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GrainGenes Sequence Report: AA046597

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Sequence
AA046597
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046597
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTATATGGTAAGATAACCAAAATTTGATGCACAATAAGTAGATACACTG
AAACATTAGAGAGATGTACACTTAAGGTTGCACAAATTTGACCAACCAAA
TGTTGTAGTTATGTCATATCAGAGAAACACCTCAACATGTGAATTTCGGA
TGATTTAAAACATAGCATACAATGAGTGAATAACACATAGCTCCTGAAAC
TTTATGTGACCTGGATATCAAAGACTTAAAGAGTAGCATGTGTAGTGACT
AAAAAGGTGGTACCGGCCACCAGATACCAACCAAGAAAGATCAAATGAGA
TGTCATAGCCACAGTAAACAACCAGTTAGAGTGGATGCAATGAACTAGTA
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AAGTACCAATGAATTGAATGAATACATTTAGCTCTAGAAAATATGCAATT
CAAAGAATCACTAAGGTGCATAGTAACTTTACTTGGACATATTTTGTAGC
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CGGAGGCTGTAAAGAACAATTATCTAAAAATTTAGCACGCACAAAGGACG
TGGGTGTGCCTGCGCACAGATCTGAAGGGGGTTTGGTGTGGGGAAGAGAC
GTACCTCCTGCCTACCACGGCTGAGGGGCTTGTCGAGCACGTTAGCATAC
TGCTTCGCCTTCCCCACGCCGATCATCTTGCCCGCCTTCCTCTGGGGCCG
CCCTTCCTACGGCTGAGGAAGGGGGAGGCGGCCGGCGATCTGGCAAGGAG
GGGGGCGGATCTGGGCAGGGAGAGGGCGGTGAAGGGGTCGGGCGGGATGA
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GGTGAAAAGAACGGGCCAGACTATCGTGTGTTGAGGGAACCACACGGGGA
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AGCTGCGGGGGTTAAAATCAAATCTCCCTCACTGCCGCGAGATGCCCACC
GTCAACCTCAGGTCGCGCGCCACCTTGGTGGCGGCCGCCACGTGCTTCGC
GGTCCTCGCGGCGGCGGCGGCGCTGCTCCATCGCAGGCGTCGCCGAGGTC
AGGCTCCATCCTGGCCTCGCCGCCTCGAGGAGCGGCGCTCCCGCCGCGCG
CGCCGCGCCTGCGAGGAGGAGGAGAAGCCGCAGGGCCGGTTCAAGCGCGT
GCTCGCGGATAACTCCTACTCCCCCTTCAAGCACCTGCGCCGCCAGGGTG
CCGACCTGGCTGTCGACGGCCACCGCGGCGAGTCCCTGCCGCAGCCGCAA
GGTGCGCCGCCCCTGATCCCACTCTCCTCATTTTTATATCGTCACTGCGC
TCATTTGCAAGGCAAATTTGTATTGAGGACCTGGTGTGTAGGATTATTTC
GTTGTGAAGCTCCCCCATGCATTGCCATGGCCAATTGTAAAGGTAAAGAC
AAGGATGTAGTATAAGTTCTGCGGGGAATTTTATGCCACACTGCTGGTCA
TGCTTGCAGAAGTTCAAACTCTAGGTGTCAGTTGGTGGTCAAATTCCTAA
AACCGCTCAGCTGCTAGGTTTGTCACTCACAATGTATAAAATGTAGCAAA
ATGCTGGTTCACCAATCACCACATGCTTCCATTTCCCATCAGGGGTATGT
