGGTTCTTTGTTATTTGGTGCTCAAAACTT CAACTTATTCTAAATACCACACGTTGAAGAATCTTGATTGCAACTATACC TGCCTATGCAGCATGAGGAGTTACATGTCGAGGGATATGATGTAAAATTT GTTTCTGCTTCTTCTTTAAGTATGGAAGTGAACCAAAATCTAGTGCCTAA GGTTAGTTGATACATCCCACCACCCATAGCCCACACTTATCCTATTACTT GTTTGGTTTCTGAAACAAACATTGGTTATGAATTGTGATATGTTGGCTCA ACAGGTTCAGTTCAATCTTGATCTGTCAGAAAAGGAAAGAAGTGACAGGG CAAATGTTGTTCTTCCTTTTGAACATCAAGGTTCTCTCATAAACTAAAGT TATTTCCTCCCTCCGATTCATATTAATTGTCTCTGAAATGGATGTATCTA GACATGTTTTAGTGCTAGCTACATCCAATCTAGCGACAATTAATATGGAT CAGAGGGAGTACCAAATTTAAGTATCAGTTAGAAGTTTTATCTGACACAT TTTGACTGCCTGAGATGCATTGATATGAAGCAGTAATTGATTGTCCCTTG TTCTTACCTTAAATCTCAGGAAAAGGTGAGCCAATCCGTATATATGACGG CCGGCGATCTCTCCTGGAGGCTCAGCAAGATACAAATTTAACTACAACAA CTCTCCTGGACGAAACAAAAGTTCCTAAATCTGCAACTGCGAAGGGTGAA ATTCATTACATTCGTGATTCTGATGATGAGCGACCTGACTCGGATGAAGA CCCAGACGATGATTTGGATATTTAGCCACAATATGAGCCCAGTTTAGCTT ATTGGGCTATCAAATCCAAGGTAACCCTTAGCCCCACTGAGAAGAACTGC AATACTTTGTCGGTAGTCATTTCCATTCCAATATTGTTTATGCCGATCAC AGACCAGTAGGGTTCACGGGGCTAGAGTGAGGGAATGATGTTGTTAACAA TTAACAAAGAATCCATTATATTTAATACTCGCTACTCTGGAATTTCAGAA CAACAGCACCCACTTCCACTGTTCTAAATTGTGAGTAAAATACAAAAAAC ATATGCATCTAGTTCCCTCAAAGAGTAAAACACCGAAATGTTGTTCAACC AATACAAGTTGACATCCGACTACTGACATGTTCCAATAACATAGTAAAAT TAATTTGGATGCACAGTGACTTGATTATATTCCACGGACCGTCTTGCGCA CACCGATCTCATTACAACTCTATTGATTCTACACAGAGCACTTTTGCTGG TGCCGTATCAACGGACCAATAATCACGTATGCCTGCAAAAAAAATGTTTA CCTGCCCACAAGCAACATGAGGAATACCAAGCCCCAACACTAAAACATCT TACTGGACATGTACGTCTTATTGCAAGTACACAAAGCAGGTAACCTAAAA GCTCAAAAGAAAAGCATAGCAAAAATGGTACCTATAACTAGGGCAGTCAG TAAGTTACTCTTTAGCCTTGATGGTGGCCTCCGACTTCGAATGGAGATCC ACCATGTGCACGAGGGGGTCCTTGAGTGACTTGTGCTTCACGGTAACACT GTATTCACCTTGGAAGAGCTCAGCCTCGAATATGCCCTTGTCATCGGTCT TGGCATCCTTGGGCACGGCCTTCCACTCGGCGATGAGCTTGTCAATGACG TCTCCAACTGGAAGGTTCTTGAAGTTTTTGTCAGTGAGGTACATGACATA ACACTCCTTGGCATGCCAAGCGCCCCACAGCACTATGCCCTTCACCCCTG GGTGCGCGAACCCTTCCCTCATCACCTCCTCCAGGTACTCCACTTGCTTT GGCCCCTTTTTGACATCGATCTCGGTGAGCCAGATGGGAACCTTGGCCTG CGCTAGAGTGTCAAGGGATCCCCTCACATAGGGAATGTTGGGGGTGTCGA AGTGGCTCTCCAAGCCGATGCCGTACTTGAGTTTGTTGTTGCCGGGGTAT GATTGGATTTGCTTGAGCTTGGCAAGGTACTTTGTGGGCAGCGGTGCCGC ATCATTGGGCTCCTCGATGGTGTTGTACTCGTTCATGAAGAGGATGGGCT TGTCGTCGAGCTTGGCCACTTCCTTGAAGATCTCGCCAGAGGCATCCTTG CCGAGCTTATCCTCGAAGAAGCTGTAGTGGAGGTTCTCGTTGAGCACATC CCAGTGGATGAGCTTTCCAGCATAGCGAGACACTACATTCTTCATCTGTT TCTCCATGGCCTTCTTGAGCTGTGGCACGCTCAATCTGCTCACCCAGTCC ATCTGTTTGCTTTGGTCGTCCCAGAACACATTGTGCCCACGCACTGAGAT GTTGTACTTCTCCGCCAGAGCCAGCATCTTATCTGGGATCTCGTACAACT CTTGGTTTTGGTCGTACTCTGTGCTATACCACTTCATCTCATTTTCCATC GTCGCCACCGTGAACCGTGACGTGAACCACTTCTCGTACTCTGGGATGTC CAAGATCTCCTTTGTCATTGCGTTGCCCAGGGGGAAGCCCCTGGCCACCT