Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA013290

[Submit comment/correction]

Sequence	AA013290
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA013290
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCACATGGTAAATTTTTTACTAAGTATTTGTGGTTCTTATTTCCCCTT GTATCTAGCAGGATAGTGAATTTTATTCAAAGTTCTACATGCAATTATCG TGGAATTACAATCGTTTGGCCATTTTCGCCTGGTATGCCCTCTCGTAGGC ATATACTCCTTTACGTATAGCACAGGACTTGGTAAACAATCTAAATAGAG TAATTCACACAACTGTGGCAACTGTAGCACAGGACTACAATTTCTGTAAA AAAAAGCCGATAACCACAAGTTTTAGAGTTATCTTTTGTGTCTCACTGAA CTGATCATGTGGCCGCTCTTTACGTGAAACTGACAATTGCCCCAGTCATC ATTGTTTTGTGAAATTTACTTATGTGGATTCAGTTTGCATGGAGTTTATA TTATCTCTAAATAACTGGACATGCCATCGCAAAACACTTGCACCTTTTGC AGTTCGCCAAGTTGACTCCTCCCAAGCTGGGCATTCCTGATAACAAGTTT GAAGAGGATGAAGATGTAACCGAAGAAACCGTTTTAATCTCTTTGAAGAG GGTGATCCGGCGCTTATCTACTCTCCAAGCACATGATGGGCACTGGCCAG GGGATATCTCTGGCCCTATGTTCCTTCTGCCGGGCTTGGTAGTTACTTCT GCTCATGTACAACAGTGAATTTGTTAACAGCCCATTATATATAGCATTCT AATGACTTTCATAGTACTCCTTCTGTTTGGAAATATAAGATGTTTTAGGA TAGTGAATCTAATGTATCTAGACACCTTTTAGTGTGTAGGTTCAAATGAA TCTACATACTAAAATATGTCTAGATACATTTATTTCACAAACCTGAAACA TCTTATAATTCCAAACGGAGGGAGTATATCAGTTAACTTCTGAACAAGCC ATTTCCGAATTCTGACAACATATTAAAGTATAGAACAATGCCAAATGACT CTTGGAAGATTGTATCCTGTGTTAACATCCTTGTTTAGGAATTCTCGAGA AAGTAGTGCCTAAGGCTTCTTGCTTGGTTAATTGTTTCTTTTGTAGTTCC CGGGCCTTCATGTTTCCCTCCAGTCATCCAGTGTCTTTTGGATTGTGACT TCTTTCTGGTCTGAACTATCGAACTTTCAGTGAACTTCTGATTTCCTGTA TAAATTGATCCATCAGATATCCCACTTCCCATTTTCTAAAATATAAAAAT GCCTCACTTTTCTCACCTGTTACCAACATTGCAGAAATTCTGGCATCTCA TTCCAGGTTATCCTTTATTTTGTGCTAAATGATGCATTTGGTTTCTCCGT CTTTCTTACTCAGGTTATAGCACTGCATTCGACTGGTGCCCTAAATGCTG TCTTATCATCGGAGCATCAGAAGGAGATACGTCGGTATCTCTATAACCAT CAGGCAAGGACATCCTCATGTTAACAAAAAGTTAGTTTCATGTGATAAAC TTACACGATAAATTTATGCAACAAAATCTGGATTTACAGTCCACATTCCT GTGTGTTTCATGTCCTTATGTTCACATTGTACATTCCATCACTACTAGCC TAATGTATATGTCATTCTTAGTTATTTTTATGTTTTCCAAACGAAGGGGA ATAAATCTCTGTTAATGCAAGTGTAGAACGAAGATGGAGGCTGGGGATTG CACATTGAGAGCCCAAGCACCATGTTTGGTTCTGTCCTGACCTTTGTTAC TTTGAGGTTACTTGGAGAAGGACCAGATAGTGGAGATGGAGCCATGGAAA TTGCTCGAAATTGGATTTTGGATCATGGAGGAGCAACCTTTACACCAGCA TGGGGAAAATTTTGGCTTTCAGTACGGTTGTTATGCATTTTCATTTAATT TTTTTGTTAGCTGCTTTGGTCTTGATACAAATGTGCTTCTTTTAATCCTA GAGAGGTCCTTATGATTTTCTTAATTTTCCTAAGGTACTCGGTGTATTTG