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AGCCTTATAAATTACATGTCATAACTATCTAAAACAACTGATGACTCTCA
TGGTCAGGAAATCCTCCCTAGGCAACTAATTTGAATATTTTGCGCTTATC
TACTCCAGGGGCTTAAGCTGTTATTCATACCACGATAGTGCCACAGCCAA
GTTAAGAAGCTGATTGCATAAGCTTTATAGGTTCACTTTAACAAAAATGG
TTGTTGCTTTTTACCATGACCCGAACGGATTGTGCCCTTTTCCATTGTCA
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AATTGGAGCATCTCGCTAGATTGTTGGGCGAGGAGAAAGCTTTTGCTGTT
GATACAGAGCAACATAGCTTTCGGTCATTCCTAGGATATACTGCACTTGT
GCAGGTAATTGCCAACATATGCATTCTTGATGCTTTGCTGCTTATTAGTT
TATTAAGGTTGTAACATATAAATTTCATCATGTAGATCTCTACCCAGAAG
GAAGACTATTTGATAGACACAATTGCGCTACATGATGCGATGGGTATTCT
GCGCCCAGTTTTTGCCAGCCCGTCCATCTGTAAGGTAGTGTATCTGTTAT
ATCTGATGATGTCATCAGGCAACCATTTCTTTTCGATTCTAGCATTAAGG
ACAGTTACTTAAAAGAAGTATTTAAATTGATATGCATTTCAGTAACAAAC
TAGGCCTTGGAAGCTCTAGAACAGTACAAGTCAGCACTAGATGCCACGCC
GCCTACGGTGTGCCGCTTTTAGCACAGTGTTAGGACAGGTAACTGAAAAA
AGTTATTCATCCTGCATCACATTTTATGAGCCAGTCTTAGCAGTAAGCCT
TGAATAGAATATATCTAGAATGGTCCCTGCTTGATTCTTCTGGCTAGCAA
CCTGAGCCATTTTCCATAAACAGAACTATATTGTTTCTCTGAATGATTGT
TCACCATAGCTCATGATTCACATTGTGTAAATGGTTGAAAGATCTCTAGG
GTCCCCACATAACAATACGTGGGACGCTAGGATGTCCTAAGCTTAAGTTC
AAAACTTCCTTAGTCGAAGGCCAGATGTGGATTTATTGCACCCAGGCTCA
TGTGCCCCCTTTAGTTTCAGATTCAAAAGGTGGTTTTATAAAACTATTTT
TTTTTTCAAAAAAAGCCCGGTCGTAGATATTAGAATGAACCATGTTGTCC
ACATGCCACAACAATTTGGATTTTTTTGGAAGAATGATTTTTGTAGCTGG
GAGCACATGCTTCCGAGCACTATTTGGCTTTACCACCCAGAAACAGAGCT
TCTTAGATAAGTTAGCATCTTTGGTTATGTCAAGAAGCGTAAGCACAAAG
GCACAACAATCTGTTACTTGACATATCTTGAAGGGCAAAAAGTTATACTG
TCACAGACTTAACAATTCCAGTCAACAACACATGTGATCCTGACTTGTTC
ATCCCCAACTTCTCATAATATCTCTCCTGTGGTTCTTGTTTCTTTGTGTC
TCCCCTCTTCAATGTATTTGAGACTACGTCAAAATATTGATGTATGCTTG
CCCAGTGGCGGAGCTAGGACTATCAGCAAGTGATGTCAAAGTTCAAAAAA
GCTGTAGTGATGTCATGAACTATGATTTATGGGGTCAATTCTGGTGTATC
CATAGCTGGGGCCTTTTTGCTCAACATATTTTTGTGTTGTTGCTTGACCA
CACAGTTGCTGTGTAGCTCCGCCACCGTGCTTGCCTCAACATAAGATCCA
CATTGCTTTTGTTTCTAAAAGGTCGGAATCATTTATGTTCTGCCTTCTTG
TGCTTCAGATCTTCCACGGAGCTGACAATGATGTTCTATGGCTTCAGAGA
GATTTCCATATTTATGTCGTGAATATGTTTGATACTGCCAAAGTAAGTTT
CTCTATTCCTGGGAAGATTTAGTATCATTCTGCAGATACTTATGCAGCCA
