Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028242

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028242
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028242
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATCTCTATCTCTACTATCTAAAAAATACGAAGGTGTTCCGTTTTCTGCCA CTACATCGATTGGCTTCGTCGCTTCGTCCCGCACCTCCGCGTTTCGCCCG TGATTCTCGCGCCCTCGCTCTGACCCCACCTCTTACCGTGTCTACCTCCT CCCCTCCCGCTTACCAGCCTCCACTCTCCTCCTCCCCTCCCGCAAACCAC CCTCCAATCTCCTCTACACCTCGGCGAAGGCCTTCTCCCCCGCATCTGAT GCCTTGGGCTCCTCCTCCGGCCCCTATTCAAACCGGTCGCCGGATCATGC TGTCTTCGCCTCCACCACGCGGATCTGGCCGTCACCTCCTCCAACACGCG GATTCGGGCTCCTCCGCACCGATCCGGTCATCATCGCGCGTCCCCTCGAT AGTCCTCGTCGTTCACCGCACGTCTCATGGTAATGGAGGACTGACAGCCT CTCCAGATCTCACGAGAAGAGCAGAAGCACGAAAAGGCTTGGATCGAGGT ATGGAGGTCTGGATCCCGTCATAGGTGCTCGAGATCTGGGCAATGAGGCC CGGACCCGATCTCCTCGCTCGACCTTGCACATGGGCAGCACCCGCCGCAG CCCACAGTCCTTCTTGCCGATGGTGGGCAAACACATGTTATACGTGCTTG TTCGCAGACAAATCAAGAGAACTATGATTGATCTGTAGAAAAGCCTTTGA TCACACATTTATTTCTGTCTCCCGATCTCATGTGCATCTCCCTACAGGCT GAACCTCCAAGATGGGTTACCGATGATGATGGATACCATTCATCTCCTCT GCCACCTGTGAGGAGGTAAGCGTGTTTGGATCTTATTCACTGCTTACGAG AGTAACTAGGCCCCTGGTAATCTCTACTATCTAAAAAATACGAAGGTGTT CCGTTTTGTCTGGTAACCATTGGAAATCCTTCTGCACACAAGATACTTGA AAAAAAATCATATGGCAAGTTCTGAGGAGCACATGAAAACACTCTGCCAA ATTTTAATTTTAATACATATATTTAGGTTTAACTAGGTTATTCTATTGGC AGTAGAACCGATGCTTAACAATTGCATTTGCACACTATACAGACAACGAT GGCTGGGACTTGGGCGATGGATGCACTTAGCTCGGAGTAGTGCGCCATAG GCATTCATGGTATGGTTTGGAAGATCTGAAGCAAGTTATTCTCGGTATTG TAGTTGAAGGATGTTGTTCCAGCCTTTATCTAGCTGCCTTTACTACAGAT CGAACCCGTGACTCTTCCTCCTTCTCATGTGTGTTCCTCGCCACCGACGT CTCTTGTGTCCTCACATGGGCACTCACCATCCATCTGCTGCAGTTTGACA TCAACTTGGCAGGTATTGTGATTGCCCATTTTTCCTCTCTAAATTTTTTG TACTGGATCAATGGTAGAGTGGAGATTTGCTACAGGTTTGGTGTTTTCTC TCTCACTTTGTATGTTTGCATAGTGTGCAAATGCAATTGTTAAGCATCGG TTCTACTGCCAATAGAATAACCTAGTTAAACCTAAATATATGTATTAAAA TTAAAATTTGGTAGAGTGTTTTCATGTGCTCCTCAGAACTTGCCATATGA TTTTTTTTCAAGTATCTTGTGTGCAGAAGGATTTCCAATGGTTACCAGAC