ACTGGTCTGGTAACAATCCATTGCTTCCTGAACTATGGTTACTACCATAC TGCCTGCCATTTCATCCAGGTATGCTCCCTCCCCCTCCCGCAGCACACCC CCTCAAAATATCTTCCGCTTTCTCCTTCAACTTTATTTTGGCTATCTCGA AAAAATTGCTACATAATGTGATTAATAGTTCAACACTGCTTAACTTCATT GTTCAAACTGGAAGGAATGCATGTTTAGACTGTTAGTGCAGATGATCAGT AGATCACACCGTGATTATGGTGTATGGTTCTCATGCAGACCGACTCCAAG GAAGTGTGTATTAGAATCCTTCCTTCTTTTAACAGATTAGAATCCTTCCT GGGATTGATAAAGCATTCAATACAGTGTGGTCCTGATTCTTATTATAAAA TATTTGTTGCGGGAATGAATAGTATGGAATTTGCAGCAGTAGTACTCTAG CTACAGGCGAGAAAGTTCATAAATATATTTTGACGCCACTAGTATGGTGG CACATAACTGCATATTCAAAATATTTGTCTAAAATTGTTCTTGACATTAT GATCTCAATTTATTAAGCTGTAAGGGATGCCCTGATAGCATATAATTTTT CTGTATAAGGGAAAGCATGTACAAAGGACAGCCTGGAAATTTACAGAATA TGTACAACGGGGAGAGGGCTAGGCCTAAGGAGAATTTATATTAGAGTTTG CCTAGTTTTTCTAGGCATGTCGATCCTAAATATGATTAGATCATGCTTTT TTTCTTCCAATCTAGTTTATTCGACAGATTGGCAAAACAATCATTGTATT ATTCACACTTTGTCAAAAGTTATTTATTTCTTACTTGATACATTTCTATT TAACGTTTCACAGTTAATAGTATATACGATAATAAACAGAATTATACAAA AACTTATTATCTTTCTTTGATAAAAAATTGGGCATCACACACAGGGCGCA TGTGGTCCCACTGCCGAATGGTATACTTTCCCATGTCTTACATATATGGG AAGAGGTTTGTCTGCCCAGTTGCACCAATTGTATTGAACTTACGGAAGGA GCTCTATAGAGTACCCTATGATGAGATTGATTGGGACAAGGCTTGCAACC AATGTGCTAAGGTCCGTTTGATTTATACTTTCCATGAATTGTTTCCATCA TGAATGTGCCAAACCAGCAAAACATCTATAAAGTTAACTTTACCTTATGA TGCCAGTAATTAGTTTTGTGTACTCGGACATGGCTACTATGTCACTCATT TTAGTTTATTACATGATGTAGAGATATCCATGCAGGATATAATTAAATGT CTCATAGATTTTGTTATAACTGTACTGTAGGAGGATATGTATTGTCCACA TCCACTGGGACAAGATATCTTATGGGCTACTCTTCACAAATTTGTTGAAC CAGTTCTGTCATGTTGGCCAGGAAGCAAATTGAGGGAGAAAGCTTTAAAA AATGCCATGCAGCATATTCATTACGAAGATGAGAATACTCAATATATCTG CAGTGGTGCTGTAGGAAAGGTAATTTAGGATCATAATGGTTCCTTTGAAA AAGTTCACACGACTCCTTTTTATTCTATTCTTTTTTCTTTTGATACTTCA ATGTCCAGCTGATTGTTGTGAAAATTGAAAATATATTTAATTGCGCAGGT ATTGAATATGCTTTGTTGCTGGATAGAAGATTCTAATTCACAGGAATTCA GATTTCACATTCCAAGGATCTATGACTATTTGTGGGTTGCTGAAGATGGC ATGAAGATGAAGGTTATCTTTCGTGTTGTCCCTGACTCCTTTGTTTTACA TTCATCTTGAAGGGATTGCATAGTATACTTTTTCACATGTGCACTTAACT TAGTAAAATAGCATTGCGTAGTTTACTTCAGCGTTTTTAGTTGGCACGGT GTCTATTAGCAAAAATTTATTAATTCAATCCAAGCATAACATCTTTCAAA TGCAGCACTAATCTGAATTCTGGATAGATAGTAAGAGTGTAGTGAATTTC TTTTCCTTTTGGCTGGTAGTAAGAAATGGTTATGTAACTGTAGGGTTACA ATGGCAGCCAACTTTGGGACACAACTTTCACAGTTGAAGCTATAATAGCT ACAGAACTCACAAAAGAGTTTGGCTCTACTCTCAAACTTGCCCATGACTA