ATGAACGCGTATGTCTGGTGGTTGTCCCGTGTTATTTTTGCTTGTACAGC
CAGTTATATGTCATTCACTACTTAGGAGAGGAATGCAACACAATTTTTGT
TTAAGTGGCTTCGCCATTTTATACAAATAAATTTCTTACACAATGGTTAT
TATTTTGACATTGTGTTCTGTACTTCTTTAGTTTCAGTCTATTTTACATA
TGAGCACTGCTACAGTCAGTTGTCTCTGTTTCAATTGTGTTGGTTTGTGT
TTTTTGTTTCGATCACAAAGTCCATTCTCTTAGAATTATAGTCTGTCTCC
ATAGATTCACAGTTCAGAAACAAAAGTTTTAGTTTATAACACTAGTTCCC
TTAGAATTATAGTCTGTGTCCATAAATATTTTGGTCCTTGAGCGTCTTTG
TTTCTTGGTACCTTTGTTCCTGCTTTCTGTCACTAAAGTTATCCTAGATG
CCATGTTTTTCGTACTTTTTGCTCTCACAATGCTCTTGTTATGCTATACA
TGTGTATGTGATTTGCTTGTTGAAAATTAATATATTTTCAGGCATGCGAG
GTTCTATCAAAACCACAGAAATCATTAGCATATTTGCTAGAATTATATTG
TGGAGTGACCACTGACAAGACAATGCAGGCAAGTAGTCTTTCATGTTTGG
CTTACATAGCAAGCTTGCTAAAGCCAGACAAATGTTCAGTGACAATTGGC
ATATTTACCGATTCTTCCGTAGCTGGTTAGATATCATGTGCCTCTTCAAC
TTCTACATGAATATTACTTCTCGGTATTTGAGAAAACTTGTGCACTAGAT
AAAGATTTGCTTTACATGTTATTTATCATGATACTAGGATGAAATCCAGT
GAGCAGTAGTTTTTTTCCTAACTCATAATATAATTATGTTGTATCAGTGG
TTAAAAGTAACTGTCCTCATGCGTAATTATTCATGATACCTTGTCAGCTC
TGACATGATGTCCTGATCACTGGCCTGGACACCCTTCACATCCTGGCCCG
AGATGGGTGCCATTTCCTTAGTCTTTTTAGCATTACTTAGATCAATTGAT
GCATGCTTCTTTAGTTTTTATCTGTGTTAACAAAATTTTAGACGAAACCA
CAGTTTAGTTTTTATTGACAATTTGAGCTTGCGTTGCATTTAATCAACCT
CAACCAAGGTTTCATTAGACCTAATATTTTCAGAAGTCTAGTAATTTGCA
TATGCATTCAATTTGGTATTGAATATGCCATCCAAAATAAAACTGATATA
CAAGTGCCTTCTGCTTGTTCTCACCGACCCTTTATCTGTGCTTGCAAAGT
CTGAATTTGTTAGGTACACGACATATCTGTTTCAAATGTCGAAGTTGCTT
TTGTAAATGCTGCTATTTTCTTTCATTTCAGCGTGAAGATTGGAGAATAC
GCCCACTGACAGAAGAAATGGTTGAGTATGCCCGTTCTGACGCTCACTAT
CTGCTGAACATTGCAAATTGTTTGGCATCAGAGCTCCATTCAAAAGCCTG
TGGTATGTAATATGTTCTAACTTCAAAGTGCTATGTCCGTATTTCCACTT
CAAAACAGTCTTTGGTTCCATTTAGTACATTAAGAGATACTGTATTTTGC
TCTTCAGCACACTGAGACAATGAATATTAAATACAGCTGAGTTTGATAGT
CCCTGGACTATGGAAGTAAATAGAGCTGATTTGCATCAGTACTTTTTGGA
TTGTTCACCTTTCAGATTTTTACTGTTGGCTGCAAATGAAACTTACCTGA
TTTAGCTCTTGTATGCTCATAGCTAATAGCAGGTTTCTGGAATTTGAATC
CTTTGTTCCCAGAAAACATGTGTAGTTTTTCATTTTGTGCTCTTAGTCTC
CCAATGCTTGAGCTGTGGCAGGAGAATTTCTGTTGTGCTCTCTACCTACA
AAGATTTTGAAAATGGTATGCTCTTAACATATATAAGCATGAAATACATT
CATATCATAAGAATCATGGATTTTGAGCTCCCAGACCGGGAGTGTGTATT
