Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025181

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025181
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025181
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCGGCCGCCGCCGCGGCGCTCGCGAGCTCGCCCCTCGCCCACCACCT CACCGCCGCGACCCGCCTGCGCCTCCCCAGGCCCAGGGCCTCCGCCAGCT GCCCGCGGTGGGCATGCCCCAGAGGCGCCTACTTGGACTGGAGGCCCCTG AGGCGGTGCGACCGGATGCGGCGCTTCTCCGTCGACGAGGGCGGCGGGGA AGCGGACGGGGAGAAGCGGAGCGACGAGGAACCGGCGGCAGCGGCGGTGG AAGCCAAGGCGGGGGCCGCCGCGGAGGAGGCAGCCTCGGAGCGGAGCAGG TCGGGGAGCTTCTCTTCCTCGTCGTCGCCGTCGTCGTCTGCGGTAAGGTG TACGCTTATAGCAGACTGCTGAATTTCCTGCTCATTTGTTGCTACTGTAC GAGAAACTATGTAGACATTTGCCATTTCGATGGAGTATTATATAGAGAGT AACAGTTGTAGTAGCTGTGCTTCCGGTTATGTAGGGAGCGGATGCCTTTG TTTCGTGCGTGAGATTTTGTGCTGAACATAGTTGGACTGGATGGCTTGCT GATTTAGGAGTATTTTCTAGCCCCGTCCGCTGGACTGAGAAACAGTACTG TGCGCTGATAGAGGCAGGCTCATATGCACTTTAAAAGGGGAATTGCTTTC TTCAACCAGTCCTTGCGATCCAATATTGCAATGTAGTGCTAGTATGGCTG TGATGGTGAAGTAATCTCTCCAATTAGATGCGTGTGGTGTTTTAGGGAGT GTGATCAGACTTCTATAATTTTGACCACGATAACATAGAAGACTATTTAG TTTGATTATATGAAATTGGCATCGTTAGACTTGCCAAGGGAAATGAACTT GGCTACCATCATAAAAAATGGCAAAAGGTACATGTTGCAGCAAGGCGGTG TTCAAAACATCCTATGAGAACTATATCAATGTAGATATTATAGACCCGAC ATTCAGTTGCAAGAAATGAGGGGAGGTTACCACATTGTGGTTGTTCTTGT CATCAAAGCCTGGTGCTAATATAGTAATTGAAAATAGCTTTTATTGGACA CTTTGGTACTTCATGTCGCGTATTTAAATGAAATTATACCTAAATGATGA ATCTCGTCATGTCATGTCTCTCTGCTACATTCAGTCACGTGTTTATCATA TCAGTATTGCTTTTGGTTTTTCCTATCCATTTATTTGCTGCAAGGTCCAA AAAAAAGTGTATACCAATGTAGGGGCTTAAGGACTGTTTGCATAGCCCAT GAGAGCCCTGCCAAATCGGGGTGTGCCAATATTTTGGATGAGCCCTGCCA AAAAAACTGAACGGGTGACCAAATAATTGGCGCAGATGTGAAATTTGGCT TATGCAAACACACGCAAACGCCCTCTGTCAACGCCAAAATTTTGGTTGGG CAATACCTGACTGCCATCCAAACGCAACCTTAAACCTGTTAGAACTTACT TAGTAACAATACTGCGAAGACTTCTTATATGAAATAGAAAAATGACATGA TACTTAGTAATACGTGCATCAACACTTTGTTTAACTGTAAATCCTATTTG TTTTAATATTATGAAAATGGACTGATTCTCTTATCAAACATATTTCTGTT AACACCTCCATTTGCTCAGACTCCTGGTGTATCGAGTGAGCCTCCACTTT TGAGCTTCAGTGTGGATAGCATTGATACAGTTAAGCTATTGGAACTTCTA GGCCCAGAAAAGGTTGATCCAGCTGATGTCAAGGCTATTAAGGAGAAGTT TTTTGGCTACACAACATTCTGGTTGACAAGAGAAGAACCTTTTGGTGATC TTGGGGAAGGAGTCCTTTTTGTTGGGAATCTCCGAGGGAATAAAGAGGAA