AAAACGGAACACCTTCGTATTTTTTAGATAGTAGAGATTACCAGGGGCCT AGTTACTCTCTAAGCAGTGAATAAGATCCAAACACGCTTACCTCCTCACA GGTGGCAGAGGAGATGAATGGTATCCATCATCATCGGTAACCCATCTTGG AGGTTCAGCCTGTAGGGAGATGCACATGAAATCGGGAGACAGAAATAAAT GTGAGATCAAAGGCTTTTCTACAGATCAATCATAGTTCTCTTGATTTGTC TGCGAACAAGCACGTATAACATGTGTTTGCCCACCATCGGCAAGAAGGAC TGTGGGCTGCGGCGGGTGCTGCCCATGTGCAAGGTCGAGCGAGGAGATCG GGTCCGGGCCTCATTGCCCAGATCTCGAGCACCTATGACGGGATCCAGAC CTCCATACCTCGATCCAAGCCTTTTCGTGCTTCTGCTCTTCTCGTGAGAT CTGGAGAGGCTGTCAGTCCTCCATTACCATGAGACGTGCGGTGAACGACG AGGACTATCGAGGGGAGGCGCGATGATGACCGGATCGGTGCGGAGGAGCC CGAATCCGCGTGTTGGAGGAGGTGACGGCCAGATCCGCGCGGTGGAGGCG AAGACAGCATGATCCGGTGACCGGTTTGAATAGGGGCCGGAGGAGGAGCC CAAGGCATCATATGCGGGGGGAGAAGGCCTTCGCCGAGGTGTAGAGGAGA TTGGAGGGTGGTTTACGGGAGGGGAGGAGGAGAGTGGAGGCTGGTGAGCG GGAGGGGAGGAGGTAGACACGGTAAGAGGTGGGGTCAGAGCGAGGGCGCG AGAATGACGGGCGAAACGCGGAGGTGCGGGACGAAGCGACGAAGCCAATT GACGTAGTGGCAGAAAACGGAACGATCGAACCCGTGACTCTTCCTCCTTC TCATGTGTGTTCCTCGCCACCGACGTCTCTTGTGTCCTCACATGGGCACT CACCATCCATCTGCTGCAGTTTGACATCAACTTGGCAGGTATTGTGATTG CCCATTTTTCCTCTCTAAATTTTTTGTACTGGATCAATGGTAGAGTGGAG ATTTGCTACAGGTTTGGTGTTTTCTCTCTCACTTTGTATGTTTGCTCGAT GATGGGTCTTTGTGTTGGTGCAGAATCTCAGTCATGCTTACTTCACATGG AGATTGAAAACTTGAATAATTTTACTGGCCATAGTTTACTGGCCATGTTG TTGCCATAGTTTTGATATATACATTAGTTCTGTAAAACAAGAATTACACC TACTGACTACTGCTATTATTTGTAGTGACTTTCCATTAGATACAAAGGTG GCACAATTTAAGACTTACGAAAGATTTTTCTCATTAGTTTAGATGATTTA TTTTAATTTGCCATAGTAGATTCACTAGACGCACAATACAAGCACACGAA AACCTGATGTTTCTAGGCTGAACTGGCAATCTTTGTTTTTTGGTAAACGA GTTGATAAAACAATTTTAATTTTCCAATTCCAAATAGGACCATATAAAAT TGTAACATGATCCTATTGTAATAAAGATATCCCGGGTGCCATTCTTTGGT GCCATCCATTGTCCTGGATTGAACTATATCTTTGTGTTCAATATAGTTTC TGTATAGGACCGTAGAAAATTGTAACATGATCCTATTGTAATAAAGACAA CCTGGGTGCCATTCTTTTGTGCCATCCATTGTCCTGGATTGAACTATATC TTTGTGTTCAATATAGTTTATGTATCCCAATTGATAAAGCTTGGACGCGT TACACATTGACCTATTTGTTATTGTTGTTTTTTCTTATGAGATGAAGTTA TTTTCTATCATATTCACCTACTTGTTATTTCTGTAATGACCATGCATGTT