CATAAAACAGTCACAGGTAATTTCTTGTTGCCTAATTTTTCTAGCCAGGT TAAGTCATTGCTTGATTATTTTTCTATTACTTATTCTGTGAAAGGTTCTT AATGACTGCCATGGAACTTTGAGTTACGGGTATCGTCATATATCTAAAGG TTCATGGACCTTCTCTACTGCTGATCAAGGTTGGCCCGTATCAGATTGCA CTGCACTAGGAATAAAGGTATTACTGCCGCCTTTCAAAAGTAGATGCCAT CAGATAATCTTTAATAATTAGCAGATAAACTTATAGAACATTGAGCCCTA CCATTCATATAAGTATTTAGTTTTGTTGCTTAAAAATCATATTATTATTA GAATAATGACAGAACGTTTCTTCATACATTTTCACTAATACACCTATGTT ATAAAAACATATGGTCAGAGGTGTTTGGTTGGACACTTGTGCTGTGCAAA ACGACATTTATTTTCGAATGAATGTTGTAATTAACGTGCGAACGATGTTT TTCACCTAAATGGATATTCACTTTGTCCAAAATATCAGGCAGGCGTGTTT TCATGATTTTACATTGGTCAACATTTTTTTTCCTCGACCATGCACCTAAA TGCGCATCATTTGTATTAGAAGGAGAGCACGAAGACGGTGCAAAGTTTTA CAGCCATCTGAAAACAGAAAAACAAATAGAACGGCAAAGAAAAGAAACAG AAAGACCTGTACAGCTACCCTATAATGGCTGAATGACAGCATCTCGTGGT CTAACATGGAGAGGTAGCTGCCAAAGTGCTTTGGCCCCTTCCATCATACA CTGATTGGCCTCATTGATGATCCCGTCGACCAGATCAGTGGCATCAGTAT TGGCGCAATGGAAGCCGCAATGGTTCCATAGTCACCACAGTCTCCATATG GTTAACACAGGATGAGTGAGCGTGTTTACCTTGGTAGCACTGCTCGATCG GCTGCAGATTGGAACCATTTTTCGAAGGTGTCTACTCGTTGAGGGTAGAT GTGCTGCAGTGACCAATGTCGCAGAACCTGGAACCAAACTTTGACCAACA GTTATTCAAACTATATGTGAAATATCTGATAGTTGATACCAATGAAAAGT CATATTTAATATGAATCACAAGATACTATCACGTAATGCACATTCAGTTC AACAATTTTTGTGTCAAAATATAAATTTTGGAAAGCCATGCACATTATAT TTCCTGAGAGAGGCAGTTTTTTTGCTACAATATTTGTTGTGCAATGACCT CGGAAATAAGGAAACTTTTAAATGCACAGAAAAACCATAATAGCCCTCAA GTTTTAGTTCCTATGATCTTGCTGTGGTGTCAAGGCCATAGTCAGAATTA TTTGTAAATCTTATAATTGTTGCAGTTCTTTTTCTTATCAGGCCTCATTG TTGTTGTCAAAGATTTCTTCAGAAAGTGTTGGCGTATCATTAGAAGCCGG TCGACTTTATGATGGCGTCAATTGTCTACTTTCTTGGATGGTATGCATAT CCTTTTTTAAACCTCCAAAAAACAGGTGTCGATATTTGTGACCTATGTTC TTATGCGTCTATCTACGATTCTATTTTTTGGGGGGGGGGGGGAGATATAA TTAAATGATTATAATATTTTTGCATAGTTTCCTAAAAAATAGACAATGGA TGCTTTGTTAACCCAGTCTGCATCAAGATGATGCATCCTAATTTTTTTTA AATAATATTTTTTATTGATTCCGAAATATAATATGAAAATTTGCAAATCT AGCACATTGTCGGTTTTGGCCAAACCGAATGGACCAATCGGTTTGGGCCA AACCTACTAGGCCATGGTTCTTCCCTTTGGCAGATTCCAGTCAGCGTGGG CAATCAGTTTGGCCGAAACCAAATGGGCCAGTTGGTTTGGGCCAAACCGA CAATGTGCTAGATTTGCAAATTCTTATTTCCGCGTATTATATTTTGAAAT CAATAAAAAACGTATTATTTAAAAAATTAGCGATGATGCATATAGCCTTA ACTTATTATTACATATTTCTGTTACAAATTGACAAAACCGCCTAAGAAAA AGAGGGAAATATCAACATATATATCAAAATAAAGTATATGGCATGCCATA GATGTTAAAAAATCAACCGGTACGTAGACACGTGAGGCAGGAGAGAGGTG