ATCTTTAGAAAGCTTCAACAGCAGCTACGTGAACTTACAGGTGACAAATA CAATCTTTTCATGGTGGAGGAGCCCAATTCAGAAGAGGATGACCCACGTG GGGGACCACGTGTTAGTTTTGGTTTGCTTAGAAGAGAAGTTTCCGAGCCT GGACCTACTACCCTGTGGCAATACGTTATTTCACTGTTACTTTTCCTTCT CACTGTGTTCTCATGTATTGAGTTAGGAATTGCATCAAAGGTAATCTCAC TTGTTATATGATACCAGAACCCAAATATCCTTCTGTGCTAGGTTGCTAAT ACAAAAAAGTTATGCTTTGTGCAGATTAGCAGTCTTCCACCAGACATCGT TGCATATTTCACTGATCCAAATGCTACTGGACCCCCACCTGACATGCAAC TTTTACTTCCATTTGTGGAATCAGCTCTACCAGTGGCTTATGGTGTGTTG GCCATCCAACTATTTCATGTAAGTAGATTTATTGAGACTTTATTCCTCTT CTTGTATTTTAACTCTTATTTGAACACCAGTGCACCTTTCACACCAGTTC GAGTCTTCAGGAAATATAATGAAATTGTCACTATTAACTTTTCCTGCTGT GCTCCTATTGGTTACAGAAGATTACCAGAAGTAAATTGTCTTCACAATTT TTTTGCTGCCGTATAAAGTGTGGAGCTAGGTGTTAACATAGTTGTTACAT ACGGGTTTGTATACAGACTCAGATCTGAATAAGTGACCTATCCTTTATGG CTCAGTATAGTTGATAATTTAAAGCAACTATTTAATCGATAATCTGTGAT CTGAGCAATTGAACATTGATATCAACTAGCAGACAACGGTATGTTGGTAT CGCAGATCCTTTAGTTAAGTGGTGATTTGTTGTGTCGTTTGAGCTGCCCT TCGTGAACCCCTTCGTCTATGGGTATTTTAAACTGACCTACTGTGTCGCA TTCTGCATGCAGGAAGTTGGACACTTTTTAGCAGCATACCCAAAGGTGAA ACTGAGCATTCCTTTCTTCATTCCGAACTTCACACTCGGAAGTTTTGGCT CAATTACTCAGGTTTGTATTTATTAAAGGAATGTGTTGTGCTGCTATTGC CTTACATATATCAAATAGTTGAGCACTAATTATCTAGCATACTGCCATAC CAGGATGATGCAAAATTGGATAAAATCTTGTGTTATTGTATTATTAATAA TACATTGCATTCTTTATCTGTACTAAATTAATTTCCTGCATGTAAATATA ATAGCATCAAAACATATGCCTTAGTACTCAAAATCTCTCTCTATCTTTCT CCCTCTTTCTAATTGGTTATGGTACTAAATAATAGTATTACATTCATTAG AGATCCTTGAGTAATGATAGTCTTTTTTTGCTACTTCTGGTGTCATCATT CACTGGAGGTACATTCCAGACTCCAGAGTCTAAACGGCAAGGAAACCCCT TTTTCTTCTTATCAAATGTATTTTGTACGACATGTCTACTTTTGTGTACA TTTTAAAATCCACATACAATTGTGCATATTTCTTTTCAACCACTACTTGG AGGTTTTCTTATTTTTCATCATCCTTTCTGTAGTTCAAATCCATTTTGCC AGACCGAAAGACAATGTTTGACATATCAACGGCTGGTCCTCTGGCTGGAG CTGCACTCTCTTTTTCAATGTTCTCTATAGGCTTGTGGCTCTCCTCGAAC CCTGCTGGGTCAAGTGATTTAGTTCAAGTACCCAGCAATCTATTCCAGGG TTCTTTGTTGCTTGGACTTGTAAGCAGAGCAATACTTGGCTACAGGTGAC TGATACCTGACATTTTGGACATTTATTTTTTACCATTTAAACTAGTCTTA AATTTTGTTGGAATATTTTTTAGTTTTGATCTGTCATAGTTCCATATATA CTAATGCACTTTTTCCTTCAACCCATCATGTTAGTGAGGACTTACTTCGC TCATAGCTAGTTTCAGTCTCGAGAAGTGTACCCGATTAGATGAAACTCTT ACTTCTAGGTTCAGGAGGACTGTTTGCTTGATCAACTCTAGCGGAATATC