TTTCTAGAGTTTTGTTGAGTCACAGTAAATCTACACGGTTTCAGTATAGT TTCGAAACCAGATGCCTTGTATATTGGATGCCATTTTAATATCCTTTGTA ATGTTTAGTAAGTTTGAATAATATAGAATCCTTTTTCTAGCATGTTACTA TTAGGAATTACCTTTTCTGATATGTTCCATGTAGTCATTCTGGACGCCGC ACGATGGTACTCAAACTACTCAAGCCTTCTTTGTTCTTTGTGATACAAAA CTTCAGTTACCATAGTTTATTCGAGCAAAGGGGATTGGAGGGGCGCACAG TGTCTCGCCACTTCGTCAACTACAAAATACGGTAATCATTGCTACATATG TGTGCTGGTCTGAATTGTTTGAGATTCTCTATTTTTGGCTAGATTAGTTG GGATTTAGAACTCGGAATTTGTGTGAATTAGTAGCGATTTACCAATGCTT GTAAAAGACGTTGTTCCGATATGTTATCTACAAAGGTGAAATGAAATTTC ATGGATGGGACTGCACTTACTTTTTTCTCTTCAGATAATAGTACTAGATT CCTACAGTTTGCAGGAGTTACCTAGAGAACAATTCATGTCGCTGCCAATT GGTCCTACTGAATGAAGACATGTCATAGCTCCTAATTAACAACAGAAAAC GTTTTGCTAAGACCAATGCTTCAGCAAATGTACTTTTAGTTATCATAAGA ATGTGACTGGTGACATAAAAAAATATTAGGTTCTGCTGAGCTGTGTTCTC TGTAAAATCAAATTCAAGGGATTAATCTGAAGATGTGATACGTTCTTAAA GATAGCTTTGAACAATAATGTGTGCTTAGACAAAAGTGGATCTAATATAT TTTGTTGAGAACTCCAGCTATTGTGCAGCTGATGCACCTATCCTTCCTAT GGAAATAATATACATCTTATGTTTTTGGGTGTAGTTATAGCATTGATTTA TGCCGAAAAGTGAATAGACGAGTTGCACAAAAAATTTATTCGAGATTTGT GACAAGTTTCAATTTAAATGTGTATTTCATTTGATCATGTGAGCTGTTGC AGAGTTACTGCAATTTTTTTTATTGACGGAACAATTGGTTTAGAGAAATA TGATTTGCATTCTTTATCTAGAATAACAAAACCAATTCGCAGTACCAGGT TTAGAAAAAAACTAAAGAACCCTGAACCACAAATTAACATAAGAAGAGAA CAGGAGGAGACTTGGCAATGATGGAATCATAGTAGTACATATATCTACTG CTACTTACCCTATATGTGCTGTGGACAAATACGGGGAACTGGAGTATATG TAAAGTATGAAACAAGGATTATTCAGATCATCATAGTATCACGTTGATAA TATTATGTCTGTCTAGGTTTGGTTCAGTTTAGTTAACCTGGCAACTCCAG TGCTGCTCAGCTTTTATTTTATTTTTACGATAACACACAATGACACATAT CTAAGATAACACATCGATGGTTCGATTTAGTTAACCTGGCATCTCCCGTA TTGCTCAGCGTTGTACTGGTTTGCTTTAGTATTCTCTTTAGTATTTATAT AAATCAAGCATTGATTCTTACTCAATCTGCTGCTCATTCATACCTGCAAT GTTGTGCTATGCTTGCAATGGACATGATTGGAGACAGGCGGAGCTGGCCA AACAGATCAACAAGCCTACGCAAGAGGTCCAGGAGTATGAGAGCGTCAAG GCCATCCCCATCCATATTGTACTCGTCAGGATGTAGCTCGCTAGCTGTTC ATTGAAATGCCCAAGTGGTGGTTCACACGGAGAAGAAATCCAACTTCCCA ATAGACAACTCCAGATGGGTTGCAAAACAAGCAAGCGCAGATAGGCCTAC TACGTGAAGTTATGAGAAAGCTCATGCCCCAGTAGCCGATGGCGAGCACT