GAAAAAAATTGAACATGGTATTTGTATATTTTGAAGGGAGGTCTGAGATG
TATATGTCAGAGTACTATAGTTAAATGAACTTTTTTTGTGTGCTGTATAA
AAAGAACAAGAAAACTGGGCATATGTTATTGGGTACAGAACACAAATGGA
CAACTATTACACAACAATTACATTTGCAGACAGTATTGCAATATGTATAC
CTGTGAGCACTTACAAATTAGCCCACTTGTTAGCTACAACTCTTTAGATT
TGCAAAAGCTGGAGGCTTATTTGTTTGTATTCTTTCTGACAAGTATCTAA
AGCTTCTTGATGACCTCAGCAGGAGTTTTGCCTTGTAAGCAAACTAATCA
TTGTCTTAAATATGTGTCTGAACACTCTTGATCTGTAGTTAAGAAATGAA
ACTAACATTAAGGAACCAAGAAAAGGACATTTGGTGATCTTTAATATGTA
TTCTATGCATTGCTGATCTATGATTAAGAAAAGGAACTAACATCAATAAA
ATGAGAGTCCGTGATCTTAAATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGACTT
GGCTTTGTCTAGAAATGAGTATATCTATATACTAAAACATGTCTAGATAC
ATGCGAATCTAGCCAAATCCATGTCATTTATTTTGGGACGGAGGGAGTAT
GTATTTTACTCATTCCCTTTCTATTGTTAATAAATGGAAGCAATACTAAG
GGATCATGAAAGAGAAATTTGTGCTAATGAACTGATGATCTATTGCTCAA
CTACAAAAATGATGTTTTATGGTTTTACCCTACATCGTGTTGGCCTTCTA
AATTATATCATAGAATAGCATATTAGTATCTCTTGCTGCACATTTTATTT
AATTTGATCAGTTGTAATATCGATTATGCTTCAGATTCTCCCGATGGTAA
AATCAATTTTTTCTTGGAGGCTAGCCGTCGGTCAAACATGGTGTGCATGC
AACTATATACCAAGGAAATTGAATGCCCTCCAGGAGCATCCTCTGCAGCA
TCTATTCTCTCACGAAATTTACAAACTCATGGACTTGACTCCAAGAAGTC
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TTTTGCGCATGGAGGGATTTAATGGTAAGCCAACTTCTCTTATTTCTCTT
TCTTATTGTGTTCCACATTTCTGTTTGAGTATGCTCTTTCAGTTGTTGAA
CCTGTTAGTTGCAAGTTAGATGTTTGGGGGCAGAATTATGTGTCTGGCCT
TTACTATGCACACGTACATGCTCACATGGTGGTTTCGGCGGTTTTCAAAT
GGATCTGGAAGTCGTCATGCATGCTTAAAACAAAAGTATTTGCTTGGCTT
ATTTTAAATGACCGTCTCAACACCAGAGATCTCCTACTAAGAAGGCATTG
GAAGGTGTCCGATGACTCATATTGCGTGTTATGCCCTACCAGGTCATACG
AGGATAGAATCCATCTGTTTTTCACGTGTAACTTCAGCCAAAGGATTTGG
TCATATTTACAGATTGAGTGGCCTATGGGTGATGATATTCAAACCATAGT
GGCTGCTGCTAGGAGGGACTTTGGGAAGCCTTTTTTCATGGAAGTTATGA
TCTTGGCTTGTTGGCACATCTGGATGCAACGCAATGGAAAAATCTTCCAA
CATGAGAGACCCACATTTTCAAGGTGGAGATGTAATTTTATCCATGATAC
TACCTTGCTAGGTCATAGGATAAAGAAAAAGCGTAGAGCTGGCCTAGCTT
CCTGGATAGCAACCCTTGTATAGATAGTCTAGTTTGGTGAGTCTTCCTTT
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AAGGTGTCCCAGATTTGTCTAAATTTGAATGAATCTAGACGCATTTTAGT
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TGATGAAAGTTTACGGTATATCCTGTCAGACCAAGCTATAGCTGCCCTTG