TCTCCAGGGACAGCTCTGCATCCGGCAGCACCTTGCCGCCTGAGCCGTGG ACGGTGATCTTTACTTTCTTCTTGCGCTCCTGCATTCATTTTAGTTTCAG TCGCGGAGCCATGGAGTATTTATGTTTCTTTTACATTAATTATTTTAGCT AGTGTCAGCATTATGTAAATCAAATGGGGATTAACACCTTGGCAATAGAC TCATCGCGATGAGACTTCCATTCTTCGAAGCTGAAGGGCTGCAGCGCCAT GCTATCCACCATCAACTCCGCGGTTACATTGGTCTGCAGTTTTGCACGTT AATTACTCAGTACGATGCTACACATCCACATGCTGTGATGCCATCTCATT GTTGTATCATGCGTGGTTATCTAACTAGCTACGTTACACACCTCAAAGAA GAGCTCACCCTTGCCTGCAGCCAAGGAGGTGGCGCCACCCTTGAGCATGG TCCAACAGCCGGACTGTACCACTATCATGCCTGCGGTGTTGAAGTTGCCA TCGGGGGTCACCAAGACGGCCCTCACAACACCGGTGCTCTTGGAAAGCTG CAGCCAAGCTGAGGTCAAGCACAAACGTTTGGTTAGAAAGCAGCAACACC TAGTTTGTTGTCCTCGATCGATCGACTTGATTCCTTCTGCGTGACCAATC ATGATGGAGGAATCAATTACCAGAGAGGGGGTAGTGAGTATCCTTTTCCA GCTCGACCTTGAGGGTGGAGCCCTTCGCTGGGGCACTCTTGCTCTTTGCC ATTAGGAGCTTCTTGCCACCAGCCGACACAGTGGCTGGTGCCTCAACTTT GGCCAGGATGCCGCCACCGTACAAAGGTTTTGGCGGCTCCTTCTCACACT GCATGCACCGCGCCAGCCTGAACCTGTTACTCCTTGTTCTCAAGGAAAAT GTATCCTGTATATACGCATATGCAACAAGAATGCATGCATCTACAGATGA TGCATAATGCACGGAATGTTTGAACCTAAAACTGTGCAATTTTGCACGGA CTTGAGAGATCGACTTGCCATTATATGATGCTAACATAAGTGGTATCACA ACCAAATGACTAAACGCTGTTGTTTGATTTTCTATCTCAAATTGAATAGA AGAGTGTCTGTGTTTTCCTAAAAAAGAGCATAAGCGATATGTATGTATGG TTGGCGCATGCAGACACAAAAGGACATGATGCTTGCCTCAATGTTTGCTG AATAGTCATATGCAACGGATTTAGCTGATTTATCCGAGTTCTCTGATTTT TCTGACCTATCTGATTTATAAGATTTAGCCAAGCATCCTGCGTTGAGAGG AGAGAAAGTTATGTATTAGCACCCTGATTGGTATGTTCACAAACACCCGA AAATTATAGTACAAGATAGCTGAATATTTATTTTTCTCAAATCTAACACC TACAAAATTCCATCTGTTCTTAAGTTTCTTAATCTAAATTGAACTTCAGC ACAGAAACTGAAATTTCATAGCTACCAGCCATGAATATTTGGCATACGTA AATTAGCGTATGTTAGTCCACATATTGTGATTTTAAAGTATACACCTTGC TACTTTGTTTACTACAAAATTCAGACAATATTTATCGATGTATGTTGTCT TATTATGGATACATAACAATAATTTACACGTTCAGATATCCAAATTGGAA CTAACCGGGAACAACTAACCTTCAAAGAGGAGGACAACCAACAAGAGCAG GACCAACTTCCCTGTGAAAACCTTCATATTTCCTATGCCACTGGCTGCAA TTGATGTGGGTGTTAGAACTTGAGACTTTGAACATAATATATAAATATGG GAGGAGAGAACATCCGAGAGCAATAAGGTAGTACTATGTTCAGTTTCGCC AACTAGAAAGAACTGTCATAAAAGGAGATAAAAACAGTAGGAAGTCAGTT TCACATGTATGGAGGTAATTAACCCATAGCATTTAGTCATTCACGAGCTC ATTAGATGCATGACTGGCAGTTCTCATTTGTCCGTTGTTGTGTCAACGTT GCCTCCAGTTCATTTTTTCATACTGTATTTTGTTAGTATTCTATTAGCAT GTACTCGCACAACACATTTGCTTAGATGAGTGTTGTTTATGTGAAAGTAA TCACTTCTTTGCCTCGTCAGGTACATTAGGCGCTTGCGAAAAAGACTAGG AGGTGATTCCCGTTGCTTGGGTGCCGAGTGCAAACTTGATGATTGAATTA TTTAAGCATATGTGTAGCTTTGTCAGCACTGGAGGAGAACCTTGGTAGTA TTTGAATGCTCAAAACTACTAGATTTGTTATCAGTAGGCTGTTGAGTAAA AACTATCGCCCAGATTTTGTAGTGTTTGGTGACGTGAATGCACGATGGCT AGTGTGGCGCAACAGCTGAAATGGGTTGAAAACAAGAGGACCTGAGAGTT GTAAGAGCACAAAATGATGTGTAATTGTGGTATATGTTGGCTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.