GGACAAGGGTATCTCGGAGATATTCTTTTGGCAAAGGTAACTTTACTGAC CCTGTTTTGATCTATGTACGTGTTAGGCTAGCCAAATTTTAATTCTTACT CTTGCTATGTTCATAGGAATGATCAATTAATTTAATGGCCTCTGCGTGAA GGTGTAAAACACATCAAGAAGACTTGGCGGCTTGTGCCGACAACAACAAC TGCATCAGACGGTACTGACAAAAGCCGGTAATTCAGAGTTTATTGTGCAT GTTTGTTCTTCAATGGAAGATTCTTATATATTCAAATGCAATTAGTAATA ACTTCCTTGTAGCATCCTCATTGTCATGTATTCAGTTTGGCATGAAAGCC AGGAAGCTCTCAGTTTACAAGTTCATTTATGATTTAATTAATTTGGTCTA TGTGGCTTCCCTTATGCTGAGTGTTGTATTTAGTGAAAGAACCTTCTACT TACCGGAGTTGGTTACATATGGCAGTGTAATCCAAGATAAGAATGACCTT ATGGTACCAACATGTCCAAGAATAACAGGATATATGTATTACTGAAAGTA CTATTGTTTGTTCGTGTTATATTGCAAACTTGTCCTCTGTTTCGTGAGTG CAGGAGTTAGAGGCAACTCTGCAGTCAAGGCGCTCACCGGTCGCCTACTG GTATATTGTCTTTACATGAGAGACTAATCCGGGCAGACGACATGTAATAG AAGCTGGCAATTTCCCTTGTCCTTCTACATAATCTTCTATGACAGACTAC ATTTCTTTTTATCTCAGAAATCTCAGTTTGTTAGCCTCTTTATTAGAAAA TTATTGATCAGTAATTTTCATGTTTTTGTCAATTAATGATCGCTTCACAA AGGATTATCACACTCATCTATATTATTTTGTTTGTTTTTAGGCCGCATGC AGGTTTGTTGCAAGTGGCAAACCATTGTTGGTTGTCGAGGTTAGAGGTCA TATGATGCCCTCTCAATAGGTTTGTCGCCTTAAAATACATAATGCTAAAA CTGGTCAAGCGGATCGGCAATGTAAGACGCCTTCCCATGAATACCATATC AGTACTCCAAAAACCACTTTGTTGAATTTGCATAGTGACTTTGTTGAGAA ATTAATGAGAAGAAACCAACAGAGTAAAGTTTTTAGTTGGAGTGATATTG TAGTTGTATCAATAGTACCAGGAGATTGCCCCCTCGATGTTTTTTACTAG AGATTAAGATGTGAATATTATATGCTTTCTCGACTTACCTTAACATTTTC TGAAGAAAAATACATGAATACTGCAGCGGTGTTGCCTTCGAATTATGTGA AGTACAATTTTTTACTCTTTGACCAATGTATGCTGATTATCTGTATGCTT ATAGTGTTAGAGCAACACACGGTTATTAAACTAGCTAATTATGTCAAGTT CTACGGAATGAACTGACACTCCTTACCTCCTTATATGTACCGTGTACTAA CTATTATTTTTGTATCTAATATCTTCTTGGTATTTATGTATGGGACCTTA AAACTCTTCAGTGTGCTCAGACACTCTCTTAACATTAAGCTGTTGTTACT TCTAGGCTTAGTTGGTTGGGATCAGAAGTTTCTATGTTATTCTCTGGACA AGACTGTAAATCTTTGATATGCTTCAGAGTATGGAAACCTTGAAGTCGTG CATACACATTCTAAGGAGCTCGCAAGTTCAACCCACTTTCTTATATGGAT TAGTCGTTCAGTATTATCTTCTCAAAATTCAATTGAAGTTTCGAACAAGG TAGCTTACATTAGCTAATATATAGCCATAGAATACACATGATCATGAGTA AGATCATTTAGTGAACCGGGCTTGCTACATATCTACACTATTATGTACTT