CTGTTAGTGTTCCAAAAGGTCCAACGGAGATCTGTGCTGTCATAGCAGAA
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TATTGTTGGTGCTCATATTGAAGAACTCTGCTATTTAATTGAGGACACCA
CAGTCAGCATGGATAACTTGTTTACAAGTTTGCTTGGAAAGTATAAAGAA
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GCTAAGTTTGAAGCAAACAAATATATTTGCTTTTGCATCAAGTGGAGGAA
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AAAAAGTTTTCATGTAAGTCACCGGTTTATCACAATTGCAGGATCTATGC
TAGTGACGGAAGACTACTTTGCTACTGTGACCGGAAAAAGTTGGAATGGT
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ATTTGGCTAAGTTAGTAGAAGATAATCCTCCAGGAATCATGCTTTTGTTT
GAACCTAAGGGCCGCCCGGAGGATGAAGATAATGAATTTTATATCCAGAG
CAAGAAAAATATATGTGTTGGATGTGGAGAAAAGAGCCACTATATCAGAT
ATAGAATAATACCATCTTGCTACAGGATGCATTTTCCGGAGCATTTGAAG
AGCCACCGTTCACATGATATTGTACTTCTATGTGTGGATTGTCATGAAAT
CGCTCATTCAGCCGCTGAGAAGTACAAGAGGCGACTAGCACAAGAATTTG
GGATACCCCTTTTTGTGCAAAAGATAGTGAACTCTGGTGATACAAGTCTA
ATAACCGATGCATCAGTATCTGAAGATAAATTGAATGGAACGGGTGTATC
TCCTTTGCTGCTCAGGACTGCTGCAATGGCCCTTCTACGGCATGGATCCA
ATATGCCTTTGAAGAGACGTGAAGAGCTAATGCAGGTAACAACATCCTTC
TGCTTTTTCTGGTTTCGTCTATATGCACTGCTTACAGTTTCCTACCAATA
TTCTTTCCTGGTTAAACATGTATTTGTTCTTAGCAGTAGAACTGTGTCAC
CGATACATCCATTTCGTTGCAGGTTGTAAGGTCATACTATGGTGGTAGGG
ACGTGACTCCTGAAGACCTGGAGATGGCATTACTTGTCGGCATGAGCCCC
CATGAGCTAAGGCGGCTTGAAAAGAAAAAGGGGTATCCTCAATCTTTTAG
AGTTCAGACTAAAAATATTGTAAGGAAGAGCAGCAACAAGACCATCTTAG
AAGACATGAGACATGATTCGGAAAACAGCCATGCTTTACCTGAGCAAGTT
TCAGAAGACGGTCAACAAGACACTGATGGAATTGGGTGTGATAATCAGGC
AGAAGATTTAAGTATCAGTCAAGGAAGCGCAAGTTTGTTAGTCAGTATGG
ATGATTCCACTTCTGACCCTCGCGTAGAGACGCTTGAGACAGATGGCGTG
CGGCGATCAAGCAATGGTACTCATGTAAACGGCCATCAGGATGAGGATTC
TACGAGCACCGACAATTCTATTTCCAAGAACGCTGAGAAGAAGATATCGC
TGCTGGGACACGGGCATCACGGTAAACAAGTCGTGGAGCTTTTGCTAGCC
AACGGTGGGGAGGAGGCTGTTAACCAGTTTTGCCAAAGATGGAGGCATGT
TTTCGTAGAAGCTGTCCACCCCCGTTTTTTACCTTCTGGTTGGAATATAA
AGCACAGGTAAAAGATCACCTTTGCTGTTTGATCGGTTAATTGCTTGATA
CCTGAAATTTTGTGTGCTTGGAATGGCCGCTGTAGCTATCTGCTACCAGT
GGCCTTAGAAGTTTATGTGTCTCTGCGAACCCTGATGCTCTTTATCTGCA
AATTTATTTATCTTTAGAAACTCGGATATTTACTGAGCATCTTGTGTGCA