AATATTTTTCCTAACTCCCAACTTATACATATATTTGATGAATAGTTACA TGTGATGGGATCTTATATGGACATTATGAGTGTGCGCTTAAACATTAAAG GATGTTACTAAGTCCTGTTGGTACCATGGTTTTGAAGGCCTTGCCTAAGC GTCACTTAGGCGTCACTTCAGTGGTAAGGCGCCTTAGGATGGCAAGGCAT CACCCTCGCCTTAGACATCTAGCACATGGCTGCCGTAGTGAAGTCTCGAC TGCAATCAGGGATCAGTGCAGCTGCTCGGTCATCGCTGTGGCTGCTCCTG AGGGATGGAAATGACAATCCCGCCACCTCCCGGCACTCCGGCAAGCATAT CGCGCCTCCTCCCTGACTCGTTCTACTCTGCTGCTGTTGTGAGGAAGGGG TTGTGGTTGCTATGGTGACTGGTGAAGCCGTGAAGGTGAACTTAGCGTTA TGTGTTGTCATGAGGAATGGGTGTTTGAGTGTAGAGGCTGTGGTGAGGAA GAAGGGAGATGTTGTGGGAATTAGGTCACAGGAGGAGTAGATTGATCATC TATAGGCTTTTAGGCCATCCAGGATGTGCTATATGGATAGTGATCCATCT CAATTATTTTATTTTATCTTGTAATATATGTGCATATTGTTCTATTCCTA TAATGTCTAACTCACCTTACCGCCTCACCTTAAACGCTTGTTAGTTATGG CAGGGATTAGACACATCACCTCGCCTTACCACCTTAAAAACCATGCTTGG TACTACAACTTCTGTGGAACATACTAGTCTATCCCTCATCTGTGAAGTTG AGGACATACTATACTTTATCAACTGCTCAACTGTATTTTTTTTAAAGTTG TGGTAGAAACTCTTATGTTACTAATGAATTAAACTAATTTTTCAGTGCTC TACATGCTGCTACCGTTTCTATCCACCCACTTGTGATCGCCGGCTGGTGA AGTCTTGCTCACTAATTTCTTGAGCTCTTAACCAAATAAGTTTTGTCTGT CTTATTGTTCCTGCAAATTCTGTAGGTGTGGTTTGACGACTACTGCCTTT AATATGCTTCCTGTTGGATGTCTTGACGGTGGAAGAGCTTTACAGGTAAA AGTTTCCCATACTTTTTCATGGGATACTCCAAATAATCACGCTGGACAAT ATGCATGTACTATGTCCATCCATAAATATAGGTAGTTTTAGTATCTCGTT TGTCCAGTTTGCAGTTCTTAGGTGCTTTTCCCTCCATTCTTCCTATCACA GCCACAGCAAGTACTCTTATGAATAACTAAATCTTAAAAGTGCTCTTGGA CAGAGAACTCAAGAATTAAGAGCATAATTAAACGCTAGTATGAGAAGAGC AATAGAGCATGATGGCTCTTTTAGGATATTACTTAATTCCTGTACTCATG CTACAATGAAATATATTTGTGAGCAGTAGGAGTATATGAGAGTAGGAACT CATTGTATCAATGAGCCTCAGTTTTCACTTTTGCTTCGGTCCCCCACCCC CTCCTCCTCCCTCTTTCAAATTTTGACAAACAAAAACTCGATTCCGATTG TTTAGAGGATCGTACGAACCCACCCAAACTCCGTATGATTCTCTTATACG TATACTCACCATATACGTATGTGCATGTGCCTGCGGAAGACGAAAATCAG AAGTTATATAACAACAACAAAAAAAATTAAAATATGACATACAAAAACGT AGATCGCGATAATAGGAGGTGGGATCAGCCGGTCGAAACGTGGATTATAC CCAGTTCGACCGAGTACACATATACAGAGATAGACGTGATCTCAATATGG GTTTCGACCAGTCAAAAAAATAACACGGCCCATGTAGCTTAAGTTTAGGG GTAGGGGACCGAAGCACACCTCCTCAGTTTTAGCTTTCTTGTTTCAGGAC TTCTTTTTCATTTACCTGTCATATGAGCTACTGAATGGTTTTTGTGTGAC TTGGATGCTATGAGTAAATAAAATGCAAAATTGTCTTCTATCTCTAATGT ATTTCTTTACTTGTCATGCTCTTTTCAAATGATGATGATCAAGACAGGAC