ATCAGGCGGCGGCTCTAACCCATCTAGGGGTTCGTCCCTCTCGTCGGTGA CGCCGCTGGTCTGCTTAGCCTCCGGTGGCCTTGGGGCCTTGGAGGTGTGG CGGACCATGGCCTCTCGCCGGCGGAGGTTTTTGTTCTTTGTTTAGATTCT TTTTCAGTGTCTTATTCGGGATGTTGAGGTGGTGGCTACATCCTGATGTC AGAATAAGGTCCTCTCTGCCCTGTCCTTGCTCTGTGGTGCGTTTAGCGCT GGCGGATGGCGCGTGGAGTCATATGTCTGACGGATCTCTTGGGATCTGTT CGGTTTTCGTGTTCATTGGTGTGGTTTTAGGTCATTCTCTTCCGATCTAC GGTTGTCATCTTTGGCGATGGTTGCTACTCCTATGTGCTGGTCATTTGGG GCCTTAGCACGACGACTTCCCGTTTGTCTACTACAACAAGCTCTACTACG ACAATCTTTGCCTGGCTCCGGTGATGGAGGGGCGAGGATGGCGGCGCGCC TTCGGCTCACCCTAGTGTCTGTAGTCGTCGCTAGGTGATTCAAGACCTAT TTATATTTTTTTATTGCTTTTGGGCTTCTTTGTACTGTTGTGGACGATTA TTAATAGATTGGTGGAATTTTCGCAAAAAAAGTATTTGGCATGCCACACC GATATACATCTACAGACTAAGAAGCCTATCGATGAAACACTATCGAAACC GGGACATAGACTCCCTGGTAATCCACTCGACCTTCTTGACGAGCTTCATC AGCCCCTTCATTGCTCCTTTAACAAAGCCCATAACCGCAGCCACCTGGTA CATGAGATGATGAGAGTAGCAACTGCATACAAGAATGAACTTTTTTTGGT CAGAGACAACACCATTTCTGCATAGCCAAATGGGCCAAAGCACCCCTGCT GCCCCCACTAAAATAAGAAGACTTAACGCCTTATCCGTCCCTCGTAGACA TCCTCGAAAAATATGTGAGATACTATTAAAAGCTAAGTACACAAGGCGCC ACACAATATGTGCGAAAACACAATCGAAAAAGAAAATACAACGTGCATCT CATTACTATTTCCTTCAAACCAATTTTCTTTAGCGAGGATTACTCCTCAT CAAAGAAATGAAATAAACACCTTAAATGGGGTGGAACTACTTATTTGTTT TATTTCTTACAGAATGGGAATGGTGGTTTCGCGTCCTATGAACTCGCAAG GTCTTATGCCTGGCTAGAGGTGAGTGGCAAATTTTCTTGGGCAAAAACTG TAAGGATGGCATTACAGATTCAGTTCTCCTCAAGGAGTATTTAAATTCTT ACATGCTTTTAAAACTATTCAGTTTCTCAATCCTTCTGAGATCTTCGAGG ACATAATGATTGATCATCCGTAAGATTTGATAACCCTATTGTTTTTATAT ATGCTGATTTTGTCATGTTCAAGAGAAACTAAACTTGAAATTTGGACTCG CAGGGTTGTTGAATGTACTTCAGAAGTGATCCAGGCCCTATCATCATTCA GAAAGCACTACCCTGGACATCGAAGGGAAGAGATAGACAAATGTATCCAT AAAGCCGATAAGTTCATTCAGAGCATTCAACGAAGTGACGGCTCGTGGTT AGTGTTGAAGCTCCATTTTGGTAAAGATAATATATCTAATACAAATATAG TTTGATGTGTGTATGGTGTCTCAGTTCAAACATAAAATTGTTTGCTATTG TTGCACATTGCTCTCTCTATTTGCAACGAGCTCTTCGACCGCCCAACTTA CCACCTAGGCATTGAAGTATTGGACAAATATTTACTGAATATCAAACTAC TCTTACATATAGGAGGTTTATTATATATTTAAATGCAAAATTCTCAAGTT TAAACTCTAAACATATTCGCAACATATTTCCCTTATCGGAAGTTACACCA AGGGGTGGCACTTTTAATTCAAAAAAATTAAACTCTCTACCGAATGAATC AAACAAGTTTATAAAAAATAGTAAATAAGTATGTTCAAATAGATGATAAC TCTCTTTCAGTTCTGGAAACATCTACACTAGAAATTACATCAAATATCTC TTTTGCATAAATGATAAATGATTTCAAGGAAGAAATTTAGTTCCTCACGC TATCAAGATTTTTCTATAGTAGTCTATACCTAATAATAAAGGACGAAGTG