AGTCTTTCTTTTCATTTAGTTTGCTTGATCCGTGTTACTGGATTGAGTAT CTTCTATAGGTTCTCAAGTGCTACCACAATCAAGCGCAGGGACATGGGTC AACCTGGCAAGTAGTAGCAATGCCTTCCTGTGGTCTGGAGATTTGGCAGG GGACAGTCGAGCTACTTGTCTTCTGGTACCTTCGACCACACGAGAATTGC TTCGGTGGTCAAATCGGTGTGTCCACGTAAGTGATATTTCTCGGGTTCTA TTGGATAATAGGATTGTTTCAGTTTCATTACCTTTTGTGCTGCAACTGCT CCTTCGATCATGTAGGCTTAGTTGGGATCAGAAGTTTCCTTAGAGCATAT AGATGGACCAGTTAAAGTTATTTTATTTTGTTCCAATGAATTACACAATT TGTTTTGTCATGTGGAAAAAGTATATCATCCATCATATTTTGGCATATAA ATATCAAACTTTTTTTGCAGGGGCCATAAATATCAAACTTGATGCATGCT TAGAATCAACGATGTGCAATATAAGGTTACCCTATCACAGTCAAGTCAGA CATCTTATTAATCTTAAAGATCACACGACCACAATAGTGGATGCTACAGT GGTTGTTACTCAGCAGGAAGTATTTTTTTCACTTTGGGTTGCATACTTGC AATTACTTCTAGATTCCCGAATCACTGAGAACACAATATTTATCTATATC CTATTGATTTTTAGTTAAAAACTATGGTACTGTACATGGCACTTATGCTA CGACATGCTCTATAACCTATATGTCAGGTACCCCATATTCTAATGAATTT TGTTTCCATTTCAGTATTTCCTTTTCAGGTACCAATCCTGGATTAAATTC TCACATGCTTTCTTTGATGGATTGGGTTTTGAATGATTGCAGTATGTTCC TGAGCATACCTTGGGTGTAGCAAGAAAGTTGCGGTTGTATTTATTCTAGG TAATAATTTACATATTATGTAGTGATATTTTCAACTTATTTTTTCAAAGC ACAAAATTCTTGTCAATGTCTATTCAGCTTTTAGTTCATGGATTCTCACA TCATGTCAACGGGCATCACTATCTTCGTTTTACGAATCAAGTTTGGTTCT GAGAATGTGTAATAAATCCACCGCCCACAAGCAATATTTCTTATGATTCA ATTATGTATATAACGCTTACTTAGCTATTTGTGATATTCTTGAACTGCTT CGAGGAAGAGATATGAATACGTCTTGTGGGACGTAATCAGGTTGAATTCT CTTTATGTTTTTTTTGTTGGATTGTATTTGACAGTCTCCCTATTTTTTGA ACCTTACACTATATTTTGATTTCTTCTAACATTTTTTGGTTTTCTCGATC AAATTCCCAGAAGAACTGATGATAACATTGAGGAAAATGTTTAGAGTTTA TGTAGGATCCAGATTATTTGAAATTCAGTACTATGACTTAGAGTGCAAGG TTAAGAATTGTATATCCATTTATATGCAAAATGGTATGACATGGTTTTGC ACAATAATTTATTTTTCACAGGCTCACTTACCGACATTTCATGGTTTAAG ATAGCCCGACATTAGCCTGCATGTAGTTGAGAACTATATCTTAAAAGATA AGGTTAAGACACTACTTGGAGAATTACTTATCTAGGTTGATTTGTACGAT TTGCCTGATTATAATGGTATATGGTGGTCAACGATATTTATAACAGAACA TTATAAAAATATGAGTCTTGCTTTGTTTCTGTCTTGTAGAAACTTTGAAG TCATGCTGTGGGAAGCTGGGAACAGCGACAAAAAATTTTCAGAATCGCAA AAAACATTGTGTGCAGTATCAAGTGCCATGTTGGAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.