ACCAGTATATGCAAATATGAGAATAGATTTTTCAGAGATGCCTGTAGCTT TCAGTGCTCACAAAAGAGTGTGGAGCTATACCTTGTGAATTAAGTGGAGA ATATCAGCCATTAGCTATTGTGCTTATTAGTCCTCGAGTTTGTACATGTT TAGGAATAAGAATTACGACTAGGAACTAAGTACACACTGTTGGATCATTG CAAATGAAGAATAGGAAACTAAAGTCGCGTGTTCACCTGTTCTGTCCTGG TGGGATTTGCCTCCTGGTCTGTTGGGATGAGAGAGGAGCATTTTGTCCCT AAGGAGGGAGCTTCAGATTTGACAGTGGGAAGGTGGGAGAATTGGAGGGT GGAAGGTGGGAGAATTGGAGGGTGGAAGGTGGCAGAGTTGAGGGTGACCA GAGGGAGATACACACGTGGCAAATTTGATCACCCCCATTGTGGATGCCCT TAAGGAGGCTTCATCTGCACTGAAAGAAGTGATACATTCAGATCTCGTCA CATGTGTTCCTTTTGCACATTTGTTGATGAGTTGCCCATTGCGTCTTTTG TCAATCTTTAAATCTAAATTAACTATACAGTACATAGTTATCTAGAACTT CTGCGTAACCTTGTATTTTGGAAATAGCATGTCTGTTTGTCAGCAAAATC CTGACATGTTCTGTGATATTCAACAGGGTGCTTTCGGAAGAAGTGCTTTG TTTGGATTTGGTTTGACGACATATTCATTGCTTGGACTTGGAGTGGTATG CCAGTCCATTACAACTTGTTGCACTTATCCTTGGAACTTTGGCTTAGAGT TTTTATAGCACTATAGGTTGTTTAATTACCTTTGGAAAGAAGAACATACA TTTTCATCCACACTAATGGCATTACAAGTTTGTGTGATTGATTGCCACTA AGCAACATGCAATGTTTTACACTTTCATAATATATAGAAAATGCTGGACT TGACAGGAAGCAACACTGCACTTCCTAGTAGGTGCCTAGGTGGTAGATAT CAATTTTTTTATAGTTCTGGAAACTAGGAAGCTAGAGTTAGGATAAGTAT ATGTAGAAAAAATTCCAGGAGTCATTATTTTTTCATGTTTTCTTCTGTTA AGATTGGAGATGTATTTGAGAAAACCTCAATGCTGAATACCTGCTATTTT TTAAAAAACTGTTAAATAACAAATGTTGGTTGTACAGGAAGTCTTTCCAG AAGACAATTGTCTCAGAATCTTGCTTACCCTTCTTATCTCATGCAAATTC AATACATGTCTAAAGATGATACTAGTATTATTGTTGTACTTCTAAATGTA AGATACCATGTACCATGAGTCTTAATCATATGGAAAACCAATCGTATCTT CGTACTAGGCCGTTGTCACTTTTCAACCCCCAAAGTTCCACTTTAGTATA CATTGATTAACTTGTGATGTTCTTCCTTCTTGTTTGCTCTAGCTTGGAGG GCCATTATCTCTTCCTTGGGGCCTGTACGTGCTACTATGTCAGGTAAACA GAAAAAACAGCCAAGTAGATGGTCAGGAGACATGCCAGGCCCGTGTTCTG TGCACCAAACTTACATGTCCCTTTTGATGATTTGTGTACCAGCGAACACC TGAAAAACCATGCTTGGACGACGTGAGCGACGTCGGCACCTGGAGGAGAT CCGCCCTGATAGTTTCGGTGTTCCTCGTCGTGCTGATCCTCATCCCGGTG TGGGATGAACTCGCGGAAGACCTAGGGGTAGGACTCGTGAACTCGTTCTG AGATACTACTACTGCCGGTAGAGGATAGGCCATGACGCAAAAGCCAATTT TGTAATCCAGATTTAGCCGTGATAGCGAAACTGCTGCTGTAAAGGCGTGA AAAAATATGGGTTTTACCTCCTTGTGTAAAAAGTGCCAGCCAAACTCTGC ACAGGGACAGCCATTGATTTGGTCAGGTCAGAGGGGGGTCGCCCACGTCT GAGCTGTGACCATCGGTTGAAATCATTGTCCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.