GTGGAAGAAGGGATTTCGGCGACTTCAGTGTCTACAAACCATCGAATCAA
GAACCCCAGCCTGCTGATGAGTGATTAGGACTTTAGGAGGGGCTGGCAGT
AGTGCCTTTTTCTCACAAAGTTGTACCCATTTCATCAAGCCTATGCTTGT
ATCACCGGATTCTTTCGGTATGTGGCACCTGGCTTGTTTTGAACTTGAAA
GAATTTTGTATCAATTTCACAAAAAGTTATTTGGATTCACTTGGACTAAG
TAAGGTACTGTGCAGTATATCCTCGGTACAATCCCAGCATCATTCATGTC
CTCTTGCAGAGAGATTTTTTTTTGTCTTTGCGTAAGTTGTTTATTATTCT
GGTAAGACGAGAAATAGGAAGTTGGAAATGGAAAATGGCGAGCAGGCTAG
GCTAGGCACAGGCAGACGGCCAGGGCGCGCCACATGATCTGTGGCAATCT
CGCGCTGACTGCCCCTCGACCACTCAGCCCGGCTTGAAAACCCCACCTGC
TCACTTCTCCACCCAAACCCAATCCAAAAAATCGTTCCCTCCCTCCACTC
CGTTCCCCTCTGCTTCCGCCTCTGCGGCCGCCGGTGACGCCCCACGCGCC
AGCCAGCCATGTCGTGCTCCCACTTATCCACCGCGTGGTCCTCCTCCGCG
CTCGCCAGCTCCTCCACCCGCCGCCGCGCCTCGACCGGCGGCAGCAGCAG
CAGCAGCCTGGTGGTGCGGTGCTCCCTTCGCGACCTCCGTAACCGCATCG
ACTCTGTCCGCAACACGCAGAAGATCACGGAGGCGATGAAGCTGGTGGCC
GCCGCCAAGGTCCGTCGCGCCCAGGAGGCCGTCGTCTCCTCCCGCCCCTT
CTCCGAGGCCCTGGTGGAGGTGCTCTACAACATGAACCAGGAGATCCAGA
CGGAGGACATCGACCTTCCGCTCACCCGGCAGCGCGCCGTCAAGCGCGTC
GCCATCGTCGTCCTCACCGGCGAGCGCGGCCTCTGCGGCGCCTTCAACAA
CAACGTGCTCAAGAAGGCCGAGGCCCGCATGGAGGACCTCAGGCAGCTCG
GCGTCGACTACAAGGTCATCAGCGTCGGCAAGAAGGGCAACGCCTACTTC
CAGCGCCGCGAGTACATCCCCACCGAGCGCTTCCTCGAGCTCGCCGGCAT
CCCCACCGTCAAGGACTCGCAGGCCATCTGCGACCTCATCTACTCCCTCT
TCGTCGCCGAGGAGGTGGACAAGGTGGAGCTCGTATACTCCAAGTTCGTC
AACCTCGTCCGCTCCGACCCAATCATCCAGACGCTGCTGCCCATGTCCCC
CAAGGGCGAGATCTGCGACGTCAACGGCATCTGTGTCGACGCCAGCGAGG
ACGAGCTCTTCAAGCTCACCACCAAGGAAGGCAAGCTCACCGTCGAGCGC
GAGAAGATCAAGATCGAGATGCAGCCCTTCTCCCCCGTCGTCCAGTTCGA
GCAGGACCCCGTCCAGATCCTCGACGCGCTCCTCCCGCTCTACCTCAACA
GCCAGATCCTGCGTGCCCTCCAGGAGTCGCTCGCCAGCGAACTCGCCGCC
AGGATGAGCGCCATGAGCAGCGCCACAGACAACGCCATCGACCTCCGGAA
AAATCTTTCTATGGTCTACAATCGCCGGCGCCAGGCCAAGATCACCGGAG
AAATTCTCGAGATCGTTGCCGGCGCCGACGCCCTCTCCGGCTGATTCCTC
CTCTCCTCCTGAGATGAGTTGCGGCTCTTATATATAATTCTTTGCCTCTT
TTTCTCCTCTCCTCCCCTCTTGTTGGTCTGTAATACTCATAGCACAAAAA
TGATGTGTCTGTACTCAATCGCCTGTCGCGAGATACACAAGATTTCAGTT
CAGAGATGCGAAATGTATAATCCAGAGTATTTGTTTACATTTGCAAACTT
GCCTCCCTCTTTCGCAATTTTCTTGTCATGAACCACTACTGACAGCAAGC
CAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.