TTTCTTACGGGTTTCGCTTTTTTTAGACTAATTTACCCTCCCACTAGACA TCATATTACCCACTATGCCACCCATAAGTGAAACAATCCGGGAGATGGGT TTTTTCATCCATTGATTGGCCAAGTCTGGCTCGTCAGTTGTCACACGTAC ATGGGTCAAGGCCCAACATTAATTATGCACGGGTTCGACCGTTAAGTGTA ATTAAGATTTGATACAACTCACATTTAGTCCCACCCTGCTGCCTTAAACC AAGCCCCACCGGTTTATATTCCTTAGCAAGTTGGCTGAAGTATCAGCAAG CAACTCGGGGAACAACAAGCAGCGAGAGTTCGAGTGTTGATTGCGGTGTG GTGCTATGCCATTGATTTTCAAAATAAATTCACATTTTTTATGACACTAC CATTTTATTTTACCGAGGATTAACATAGTTTTGCTAATTAGATCCAGAGT TTGTAACATATAATGTCTTCAAGATCCACATGCATTATGATAATAAAGAC TAACTTCTTCCGCTGCAACGCGCGGGCATTTTGCTATAATTACCAAAATT CCACAACCTGACAAGAAAAGTTGTATTAGCAACTCTAATCATGTGGCAAC ACAAAACTGATGCACAGAAAATGTTGTACTGATGTCATTTTATTTTCGTC ACATTATCCTACTATTGTAGGACTGTGCAGCATTACTTTCCCATACACTA GTTGGTACTTGGAAGTTACCAAATGTTTTTATTAATTCTCAGTATCTGAA TATAGCAACTATTGATCTCAATTTAATAATTCCTATTTATTTATAGTGTT GAGTGACATATTACCCGCTTAGAGGCAATAGGTCACCACATAATCTAAGA CTCTTTGATCAAAAGAAATGGGCAGCCCATACCAGTTCAGGAGCGTCTTG ACATTTCTAAGTGCAACAGGTACGGCTCGTGGGCTGTTTGTTTCACCCAT GGGACATGGTACGCAGTGAGGGGGTTAGTTGCCGCTGGCGGGACATTCAA GAACTCTCCTGCTATCAGGAAGGCATGCCAGTTTTTGTTGTCCAAAGAGC TTCCTTCTGGTGGTTGGGGAGAAAGCTATTTGTCATGCAGGGATAAGGTA CAGTTTTATATGTTGAAATTAGGCTAAATCCTAGAAAAAATGTGCATTTC TATTAATATATGTAGGTGAAAATTTTGTCTACGCCCCAGGCCATGGCCCG GGTTGCTCGGGGTGTAGATCCGCCCCTGCATATAGGGATCCTAATTTATA AGAATTAGGACAATGAAAAATAGCTTGAGATAAAATTAATGGTTCATTCC CATATAAAGACTTAATTTGATATTAATGCATCCAGAAATATTCTGCTATT CGCCCTAATAGTTTGTCTTTAATTCCTCCATTTTAACGGCTCATGCATAA ATACAGGGCAGAAAAATAATTTATTTTTCAAAATATCAATCAACCATGTT TTCACCAAACATTGCTTTTTTTTTTTGTGCAAACGTGAATGTCTCTGATG TCTGATCTGAATTTTTTAATTTCTGCACATAGGTTTACACCGAACTTGAA GGAAGGCGCCCCCATGTAGTCAACACTAGTTGGGCCATGCTGGCCCTGAT TGATGCTGGGCAGGTATTTATGTCTTTCCTTAATTTTCTCTTTGATTTGA CATTGTTTATTAAGCTATGTGCCGTGCTCATTTACATTTGCACTTTGATT TACGTTGGAACAGGCCGACAGAGACCCAGCACCTTTGCACCGGGCAGCCA GGATTTTGATTAACCTACAGTTAAAGGATGGAGAATTCCCTCAGCAAGTA AGTATTCAGAGATCTAAAAAAGCTAAGCTTTATTGTGTGGAAACTTGTCG AAACTGGTTGCTGTTCTAGCTTATTTAGTTTCCAGACAGTGGGCTGTCAC CAATTATTATTCAGGTATACTGTTTTATCTCCCCAATCAGTTGAATGTTT TTTGTGCCACACACATAACAGGAGATCATTGGAATCTTCGCCAGAAACTG CACCATCACCTACTCCCAGTATAGGAACATCTTCCCTATCTGGGCACTCG GAGAGTACCGCTGCCGAGTCTTGGGCACCAAATCCTCGCAGGAACCTGAC AACTCTAACTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.